单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 24304 篇文献，本页显示第 2221 - 2240 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2221 | 2024-11-15 |
Immunofluorescence-Verified Sphingolipid Signatures Indicate Improved Prognosis in Liver Cancer Patients
2024, Journal of Cancer
IF:3.3Q2
DOI:10.7150/jca.101330
PMID:39513103
|
研究论文 | 本文通过多组学整合和免疫荧光验证，开发了一种基于鞘脂代谢的肝癌预后模型，并探讨了其在免疫治疗反应中的应用 | 首次通过多组学整合和免疫荧光验证，开发了一种基于鞘脂代谢的肝癌预后模型，并揭示了其在免疫治疗反应中的潜在应用 | 需要进一步的实验验证和临床试验来验证模型的临床应用 | 开发一种基于鞘脂代谢的肝癌预后模型，并探讨其在免疫治疗反应中的应用 | 肝细胞癌患者及其预后和免疫治疗反应 | 数字病理学 | 肝癌 | scRNA-seq, AUCell算法, Cox比例风险模型, Lasso回归, 免疫荧光 | Cox比例风险模型, Lasso回归 | 基因表达数据 | 独立验证队列来自国际癌症基因组联盟（ICGC） |
| 2222 | 2024-11-15 |
ISG15 and ISGylation modulates cancer stem cell-like characteristics in promoting tumor growth of anaplastic thyroid carcinoma
2023-Jul-27, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02751-9
PMID:37501099
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研究论文 | 研究揭示了ISG15和ISGylation在调节甲状腺未分化癌（ATC）干细胞样特性中的新作用 | 首次揭示了ISG15在调节ATC干细胞样特性中的作用及其机制 | NA | 探讨ISG15和ISGylation在ATC干细胞样特性中的作用及其机制 | 甲状腺未分化癌（ATC）的干细胞样特性 | 数字病理学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序、流式细胞术、免疫荧光、免疫沉淀、质谱分析 | NA | 基因表达数据、蛋白质表达数据 | NA |
| 2223 | 2024-11-15 |
Targeting Epsins to Inhibit Fibroblast Growth Factor Signaling While Potentiating Transforming Growth Factor-β Signaling Constrains Endothelial-to-Mesenchymal Transition in Atherosclerosis
2023-02-21, Circulation
IF:35.5Q1
|
研究论文 | 研究探讨了Epsin蛋白在动脉粥样硬化中的作用及其通过抑制EndoMT的治疗潜力 | 首次揭示了Epsin蛋白通过调节FGF和TGF-β信号通路促进EndoMT，并提出了一种新的治疗策略 | 研究主要基于小鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨Epsin蛋白在动脉粥样硬化中的分子机制及其治疗潜力 | Epsin蛋白、EndoMT、FGF和TGF-β信号通路 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、分子、细胞和生化分析 | NA | RNA | Apoe-/-小鼠模型和病毒诱导的动脉粥样硬化小鼠模型 |
| 2224 | 2024-11-15 |
Effects of Metformin on Modulating the Expression of Brain-related Genes of APP/PS1 Transgenic Mice based on Single Cell Sequencing
2022, Current Alzheimer research
IF:1.8Q4
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研究论文 | 研究了二甲双胍对APP/PS1转基因小鼠大脑相关基因表达的调节作用，通过单细胞测序技术分析了其对小鼠认知功能和细胞分化的影响 | 首次通过单细胞测序技术研究二甲双胍对APP/PS1转基因小鼠大脑细胞类型和基因表达的调节作用 | 研究仅限于APP/PS1转基因小鼠模型，结果的普适性有待进一步验证 | 探讨二甲双胍对阿尔茨海默病模型小鼠大脑基因表达和认知功能的调节作用 | APP/PS1转基因小鼠的大脑细胞和基因表达 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | APP/PS1转基因小鼠 |
| 2225 | 2024-11-15 |
Single-cell RNA sequencing of the mammalian pineal gland identifies two pinealocyte subtypes and cell type-specific daily patterns of gene expression
2018, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0205883
PMID:30347410
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了大鼠松果体转录组，识别出两种松果体细胞亚型，并揭示了细胞类型特异性的每日基因表达模式 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别出大鼠松果体中的两种松果体细胞亚型，并揭示了细胞类型特异性的每日基因表达模式 | 研究仅限于大鼠松果体，结果可能不适用于其他物种 | 通过单细胞RNA测序技术分析大鼠松果体细胞的组成及其基因表达的每日变化模式 | 大鼠松果体细胞及其基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约17,000个松果体细胞 |
| 2226 | 2024-11-14 |
Single cell RNA-seq reveals cellular and transcriptional heterogeneity in the splenic CD11b+Ly6Chigh monocyte population expanded in sepsis-surviving mice
2024-Nov-06, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-024-00970-0
PMID:39506629
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研究论文 | 研究分析了在脓毒症幸存小鼠中扩增的脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体的细胞和转录异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了脓毒症幸存小鼠脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体的细胞和转录异质性 | 研究仅限于C57BL/6J和BALB/c小鼠模型，结果可能不适用于其他物种或人类 | 探讨脓毒症幸存者免疫失调的分子基础 | 脾脏CD11b+Ly6Chigh单核细胞群体 | 数字病理学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | C57BL/6J和BALB/c小鼠的脾脏CD11b+Ly6Chigh细胞 |
| 2227 | 2024-11-14 |
Cellular heterogeneity and dynamics of the human uterus in healthy premenopausal women
2024-Nov-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2404775121
PMID:39471215
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研究论文 | 研究应用单细胞RNA测序技术分析了来自五名健康育龄女性的子宫内膜和子宫肌层的细胞异质性和动态变化 | 构建了一个包含超过167,000个细胞的正常子宫细胞图谱，并提出了一个包含39个子类型的共识注释系统 | 研究仅限于健康育龄女性，未涵盖其他年龄段或疾病状态 | 揭示人类子宫在健康育龄女性的细胞异质性和动态变化 | 子宫内膜和子宫肌层的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 5名健康育龄女性，共50,000多个子宫细胞 |
| 2228 | 2024-11-14 |
Correct stimulation of CD28H arms NK cells against tumor cells
2024-Nov, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.202350901
PMID:39101623
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研究论文 | 研究通过靶向CD28H激活NK细胞，增强其对肿瘤细胞的杀伤作用 | 首次研究了靶向CD28H的单克隆抗体对NK细胞的激活作用及其对肿瘤细胞的杀伤效果 | NA | 探讨CD28H在NK细胞激活和肿瘤免疫逃逸中的作用 | CD28H、NK细胞、肿瘤细胞 | 免疫学 | 肾癌 | 单克隆抗体、scRNA-seq | NA | 细胞 | 涉及多种血液细胞系和透明细胞肾癌细胞 |
| 2229 | 2024-11-14 |
Computational methods for allele-specific expression in single cells
2024-Nov, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.07.003
PMID:39127549
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综述 | 本文综述了单细胞等位基因特异性表达（ASE）数据的计算方法 | 本文讨论了处理和分析单细胞ASE数据的计算方法，并强调了未来需要整合和优化的生物信息学流程以及统计方法的发展 | NA | 探讨单细胞等位基因特异性表达数据的计算方法 | 单细胞等位基因特异性表达数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 2230 | 2024-11-14 |
Adding Highly Variable Genes to Spatially Variable Genes Can Improve Cell Type Clustering Performance in Spatial Transcriptomics Data
2024-Oct-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5315913/v1
PMID:39502778
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研究论文 | 研究探讨了在空间转录组数据中，将高变异基因与空间变异基因结合是否能提高细胞类型聚类性能 | 首次研究了将高变异基因与空间变异基因结合对细胞类型聚类性能的影响 | 仅在50个真实空间转录组数据集上进行了测试，可能需要更多数据集验证 | 探讨在空间转录组数据中，结合高变异基因与空间变异基因对细胞类型聚类性能的影响 | 空间转录组数据中的高变异基因和空间变异基因 | 基因组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据 | 50个真实空间转录组数据集 |
| 2231 | 2024-11-14 |
Single-cell sequencing technology to characterize stem T-cell subpopulations in acute T-lymphoblastic leukemia and the role of stem T-cells in the disease process
2024-Oct-17, Aging
DOI:10.18632/aging.206123
PMID:39422621
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研究论文 | 研究使用单细胞测序技术分析急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群及其在疾病过程中的作用 | 首次通过单细胞测序技术详细分析了急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群及其在疾病发展中的作用 | 研究依赖于公共数据库的数据，可能存在数据质量和样本多样性的限制 | 探讨急性T淋巴母细胞白血病中干细胞T细胞亚群的特征及其在疾病过程中的作用 | 急性T淋巴母细胞白血病中的干细胞T细胞亚群 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞数据 | 来自公共数据库的单细胞测序数据 |
| 2232 | 2024-11-14 |
Antibody-Fab and -Fc features promote Mycobacterium tuberculosis restriction
2024-Oct-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.07.617070
PMID:39416184
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研究论文 | 研究了抗体Fab和Fc特征在限制结核分枝杆菌中的作用 | 通过Fc交换优化了保护性脂阿拉伯甘露聚糖特异性单克隆抗体，并揭示了Fc效应功能在限制中的关键作用 | NA | 探讨抗体在控制结核分枝杆菌中的机制 | 结核分枝杆菌、单克隆抗体、Fc变体 | NA | 结核病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2233 | 2024-11-14 |
Unraveling the phenotypic states of human innate-like T cells: Comparative insights with conventional T cells and mouse models
2024-Sep-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.114705
PMID:39264810
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序和流式细胞术，比较了人类先天样T细胞与常规T细胞在胸腺和血液中的转录组特征 | 揭示了人类先天样T细胞与常规T细胞在转录组水平上的差异，并发现了人类与小鼠在T细胞分化上的物种特异性差异 | NA | 探索人类先天样T细胞的表型状态及其与常规T细胞和小鼠模型的比较 | 人类先天样T细胞和常规T细胞 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) 和流式细胞术 | NA | 转录组数据 | NA |
| 2234 | 2024-11-14 |
IKKα-STAT3-S727 axis: a novel mechanism in DOX-induced cardiomyopathy
2024-Sep-17, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-024-05439-1
PMID:39287798
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研究论文 | 研究探讨了IKKα在DOX诱导的心肌病中的作用及其机制 | 发现了IKKα-STAT3-S727信号通路在DOX诱导的心肌病中的关键作用 | 研究仅在动物模型中进行，尚未在人体中验证 | 研究IKKα如何调节巨噬细胞激活并导致DOX诱导的心肌病 | 巨噬细胞IKKα在小鼠模型中的作用 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 单细胞测序分析 | NA | 基因表达数据 | 使用巨噬细胞特异性IKKα敲除小鼠进行研究 |
| 2235 | 2024-11-14 |
TWIST1+FAP+ fibroblasts in the pathogenesis of intestinal fibrosis in Crohn's disease
2024-Jul-18, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI179472
PMID:39024569
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研究论文 | 研究了克罗恩病中肠纤维化的发病机制，特别是TWIST1+FAP+成纤维细胞的作用 | 首次揭示了TWIST1+FAP+成纤维细胞在肠纤维化中的关键作用，并提出了通过抑制TWIST1来治疗克罗恩病纤维化的潜在策略 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞RNA测序数据，需要进一步的临床验证 | 探讨克罗恩病中肠纤维化的发病机制，并寻找有效的治疗策略 | 克罗恩病患者的纤维化和非纤维化回肠组织，以及小鼠的慢性葡聚糖硫酸钠盐结肠炎模型 | 数字病理学 | 克罗恩病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 克罗恩病患者和小鼠模型的多个样本 |
| 2236 | 2024-11-14 |
Metabolic regulator ERRγ governs gastric stem cell differentiation into acid-secreting parietal cells
2024-Jun-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2024.04.016
PMID:38733994
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研究论文 | 研究揭示了代谢调节因子ERRγ在胃干细胞向壁细胞分化中的作用 | 首次识别了从峡部干细胞产生的壁细胞前体，并展示了ERRγ在壁细胞分化过程中的关键作用 | NA | 阐明胃干细胞向壁细胞分化的机制 | 小鼠模型和人类胃细胞中的壁细胞前体 | NA | NA | scRNA-seq | NA | 细胞 | 小鼠模型和人类胃细胞 |
| 2237 | 2024-11-14 |
Differential CpG methylation at Nnat in the early establishment of beta cell heterogeneity
2024-Jun, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-024-06123-6
PMID:38512414
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研究论文 | 研究探讨了Nnat基因在β细胞异质性早期建立中的差异CpG甲基化机制 | 首次揭示了Nnat基因的差异甲基化在β细胞异质性建立中的作用 | NA | 探讨β细胞异质性建立的分子机制 | 胰腺β细胞及其亚群 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序、亲和纯化质谱分析、钙成像 | NA | RNA、蛋白质 | 转基因小鼠和db/db小鼠 |
| 2238 | 2024-11-14 |
Cellular-resolution gene expression mapping reveals organization in the head ganglia of the gastropod, Berghia stephanieae
2024-06, The Journal of comparative neurology
IF:2.3Q1
DOI:10.1002/cne.25628
PMID:38852042
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研究论文 | 本文通过结合高通量单细胞RNA测序和原位杂交链反应，在海蛞蝓Berghia stephanieae中识别和可视化了细胞类型的标记基因表达 | 首次在海蛞蝓中进行细胞分辨率的基因表达图谱绘制，揭示了神经元和胶质细胞的分子标记及其在神经节中的组织结构 | 仅限于海蛞蝓Berghia stephanieae，未涵盖其他软体动物 | 揭示软体动物神经系统中神经元和胶质细胞的基本细胞组织结构 | 海蛞蝓Berghia stephanieae的头部神经节 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序、原位杂交链反应 | NA | 基因表达数据 | 多个神经元和胶质细胞样本 |
| 2239 | 2024-11-14 |
Notch ligands are biomarkers of anti-TNF response in RA patients
2024-May, Angiogenesis
IF:9.2Q1
DOI:10.1007/s10456-023-09897-2
PMID:37796367
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研究论文 | 研究探讨了Notch配体在类风湿性关节炎（RA）患者中的表达及其作为抗TNF治疗反应的生物标志物的潜力 | 首次揭示了RA患者中Notch配体在不同细胞类型中的表达模式及其对抗TNF治疗反应的影响 | 研究主要集中在RA患者的滑膜组织，未涵盖其他组织或细胞类型 | 探讨Notch通路在RA发病机制中的作用及其在RA治疗中的潜在应用 | RA患者的滑膜组织细胞和内皮细胞 | NA | 类风湿性关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 涉及RA患者的滑膜组织细胞和内皮细胞 |
| 2240 | 2024-11-14 |
Maximum Likelihood Inference of Time-scaled Cell Lineage Trees with Mixed-type Missing Data
2024-Mar-23, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.03.05.583638
PMID:38496496
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研究论文 | 本文介绍了一种用于推断带有混合类型缺失数据的时间缩放细胞谱系树的最大似然方法 | 引入了Probabilistic Mixed-type Missing (PMM)模型，并开发了LAML算法，该算法结合了期望最大化(EM)算法和启发式树搜索，能够更准确地推断树拓扑结构和分支长度 | NA | 解决动态谱系追踪中的关键计算问题，即从测量的CRISPR诱导突变中推断细胞谱系树 | 细胞谱系树的推断 | 生物信息学 | 肺癌 | CRISPR-based genome editing, single-cell sequencing | 最大似然模型 | 基因组数据 | NA |