单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 24273 篇文献，本页显示第 22041 - 22060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 22041 | 2024-08-09 |
Diversity of peripheral blood human NK cells identified by single-cell RNA sequencing
2020-04-14, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2019000699
PMID:32271902
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了健康CMV阴性供体中未刺激和IL-2激活的NK细胞的基因表达，并发现了三种已知和三种新型的人类血液NK细胞亚群 | 本文首次识别出三种新型的人类血液NK细胞亚群，并揭示了CMV阳性供体中NK细胞亚群比例的变化及其基因调控 | NA | 研究人类外周血中NK细胞的多样性和特定亚群的分类 | 人类外周血中的NK细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 来自健康CMV阴性供体的NK细胞 |
| 22042 | 2024-08-09 |
Insights into Gonadal Sex Differentiation Provided by Single-Cell Transcriptomics in the Chicken Embryo
2020-04-07, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.03.055
PMID:32268081
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组测序技术，对鸡胚胎性腺性别分化进行了全面分析 | 研究发现鸡胚胎支持细胞并非源自体腔上皮，而是源自DMRT1/PAX2/WNT4/OSR1间充质细胞群，且性腺细胞类型比以往认知更为复杂 | NA | 探究不同物种间性腺性别分化的细胞生物学差异 | 鸡胚胎性腺在性别分化过程中的细胞类型和来源 | NA | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 鸡胚胎性腺样本 |
| 22043 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing Maps Endothelial Metabolic Plasticity in Pathological Angiogenesis
2020-04-07, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2020.03.009
PMID:32268117
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析了28,337个鼠视网膜下腔内皮细胞（CECs）和新血管化内皮细胞（CNV-ECs）的代谢异质性 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了内皮细胞在病理血管生成中的代谢转录组可塑性，并识别了SQLE和ALDH18A1作为新的代谢血管生成靶点 | 研究主要基于鼠模型，未来需在人类样本中验证这些发现 | 探索内皮细胞代谢在肿瘤血管生成和脉络膜新生血管化中的作用 | 鼠视网膜下腔内皮细胞和新生血管化内皮细胞的代谢转录组 | 数字病理学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 28,337个鼠视网膜下腔内皮细胞和新生血管化内皮细胞 |
| 22044 | 2024-08-09 |
A conserved dendritic-cell regulatory program limits antitumour immunity
2020-04, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-020-2134-y
PMID:32269339
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术，在人鼠非小细胞肺癌中鉴定出一类名为'富含免疫调节分子的成熟树突状细胞'（mregDCs）的新型树突状细胞群，并探讨了其在肿瘤抗原摄取后对DC1功能的调节作用 | 首次发现并命名了mregDCs，并揭示了其在肿瘤抗原摄取后对DC1功能的调节机制 | 研究主要基于人鼠非小细胞肺癌模型，其结果在其他类型肿瘤中的适用性有待进一步验证 | 探讨树突状细胞在肿瘤免疫治疗中的作用及其调控机制 | 树突状细胞（DC1s和DC2s）及其在肿瘤抗原摄取后的功能变化 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 人鼠非小细胞肺癌样本 |
| 22045 | 2024-08-09 |
Cellular, transcriptomic and isoform heterogeneity of breast cancer cell line revealed by full-length single-cell RNA sequencing
2020, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2020.03.005
PMID:32257051
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研究论文 | 本研究采用全长的单细胞RNA测序技术，揭示了三阴性乳腺癌细胞系SUM149的细胞、转录组和异构体异质性 | 本研究首次使用深度的全长单细胞RNA测序技术，揭示了三阴性乳腺癌细胞系中癌症干细胞的细胞、转录组和异构体异质性 | 现有的单细胞转录组技术存在数据丢失和不均匀覆盖的限制，这挑战了肿瘤异质性的进一步划分 | 研究肿瘤异质性的生成机制，特别是通过遗传和表观遗传机制，以及这些机制在肿瘤形成和转移中的作用 | 三阴性乳腺癌细胞系SUM149及其癌症干细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 全长单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及三阴性乳腺癌细胞系SUM149和红白血病K562细胞系作为对照 |
| 22046 | 2024-08-09 |
Single-Cell Approaches to Profile the Response to Immune Checkpoint Inhibitors
2020, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2020.00490
PMID:32265933
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综述 | 本文综述了单细胞技术在免疫检查点抑制剂治疗反应分析中的应用 | 整合传统方法与新型单细胞技术，如高参数流式细胞术、单细胞测序和高分辨率成像，以深入研究肿瘤微环境中的分子和细胞相互作用 | NA | 探讨单细胞技术如何帮助揭示肿瘤微环境中免疫细胞的异质性 | 免疫检查点抑制剂治疗反应的分子和细胞机制 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 22047 | 2024-08-09 |
Non-coding RNAs in Cardiac Regeneration
2020, Advances in experimental medicine and biology
DOI:10.1007/978-981-15-1671-9_9
PMID:32285411
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研究论文 | 本文探讨了非编码RNA在心脏再生中的作用 | 文章提出通过重新激活现有心肌细胞的增殖能力来促进心脏再生的新研究方向 | 尽管干细胞疗法对功能参数有积极影响，但c-kit阳性心脏前体细胞对功能性心肌细胞生成的贡献有限 | 研究如何通过重新激活心肌细胞的增殖来促进心脏再生 | 非编码RNA在心脏再生中的作用及心肌细胞的增殖机制 | NA | 心血管疾病 | 单细胞测序和遗传谱系追踪 | NA | 细胞 | 涉及小鼠心脏在稳态和再生条件下的细胞 |
| 22048 | 2024-08-09 |
Long noncoding RNA 2193 regulates meiosis through global epigenetic modification and cytoskeleton organization in pig oocytes
2020-11, Journal of cellular physiology
IF:4.5Q1
DOI:10.1002/jcp.29675
PMID:32239703
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序在猪卵母细胞中鉴定了一种新的长非编码RNA（lncRNA2193），并探讨了其在卵母细胞减数分裂中的功能 | 首次揭示了lncRNA2193在猪卵母细胞减数分裂中的作用，包括其对全局表观遗传修饰和细胞骨架组织的调控 | 研究主要集中在体外成熟过程中，未涉及体内环境下的影响 | 探讨长非编码RNA在哺乳动物生殖细胞中的生物学功能 | 猪卵母细胞中的lncRNA2193及其在减数分裂中的作用 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 猪卵母细胞 |
| 22049 | 2024-08-09 |
Identifying cell types to interpret scRNA-seq data: how, why and more possibilities
2020-07-29, Briefings in functional genomics
IF:2.5Q3
DOI:10.1093/bfgp/elaa003
PMID:32232401
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综述 | 本文综述了用于解释单细胞RNA测序（scRNA-seq）数据中细胞类型识别的方法和工具，并探讨了scRNA-seq在未来的发展可能性 | NA | NA | 探讨scRNA-seq数据中细胞类型识别的方法及其未来发展 | scRNA-seq数据中的细胞类型 | 数字病理学 | NA | scRNA-seq | NA | 文本 | NA |
| 22050 | 2024-08-09 |
Essential gene expression pattern of head and neck squamous cell carcinoma revealed by tumor-specific expression rule based on single-cell RNA sequencing
2020-07-01, Biochimica et biophysica acta. Molecular basis of disease
DOI:10.1016/j.bbadis.2020.165791
PMID:32234410
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研究论文 | 本文通过基于单细胞RNA测序的肿瘤特异性表达规则，揭示了头颈鳞状细胞癌的关键基因表达模式 | 利用单细胞测序技术消除了非恶性细胞对传统批量测序数据的影响，并建立了一种计算过滤策略来识别肿瘤细胞 | NA | 旨在识别头颈鳞状细胞癌的核心致癌因素，并加深对肿瘤异质性和肿瘤发生的理解 | 头颈鳞状细胞癌及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 多个独立数据集 |
| 22051 | 2024-08-09 |
Tumor Microenvironment Is Critical for the Maintenance of Cellular States Found in Primary Glioblastomas
2020-07, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-20-0057
PMID:32253265
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研究论文 | 本文通过比较五名患者来源的四种胶质母细胞瘤干细胞（GSC）衍生模型类型的单细胞RNA测序，探讨了肿瘤微环境在维持原发性胶质母细胞瘤细胞状态中的关键作用 | 首次展示了神经解剖学上准确的人类微环境对于重现人类原发性胶质母细胞瘤细胞状态的关键性和充分性 | NA | 探讨不同患者来源的胶质母细胞瘤模型能否重现原发性肿瘤的全部异质性 | 胶质母细胞瘤干细胞及其衍生模型 | 数字病理学 | 脑癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 五名患者的肿瘤细胞 |
| 22052 | 2024-08-09 |
Uncovering the key dimensions of high-throughput biomolecular data using deep learning
2020-06-04, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkaa191
PMID:32232416
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research paper | 本文提出了一种基于自编码器的深度学习框架DeepAE，用于解析高维单细胞RNA-seq数据的关键维度 | DeepAE在揭示单细胞RNA-seq数据的关键维度方面表现优于传统方法，并能在其他平台如质谱流式细胞术和代谢组学中展现全面性能 | NA | 解决高维单细胞RNA-seq数据的解析问题 | 单细胞RNA-seq数据的关键维度 | machine learning | NA | RNA-seq | auto-encoder | gene expression | 九个转录组学数据集 |
| 22053 | 2024-08-09 |
Identification of a potential mechanism of acute kidney injury during the COVID-19 outbreak: a study based on single-cell transcriptome analysis
2020-06, Intensive care medicine
IF:27.1Q1
DOI:10.1007/s00134-020-06026-1
PMID:32236644
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 22054 | 2024-08-09 |
Joint learning dimension reduction and clustering of single-cell RNA-sequencing data
2020-06-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa231
PMID:32246821
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研究论文 | 本文提出了一种联合学习单细胞RNA测序数据降维和聚类的新算法DRjCC | DRjCC算法通过联合学习降维和细胞聚类，改善了细胞类型发现的性能 | NA | 提高单细胞RNA测序数据中细胞类型发现的准确性和效率 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 涉及11个单细胞RNA测序数据集，细胞数量从49到68,579不等，细胞类型从3到14种 |
| 22055 | 2024-08-09 |
Genomic Analysis of Circulating Tumor Cells at the Single-Cell Level
2020-06, The Journal of molecular diagnostics : JMD
DOI:10.1016/j.jmoldx.2020.02.013
PMID:32247862
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研究论文 | 本文评估了四种全基因组扩增（WGA）/下一代测序工作流程在单个循环肿瘤细胞（CTC）基因组分析中的应用 | MALBAC与低通全基因组测序结合的工作流程在全基因组拷贝数变异（CNV）分析中表现出更好的覆盖广度、均匀性和重复性 | 所有评估的单细胞测序工作流程在突变检测方面均未达到临床应用所需的足够灵敏度和特异性 | 评估不同全基因组扩增方法在单个循环肿瘤细胞基因组分析中的性能 | 循环肿瘤细胞（CTC）的基因组分析 | 数字病理学 | 肺癌 | 下一代测序（NGS） | NA | 基因组数据 | 四个鳞状非小细胞肺癌患者的单个循环肿瘤细胞 |
| 22056 | 2024-08-09 |
GAD-alum immunotherapy in type 1 diabetes expands bifunctional Th1/Th2 autoreactive CD4 T cells
2020-06, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-020-05130-7
PMID:32248243
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研究论文 | 本研究探讨了GAD-alum免疫疗法在1型糖尿病中的作用机制，特别是在调节Th1自身免疫和诱导Th2反应方面。 | 本研究发现GAD-alum免疫疗法能够激活并扩增具有双功能Th1/Th2表型的GAD特异性CD4 T细胞。 | NA | 研究GAD-alum免疫疗法在1型糖尿病中的作用机制，特别是其如何调节Th1自身免疫和诱导Th2反应。 | GAD-alum免疫疗法对GAD特异性CD4 T细胞的影响。 | 免疫学 | 1型糖尿病 | GAD-alum免疫疗法 | NA | 血液单个核细胞 | 参与者接受了20 μg GAD-alum（两次或三次）或alum单独免疫，并在基线和治疗后采集了外周血单个核细胞样本。 |
| 22057 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing of murine islets shows high cellular complexity at all stages of autoimmune diabetes
2020-06-01, The Journal of experimental medicine
IF:12.6Q1
DOI:10.1084/jem.20192362
PMID:32251514
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，对非肥胖糖尿病小鼠胰岛中的多种浸润细胞在自身免疫性糖尿病过程中的转录组异质性进行了无偏倚的检查 | 首次揭示了自身免疫性糖尿病过程中胰岛微环境的动态重塑，以及特定细胞亚群的转录组特征 | NA | 定义自身免疫性糖尿病的分期，并揭示驱动该疾病的转录组特异性细胞群体 | 非肥胖糖尿病小鼠胰岛中的浸润细胞 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 22058 | 2024-08-09 |
Cell type-specific transcriptomics of esophageal adenocarcinoma as a scalable alternative for single cell transcriptomics
2020-06, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.12680
PMID:32255255
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研究论文 | 本文开发了一种协议，通过荧光激活细胞分选和随后的RNA测序，将食管腺癌组织分离成白细胞、上皮细胞和成纤维细胞，并对其转录组进行分析 | 提出了一种更可扩展的方法，通过分离特定细胞类型进行转录组分析，以替代单细胞转录组学 | NA | 开发一种更可扩展的方法来研究食管腺癌中特定细胞群体的转录组变化及其与临床参数的关联 | 食管腺癌组织中的白细胞、上皮细胞和成纤维细胞 | 数字病理学 | 食管腺癌 | 荧光激活细胞分选，RNA测序 | NA | 转录组数据 | 9名患者的肿瘤样本 |
| 22059 | 2024-08-09 |
Bilateral murine tumor models for characterizing the response to immune checkpoint blockade
2020-05, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-020-0299-3
PMID:32238953
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研究论文 | 本文描述了一种双侧小鼠肿瘤模型，用于研究免疫检查点阻断（ICB）疗法的反应 | 该模型通过使用同基因癌细胞系，展示了ICB疗法的对称且二分反应，有助于在高度均质化的背景下详细分析整个肿瘤 | NA | 研究免疫检查点阻断疗法在不同肿瘤模型中的反应机制 | 小鼠肿瘤模型及其对ICB疗法的反应 | NA | NA | RNA-seq, 免疫组织化学, 单细胞RNA-seq, 流式细胞术 | NA | 组织, 单细胞悬液 | NA |
| 22060 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA sequencing identifies senescent cerebromicrovascular endothelial cells in the aged mouse brain
2020-04, GeroScience
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s11357-020-00177-1
PMID:32236824
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了老年小鼠大脑中衰老的脑微血管内皮细胞 | 首次通过单细胞RNA测序技术在老年小鼠模型中检测到衰老的脑微血管内皮细胞，并提出了评估衰老对不同脑细胞类型影响及多种衰老药物治疗效果的方法 | 研究仅限于C57BL/6小鼠模型，可能限制了结果的普遍性 | 探讨年龄相关性脑微血管内皮细胞表型变化及其在血管性认知障碍中的作用机制 | 老年小鼠大脑中的脑微血管内皮细胞 | 数字病理学 | 神经退行性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 4233个细胞，来自3个月和28个月大的C57BL/6小鼠 |