单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 24253 篇文献，本页显示第 22441 - 22460 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22441 | 2024-08-09 |
Recent advances in understanding neocortical development
2019, F1000Research
DOI:10.12688/f1000research.20332.1
PMID:31681469
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综述 | 本文综述了最近在理解新皮质发育方面的突出进展，特别关注背侧前体细胞和兴奋性神经元 | 强调了神经干细胞在不同类别中的分化及其增殖和神经元产生的过程，以及最近关于神经元迁移的发现 | NA | 总结新皮质发育的最新进展，并探讨其进化和疾病机制 | 新皮质发育，特别是背侧前体细胞和兴奋性神经元 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22442 | 2024-08-09 |
Subregion-specific rules govern the distribution of neuronal immediate-early gene induction
2020-09-22, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1913658116
PMID:31636216
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研究论文 | 本文研究了即时早期基因（IEG）在神经元集合中的分布规律，特别是在背侧纹状体中的刺状投射神经元（SPN）中，通过急性可卡因暴露后的表达情况。 | 发现了IEG表达的区域特异性规则，并观察到IEG表达的神经元集合形成空间定义的集群，这些集群与多个IEG的协同和强表达相关。 | 研究主要集中在背侧纹状体的SPN中，未涵盖所有脑结构和刺激类型。 | 探讨IEG在神经元集合中的分布规律及其与记忆形成的关系。 | 背侧纹状体中的刺状投射神经元（SPN）和皮质神经元的IEG表达。 | 神经科学 | NA | 单分子荧光原位杂交（smFISH） | NA | RNA序列 | 小鼠背侧纹状体中的SPN和皮质神经元 |
| 22443 | 2024-08-09 |
deepMc: Deep Matrix Completion for Imputation of Single-Cell RNA-seq Data
2020-07, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2019.0278
PMID:31657645
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研究论文 | 本文提出了一种基于深度矩阵分解的方法deepMc，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 利用深度学习技术解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中的缺失值问题 | 单细胞RNA测序数据中的基因表达数据 | 机器学习 | NA | 深度矩阵分解 | 深度学习模型 | 基因表达数据 | NA |
| 22444 | 2024-08-09 |
Migraine-associated gene expression in cell types of the central and peripheral nervous system
2020-04, Cephalalgia : an international journal of headache
IF:5.0Q1
DOI:10.1177/0333102419877834
PMID:31660761
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，分析了中枢和周围神经系统中与偏头痛相关的基因表达情况 | 首次通过单细胞RNA测序技术，确定了与偏头痛相关的基因在中枢和周围神经系统中的具体细胞类型表达 | NA | 确定与偏头痛相关的基因在神经系统中的细胞类型特异性表达 | 中枢和周围神经系统中的细胞类型 | NA | 偏头痛 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 22445 | 2024-08-09 |
SINC: a scale-invariant deep-neural-network classifier for bulk and single-cell RNA-seq data
2020-03-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz801
PMID:31647523
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SINC的尺度不变深度神经网络分类器，用于批量和单细胞RNA-seq数据分析 | SINC分类器能够在不进行序列深度缩放的情况下直接使用原始计数数据，且在不同序列深度估计下给出相同结果 | NA | 开发一种尺度不变的深度神经网络分类器，用于样本分类，如正常与癌变样本的区分 | 批量和单细胞RNA-seq数据 | 机器学习 | NA | RNA-seq | 深度神经网络 | RNA-seq数据 | 九个批量和单细胞数据集 |
| 22446 | 2024-08-09 |
PlanExp: intuitive integration of complex RNA-seq datasets with planarian omics resources
2020-03-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btz802
PMID:31647529
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研究论文 | 本文介绍了一个名为PlanExp的网络应用程序，用于探索和可视化不同RNA-seq实验（传统和单细胞RNA-seq）中的基因表达数据，特别是针对地中海扁虫Schmidtea mediterranea | PlanExp提供了多种交互式绘图工具，如热图、散点图等，并整合了PlanNET网络应用程序，实现了基因组和转录水平的序列注释链接，以及基因/蛋白质网络编辑器和单细胞RNA-seq数据的遗传相互作用预测 | NA | 旨在帮助研究人员理解和分析扁虫再生和发育过程中的大量转录组和基因组数据 | 地中海扁虫Schmidtea mediterranea的基因表达数据 | 生物信息学 | NA | RNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22447 | 2024-08-09 |
Macrophage-Derived CXCL9 and CXCL10 Are Required for Antitumor Immune Responses Following Immune Checkpoint Blockade
2020-01-15, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-1868
PMID:31636098
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研究论文 | 研究免疫检查点阻断治疗后，巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10在抗肿瘤免疫反应中的作用 | 首次揭示了巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10在免疫检查点阻断治疗中对T细胞招募和治疗效果的关键作用 | NA | 探讨免疫检查点阻断治疗中，巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10对T细胞招募和治疗效果的影响 | 巨噬细胞衍生的CXCL9和CXCL10在免疫检查点阻断治疗中的作用 | 免疫学 | NA | NanoString-based分析、流式细胞术、细胞珠阵列、单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq | 包括小鼠模型和接受免疫检查点抑制剂治疗的患者 |
| 22448 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA-seq Identifies Cell Diversity in Embryonic Salivary Glands
2020-01, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/0022034519883888
PMID:31644367
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胚胎期12天的下颌下腺和腮腺中的14,441个细胞的转录组，以揭示这些腺体在芽形成初期的分子特征 | 首次全面描述了芽形成阶段特定的细胞分子标志，并提供了胚胎期腮腺的转录组数据，尤其是对未充分研究的间充质细胞群体 | NA | 探索胚胎期唾液腺中细胞多样性的分子基础 | 胚胎期12天的下颌下腺和腮腺中的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 14,441个细胞 |
| 22449 | 2024-08-09 |
Single-Cell Sequencing of Mouse Heart Immune Infiltrate in Pressure Overload-Driven Heart Failure Reveals Extent of Immune Activation
2019-12-17, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，分析了在小鼠压力超负荷诱导的心力衰竭模型中心脏免疫浸润的组成和免疫激活情况 | 揭示了在心力衰竭中，除了已知的巨噬细胞和T淋巴细胞外，中性粒细胞、B细胞、自然杀伤细胞和肥大细胞等多种免疫细胞类型也参与了免疫激活 | NA | 探究压力超负荷诱导的心力衰竭中的心脏免疫反应 | 小鼠心脏中的免疫细胞亚群及其在心力衰竭中的变化 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠和人类样本 |
| 22450 | 2024-08-09 |
Isolation of Cardiomyocytes Undergoing Mitosis With Complete Cytokinesis
2019-12-06, Circulation research
IF:16.5Q1
DOI:10.1161/CIRCRESAHA.119.314908
PMID:31648614
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研究论文 | 本研究开发了一种新技术，通过使用分子信标（MBs）和荧光激活细胞分选（FACS）来分离完成细胞分裂/胞质分裂的心肌细胞 | 本研究提出了一种新的方法，通过分子信标（MBs）和荧光激活细胞分选（FACS）来分离具有真正有丝分裂潜力的心肌细胞，这是对基于DNA含量的现有方法的替代 | NA | 深入理解心肌细胞分裂的机制，特别是那些完成细胞分裂/胞质分裂的心肌细胞 | 从人诱导多能干细胞衍生的真正增殖的心肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 荧光激活细胞分选（FACS），单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 22451 | 2024-08-09 |
Inhibiting repressive epigenetic modification promotes telomere rejuvenation in somatic cell reprogramming
2019-12, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.201901486RR
PMID:31645134
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研究论文 | 研究通过小分子筛选和实验验证，发现褪黑素能促进体细胞核转移（SCNT）重编程过程中的端粒恢复，提高克隆动物的生产效率 | 首次研究了褪黑素处理与SCNT介导重编程中端粒恢复的关系，并发现褪黑素能抑制与基因沉默相关的异染色质表观遗传修饰 | NA | 提高体细胞核转移重编程的效率，促进克隆动物的生产 | 体细胞核转移重编程过程中的端粒恢复和表观遗传修饰 | NA | NA | 单细胞RNA测序，定量FISH实验 | NA | RNA | SCNT衍生胚胎 |
| 22452 | 2024-08-09 |
Single-cell study of neural stem cells derived from human iPSCs reveals distinct progenitor populations with neurogenic and gliogenic potential
2019-Dec, Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms
IF:1.3Q4
DOI:10.1111/gtc.12731
PMID:31651061
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了来源于人诱导多能干细胞（iPSCs）和胎脑的神经干细胞（NSCs），揭示了神经发生和胶质发生前体细胞的异质性 | 发现了来源于iPS细胞的NSC与胎脑来源的NSC在神经发生前体细胞的异质性及自发分化潜能上的差异 | NA | 研究神经干细胞阶段细胞类型的内在异质性 | 来源于人诱导多能干细胞和胎脑的神经干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多个来源于人诱导多能干细胞的神经干细胞系和一个来源于胎脑的神经干细胞系 |
| 22453 | 2024-08-09 |
A single-cell view of tissue regeneration in plants
2019-12, Current opinion in plant biology
IF:8.3Q1
DOI:10.1016/j.pbi.2019.09.003
PMID:31655397
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综述 | 本文综述了利用先进的分子遗传学和计算技术在植物组织再生中对单个细胞的研究进展 | 通过单细胞RNA测序（ScRNA-seq）和实时成像技术，定义了再生组织中的形态发生和细胞变化，并利用迭代计算和实验方法阐明了候选机制 | NA | 探讨植物组织再生的细胞机制 | 植物组织再生中的细胞死亡、分裂、去分化和转分化过程 | 分子遗传学 | NA | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 22454 | 2024-08-09 |
Ontogenic Changes in Hematopoietic Hierarchy Determine Pediatric Specificity and Disease Phenotype in Fusion Oncogene-Driven Myeloid Leukemia
2019-12, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-18-1463
PMID:31662298
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研究论文 | 本研究探讨了融合致癌基因在儿童急性髓系白血病中的年龄特异性及其对疾病表型的影响 | 首次揭示了融合致癌基因在儿童急性髓系白血病中的年龄依赖性作用，并发现关键转录因子的活性差异 | NA | 研究融合致癌基因在儿童急性髓系白血病中的作用及其与年龄的关系 | 融合致癌基因、儿童急性髓系白血病、关键转录因子 | 数字病理学 | 白血病 | 染色质可及性分析、单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 使用诱导性转基因小鼠模型进行分析 |
| 22455 | 2024-08-09 |
Tumour-associated macrophage-derived interleukin-1 mediates glioblastoma-associated cerebral oedema
2019-12-01, Brain : a journal of neurology
IF:10.6Q1
DOI:10.1093/brain/awz331
PMID:31665239
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研究论文 | 本文研究了肿瘤相关巨噬细胞衍生的白细胞介素-1在胶质母细胞瘤相关脑水肿中的作用，并探讨了地塞米松对此过程的影响。 | 首次证明了地塞米松能阻断骨髓来源和脑内巨噬细胞中的白细胞介素-1产生，并抑制其下游效应，同时揭示了白细胞介素-1信号通路在胶质母细胞瘤相关脑水肿治疗中的潜在价值。 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，临床应用的实际效果和副作用需要进一步验证。 | 探讨胶质母细胞瘤相关脑水肿的机制及潜在治疗策略。 | 胶质母细胞瘤、肿瘤相关巨噬细胞、脑水肿、地塞米松治疗效果。 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | NA | NA | NA | 涉及骨髓来源和脑内巨噬细胞的细胞培养及小鼠模型实验。 |
| 22456 | 2024-08-09 |
Non-templated addition and template switching by Moloney murine leukemia virus (MMLV)-based reverse transcriptases co-occur and compete with each other
2019-11-29, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA119.010676
PMID:31640989
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研究论文 | 本研究详细分析了基于Moloney鼠白血病病毒（MMLV）的逆转录酶在模板切换过程中的偏倚，特别是RNA模板5'端序列和性质（加帽与非加帽）对这些偏倚的影响 | 研究发现非模板添加和模板切换是同时且相互竞争的过程，这与当前对模板切换过程的理解相反 | NA | 探讨单细胞RNA测序中模板切换机制的细节及其影响因素 | Moloney鼠白血病病毒（MMLV）型逆转录酶的模板切换特性和非模板添加的组成 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | RNA | NA |
| 22457 | 2024-08-09 |
Dynamics of trophoblast differentiation in peri-implantation-stage human embryos
2019-11-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1911362116
PMID:31636193
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析培养的人类囊胚细胞，定义了在绒毛膜形成前的第8天至第12天植入期周围胎盘滋养层细胞的转录组图谱 | 首次详细描述了人类胚胎植入期间滋养层细胞的动态分化过程，并揭示了不同类型滋养层细胞的转录组特征 | NA | 研究人类胚胎植入期间滋养层细胞的分化动态及其转录组特征 | 人类胚胎植入期间的滋养层细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 从培养的胚胎中手动挑选的3种早期胎盘细胞类型（细胞滋养层细胞、合体滋养层细胞和迁移性滋养层细胞） |
| 22458 | 2024-08-09 |
Immunology Driven by Large-Scale Single-Cell Sequencing
2019-11, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2019.09.004
PMID:31645299
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研究论文 | 本文讨论了利用大规模单细胞多组学数据和改进的计算方法来解析免疫细胞身份的必要性 | 提出了结合大规模单细胞多组学数据和先进计算方法来深入研究免疫细胞的多样性和可塑性 | NA | 探讨如何利用大规模单细胞多组学数据和计算方法来解析免疫细胞身份 | 免疫细胞的多样性和可塑性 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 多组学数据 | 大规模 |
| 22459 | 2024-08-09 |
Single-pollen-cell sequencing for gamete-based phased diploid genome assembly in plants
2019-11, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.251033.119
PMID:31649061
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研究论文 | 本文介绍了一种结合花粉原生质体分离和单细胞DNA扩增技术的新方法，用于植物配子阶段的双倍体基因组组装 | 本文首次成功利用单花粉细胞测序技术，实现了梨基因组的高效准确分相，揭示了梨参考基因组中8.12%的基因存在镶嵌式组装 | 该方法目前仅在梨这一特定植物物种中得到验证，其普遍适用性有待进一步研究 | 开发一种新的方法，用于植物配子阶段的双倍体基因组组装，并分析基因表达的等位效应 | 梨基因组及其在花粉中减数分裂期间的重组信息 | 基因组学 | NA | 单细胞测序 | NA | 序列数据 | 12个花粉细胞 |
| 22460 | 2024-08-09 |
A chemical probe of CARM1 alters epigenetic plasticity against breast cancer cell invasion
2019-10-28, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.47110
PMID:31657716
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研究论文 | 本文介绍了一种具有前药特性的CARM1化学探针，能够改变表观遗传可塑性，抑制乳腺癌细胞侵袭 | 发现了一种新的CARM1依赖机制，用于癌症转移，并开发了一种化学探针来靶向这一过程 | NA | 研究CARM1蛋白在乳腺癌细胞侵袭中的作用，并开发相应的化学探针 | CARM1蛋白及其在乳腺癌细胞侵袭中的作用 | NA | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |