单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 28561 篇文献，本页显示第 21541 - 21560 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21541 | 2024-08-05 |
A Bayesian multivariate mixture model for high throughput spatial transcriptomics
2023-09, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1111/biom.13727
PMID:35895854
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研究论文 | 本文开发了一种基于贝叶斯的多变量有限混合模型SPRUCE，以识别高通量空间转录组数据中的细胞亚群 | 提出了利用多变量偏态正态分布的贝叶斯空间多变量有限混合模型，并结合了Pólya-Gamma数据增强和空间随机效应 | 依赖于模拟研究来证明忽视偏斜性或空间相关性在HST数据中的推断效应 | 识别组织样本中细胞的亚群以支持生物研究 | 高通量空间转录组数据中的细胞亚群 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 高通量空间转录组技术 | 多变量有限混合模型 | 基因表达数据 | 使用公开的人脑和乳腺癌HST数据集 |
| 21542 | 2024-08-08 |
Cross-platform analysis reveals cellular and molecular landscape of glioblastoma invasion
2023-03-14, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noac186
PMID:35901838
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研究论文 | 本研究通过综合分析组织学和单细胞RNA测序数据，揭示了胶质母细胞瘤侵袭的细胞和分子景观 | 发现了CRYAB和CD44在侵袭性胶质母细胞瘤中的高度共表达，并证实了它们对肿瘤侵袭性的贡献 | NA | 改善胶质母细胞瘤的治疗，特别是针对肿瘤侵袭性这一疾病特征 | 胶质母细胞瘤的侵袭性 | 数字病理学 | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 组织学样本和RNA测序数据 | 10名胶质母细胞瘤患者 |
| 21543 | 2024-08-05 |
Integration of Computational Analysis and Spatial Transcriptomics in Single-cell Studies
2023-02, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.06.006
PMID:35901961
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review | 本文回顾了单细胞转录组学和空间转录组学的技术特点以及计算数据分析的核心概念 | 强调了数据整合方法的应用挑战和研究结果的生物学背景解读 | 缺乏针对具体细胞类型或疾病的详细实例分析 | 探讨单细胞转录组学和空间转录组学在健康和疾病中的基本生物学问题 | 单细胞RNA测序和空间转录组学 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA | NA |
| 21544 | 2024-08-08 |
A Fc-VEGF chimeric fusion enhances PD-L1 immunotherapy via inducing immune reprogramming and infiltration in the immunosuppressive tumor microenvironment
2023-Feb, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03255-9
PMID:35895109
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研究论文 | 本文研究了Fc-VEGF嵌合抗体药物通过诱导免疫重编程和浸润来增强PD-L1免疫疗法在免疫抑制性肿瘤微环境中的效果 | Fc-VEGF嵌合抗体药物通过血管正常化和肿瘤微环境重编程，增强了免疫细胞的浸润，并抑制了M2巨噬细胞的分化和血管生成相关因子的分泌 | NA | 探索Fc-VEGF嵌合抗体药物如何通过血管正常化和肿瘤微环境重编程来增强免疫疗法的效果 | Fc-VEGF嵌合抗体药物在肿瘤微环境中的作用机制及其对免疫细胞浸润的影响 | 免疫学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21545 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis of peripheral CD8+ T cell responses in patients receiving checkpoint blockade immunotherapy for cancer
2023-Feb, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-022-03263-9
PMID:35907015
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序结合T细胞受体测序技术，分析了接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者外周血中CD8+ T细胞的反应 | 首次详细描述了免疫检查点抑制剂治疗前后，患者外周血中CD8+ T细胞的转录组变化，并发现这些变化与患者的生存期相关 | 研究样本量较小，且结果在更大规模患者群体中的预测能力有待验证 | 探讨免疫检查点抑制剂治疗对癌症患者外周血中CD8+ T细胞反应的影响及其与临床疗效的关系 | 接受免疫检查点抑制剂治疗的癌症患者外周血中的CD8+ T细胞 | 数字病理学 | 皮肤黑色素瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 53名癌症患者 |
| 21546 | 2024-08-08 |
Granulocytic myeloid-derived suppressor cells to prevent and treat murine immune-mediated bone marrow failure
2023-01-10, Blood advances
IF:7.4Q1
DOI:10.1182/bloodadvances.2022007254
PMID:35895513
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研究论文 | 研究粒细胞样髓源性抑制细胞（G-MDSCs）在预防和治疗小鼠免疫介导的骨髓衰竭中的作用 | 首次探讨了G-MDSCs在免疫性再生障碍性贫血（AA）中的作用，并展示了其在MHC匹配的小鼠模型中的治疗效果 | 研究结果显示G-MDSCs的治疗效果依赖于免疫背景，MHC不匹配的模型中效果不佳 | 探讨G-MDSCs在免疫介导的骨髓衰竭中的作用及其治疗潜力 | 粒细胞样髓源性抑制细胞（G-MDSCs）在免疫性再生障碍性贫血（AA）和骨髓衰竭（BMF）小鼠模型中的作用 | 免疫学 | 骨髓衰竭 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用了MHC匹配的C.B10 BMF小鼠和MHC不匹配的CByB6F1 AA模型小鼠 |
| 21547 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing in the context of neuropathic pain: progress, challenges, and prospects
2023-01, Translational research : the journal of laboratory and clinical medicine
IF:6.4Q1
DOI:10.1016/j.trsl.2022.07.004
PMID:35902034
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研究论文 | 本文探讨了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在神经病理性疼痛研究中的应用、挑战和前景 | scRNA-seq技术能够无偏差、高通量和高分辨率地分析与神经病理性疼痛相关的细胞转录组，有助于深入理解疼痛机制并实现个性化疼痛管理 | scRNA-seq在神经病理性疼痛领域的应用相对较新，且主要基于动物模型，需要更多关注转化医学研究 | 探索神经病理性疼痛的机制，以改善临床上对疼痛的诊断、治疗和管理 | 神经病理性疼痛及其相关细胞的转录组 | 数字病理学 | 神经病理性疼痛 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未提及 |
| 21548 | 2024-08-08 |
Clonal germinal center B cells function as a niche for T-cell lymphoma
2022-11-03, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2022015451
PMID:35921527
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研究论文 | 研究使用小鼠模型和人类样本，探讨了TET2突变免疫细胞如何促进血管免疫母细胞性T细胞淋巴瘤（AITL）的发展 | 首次揭示了TET2突变免疫细胞作为AITL发展的生态位，并通过单细胞RNA测序和计算机网络分析，识别了CD40-CD40LG轴在GCB细胞和肿瘤细胞集群交互中的潜在作用 | NA | 探究TET2突变免疫细胞在AITL发展中的机制 | 小鼠模型和人类AITL样本 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 超过50,000个细胞 |
| 21549 | 2024-08-08 |
Analyzing the gene regulatory network in hepatitis B patients by single-cell ATAC sequencing
2022-Nov, Clinical rheumatology
IF:2.9Q2
DOI:10.1007/s10067-022-06310-z
PMID:35902485
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研究论文 | 本研究通过单细胞ATAC测序分析慢性乙型肝炎患者的基因调控网络，以揭示其病理生理机制 | 首次使用单细胞ATAC测序技术分析慢性乙型肝炎患者的基因调控网络，为理解疾病发展提供了新的视角 | NA | 旨在通过分析慢性乙型肝炎患者的基因调控网络，揭示其病理生理机制 | 慢性乙型肝炎患者的基因调控网络 | 数字病理学 | 乙型肝炎 | 单细胞ATAC测序 | NA | 基因组数据 | 8016个细胞 |
| 21550 | 2024-08-08 |
The scINSIGHT Package for Integrating Single-Cell RNA-Seq Data from Different Biological Conditions
2022-11, Journal of computational biology : a journal of computational molecular cell biology
IF:1.4Q2
DOI:10.1089/cmb.2022.0244
PMID:35920848
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研究论文 | 介绍了一种名为scINSIGHT的新型单细胞RNA测序数据整合方法及其R包的使用 | scINSIGHT基于一种新颖的非负矩阵分解模型，能够学习不同生物或实验条件下样本中的共同和条件特异性基因模块 | NA | 改进多单细胞样本的整合，识别细胞身份和不同细胞类型或条件下的活跃生物过程 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解 | 基因表达数据 | 多个单细胞样本 |
| 21551 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA-Seq Identifies Dynamic Cardiac Transition Program from ADCs Induced by Leukemia Inhibitory Factor
2022-10-21, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxac048
PMID:35896368
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了白血病抑制因子（LIF）诱导的脂肪来源细胞（ADCs）向心肌细胞转变过程中的细胞异质性和动态变化 | 本研究首次揭示了ADCs在LIF诱导下进入心肌生成程序时的不同亚群反应，以及ADCs向心肌细胞转变的时间依赖性和Nrf2信号通路的瞬时变化 | NA | 探索ADCs的异质性和LIF诱导的ADCs向心肌细胞转变的细胞动力学 | 脂肪来源细胞（ADCs）及其在LIF诱导下的心肌细胞转变过程 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 39,432个单细胞 |
| 21552 | 2024-08-08 |
Cluster-independent marker feature identification from single-cell omics data using SEMITONES
2022-10-14, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac639
PMID:35909238
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研究论文 | 本文介绍了一种名为SEMITONES的方法，用于从单细胞组学数据中进行无聚类标记特征识别 | SEMITONES是一种无聚类标记识别方法，不依赖细胞的聚类分配，适用于发育数据等复杂情况 | NA | 开发一种无需细胞聚类的新方法，用于从单细胞组学数据中识别细胞身份标记 | 人类造血系统的单细胞数据以及空间转录组数据 | 单细胞组学 | NA | SEMITONES | NA | 单细胞数据 | 使用了多个模拟和精选的数据集进行验证 |
| 21553 | 2024-08-08 |
Tyrosine Kinase Inhibition Alters Intratumoral CD8+ T-cell Subtype Composition and Activity
2022-10-04, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-21-1039
PMID:35917579
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研究论文 | 研究酪氨酸激酶抑制剂（TKI）对肿瘤内CD8+ T细胞亚型组成和活性的影响 | 发现TKI与IL15超激动剂（IL15SA）联合使用可恢复肿瘤内效应CD8+ T细胞功能和CD8+ T细胞内PI3K信号传导，从而增强肿瘤破坏 | 尽管联合使用TKI和免疫检查点阻断（ICB）在晚期GIST中取得了一定效果，但治疗效果仍然有限 | 探讨TKI对肿瘤内CD8+ T细胞亚型组成和活性的影响，并评估联合治疗策略的效果 | 胃肠间质瘤（GIST）中的CD8+ T细胞亚型和活性 | 数字病理学 | 胃肠间质瘤 | RNA测序（RNA-seq），单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | RNA | 使用了基因工程小鼠模型和人类GIST样本 |
| 21554 | 2024-08-08 |
Constitutive programmed death ligand 1 expression protects gastric G-cells from Helicobacter pylori-induced inflammation
2022-Oct, Helicobacter
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/hel.12917
PMID:35899973
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研究论文 | 研究胃肠道化生（GIM）患者组织在幽门螺杆菌感染后是否通过PD-L1表达逃避免疫监视 | 发现G-细胞在幽门螺杆菌感染期间通过PD-L1表达得到保护，而GIM本身不表达PD-L1 | NA | 探究GIM患者组织在幽门螺杆菌感染后是否通过PD-L1表达逃避免疫监视 | GIM患者的组织样本 | NA | 胃肠道疾病 | 免疫组织化学染色，多重免疫荧光染色，单细胞测序 | NA | 组织样本 | 来自已知GIM患者的一组样本 |
| 21555 | 2024-08-08 |
Research strategies for single-cell transcriptome analysis in plant leaves
2022-10, The Plant journal : for cell and molecular biology
DOI:10.1111/tpj.15927
PMID:35904970
|
综述 | 本文综述了单细胞RNA测序技术在植物叶片研究中的进展，并探讨了相关的分析方法及当前研究中遇到的困难和问题 | NA | 植物单细胞研究面临细胞分离、细胞类型注释、细胞功能分析和细胞间通信网络等挑战，且缺乏可靠稳定的分析方法和标准 | 总结植物叶片中单细胞转录组分析的研究进展，并探讨未来的发展方向 | 植物叶片的单细胞转录组 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 21556 | 2024-08-08 |
Ontogenetic rules for the molecular diversification of hypothalamic neurons
2022-10, Nature reviews. Neuroscience
DOI:10.1038/s41583-022-00615-3
PMID:35906427
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研究论文 | 本文通过整合单细胞RNA测序、小鼠遗传学和内分泌学研究，描述了下丘脑发育的关键阶段，包括局部神经发生、谷氨酸能神经元的直接终末分化、GABA能神经元和GABA能细胞衍生多巴胺细胞的过渡级联、局部神经元迁移的波次以及神经肽和激素的顺序富集。 | 本文利用分子指纹技术，提供了前所未有的数据量和深度，以区分甚至预测多种神经元模式的突触和内分泌能力、连接性和刺激选择性。 | NA | 研究下丘脑神经元的分子多样化和发育分离的分子规则。 | 下丘脑的神经元及其在发育过程中的分子多样化和终末分化。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及多种神经元亚型 |
| 21557 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing: Unravelling the Bone One Cell at a Time
2022-10, Current osteoporosis reports
IF:4.2Q1
DOI:10.1007/s11914-022-00735-w
PMID:35915289
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综述 | 本文综述了使用单细胞RNA测序和新兴的空间RNA测序技术在骨骼研究中的最新发现 | 单细胞RNA测序揭示了骨骼细胞谱系中新的和转录上不同的细胞集群，空间转录组学方法提供了不同细胞群的定位信息 | NA | 总结近期使用单细胞RNA测序和空间RNA测序技术在骨骼研究中的发现，描述不同骨骼驻留细胞类型及其分子程序 | 骨骼中的不同细胞类型及其分子程序 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21558 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome analysis of fractional CO2 laser efficiency in treating a mouse model of alopecia
2022-10, Lasers in surgery and medicine
IF:2.2Q2
DOI:10.1002/lsm.23590
PMID:35916125
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析，探讨了分次二氧化碳激光治疗小鼠模型脱发的分子和细胞机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术，详细分析了激光照射后皮肤中细胞群及其基因表达的变化 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证其效果 | 探究分次二氧化碳激光治疗脱发的有效条件及其分子和细胞机制 | 小鼠模型的脱发治疗 | 数字病理学 | 皮肤病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型的皮肤样本 |
| 21559 | 2024-08-08 |
GLOBE: a contrastive learning-based framework for integrating single-cell transcriptome datasets
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac311
PMID:35901449
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研究论文 | 本文介绍了一种基于对比学习的单细胞转录组数据集整合框架GLOBE，该框架通过定义自适应平移变换和使用硬度感知与一致性感知的损失函数来去除批次效应，并支持多样化的下游分析 | GLOBE框架通过自适应平移变换和硬度感知与一致性感知的损失函数，提高了批次效应去除的稳定性和表示对齐的一致性 | NA | 开发一种改进的基于对比学习的批次效应校正框架，以整合来自多个来源的单细胞转录组数据集 | 单细胞转录组数据集的批次效应去除 | 生物信息学 | NA | 对比学习 | 对比学习框架 | 转录组数据 | 广泛的数据集，包括两个发育中的小鼠新皮质数据集 |
| 21560 | 2024-08-08 |
GE-Impute: graph embedding-based imputation for single-cell RNA-seq data
2022-09-20, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac313
PMID:35901457
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研究论文 | 提出了一种基于图嵌入的神经网络模型GE-Impute，用于填补单细胞RNA测序数据中的缺失值 | GE-Impute通过学习每个细胞的神经图表示并重建细胞间相似性网络，从而更准确地填补缺失值 | NA | 开发一种新的方法来提高单细胞RNA测序数据的可靠性和生物学解释性 | 单细胞RNA测序数据中的缺失值 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | 图嵌入神经网络 | 基因表达数据 | NA |