单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 22581 - 22600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22581 | 2024-08-08 |
Can single cell RNA sequencing reshape the clinical biochemistry of hematology: New clusters of circulating blood cells
2021-12, Clinical and translational medicine
IF:7.9Q1
DOI:10.1002/ctm2.671
PMID:34898038
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在血液学临床生物化学中的应用及其对循环血细胞分类的影响 | scRNA-seq有助于深入理解疾病，识别疾病特异性目标组，并提出新的治疗策略 | scRNA-seq的应用需要标准化和规范化，并在大量健康和疾病患者中进行验证 | 研究scRNA-seq在临床决策和分子医学指导中的作用 | 循环血细胞的分类和分化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA序列 | 大量健康和疾病患者 |
| 22582 | 2024-08-08 |
Combinatorial immunotherapy induces tumor-infiltrating CD8+ T cells with distinct functional, migratory, and stem-like properties
2021-12, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003614
PMID:34903555
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研究论文 | 研究通过高维流式细胞术和单细胞RNA测序分析了组合免疫疗法对肿瘤浸润性CD8+ T细胞功能和迁移特性的影响 | 发现OX40/4-1BB激动剂扩展了一种干细胞样PD-1loKLRG-1+Ki-67+CD8+ T细胞亚群，与PD-(L)1阻断协同作用，显著增强了干细胞样TIL的存在 | 对单一疗法作用机制的理解尚不完全，且不清楚组合疗法是否会导致协同作用、引发新的免疫机制或产生叠加效应 | 探讨组合免疫疗法中各成分之间的相互作用机制 | 肿瘤浸润性淋巴细胞（TILs）及其在不同治疗方案下的功能和迁移特性 | 免疫学 | NA | 高维流式细胞术，单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自携带B16或MC38同基因肿瘤宿主的肿瘤浸润性淋巴细胞 |
| 22583 | 2024-08-08 |
Statistical tests for intra-tumour clonal co-occurrence and exclusivity
2021-12, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1009036
PMID:34910733
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研究论文 | 本文开发了一种名为GeneAccord的新统计测试框架，用于识别在同一肿瘤的不同亚克隆中发生改变的基因对，这些基因对在患者样本中以共现或克隆排他性方式过度表达 | 提出了GeneAccord统计测试框架，用于检测肿瘤内克隆共现和排他性，并考虑了克隆间的进化依赖性 | NA | 开发和验证一种新的统计方法，用于识别影响肿瘤进化和治疗结果的基因对 | 急性髓系白血病患者的单细胞测序数据 | NA | 急性髓系白血病 | 单细胞测序 | NA | 基因数据 | 123名急性髓系白血病患者 |
| 22584 | 2024-08-08 |
Preparation and Transfection of Populus tomentosa Mesophyll Protoplasts
2021-Nov-20, Bio-protocol
IF:1.0Q3
DOI:10.21769/BioProtoc.4220
PMID:34909441
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研究论文 | 本文详细介绍了一种简单且高效的方法来制备和转染毛白杨叶肉原生质体 | 提出了一种新的方法来克服木本植物中由于细胞壁富含果胶而难以分离叶肉原生质体的难题 | NA | 开发一种适用于木本植物的叶肉原生质体制备和转染技术 | 毛白杨叶肉原生质体 | NA | NA | 转染技术 | NA | 原生质体 | NA |
| 22585 | 2024-08-08 |
[Circulating tumor cells in the diagnosis and treatment of early and advanced prostate cancer]
2021-10-20, Zhonghua nan ke xue = National journal of andrology
PMID:34914273
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综述 | 本文总结了循环肿瘤细胞（CTC）技术在前列腺癌（PCa）诊断和治疗中的研究进展 | CTC检测已从简单的计数发展到表型分类，甚至结合特定基因表达（如AR, AR-V7等）和单细胞测序 | CTC技术在早期PCa诊断中的意义有限，主要价值在于晚期药物敏感性和预后评估 | 探讨CTC技术在PCa诊断和治疗中的应用及进展预测风险 | 循环肿瘤细胞（CTC）和前列腺癌（PCa） | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞测序 | NA | 血液样本 | NA |
| 22586 | 2024-08-08 |
Dupilumab Effects on Innate Lymphoid Cell and Helper T Cell Populations in Patients with Atopic Dermatitis
2021-Mar, JID innovations : skin science from molecules to population health
DOI:10.1016/j.xjidi.2021.100003
PMID:34909707
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研究论文 | 研究探讨了Dupilumab在特应性皮炎患者中对先天淋巴细胞和辅助T细胞群体的影响 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示了Dupilumab治疗前后Th2细胞和ILC2s的基因表达变化 | 研究样本仅限于27名日本患者，可能限制了结果的普遍性 | 探究Dupilumab治疗特应性皮炎的机制，特别是对Th2细胞和ILC2s的影响 | 特应性皮炎患者的Th2细胞和ILC2s | NA | 特应性皮炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 27名日本特应性皮炎患者 |
| 22587 | 2024-08-08 |
Reverse engineering of a mechanistic model of gene expression using metastability and temporal dynamics
2021, In silico biology
DOI:10.3233/ISB-210226
PMID:34897081
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研究论文 | 本文介绍了一种名为CARDAMOM的新算法，用于从时间戳单细胞RNA测序数据中推断基因调控网络（GRN），该算法利用了细胞分化的亚稳态和转录爆发的概念 | 首次描述了一种利用亚稳态概念进行GRN推断的方法 | NA | 开发一种新的算法来推断基因调控网络 | 单细胞RNA测序数据中的基因调控网络 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq | CARDAMOM算法 | 时间戳单细胞RNA测序数据 | NA |
| 22588 | 2024-08-08 |
Identifying Diagnostic and Prognostic Biomarkers and Candidate Therapeutic Drugs of Gastric Cancer Based on Transcriptomics and Single-Cell Sequencing
2021, Pathology oncology research : POR
DOI:10.3389/pore.2021.1609955
PMID:34899080
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研究论文 | 本研究通过转录组学和单细胞测序技术，筛选并验证了胃癌的诊断和预后生物标志物以及潜在的治疗药物靶点 | 本研究通过整合GSE54129和TCGA STAD数据集，识别了胃癌中的关键基因，并通过单细胞RNA测序进一步验证了这些基因的表达 | 本研究主要依赖于公共数据库和单细胞测序数据，可能存在样本选择偏倚和数据集的局限性 | 探索胃癌的新诊断和预后指标以及潜在的治疗靶点 | 胃癌的诊断、预后以及治疗药物敏感性 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 222个重叠基因，17个关键基因 |
| 22589 | 2024-08-08 |
MultiCapsNet: A General Framework for Data Integration and Interpretable Classification
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.767602
PMID:34899854
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MultiCapsNet的新型深度学习模型，该模型基于CapsNet和scCapsNet构建，具有数据集成简便和模型解释性高的优点 | MultiCapsNet模型能够处理模块化特征，这在生物学领域中常见，并且提供了数据源的重要性评分，无需额外的评分确定步骤 | NA | 展示MultiCapsNet作为可解释分类器处理模块化输入的能力 | MultiCapsNet模型在不同数据类型和应用场景下的性能 | 机器学习 | NA | 深度学习 | CapsNet | 数据集 | 三个不同数据类型和应用场景的数据集 |
| 22590 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Multiple Pathways and the Tumor Microenvironment Could Lead to Chemotherapy Resistance in Cervical Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.753386
PMID:34900703
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了宫颈癌组织中的细胞，揭示了化疗耐药性的分子机制及其与肿瘤微环境的关系 | 首次全面分析了预处理和化疗耐药的宫颈癌组织细胞，揭示了化疗耐药性的分子机制 | 研究样本仅包括宫颈鳞状细胞癌、宫颈腺癌和慢性宫颈炎，可能无法完全代表所有宫颈癌类型 | 旨在全面分析宫颈癌组织细胞，生成细胞群体的分子普查，并探讨化疗耐药性的分子机制 | 宫颈鳞状细胞癌、宫颈腺癌和慢性宫颈炎患者的活检组织 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 24,371个细胞 |
| 22591 | 2024-08-08 |
Chromatin Accessibility Predetermines Odontoblast Terminal Differentiation
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.769193
PMID:34901015
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序，揭示了牙本质生成过程中染色质可及性与成牙本质细胞终末分化的关系 | 首次展示了染色质可及性在成牙本质细胞终末分化中的作用，并通过时间序列ATAC-seq实验验证了ATF5的正向作用 | NA | 探讨染色质可及性如何影响成牙本质细胞的终末分化 | 成牙本质细胞的分化过程及相关的染色质可及性变化 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, ATAC-seq, H3K27Ac CUT and Tag | NA | RNA序列, 染色质可及性数据 | 使用E18.5的牙乳头细胞进行研究 |
| 22592 | 2024-08-08 |
Emerging Technologies to Study the Glomerular Filtration Barrier
2021, Frontiers in medicine
IF:3.1Q1
DOI:10.3389/fmed.2021.772883
PMID:34901088
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综述 | 本文综述了利用单细胞RNA测序、生物信息学空间转录组学以及肾脏类器官和芯片上的肾小球等技术，对肾小球滤过屏障病理生理学的理解 | 介绍了单细胞RNA测序和生物信息学空间转录组学等新技术在研究肾小球滤过屏障中的应用 | NA | 探讨新技术如何促进对肾小球病理生理学的理解，并推动个性化治疗策略的发展 | 肾小球滤过屏障的细胞和分子变化 | NA | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 22593 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiles Reveal Fibrocytes as Potential Targets of Cell Therapies for Abdominal Aortic Aneurysm
2021, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2021.753711
PMID:34901214
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了腹主动脉瘤（AAA）的小鼠模型，揭示了纤维细胞在AAA发展中的潜在作用 | 发现了多种巨噬细胞亚型，并首次定义了CD45COL1纤维细胞在AAA中的作用 | NA | 探索腹主动脉瘤形成和发病机制中不同血管和免疫细胞的作用 | 腹主动脉瘤（AAA）中的巨噬细胞、B细胞、T细胞、成纤维细胞、平滑肌细胞和内皮细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 小鼠和人类AAA组织 |
| 22594 | 2024-08-08 |
FEM: mining biological meaning from cell level in single-cell RNA sequencing data
2021, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.12570
PMID:34909283
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研究论文 | 本文开发了功能表达矩阵（FEM）算法，用于从单细胞RNA测序数据中挖掘细胞层面的生物学意义 | FEM算法能够利用所有表达基因的信息，将基因表达矩阵（GEM）转换为FEM，从而提供单个细胞的生物学意义 | NA | 探索表达数据分析中基因的生物学意义或功能 | 单细胞RNA测序数据中的细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-SEQ） | 功能表达矩阵（FEM）算法 | 基因表达数据 | 三个数据集（外周血单个核细胞、人肝脏和人胰腺） |
| 22595 | 2024-08-08 |
Transcriptomic and Single-Cell Analysis Reveals Regulatory Networks and Cellular Heterogeneity in Mouse Primary Sjögren's Syndrome Salivary Glands
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.729040
PMID:34912329
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研究论文 | 本文通过转录组和单细胞分析揭示了小鼠原发性Sjögren's综合征唾液腺中的调控网络和细胞异质性 | 本文通过RNA测序和单细胞RNA测序分析，揭示了与Sjögren's综合征病理生物学相关的重要通路和调控网络，以及疾病细胞群体的分子和细胞异质性 | NA | 阐明Sjögren's综合征的分子本质，为靶向治疗提供新见解 | 小鼠原发性Sjögren's综合征唾液腺 | 数字病理学 | 自身免疫病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了已建立的原发性Sjögren's综合征小鼠模型的下颌下腺 |
| 22596 | 2024-08-08 |
Identification of the Nerve-Cancer Cross-Talk-Related Prognostic Gene Model in Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.788671
PMID:34912722
|
研究论文 | 本研究构建了一个基于神经-癌症交叉对话相关基因（NCCGs）的预后模型，用于预测头颈部鳞状细胞癌（HNSC）的生存率 | 首次构建了基于NCCGs的预后模型，并验证了其在HNSC中的有效性 | NA | 探索神经-癌症交叉对话相关基因在头颈部鳞状细胞癌中的作用，并构建预后模型 | 头颈部鳞状细胞癌（HNSC）及其相关基因 | 数字病理学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 单细胞测序 | LASSO回归 | 基因表达数据 | TCGA-HNSC队列中共有23个基因上调或下调 |
| 22597 | 2024-08-08 |
Bone Marrow Adipocytes: A Critical Player in the Bone Marrow Microenvironment
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.770705
PMID:34912805
|
综述 | 本文综述了骨髓脂肪细胞（BMAs）的起源、分化及其在造血、成骨、破骨细胞生成和免疫调节中的作用 | BMAs被认为是骨髓相关疾病（如骨质疏松和白血病）的新治疗靶点 | NA | 探讨BMAs在骨髓微环境中的关键作用及其在疾病治疗中的潜在价值 | 骨髓脂肪细胞及其在骨髓微环境中的功能 | NA | 骨质疏松, 白血病 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 22598 | 2024-08-08 |
Molecular Characterization and Clinical Relevance of ANXA1 in Gliomas via 1,018 Chinese Cohort Patients
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.777182
PMID:34912807
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研究论文 | 本研究通过对中国1,018名胶质瘤患者的RNA测序和全外显子测序数据进行分析，探讨了ANXA1在胶质瘤中的分子特征及其临床相关性 | 首次揭示了ANXA1在胶质瘤中的表达与恶性进展、临床行为及患者生存结果的密切关系，并发现其在M2巨噬细胞和间质型肿瘤细胞中的高表达 | NA | 探讨ANXA1在胶质瘤中的生物学作用及其临床意义 | ANXA1在胶质瘤中的表达及其对患者生存结果的影响 | 数字病理学 | 脑瘤 | RNA测序, 全外显子测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1,018名中国胶质瘤患者, 286例全外显子测序数据, 270例不同组织区域的胶质母细胞瘤样本, 7,630个单细胞 |
| 22599 | 2024-08-08 |
A Clustering Ensemble Method for Cell Type Detection by Multiobjective Particle Optimization
2023 Jan-Feb, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2021.3132400
PMID:34860653
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研究论文 | 本文提出了一种基于多目标粒子优化的聚类集成算法CEMP，用于通过单细胞RNA测序数据检测细胞类型 | 引入了一种多子空间投影方法，用于将原始数据映射到低维子空间，以检测复杂的数据结构，并提出了一种聚类集成优化方法 | NA | 开发新的计算方法以揭示细胞群体中的细胞类型 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 聚类集成算法 | 基因表达数据 | 9个真实单细胞RNA测序数据集 |
| 22600 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals that BMPR2 mutation regulates right ventricular function via ID genes
2022-07, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00327-2021
PMID:34857612
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了BMPR2突变通过ID基因调控右心室功能 | 首次揭示了BMPR2信号通过ID和USP9X调控心脏分化，并发现ID1和ID3表达缺失导致CHD-PAH患者心肌细胞功能障碍 | NA | 旨在阐明BMPR2信号是否通过下游效应器ID蛋白在心脏发育过程中作用，从而促进CHD-PAH患者的PAH进展 | BMPR2突变对右心室功能的影响及ID基因的作用 | 数字病理学 | 先天性心脏病相关肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 25只心脏特异性Id 1/3敲除小鼠，12只发展出轻度PAH；ID1和ID3双敲除人类胚胎干细胞 |