单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 24273 篇文献，本页显示第 21961 - 21980 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21961 | 2024-08-09 |
High systemic and tumor-associated IL-8 correlates with reduced clinical benefit of PD-L1 blockade
2020-05, Nature medicine
IF:58.7Q1
DOI:10.1038/s41591-020-0860-1
PMID:32405063
|
研究论文 | 本文分析了循环中的IL-8和IL8基因在外周血单个核细胞和肿瘤中的表达，评估了其与atezolizumab（一种抗PD-L1单克隆抗体）治疗效果的关系。 | 首次在大规模随机研究中全面评估了IL-8水平与免疫检查点抑制剂疗效的关系，并揭示了IL-8在肿瘤微环境中的表达模式及其对免疫治疗效果的影响。 | 研究主要集中在转移性尿路上皮癌和转移性肾细胞癌患者，可能不适用于所有癌症类型。 | 探讨IL-8水平与PD-L1阻断剂临床疗效的关系。 | 转移性尿路上皮癌和转移性肾细胞癌患者。 | NA | 转移性尿路上皮癌，转移性肾细胞癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 1445名患者 |
| 21962 | 2024-08-09 |
A new view of the mammary epithelial hierarchy and its implications for breast cancer initiation and metastasis
2019, Journal of cancer metastasis and treatment
IF:1.4Q4
DOI:10.20517/2394-4722.2019.24
PMID:32395618
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序技术，对乳腺上皮细胞的分化层次进行了深入研究，揭示了乳腺上皮细胞层次的新模型及其对乳腺癌发生和转移的影响 | 利用单细胞RNA测序技术，揭示了乳腺上皮细胞层次的新模型，打破了传统上对干细胞、祖细胞和分化细胞之间严格界限的认识 | NA | 研究乳腺上皮细胞的分化层次及其对乳腺癌发生和转移的影响 | 乳腺上皮干细胞及其下游祖细胞的分化层次 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 21963 | 2024-08-09 |
Activation of the 15-lipoxygenase pathway in aspirin-exacerbated respiratory disease
2021-02, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2020.04.031
PMID:32371071
|
研究论文 | 本文研究了阿司匹林加重呼吸疾病（AERD）中15-脂氧合酶途径的激活 | 首次采用单细胞RNA测序技术研究AERD中花生四烯酸代谢途径，并发现15-脂氧合酶（15-LO）基因在AERD患者鼻息肉细胞中显著上调 | NA | 利用无偏倚方法研究AERD中花生四烯酸代谢途径 | AERD患者和慢性鼻窦炎伴鼻息肉（CRSwNP）患者的鼻息肉细胞 | NA | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | AERD和CRSwNP患者的鼻息肉细胞 |
| 21964 | 2024-08-09 |
SCCLRR: A Robust Computational Method for Accurate Clustering Single Cell RNA-Seq Data
2021-01, IEEE journal of biomedical and health informatics
IF:6.7Q1
DOI:10.1109/JBHI.2020.2991172
PMID:32356764
|
研究论文 | 本文提出了一种名为SCCLRR的新型细胞类型检测方法，通过学习一个稳健且准确的相似矩阵来识别单细胞RNA测序数据中的子群体 | SCCLRR方法结合了低秩表示框架，同时捕捉数据的全局和局部内在属性，并使用归一化欧氏距离和余弦相似度来平衡数据的线性和非线性流形 | NA | 开发一种新的计算方法，用于准确和稳健地聚类单细胞RNA测序数据 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 低秩表示框架 | RNA测序数据 | 九个真实的单细胞RNA测序数据集 |
| 21965 | 2024-08-09 |
Spatially Resolved Transcriptomes-Next Generation Tools for Tissue Exploration
2020-10, BioEssays : news and reviews in molecular, cellular and developmental biology
IF:3.2Q1
DOI:10.1002/bies.201900221
PMID:32363691
|
综述 | 本文综述了空间分辨转录组学领域的最新进展及其在探索复杂多细胞生物系统中的应用 | 介绍了多种旨在结合基因表达数据与空间信息的新技术 | 目前尚无单一方法能解决所有关键参数，如敏感性、劳动强度、组织类型依赖性和获取详细单细胞信息的有限能力 | 探讨空间转录组学方法的应用及其优缺点，并展望该领域的未来发展 | 空间转录组学方法及其在生物系统研究中的应用 | 转录组学 | NA | 空间分辨转录组学 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 21966 | 2024-08-09 |
scDoc: correcting drop-out events in single-cell RNA-seq data
2020-08-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa283
PMID:32365169
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为scDoc的新方法，用于校正单细胞RNA测序数据中的'drop-out'事件 | scDoc是首个直接利用drop-out信息进行细胞间相似度估计的方法，这在单细胞RNA测序数据插补中至关重要 | NA | 解决单细胞RNA测序研究中的'drop-out'事件问题 | 单细胞RNA测序数据中的'drop-out'事件 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA |
| 21967 | 2024-08-09 |
PRIME: a probabilistic imputation method to reduce dropout effects in single-cell RNA sequencing
2020-07-01, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btaa278
PMID:32348450
|
研究论文 | 本文介绍了一种新的概率插补方法PRIME，用于减少单细胞RNA测序中的丢失效应 | 构建了一个细胞对应网络，并基于相同类型细胞的局部子网络的转录组轮廓调整基因表达估计 | NA | 减少单细胞RNA测序中的丢失效应，提高数据质量和分析准确性 | 单细胞RNA测序数据 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 合成数据和八个真实单细胞测序数据集 |
| 21968 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis of the brainstem of mutant SOD1 mice reveals perturbed cell types and pathways of amyotrophic lateral sclerosis
2020-07, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2020.104877
PMID:32360664
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了突变SOD1小鼠脑干的细胞类型和通路，揭示了肌萎缩侧索硬化症（ALS）中受影响的细胞类型和分子机制 | 本研究首次在单细胞水平上全面分析了ALS小鼠模型脑干中的细胞类型、基因和通路变化 | 研究仅限于特定的小鼠模型和特定的发育阶段，可能需要进一步研究以验证这些发现是否适用于其他模型或人类 | 探究ALS在脑干中的细胞特异性机制和细胞脆弱性 | 突变SOD1小鼠的脑干细胞 | 数字病理学 | 肌萎缩侧索硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 从野生型和突变SOD1小鼠的脑干中分别分离出1894和3199个细胞 |
| 21969 | 2024-08-09 |
Single-cell RNA-seq analysis of human CSF microglia and myeloid cells in neuroinflammation
2020-07, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000000732
PMID:32371549
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了多发性硬化症（MS）和抗髓鞘少突胶质细胞糖蛋白（MOG）障碍患者脑脊液（CSF）中的髓系细胞 | 首次通过高分辨率单细胞基因表达分析明确区分了神经炎症患者CSF中存在的不同髓系细胞类型，并发现了存在于人类CSF中的微胶质细胞群 | 需要进一步研究这些细胞在免疫和疾病中的功能 | 识别和表征MS和抗MOG障碍患者CSF中的髓系细胞群 | 多发性硬化症和抗MOG障碍患者的脑脊液髓系细胞 | 数字病理学 | 多发性硬化症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 2名复发缓解型多发性硬化症（RRMS）患者、1名抗MOG障碍患者以及2名HIV患者的血液和CSF样本，以及11名包括RRMS、抗MOG障碍和对照组患者的CSF样本 |
| 21970 | 2024-08-09 |
UHRF1 Controls Thymocyte Fate Decisions through the Epigenetic Regulation of EGR1 Expression
2020-06-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.1901471
PMID:32358021
|
研究论文 | 本研究探讨了UHRF1通过表观遗传调控EGR1表达影响胸腺细胞命运决定的作用 | 首次揭示了UHRF1在胸腺细胞分化中的关键作用，并通过单细胞RNA测序分析了其对T细胞谱系发展的影响 | NA | 研究UHRF1在胸腺细胞分化过程中的表观遗传调控作用 | 胸腺细胞的命运决定和T细胞谱系发展 | 表观遗传学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠胸腺细胞 |
| 21971 | 2024-08-09 |
Integrative analysis of in vivo recording with single-cell RNA-seq data reveals molecular properties of light-sensitive neurons in mouse V1
2020-06, Protein & cell
IF:13.6Q1
DOI:10.1007/s13238-020-00720-y
PMID:32350740
|
研究论文 | 本研究通过整合体内记录与单细胞RNA测序数据，揭示了小鼠V1区光敏感神经元的分子特性 | 首次揭示了小鼠V1区单个光刺激神经元的转录组特征，并发现了与光反应相关的关键基因 | 研究仅限于小鼠V1区的第2/3层神经元，未涉及其他层次或其他脑区的神经元 | 探索小鼠V1区光敏感神经元的分子机制 | 小鼠V1区的光敏感神经元 | 数字病理学 | NA | 钙成像、全细胞膜片钳记录、mRNA测序 | NA | RNA-seq数据 | 53个来自小鼠V1区第2/3层的单个神经元 |
| 21972 | 2024-08-09 |
Differentiation of transplanted haematopoietic stem cells tracked by single-cell transcriptomic analysis
2020-06, Nature cell biology
IF:17.3Q1
DOI:10.1038/s41556-020-0512-1
PMID:32367048
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，追踪了移植后的造血干细胞在预处理宿主体内的动态变化 | 首次通过单细胞转录组分析，揭示了移植后造血干细胞在早期阶段的命运选择和动力学 | 研究仅限于移植后第一周的观察，未涉及更长时间段的变化 | 探究移植后造血干细胞在预处理宿主体内的行为和命运 | 造血干细胞及其在移植后的分化过程 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 28种造血细胞类型 |
| 21973 | 2024-08-09 |
Single-cell resolution analysis of the human pancreatic ductal progenitor cell niche
2020-05-19, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.1918314117
PMID:32354994
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序分析了人胰腺主胰管中的多能祖细胞样细胞，揭示了其亚群结构及分化潜力 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了胰腺主胰管中祖细胞样细胞的多个亚群及其向腺泡组织过渡的表型，并展示了这些细胞在移植后的分化能力 | NA | 研究人胰腺主胰管中多能祖细胞样细胞的特性及其在糖尿病中的潜在应用 | 人胰腺主胰管中的多能祖细胞样细胞 | 数字病理学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 涉及多个胰腺样本及糖尿病患者样本 |
| 21974 | 2024-08-09 |
Landscape of genomic imprinting and its functions in the mouse mammary gland
2020-05-05, Journal of molecular cell biology
IF:5.3Q2
DOI:10.1093/jmcb/mjaa020
PMID:32369566
|
研究论文 | 本研究探讨了小鼠乳腺中基因组印记及其功能 | 首次详细研究了小鼠乳腺中的基因组印记，并揭示了印记基因在乳腺发育和泌乳中的作用 | NA | 研究小鼠乳腺中基因组印记的作用及其对乳腺发育和泌乳的影响 | 小鼠乳腺中的印记基因及其表达 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 21975 | 2024-08-09 |
Interstitial Cell Remodeling Promotes Aberrant Adipogenesis in Dystrophic Muscles
2020-05-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107597
PMID:32375047
|
研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术分析健康与肌营养不良骨骼肌中的间质细胞群，揭示了CD142阳性细胞通过分泌GDF10抑制脂肪生成的作用，并发现肌营养不良中该细胞群的缺失与异常脂肪沉积有关。 | 首次通过单细胞RNA测序技术解析肌营养不良骨骼肌中间质细胞的特性，并发现CD142阳性细胞在抑制脂肪生成中的关键作用。 | 研究主要集中在小鼠和人类样本上，可能需要进一步验证在其他物种中的适用性。 | 探究肌营养不良中骨骼肌纤维化和脂肪替代的机制，为治疗提供新思路。 | 肌营养不良患者的骨骼肌中间质细胞及其在脂肪生成中的作用。 | 数字病理学 | 肌营养不良 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 小鼠和人类样本 |
| 21976 | 2024-08-09 |
Defining the Homo- and Heterodimerization Propensities of Metabotropic Glutamate Receptors
2020-05-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2020.107605
PMID:32375054
|
研究论文 | 本文通过分析单细胞RNA测序数据和开发基于荧光的定量检测方法，研究了代谢型谷氨酸受体（mGluRs）的同型和异型二聚化倾向 | 首次详细定义了组I、II和III mGluRs的同型和异型二聚化倾向，并通过体内RNA杂交和共免疫沉淀实验验证了mGluR2与mGluR3的异型二聚化偏好 | NA | 阐明代谢型谷氨酸受体的同型和异型二聚化倾向及其在神经系统中的生物学意义 | 代谢型谷氨酸受体（mGluRs）及其在皮质锥体细胞中的表达和二聚化倾向 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 荧光检测, 体内RNA杂交, 共免疫沉淀 | NA | RNA序列 | 多个皮质锥体细胞样本 |
| 21977 | 2024-08-09 |
Prediction model construction of mouse stem cell pluripotency using CpG and non-CpG DNA methylation markers
2020-May-04, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-020-3448-3
PMID:32366211
|
研究论文 | 本研究利用单细胞DNA甲基化和RNA测序数据，构建了一个机器学习模型，用于预测小鼠胚胎干细胞的多能性程度 | 首次测试了CpG和非CpG标记以及它们的组合在预测小鼠胚胎干细胞多能性中的预测能力 | NA | 研究CpG和非CpG甲基化与小鼠干细胞多能性的关系，并开发相应的预测模型 | 小鼠胚胎干细胞的多能性 | 机器学习 | NA | scBS-seq, scRNA-seq | 机器学习模型 | DNA甲基化数据, RNA测序数据 | 16个CpG标记和33个非CpG标记 |
| 21978 | 2024-08-09 |
Reprogramming Axial Level Identity to Rescue Neural-Crest-Related Congenital Heart Defects
2020-05-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2020.04.005
PMID:32369742
|
研究论文 | 本研究探讨了心脏神经嵴的分子机制，并发现了一种转录子电路，该电路能够赋予躯干神经嵴细胞修复心脏缺陷的能力 | 发现了一种新的转录子电路（Tgif1, Ets1, 和 Sox8），该电路能够赋予躯干神经嵴细胞修复心脏缺陷的能力 | NA | 揭示心脏神经嵴的分子机制，并探索其对心脏发育的影响 | 心脏神经嵴及其在心脏发育中的作用 | 心血管疾病 | 先天性心脏缺陷 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 21979 | 2024-08-09 |
Single-Cell RNA Sequencing and Its Combination with Protein and DNA Analyses
2020-05-04, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells9051130
PMID:32375335
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）技术及其与蛋白质和DNA分析结合的最新进展和应用 | 结合scRNA-seq与基因组或蛋白质组数据，能更全面地描述细胞异质性 | 讨论了scRNA-seq技术的优势和局限性，并指出其在商业化过程中仍面临的挑战 | 全面回顾scRNA-seq技术及其在生物医学应用中的潜力 | 单细胞RNA测序技术及其与蛋白质和DNA分析的结合 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 21980 | 2024-08-09 |
Regenerative potential of prostate luminal cells revealed by single-cell analysis
2020-05-01, Science (New York, N.Y.)
DOI:10.1126/science.aay0267
PMID:32355025
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了前列腺腔细胞的再生潜力 | 研究发现前列腺再生不仅由稀有的干细胞驱动，而是几乎所有持续存在的前列腺腔细胞都参与其中 | NA | 探讨前列腺再生过程中腔细胞的作用 | 前列腺腔细胞及其在再生过程中的作用 | 数字病理学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及小鼠和人类的前列腺组织样本 |