单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27747 篇文献，本页显示第 22161 - 22180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22161 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis revealed a suppressive tumor immune microenvironment in EGFR mutant lung adenocarcinoma
2022-01, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2021-003534
PMID:35140113
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序和多重免疫组织化学技术，分析了EGFR突变型肺腺癌的肿瘤免疫微环境特征 | 首次全面描述了EGFR突变型肺腺癌的肿瘤微环境特征，从细胞组成和功能角度深入理解其免疫景观 | 研究样本量有限，仅包括九个未经治疗和三个经过免疫治疗的样本 | 旨在描述EGFR突变型肺腺癌的特定肿瘤微环境，以更好地理解其免疫景观 | EGFR突变型和野生型肺腺癌的免疫微环境 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 九个未经治疗和三个经过免疫治疗的样本 |
| 22162 | 2024-08-08 |
ATG16L1 is a Potential Prognostic Biomarker and Immune Signature for Osteosarcoma: A Study Based on Bulk RNA and Single-Cell RNA-Sequencing
2022, International journal of general medicine
IF:2.1Q2
DOI:10.2147/IJGM.S341879
PMID:35140506
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研究论文 | 本研究通过批量RNA测序和单细胞RNA测序分析，探讨了自噬相关基因ATG16L1在骨肉瘤中的预后生物标志物和免疫特征的作用 | 首次通过批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，揭示了ATG16L1作为骨肉瘤的潜在预后生物标志物和免疫特征 | 研究仅基于GSE21257数据库和GSE152048数据集，可能需要更多样本和数据集来验证结果 | 探讨ATG16L1作为骨肉瘤预后生物标志物和免疫特征的潜力 | 骨肉瘤患者及其肿瘤细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | RNA测序 | LASSO回归分析和Cox回归分析 | RNA | 使用GSE21257数据库和GSE152048数据集进行分析 |
| 22163 | 2024-08-08 |
Mapk14 is a Prognostic Biomarker and Correlates with the Clinicopathological Features and Immune Infiltration of Colorectal Cancer
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.817800
PMID:35141222
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研究论文 | 本研究探讨了Mapk14在结直肠癌中的表达及其与临床病理特征和免疫浸润的关系 | 发现Mapk14可作为结直肠癌的新型预后生物标志物，并与免疫浸润和药物治疗相关 | NA | 研究Mapk14在结直肠癌中的作用及其作为预后标志物的潜力 | Mapk14的表达、甲基化水平及其与结直肠癌临床病理特征和免疫浸润的关系 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了来自TCGA和GEO数据库的结直肠癌患者数据 |
| 22164 | 2024-08-08 |
Development of an Inflammation-Related lncRNA-miRNA-mRNA Network Based on Competing Endogenous RNA in Breast Cancer at Single-Cell Resolution
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.839876
PMID:35145966
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研究论文 | 本研究旨在探讨炎症与长非编码RNA（lncRNA）之间的关系，并在乳腺癌中建立基于竞争性内源RNA（ceRNA）的炎症相关网络 | 首次在单细胞分辨率下构建了乳腺癌中的炎症相关ceRNA网络，并识别了潜在的关键lncRNA LRRC75A-AS1 | NA | 探索炎症与lncRNA在乳腺癌中的关系及机制 | 乳腺癌中的炎症相关lncRNA及其ceRNA网络 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 基于四项单细胞RNA测序研究的数据 |
| 22165 | 2024-08-08 |
Integrated Analysis Reveals the Characteristics and Effects of SARS-CoV-2 Maternal-Fetal Transmission
2022, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2022.813187
PMID:35154056
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研究论文 | 本文通过综合分析大规模转录组和单细胞测序数据，探讨了影响SARS-CoV-2母婴传播的关键因素及其特征和影响 | 研究揭示了胚胎发育阶段多个组织中ACE2和TMPRSS2的表达情况，以及这些因素在母婴传播中的潜在风险 | 研究主要集中在转录组和单细胞测序数据分析，未涉及临床病例的具体观察 | 探究SARS-CoV-2母婴传播的特征、影响及其分子机制 | SARS-CoV-2母婴传播的关键因素、特征和影响 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 22166 | 2024-08-08 |
Characterization of Pipefish Immune Cell Populations Through Single-Cell Transcriptomics
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.820152
PMID:35154138
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术首次对海龙科鱼类的免疫细胞群进行了表征 | 首次利用单细胞RNA测序技术对海龙科鱼类的免疫细胞群进行表征，揭示了其独特的免疫细胞亚群 | NA | 探索海龙科鱼类在进化过程中免疫系统的变化及其对免疫细胞群动态的影响 | 海龙科鱼类的免疫细胞群 | 生物学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 基因表达数据 | 从血液和头肾提取的单个细胞 |
| 22167 | 2024-08-08 |
Integration of Single-Cell RNA Sequencing and Bulk RNA Sequencing Data to Establish and Validate a Prognostic Model for Patients With Lung Adenocarcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.833797
PMID:35154287
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建并验证了肺腺癌的预后模型 | 利用单细胞RNA测序技术，能够检测肿瘤细胞中的精确细胞和分子变化，这是传统RNA测序无法做到的 | NA | 构建肺腺癌的预后模型 | 肺腺癌患者 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 非负矩阵分解算法, Cox回归分析 | RNA测序数据 | 四个样本的单细胞RNA测序数据，以及来自TCGA和GEO数据库的批量RNA测序数据 |
| 22168 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA landscape of the osteoimmunology microenvironment in periodontitis
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.65694
PMID:35154475
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术揭示了牙周炎中骨免疫微环境的分子成分和细胞组成的复杂性 | 首次在单细胞水平上全面揭示了牙周炎中骨免疫微环境的细胞类型和分子通路，特别是纤维母细胞和间充质干细胞在牙周炎中的变化 | NA | 探索牙周炎中骨免疫微环境的单细胞RNA图谱及其在牙周骨再生中的作用 | 健康对照组、严重慢性牙周炎患者及接受初步牙周治疗后的患者 | 数字病理学 | 牙周病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | UMAP | RNA | 共51248个单细胞，来自健康对照组（4例）、严重慢性牙周炎患者（5例）及初步牙周治疗后1个月内的患者（3例） |
| 22169 | 2024-08-08 |
Lipid-related protein NECTIN2 is an important marker in the progression of carotid atherosclerosis: An intersection of clinical and basic studies
2021-Dec-01, Journal of translational internal medicine
IF:4.7Q1
DOI:10.2478/jtim-2021-0044
PMID:35136728
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研究论文 | 本研究探讨了脂质相关蛋白NECTIN2在颈动脉粥样硬化进展中的作用 | NECTIN2被识别为影响颈动脉粥样硬化的关键因素，并可能成为新的临床预防治疗靶点 | NA | 探索NECTIN2在颈动脉粥样硬化中的潜在作用 | 颈动脉粥样硬化患者和APOE-/-大鼠 | NA | 心血管疾病 | NA | NA | 单细胞转录组和微阵列数据 | 108名患者和APOE-/-大鼠 |
| 22170 | 2024-08-08 |
Discoveries in Pancreatic Physiology and Disease Biology Using Single-Cell RNA Sequencing
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.732776
PMID:35141228
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在胰腺生理和疾病生物学中的应用及其对糖尿病和胰腺癌治疗策略优化的潜在影响 | 单细胞RNA测序技术揭示了正常和疾病状态下胰腺中先前未知的细胞亚型，并研究了罕见胰岛细胞的功能角色以及糖尿病和癌症中各种细胞类型的作用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在胰腺生理和病理学中的应用，以优化糖尿病和胰腺癌的治疗策略 | 胰腺生理功能、胰腺肿瘤基因表达、糖尿病和胰腺癌中的细胞类型 | 数字病理学 | 糖尿病、胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22171 | 2024-08-08 |
Immune Infiltration of CD8+ T Cells in Patients With Diabetic Pancreatic Cancer Reduces the Malignancy of Cancer Tissues: An In Silico Study
2021, Frontiers in endocrinology
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fendo.2021.826667
PMID:35145483
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研究论文 | 本文通过计算研究探讨了糖尿病胰腺癌患者中CD8+ T细胞的免疫浸润如何降低癌细胞的恶性程度 | 首次揭示了糖尿病胰腺癌患者中炎症相关信号通路的激活增加CD8+ T细胞的免疫浸润，并减少恶性肿瘤组织的发展 | 研究基于数据库中的现有数据，未进行实验验证 | 探讨糖尿病胰腺癌患者中免疫浸润与肿瘤恶性程度的关系 | 糖尿病胰腺癌患者与非糖尿病胰腺癌患者的免疫浸润及肿瘤恶性程度 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞表达谱测序 | NA | mRNA表达数据 | 141例糖尿病胰腺癌患者和51例非糖尿病胰腺癌患者的mRNA表达数据 |
| 22172 | 2024-08-08 |
Single Cell Transcriptomic and Chromatin Profiles Suggest Layer Vb Is the Only Layer With Shared Excitatory Cell Types in the Medial and Lateral Entorhinal Cortex
2021, Frontiers in neural circuits
IF:3.4Q2
DOI:10.3389/fncir.2021.806154
PMID:35153682
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研究论文 | 本文通过单细胞分析技术研究了内侧和外侧内嗅皮质的染色质可及性和转录组特征，发现Vb层是唯一具有共享兴奋性细胞类型的层 | 首次在两个相似但不同的皮质区域应用单细胞染色质可及性分析，并结合scRNA-seq数据集进行整合分析 | 研究仅限于内侧和外侧内嗅皮质，未涉及所有脑区域 | 阐明内嗅皮质电路中的细胞类型及其功能基础 | 内侧和外侧内嗅皮质的神经细胞类型 | 神经科学 | NA | 单细胞分析 | NA | 转录组和染色质可及性数据 | 4,136个细胞 |
| 22173 | 2024-08-08 |
CA9-Related Acidic Microenvironment Mediates CD8+ T Cell Related Immunosuppression in Pancreatic Cancer
2021, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2021.832315
PMID:35155218
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研究论文 | 本研究整合了胰腺癌TCGA、GEO和单细胞RNA测序数据集，通过生物信息学方法、体外和体内实验探索胰腺癌免疫微环境的潜在预后标志物和潜在机制。 | 研究揭示了胰腺癌细胞通过CA9抑制CD8+ T细胞浸润的机制，为胰腺癌的免疫逃逸途径和免疫靶向治疗提供了新的视角。 | NA | 探索胰腺癌免疫微环境的潜在预后标志物和潜在机制。 | 胰腺癌的免疫微环境及其对CD8+ T细胞的影响。 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用了TCGA、GEO和单细胞测序数据集，具体样本数量未详细说明。 |
| 22174 | 2024-08-08 |
Interpreting Functional Impact of Genetic Variations by Network QTL for Genotype-Phenotype Association Study
2021, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2021.720321
PMID:35155440
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研究论文 | 本文提出了一种新的网络QTL框架，用于解析遗传变异对表型的功能影响，通过识别基因型与表型之间的网络关联，而非传统的表达QTL方法。 | 本文创新性地提出了网络QTL（nQTL）框架，通过识别基因型与表型之间的网络关联，能够更全面地解析遗传变异对表型的影响，特别是在复杂生物过程中。 | 本文未明确提及具体的研究局限性。 | 研究旨在通过网络QTL框架，解析遗传变异对表型的功能影响，特别是在疾病亚型、疾病预后、药物反应和病原因子关联中的应用。 | 研究对象包括遗传变异、基因网络、表型及其在生物医学数据中的应用。 | 基因组学 | NA | 网络QTL分析 | 网络QTL框架 | 基因表达数据 | 研究中使用了多种生物医学数据集，但具体样本数量未明确提及。 |
| 22175 | 2024-08-08 |
IsoCell: An Approach to Enhance Single Cell Clustering by Integrating Isoform-Level Expression Through Orthogonal Projection
2023 Jan-Feb, IEEE/ACM transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBB.2022.3147193
PMID:35100120
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研究论文 | 本文提出了一种通过正交投影整合isoform水平表达来增强单细胞聚类的方法IsoCell | 首次提出将isoform水平表达信息与基因水平表达信息结合，以增强单细胞聚类分析 | NA | 探索通过整合isoform水平表达信息来提高单细胞聚类分析的性能 | 单细胞RNA测序数据中的isoform水平表达信息 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | 正交投影矩阵 | 基因表达数据 | 十六个scRNA-seq数据集 |
| 22176 | 2024-08-08 |
A decade of molecular cell atlases
2022-08, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2022.01.004
PMID:35105475
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评论 | 本文讨论了利用单细胞转录组测序技术创建细胞图谱的历史和技术创新 | 介绍了单细胞转录组测序技术在创建细胞图谱方面的进展 | NA | 探讨细胞图谱的发展及其对理解细胞类型多样性的贡献 | 细胞类型的分子特征 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22177 | 2024-08-08 |
Integrated Analysis of Single-Cell and Spatial Transcriptomics in Keloids: Highlights on Fibrovascular Interactions in Keloid Pathogenesis
2022-08, The Journal of investigative dermatology
IF:5.7Q1
DOI:10.1016/j.jid.2022.01.017
PMID:35123990
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术，分析了瘢痕疙瘩组织及其正常皮肤对照样本，揭示了瘢痕疙瘩发病机制中的纤维血管相互作用。 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学技术，详细描绘了瘢痕疙瘩的细胞图谱，并发现了纤维细胞与内皮细胞之间的显著相互作用。 | 研究仅限于瘢痕疙瘩组织样本，未涉及其他类型的皮肤病变，可能限制了结果的普遍性。 | 探究瘢痕疙瘩的病理生理机制，特别是纤维细胞与内皮细胞在瘢痕疙瘩形成中的相互作用。 | 瘢痕疙瘩组织及其正常皮肤对照样本，以及患者匹配的瘢痕疙瘩和正常成熟瘢痕。 | 数字病理学 | 瘢痕疙瘩 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 22178 | 2024-08-08 |
SLRRSC: Single-Cell Type Recognition Method Based on Similarity and Graph Regularization Constraints
2022-07, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2022.3148286
PMID:35120014
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研究论文 | 本文提出了一种基于相似性和图正则化约束的单细胞类型识别方法SLRRSC，用于解决scRNA-seq数据中细胞类型识别的挑战 | 引入基于流形的图正则化和相似性约束到低秩表示方法中，以保留数据的局部几何结构并提高全局结构的学习能力 | NA | 开发一种新的子空间聚类算法，以更有效地从大量细胞混合物中识别细胞类型 | scRNA-seq数据中的单细胞聚类 | 生物信息学 | NA | 低秩表示模型 | SLRRSC算法 | scRNA-seq数据 | 模拟数据和真实单细胞数据集 |
| 22179 | 2024-08-08 |
Temporal modelling using single-cell transcriptomics
2022-06, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-021-00444-7
PMID:35102309
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综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学进行时间序列分析的方法，重点讨论了时间序列单细胞RNA测序（scRNA-seq）的分析和建模问题 | 单细胞转录组学方法革新了我们对多个生物过程和系统的研究能力，包括发育、分化、响应程序和疾病进展 | 时间序列单细胞RNA测序提出了新的分析和建模问题，如确定何时以及如何深入地分析细胞、连接不同时间点的细胞、学习连续轨迹以及整合批量和单细胞数据以重建动态网络模型 | 探讨时间序列单细胞RNA测序的分析和建模方法 | 单细胞转录组学数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 22180 | 2024-08-08 |
Signatures of malignant cells and novel therapeutic targets revealed by single-cell sequencing in lung adenocarcinoma
2022-06, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.4547
PMID:35102706
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组数据分析肺腺癌中的恶性细胞特异性基因，探索诊断和治疗标志物 | 发现了369个在单个恶性细胞中特异性表达的基因，其中70个编码分泌或膜结合蛋白的基因在肿瘤生物学中的细胞间通讯中发挥作用 | 需要进一步验证这些基因在更多类型的肿瘤中的作用 | 探索肺腺癌中单细胞转录组数据中的恶性细胞特异性基因，以发现新的诊断和治疗标志物 | 肺腺癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | LASSO回归模型 | 转录组数据 | 22,491个肿瘤细胞和181,666个正常细胞 |