单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 23993 篇文献，本页显示第 22801 - 22820 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22801 | 2024-08-09 |
The genomic organization and expression pattern of the low-affinity Fc gamma receptors (FcγR) in the Göttingen minipig
2019-02, Immunogenetics
IF:2.9Q3
DOI:10.1007/s00251-018-01099-1
PMID:30564855
|
研究论文 | 本文研究了Göttingen小型猪中低亲和力Fcγ受体（FcγR）的基因组结构和表达模式 | 首次在Göttingen小型猪中鉴定出新的FcγRIIa基因，并分析了其在血小板上的表达 | 文章未提及具体的局限性 | 探讨Göttingen小型猪中Fcγ受体的基因组结构和表达模式，以促进其在治疗性抗体预临床研究中的应用 | Göttingen小型猪的Fcγ受体基因及其表达模式 | 生物医学研究 | NA | 基因组分析、测序、流式细胞术、单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据、RNA序列数据 | 涉及Göttingen小型猪的外周血单核细胞（PBMCs）和全血样本 |
| 22802 | 2024-08-09 |
Tumor Suppressor PTEN Regulates Negatively Sertoli Cell Proliferation, Testis Size, and Sperm Production In Vivo
2019-02-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/en.2018-00892
PMID:30576429
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序和基因敲除小鼠模型，探讨了IGFs在睾丸中的来源及其通过IGF/PTEN/PI3K途径促进未成熟Sertoli细胞增殖的机制 | 首次揭示了IGFs在睾丸间质类固醇生成前体细胞中的表达，并通过PTEN基因敲除小鼠模型验证了IGF/PTEN/PI3K途径在未成熟Sertoli细胞增殖中的作用 | 研究主要集中在小鼠模型上，其结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明IGFs在睾丸中的来源及其通过IGF/PTEN/PI3K途径促进未成熟Sertoli细胞增殖的机制 | 未成熟Sertoli细胞的增殖、睾丸大小和精子产量 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 基因敲除小鼠模型 | RNA | 小鼠胚胎睾丸细胞 |
| 22803 | 2024-08-09 |
Tissue Resident CCR2- and CCR2+ Cardiac Macrophages Differentially Orchestrate Monocyte Recruitment and Fate Specification Following Myocardial Injury
2019-01-18, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.118.314028
PMID:30582448
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研究论文 | 本文研究了心肌损伤后组织驻留的CCR2-和CCR2+心脏巨噬细胞如何不同地调控单核细胞的招募和命运指定 | 首次揭示了组织驻留的CCR2+和CCR2-巨噬细胞在心肌损伤后对单核细胞招募和命运指定的不同调控机制 | NA | 测试组织驻留的CCR2-和CCR2+巨噬细胞在心肌损伤后对单核细胞招募和命运指定的不同调控作用的假设 | 组织驻留的CCR2-和CCR2+心脏巨噬细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 使用多种小鼠模型进行研究 |
| 22804 | 2024-08-09 |
Identification of Embryonic Neural Plate Border Stem Cells and Their Generation by Direct Reprogramming from Adult Human Blood Cells
2019-01-03, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2018.11.015
PMID:30581079
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研究论文 | 本文报道了通过异位表达四个神经转录因子，将成人人类成纤维细胞和血液细胞直接重编程为诱导的神经板边界干细胞（iNBSCs），并探讨了其在再生医学中的应用潜力 | 首次报道了通过直接重编程技术生成人类iNBSCs，并展示了其在模拟人类疼痛综合症和再生医学中的应用 | NA | 探索神经发育机制并为再生医学提供神经干细胞来源 | 成人人类成纤维细胞和血液细胞，以及人类多能干细胞 | 再生医学 | NA | 直接重编程技术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | NA |
| 22805 | 2024-08-09 |
Metabolic heterogeneity underlies reciprocal fates of TH17 cell stemness and plasticity
2019-01, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-018-0806-7
PMID:30568299
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研究论文 | 本文研究了T17细胞在自身免疫性疾病模型中的代谢异质性及其对细胞命运的影响 | 首次揭示了T17细胞中存在具有干细胞样特征的亚群和具有高代谢活性的亚群，并阐明了mTORC1信号通路在调控T17细胞命运决策中的关键作用 | NA | 探讨T17细胞在慢性炎症条件下的异质性及其对自身免疫性疾病的贡献 | T17细胞的代谢异质性和细胞命运 | 免疫学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22806 | 2024-08-09 |
A test metric for assessing single-cell RNA-seq batch correction
2019-01, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-018-0254-1
PMID:30573817
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研究论文 | 本文介绍了一种用于评估单细胞RNA测序批次效应校正的用户友好、稳健且敏感的k近邻批次效应测试（kBET） | 提出了一个量化批次效应的kBET方法，用于评估批次回归和归一化方法的效果，并区分细胞类型特异性个体间变异与细胞群体相对比例的变化 | NA | 评估单细胞RNA测序中的批次效应校正方法 | 单细胞RNA测序数据中的批次效应 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | k近邻批次效应测试（kBET） | 单细胞转录组数据 | 外周血单个核细胞（PBMCs）来自健康捐赠者 |
| 22807 | 2024-08-09 |
SCOPE-Seq: a scalable technology for linking live cell imaging and single-cell RNA sequencing
2018-12-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-018-1607-x
PMID:30583733
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SCOPE-Seq的新技术，通过结合微流控技术和光学可解码珠，实现了活细胞成像与单细胞RNA测序的链接 | SCOPE-Seq技术首次实现了活细胞表型分析与单细胞测序的结合，提高了测量的准确性和可扩展性 | NA | 验证SCOPE-Seq技术在结合活细胞成像与单细胞RNA测序中的准确性和可扩展性 | 活细胞和单细胞RNA | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | 微流控技术 | 图像和RNA序列 | NA |
| 22808 | 2024-08-09 |
The International Conference on Intelligent Biology and Medicine (ICIBM) 2018: systems biology on diverse data types
2018-12-21, BMC systems biology
DOI:10.1186/s12918-018-0648-9
PMID:30577731
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research paper | 本文描述了2018年国际智能生物与医学会议(ICIBM 2018)中关于系统生物学的十篇高质量论文 | 涵盖了多种数据类型的系统生物学进展，包括基因调控、环状RNA表达、单细胞RNA-Seq、染色体间相互作用、代谢组学、蛋白质组学和磷酸蛋白质组学 | NA | 介绍ICIBM 2018会议中关于系统生物学的高质量研究成果 | 系统生物学领域的多种数据类型 | 系统生物学 | NA | NA | NA | 多种数据类型，包括基因调控、环状RNA表达、单细胞RNA-Seq、染色体间相互作用、代谢组学、蛋白质组学和磷酸蛋白质组学 | NA |
| 22809 | 2024-08-09 |
scdNet: a computational tool for single-cell differential network analysis
2018-12-21, BMC systems biology
DOI:10.1186/s12918-018-0652-0
PMID:30577836
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研究论文 | 本文介绍了首个基于单细胞RNA测序（scRNA-Seq）的差异网络分析生物信息学工具scdNet，该工具具有基因-基因相关性的样本大小调整、状态间相关性的比较和差异网络构建等功能 | scdNet是首个针对scRNA-Seq数据进行差异网络分析的工具，能够有效处理高度稀疏的数据矩阵，并具有较低的样本大小要求、高计算效率和对测序噪声的容忍度 | NA | 开发一种新的生物信息学工具，用于分析单细胞RNA测序数据中的差异基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据，特别是循环肿瘤细胞（CTCs）和早期小鼠胚胎的数据 | 生物信息学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 基因表达数据 | 适用于小样本大小，具体数量未在摘要中提及 |
| 22810 | 2024-08-09 |
A Cellular Anatomy of the Normal Adult Human Prostate and Prostatic Urethra
2018-12-18, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2018.11.086
PMID:30566875
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research paper | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术，提供了年轻成人前列腺和前列腺尿道的细胞图谱 | 使用单细胞RNA测序和流式细胞术，结合免疫组化技术，提供了前列腺和前列腺尿道的详细细胞图谱，并设计了新的细胞类型特异性标记物 | NA | 解决良性前列腺增生和前列腺癌的细胞起源问题 | 正常成人人类前列腺和前列腺尿道的细胞结构 | digital pathology | prostate cancer | scRNA-seq, flow cytometry, immunohistochemistry | NA | 细胞数据 | 约98,000个细胞 |
| 22811 | 2024-08-09 |
Understanding the Biology and Pathogenesis of the Kidney by Single-Cell Transcriptomic Analysis
2018-Nov, Kidney diseases (Basel, Switzerland)
DOI:10.1159/000492470
PMID:30574498
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）的历史、改进及其在肾脏研究领域的应用 | scRNA-seq能够以单细胞分辨率进行基因表达分析，识别组织中的所有细胞类型和亚型，包括新发现的或数量较少的细胞类型 | NA | 探讨scRNA-seq在肾脏研究中的应用及其潜在用途 | 肾脏细胞及其在疾病中的分子动态 | 生物医学研究 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22812 | 2024-08-09 |
VASC: Dimension Reduction and Visualization of Single-cell RNA-seq Data by Deep Variational Autoencoder
2018-10, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2018.08.003
PMID:30576740
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度变分自编码器的单细胞RNA测序数据降维和可视化方法（VASC） | VASC能够显式建模dropout事件，并找到原始数据的非线性层次特征表示 | NA | 研究单细胞RNA测序数据的降维和可视化 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | RNA测序数据 | 超过20个数据集 |
| 22813 | 2024-08-09 |
Technical Advances in Single-Cell RNA Sequencing and Applications in Normal and Malignant Hematopoiesis
2018, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2018.00582
PMID:30581771
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在正常和恶性造血中的最新进展及其应用 | scRNA-seq技术的发展改变了我们对许多生物现象的理解，包括器官发育和癌症发生 | NA | 旨在进一步理解造血层次结构，并阐明个性化治疗和精准医学方法在临床治疗血液恶性肿瘤中的应用 | 正常和恶性造血细胞 | 数字病理学 | 血液恶性肿瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 22814 | 2024-08-09 |
Single-nucleus and single-cell transcriptomes compared in matched cortical cell types
2018, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0209648
PMID:30586455
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研究论文 | 本文比较了单核和单细胞转录组在匹配的皮质细胞类型中的应用 | 证明了单核RNA测序（snRNA-seq）在分析复杂组织转录组时相较于单细胞RNA测序（scRNA-seq）的优势，包括更少的细胞偏倚覆盖、不受细胞分离导致的转录伪影影响，以及可应用于冷冻存档样本 | NA | 比较单核和单细胞转录组在识别细胞类型方面的效果 | 小鼠视觉皮质的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq）和单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 小鼠视觉皮质样本 |
| 22815 | 2024-08-09 |
Optimal Gene Filtering for Single-Cell data (OGFSC)-a gene filtering algorithm for single-cell RNA-seq data
2019-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty1016
PMID:30535000
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研究论文 | 本文提出了一种名为Optimal Gene Filtering for Single-Cell data (OGFSC)的新算法，用于构建基于基因表达水平和相应方差的阈值曲线，以有效减少单细胞RNA-seq数据中的技术噪声 | OGFSC算法通过构建基于基因表达水平和方差的阈值曲线，避免了传统固定阈值方法导致的过度严格或不足严格错误 | NA | 旨在提高单细胞RNA-seq数据中差异表达基因和细胞群的精确识别 | 单细胞RNA-seq数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 基因表达数据 | 多个模拟和已发表的实验数据集 |
| 22816 | 2024-08-09 |
DensityPath: an algorithm to visualize and reconstruct cell state-transition path on density landscape for single-cell RNA sequencing data
2019-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/bty1009
PMID:30535348
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研究论文 | 提出了一种名为DensityPath的算法，用于在单细胞RNA测序数据的密度景观上可视化和重建细胞状态转换路径 | DensityPath算法通过采用弹性嵌入的非线性降维方法，揭示数据内在结构，并从单细胞多模态密度景观中提取高密度水平集簇的拓扑特征，重建细胞状态转换的最优路径 | NA | 旨在解决单细胞RNA测序数据中细胞发育轨迹的可视化和重建问题 | 单细胞RNA测序数据中的细胞发育轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 弹性嵌入 | 单细胞RNA测序数据 | NA |
| 22817 | 2024-08-09 |
Hypermutagenesis in untreated adult gliomas due to inherited mismatch mutations
2019-06-15, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.32054
PMID:30536544
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研究论文 | 研究未治疗的成人胶质瘤中由于遗传性错配修复突变导致的超突变现象 | 首次识别出未经治疗成人胶质瘤中存在的新生超突变表型，并探讨了自发和治疗诱导的超突变进化 | NA | 揭示未治疗成人胶质瘤中超突变过程的新理解，并为胶质瘤治疗的免疫疗法提供临床意义 | 未经治疗和治疗后的超突变胶质瘤 | 数字病理学 | 脑瘤 | 全外显子测序（WES），全转录组测序（WTS），单细胞测序（SCS） | NA | 基因组数据 | 涉及未经治疗和治疗后的超突变胶质瘤样本 |
| 22818 | 2024-08-09 |
Deconstructing Retinal Organoids: Single Cell RNA-Seq Reveals the Cellular Components of Human Pluripotent Stem Cell-Derived Retina
2019-05, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1002/stem.2963
PMID:30548510
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术分析了从人类胚胎干细胞衍生的视网膜类器官在三个分化时间点的细胞组成 | 首次利用单细胞RNA测序技术揭示了视网膜类器官中关键细胞类型的有序生成过程 | NA | 探究视网膜类器官的细胞生物学特性及其相互作用 | 人类胚胎干细胞衍生的视网膜类器官 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个时间点的视网膜类器官样本 |
| 22819 | 2024-08-09 |
Network Inference from Single-Cell Transcriptomic Data
2019, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-4939-8882-2_10
PMID:30547403
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研究论文 | 本文探讨了利用单细胞转录组数据进行网络推断的优势和方法 | 利用单细胞转录组数据可以识别更复杂的非线性基因依赖关系，并推断特定条件下的调控网络 | NA | 研究如何利用单细胞转录组数据增强基因调控网络的推断 | 单细胞转录组数据中的基因依赖关系和调控网络 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 大量单细胞样本 |
| 22820 | 2024-08-09 |
Better Being Single? Omics Improves Kidney Organoids
2019, Nephron
IF:2.3Q2
DOI:10.1159/000496009
PMID:30554217
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术比较分析了两种肾脏类器官分化协议，并基于这些数据开发了一种新的分化协议以减少非肾脏细胞类型 | 开发了一种新的分化协议，旨在减少非肾脏细胞类型，同时不影响类器官上皮细胞的功能 | 文章指出，现有的分化协议未能产生纯净或全面的肾脏细胞，且存在非肾脏细胞类型的污染 | 比较不同肾脏类器官分化协议，并改进其功能 | 人类肾脏类器官及其分化协议 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及两种肾脏类器官分化协议的数据 |