单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 23956 篇文献，本页显示第 23321 - 23340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23321 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-Seq Analysis of Infiltrating Neoplastic Cells at the Migrating Front of Human Glioblastoma
2017-10-31, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2017.10.030
PMID:29091775
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了人胶质母细胞瘤浸润性肿瘤细胞的基因表达特征 | 首次在单细胞水平上揭示了胶质母细胞瘤细胞在肿瘤核心及周边区域的基因表达差异，并识别出浸润性肿瘤细胞的共同基因特征 | 研究样本仅限于四名患者，可能影响结果的普遍性 | 探究胶质母细胞瘤细胞的基因表达特征及其在肿瘤形成和迁移中的作用 | 人胶质母细胞瘤的浸润性肿瘤细胞及其基因表达 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 3,589个细胞，来自四名患者 |
| 23322 | 2024-08-09 |
SFRP2/DPP4 and FMO1/LSP1 Define Major Fibroblast Populations in Human Skin
2018-04, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2017.09.045
PMID:29080679
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析正常人皮肤中的不同成纤维细胞群体 | 发现了两个主要的成纤维细胞群体，分别由SFRP2和FMO1基因定义，并进一步定义了每个群体内的亚群 | NA | 探索人皮肤中不同成纤维细胞群体的特征 | 人皮肤中的成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 6个皮肤活检样本 |
| 23323 | 2024-08-09 |
Polysome-profiling in small tissue samples
2018-01-09, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx940
PMID:29069469
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研究论文 | 本文优化了一种非线性蔗糖梯度方法，用于在小组织样本中富集高效翻译的mRNA，减少了样本处理量，并结合smart-seq2单细胞RNA测序技术，实现了小组织样本的翻译组分析。 | 提出了一种优化的非线性蔗糖梯度方法，减少了样本处理量，适用于大规模研究设计、原代细胞和生物库中收集的冷冻组织样本。 | NA | 优化polysome-profiling技术，使其适用于小组织样本和大规模实验设计。 | 小组织样本中的高效翻译mRNA。 | NA | NA | polysome-profiling, smart-seq2单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 23324 | 2024-08-09 |
Neuromedin B Expression Defines the Mouse Retrotrapezoid Nucleus
2017-11-29, The Journal of neuroscience : the official journal of the Society for Neuroscience
DOI:10.1523/JNEUROSCI.2055-17.2017
PMID:29066557
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研究论文 | 本文通过多重杂交和单细胞RNA测序技术，研究了小鼠延髓旁面部区域的RTN神经元的表型多样性，发现Neuromedin B mRNA可以作为RTN神经元的单一特异性标记物。 | 本文首次证明了Neuromedin B mRNA可以作为小鼠RTN神经元的单一特异性标记物，并揭示了RTN神经元的表型多样性。 | 本文主要集中在小鼠模型上，未涉及其他物种，且对于高表达Neuromedin B mRNA的RTN神经元的功能尚未明确。 | 研究小鼠RTN神经元的表型多样性及其特异性标记物。 | 小鼠RTN神经元及其表型多样性。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序，多重杂交 | NA | RNA | 雄性和雌性小鼠 |
| 23325 | 2024-08-09 |
Cardiovascular homeostasis dependence on MICU2, a regulatory subunit of the mitochondrial calcium uniporter
2017-10-24, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1711303114
PMID:29073106
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研究论文 | 本研究通过比较人类和小鼠心血管病理学中的转录组特征，发现MICU2（线粒体钙单向转运体复合物的调节亚单位）表达升高，并通过产生和表征MICU2突变小鼠，探讨其对心脏保护作用的影响。 | 本研究揭示了MICU2在调节血管紧张素II介导的高血压反应中的新作用，对保护腹主动脉免受损伤至关重要。 | NA | 探讨MICU2表达在心血管疾病中的保护作用及其机制。 | 人类和小鼠的心血管病理学转录组特征及MICU2突变小鼠的心脏功能。 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | RNA测序（RNA-seq） | NA | 转录组数据 | MICU2突变小鼠和野生型小鼠 |
| 23326 | 2024-08-09 |
Dynamics of lineage commitment revealed by single-cell transcriptomics of differentiating embryonic stem cells
2017-10-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-017-01076-4
PMID:29061959
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学方法研究了视黄酸驱动的胚胎干细胞从多能态到谱系承诺的基因表达动力学 | 首次系统地研究了单细胞水平上胚胎干细胞退出多能态和谱系承诺的过程，并揭示了该阶段的几个转录特征 | NA | 研究胚胎干细胞从多能态到谱系承诺的基因表达动态变化 | 小鼠胚胎干细胞的谱系承诺过程 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 未具体说明样本数量 |
| 23327 | 2024-08-09 |
Transcriptomic correlates of neuron electrophysiological diversity
2017-Oct, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1005814
PMID:29069078
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研究论文 | 本文通过整合池化和单细胞转录组学与细胞内电生理学，研究了基因表达与神经元电生理多样性之间的关系 | 本文首次编译了包含34种神经元类型的脑部数据集，并识别了420个与生理参数变异性显著相关的基因，这些发现有助于理解神经元功能多样性的生成机制 | 本文的研究主要基于公开可获取的数据，且模型预测能力需要在更多不同类型的细胞中进一步验证 | 探讨神经元多样性如何从复杂的基因表达模式中产生 | 神经元的基因表达与电生理特性 | 神经科学 | NA | 转录组学、电生理学 | 统计模型 | 基因表达数据、电生理数据 | 34种神经元类型，12种视觉皮层细胞类型 |
| 23328 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis identifies cellular markers of the HIV permissive cell
2017-Oct, PLoS pathogens
IF:5.5Q1
DOI:10.1371/journal.ppat.1006678
PMID:29073251
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析，识别了HIV易感细胞的细胞标志物 | 本文通过单细胞RNA测序和功能性细胞标志物鉴定，提供了“HIV易感细胞”的特征 | NA | 探索HIV感染细胞易感性的基础 | 非感染的CD4+ T细胞 | NA | HIV | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自高和低易感个体的CD4+ T细胞 |
| 23329 | 2024-08-09 |
Recent Advances in the Systems Biology of Aging
2018-10-01, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2017.7367
PMID:29020802
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综述 | 本文综述了系统生物学在衰老研究中的最新进展，特别是通过饮食限制、神经退行性疾病和衰老生物标志物的研究 | 介绍了新的技术如单细胞测序、超越甲基化的表观遗传学进展以及多组学网络研究，这些技术扩展了系统生物学家的研究范围 | 尽管系统生物学方法取得了进展，但仍不完全理解影响衰老的个体基因和通路 | 旨在通过系统生物学方法深化对衰老机制的理解，并探索可能的干预措施以延缓与年龄相关的疾病 | 衰老的基本生物学机制，特别是通过饮食限制、神经退行性疾病和衰老生物标志物的研究 | 系统生物学 | 衰老 | 单细胞测序、高通量测序的转座酶可及染色质分析、多组学网络研究 | NA | 基因组数据、表观遗传数据 | NA |
| 23330 | 2024-08-09 |
Global and targeted approaches to single-cell transcriptome characterization
2018-07-01, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elx025
PMID:29028866
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组表征的两种主要方法：定量逆转录PCR（RT-qPCR）和RNA测序 | 介绍了单细胞转录组分析的新方法，使得对细胞数量有限的样本（如早期胚胎细胞）和细胞群体异质性（如血液细胞或神经元）的研究成为可能 | NA | 探索单细胞转录组表征的新方法，以更好地理解细胞功能 | 单细胞转录组 | 分子生物学 | NA | RT-qPCR, RNA测序 | NA | 转录组 | 单细胞 |
| 23331 | 2024-08-09 |
Immune cell type 'fingerprints' at the basis of outcome diversity of human infection
2018-04, Current opinion in microbiology
IF:5.9Q1
DOI:10.1016/j.mib.2017.09.012
PMID:29049916
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研究论文 | 本文提出利用单细胞分析技术研究人类感染结果多样性的新视角 | 利用单细胞RNA测序技术识别与宿主清除病原体能力相关的免疫细胞类型指纹 | NA | 探索感染结果多样性的原因，为治疗传染病提供新工具 | 人类感染结果的多样性及免疫细胞类型的作用 | NA | 传染病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 23332 | 2024-08-09 |
Fluctuation localization imaging-based fluorescence in situ hybridization (fliFISH) for accurate detection and counting of RNA copies in single cells
2018-01-25, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx874
PMID:29040675
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研究论文 | 本文介绍了一种基于波动定位成像的荧光原位杂交技术（fliFISH），用于准确检测和计数单细胞中的RNA拷贝 | fliFISH技术利用可开关荧光染料的开关周期来设定真实信号和虚假信号之间的定量阈值，从而提高了smFISH技术的精确度 | NA | 开发一种新的技术以提高单细胞中RNA拷贝检测和计数的准确性 | 单细胞中的RNA拷贝 | 分子生物学 | 糖尿病 | 荧光原位杂交（FISH） | NA | 图像 | 小鼠胰岛细胞 |
| 23333 | 2024-08-09 |
SCPortalen: human and mouse single-cell centric database
2018-01-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx949
PMID:29045713
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研究论文 | 本文介绍了单细胞中心数据库'SCPortalen'的开发，该数据库旨在整合和标准化人类和小鼠的单细胞转录组数据，以便于比较和重用。 | SCPortalen数据库通过手动筛选和标准化元数据，以及进行质量评估和数据处理，提供了一个高质量的单细胞数据平台。 | NA | 开发一个能够整合和标准化不同来源的单细胞转录组数据的数据库，以支持研究人员对特定细胞类型或群体异质性的研究。 | 人类和小鼠的单细胞转录组数据。 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据，图像文件 | 涵盖了从INSDC站点公开的人类和小鼠单细胞转录组数据集。 |
| 23334 | 2024-08-09 |
DIMM-SC: a Dirichlet mixture model for clustering droplet-based single cell transcriptomic data
2018-01-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btx490
PMID:29036318
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研究论文 | 本文开发了一种名为DIMM-SC的Dirichlet混合模型，用于聚类基于液滴的单细胞转录组数据 | DIMM-SC模型能够显式地建模scRNA-Seq实验中的UMI计数数据，并通过Dirichlet混合先验表征不同细胞簇之间的变异 | NA | 开发一种新的统计方法和计算工具，用于分析基于液滴的单细胞转录组数据 | 基于液滴的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | 系统性硬化症 | scRNA-Seq | Dirichlet混合模型 | 转录组数据 | 数千个单细胞 |
| 23335 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals a distinct transcriptome signature of aneuploid hematopoietic cells
2017-12-21, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood-2017-08-803353
PMID:29030335
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来自健康供体和骨髓衰竭患者的骨髓中的造血干细胞和祖细胞，以揭示非整倍体造血细胞的转录组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了非整倍体细胞与二倍体细胞在转录组水平上的差异，并探讨了染色体增减对细胞功能的影响 | 研究样本量有限，且仅包括健康供体和骨髓衰竭患者，可能限制了结果的普遍性 | 探讨非整倍体细胞在转录组水平上的特征及其对细胞功能的影响 | 健康供体和骨髓衰竭患者的骨髓中的造血干细胞和祖细胞 | 数字病理学 | 骨髓衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 共分析了391个对照细胞和588个患者细胞 |
| 23336 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals developmental heterogeneity among early lymphoid progenitors
2017-12-15, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.201797105
PMID:29030486
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研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术揭示了早期淋巴祖细胞的发育异质性 | 本文首次识别了一个新的亚群，作为B细胞定向分化的直接前体，并揭示了B220CD117CD19NK1.1祖细胞在单细胞水平上的异质性 | NA | 研究早期淋巴祖细胞的发育异质性及其潜在的细胞分化关系 | B220CD117CD19NK1.1未定型的造血祖细胞及其亚群 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个B220CD117CD19NK1.1祖细胞及其亚群的单细胞 |
| 23337 | 2024-08-09 |
Pathologic Stimulus Determines Lineage Commitment of Cardiac C-kit+ Cells
2017-Dec-12, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 研究不同病理刺激对心脏c-kit+细胞谱系分化的影响 | 首次揭示了不同病理刺激对心脏c-kit+细胞最终命运的影响，并发现p53在c-kit+细胞向心肌细胞分化中的关键作用 | 心肌细胞从c-kit+细胞形成的总体速率仍低于临床相关水平 | 探讨不同病理刺激对心脏c-kit+细胞谱系分化的影响 | 心脏c-kit+细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | 心脏CD45-c-kit+细胞 |
| 23338 | 2024-08-09 |
Accounting for technical noise in differential expression analysis of single-cell RNA sequencing data
2017-Nov-02, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkx754
PMID:29036714
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研究论文 | 本文提出了一种名为TASC的统计框架，用于在单细胞RNA测序数据中考虑细胞间的技术差异，以准确估计基因的生物学变异并检测差异表达基因 | TASC框架采用经验贝叶斯方法，通过使用外部RNA spike-ins可靠地建模细胞特异性dropout率和放大偏差，并能调整协变量以进一步消除细胞大小和细胞周期差异带来的混杂影响 | NA | 开发一种方法来调整单细胞RNA测序数据中的技术噪声，以提高差异表达分析的准确性和鲁棒性 | 单细胞RNA测序数据中的技术噪声和差异表达基因 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 分层混合模型 | RNA测序数据 | NA |
| 23339 | 2024-08-09 |
Single-cell gene expression analysis reveals regulators of distinct cell subpopulations among developing human neurons
2017-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.223313.117
PMID:29030469
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了发育中的人类神经元的基因表达，揭示了神经前体细胞亚型的调控机制 | 本研究采用无监督的高分辨率策略，识别细胞发育的分支点，追踪亚群的随机转录动力学，阐明调控网络，并发现关键调控因子 | NA | 揭示个体人类神经前体细胞分化为成熟神经元的随机动力学和调控机制 | 发育中的人类神经元及其神经前体细胞亚型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 23340 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing data reveal widespread recurrence and loss of mutational hits in the life histories of tumors
2017-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.220707.117
PMID:29030470
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研究论文 | 本文通过单细胞测序数据，揭示了肿瘤生命史中广泛存在的突变复发和丢失现象 | 开发了一种严格的统计框架，用于测试无限位点假设，并发现多个单细胞测序数据集中存在同一基因组位置多次突变的情况 | 仅基于12个单细胞测序数据集进行分析，可能需要更多数据以验证结果的普遍性 | 评估无限位点假设的有效性，并探索更复杂的模型以量化肿瘤内异质性 | 人类癌症的单细胞测序数据 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | 统计框架 | 基因组数据 | 12个单细胞测序数据集 |