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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2101 | 2025-12-31 |
Mature tertiary lymphoid structures support B cell-mediated antitumour immunity and are disrupted by neoadjuvant therapy in rectal cancer: a multicentre, retrospective study
2025-Dec, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2025.106030
PMID:41265130
|
研究论文 | 本研究探讨了成熟三级淋巴结构(mTLS)在直肠癌中的抗肿瘤免疫作用及其受新辅助治疗的影响 | 首次在直肠癌中系统评估mTLS与B细胞介导的免疫特征及预后的关联,并揭示新辅助治疗对TLS的破坏作用 | 回顾性研究设计可能引入选择偏倚,样本量有限且需进一步验证 | 阐明mTLS在直肠癌肿瘤免疫微环境中的作用及新辅助治疗的免疫调节效应 | 直肠癌患者组织样本 | 数字病理学 | 直肠癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, scBCR-seq, 免疫组化, 多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据, 单细胞数据, 组织图像 | 队列1:bulk RNA-seq 123例,免疫组化/多重免疫荧光161例,scRNA-seq/scBCR-seq 10例;队列2:bulk RNA-seq 19例,免疫组化125例 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞BCR测序, 空间转录组学相关技术 | NA | NA |
| 2102 | 2025-12-31 |
Subpopulation-specific apoptotic responses of hemocytes to decapod iridescent virus 1 in Macrobrachium rosenbergii
2025-Dec, Fish & shellfish immunology
IF:4.1Q1
DOI:10.1016/j.fsi.2025.110685
PMID:40865745
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研究论文 | 本研究整合流式细胞术和单细胞RNA测序,揭示了罗氏沼虾血细胞亚群对虹彩病毒1型感染的凋亡反应差异 | 首次结合流式细胞术和单细胞RNA测序技术,系统解析了罗氏沼虾血细胞亚群在DIV1感染下的凋亡动态和分化轨迹,揭示了透明细胞的凋亡激活和补偿性分化机制 | 研究主要关注早期感染阶段(24小时),长期感染动态和具体凋亡信号通路的功能验证有待进一步探索 | 探究罗氏沼虾血细胞亚群对虹彩病毒1型感染的凋亡反应差异和免疫机制 | 罗氏沼虾的血细胞亚群,包括无颗粒细胞(透明细胞和前血细胞)、半颗粒细胞和颗粒细胞 | 单细胞组学 | 病毒感染 | 流式细胞术,单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2103 | 2025-12-31 |
Stc1-expressing myofibroblasts are a developmentally distinct lineage cleared through intrinsic apoptosis in the neonatal lung
2025-Jun-15, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.12.659126
PMID:40661545
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研究论文 | 本研究通过构建Stc1谱系标记小鼠,揭示了肺肌成纤维细胞中次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)作为一个发育上独特的谱系,其通过内在凋亡在新生儿肺中被清除 | 首次构建了能够特异性标记发育性短暂次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)的小鼠品系,并证明SCMF与肺泡管肌成纤维细胞(DMF)是发育上不同的独立谱系 | 研究主要基于小鼠模型,人类肺发育中SCMF的清除机制是否相同尚需验证 | 阐明肺肌成纤维细胞中不同谱系在肺泡发育过程中的独特贡献与命运 | 小鼠肺组织中的次级嵴肌成纤维细胞(SCMF)和肺泡管肌成纤维细胞(DMF) | 发育生物学 | 肺发育异常 | 单细胞RNA测序、胚胎谱系追踪、基因敲除 | 遗传小鼠模型 | 基因表达数据、谱系追踪数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2104 | 2025-12-31 |
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2025-May-20, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.10.06.561193
PMID:38370853
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术,揭示了肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的作用,特别是在去神经和再神经过程中的动态变化 | 发现了一种新型的末端施万细胞亚型,该亚型在去神经-再神经循环中起关键作用,并识别了SPP1信号作为神经肌肉接头动态的关键调节因子 | NA | 探究肌肉驻留施万细胞在神经肌肉接头重塑中的贡献 | 肌肉驻留施万细胞,包括末端施万细胞和髓鞘施万细胞亚型 | 数字病理学 | 神经肌肉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2105 | 2025-12-31 |
A Complete Spatial Map of Mouse Retinal Ganglion Cells Reveals Density and Gene Expression Specializations
2025-Feb-12, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637538
PMID:39990332
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学和机器学习技术,绘制了小鼠视网膜神经节细胞亚型的完整空间分布图,揭示了其密度和基因表达的特异性 | 首次结合en-face冷冻切片、空间转录组学和机器学习,全面映射所有已知RGC亚型的空间分布,并发现亚型内基因表达沿背腹轴或在ART区域内外存在意外变异 | ART区域与灵长类黄斑的基因谱相关性有限,提示小鼠与灵长类中央视觉的特化可能不同,研究结果可能受物种差异限制 | 探索小鼠视网膜神经节细胞亚型的空间分布特化和基因表达模式,以理解其视觉功能基础 | 小鼠视网膜神经节细胞亚型 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学,机器学习 | 机器学习 | 空间转录组数据,图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2106 | 2025-12-31 |
FastCCC: A permutation-free framework for scalable, robust, and reference-based cell-cell communication analysis in single cell transcriptomics studies
2025-Jan-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.27.635115
PMID:39975391
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研究论文 | 本文介绍了一种名为FastCCC的无置换框架,用于单细胞转录组学研究中的细胞间通讯分析,该框架具有可扩展性、鲁棒性,并支持基于参考的分析 | 提出了首个无置换的CCC分析框架,利用快速傅里叶变换卷积解析计算p值;引入了模块化代数运算框架以捕获广泛的CCC模式;构建了首个涵盖19种组织类型、450多种细胞类型、约1600万细胞的人类CCC参考面板 | 未明确提及具体限制,但暗示现有CCC方法在分析复杂数据集时存在能力不足 | 开发一种可扩展、鲁棒且支持参考的单细胞转录组学细胞间通讯分析方法 | 单细胞转录组数据中的细胞间通讯 | 单细胞转录组学 | COVID-19 | 单细胞RNA-seq | 基于快速傅里叶变换的卷积模型 | 单细胞转录组数据 | 约1600万细胞(参考面板) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2107 | 2025-12-31 |
Exploring Cellular Heterogeneity: Single-Cell and Spatial Transcriptomics of Alzheimer Disease Brains and iPSC-Derived Microglia
2024-Oct-16, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-5045715/v1
PMID:39483903
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和空间转录组学数据,揭示了阿尔茨海默病大脑中微胶质细胞的异质性及其与淀粉样斑块的空间分布关系 | 首次整合多队列、多脑区的单细胞与空间转录组学数据,系统绘制了微胶质细胞在阿尔茨海默病中的多样性图谱,并揭示了其状态与淀粉样斑块空间定位的特异性关联 | 研究主要基于转录组数据,功能验证相对有限;样本来源和脑区覆盖可能仍存在一定局限性 | 阐明阿尔茨海默病中微胶质细胞的转录状态异质性及其空间分布特征 | 实验模型和人类大脑中的微胶质细胞,包括阿尔茨海默病患者与对照样本 | 数字病理学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 | NA | 转录组数据, 空间定位数据, 免疫染色图像 | 多队列、多脑区样本(具体数量未在摘要中说明) | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2108 | 2025-12-31 |
Novel Populations of Lung Capillary Endothelial Cells and Their Functional Significance
2023-May-03, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-2887159/v1
PMID:37205391
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学技术,在肺毛细血管内皮细胞中发现了五个具有不同分子特征和功能的新细胞群 | 首次识别出五个新的肺毛细血管内皮细胞群,包括表达特定离子转运蛋白的细胞群、具有再生功能的“根”细胞群以及具有血管生成调节能力的细胞群 | 研究主要基于单细胞转录组学数据,需要进一步的体内功能验证 | 探究肺毛细血管内皮细胞的异质性及其在生理和病理过程中的功能 | 肺毛细血管内皮细胞 | 单细胞组学 | 肺疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2109 | 2025-12-30 |
Integrating Single-Cell Sequencing, Machine Learning, and Molecular Docking to Elucidate the Molecular Network Linking Myocardial Infarction and DEHP Exposure
2026-Jan, Journal of biochemical and molecular toxicology
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jbt.70663
PMID:41459671
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序、机器学习和分子对接技术,揭示了环境塑化剂DEHP通过结合SLC2A3和MMP9等核心基因,在特定免疫细胞中加剧心肌梗死的分子机制 | 首次结合单细胞RNA测序、机器学习算法集成和分子对接模拟,系统解析了DEHP在心肌梗死中细胞类型特异性的促炎免疫失调网络,并识别出六个核心诊断生物标志物 | 研究主要基于公共转录组数据集和计算预测,缺乏体内或体外实验的直接功能验证 | 阐明DEHP暴露与心肌梗死发病机制之间的细胞类型特异性分子联系 | DEHP(邻苯二甲酸二(2-乙基己基)酯)暴露下的免疫细胞与心肌梗死相关分子靶点 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 加权基因共表达网络分析, 分子对接模拟 | 集成机器学习算法(11种算法) | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | 多个公共数据集(GSE66360, GSE60993, GSE61144, GSE48060, GSE141512, GSE269269),具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2110 | 2025-12-30 |
Multi-omics analysis identifies a microbiota-bile acid-TLR signaling axis driving bladder injury in interstitial cystitis
2025-Dec-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-68060-1
PMID:41457077
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研究论文 | 本研究通过整合多组学分析,揭示了肠道微生物-胆汁酸-TLR3信号轴在驱动间质性膀胱炎膀胱损伤中的作用 | 首次结合宏基因组测序、靶向代谢组学和单细胞RNA测序,识别出Enterococcus avium富集的微生物特征和胆汁酸代谢改变,并证实其通过TLR3激活导致膀胱上皮损伤 | 研究主要基于实验模型,人类样本验证有限,且具体机制细节需进一步探索 | 探究间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征(HIC)的上游驱动机制,以寻找生物标志物和靶向治疗机会 | Hunner型间质性膀胱炎患者的尿液、血清样本及实验模型 | 多组学整合分析 | 间质性膀胱炎/膀胱疼痛综合征 | 宏基因组测序, 靶向代谢组学, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组, 代谢组, 转录组数据 | NA | NA | 宏基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2111 | 2025-12-30 |
Venetoclax resistance in preclinical KMT2A-rearranged acute lymphoblastic leukemia models is characterized by high inter- and intra-model heterogeneity
2025-Dec-29, NPJ precision oncology
IF:6.8Q1
DOI:10.1038/s41698-025-01249-1
PMID:41457105
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研究论文 | 本研究利用KMT2A重排的急性淋巴细胞白血病细胞系和异种移植模型,揭示了Venetoclax耐药性的产生机制,并强调了其高度异质性 | 首次在KMT2A重排的急性淋巴细胞白血病临床前模型中系统表征了Venetoclax耐药性的出现,揭示了肿瘤抑制因子TP53和促凋亡分子BAX的新发及已知致病性变异,并通过单细胞RNA测序发现了肿瘤微环境在耐药性发展中的潜在作用 | 研究基于临床前模型(细胞系和异种移植),其结果向临床转化的直接相关性尚需验证;耐药机制具有高度异质性,可能难以找到普适性的单一解决方案 | 阐明KMT2A重排的急性淋巴细胞白血病对BCL-2抑制剂Venetoclax产生继发性耐药的机制 | KMT2A重排的急性淋巴细胞白血病细胞系和异种移植模型 | NA | 急性淋巴细胞白血病 | 靶向DNA测序, mRNA测序, 单细胞mRNA测序, 蛋白质表达分析 | NA | 基因组序列数据, 转录组数据, 单细胞转录组数据, 蛋白质表达数据 | 未明确具体样本数量,涉及KMT2A重排的ALL细胞系和异种移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2112 | 2025-12-30 |
ADME Profiling of Quantum Dots and Immune Responses: Impact of Dynamic Inflammatory Mediator Changes on the Nervous System
2025-Dec-29, Small (Weinheim an der Bergstrasse, Germany)
DOI:10.1002/smll.202510266
PMID:41457817
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研究论文 | 本研究系统评估了碲化镉量子点的体内分布、神经行为效应及细胞反应,揭示了其诱发持续性神经炎症并损害学习记忆功能的多细胞机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术解析量子点诱导神经毒性的多细胞协调响应机制,明确了小胶质细胞、少突胶质前体细胞和内皮细胞在炎症、氧化及细胞应激通路中的关键作用 | 研究仅使用小鼠模型,未验证其他物种;量子点类型和表面修饰单一;长期神经毒性效应需进一步追踪 | 评估量子点的神经安全性并阐明其神经毒性机制 | 注射巯基丙酸修饰碲化镉量子点的小鼠模型 | 单细胞组学 | 神经毒性 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠海马组织单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2113 | 2025-12-30 |
Xiangpi Shengji Ointment Accelerates Anal Fistula Healing by Regulating Macrophage-Fibroblast Crosstalk Through the Nuclear Factor Kappa B/Hypoxia-Inducible Factor Alpha/Vascular Endothelial Growth Factor Signaling Axis
2025-Dec-29, Molecular and cellular biology
IF:3.2Q3
DOI:10.1080/10985549.2025.2597464
PMID:41457935
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研究论文 | 本研究揭示了象皮生肌膏通过调控NF-κB/HIF-α/VEGF信号轴促进巨噬细胞-成纤维细胞交互作用,从而加速肛瘘愈合的分子机制 | 首次结合网络药理学、转录组学及单细胞RNA测序技术,系统阐明了象皮生肌膏通过NF-κB/HIF-α/VEGF轴调控巨噬细胞M1极化和成纤维细胞功能的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,临床转化效果需进一步验证;NF-κB抑制剂的反转实验仅部分验证通路参与 | 探究象皮生肌膏促进肛瘘伤口愈合的分子作用机制 | 肛瘘伤口愈合过程、巨噬细胞与成纤维细胞的交互作用 | 生物信息学与分子生物学 | 肛瘘 | 网络药理学、转录组分析、单细胞RNA测序、CCK-8、ELISA、WB、RT-qPCR | NA | 基因表达数据、测序数据、体外实验数据、体内实验数据 | 转录组数据集(GSE28914, GSE203244)、小鼠肛瘘模型 | NA | 单细胞RNA测序, 转录组分析 | NA | NA |
| 2114 | 2025-12-30 |
Exploring hypoxia- and cuproptosis-related biomarkers in periodontitis based on transcriptome and single-cell analysis
2025-Dec-29, Clinical oral investigations
IF:3.1Q1
DOI:10.1007/s00784-025-06677-8
PMID:41460373
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研究论文 | 本研究通过转录组和单细胞分析,探索了牙周炎中与缺氧和铜死亡相关的生物标志物 | 首次将缺氧相关基因与铜死亡相关基因结合起来,在牙周炎中进行综合分析,并利用单细胞RNA测序数据在单细胞水平验证了关键生物标志物的表达 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据,缺乏前瞻性临床队列验证,且样本量有限 | 识别和表征与牙周炎中缺氧和铜死亡过程相关的关键生物标志物,以深入理解其分子机制 | 牙周炎患者与健康对照的基因表达数据 | 生物信息学 | 牙周炎 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | 机器学习(Boruta算法,LASSO回归,递归特征消除) | 基因表达数据(转录组数据) | 使用了来自GEO数据库的多个数据集(如GSE16134, GSE10334, GSE152042),具体样本数量未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2115 | 2025-12-30 |
Targeting SPP1-CD44-Hedgehog Axis Elicits Therapeutic Effects in Hepatocellular Carcinoma by Suppressing Intratumoral Fibrosis
2025-Dec-28, Cancer science
IF:4.5Q1
DOI:10.1111/cas.70296
PMID:41456866
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研究论文 | 本研究通过转录组学、免疫组化和单细胞RNA测序分析,揭示了SPP1通过SPP1-CD44-GLI1轴促进肝细胞癌(HCC)内肿瘤纤维化和进展的机制,并评估了靶向该轴的潜在治疗价值 | 首次将SPP1与HCC内肿瘤纤维化直接关联,并阐明其通过SPP1-CD44信号激活Hedgehog通路和GLI1来驱动肝星状细胞活化的新机制 | 研究主要基于体外和动物模型,缺乏直接的人类临床试验验证;样本量相对有限,且未涵盖所有HCC亚型 | 探索HCC中内肿瘤纤维化的关键介导因子及其治疗靶点 | 肝细胞癌(HCC)组织、肝星状细胞(HSCs)和xenograft模型 | 癌症生物学 | 肝细胞癌 | 转录组学分析、免疫组化、单细胞RNA测序(scRNA-seq)、细胞共培养、基因集富集分析、差异基因表达分析、细胞间相互作用预测 | xenograft模型 | RNA-seq数据、单细胞RNA-seq数据、组织图像数据 | 372个HCC样本(公开数据集)、103个HCC组织样本、228,564个活细胞(单细胞分析) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2116 | 2025-12-30 |
Multi-modal molecular and spatial profiling reveals NNT as a prognostic biomarker in obesity-associated colorectal cancer
2025-Dec-28, Journal of gastroenterology
IF:6.9Q1
DOI:10.1007/s00535-025-02339-4
PMID:41457181
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研究论文 | 本研究通过多模态分子和空间分析,识别出NNT作为肥胖相关结直肠癌的潜在预后生物标志物 | 结合转录组数据、临床验证和空间转录组分析,首次在肥胖相关结直肠癌中揭示NNT的预后价值及其在肿瘤微环境中的作用 | 研究依赖于公共数据集和独立队列的验证,可能受样本异质性限制,且空间分析仅针对候选基因 | 识别反映肥胖相关肿瘤特征的分子生物标志物并分层患者预后 | 结直肠癌患者,包括正常、健康体重和肥胖样本 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 转录组分析、免疫组织化学、空间转录组分析 | NA | 转录组数据、蛋白质表达数据、空间转录组数据 | 基于TCGA-COADREAD数据集和独立验证队列,具体样本数未明确 | NA | 空间转录组学 | GeoMx DSP | NA |
| 2117 | 2025-12-30 |
Identification of novel fibroblast subsets in diffuse cutaneous systemic sclerosis
2025-Dec-27, Annals of the rheumatic diseases
IF:20.3Q1
DOI:10.1016/j.ard.2025.11.027
PMID:41457004
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序识别了弥漫性皮肤系统性硬化症中新的成纤维细胞亚群,并探讨了CD9和FHL1的功能作用 | 首次在系统性硬化症中识别出以CD9和FHL1上调为特征的新型成纤维细胞亚群,并揭示了FHL1在细胞外基质产生调控中的功能角色及其与VGLL3的机制联系 | 研究基于培养的皮肤成纤维细胞,可能无法完全反映体内微环境;样本量未明确说明,可能限制统计效力 | 识别系统性硬化症中的新型成纤维细胞亚群并确定其功能作用 | 来自健康供体和弥漫性皮肤系统性硬化症患者的皮肤成纤维细胞 | 单细胞组学 | 系统性硬化症 | 单细胞RNA测序,siRNA敲低实验,蛋白水平验证 | NA | RNA测序数据,蛋白表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2118 | 2025-12-30 |
Adult leptomeningeal vestigial neural crest-derived multipotent cells promote vascular repair after stroke
2025-Dec-26, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116747
PMID:41456275
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研究论文 | 本研究通过神经嵴谱系追踪、单细胞和空间转录组学等方法,发现成年小鼠软脑膜中存在神经嵴来源的多能细胞,这些细胞在缺血性中风后能被重新激活,通过特定信号通路促进血管修复 | 首次识别成年小鼠软脑膜中持续存在的神经嵴来源多能细胞,并揭示其在脑损伤后通过SDF1α-CXCR4信号通路被招募至受损血管,通过β-catenin和STAT3通路调控,以多效蛋白介导的信号恢复血管完整性 | 研究主要基于小鼠模型,尚未在人类中验证;具体细胞激活和修复机制的分子细节仍需进一步探索 | 探究成年大脑中是否存在神经嵴来源的多能细胞,并研究其在脑损伤后血管修复中的作用 | 成年小鼠的软脑膜组织及缺血性中风模型 | 神经科学 | 中风 | 单细胞转录组学, 空间转录组学, 谱系追踪, 相互作用组建模, 活体成像 | NA | 转录组数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2119 | 2025-12-30 |
Single-cell and spatial transcriptomics reveal the interaction between PRRX2-driven epithelial cells and SPP1+ macrophages in mediating gemcitabine resistance in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-Dec-26, Chinese medical journal
IF:7.5Q1
DOI:10.1097/CM9.0000000000003966
PMID:41456929
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研究论文 | 本研究通过整合分析单细胞RNA测序和空间转录组学数据,揭示了PRRX2+上皮细胞与SPP1+巨噬细胞之间的相互作用在介导胰腺导管腺癌吉西他滨耐药中的关键机制 | 首次通过整合单细胞和空间转录组学技术,系统揭示了PRRX2驱动的上皮细胞与SPP1+巨噬细胞通过TGFB1/TGFBR2轴相互作用,促进EMT和ECM重塑,从而介导吉西他滨耐药的新机制 | 研究结论主要基于细胞系和临床样本的体外验证,缺乏体内动物模型的进一步验证,且临床队列样本量可能有限 | 阐明胰腺导管腺癌对吉西他滨产生耐药的分子和细胞机制,以优化治疗策略并改善患者预后 | 胰腺导管腺癌患者样本、PDAC细胞系 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,RNA-seq,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据,空间转录组数据,图像数据 | 临床队列样本及PDAC细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2120 | 2025-12-30 |
Integrating single-cell and bulk RNA-Seq to unravel the molecular mechanisms of airway stenosis
2025-Dec-23, Functional & integrative genomics
IF:3.9Q1
DOI:10.1007/s10142-025-01794-9
PMID:41432785
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序和bulk RNA-Seq数据,揭示了气道狭窄的分子机制,并识别出四个关键基因及其调控通路 | 首次整合单细胞和bulk转录组数据系统研究气道狭窄的分子机制,识别出FAM118A、RCN3、PCSK7和REEP3四个关键促狭窄基因,并阐明了其通过KRAS→PI3K-AKT通路激活成纤维细胞的机制 | NA | 阐明气道狭窄的潜在分子机制 | 气道狭窄组织 | 数字病理学 | 气道狭窄 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-Seq, 分子生物学实验 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |