单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 23993 篇文献，本页显示第 23041 - 23060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 23041 | 2024-08-09 |
scPipe: A flexible R/Bioconductor preprocessing pipeline for single-cell RNA-sequencing data
2018-08, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1006361
PMID:30096152
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scPipe的R/Bioconductor包，用于处理单细胞RNA测序数据的预处理 | scPipe能够处理多种不同协议的条形码策略，并提供样本级别的质量评估和结果可视化 | NA | 开发一种灵活的工具，用于处理和分析单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 文本 | 数千个细胞 |
| 23042 | 2024-08-09 |
New MiniPromoter Ple345 (NEFL) Drives Strong and Specific Expression in Retinal Ganglion Cells of Mouse and Primate Retina
2019-03, Human gene therapy
IF:3.9Q2
DOI:10.1089/hum.2018.118
PMID:30062914
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研究论文 | 本文通过计算生物学方法，挖掘人类基因组，开发了一种新的最小启动子元素（MiniPromoter）Ple345（NEFL），旨在提高视网膜神经节细胞基因治疗的安全性和有效性 | 开发了一种新的基于人类DNA的最小启动子Ple345（NEFL），该启动子在重组腺相关病毒（rAAV）中显示出在非人类灵长类视网膜神经节细胞中的特异性和强表达 | NA | 改进视网膜神经节细胞基因治疗的安全性和有效性 | 视网膜神经节细胞 | 基因治疗 | 视网膜疾病 | 单细胞RNA测序（Drop-seq） | NA | 基因组数据 | 在老鼠和非人类灵长类视网膜中测试了七个启动子设计 |
| 23043 | 2024-08-09 |
GPseudoRank: a permutation sampler for single cell orderings
2019-02-15, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty664
PMID:30052778
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研究论文 | 本文介绍了一种名为GPseudoRank的排列采样器，用于单细胞排序 | GPseudoRank能够从复杂的多模态后验分布中采样，并识别生物过程中低和高伪时间不确定性的阶段 | NA | 开发一种方法来采样复杂的、多模态的排序分布，并估计生物发育过程中排序不确定性的变化 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | Bayesian modelling, MCMC | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 23044 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis identifies markers of resistance to targeted BRAF inhibitors in melanoma cell populations
2018-09, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.234062.117
PMID:30061114
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SAKE的单细胞RNA测序分析方法，用于识别黑色素瘤细胞对BRAF抑制剂的耐药标志物 | SAKE方法在处理大型复杂细胞群体时优于其他单细胞分析方法，并能识别出BRAF抑制剂耐药细胞的新标志物 | 单细胞RNA测序数据存在高转录本丢失率、随机转录事件和复杂群体亚结构等挑战 | 开发和验证一种新的单细胞RNA测序分析方法，以识别黑色素瘤细胞对BRAF抑制剂的耐药标志物 | 黑色素瘤细胞对BRAF抑制剂的耐药性 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 使用了来自Fluidigm C1和10x Genomics平台的单细胞RNA测序数据 |
| 23045 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq uncovers dynamic processes and critical regulators in mouse spermatogenesis
2018-09, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-018-0074-y
PMID:30061742
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研究论文 | 本文通过结合转基因标记和生精上皮周期的同步化，开发了一种纯化所有类型均一精原细胞的方法，并进行了单细胞RNA测序，揭示了小鼠精子发生中的动态过程和关键调控因子。 | 本文揭示了先前未被描述的广泛的动态基因表达过程和分子特征，以及特定阶段的男性生殖细胞发育中的替代剪接模式和新调控因子。 | NA | 全面理解精子发生的分子机制，并为不孕症治疗和男性避孕开发新策略。 | 小鼠的精原细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 所有类型的均一精原细胞 |
| 23046 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals the diversity of trophoblast subtypes and patterns of differentiation in the human placenta
2018-08, Cell research
IF:28.1Q1
DOI:10.1038/s41422-018-0066-y
PMID:30042384
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了人类胎盘中滋养层细胞亚型的多样性及其分化模式 | 发现了新的细胞亚型，并定义了细胞类型特异性的基因特征，揭示了人类胎盘的许多先前未知的功能 | NA | 深入了解人类胎盘在妊娠早期的形成过程 | 人类胎盘中的滋养层细胞亚型及其分化模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来自第一和第二孕期人类胎盘的已分类胎盘细胞 |
| 23047 | 2024-08-09 |
BraCeR: B-cell-receptor reconstruction and clonality inference from single-cell RNA-seq
2018-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-018-0082-3
PMID:30065371
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23048 | 2024-08-09 |
Tumor genetic analysis from single-cell RNA-seq data
2018-08, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-018-0089-9
PMID:30065381
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 23049 | 2024-08-09 |
Human glioblastoma arises from subventricular zone cells with low-level driver mutations
2018-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0389-3
PMID:30069053
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研究论文 | 本文通过深度测序和单细胞测序技术，证实了人脑室下带（SVZ）中的星形胶质样神经干细胞（NSCs）是含有胶质母细胞瘤（GBM）驱动突变的起源细胞 | 首次提供了直接的分子遗传学证据，证明SVZ中的NSCs是GBM的起源细胞，并含有驱动突变 | 研究样本仅限于28名IDH野生型GBM患者，可能无法代表所有GBM病例 | 确定胶质母细胞瘤的起源细胞并理解其疾病进展机制 | 人脑室下带的神经干细胞和胶质母细胞瘤组织 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 深度测序、单细胞测序、激光显微切割 | NA | 组织样本 | 28名IDH野生型GBM患者 |
| 23050 | 2024-08-09 |
High-Throughput Approaches onto Uncover (Epi)Genomic Architecture of Type 2 Diabetes
2018-Jul-26, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes9080374
PMID:30050001
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综述 | 本文综述了利用高通量方法揭示2型糖尿病的(表观)基因组结构的主要进展 | 利用全基因组关联研究(GWAS)和下一代测序(NGS)技术，揭示了2型糖尿病的常见易感基因和罕见编码遗传变异，以及单细胞测序在人胰腺胰岛中的应用 | NA | 更好地理解2型糖尿病的分子基础 | 2型糖尿病的(表观)基因组结构 | 数字病理学 | 2型糖尿病 | 全基因组关联研究(GWAS), 下一代测序(NGS), 单细胞测序 | NA | 基因组数据, 表观基因组数据 | NA |
| 23051 | 2024-08-09 |
Interferon gene therapy reprograms the leukemia microenvironment inducing protective immunity to multiple tumor antigens
2018-07-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-018-05315-0
PMID:30042420
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研究论文 | 本文研究了通过单核细胞介导的IFNα基因传递抑制小鼠模型中的白血病，并探讨了其在免疫治疗中的应用 | 首次展示了IFN基因疗法如何通过重编程白血病微环境来诱导对多种肿瘤抗原的保护性免疫 | 研究主要在实验模型中进行，需要进一步的临床试验验证 | 探索免疫疗法在癌症治疗中的应用及机制 | 白血病微环境及免疫治疗效果 | 免疫学 | 白血病 | IFN基因疗法 | NA | 转录组数据 | 小鼠模型 |
| 23052 | 2024-08-09 |
High-resolution transcriptional dissection of in vivo Atoh1-mediated hair cell conversion in mature cochleae identifies Isl1 as a co-reprogramming factor
2018-07, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1007552
PMID:30063705
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了Atoh1在成熟耳蜗中诱导非感觉支持细胞转化为毛细胞的过程，并发现Isl1作为共重编程因子可以提高转化效率 | 首次通过高分辨率转录组分析揭示了Atoh1和Isl1共同表达可以提高毛细胞转化效率 | 转化效率仍然较低，且功能性目标细胞的产生仍具挑战 | 研究如何提高体内分化细胞直接转化的效率并产生功能性目标细胞 | 小鼠耳蜗中的非感觉支持细胞和毛细胞 | 再生医学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 多个时间点的整个小鼠感觉上皮细胞 |
| 23053 | 2024-08-09 |
Zuo Gui Wan Alters Expression of Energy Metabolism Genes and Prevents Cell Death in High-Glucose Loaded Mouse Embryos
2018, Evidence-based complementary and alternative medicine : eCAM
DOI:10.1155/2018/2409471
PMID:30046334
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研究论文 | 本研究探讨了中药方剂左归丸对高糖负荷小鼠胚胎细胞死亡的分子机制 | 左归丸能够逆转高糖对核糖体途径基因的抑制作用，并通过调节线粒体能量代谢来防止胚胎细胞死亡 | NA | 理解左归丸对受损葡萄糖耐量（IGT）的分子机制 | 高糖负荷的2细胞期小鼠胚胎 | NA | NA | 单细胞RNA测序技术 | NA | 转录组数据 | 高糖负荷的2细胞期小鼠胚胎 |
| 23054 | 2024-08-09 |
Elucidating T Cell Activation-Dependent Mechanisms for Bifurcation of Regulatory and Effector T Cell Differentiation by Multidimensional and Single-Cell Analysis
2018, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2018.01444
PMID:30061879
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研究论文 | 本研究通过多维度和单细胞分析方法，探讨了T细胞受体（TCR）信号如何调控调节性T细胞（Treg）和效应T细胞（Teff）的分化机制 | 首次揭示了TCR信号在Treg和Teff分化中的作用机制，并利用单细胞组合CCA方法分析了肿瘤浸润T细胞的未注释单细胞RNA-seq数据 | NA | 阐明TCR信号下游的激活机制，以及其如何调控Treg和Teff的分化及成熟过程 | T细胞亚群的转录组 | 免疫学 | NA | 多维度分析方法（CCA）和单细胞组合CCA | NA | RNA-seq数据 | 来自独立数据集的各种T细胞亚群 |
| 23055 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing reveals distinct gene expression patterns in glucose metabolism of human preimplantation embryos
2019-Jan, Reproduction, fertility, and development
DOI:10.1071/RD18178
PMID:30017025
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了人类胚胎植入前阶段葡萄糖代谢相关基因的表达模式 | 首次在单细胞分辨率下研究了胚胎植入前阶段葡萄糖代谢的动态基因表达谱 | NA | 探究人类胚胎植入前阶段葡萄糖代谢相关基因的表达调控机制 | 人类胚胎植入前阶段的葡萄糖代谢相关基因 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 人类胚胎植入前阶段的多个细胞 |
| 23056 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis reveals the progression of human osteoarthritis
2019-01, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1136/annrheumdis-2017-212863
PMID:30026257
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人类骨关节炎的进展过程 | 发现了七种分子定义的软骨细胞群体，包括三种具有独特功能的新表型，并揭示了软骨祖细胞的新标记 | NA | 理解人类软骨退化和再生的分子机制，以改进骨关节炎的治疗策略 | 10名接受膝关节置换手术的骨关节炎患者的1464个软骨细胞 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 1464个软骨细胞 |
| 23057 | 2024-08-09 |
Advancing insights into stem cell niche complexities with next-generation technologies
2018-12, Current opinion in cell biology
IF:6.0Q1
DOI:10.1016/j.ceb.2018.06.012
PMID:30031324
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综述 | 本文综述了利用下一代技术，如单细胞转录组分析、3D体外培养和4D体内显微镜技术，对成体组织特异性干细胞及其微环境的复杂相互作用的理解进展 | 利用先进的单细胞转录组分析、3D体外培养和4D体内显微镜技术，深入研究干细胞与其微环境的复杂相互作用 | NA | 探讨干细胞与其微环境的复杂相互作用，以更好地理解干细胞在组织维持和再生中的作用 | 成体组织特异性干细胞及其微环境 | NA | NA | 单细胞转录组分析, 3D体外培养, 4D体内显微镜 | NA | 转录组数据, 显微图像 | NA |
| 23058 | 2024-08-09 |
Atherosclerosis in the single-cell era
2018-10, Current opinion in lipidology
IF:3.8Q1
DOI:10.1097/MOL.0000000000000537
PMID:30020199
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综述 | 本文综述了在单细胞时代下，利用高参数技术如质谱流式细胞术（CyTOF）和单细胞RNA测序（scRNAseq）分析免疫细胞在动脉粥样硬化发展中的作用 | 介绍了通过CyTOF和scRNAseq技术发现的新免疫细胞亚群及其潜在功能 | 酶消化导致的细胞死亡和scRNAseq转录组深度的限制 | 探讨免疫细胞在动脉粥样硬化中的作用及新技术在其中的应用 | 动脉粥样硬化的小鼠动脉壁中的免疫细胞 | NA | 心血管疾病 | 质谱流式细胞术（CyTOF）, 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 细胞 | 10-30种免疫细胞亚群 |
| 23059 | 2024-08-09 |
Gene Signature of Proliferating Human Pancreatic α Cells
2018-09-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/en.2018-00469
PMID:30010845
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研究论文 | 本研究通过大规模单细胞RNA测序结合伪时间排序，对人类胰腺α细胞进行了特征描述，并识别出两个主要亚群和一个较小的增殖α细胞群 | 首次详细描述了人类胰腺α细胞的增殖特征，并识别出与细胞周期调控相关的基因表达模式 | NA | 揭示人类胰腺α细胞的增殖机制及其基因表达特征 | 人类胰腺α细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 大规模单细胞样本 |
| 23060 | 2024-08-09 |
Optimal Hypoxia Regulates Human iPSC-Derived Liver Bud Differentiation through Intercellular TGFB Signaling
2018-08-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2018.06.015
PMID:30033085
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研究论文 | 研究探讨了在人诱导多能干细胞衍生的肝芽模型中，通过细胞间TGFB信号传导，最佳低氧条件对肝细胞分化的影响 | 首次揭示了低氧通过调节TGFB1和TGFB3的表达，影响肝细胞和胆管细胞标记物的表达，从而促进肝细胞分化 | NA | 探究低氧条件对肝细胞分化的影响及其机制 | 人诱导多能干细胞衍生的肝芽 | 干细胞研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |