单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27648 篇文献，本页显示第 21201 - 21220 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21201 | 2024-08-08 |
PCGA: a comprehensive web server for phenotype-cell-gene association analysis
2022-07-05, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkac425
PMID:35639771
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研究论文 | 本文介绍了PCGA，一个综合性的网络服务器，用于通过GWAS汇总统计数据联合估计复杂表型的相关组织/细胞类型和易感基因 | PCGA整合了GWAS汇总统计数据和转录组数据，通过收集和处理大量bulk和单细胞RNA测序数据，提供了54个人体组织、2,214个人类细胞类型和4,384个鼠类细胞类型的表达谱，为估计相关组织/细胞类型和基因提供了基础 | NA | 开发一个框架来顺序估计复杂表型的相关组织和细胞类型，并构建一个表型-细胞-基因关联图谱 | 复杂表型的相关组织/细胞类型和易感基因 | 生物信息学 | NA | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 54个人体组织，2,214个人类细胞类型，4,384个鼠类细胞类型 |
| 21202 | 2024-08-08 |
Up-regulation of cell division cycle 20 expression alters the morphology of neuronal dendritic spines in the nucleus accumbens by promoting FMRP ubiquitination
2022-07, Journal of neurochemistry
IF:4.2Q2
DOI:10.1111/jnc.15649
PMID:35621027
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了成年大鼠伏隔核中由细胞分裂周期20（Cdc20）mRNA表达特征的GABA能神经元亚群，并探讨了Cdc20表达对神经元树突棘形态及大鼠行为的影响。 | 首次揭示了Cdc20在伏隔核GABA能神经元中的表达及其通过促进FMRP泛素化影响树突棘密度和行为表现的机制。 | 研究主要集中在体外和体内实验，未来需进一步验证Cdc20调控FMRP泛素化的具体分子机制及其在神经精神疾病中的潜在作用。 | 探讨Cdc20在伏隔核神经元中的表达及其对神经元形态和行为的影响。 | 成年大鼠伏隔核中的GABA能神经元及Cdc20的表达。 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | mRNA | 成年大鼠的伏隔核神经元及发育中的大鼠样本 |
| 21203 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics profiling the compatibility mechanism of As2O3-indigo naturalis formula based on bone marrow stroma cells
2022-Jul, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2022.113182
PMID:35643069
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了雄黄-青黛复方在骨髓基质细胞中的兼容机制及其对急性早幼粒细胞白血病（APL）的治疗效果 | 首次在骨髓基质细胞中研究了雄黄-青黛复方的兼容机制，并通过单细胞RNA测序技术揭示了ATI组合在调节骨髓基质细胞和维持造血微环境稳定中的潜在机制 | NA | 探讨雄黄-青黛复方在骨髓基质细胞中的兼容机制及其对急性早幼粒细胞白血病的治疗效果 | 骨髓基质细胞（BMSCs）和急性早幼粒细胞白血病（APL）模型 | 数字病理学 | 白血病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NA |
| 21204 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Association Between a Novel GJA5 Variant and Trifascicular Block
2022-07, JACC. Clinical electrophysiology
DOI:10.1016/j.jacep.2022.04.002
PMID:35643807
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 21205 | 2024-08-08 |
Endothelium-targeted delivery of PPARδ by adeno-associated virus serotype 1 ameliorates vascular injury induced by hindlimb ischemia in obese mice
2022-Jul, Biomedicine & pharmacotherapy = Biomedecine & pharmacotherapie
DOI:10.1016/j.biopha.2022.113172
PMID:35644115
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研究论文 | 研究通过腺相关病毒1型（AAV1）靶向内皮细胞递送PPARδ，改善肥胖小鼠后肢缺血引起的血管损伤 | 首次通过AAV1靶向内皮细胞递送PPARδ，有效改善了肥胖小鼠的血管修复和肌肉再生 | 研究仅限于动物模型，需要进一步的人体试验验证其疗效 | 探索PPARδ在血管内皮稳态中的作用，并评估其在治疗外周动脉疾病（PAD）和严重肢体缺血（CLI）中的潜力 | 肥胖小鼠的后肢缺血模型 | NA | 糖尿病血管病变 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 肥胖小鼠和正常饮食小鼠的后肢缺血肌肉内皮细胞 |
| 21206 | 2024-08-08 |
Cell-specific RNA purification to study translatomes of mouse central nervous system
2022-06-17, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101397
PMID:35620074
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研究论文 | 本文介绍了一种评估遗传靶向细胞类型细胞特异性翻译组的方法，重点关注星形胶质细胞，并使用RiboTag工具进行RNA纯化 | 该方法允许高测序深度以检测低表达基因，并探索亚细胞区室中翻译的RNA，避免了细胞分离程序对易感细胞转录本的低估 | NA | 研究小鼠中枢神经系统的细胞特异性翻译组 | 星形胶质细胞的细胞特异性RNA | 细胞生物学 | NA | RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21207 | 2024-08-08 |
Heterologous ChAdOx1-BNT162b2 vaccination in Korean cohort induces robust immune and antibody responses that includes Omicron
2022-Jun-17, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104473
PMID:35637788
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研究论文 | 研究异源ChAdOx1-BNT162b2疫苗在韩国人群中的免疫和抗体反应 | 异源ChAdOx1-BNT162b2疫苗诱导的免疫反应比同源BNT162b2-BNT162b2疫苗更强 | NA | 研究异源ChAdOx1-BNT162b2疫苗接种后的分子转录组、免疫球蛋白位点的胚系等位基因变异以及抗Omicron抗体水平 | 46名来自韩国的办公室和实验室工作人员 | NA | NA | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 免疫细胞数据 | 46名参与者 |
| 21208 | 2024-08-08 |
Droplet Microfluidics for High-Resolution Virology
2022-06-14, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.2c00615
PMID:35622865
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研究论文 | 本文探讨了液滴微流控技术在病毒学中的应用，特别是在病毒检测和研究方面的新进展 | 液滴微流控技术提供了新的灵敏度和通量水平，能够解决传统方法在病毒分析中的局限性 | NA | 探索液滴微流控技术在病毒学中的应用，以提高对病毒的理解 | 病毒及其与宿主的相互作用 | 生物技术 | NA | 液滴微流控技术 | NA | NA | NA |
| 21209 | 2024-08-08 |
Altered patterning of trisomy 21 interneuron progenitors
2022-06-14, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.05.001
PMID:35623352
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研究论文 | 本文通过立体学分析和单细胞RNA测序研究了唐氏综合征（DS）患者大脑皮质中表达calretinin的中间神经元的减少，并探讨了WNT信号通路在其中的作用。 | 利用唐氏综合征患者的诱导多能干细胞（iPSCs）和同基因对照，发现Ts21前体细胞产生较少的COUP-TFII+前体细胞，且增殖减少，并通过单细胞RNA测序确认了前体细胞亚群的改变。 | NA | 探究唐氏综合征患者大脑皮质中间神经元发育缺陷的原因。 | 唐氏综合征患者的大脑皮质中间神经元。 | NA | 唐氏综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用唐氏综合征患者的诱导多能干细胞（iPSCs）和同基因对照进行研究。 |
| 21210 | 2024-08-08 |
Critical roles of FGF, RA, and WNT signalling in the development of the human otic placode and subsequent lineages in a dish
2022-Jun, Regenerative therapy
IF:3.4Q2
DOI:10.1016/j.reth.2022.04.008
PMID:35620640
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研究论文 | 本研究开发了一种新的分化系统，利用三维（3D）悬浮培养和信号因子，通过逐步分化人类多能干细胞（hPSCs）来生成耳细胞谱系 | 本研究首次在3D环境中展示了FGF2、RA和WNT信号在hPSCs体外分化耳细胞谱系中的关键作用 | NA | 研究旨在有效诱导耳原基的形成，为耳发育和感觉神经性听力损失建模提供一个强大的平台 | 人类多能干细胞（hPSCs）及其分化产生的耳细胞谱系 | 干细胞 | 感觉神经性听力损失 | 免疫细胞化学、定量PCR（qPCR）、群体平均和单细胞RNA测序（RNA-seq）分析 | NA | 细胞 | NA |
| 21211 | 2024-08-08 |
Characterizing the landscape of cervical squamous cell carcinoma immune microenvironment by integrating the single-cell transcriptomics and RNA-Seq
2022-06, Immunity, inflammation and disease
DOI:10.1002/iid3.608
PMID:35634956
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研究论文 | 本文通过整合单细胞转录组学和RNA测序数据，研究了宫颈鳞状细胞癌（CSCC）的免疫微环境特征 | 首次通过整合单细胞测序数据，揭示了CSCC中免疫相关基因和免疫检查点基因在肿瘤免疫微环境中的作用 | NA | 研究宫颈鳞状细胞癌的免疫微环境特征及其在免疫治疗中的潜在作用 | 宫颈鳞状细胞癌的免疫相关基因和免疫检查点基因 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞转录组学, RNA-Seq | NA | 基因表达数据 | 使用了来自多个数据库的RNA表达数据，并整合了两组单细胞测序数据 |
| 21212 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics of adult macaque hippocampus reveals neural precursor cell populations
2022-06, Nature neuroscience
IF:21.2Q1
DOI:10.1038/s41593-022-01073-x
PMID:35637371
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研究论文 | 本研究利用优化的单细胞RNA测序技术，分析了成年猕猴海马区的207,785个细胞，识别出34种细胞群，包括所有主要的海马细胞类型，并揭示了关键的神经营养前体细胞群的存在 | 首次在成年猕猴海马区识别出多种神经营养前体细胞群，并发现HMGB2作为新的中间前体细胞标记物 | NA | 探讨成年灵长类动物海马区的神经发生过程 | 成年猕猴海马区的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 207,785个细胞 |
| 21213 | 2024-08-08 |
α Cell dysfunction in islets from nondiabetic, glutamic acid decarboxylase autoantibody-positive individuals
2022-06-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI156243
PMID:35642629
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研究论文 | 本研究探讨了非糖尿病、谷氨酸脱羧酶自身抗体阳性个体的胰岛α细胞功能障碍 | 首次揭示了在胰岛自身免疫早期阶段，尽管β细胞数量正常，但α细胞功能已出现障碍 | NA | 研究非糖尿病谷氨酸脱羧酶自身抗体阳性个体胰岛α细胞的功能障碍及其在1型糖尿病进展中的作用 | 非糖尿病谷氨酸脱羧酶自身抗体阳性个体和1型糖尿病患者的胰岛 | NA | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 21214 | 2024-08-08 |
Enhanced transcriptional heterogeneity mediated by NF-κB super-enhancers
2022-06, PLoS genetics
IF:4.0Q1
DOI:10.1371/journal.pgen.1010235
PMID:35648786
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研究论文 | 研究了NF-κB介导的超级增强子（SE）在抗IgM刺激的B细胞中的活性特征 | 发现NF-κB超级增强子通过液-液相分离过程调控基因表达，增强细胞间的转录反应异质性 | NA | 阐明NF-κB超级增强子在基因调控中的生物学功能 | NF-κB介导的超级增强子在B细胞中的活性 | 分子生物学 | NA | 荧光成像、单细胞转录组分析、染色质可及性分析 | NA | 图像、转录组数据 | 抗IgM刺激的B细胞 |
| 21215 | 2024-08-08 |
Blocking connexin 43 and its promotion of ATP release from renal tubular epithelial cells ameliorates renal fibrosis
2022-05-31, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-022-04910-w
PMID:35641484
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研究论文 | 本文探讨了肾小管上皮细胞损伤后释放的代谢物，特别是通过连接蛋白43（Cx43）促进的三磷酸腺苷（ATP）释放，在肾纤维化中的作用。 | 首次全面研究了Cx43在肾间质纤维化中的作用，并揭示了Cx43通过促进ATP释放，诱导巨噬细胞焦亡，进而加速肾纤维化的机制。 | 研究主要基于动物模型和临床样本，需要进一步的临床试验验证其结果的普遍性和有效性。 | 探讨肾小管上皮细胞损伤后释放的代谢物在肾纤维化中的作用，特别是Cx43和ATP的作用。 | 肾小管上皮细胞、巨噬细胞、肾纤维化 | NA | 肾病 | 转录组学、代谢组学、单细胞测序 | NA | RNA序列 | 包括来自阻塞性肾病的患者样本和单侧输尿管阻塞（UUO）的小鼠模型 |
| 21216 | 2024-08-08 |
Chord: an ensemble machine learning algorithm to identify doublets in single-cell RNA sequencing data
2022-05-30, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-022-03476-9
PMID:35637301
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研究论文 | 本文提出了一种名为Chord的集成机器学习算法，用于识别单细胞RNA测序数据中的双细胞 | Chord通过集成多种双细胞检测方法，提高了准确性和稳定性，并具有模块化架构，便于新工具的整合 | NA | 解决单细胞RNA测序数据中双细胞检测的问题 | 单细胞RNA测序数据中的双细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 集成机器学习算法 | RNA测序数据 | 包含真实和合成数据的不同数据集 |
| 21217 | 2024-08-08 |
Characteristics of alveolar macrophages in bronchioalveolar lavage fluids from active tuberculosis patients identified by single-cell RNA sequencing
2022-May-28, Journal of biomedical research
IF:2.2Q3
DOI:10.7555/JBR.36.20220007
PMID:35635159
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术分析了活动性结核病患者支气管肺泡灌洗液中肺泡巨噬细胞的特征 | 首次在单细胞分辨率下描述了活动性结核病患者肺泡巨噬细胞的特征，并探讨了其与炎症信号通路及基本巨噬细胞功能的关系 | 研究样本量较小，仅包括三名活动性结核病患者和三名健康成人作为对照 | 展示活动性结核病患者支气管肺泡灌洗液中肺泡巨噬细胞的特征 | 活动性结核病患者的肺泡巨噬细胞 | 数字病理学 | 结核病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | 三名活动性结核病患者和三名健康成人 |
| 21218 | 2024-08-08 |
Activation-induced pyroptosis contributes to the loss of MAIT cells in chronic HIV-1 infected patients
2022-05-27, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-022-00384-1
PMID:35619176
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研究论文 | 本研究探讨了激活诱导的焦亡在慢性HIV-1感染患者中导致黏膜相关恒定T细胞（MAIT细胞）丢失的机制 | 首次揭示了激活诱导的MAIT细胞焦亡在HIV-1感染患者中的作用，并关联了系统性T细胞激活、微生物移位和肠道损伤的标志 | 研究样本仅限于中国北京的一家医院，可能限制了结果的普遍性 | 识别导致HIV-1感染患者中MAIT细胞丢失的机制 | HIV-1感染患者的MAIT细胞及其焦亡特征 | 免疫学 | HIV/AIDS | 流式细胞术，单细胞RNA测序，免疫组织化学染色 | NA | 单细胞转录组数据 | 127名HIV-1感染者，包括69名未治疗患者、28名完全应答者、15名免疫非应答者和15名精英控制者 |
| 21219 | 2024-08-08 |
Toll-like receptor 9 deficiency induces osteoclastic bone loss via gut microbiota-associated systemic chronic inflammation
2022-May-27, Bone research
IF:14.3Q1
DOI:10.1038/s41413-022-00210-3
PMID:35624094
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研究论文 | 本研究首次展示了TLR9缺陷小鼠表现出低骨量和低级别系统性慢性炎症，这种炎症由肠道微生物群失调引起，并导致骨丢失。 | 本研究首次揭示了TLR9信号通过肠道微生物群与免疫系统和骨骼系统的连接，对维持炎症、造血和骨代谢的稳态至关重要。 | NA | 探讨TLR9在正常骨重塑中的作用及其机制。 | TLR9缺陷小鼠的骨量、系统性慢性炎症及肠道微生物群变化。 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | TLR9缺陷小鼠 |
| 21220 | 2024-08-08 |
Glutamine Metabolism Is Required for Alveolar Regeneration during Lung Injury
2022-05-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom12050728
PMID:35625656
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研究论文 | 本研究探讨了谷氨酰胺代谢在肺损伤后肺泡再生的作用，特别是在特发性肺纤维化（IPF）患者和博莱霉素诱导的纤维化小鼠模型中的作用。 | 首次揭示了谷氨酰胺代谢在肺泡上皮细胞再生中的关键作用，特别是在肺纤维化过程中的作用。 | 研究主要基于小鼠模型和IPF患者的细胞样本，可能需要进一步的人体临床试验来验证结果。 | 研究谷氨酰胺代谢在肺泡上皮细胞再生中的作用，特别是在肺损伤和纤维化过程中的作用。 | 特发性肺纤维化患者和小鼠的肺泡II型细胞（AT2细胞）。 | NA | 肺纤维化 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、转录组和代谢组分析 | NA | RNA | 包括IPF患者的AT2细胞和小鼠的肺组织样本 |