单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 24049 篇文献，本页显示第 22581 - 22600 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22581 | 2024-08-09 |
Systematic expression analysis of ligand-receptor pairs reveals important cell-to-cell interactions inside glioma
2019-05-22, Cell communication and signaling : CCS
IF:8.2Q1
DOI:10.1186/s12964-019-0363-1
PMID:31118022
|
研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据，揭示了胶质瘤内部细胞间的相互作用 | 首次利用单细胞RNA测序数据和TCGA数据，系统地揭示了胶质瘤内部细胞间的相互作用，并构建了预测胶质瘤患者预后的机器学习模型 | NA | 揭示胶质瘤内部细胞间的相互作用，并发现潜在的预后标志物 | 胶质瘤细胞及其相互作用 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | 机器学习模型 | RNA测序数据 | 6341个胶质瘤细胞 |
| 22582 | 2024-08-09 |
Decomposing Cell Identity for Transfer Learning across Cellular Measurements, Platforms, Tissues, and Species
2019-05-22, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2019.04.004
PMID:31121116
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研究论文 | 本文介绍了scCoGAPS和projectR工具，用于从源单细胞RNA测序数据集定义潜在空间，并通过迁移学习在独立目标数据集中评估这些潜在空间 | 提出了scCoGAPS和projectR工具，通过迁移学习在不同生物学背景下识别共享的生物学特征，超越了依赖标记基因或整体分子身份的传统方法 | NA | 探索单细胞RNA测序数据通过潜在空间表示的分析方法 | 单细胞RNA测序数据集及其在不同组织和物种中的应用 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 包括发育中的小鼠视网膜、成年小鼠视网膜、人类视网膜发育时间序列、发育中的大脑单细胞RNA测序数据集、染色质可及性数据和鼠细胞类型图谱 |
| 22583 | 2024-08-09 |
Wnt Signaling Separates the Progenitor and Endocrine Compartments during Pancreas Development
2019-05-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.04.083
PMID:31116975
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研究论文 | 研究通过单细胞RNA测序分析人胚胎干细胞在球状聚集体中分化时，Wnt信号通路在胰腺发育中分离祖细胞和内分泌细胞区室的作用 | 揭示了Wnt信号通路抑制在体外分化过程中对内分泌细胞比例增加的作用，为1型糖尿病治疗提供了新的见解 | NA | 探索体外分化过程中人胚胎干细胞自主反应，提高分化效率并控制细胞群体的最终组成 | 人胚胎干细胞在球状聚集体中的分化过程及Wnt信号通路的作用 | NA | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22584 | 2024-08-09 |
An Atlas of Vagal Sensory Neurons and Their Molecular Specialization
2019-05-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.04.096
PMID:31116992
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术对神经嵴（颈静脉）和基板（结节）来源的迷走神经节中的神经元类型进行了全面的识别、分类和验证 | 本文揭示了来自不同胚胎起源的神经元之间的重要差异，并发现了多种先前未预料到的神经元类型 | NA | 研究迷走神经的感觉功能及其在心血管和胃肠道系统中的作用 | 迷走神经节中的神经元类型及其分子特化 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 22585 | 2024-08-09 |
Differential microglia and macrophage profiles in human IDH-mutant and -wild type glioblastoma
2019-May-03, Oncotarget
DOI:10.18632/oncotarget.26863
PMID:31139325
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研究论文 | 本研究通过流式细胞术、免疫荧光技术和单细胞RNA测序，比较了IDH突变型和野生型胶质母细胞瘤中与肿瘤相关的微胶质细胞和巨噬细胞的差异 | 首次直接比较了未经治疗的IDH突变型与野生型胶质母细胞瘤中与肿瘤相关的微胶质细胞和巨噬细胞的差异 | 研究样本仅限于四个未经治疗的IDH突变型胶质母细胞瘤 | 探讨IDH突变型和野生型胶质母细胞瘤中微胶质细胞和巨噬细胞的差异及其对预后的影响 | IDH突变型和野生型胶质母细胞瘤中的微胶质细胞和巨噬细胞 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 四个未经治疗的IDH突变型胶质母细胞瘤 |
| 22586 | 2024-08-09 |
NormExpression: An R Package to Normalize Gene Expression Data Using Evaluated Methods
2019, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2019.00400
PMID:31114611
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研究论文 | 本文介绍了一个名为NormExpression的R包，用于使用评估方法对基因表达数据进行标准化 | 提出了一种新的评估指标AUCVC，并结合mSCC评估了14种常用标准化方法，确保了指标和数据集的一致性 | NA | 旨在建立指导标准化方法评估的原则，并提供一个框架帮助研究人员选择最佳标准化方法 | 基因表达数据的标准化方法及其评估 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序（bulk RNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 使用scRNA-seq和bulk RNA-seq数据评估了14种常用标准化方法 |
| 22587 | 2024-08-09 |
Tracking tumor evolution one-cell-at-a-time
2019, Molecular & cellular oncology
IF:2.6Q3
DOI:10.1080/23723556.2019.1590089
PMID:31131309
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研究论文 | 本文利用单细胞转录组学研究了口腔鳞状细胞癌中表型性肿瘤内异质性对药物诱导肿瘤演化的影响 | 采用单细胞转录组学技术，从单细胞层面追踪肿瘤演化 | NA | 探究肿瘤内异质性对药物治疗反应的影响 | 口腔鳞状细胞癌中的肿瘤内异质性 | 数字病理学 | 口腔癌 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 来自患者的原代细胞 |
| 22588 | 2024-08-09 |
Aging Human Hematopoietic Stem Cells Manifest Profound Epigenetic Reprogramming of Enhancers That May Predispose to Leukemia
2019-08, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-18-1474
PMID:31085557
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研究论文 | 研究揭示了人类造血干细胞随着年龄增长出现的表观遗传重编程现象，这种重编程可能增加患白血病的风险 | 首次综合分析了人类正常衰老过程中造血干细胞的表观基因组和转录组变化，特别是单细胞RNA测序的应用 | NA | 探讨年龄相关的造血干细胞表观遗传重编程及其与白血病风险的关联 | 人类造血干细胞的表观遗传和转录组变化 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 涉及4,646个活跃增强子、3,091个双价启动子以及多个表观遗传修饰因子和关键造血转录因子 |
| 22589 | 2024-08-09 |
RNA-seq in Skeletal Biology
2019-08, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-019-00517-x
PMID:31093870
|
综述 | 本文综述了最先进的转录组分析方法及其在骨骼生物学领域的最新应用 | 介绍了单细胞RNA测序等先进技术在识别骨骼组织中新细胞类型的应用 | NA | 综述转录组分析方法在骨骼生物学中的应用 | 骨骼生物学中的基因和转录因子 | NA | NA | RNA-seq | NA | 转录组数据 | 小动物模型、大动物模型、人类组织和细胞 |
| 22590 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq reveals distinct dynamic behavior of sex chromosomes during early human embryogenesis
2019-07, Molecular reproduction and development
IF:2.7Q2
DOI:10.1002/mrd.23162
PMID:31094050
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了1607个来自99个人类早期胚胎的单细胞，揭示了性染色体在人类早期胚胎发育中的动态行为 | 首次系统地比较了男性与女性胚胎在胚胎基因组激活后的性染色体表达差异，揭示了性染色体在早期胚胎发育中的动态表达和沉默过程 | 研究样本量有限，且仅使用了现有的单细胞RNA测序数据 | 探讨性染色体在人类早期胚胎发育中的分子机制及其对胚胎发育的影响 | 人类早期胚胎的性染色体表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1607个单细胞来自99个人类早期胚胎 |
| 22591 | 2024-08-09 |
Tubular cell and keratinocyte single-cell transcriptomics applied to lupus nephritis reveal type I IFN and fibrosis relevant pathways
2019-07, Nature immunology
IF:27.7Q1
DOI:10.1038/s41590-019-0386-1
PMID:31110316
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析狼疮性肾炎患者的肾和皮肤活检样本，揭示了I型干扰素和纤维化相关通路 | 首次应用单细胞RNA测序技术于狼疮性肾炎患者的肾和皮肤活检样本，揭示了I型干扰素反应和纤维化相关通路 | NA | 研究狼疮性肾炎的分子和细胞过程，以及其异质性 | 狼疮性肾炎患者的肾和皮肤活检样本 | 数字病理学 | 狼疮性肾炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22592 | 2024-08-09 |
Regulation of Feeding-Related Behaviors by Arcuate Neuropeptide Y Neurons
2019-06-01, Endocrinology
IF:3.8Q2
DOI:10.1210/en.2019-00056
PMID:31089694
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综述 | 本文综述了下丘脑弓状核中的神经肽Y（NPY）神经元在调节与进食相关行为中的作用 | 结合遗传小鼠模型和化学遗传学及光遗传学技术，揭示了NPY神经元在能量消耗、产热、身体活动、食物寻求行为及焦虑控制中的额外功能 | NA | 探讨NPY神经元在个体生存回路中潜在的交互途径中的整合作用 | 下丘脑弓状核中的NPY神经元及其在行为控制中的作用 | 神经科学 | NA | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 22593 | 2024-08-09 |
Novel insights into cell cycle regulation of cell fate determination
2019-Jun, Journal of Zhejiang University. Science. B
DOI:10.1631/jzus.B1900197
PMID:31090272
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综述 | 本文综述了细胞周期调控在细胞命运决定中的最新进展 | 利用高分辨率表观基因组分析、单细胞转录组学和细胞周期报告系统提供了新的见解 | NA | 探讨细胞周期调控在细胞命运决定中的作用及其在转化医学中的潜在应用 | 干细胞/祖细胞的自我更新和多谱系分化能力 | NA | NA | 高分辨率表观基因组分析、单细胞转录组学 | NA | 表观基因组数据、转录组数据 | NA |
| 22594 | 2024-08-09 |
Oncogenes and Clotting Factors: The Emerging Role of Tumor Cell Genome and Epigenome in Cancer-Associated Thrombosis
2019-Jun, Seminars in thrombosis and hemostasis
IF:3.6Q1
DOI:10.1055/s-0039-1687891
PMID:31096313
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研究论文 | 探讨肿瘤细胞基因组和表观基因组在癌症相关血栓形成中的新兴作用 | 提出癌症可能作为促凝复合体运作，其中单个细胞及其主导群体表达不同的促凝表型，对止血系统产生净影响 | NA | 研究癌症进展的生物学和遗传学方面与癌症相关血栓形成机制之间的联系 | 胶质母细胞瘤的多形性，以及肿瘤细胞基因组和表观基因组在癌症相关血栓形成中的作用 | 数字病理学 | 脑瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 胶质母细胞瘤样本 |
| 22595 | 2024-08-09 |
Single-Cell Profiles and Clinically Useful Properties of Human Mesenchymal Stem Cells of Adipose and Bone Marrow Origin
2019-06, The American journal of sports medicine
DOI:10.1177/0363546519848678
PMID:31100005
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研究论文 | 本文探讨了脂肪和骨髓来源的人间充质干细胞在单细胞和批量细胞水平上的特征和差异，并研究了这两种细胞在治疗骨关节炎中的临床结果，为更精确的临床应用提供指导。 | 本文通过单细胞RNA测序分析和临床试验的元分析，揭示了脂肪来源干细胞在转录组异质性、能量产生依赖性和免疫抑制能力方面的优势。 | NA | 探索脂肪和骨髓来源的人间充质干细胞的特征和差异，并研究其在治疗骨关节炎中的临床效果。 | 脂肪来源干细胞（ADSCs）和骨髓间充质干细胞（BMSCs）。 | 细胞生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 来自同一供体的ADSCs和BMSCs |
| 22596 | 2024-08-09 |
MARS-seq2.0: an experimental and analytical pipeline for indexed sorting combined with single-cell RNA sequencing
2019-06, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-019-0164-4
PMID:31101904
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研究论文 | 本文介绍了MARS-seq2.0，一种结合索引排序和单细胞RNA测序的实验和分析流程 | MARS-seq2.0在成本、重复性和减少污染方面进行了改进，结合了亚微升反应体积、酶混合物的优化和增强的分析流程 | NA | 开发一种高效的集成流程，用于索引排序和大规模并行单细胞RNA测序，以识别不同组织和疾病中的独特细胞类型 | 人类组织中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 超过100万个细胞 |
| 22597 | 2024-08-09 |
Low ambient humidity impairs barrier function and innate resistance against influenza infection
2019-05-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1902840116
PMID:31085641
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研究论文 | 研究低湿度环境对小鼠流感感染屏障功能和先天抵抗力的影响 | 首次揭示了低湿度环境通过影响黏膜纤毛清除、先天抗病毒防御和组织修复，增强小鼠对流感病毒的易感性 | 研究仅限于特定基因型的小鼠模型，可能不适用于所有人群 | 探究低湿度环境对宿主流感病毒感染防御和疾病结果的影响 | Mx1同源小鼠在低湿度环境下的流感病毒感染反应 | NA | 流感 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | Mx1同源小鼠 |
| 22598 | 2024-08-09 |
Comments on the model parameters in "SiFit: inferring tumor trees from single-cell sequencing data under finite-sites models"
2019-05-16, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-019-1692-5
PMID:31096998
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22599 | 2024-08-09 |
Hydro-Seq enables contamination-free high-throughput single-cell RNA-sequencing for circulating tumor cells
2019-05-15, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-10122-2
PMID:31092822
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研究论文 | 本文介绍了一种名为Hydro-Seq的高通量单细胞RNA测序技术，用于循环肿瘤细胞的无污染分析 | Hydro-Seq技术具有高细胞捕获效率和污染去除能力，能够成功对666个来自21名乳腺癌患者的循环肿瘤细胞进行高通量单细胞RNA测序 | NA | 开发一种新的技术以提高循环肿瘤细胞的单细胞RNA测序效率和减少血液细胞污染 | 循环肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 666个循环肿瘤细胞，来自21名乳腺癌患者 |
| 22600 | 2024-08-09 |
High-Throughput Single-Cell Transcriptome Profiling of Plant Cell Types
2019-05-14, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.04.054
PMID:31091459
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research paper | 本文利用高吞吐量的Drop-seq方法对拟南芥根部的超过12,000个细胞进行单细胞转录组分析 | 首次广泛应用单细胞转录组测序技术于植物细胞类型分析，揭示了不同细胞类型及其标记基因，并展示了环境条件对植物发育过程的影响 | NA | 展示单细胞RNA测序技术在植物发育过程分析中的应用及其对外部刺激的响应 | 拟南芥根部的细胞类型及其在不同环境条件下的变化 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 超过12,000个细胞 |