单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27621 篇文献，本页显示第 21041 - 21060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 21041 | 2024-08-08 |
Fangchinoline inhibits non-small cell lung cancer metastasis by reversing epithelial-mesenchymal transition and suppressing the cytosolic ROS-related Akt-mTOR signaling pathway
2022-09-01, Cancer letters
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.canlet.2022.215783
PMID:35700820
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研究论文 | 本文研究了防己碱通过逆转上皮-间质转化和抑制细胞质ROS相关的Akt-mTOR信号通路来抑制非小细胞肺癌转移的作用 | 防己碱通过直接靶向NOX4并促进其降解，从而减少细胞质ROS，抑制Akt-mTOR信号通路，显示出抑制非小细胞肺癌转移的新机制 | NA | 研究防己碱抑制非小细胞肺癌转移的机制 | 非小细胞肺癌细胞和动物模型 | 数字病理学 | 肺癌 | RNA测序 | NA | RNA | 包括TCGA和香港队列的多个样本，以及小鼠模型 |
| 21042 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis of liver reveals the enhanced entry and release abilities of human adenovirus F41, partially explaining acute hepatitis in children
2022-09, The Journal of infection
IF:14.3Q1
DOI:10.1016/j.jinf.2022.06.007
PMID:35700865
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 21043 | 2024-08-08 |
Brain-wide bidirectional neuropeptide modulation of individual neuron classes regulates a developmental decision
2022-08-08, Current biology : CB
IF:8.1Q1
DOI:10.1016/j.cub.2022.05.048
PMID:35679871
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研究论文 | 本文通过系统层面的研究，探讨了神经肽受体信号功能和细胞类型特异性分布在Caenorhabditis elegans发育决策中的作用 | 本文采用系统层面的方法，全面分析了神经肽受体突变体在诱导滞育进入表型中的功能，并结合单细胞RNA测序数据，揭示了几乎所有神经元类群都表达至少一种与滞育进入相关的受体 | NA | 研究神经肽在Caenorhabditis elegans发育决策中的作用 | Caenorhabditis elegans的神经肽受体信号功能和细胞类型特异性分布 | 神经科学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 21044 | 2024-08-08 |
scCNC: a method based on capsule network for clustering scRNA-seq data
2022-08-02, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac393
PMID:35699473
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研究论文 | 本文提出了一种基于胶囊网络的半监督聚类方法scCNC，用于scRNA-seq数据的聚类分析 | scCNC方法将领域知识整合到聚类步骤中，并提出了一种半监督贪婪迭代训练方法来训练整个网络 | NA | 提高scRNA-seq数据聚类性能并促进下游分析 | scRNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 胶囊网络 | 胶囊网络 | scRNA-seq数据 | 一些真实scRNA-seq数据集 |
| 21045 | 2024-08-08 |
IsoLGs (Isolevuglandins) Drive Neutrophil Migration in Hypertension and Are Essential for the Formation of Neutrophil Extracellular Traps
2022-08, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本研究探讨了IsoLGs（异构月桂酸）在高血压中驱动中性粒细胞迁移和NET形成的作用 | 首次揭示了IsoLGs在高血压中对中性粒细胞迁移和NETosis的关键作用 | NA | 确定IsoLGs在高血压中对中性粒细胞迁移和NET形成的作用 | 小鼠和人类中性粒细胞 | NA | 高血压 | 单细胞测序、流式细胞术、免疫荧光和活细胞共聚焦显微镜 | NA | 细胞 | 小鼠和人类中性粒细胞 |
| 21046 | 2024-08-08 |
The antioxidant enzyme Peroxiredoxin-1 controls stroke-associated microglia against acute ischemic stroke
2022-08, Redox biology
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.redox.2022.102347
PMID:35688114
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序研究了缺血再灌注损伤后大脑中与卒中相关的新型微胶质细胞类型，并探讨了抗氧化酶Peroxiredoxin-1在其功能中的作用 | 首次鉴定出一种具有增强抗氧化功能的新型微胶质细胞类型，称为卒中相关微胶质细胞（SAM），并揭示了Peroxiredoxin-1在其抗氧化功能中的关键作用 | NA | 研究缺血再灌注损伤后大脑中微胶质细胞的新型类型及其在抗氧化防御中的作用 | 卒中相关微胶质细胞及其抗氧化酶Peroxiredoxin-1的表达和功能 | 数字病理学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 21047 | 2024-08-08 |
Thyrotropin-releasing hormone induces Ca2+ increase in a subset of vagal nodose ganglion neurons
2022-Aug, Neuropeptides
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.npep.2022.102261
PMID:35704969
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研究论文 | 本文通过原位杂交和免疫组织化学方法验证了甲状腺释放激素受体1（TRHR1）在迷走神经结状神经节（NG）神经元中的表达，并使用遗传编码的钙指示剂（GECI）显示甲状腺释放激素（TRH）在NG神经元中诱导钙增加 | 首次证明了TRHR1在NG神经元中具有功能活性，并揭示了TRH通过Gq途径激活NG神经元 | NA | 探讨甲状腺释放激素（TRH）在迷走神经结状神经节神经元中的功能活性及其信号传导途径 | 迷走神经结状神经节神经元 | NA | NA | 原位杂交、免疫组织化学、遗传编码的钙指示剂（GECI） | NA | 神经元信号 | NA |
| 21048 | 2024-08-08 |
Dissecting the Heterogeneity of Human Thoracic Aortic Aneurysms Using Single-Cell Transcriptomics
2022-08, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
DOI:10.1161/ATVBAHA.122.317484
PMID:35708028
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综述 | 本文综述了利用单细胞转录组学技术在人类胸主动脉瘤和夹层研究中的应用及其面临的挑战 | 介绍了单细胞RNA测序技术在解析胸主动脉瘤和夹层复杂性方面的应用 | 目前尚无有效的治疗方法来预防或临床管理胸主动脉瘤和夹层，仅有的有效治疗是手术修复 | 理解胸主动脉瘤和夹层发病机制中的瘤内和瘤间异质性 | 人类胸主动脉瘤和夹层 | 数字病理学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 21049 | 2024-08-08 |
Cortical VIP+ Interneurons in the Upper and Deeper Layers Are Transcriptionally Distinct
2022-Aug, Journal of molecular neuroscience : MN
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12031-022-02040-8
PMID:35708842
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研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序数据分析了大脑皮层中VIP中间神经元在不同层次的转录组差异 | 揭示了VIP中间神经元在浅层和深层层次的转录组差异，并发现了可能的标记基因 | 研究主要集中在视觉皮层和运动皮层，其他脑区的研究较少 | 探讨同一类中间神经元在不同层次的分子差异 | 大脑皮层中的VIP中间神经元 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 1175个高质量的VIP中间神经元 |
| 21050 | 2024-08-08 |
Entropy-based inference of transition states and cellular trajectory for single-cell transcriptomics
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac225
PMID:35696651
|
研究论文 | 本文提出了一种基于过渡熵的单细胞轨迹推断方法scTite，用于从scRNA-seq数据中识别过渡状态并重建细胞轨迹 | 引入了一种新的度量标准——过渡熵，用于测量细胞属于不同细胞集群的不确定性，并据此识别细胞状态和过渡细胞 | NA | 开发一种新的单细胞轨迹推断方法，以更准确地重建细胞轨迹 | 单细胞RNA测序数据中的细胞类型、状态和过渡 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 文本 | 四组真实scRNA-seq数据和一个综合数据集 |
| 21051 | 2024-08-08 |
DURIAN: an integrative deconvolution and imputation method for robust signaling analysis of single-cell transcriptomics data
2022-07-18, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac223
PMID:35709795
|
研究论文 | 介绍了一种名为DURIAN的集成去卷积和插补方法，用于恢复单细胞转录组数据中的基因表达 | DURIAN方法通过多任务回归基础的插补技术，提高了单细胞数据的聚类、低维嵌入和细胞间信号网络的恢复 | NA | 开发一种新的方法来恢复单细胞转录组数据中的基因表达信息 | 单细胞转录组数据中的基因表达 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 多任务回归 | 转录组数据 | 使用合成数据集和已发表的数据集进行系统基准测试 |
| 21052 | 2024-08-08 |
Analysis of Gene Expression and TCR/B Cell Receptor Profiling of Immune Cells in Primary Sjögren's Syndrome by Single-Cell Sequencing
2022-07-15, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2100803
PMID:35705251
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研究论文 | 本研究利用单细胞测序技术全面分析了原发性干燥综合征（pSS）患者外周血单个核细胞（PBMCs）的基因表达变化及TCR/BCR谱系特征 | 首次通过单细胞RNA测序和单细胞V(D)J测序技术，全面揭示了pSS患者免疫细胞亚群的变化及其TCR/BCR谱系的改变 | 研究仅限于pSS患者的外周血单个核细胞，未涉及其他组织或器官的免疫细胞 | 旨在全面表征pSS患者PBMCs的转录变化，以更好地理解pSS的发病机制、诊断和治疗 | 原发性干燥综合征（pSS）患者的免疫细胞及其TCR/BCR谱系 | 数字病理学 | 自身免疫疾病 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 未明确提及具体样本数量 |
| 21053 | 2024-08-08 |
Mapping the single-cell transcriptomic response of murine diabetic kidney disease to therapies
2022-07-05, Cell metabolism
IF:27.7Q1
DOI:10.1016/j.cmet.2022.05.010
PMID:35709763
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研究论文 | 研究使用单细胞RNA测序技术分析了小鼠糖尿病肾病模型对五种治疗方案的反应 | 首次揭示了糖尿病肾病及其治疗对所有肾脏细胞类型的异质性反应，并探讨了SGLT2i类药物可能的作用机制 | NA | 研究糖尿病肾病对小鼠肾脏细胞的影响及不同治疗方案的效果 | 小鼠糖尿病肾病模型及其对五种治疗方案的反应 | 数字病理学 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 约100万个细胞 |
| 21054 | 2024-08-08 |
A multifunctional locus controls motor neuron differentiation through short and long noncoding RNAs
2022-07-04, The EMBO journal
DOI:10.15252/embj.2021108918
PMID:35698802
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研究论文 | 本文研究了一个多功能位点通过短链和长链非编码RNA调控运动神经元分化的机制 | 首次揭示了一个特定转录单元MN2中的长链非编码RNA lncMN2-203和两个miRNAs通过吸附miR-466i-5p并上调其靶点，以及抑制与增殖相关因子，来影响运动神经元分化的功能 | NA | 探究运动神经元分化过程中转录后调控的机制 | 运动神经元分化过程中的非编码RNA的作用 | NA | NA | 单细胞测序 | CRISPR/Cas9 | RNA | NA |
| 21055 | 2024-08-08 |
BET bromodomain inhibitor JQ1 regulates spermatid development by changing chromatin conformation in mouse spermatogenesis
2022-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2020.12.012
PMID:35685458
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序（scRNA-seq）和ATAC-seq技术，探讨了BET溴结构域抑制剂JQ1在雄性小鼠精子发生中的基因调控机制 | 首次揭示了JQ1通过改变染色质构象调控基因转录，影响精子发生的过程 | NA | 探究JQ1在雄性小鼠精子发生中的基因调控机制 | JQ1对小鼠精子发生的影响及其分子机制 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），ATAC-seq | NA | 基因表达数据，染色质开放性数据 | 小鼠睾丸样本 |
| 21056 | 2024-08-08 |
Application and prospect of single-cell sequencing in cancer metastasis
2022-Jul, Future oncology (London, England)
DOI:10.2217/fon-2022-0156
PMID:35686493
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研究论文 | 本文探讨了单细胞测序技术在癌症转移研究中的应用及其未来前景 | 单细胞测序技术揭示了肿瘤进化遗传谱系、肿瘤内异质性和肿瘤微环境，促进了临床医学与分子生物学的结合 | NA | 探索单细胞测序在癌症转移中的应用，寻找更多临床治疗靶点 | 癌症转移过程中的遗传变异和肿瘤微环境 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 21057 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing sheds light on cell-type specific gene expression in immune cells
2022-07, Nature reviews. Rheumatology
DOI:10.1038/s41584-022-00802-7
PMID:35689032
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 21058 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals differential expression of EGFL7 and VEGF in giant-cell tumor of bone and osteosarcoma
2022-07, Experimental biology and medicine (Maywood, N.J.)
DOI:10.1177/15353702221088238
PMID:35695550
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了巨细胞瘤骨和骨肉瘤中EGFL7和VEGF的基因表达谱 | 首次揭示了EGFL7和VEGF在巨细胞瘤骨和骨肉瘤中的细胞类型特异性表达模式 | NA | 探究巨细胞瘤骨和骨肉瘤中促血管生成基因的表达及其作为潜在预后生物标志物和细胞类型靶向治疗的可能性 | 巨细胞瘤骨和骨肉瘤中的EGFL7和VEGF基因表达 | 数字病理学 | 骨肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及巨细胞瘤骨和骨肉瘤中的多种细胞类型 |
| 21059 | 2024-08-08 |
Evaluating the performance of dropout imputation and clustering methods for single-cell RNA sequencing data
2022-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2022.105697
PMID:35697529
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研究论文 | 评估了九种流行的dropout插补方法与八种聚类方法在10个不同样本大小的单细胞RNA测序数据集上的组合效果 | 展示了插补算法通常能提高聚类方法的性能，并且特定插补与聚类方法组合的性能随数据集大小而变化 | NA | 探讨如何通过插补方法改善单细胞RNA测序数据的聚类质量 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 10个不同样本大小的数据集 |
| 21060 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing reveals microglia induced angiogenesis by specific subsets of endothelial cells following spinal cord injury
2022-07, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200337R
PMID:35699080
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，揭示了脊髓损伤后特定内皮细胞亚群介导的微胶质细胞诱导的血管生成过程 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了脊髓损伤后血管生成的细胞和分子图谱 | 研究仅限于大鼠模型，未来需在更多物种中验证结果 | 探究脊髓损伤后血管生成的细胞机制 | 脊髓损伤后的血管内皮细胞和微胶质细胞 | 数字病理学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 不同时间点的脊髓组织样本 |