单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 23918 篇文献，本页显示第 23541 - 23560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23541 | 2024-08-09 |
Cancer genomics: Single-cell RNA-seq to decipher tumour architecture
2017-01, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/nrg.2016.151
PMID:27890926
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23542 | 2024-08-09 |
TRACING CO-REGULATORY NETWORK DYNAMICS IN NOISY, SINGLE-CELL TRANSCRIPTOME TRAJECTORIES
2017, Pacific Symposium on Biocomputing. Pacific Symposium on Biocomputing
DOI:10.1142/9789813207813_0053
PMID:27897008
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SCIMITAR的框架，用于从静态单细胞转录组数据中推断进展轨迹及其相关调控 | SCIMITAR通过在高维曲线中采用高斯混合的连续参数化，从数据中生成丰富的模型，突出与推断进展相关的基因表达和共表达模式 | NA | 探索复杂生物过程如分化和肿瘤发生的分子基础 | 单细胞转录组数据中的基因调控网络重构 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | 高斯混合模型 | 转录组数据 | 单细胞人类胎儿神经元数据集 |
| 23543 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing maps gene expression to mutational phylogenies in PDGF- and EGF-driven gliomas
2016-Nov-25, Molecular systems biology
IF:8.5Q1
DOI:10.15252/msb.20166969
PMID:27888226
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术，将基因表达与突变系统发育联系起来，研究了PDGF和EGF驱动的胶质瘤 | 开发了一种新方法，将单细胞表达谱映射到从外显子测序中识别的顺序获得的突变上 | NA | 评估克隆异质性对基因表达的影响 | PDGF和EGF驱动的胶质瘤 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 288个单细胞 |
| 23544 | 2024-08-09 |
Measuring intratumor heterogeneity by network entropy using RNA-seq data
2016-11-24, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep37767
PMID:27883053
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研究论文 | 本文利用RNA测序数据，通过生物网络状态测量肿瘤内异质性（ITH）水平 | 提出了一种基于熵的距离度量nJSD，用于测量两个网络之间的ITH，并在多个数据集上验证了其有效性 | NA | 研究肿瘤内异质性的测量方法及其在临床应用中的重要性 | 肿瘤样本的RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 分析了TCGA泛癌6,320名患者的数据，并使用了人类癌细胞系和单细胞测序数据进行验证 |
| 23545 | 2024-08-09 |
p53 Regulates Progenitor Cell Quiescence and Differentiation in the Airway
2016-11-22, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2016.11.007
PMID:27880895
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研究论文 | 本文研究了肿瘤抑制因子p53在气道上皮祖细胞的增殖和分化中的调控作用 | 首次证明了p53在气道上皮祖细胞的静止和分化中的关键作用，并揭示了p53水平对祖细胞行为的紧密调控 | NA | 探究p53在气道上皮祖细胞静止和分化中的调控机制 | 气道上皮祖细胞的增殖和分化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 23546 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomes identify human islet cell signatures and reveal cell-type-specific expression changes in type 2 diabetes
2017-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.212720.116
PMID:27864352
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研究论文 | 研究通过单细胞转录组分析，揭示了人类胰岛细胞的特征以及2型糖尿病中细胞类型特异性的表达变化 | 首次报道了来自非糖尿病和2型糖尿病人类胰岛样本的638个细胞的单细胞转录组，并识别了delta和PP/gamma细胞类型中与胰岛功能障碍和糖尿病相关的基因 | 研究主要集中在胰岛细胞的转录组分析，未涉及细胞功能的具体实验验证 | 识别胰腺胰岛功能障碍的基本细胞类型特异性特征，并提供理解胰岛生物学和糖尿病发病机制的关键资源 | 人类胰岛细胞及其在2型糖尿病中的表达变化 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 638个细胞 |
| 23547 | 2024-08-09 |
Reply from Authors re: Xue-Ru Wu. Attention to Detail by Single-cell sequencing. Eur Urol 2017;71:13-4
2017-01, European urology
IF:25.3Q1
DOI:10.1016/j.eururo.2016.11.003
PMID:27842721
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23548 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing for Drug Discovery and Drug Development
2017, Current topics in medicinal chemistry
IF:2.9Q3
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在药物发现和药物开发中的应用现状 | 单细胞测序技术提供了更强大和精确的方法来分析药物对处理过的细胞和组织的影响 | NA | 探讨单细胞测序技术在药物发现和药物开发中的潜在应用 | 单细胞全基因组/外显子测序、单细胞转录组测序、单细胞亚硫酸氢盐测序等 | 基因组学 | NA | NGS（下一代测序技术） | NA | 基因组、表观基因组和转录组数据 | 单细胞级别 |
| 23549 | 2024-08-09 |
Genome evolution in ductal carcinoma in situ: invasion of the clones
2017-Jan, The Journal of pathology
IF:5.6Q1
DOI:10.1002/path.4840
PMID:27861897
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综述 | 本文综述了导管原位癌（DCIS）向浸润性导管癌（IDC）进展过程中肿瘤内异质性的作用及其在诊断和治疗中的相关性 | 讨论了新兴技术如单细胞测序、STAR-FISH和成像质谱技术在理解DCIS演化中的潜在应用 | NA | 探讨DCIS向IDC进展的分子和基因组基础 | 导管原位癌（DCIS）及其向浸润性导管癌（IDC）的进展 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 23550 | 2024-08-09 |
Pinpointing Cancer Stem Cells in Oligodendroglioma
2017-01, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-NB2016-149
PMID:27864226
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究低级别少突胶质瘤，识别出具有神经干细胞和祖细胞基因表达特征的细胞群体 | 首次通过单细胞RNA测序技术在低级别少突胶质瘤中识别出具有神经干细胞特征的癌症干细胞 | NA | 识别并研究少突胶质瘤中的癌症干细胞 | 低级别少突胶质瘤中的单个细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未提及 |
| 23551 | 2024-08-09 |
Single-cell isolation by a modular single-cell pipette for RNA-sequencing
2016-11-29, Lab on a chip
IF:6.1Q2
DOI:10.1039/c6lc01241h
PMID:27841430
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research paper | 本文报道了一种模块化单细胞移液管（mSCP），由SCP-Tip、空气置换移液管（ADP）和ADP-Tips三个模块化组件组成，可快速、方便且可靠地从细胞悬液中分离单个活细胞，并适用于单细胞转录组测序。 | mSCP通过组装含有流体动力陷阱的SCP-Tip，能够从每微升5-10个细胞的悬液中分离单细胞，并实现100%的单细胞分离效率。 | NA | 开发一种方便、快速且高效的单细胞分离方法，以满足单细胞转录组测序的需求。 | 单细胞分离技术及其在单细胞转录组测序中的应用。 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | text | 每微升5-10个细胞 |
| 23552 | 2024-08-09 |
An automated approach to prepare tissue-derived spatially barcoded RNA-sequencing libraries
2016-11-16, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep37137
PMID:27849009
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研究论文 | 本文介绍了一种在机器人工作站上运行的保留转录本空间信息的自动化方法 | 该方法通过减少技术变异性和提高吞吐量，实现了比标准协议更高的效率 | NA | 开发一种稳健、可扩展且自动化的文库制备协议，以保留或推断空间上下文 | 牙龈组织活检样本的RNA序列 | 数字病理学 | 牙周病 | RNA测序 | NA | RNA | 六个牙龈组织活检样本的重复切片 |
| 23553 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq ties macrophage polarization to growth rate of intracellular Salmonella
2016-Nov-14, Nature microbiology
IF:20.5Q1
DOI:10.1038/nmicrobiol.2016.206
PMID:27841856
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研究论文 | 本文通过结合荧光报告细菌细胞分裂和单细胞RNA测序分析，研究了巨噬细胞对模型病原体沙门氏菌不同细胞内状态的反应 | 首次揭示了巨噬细胞在感染不同生长状态的沙门氏菌时表现出不同的功能性宿主反应状态，并展示了这些状态如何影响病原体的生长和免疫逃避 | NA | 探究宿主细胞如何响应细胞内病原体生长速率的异质性 | 巨噬细胞对沙门氏菌不同细胞内状态的反应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 23554 | 2024-08-09 |
Exploring viral infection using single-cell sequencing
2017-07-15, Virus research
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.virusres.2016.10.016
PMID:27816430
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综述 | 本文综述了利用单细胞测序技术研究病毒多样性和细胞对病毒复制的响应变异性的最新研究 | 利用单细胞测序技术从病毒和宿主细胞的角度研究病毒感染的动态变化 | NA | 探讨单细胞测序技术在病毒学领域的应用 | 病毒多样性和细胞对病毒复制的响应变异性 | 基因组学 | NA | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组和/或转录组数据 | NA |
| 23555 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing of the small-RNA transcriptome
2016-Dec, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.3701
PMID:27798564
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研究论文 | 本文介绍了一种单细胞水平的小RNA转录组测序方法，并应用于人类胚胎干细胞和癌细胞中，分析了microRNA及tRNA和snoRNA片段，揭示了microRNA作为不同细胞类型和状态标记的潜力 | 首次开发了一种单细胞水平的小RNA转录组测序方法 | NA | 研究小RNA表达的异质性及其在不同细胞类型和状态中的作用 | 人类胚胎干细胞和癌细胞中的小RNA | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | RNA | 多种人类胚胎干细胞和癌细胞 |
| 23556 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq supports a developmental hierarchy in human oligodendroglioma
2016-11-10, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/nature20123
PMID:27806376
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了6个IDH1或IDH2突变的人类少突胶质细胞瘤中的4,347个单细胞，重建了其发育程序，并推断出肿瘤细胞的分化状态与神经干细胞表达程序的关联 | 首次提供了单细胞分辨率下少突胶质细胞瘤细胞结构的深入分析，支持了癌症干细胞模型 | 需要完整的系统发育树来确定遗传进化对推断层次结构的影响 | 探究人类少突胶质细胞瘤中的细胞层次结构及其与发育程序的关系 | IDH1或IDH2突变的人类少突胶质细胞瘤中的单细胞 | 数字病理学 | 神经系统肿瘤 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4,347个单细胞 |
| 23557 | 2024-08-09 |
Revealing the vectors of cellular identity with single-cell genomics
2016-Nov-08, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/nbt.3711
PMID:27824854
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研究论文 | 本文探讨了单细胞基因组学在构建人类细胞全面图谱以及重新定义细胞身份和其分子调控机制方面的应用 | 利用新兴的计算分析方法，特别是单细胞RNA测序（scRNA-seq），以数据驱动的方式揭示细胞身份的多方面特征 | 计算方法需要克服技术噪声、数据规模及形成新的生物学抽象概念等挑战 | 探索单细胞基因组学在细胞身份定义和调控机制中的应用 | 人类细胞的身份及其分子调控机制 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因组数据 | NA |
| 23558 | 2024-08-09 |
Laminin-guided highly efficient endothelial commitment from human pluripotent stem cells
2016-11-02, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/srep35680
PMID:27804979
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研究论文 | 本文研究了从人多能干细胞（hPSCs）通过定向分化获得高度纯化的内皮祖细胞（PSC-EPCs）的方法，特别关注了细胞外基质（ECM）在分化过程中的作用。 | 使用短片段的层粘连蛋白411（LM411-E8）作为ECM，成功引导hPSCs高效分化为纯度超过95%的PSC-EPCs，无需细胞分选，并通过单细胞RNA测序分析揭示了其对细胞转录异质性的解决作用。 | NA | 探索和优化从hPSCs定向分化为内皮细胞的条件，特别是ECM的作用。 | 人多能干细胞（hPSCs）及其定向分化为内皮祖细胞（PSC-EPCs）的过程。 | 细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 23559 | 2024-08-09 |
Embryo genome profiling by single-cell sequencing for successful preimplantation genetic diagnosis in a family harboring COL4A1 c.1537G>A; p.G513S mutation
2016 Jul-Sep, Journal of human reproductive sciences
DOI:10.4103/0974-1208.192072
PMID:27803589
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术对携带COL4A1基因c.1537G>A; p.G513S突变家庭的胚胎进行基因组分析，实现了成功的植入前遗传诊断 | 这是印度首次报道通过IVF程序使用单细胞测序技术避免潜在致病性COL4A1等位基因，成功诞生正常儿童 | NA | 筛查不携带COL4A1基因c.1537G>A; p.G513S突变的胚胎，以避免选择性妊娠终止 | 12个胚胎的滋养层活检样本 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | DNA | 12个胚胎 |
| 23560 | 2024-08-09 |
De Novo MS/MS Sequencing of Native Human Antibodies
2017-01-06, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.6b00608
PMID:27779884
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研究论文 | 本研究展示了一种新的MS/MS抗体发现方法，该方法仅需要血清抗体，无需基因材料测序 | 首次证明了仅通过MS/MS技术直接从血清中纯化和测序抗体的可行性 | NA | 探索一种新的抗体发现方法，以简化从感染个体中获取治疗性单克隆抗体的过程 | 来自巨细胞病毒暴露个体的血清多克隆抗体 | 生物技术 | NA | MS/MS | NA | 血清 | 单个巨细胞病毒暴露个体 |