单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27747 篇文献，本页显示第 22281 - 22300 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22281 | 2024-08-08 |
Prognostic Autophagy-Related Model Revealed by Integrating Single-Cell RNA Sequencing Data and Bulk Gene Profiles in Gastric Cancer
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.729485
PMID:35083210
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，识别出一个与自噬相关的风险模型，该模型能够区分胃癌患者的不良预后 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据，构建了一个与自噬相关的风险模型，并验证了其在胃癌患者预后评估中的应用价值 | NA | 旨在揭示自噬相关模型在胃癌中的临床意义 | 胃癌患者的预后评估 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | 风险模型 | RNA测序数据 | 使用了TCGA和两个独立的Gene Expression Omnibus队列的数据 |
| 22282 | 2024-08-08 |
Single-Cell Profiles of Age-Related Osteoarthritis Uncover Underlying Heterogeneity Associated With Disease Progression
2021, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2021.748360
PMID:35083277
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了与年龄相关的骨关节炎（OA）滑膜组织的细胞异质性 | 首次揭示了OA滑膜组织中免疫细胞亚群的转录组多样性及其在疾病进展中的作用 | NA | 旨在描绘骨关节炎滑膜组织的细胞间异质性 | 骨关节炎滑膜组织中的细胞异质性 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA表达数据 | 整合了GSE55235和GSE55457两个数据集 |
| 22283 | 2024-08-08 |
The Crosstalk Between Malignant Cells and Tumor-Promoting Immune Cells Relevant to Immunotherapy in Pancreatic Ductal Adenocarcinoma
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.821232
PMID:35087839
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，评估了胰腺导管腺癌（PDAC）中恶性细胞与免疫细胞之间的细胞间通讯，构建了恶性-免疫细胞交叉对话（MIT）评分，用于预测PDAC患者的生存和治疗反应。 | 本研究首次构建了恶性-免疫细胞交叉对话（MIT）评分，用于预测PDAC患者的免疫检查点阻断（ICB）免疫治疗反应，并识别了15对恶性细胞与肿瘤促进免疫细胞之间的配体-受体对，为开发新的免疫治疗策略提供了潜在靶点。 | NA | 理解PDAC形成免疫抑制微环境的机制，开发新的有效免疫治疗策略。 | 胰腺导管腺癌（PDAC）中的恶性细胞与免疫细胞之间的细胞间通讯。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA |
| 22284 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Profiling Unravels Distinct Peripheral Blood Immune Cell Signatures of RRMS and MOG Antibody-Associated Disease
2021, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2021.807646
PMID:35095746
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组测序技术，揭示了复发缓解型多发性硬化症（RRMS）和髓鞘少突胶质细胞糖蛋白抗体相关疾病（MOGAD）在周围血免疫细胞中的独特特征 | 首次通过单细胞转录组测序技术，展示了RRMS和MOGAD在免疫细胞层面的显著差异，为这两种疾病的鉴别诊断提供了新的生物标志物 | 研究样本量较小，仅包括三名受试者（一名RRMS患者、一名MOGAD患者和一名健康对照），可能影响结果的普遍性和可靠性 | 旨在通过单细胞转录组测序技术，发现RRMS和MOGAD的独特免疫细胞特征，以提高这两种疾病的诊断和治疗效果 | 复发缓解型多发性硬化症（RRMS）和髓鞘少突胶质细胞糖蛋白抗体相关疾病（MOGAD）的患者 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 三名受试者（一名RRMS患者、一名MOGAD患者和一名健康对照） |
| 22285 | 2024-08-08 |
Pulmonary Mesenchymal Stem Cells in Mild Cases of COVID-19 Are Dedicated to Proliferation; In Severe Cases, They Control Inflammation, Make Cell Dispersion, and Tissue Regeneration
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.780900
PMID:35095855
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了COVID-19轻度和重度患者支气管肺泡灌洗样本中的间充质干细胞（MSCs），探讨了MSCs在不同病情中的生物学功能和治疗潜力。 | 首次详细分析了COVID-19不同病情下MSCs的基因表达变化，揭示了MSCs在控制炎症、细胞分散和组织再生中的作用。 | 研究仅限于单细胞RNA测序数据分析，未涉及MSCs的体内功能验证和临床治疗应用。 | 探讨间充质干细胞在COVID-19不同病情中的生物学功能和治疗潜力。 | COVID-19轻度和重度患者的支气管肺泡灌洗样本中的间充质干细胞。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | COVID-19轻度和重度患者的支气管肺泡灌洗样本 |
| 22286 | 2024-08-08 |
The Transient IFN Response and the Delay of Adaptive Immunity Feature the Severity of COVID-19
2021, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2021.816745
PMID:35095917
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析COVID-19患者的免疫反应，揭示了不同临床结果患者的免疫特征 | 首次通过纵向单细胞RNA测序数据揭示了COVID-19患者免疫景观的动态变化及其与疾病进展和恢复的关系 | NA | 探究COVID-19患者免疫反应的异质性和动态特征及其与临床结果的关系 | COVID-19患者的免疫反应 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种临床结果的COVID-19患者 |
| 22287 | 2024-08-08 |
Single-Cell Ribonucleic Acid Sequencing Clarifies Cold Tolerance Mechanisms in the Pacific White Shrimp (Litopenaeus Vannamei)
2021, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2021.792172
PMID:35096009
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了太平洋白虾在不同温度下的肝胰腺细胞，以阐明其耐寒机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术研究太平洋白虾的耐寒机制，并识别了与耐寒相关的关键基因和代谢途径 | 研究仅限于特定的细胞类型和温度条件，可能需要进一步的研究来验证这些发现在更广泛条件下的适用性 | 阐明太平洋白虾的耐寒分子机制 | 太平洋白虾的肝胰腺细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 约5185个肝胰腺细胞，来自耐寒和普通太平洋白虾，分别在28°C和10°C下采集 |
| 22288 | 2024-08-08 |
Interactions Between Anti-Angiogenic Therapy and Immunotherapy in Glioblastoma
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.812916
PMID:35096619
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综述 | 本文综述了胶质母细胞瘤中抗血管生成治疗与免疫治疗之间的相互作用及其潜在的协同效应 | 探讨了抗血管生成治疗与免疫治疗在胶质母细胞瘤中的协同作用，以及通过抑制VEGF等促血管生成因子来增加效应免疫细胞浸润的可能性 | NA | 探讨胶质母细胞瘤肿瘤微环境中的肿瘤血管与免疫细胞的相互作用，并寻找针对这些相互作用的潜在治疗策略 | 胶质母细胞瘤的肿瘤微环境及其与免疫治疗的相互作用 | NA | 脑瘤 | 单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 22289 | 2024-08-08 |
Identification of prognostic biomarkers in papillary renal cell carcinoma and PTTG1 may serve as a biomarker for predicting immunotherapy response
2022-Dec, Annals of medicine
IF:4.9Q1
DOI:10.1080/07853890.2021.2011956
PMID:35037540
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研究论文 | 本研究旨在识别乳头状肾细胞癌（pRCC）中的潜在预后和治疗生物标志物，并探讨PTTG1作为预测免疫治疗反应的生物标志物的可能性。 | 本研究通过分析基因表达数据和蛋白质-蛋白质相互作用网络，首次发现PTTG1与肿瘤微环境中的淋巴细胞、免疫调节剂和趋化因子显著相关，并可能作为免疫检查点阻断（ICB）反应的预测因子。 | 本研究主要基于两个微阵列数据集和单细胞RNA测序数据，未来研究需要更多的临床样本和多中心数据来验证这些发现。 | 识别乳头状肾细胞癌中的预后和治疗生物标志物。 | 乳头状肾细胞癌（pRCC）患者及其肿瘤微环境中的生物标志物。 | 数字病理学 | 肾癌 | 微阵列分析、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 两个微阵列数据集和复旦大学上海癌症中心（FUSCC）队列 |
| 22290 | 2024-08-08 |
Pre-existing Castration-resistant Prostate Cancer-like Cells in Primary Prostate Cancer Promote Resistance to Hormonal Therapy
2022-05, European urology
IF:25.3Q1
DOI:10.1016/j.eururo.2021.12.039
PMID:35058087
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研究论文 | 研究揭示了在前列腺癌早期存在的去势抵抗性前列腺癌样细胞，这些细胞促进了激素治疗的抵抗 | 发现了在激素治疗前就存在于前列腺癌中的去势抵抗性前列腺癌样细胞，这些细胞与疾病进展和远处转移有关 | 研究仅限于从新鲜的人类前列腺癌病例中分离的细胞，可能无法完全代表所有前列腺癌病例 | 理解早期前列腺癌中的亚克隆如何发展成去势抵抗性前列腺癌的机制 | 从新鲜的人类前列腺癌病例中分离的腺癌细胞，包括原发性腺癌、局部复发的去势抵抗性前列腺癌和转移性去势抵抗性前列腺癌 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据 | 23226个上皮细胞 |
| 22291 | 2024-08-08 |
scJoint integrates atlas-scale single-cell RNA-seq and ATAC-seq data with transfer learning
2022-05, Nature biotechnology
IF:33.1Q1
DOI:10.1038/s41587-021-01161-6
PMID:35058621
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研究论文 | 本文介绍了一种名为scJoint的迁移学习方法，用于整合大规模异构的单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单细胞ATAC测序（scATAC-seq）数据 | scJoint利用半监督框架中的注释scRNA-seq数据，并通过神经网络同时训练标记和未标记数据，实现了标签转移和联合可视化 | NA | 开发一种方法以克服不同数据模式的异质性，从而更全面地理解细胞表型 | 单细胞RNA测序和单细胞ATAC测序数据 | 机器学习 | NA | 迁移学习 | 神经网络 | 单细胞RNA测序数据和单细胞ATAC测序数据 | 使用图谱数据以及通过ASAP-seq和CITE-seq生成的多模态数据集进行验证 |
| 22292 | 2024-08-08 |
Transient Cell Cycle Induction in Cardiomyocytes to Treat Subacute Ischemic Heart Failure
2022-04-26, Circulation
IF:35.5Q1
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研究论文 | 本研究通过引入4个细胞周期因子（4F）促进心肌细胞增殖，以治疗亚急性缺血性心力衰竭 | 使用新型瞬时且心肌细胞特异性的病毒构建体，减少了细胞周期因子的致癌潜力 | NA | 研究强制心肌细胞增殖的过程，并推进该方法的临床可行性 | 心肌细胞 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 大鼠模型每组10只，猪模型每组6-7只 |
| 22293 | 2024-08-08 |
Age-related differences in immune dynamics during SARS-CoV-2 infection in rhesus macaques
2022-04, Life science alliance
IF:3.3Q1
DOI:10.26508/lsa.202101314
PMID:35039442
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研究论文 | 研究使用恒河猴模型探讨年龄相关的SARS-CoV-2感染免疫动力学差异 | 首次在恒河猴模型中详细分析了年龄对SARS-CoV-2感染后免疫反应的影响，特别是在急性后期阶段 | 研究仅限于恒河猴模型，可能不完全适用于人类 | 探究年龄对SARS-CoV-2感染免疫反应的影响 | 老年和年轻恒河猴的SARS-CoV-2感染免疫反应 | NA | COVID-19 | 单细胞转录组学、多参数流式细胞术、多重免疫组织化学、细胞因子检测、脂质组学分析 | NA | RNA、临床观察、胸部X光片、细胞因子、脂质 | 16只恒河猴（8只老年，8只年轻） |
| 22294 | 2024-08-08 |
Automation enables high-throughput and reproducible single-cell transcriptomics library preparation
2022-04, SLAS technology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.slast.2021.10.018
PMID:35058211
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研究论文 | 本文开发了一种自动化工作流程，用于提高单细胞RNA测序（scRNA-seq）文库制备的通量并减少操作时间 | 通过自动化流程，将scRNA-seq文库制备的通量提高至48个反应，并将操作时间减少75% | NA | 提高单细胞RNA测序的效率和可重复性 | 单细胞RNA测序文库制备的自动化流程 | 数字病理学 | NA | NGS | NA | RNA | 最多48个反应 |
| 22295 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals Novel Role of Microglia in Fibrovascular Membrane of Proliferative Diabetic Retinopathy
2022-04-01, Diabetes
IF:6.2Q1
DOI:10.2337/db21-0551
PMID:35061025
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了增生性糖尿病视网膜病变（PDR）中的纤维血管膜（FVM），揭示了微胶质细胞在FVM中的新角色 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了PDR-FVM中微胶质细胞的GPNMB+亚群，及其在纤维化和纤维生成中的作用 | NA | 探讨微胶质细胞在增生性糖尿病视网膜病变中的病理生理作用 | 增生性糖尿病视网膜病变中的纤维血管膜 | 数字病理学 | 糖尿病视网膜病变 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 手术采集的PDR-FVM样本 |
| 22296 | 2024-08-08 |
AlzCode: a platform for multiview analysis of genes related to Alzheimer's disease
2022-03-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac033
PMID:35040932
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研究论文 | 介绍了一个名为AlzCode的平台，用于多视角分析与阿尔茨海默病相关的基因 | AlzCode平台整合了多种类型的组学数据和方法，为分析候选基因提供了丰富的功能基因组数据和多种分析方法 | NA | 为了深入理解候选基因与阿尔茨海默病的相关性，并筛选出适合实验测试的基因 | 与阿尔茨海默病相关的基因 | 生物信息学 | 阿尔茨海默病 | 基因表达分析，单细胞RNA测序，蛋白质表达分析 | NA | 基因表达数据，生物网络数据，神经病理学和临床特征数据 | NA |
| 22297 | 2024-08-08 |
Identify, quantify and characterize cellular communication from single-cell RNA sequencing data with scSeqComm
2022-03-28, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac036
PMID:35043939
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研究论文 | 本文介绍了scSeqComm方法，用于从单细胞RNA测序数据中识别、量化和表征细胞间和细胞内信号传导 | scSeqComm方法能够同时考虑细胞间和细胞内信号传导，并提供功能性表征，增加了推断通信的可靠性 | NA | 开发一种新的计算方法，用于从单细胞RNA测序数据中识别和量化细胞通信 | 单细胞RNA测序数据中的细胞间和细胞内信号传导 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 22298 | 2024-08-08 |
sc-REnF: An entropy guided robust feature selection for single-cell RNA-seq data
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab517
PMID:35037023
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研究论文 | 介绍了一种基于熵的鲁棒特征选择方法sc-REnF，用于单细胞RNA测序数据的基因选择，以提高细胞聚类的准确性 | 利用Rényi和Tsallis熵在基因选择中的优势，通过调整参数$q$显著改善了聚类结果 | NA | 旨在提高单细胞RNA测序数据中细胞聚类的准确性 | 单细胞RNA测序数据中的基因选择 | 机器学习 | NA | RNA-seq | NA | 基因数据 | 小样本，大特征的单细胞RNA测序数据 |
| 22299 | 2024-08-08 |
hDirect-MAP: projection-free single-cell modeling of response to checkpoint immunotherapy
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab575
PMID:35037026
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研究论文 | 本文开发了hDirect-MAP算法，用于在多种癌症类型中预测免疫检查点阻断反应的单细胞建模 | hDirect-MAP算法能够在高维表达空间中将T细胞按共同表型分组，而不是通过降维特征或这些特征的扭曲视图 | NA | 开发一种新的算法来预测免疫检查点阻断治疗的反应 | T细胞及其在不同癌症类型中的功能 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序，质谱流式细胞术 | NA | 单细胞数据 | 五个单细胞RNA测序或质谱流式细胞术数据集 |
| 22300 | 2024-08-08 |
Network-based integrative analysis of single-cell transcriptomic and epigenomic data for cell types
2022-03-10, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbab546
PMID:35043143
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研究论文 | 本文提出了一种基于网络的集成聚类算法（NIC），用于通过融合单细胞转录组（scRNA-seq）和表观基因组（scATAC-seq或DNA甲基化）数据来识别细胞类型 | NIC算法通过自动学习细胞间相似性图，将多组学数据的融合转化为多网络分析，并利用联合非负矩阵分解学习细胞的共享特征，提供了一种更好的细胞特征表征方法 | NA | 研究目的是开发一种有效的集成分析方法，用于处理单细胞多组学数据的异质性、噪声和稀疏性问题 | 单细胞转录组和表观基因组数据 | 生物信息学 | NA | scRNA-seq, scATAC-seq, DNA甲基化 | 非负矩阵分解 | 转录组数据, 表观基因组数据 | 13个来自不同组织和生物的单细胞多组学数据集 |