单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 24273 篇文献，本页显示第 22241 - 22260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22241 | 2024-08-09 |
A molecular basis for the T cell response in HLA-DQ2.2 mediated celiac disease
2020-02-11, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1914308117
PMID:31974305
|
研究论文 | 本文通过结构证据解释了HLA-DQ2.2在乳糜泻中的作用机制，特别是单个多态性残基如何影响其与特定麸质表位的结合。 | 首次展示了HLA-DQ2.2与特定麸质表位结合的晶体结构，并揭示了其与T细胞受体结合的独特策略。 | NA | 探讨HLA-DQ2.2在乳糜泻发病机制中的分子基础。 | HLA-DQ2.2分子及其在乳糜泻中的作用机制。 | NA | 乳糜泻 | 单细胞测序 | NA | 晶体结构 | 两例乳糜泻患者来源的T细胞受体 |
| 22242 | 2024-08-09 |
Silencing Trisomy 21 with XIST in Neural Stem Cells Promotes Neuronal Differentiation
2020-02-10, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2019.12.015
PMID:31978324
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研究论文 | 本文研究了XIST RNA在分化神经细胞中诱导的染色体21沉默，以及其在唐氏综合征患者细胞中的应用 | 首次证明XIST RNA在分化神经细胞中可以触发染色体21的广泛沉默，并纠正了三体神经干细胞向神经元的分化缺陷 | 目前认为XIST需要多能性的自然环境来启动染色体沉默，这可能限制了其在非多能细胞中的应用 | 探讨XIST在唐氏综合征神经生物学中的作用及其治疗潜力 | 唐氏综合征患者来源的细胞和神经干细胞 | NA | 唐氏综合征 | 单细胞转录组学 | NA | RNA | 具体样本数量未提及 |
| 22243 | 2024-08-09 |
Pro-efferocytic nanoparticles are specifically taken up by lesional macrophages and prevent atherosclerosis
2020-02, Nature nanotechnology
IF:38.1Q1
DOI:10.1038/s41565-019-0619-3
PMID:31988506
|
研究论文 | 本文开发了一种基于单壁碳纳米管的巨噬细胞特异性纳米疗法，用于预防动脉粥样硬化 | 利用单壁碳纳米管装载化学抑制剂，特异性作用于病变巨噬细胞，减少动脉粥样硬化斑块负担，同时避免了对健康组织的非特异性清除 | NA | 开发一种新的巨噬细胞特异性纳米疗法，以克服现有疗法的毒性问题 | 动脉粥样硬化斑块中的巨噬细胞 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | apoE缺陷小鼠 |
| 22244 | 2024-08-09 |
netNMF-sc: leveraging gene-gene interactions for imputation and dimensionality reduction in single-cell expression analysis
2020-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.251603.119
PMID:31992614
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研究论文 | 本文介绍了一种名为netNMF-sc的算法，该算法利用基因间相互作用信息进行单细胞表达数据的插补和降维分析 | netNMF-sc算法通过网络正则化的非负矩阵分解，利用基因间相互作用的先验知识，鼓励已知相互作用的基因对在低维表示中彼此接近 | NA | 提高单细胞RNA测序数据分析中细胞聚类和基因间协方差估计的准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | NA |
| 22245 | 2024-08-09 |
SHARP: hyperfast and accurate processing of single-cell RNA-seq data via ensemble random projection
2020-02, Genome research
IF:6.2Q1
DOI:10.1101/gr.254557.119
PMID:31992615
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研究论文 | 本文介绍了一种基于集成随机投影的算法SHARP，用于高效处理大规模单细胞RNA测序数据 | SHARP算法在处理大规模数据时速度更快且保持高聚类准确性和鲁棒性 | NA | 开发一种能够有效处理大规模单细胞RNA测序数据的新算法 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成随机投影 | 基因表达数据 | 1000万细胞 |
| 22246 | 2024-08-09 |
Chromatin mapping and single-cell immune profiling define the temporal dynamics of ibrutinib response in CLL
2020-Jan-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14081-6
PMID:31996669
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研究论文 | 本研究通过结合免疫表型分析、单细胞转录组测序和染色质图谱，分析了慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者在接受伊布替尼治疗期间的时间动态变化 | 研究揭示了伊布替尼治疗CLL的细胞和分子层面的时间依赖性效应，并建立了一种基于表观基因组/转录组的治疗监测方法 | NA | 定义伊布替尼治疗CLL的潜在调控动态 | 慢性淋巴细胞白血病（CLL）患者 | NA | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组测序，染色质图谱 | NA | 基因表达数据，染色质数据 | 多个CLL患者样本 |
| 22247 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics identifies CD44 as a marker and regulator of endothelial to haematopoietic transition
2020-Jan-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14171-5
PMID:31996681
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析和抗体筛选，识别CD44作为内皮细胞向造血细胞转变（EHT）的标记物和调节因子 | 首次确定CD44作为EHT的标记物，并证明通过抑制CD44与其配体透明质酸的相互作用可以阻断EHT | NA | 阐明内皮细胞向造血细胞转变过程中的中间步骤和相关细胞的身份 | 内皮细胞向造血干细胞和祖细胞（HSPCs）的转变过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22248 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptional diversity is a hallmark of developmental potential
2020-01-24, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aax0249
PMID:31974247
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据，开发了一种计算框架CytoTRACE，用于预测细胞分化状态 | 提出了一种新的计算框架CytoTRACE，用于从单细胞RNA测序数据中预测分化状态，并在多种组织类型和生物体中表现优于先前方法 | NA | 研究细胞分化潜力及其在不同组织和生物体中的应用 | 单细胞RNA测序数据中的细胞分化状态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 计算框架 | RNA测序数据 | 近19,000个注释基因集和52个实验确定的发育轨迹 |
| 22249 | 2024-08-09 |
scMAGeCK links genotypes with multiple phenotypes in single-cell CRISPR screens
2020-01-24, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-020-1928-4
PMID:31980032
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scMAGeCK的计算框架，用于在单细胞CRISPR筛选中识别与多种表达型表型相关的基因组元件 | scMAGeCK超越现有方法，能够识别与细胞增殖相关的已知和新功能基因及增强子，并实现基因型-表型网络的无偏构建 | NA | 研究基因型与表型之间的关系 | 单细胞CRISPR筛选中的基因组元件 | 生物信息学 | NA | CRISPR/Cas9, 单细胞RNA测序 | 计算框架 | 基因组数据, 表达数据 | 小鼠胚胎干细胞 |
| 22250 | 2024-08-09 |
Cellular diversity and lineage trajectory: insights from mouse single cell transcriptomes
2020-01-24, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.179788
PMID:31980483
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研究论文 | 本文讨论了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术在解析小鼠胚胎发育中的细胞多样性和谱系轨迹方面的应用 | 文章介绍了单细胞技术与计算方法的最新进展，这些方法能够在没有明确引入遗传标记的情况下推断细胞的分化谱系 | 分析和解释这些多组学数据仍面临挑战，需要进一步的方法学发展 | 探讨单细胞实验和计算方法在小鼠胚胎发育研究中的应用，并强调其在细胞身份、多样性和谱系分化方面的关键见解 | 小鼠胚胎发育中的细胞多样性和谱系轨迹 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组 | 大量单细胞样本 |
| 22251 | 2024-08-09 |
Single-cell analysis reveals new evolutionary complexity in uveal melanoma
2020-01-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-019-14256-1
PMID:31980621
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了8个原发性和3个转移性葡萄膜黑色素瘤样本中的59,915个肿瘤和非瘤细胞，揭示了肿瘤细胞的新亚克隆基因组复杂性和转录状态，以及肿瘤浸润免疫细胞的先前未被识别的多样性。 | 发现了葡萄膜黑色素瘤中肿瘤细胞的新亚克隆基因组复杂性和转录状态，以及肿瘤浸润免疫细胞的多样性，特别是CD8 T细胞主要表达LAG3而不是PD1或CTLA4。 | NA | 探究葡萄膜黑色素瘤的肿瘤微环境，并寻找潜在的免疫治疗靶点。 | 葡萄膜黑色素瘤的原发性和转移性样本中的肿瘤和非瘤细胞。 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 59,915个肿瘤和非瘤细胞，来自8个原发性和3个转移性样本 |
| 22252 | 2024-08-09 |
Snake Venom Gland Organoids
2020-01-23, Cell
IF:45.5Q1
DOI:10.1016/j.cell.2019.11.038
PMID:31978343
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研究论文 | 本研究建立了来自多种蛇类的长期扩展的毒腺类器官，并利用单细胞RNA测序分析了这些类器官和原始组织的细胞类型。 | 首次将类器官技术扩展到爬行动物的组织，并描述了一个实验上可操作的蛇毒腺模型系统。 | NA | 扩展类器官技术至爬行动物组织，并建立蛇毒腺的实验模型。 | 蛇毒腺类器官及其细胞类型。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 多种蛇类的毒腺组织 |
| 22253 | 2024-08-09 |
Multiplexed Single Cell mRNA Sequencing Analysis of Mouse Embryonic Cells
2020-01-07, Journal of visualized experiments : JoVE
DOI:10.3791/60647
PMID:31984954
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研究论文 | 本文使用基于液滴的scRNA-Seq方法，以心脏为例，展示了如何对小鼠胚胎组织细胞进行单细胞mRNA测序分析 | 本文将两种策略整合到工作流程中，以在单次实验中同时分析多个样本，并成功同时分析了来自八个心脏样本的9,000多个细胞 | NA | 展示如何使用基于液滴的scRNA-Seq方法对小鼠胚胎组织细胞进行单细胞mRNA测序分析 | 小鼠胚胎组织细胞 | 发育生物学 | NA | scRNA-Seq | NA | mRNA | 9,000多个细胞，来自八个心脏样本 |
| 22254 | 2024-08-09 |
Single-cell transcriptomics from human pancreatic islets: sample preparation matters
2020, Biology methods & protocols
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/biomethods/bpz019
PMID:31984226
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研究论文 | 本文通过比较四种不同的样本处理策略对新鲜胰岛样本的单细胞RNA测序数据的影响，探讨了样本准备对研究结果的重要性。 | 首次详细比较了不同样本处理方法对人类胰岛单细胞RNA测序数据的影响，强调了样本处理方法在单细胞研究中的重要性。 | 研究仅限于胰岛组织，可能需要进一步研究其他类型组织以验证结论的普遍性。 | 评估不同样本准备协议对新鲜胰岛样本单细胞RNA测序数据的可能影响。 | 人类胰岛组织 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 两个捐赠者的新鲜胰岛样本 |
| 22255 | 2024-08-09 |
Microglia response following acute demyelination is heterogeneous and limits infiltrating macrophage dispersion
2020-01, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.aay6324
PMID:31998844
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研究论文 | 本研究通过基因标记和单细胞RNA测序技术，探讨了急性脱髓鞘后小胶质细胞和浸润巨噬细胞的反应及其相互作用 | 揭示了小胶质细胞在限制浸润巨噬细胞扩散中的新作用，并提出这可能是中枢神经系统维持其“免疫特权”状态的一种先前未被识别的机制 | NA | 研究中枢神经系统损伤后小胶质细胞和浸润巨噬细胞的反应及其相对贡献 | 小胶质细胞和浸润巨噬细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 22256 | 2024-08-09 |
Preparation of single cells from tumors for single-cell RNA sequencing
2020, Methods in enzymology
DOI:10.1016/bs.mie.2019.05.057
PMID:32000902
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研究论文 | 本文描述了一种从人类肿瘤样本中生成单细胞悬浮液的协议，该协议已针对单细胞RNA测序进行了优化 | 提出了一个优化的单细胞RNA测序样本准备协议，旨在最大化细胞活力并最小化可能影响下游分析的细胞应激因素 | 样本准备过程如果执行不当，可能会产生误导性结果 | 优化单细胞RNA测序的样本准备过程 | 人类肿瘤样本中的单细胞悬浮液 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | NA |
| 22257 | 2024-08-09 |
Evaluating genetic causes of azoospermia: What can we learn from a complex cellular structure and single-cell transcriptomics of the human testis?
2021-Jan, Human genetics
IF:3.8Q2
DOI:10.1007/s00439-020-02116-8
PMID:31950241
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综述 | 本文综述了无精症的遗传原因，并探讨了人类睾丸的复杂细胞结构和单细胞转录组学在不同类型无精症中的应用 | 利用下一代测序技术，通过单细胞RNA测序获得了详细的细胞类型特异性表达模式，并结合现有数据集进行综合分析 | 需要对高度复杂的数据处理和可视化方法有深入了解才能正确解读单细胞RNA测序数据 | 探讨无精症的遗传原因及其对睾丸病理的影响 | 人类睾丸的细胞结构和单细胞转录组学 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 62,751个睾丸细胞，每个细胞中位数为2637个转录本 |
| 22258 | 2024-08-09 |
Liquid Biopsy Based Single-Cell Transcriptome Profiling Characterizes Heterogeneity of Disseminated Tumor Cells from Lung Adenocarcinoma
2020-07, Proteomics
IF:3.4Q2
DOI:10.1002/pmic.201900224
PMID:31960581
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研究论文 | 本文利用高通量单细胞转录组测序技术和稀有DTC富集方法，解析了来自肺腺癌的恶性胸腔积液（MPE）中DTCs的异质性和独特的分子特征 | 首次使用单细胞转录组测序技术研究液体活检中的DTCs异质性，并识别出19个肿瘤特异性标记物 | 研究仅限于肺腺癌的恶性胸腔积液样本，未涉及其他类型的癌症或样本 | 解析肿瘤细胞的异质性及其分子机制 | 肺腺癌中的扩散肿瘤细胞（DTCs） | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 8213个来自恶性胸腔积液的细胞 |
| 22259 | 2024-08-09 |
Progress and applications of single-cell sequencing techniques
2020-06, Infection, genetics and evolution : journal of molecular epidemiology and evolutionary genetics in infectious diseases
DOI:10.1016/j.meegid.2020.104198
PMID:31958516
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综述 | 本文主要总结了单细胞测序技术的方法及其应用领域 | NA | NA | 总结单细胞测序技术的方法和应用领域，为其未来在临床上的应用提供潜在参考 | 单细胞测序技术的方法及其在胚胎和器官发育、免疫系统、癌症进展、寄生虫和传染病以及干细胞研究、抗体筛选和治疗研究开发等领域的应用 | NA | NA | 单细胞测序（SCS） | NA | 基因组、转录组和表观基因组 | NA |
| 22260 | 2024-08-09 |
Surfactant Expression Defines an Inflamed Subtype of Lung Adenocarcinoma Brain Metastases that Correlates with Prolonged Survival
2020-05-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-19-2184
PMID:31953311
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研究论文 | 研究通过量化肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）并分析其与肺腺癌脑转移的关系，揭示了表面活性剂代谢相关基因表达与免疫微环境及患者生存期的关联 | 首次发现表面活性剂代谢相关基因（SFTPA1, SFTPB, NAPSA）的高表达与肺腺癌脑转移的炎症亚型相关，这种亚型具有高密度的TIL和较长的生存期 | 研究样本量有限，且仅分析了部分患者的转录组数据 | 深入理解免疫系统与脑转移之间的相互作用，为这种致命疾病提供新的治疗选择 | 肺腺癌脑转移患者的肿瘤浸润淋巴细胞及表面活性剂代谢相关基因表达 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 81例肺腺癌脑转移患者，其中63例进行了转录组分析 |