单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 35765 篇文献，本页显示第 2181 - 2200 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2181 | 2025-12-29 |
Multi-Omics Integration Identifies FGF1 as a Diagnostic Biomarker and RAS-MAPK-Driven Pathogenic Factor in Osteoarthritis
2025, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S553461
PMID:41450747
|
研究论文 | 本研究通过多组学整合分析，鉴定出FGF1作为骨关节炎的诊断生物标志物，并揭示了其通过激活RAS-MAPK通路在疾病发病机制中的关键作用 | 首次通过整合GWAS、eQTL、转录组等多组学数据，结合机器学习、孟德尔随机化和单细胞测序技术，系统性地将FGF1鉴定为骨关节炎的诊断生物标志物和致病因子，并阐明了其通过RAS-MAPK通路介导软骨破坏的具体机制 | 孟德尔随机化分析仅提供了提示性的因果证据，需要进一步的功能实验验证；研究主要基于公共数据库和体外/体内实验，缺乏大规模临床队列的独立验证 | 识别骨关节炎的潜在治疗靶点并探索相关的机制通路 | 骨关节炎相关的基因、通路和软骨细胞 | 生物信息学与多组学整合分析 | 骨关节炎 | GWAS, eQTL分析, 差异表达分析, WGCNA, PPI网络分析, 机器学习, 孟德尔随机化, 单细胞测序, 体外实验, 体内实验 | 机器学习算法 | 基因组、转录组、单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2182 | 2025-12-29 |
Rank Aggregation Methods and Tools in Genomic Data Analysis
2025, Current genomics
IF:1.8Q3
|
综述 | 本文综述了基因组数据分析中的排序聚合方法及其工具，重点介绍了针对基因组学研究复杂性定制的技术及其应用 | 系统性地概述了针对基因组数据异质性、混合质量排序等挑战而专门设计的排序聚合方法，并指出了在单细胞组学和空间转录组学等新兴领域中的应用前景 | 作为一篇综述文章，未提出新的算法或模型，主要侧重于现有方法的总结和未来方向的展望 | 为研究人员提供基因组数据整合中排序聚合方法的背景知识，以有效应对数据整合的复杂性 | 基因组数据，特别是来自基因表达分析、荟萃分析、基因优先排序和生物标志物发现等领域的排序数据 | 机器学习 | NA | 排序聚合 | NA | 排序数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2183 | 2025-12-29 |
COL8A1 as a pro-inflammatory mediator bridges immune evasion and therapy resistance in glioma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1727298
PMID:41451204
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法，鉴定出COL8A1作为胶质瘤中连接免疫逃逸和治疗抵抗的关键促炎介质 | 首次将COL8A1确定为胶质瘤炎症信号网络的核心枢纽，并系统揭示了其与免疫微环境、治疗抵抗和预后的多重关联 | 研究主要基于计算分析和体外验证，缺乏体内动物模型实验和临床样本的深入机制验证 | 探索胶质瘤中炎症信号在肿瘤进展和治疗反应中的作用，寻找新的治疗靶点和预后标志物 | 胶质瘤细胞、肿瘤微环境中的免疫细胞和基质细胞 | 生物信息学与计算生物学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、微阵列分析、机器学习算法 | CoxBoost、LASSO、随机生存森林 | 基因表达数据、生存数据、突变数据 | 18个样本中的93,027个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2184 | 2025-12-29 |
RARS1 inhibits ENO1 ubiquitination and degradation to protect against ferroptosis in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1686597
PMID:41451236
|
研究论文 | 本研究探讨了RARS1基因在肝细胞癌（LIHC）进展中的作用，发现其通过调节ENO1的泛素化和降解来抑制铁死亡，从而促进肿瘤发展 | 首次揭示RARS1通过保护ENO1免于泛素化降解来抑制铁死亡，在LIHC中作为新的致癌机制，并基于AR-DEGs对LIHC进行分子亚型分型，识别了不同的免疫景观 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，缺乏体内动物模型验证，且药物AH.6809的临床前和临床效果尚未充分评估 | 探究RARS1在肝细胞癌进展中的功能及其作为治疗靶点的潜力 | 肝细胞癌（LIHC）患者样本、LIHC细胞系 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 差异表达分析、Cox回归分析、非负矩阵分解（NMF）、生物信息学分析、分子生物学技术（包括基因敲低）、药物敏感性分析 | NA | 转录组数据、单细胞数据、空间转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2185 | 2025-12-29 |
Impact of chemotherapeutic agents on liver microenvironment: oxaliplatin create a pro-metastatic landscape
2023-Sep-11, Journal of experimental & clinical cancer research : CR
IF:11.4Q1
DOI:10.1186/s13046-023-02804-z
PMID:37697332
|
研究论文 | 本研究探讨了奥沙利铂对肝脏微环境的影响，发现其通过诱导免疫抑制促进结直肠癌肝转移 | 首次利用单细胞RNA测序揭示奥沙利铂如何改变肝脏免疫微环境，并证明T细胞补充可逆转其促转移效应 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限，且未涉及其他化疗药物的比较 | 探究奥沙利铂对肝脏预转移微环境的影响及其在结直肠癌肝转移中的作用机制 | BALB/c和BALB/c-nude小鼠模型、CT26细胞系、结直肠癌患者样本 | 单细胞组学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、流式细胞术、LDH检测、细胞增殖与凋亡实验、荟萃分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、流式细胞数据、临床荟萃数据 | 小鼠模型及结直肠癌患者样本，具体数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2186 | 2025-12-28 |
Lubricin maintains temporomandibular joint homeostasis by regulating synovial inflammation
2026-Mar, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2025.101051
PMID:41445976
|
研究论文 | 本研究探讨了蛋白聚糖4（Prg4，即润滑素）在维持颞下颌关节稳态中的作用及其在颞下颌关节骨关节炎中的病理意义 | 首次利用高分辨率Visium HD空间转录组学揭示了Prg4在颞下颌关节中的区域特异性表达模式，并阐明了其在炎症过程中的时间依赖性调控作用 | 研究主要基于小鼠模型，其结论向人类临床转化的有效性仍需进一步验证 | 探索Prg4在维持颞下颌关节稳态及治疗颞下颌关节骨关节炎中的潜在再生治疗应用 | 野生型和Prg4敲除小鼠的颞下颌关节、体外培养的滑膜细胞 | 空间转录组学 | 颞下颌关节骨关节炎 | 空间转录组学、谱系追踪、体外炎症刺激 | NA | 空间转录组数据、组织学图像、基因表达数据 | 野生型和Prg4敲除小鼠模型，具体数量未明确说明 | 10x Genomics | 空间转录组学 | Visium HD | 高分辨率Visium HD空间转录组学平台 |
| 2187 | 2025-12-28 |
SpatialFusion: A Unified Model for Integrating Spatial Transcriptomics to Unveil Cell-type Distribution, Interaction, and Functional Heterogeneity in Tissue Microenvironments
2026-Jan-15, Journal of molecular biology
IF:4.7Q1
DOI:10.1016/j.jmb.2025.169535
PMID:41237948
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为SpatialFusion的深度学习模型，旨在通过整合基因表达和空间坐标来改进空间转录组学中的空间域识别和细胞类型反卷积 | SpatialFusion模型创新性地结合了图神经网络和注意力机制，通过空间数据的多维嵌入捕获复杂空间关系，并采用双编码策略（空间图和特征图的协同学习）及自监督对比学习，显著提高了准确性和鲁棒性 | NA | 解决空间转录组学中空间域识别和细胞类型反卷积在准确性、鲁棒性和计算效率方面的挑战 | 人类DLPFC数据集和乳腺癌肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 乳腺癌 | 空间转录组学 | 图神经网络, 注意力机制 | 基因表达数据, 空间坐标数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2188 | 2025-12-28 |
Dissecting neuroblastoma heterogeneity through single-cell multi-omics: insights into development, immunity, and therapeutic resistance
2026-Jan, Oncogene
IF:6.9Q1
DOI:10.1038/s41388-025-03635-2
PMID:41309932
|
综述 | 本文综述了单细胞多组学技术在解析神经母细胞瘤异质性、发育起源、免疫微环境及治疗耐药性方面的应用与见解 | 整合单细胞转录组学、表观基因组学和空间分析，揭示了神经母细胞瘤沿肾上腺能-间充质连续体的细胞状态动态、肿瘤微环境互作及可逆的耐药机制，强调了肿瘤可塑性作为潜在治疗靶点 | NA | 解析神经母细胞瘤的细胞异质性、发育起源、免疫微环境及治疗耐药机制，以指导联合治疗策略 | 神经母细胞瘤（儿童最常见的颅外实体肿瘤） | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞多组学分析 | NA | 单细胞转录组、表观基因组、空间分析数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2189 | 2025-12-28 |
Hpv-driven rewiring of the tumor immune microenvironment through single-cell profiling informs prognosis and therapy in HNSCC
2026-Jan, Oral oncology
IF:4.0Q2
|
研究论文 | 本研究通过单细胞分析揭示了HPV感染如何重塑头颈鳞状细胞癌的肿瘤免疫微环境，并开发了一个基于HPV相关基因的预后模型 | 利用单细胞RNA测序技术全面描绘HPV+与HPV- HNSCC肿瘤免疫微环境的差异，并构建了一个基于七个HPV相关基因的新型预后风险特征 | 研究依赖于公共数据库（TCGA和GEO）的数据，可能受到样本异质性和技术批次效应的影响，且需要进一步的前瞻性临床验证 | 阐明HPV感染如何重编程头颈鳞状细胞癌的肿瘤免疫微环境，并开发一个用于患者分层和指导个性化治疗的预后模型 | 头颈鳞状细胞癌患者，特别是基于HPV状态（HPV+和HPV-）的肿瘤样本 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序，转录组去卷积分析，LASSO-COX回归，免疫组织化学 | 预后风险模型（基于LASSO-COX回归） | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的多个独立队列，具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2190 | 2025-12-28 |
The Crosstalk of Epithelial Cells, Endothelial Cells, and Macrophages Orchestrates Inflammation in Chronic Obstructive Pulmonary Disease
2026-Jan, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.70120
PMID:41452059
|
研究论文 | 本研究通过建立细胞共培养模型，探讨了慢性阻塞性肺病（COPD）中上皮细胞、内皮细胞和巨噬细胞之间的相互作用如何通过激活NF-κB和GSK3β信号通路来放大炎症反应 | 首次结合单细胞RNA测序数据分析和LPS诱导的三细胞（A549、HUVECs、THP-1）共培养模型，系统揭示了COPD中特定细胞间通讯网络及其通过NF-κB和GSK3β信号通路放大炎症的机制 | 研究主要基于体外细胞模型，可能无法完全模拟体内复杂的微环境；使用的细胞系（如A549、THP-1）可能无法代表所有相关细胞类型的异质性 | 旨在建立模拟COPD炎症微环境的细胞共培养模型，并研究其中细胞通讯的机制 | 肺泡上皮细胞（A549）、人脐静脉内皮细胞（HUVECs）和巨噬细胞（THP-1） | 单细胞组学与细胞生物学 | 慢性阻塞性肺病 | 单细胞RNA测序，细胞共培养，Transwell系统，细胞因子谱分析，蛋白质印迹 | 细胞共培养模型 | 单细胞RNA测序数据，细胞因子分泌数据，蛋白质表达数据 | 基于GEO数据库中的单细胞RNA测序数据进行分析，具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2191 | 2025-12-28 |
Comparative analysis reveals distinct molecular heterogeneity in vaginal cells between recurrent and primary pelvic organ prolapse patients
2025-Dec-27, Frontiers of medicine
IF:3.9Q2
DOI:10.1007/s11684-025-1180-0
PMID:41454077
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序比较分析了复发性与原发性盆腔器官脱垂患者阴道细胞中的分子异质性 | 首次在单细胞分辨率上揭示了复发性与原发性盆腔器官脱垂之间的分子异质性差异，并识别出与复发相关的特异性成纤维细胞亚群和巨噬细胞表型变化 | 研究基于现有单细胞RNA测序数据集，样本量可能有限，且未进行功能验证实验 | 探究盆腔器官脱垂复发与原发性病例在阴道细胞分子层面的异质性差异 | 复发性与原发性盆腔器官脱垂患者的阴道成纤维细胞、平滑肌细胞和巨噬细胞 | 单细胞组学 | 盆腔器官脱垂 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2192 | 2025-12-28 |
Immune involvement in neuropsychiatric disorders: Insights from single-cell transcriptomic studies
2025-Dec-27, Psychiatry and clinical neurosciences
IF:5.0Q1
DOI:10.1111/pcn.70018
PMID:41454738
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学技术在神经精神疾病免疫机制研究中的应用与发现 | 整合单细胞RNA测序和单核RNA测序技术，克服了批量RNA测序的平均化效应，揭示了多种神经精神疾病中的细胞类型特异性免疫改变 | 单细胞和单核RNA测序方法仍面临技术挑战，如细胞捕获效率、测序深度和数据分析复杂性 | 探讨免疫系统在神经精神疾病中的作用，并综述相关单细胞转录组学研究进展 | 精神疾病（如精神分裂症、双相情感障碍、重度抑郁症、自闭症谱系障碍、注意力缺陷多动障碍）和神经系统疾病（如阿尔茨海默病、帕金森病、路易体痴呆、多发性硬化症、抗NMDA受体脑炎） | 数字病理学 | 神经精神疾病 | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 批量RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2193 | 2025-12-28 |
CellCraft: an extensible visual programming application for gene regulatory network inference
2025-Dec-26, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaf684
PMID:41452748
|
研究论文 | 本文介绍了CellCraft，一个基于Web的应用程序，旨在简化单细胞RNA测序数据的基因调控网络推断 | CellCraft提供了一个直观的图形用户界面和视觉编程接口，简化了复杂多步骤分析的设计与执行，并采用模块化插件架构确保可扩展性 | NA | 开发一个用户友好且可扩展的应用程序，用于单细胞RNA测序数据的基因调控网络推断 | 单细胞RNA测序数据 | 自然语言处理 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2194 | 2025-12-28 |
Non-parasite genome encoded virus-like RNAs reprogram the pathogenicity of human blood flukes
2025-Dec-26, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-67822-1
PMID:41453891
|
研究论文 | 本研究发现了四种存在于日本血吸虫中的非寄生虫基因组编码的病毒样RNA，这些RNA在生殖细胞中富集，通过编码RNA依赖性RNA聚合酶调控胚胎活力和产卵，从而影响宿主病理 | 首次在人类血吸虫中鉴定出非寄生虫基因组编码的病毒样RNA，并揭示其通过RdRp调控生殖和生存的关键功能，为血吸虫病控制提供了新的潜在治疗靶点 | 研究主要聚焦于日本血吸虫和涡虫，其他寄生虫或生物中的ngRNA功能尚未探索，且机制细节需进一步验证 | 探究非寄生虫基因组编码RNA在寄生虫生物学中的作用，特别是其对病原性和生存的影响 | 日本血吸虫（Schistosoma japonicum）和涡虫（Dugesia japonica） | 寄生虫学 | 血吸虫病 | 宏转录组学、单细胞RNA测序、RNA干扰、分子生物学方法 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2195 | 2025-12-28 |
Phosphodiesterase ENPP2, which is co-upregulated in obese and pregnant mice, is essential for islet beta cell compensation during obesity
2025-Dec-26, Diabetologia
IF:8.4Q1
DOI:10.1007/s00125-025-06639-5
PMID:41454014
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，识别了在肥胖和妊娠小鼠胰岛β细胞中共同上调的磷酸二酯酶ENPP2，并验证了其通过LPA-Akt/mTOR信号通路促进β细胞增殖、抑制凋亡和增强胰岛素分泌的关键作用 | 首次利用单细胞RNA测序比较肥胖和妊娠小鼠胰岛细胞的转录组，发现ENPP2作为共同上调基因，在β细胞补偿中起核心调节作用，并揭示了其通过LPA受体2介导的Akt/mTOR通路机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类糖尿病样本中ENPP2表达降低的临床相关性及治疗潜力需进一步验证 | 识别能适度增强肥胖期间β细胞补偿能力的关键分子 | 饮食诱导肥胖小鼠、妊娠小鼠的胰岛细胞，Min6 β细胞系，以及Enpp2基因敲除和过表达转基因小鼠 | 单细胞组学 | 糖尿病 | 单细胞RNA-seq, 定量PCR, 免疫荧光 | NA | RNA表达数据 | 未明确指定样本数量，涉及多种小鼠模型和细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2196 | 2025-12-28 |
Coronary Artery Calcification: Decoding Mechanisms, Innovations, and Translational Strategies from Bench to Bedside
2025-Dec-26, Journal of cardiovascular translational research
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12265-025-10720-0
PMID:41454180
|
综述 | 本文回顾了冠状动脉钙化（CAC）30年的研究进展，整合了病理机制、技术创新和临床证据，并探讨了从被动标志物到主动调控过程的认知转变 | 总结了单细胞测序揭示的CAC内膜与中膜亚型及其驱动通路（如BMP2/Smad、OPG/RANKL），并强调了血管内碎石术（IVL）和人工智能在影像分析中的创新应用 | 指出他汀类药物对钙化的双重效应、亚型诊断空白、以及先进工具（如IVL）在资源有限地区普及率低（>70%无法获得）等挑战 | 旨在综合CAC的病理机制、技术进展与临床管理策略，推动从被动治疗向主动血管健康优化的转变 | 冠状动脉钙化（CAC）及其相关的动脉粥样硬化病理过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞测序，人工智能影像分析 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2197 | 2025-12-28 |
Decoding anoikis-related genes in lung adenocarcinoma brainmetastasis via single-cell RNA sequencing: CD44-mediated functions
2025-Dec-26, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-025-15485-y
PMID:41454310
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序解码了肺腺癌脑转移中失巢凋亡相关基因的作用，并验证了CD44的关键功能 | 首次在单细胞水平上系统分析了肺腺癌脑转移过程中失巢凋亡相关基因的表达变化和功能，并构建了基于批量RNA数据的预后模型 | 样本量相对较小（6个肺癌样本和6个脑转移样本），且为回顾性研究 | 探究失巢凋亡相关基因在肺腺癌脑转移进展中的作用 | 肺腺癌原发肿瘤组织和脑转移组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 预后模型 | 单细胞RNA测序数据，批量RNA测序数据，临床生存数据 | 6个肺癌样本和6个脑转移样本（来自单细胞RNA测序数据集），外加用于验证的临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2198 | 2025-12-28 |
Identification of conserved canonical marker genes in human and mouse adrenal glands using Visium spatial transcriptomics
2025-Dec-24, Histochemistry and cell biology
IF:2.1Q2
DOI:10.1007/s00418-025-02446-6
PMID:41442035
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术，全面绘制了成年人类和小鼠肾上腺的基因表达图谱，旨在鉴定跨物种保守的经典标记基因 | 首次在人类和小鼠肾上腺中系统性地整合空间转录组数据，揭示了一个定义肾上腺分区和功能的保守经典标记基因目录，并强调了小鼠模型在肾上腺研究中的转化价值 | 研究样本量有限（仅1例人类样本和4只小鼠），且人类和小鼠样本采用了不同的制备方法（OCT vs FFPE），可能影响直接比较 | 鉴定人类和小鼠肾上腺中保守的经典标记基因，以理解肾上腺组织的分子保守性和支持小鼠模型的转化研究 | 成年人类肾上腺（31岁女性）和成年小鼠肾上腺（10周龄雄性CD-1小鼠） | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 无监督聚类 | 空间基因表达数据 | 1例人类肾上腺样本，4只小鼠肾上腺样本 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | NA |
| 2199 | 2025-12-28 |
Identification of coagulation-related hub genes in ischemic stroke based on bioinformatics integration analysis and investigation of their immune regulatory mechanisms
2025-Dec-24, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03477-4
PMID:41444657
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学整合分析，识别了缺血性脑卒中中与凝血相关的枢纽基因，并探讨了其免疫调控机制 | 结合多个数据集和机器学习模型筛选枢纽基因，并通过单细胞RNA-seq分析其在特定细胞簇中的表达定位 | 部分枢纽基因在独立数据集和RT-qPCR验证中表达趋势不完全一致，且样本量有限 | 探索凝血相关基因在缺血性脑卒中发病机制中的作用，并寻找潜在的生物标志物和治疗靶点 | 缺血性脑卒中患者样本及相关基因表达数据 | 生物信息学 | 缺血性脑卒中 | 生物信息学整合分析、机器学习、RT-qPCR、单细胞RNA-seq | 随机森林、梯度提升决策树、支持向量机 | 基因表达数据 | 多个数据集（GSE16561、GSE9877、GSE58294、GSE224273）及临床样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2200 | 2025-12-28 |
Characterization of m6A-regulated targets and immune cells in dental caries: insights from multi-omics analysis
2025-Dec-24, European journal of medical research
IF:2.8Q2
DOI:10.1186/s40001-025-03514-2
PMID:41444670
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据，探讨了m6A相关遗传位点与龋齿之间的因果关系，并提供了龋齿的单细胞转录组图谱 | 首次结合m6A-QTL数据、GWAS数据和单细胞RNA测序数据，系统研究了m6A修饰在龋齿发病机制中的作用，并利用孟德尔随机化方法验证了免疫细胞特征与龋齿的因果关系 | 研究主要基于公开数据库和单细胞测序数据，样本量相对有限，且龋齿的病因复杂，其他环境因素和遗传因素可能未被完全考虑 | 探究m6A相关遗传变异与龋齿之间的因果关系，并分析龋齿中的免疫细胞特征 | 龋齿患者和健康个体的牙髓组织，以及相关的遗传位点和免疫细胞 | 多组学分析 | 龋齿 | 单细胞RNA测序、全基因组关联研究、孟德尔随机化、基因集富集分析 | NA | 遗传数据、单细胞转录组数据 | 单细胞RNA测序包含53,595个细胞；孟德尔随机化分析涉及161,113例病例和216,164例对照 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |