单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 24253 篇文献，本页显示第 22421 - 22440 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22421 | 2024-08-09 |
Evaluation of single-cell classifiers for single-cell RNA sequencing data sets
2020-09-25, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbz096
PMID:31675098
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研究论文 | 本文对九种专门为单细胞RNA测序数据集设计的分类软件工具进行了全面且公正的评估 | 提出了使用集成投票方法提高预测准确性，并在非理想情况下，基于簇级相似性的工具表现出优越性能 | 仅使用单细胞分类器难以捕捉到新的细胞类型，即使有分配'未分配'标签的功能 | 评估单细胞RNA测序数据集的分类工具，并提供选择和应用这些工具的指南 | 单细胞RNA测序数据集的细胞类型分类工具 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | 随机森林、相关性分析、XGBoost | 单细胞RNA测序数据 | 涉及小规模和类别不平衡的参考数据集 |
| 22422 | 2024-08-09 |
Differential expression of α6 and β1 integrins reveals epidermal heterogeneity at single-cell resolution
2020-03, Journal of cellular biochemistry
IF:3.0Q3
DOI:10.1002/jcb.29487
PMID:31680320
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研究论文 | 本研究通过基于α6和β1整合素差异表达的荧光激活细胞分选（FACS）策略，结合转录组分析，探索了表皮异质性 | 本研究提出了一种预分选方法，用于研究整合素表达与表皮异质性的关系，并识别了多种表皮细胞类型及其表达谱 | NA | 探索表皮异质性及整合素表达与表皮细胞类型的关系 | 表皮细胞及其整合素表达 | 数字病理学 | NA | 荧光激活细胞分选（FACS），RNA-seq | NA | 转录组数据 | 从C57BL/6小鼠背部皮肤获取的表皮细胞，共576个单细胞 |
| 22423 | 2024-08-09 |
TM3'seq: A Tagmentation-Mediated 3' Sequencing Approach for Improving Scalability of RNAseq Experiments
2020-01-07, G3 (Bethesda, Md.)
DOI:10.1534/g3.119.400821
PMID:31676507
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研究论文 | 本文介绍了一种名为TM3'seq的新型3'富集文库制备协议，该协议使用Tn5转座酶并保留每个步骤中的样本身份，旨在提高RNA-seq实验的可扩展性 | TM3'seq协议能够在6小时内处理96个样本，且只需3小时的直接操作时间，成本仅为每样本1.5美元，显著降低了RNA-seq实验的成本和时间 | NA | 开发一种成本和时间效率高的RNA-seq文库制备方法，以促进大规模RNA-seq实验的普及 | 人类和其他RNA样本的转录组 | 基因组学 | NA | RNA-seq | NA | RNA | 多种人类和其他RNA样本 |
| 22424 | 2024-08-09 |
Developmental and cellular age direct conversion of CD4+ T cells into RORγ+ or Helios+ colon Treg cells
2020-01-06, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20190428
PMID:31685531
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研究论文 | 研究探讨了CD4+ T细胞向RORγ+或Helios+结肠Treg细胞的定向分化 | 首次揭示了CD4+ Tconv细胞能够根据细胞或个体的年龄差异分化为RORγ+和Helios+ pTreg细胞，为结肠Treg细胞的生理适应性提供了新见解 | NA | 阐明结肠中RORγ+和Helios+ Treg细胞的起源和关系 | CD4+ T细胞、RORγ+和Helios+ Treg细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用单个结肠化和小鼠模型进行研究 |
| 22425 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Yes-Associated Protein 1-Dependent Hepatic Mesothelial Progenitors in Fibrolamellar Carcinoma
2020-01, The American journal of pathology
DOI:10.1016/j.ajpath.2019.09.018
PMID:31669305
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了来源于患者的纤维板层癌异种移植模型，并识别了治疗靶点 | 首次发现Yes相关蛋白1依赖的肝间皮祖细胞在纤维板层癌中的作用，并证实抑制YAP1可显著减少细胞生长和迁移 | NA | 探索纤维板层癌的治疗靶点 | 纤维板层癌细胞及其治疗靶点 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 来源于患者的纤维板层癌异种移植模型 |
| 22426 | 2024-08-09 |
Conversion of human cardiac progenitor cells into cardiac pacemaker-like cells
2020-01, Journal of molecular and cellular cardiology
IF:4.9Q2
DOI:10.1016/j.yjmcc.2019.09.015
PMID:31678351
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研究论文 | 本研究通过筛选策略测试了将人类心脏前体细胞（CPCs）转化为类似起搏器细胞的再编程因子 | 发现SHOX2、HCN2和TBX5（SHT5）组合的转录因子在驱动CPCs转化为类似起搏器细胞方面比其他组合和单一转录因子更有效 | NA | 探索将人类心脏前体细胞转化为类似起搏器细胞的方法，以促进心脏衰竭患者起搏器样细胞疗法的发展 | 人类心脏前体细胞（CPCs）和类似起搏器细胞 | NA | 心脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22427 | 2024-08-09 |
Photic generation of 11-cis-retinal in bovine retinal pigment epithelium
2019-12-13, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1074/jbc.RA119.011169
PMID:31694912
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研究论文 | 本文描述了在特定波长光照刺激下，牛视网膜色素上皮细胞膜中11-cis-视黄醛的高水平生成过程 | 研究揭示了RGR与CRALBP协同作用下，在持续光照条件下再生视觉色素的全新机制 | NA | 探讨生理条件下视黄醛光异构化的机制 | 牛视网膜色素上皮细胞中的11-cis-视黄醛生成 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人类和牛的视网膜色素上皮组织及Müller胶质细胞 |
| 22428 | 2024-08-09 |
Chronic Stress Induces Activity, Synaptic, and Transcriptional Remodeling of the Lateral Habenula Associated with Deficits in Motivated Behaviors
2019-12-04, Neuron
IF:14.7Q1
DOI:10.1016/j.neuron.2019.09.005
PMID:31672263
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研究论文 | 本文研究了慢性压力（CS）对侧缰核（LHb）神经元的活动、突触和转录重塑，以及这些变化与动机行为缺陷的关联 | 首次揭示了CS诱导的LHb神经元超活动与被动应对（PC）增加的关联，并利用单细胞转录组学识别了一组可作为PC增加小鼠生物标志物的基因 | NA | 探讨慢性压力对侧缰核神经元的活动、突触和转录重塑及其与动机行为缺陷的关系 | 侧缰核（LHb）神经元及其与腹侧被盖区（VTA）和背缝核（DR）的神经连接 | 神经科学 | 抑郁症 | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 小鼠 |
| 22429 | 2024-08-09 |
Improving single-cell transcriptome sequencing efficiency with a microfluidic phase-switch device
2019-Dec-02, The Analyst
DOI:10.1039/c9an00823c
PMID:31688860
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research paper | 本文介绍了一种新型微流控相变装置，用于提高单细胞转录组测序的效率，特别适用于细胞数量有限的珍贵样本。 | 设计了一种集成多个单细胞隔离室的微流控装置，实现了近100%的单细胞捕获率和极低的细胞损失，并采用了一种新的相变方法将单细胞封装到皮升大小的水凝胶液滴中。 | NA | 提高单细胞转录组测序的效率和可及性。 | 单细胞转录组测序，特别是细胞数量有限的珍贵样本。 | digital pathology | NA | RNA-seq | NA | text | 数十个hESCs（H9） |
| 22430 | 2024-08-09 |
Unravelling fibrosis using single-cell transcriptomics
2019-12, Current opinion in pharmacology
IF:4.0Q1
DOI:10.1016/j.coph.2019.09.004
PMID:31670054
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综述 | 本文综述了单细胞转录组学在揭示纤维化疾病发病机制中的应用 | 单细胞转录组学技术使得在纤维化背景下对个体致病细胞群体的研究达到了前所未有的分辨率 | NA | 探讨单细胞转录组学如何推动对纤维化疾病发病机制的理解 | 纤维化疾病及其治疗靶点的精确识别 | 单细胞转录组学 | 纤维化 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22431 | 2024-08-09 |
Preclinical development of T-cell receptor-engineered T-cell therapy targeting the 5T4 tumor antigen on renal cell carcinoma
2019-Dec, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-019-02419-4
PMID:31686124
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研究论文 | 本研究开发了一种针对肾细胞癌中5T4肿瘤抗原的T细胞受体工程化T细胞疗法，并通过单细胞RNA测序和功能测试验证了其有效性 | 首次探索了5T4作为T细胞受体工程化T细胞疗法的目标，并成功开发了针对该抗原的T细胞疗法 | NA | 开发和验证针对5T4肿瘤抗原的T细胞受体工程化T细胞疗法 | 5T4肿瘤抗原特异性的T细胞克隆及其功能 | 免疫疗法 | 肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | T细胞受体工程化T细胞 | RNA | 七对独特的TRA-TRB配对 |
| 22432 | 2024-08-09 |
Single-cell sequencing and its applications in head and neck cancer
2019-12, Oral oncology
IF:4.0Q2
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在头颈癌研究中的应用及其在基因组、转录组和表观基因组层面的技术和计算进展 | 单细胞测序技术为理解肿瘤生物学中的细微差异提供了新途径，通过识别不同的细胞亚群、解析肿瘤微环境中的信号传导以及描述细胞基因组突变和拷贝数异常 | NA | 探讨单细胞测序技术在头颈癌研究和临床实践中的应用 | 头颈鳞状细胞癌（HNSCC）的细胞亚群及其基因组、转录组和表观基因组特征 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组数据 | NA |
| 22433 | 2024-08-09 |
Bayesian Inference of Allelic Inclusion Rates in the Human T Cell Receptor Repertoire
2019-11-27, Cell systems
IF:9.0Q1
DOI:10.1016/j.cels.2019.09.006
PMID:31677971
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研究论文 | 本文开发并实验验证了一种完全贝叶斯推理模型，用于可靠地估计α和β TCR等位基因包含率 | 提出了一个完全贝叶斯推理模型来估计α和β TCR等位基因包含率，并提供了超过51,000个先前未发表的等位基因包含TCR序列集的数据库 | 单细胞测序技术的局限性阻碍了对这些双受体T细胞的全面计数 | 研究人类T细胞受体库中的等位基因包含率 | αβ T细胞的等位基因包含现象 | NA | NA | 单细胞测序 | 贝叶斯推理模型 | 序列数据 | 超过51,000个TCR序列集，来自8名健康个体 |
| 22434 | 2024-08-09 |
Self-renewing endometrial epithelial organoids of the human uterus
2019-11-12, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1915389116
PMID:31666317
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研究论文 | 本研究使用已建立的器官培养协议，从人类子宫内膜活检中生成并全面分析了三维子宫内膜上皮器官（EEO）培养物 | 本研究首次详细描述了人类子宫内膜上皮器官的生成及其在激素处理下的基因表达变化 | NA | 研究子宫内膜在妊娠早期的作用及其生理和病理机制 | 人类子宫内膜上皮器官（EEO）及其在激素处理下的反应 | NA | 不孕症 | 实时定量PCR，批量RNA测序，单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自2个不同供体的子宫内膜样本 |
| 22435 | 2024-08-09 |
Modular transcriptional programs separately define axon and dendrite connectivity
2019-11-05, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.50822
PMID:31687928
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研究论文 | 本文研究了T4/T5神经元的转录调控程序，揭示了不同树突和轴突连接模式的转录程序 | 本文首次揭示了模块化转录程序在定义神经元连接模式中的独立控制作用 | NA | 探索神经元连接模式的转录调控机制 | T4/T5神经元的树突和轴突连接模式 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 八种T4/T5神经元亚型 |
| 22436 | 2024-08-09 |
DoubletDecon: Deconvoluting Doublets from Single-Cell RNA-Sequencing Data
2019-11-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2019.09.082
PMID:31693907
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DoubletDecon的方法，用于从单细胞RNA测序数据中去除双细胞捕获的技术伪影 | DoubletDecon结合了去卷积分析和独特细胞状态基因表达的识别，能够高灵敏度地识别不同类型的双细胞，并避免将有效的混合谱系和过渡细胞状态误判为双细胞 | NA | 开发一种方法来检测和去除单细胞RNA测序数据中的双细胞 | 单细胞RNA测序数据中的双细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 不同细胞复杂度的单细胞RNA测序数据集 |
| 22437 | 2024-08-09 |
Single-cell proteomics reveals changes in expression during hair-cell development
2019-11-04, eLife
IF:6.4Q1
DOI:10.7554/eLife.50777
PMID:31682227
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研究论文 | 本文利用单细胞纳米级 shotgun 质谱技术研究了鸡胚胎第15天椭圆囊中分化中的毛细胞的蛋白质表达动态变化 | 首次使用单细胞质谱技术揭示了毛细胞分化过程中蛋白质表达的变化，并与单细胞转录组数据相结合，提供了细胞发育特征的新见解 | NA | 探索内耳中感觉毛细胞分化过程中的蛋白质表达动态变化 | 鸡胚胎第15天椭圆囊中的毛细胞及其前体细胞 | 蛋白质组学 | NA | 单细胞 shotgun 质谱技术 | NA | 蛋白质组和转录组数据 | 多个单细胞样本 |
| 22438 | 2024-08-09 |
Single-Cell Profiling Reveals Sex, Lineage, and Regional Diversity in the Mouse Kidney
2019-11-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2019.10.005
PMID:31689386
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研究论文 | 本研究通过解剖引导的单细胞RNA测序结合原位表达研究和细胞系追踪，揭示了成年雄性和雌性小鼠肾脏的细胞多样性、显著的性别差异以及肾单位的组织和细胞组成 | 研究首次综合了单细胞RNA测序、原位表达研究和细胞系追踪，揭示了小鼠肾脏中的细胞多样性和性别差异，并创建了一个可搜索的数据库Kidney Cell Explorer | NA | 增强对哺乳动物肾脏的理解，特别是在细胞多样性和性别差异方面 | 成年雄性和雌性小鼠的肾脏 | 数字病理学 | 慢性肾脏疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | 成年雄性和雌性小鼠的肾脏样本 |
| 22439 | 2024-08-09 |
Stress-Induced Metabolic Disorder in Peripheral CD4+ T Cells Leads to Anxiety-like Behavior
2019-10-31, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.10.001
PMID:31675497
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研究论文 | 本研究探讨了外周CD4+ T细胞在应激诱导的焦虑样行为中的病理作用及其调控机制 | 首次揭示了CD4 T细胞中由应激诱导的白三烯B4触发线粒体裂变，进而导致焦虑、抑郁和社会行为异常的机制 | NA | 阐明外周CD4+ T细胞在情绪障碍中的病理作用及调控机制 | 外周CD4+ T细胞在应激诱导的焦虑样行为中的作用 | NA | 焦虑症 | 代谢组学分析，单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22440 | 2024-08-09 |
Single-cell proteomics in complex tissues using microprobe capillary electrophoresis mass spectrometry
2019, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2019.07.001
PMID:31668233
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研究论文 | 本文介绍了一种基于微探针毛细管电泳高分辨率质谱（CE-HRMS）的单细胞蛋白质组学分析方法，能够在不分离或解剖整个细胞的情况下，直接对嵌入复杂组织中的单个细胞进行蛋白质组学分析 | 该技术利用微尺度样品收集和处理、分离及离子化技术的最新进展，将高分辨率质谱技术扩展到单细胞水平，揭示了胚胎细胞和神经元之间先前未知的蛋白质组学差异 | NA | 旨在扩展我们对单个细胞产生的蛋白质差异（异质性）及其对正常和受损发育贡献的理解 | 研究对象包括非洲爪蟾和斑马鱼的早期发育胚胎中的单个细胞，以及小鼠黑质中电生理学识别的单个神经元 | 蛋白质组学 | NA | 微探针毛细管电泳高分辨率质谱（CE-HRMS） | NA | 蛋白质组学数据 | 涉及非洲爪蟾、斑马鱼的早期发育胚胎中的单个细胞，以及小鼠黑质中电生理学识别的单个神经元 |