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当前共找到 35765 篇文献，本页显示第 2081 - 2100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2081 | 2025-12-31 |
EPI-SauriCas9-based mouse ovarian cancer models recapitulating pten deletion in patients
2025-Dec-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09437-2
PMID:41466059
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研究论文 | 本研究开发并验证了一种基于EPI-SauriCas9系统的小鼠卵巢上皮Pten和Trp53缺失模型（MEPP），用于模拟患者PTEN缺失的卵巢癌 | 利用EPI-SauriCas9系统创建了首个模拟PTEN和TP53缺失的小鼠卵巢癌模型，并通过单细胞RNA测序揭示了不同转移潜能的肿瘤上皮亚群 | 模型仅模拟了PTEN和TP53两种基因缺失，可能无法完全代表人类卵巢癌的复杂遗传背景 | 开发一种能够模拟患者PTEN缺失的卵巢癌临床相关模型，以研究肿瘤发生、转移机制并筛选潜在治疗药物 | 小鼠卵巢上皮细胞及由此衍生的肿瘤模型 | 癌症生物学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序，高通量药物筛选，靶向基因编辑 | EPI-SauriCas9基因编辑系统 | 基因表达数据，药物反应数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2082 | 2025-12-31 |
Interpretable multimodal deep learning improves postoperative risk stratification in intrahepatic cholangiocarcinoma in multicentre cohorts
2025-Dec-29, NPJ digital medicine
IF:12.4Q1
DOI:10.1038/s41746-025-02282-x
PMID:41466129
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研究论文 | 本研究开发了一种基于Transformer的可解释多模态深度学习框架，整合临床变量、影像组学特征和全切片病理图像，用于肝内胆管癌患者的术后风险分层 | 首次将Transformer网络与预训练编码器结合，融合多模态数据，并通过空间转录组学和蛋白质组学验证模型的生物学可解释性 | 研究基于回顾性多中心队列，可能存在选择偏倚，且模型在更广泛人群中的泛化能力需进一步验证 | 改善肝内胆管癌患者术后风险分层，预测2年总生存期 | 肝内胆管癌患者 | 计算机视觉 | 肝内胆管癌 | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | Transformer，深度学习 | 临床变量，影像组学特征，全切片病理图像 | 三个独立验证队列 | NA | 空间转录组学，空间蛋白质组学 | NA | NA |
| 2083 | 2025-12-29 |
Exploring cellular heterogeneity: single-cell and spatial transcriptomics of Alzheimer's disease brains and iPSC-derived microglia
2025-Dec-28, Alzheimer's research & therapy
DOI:10.1186/s13195-025-01944-y
PMID:41456076
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2084 | 2025-12-31 |
Distinct populations of lung capillary endothelial cells and their functional significance
2025-Dec-26, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09420-x
PMID:41449269
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研究论文 | 本文通过单细胞转录组学技术研究了肺毛细血管内皮细胞的异质性，并鉴定了五个新的gCaps亚群及其功能 | 首次通过scRNAseq识别出五个新的gCaps亚群，包括表达Scn7a和Clic4离子转运蛋白的主要群体、有丝分裂活跃的'根'细胞以及表达Lingo2的静脉-毛细血管内皮，揭示了它们在血管表型转换、再生修复和血管生成调控中的新作用 | 研究主要基于单细胞转录组数据，缺乏功能验证实验的直接证据，且缺氧模型可能无法完全模拟真实疾病环境 | 探究肺毛细血管内皮细胞的分子异质性及其在正常生理和肺疾病病理生物学中的功能意义 | 肺毛细血管内皮细胞 | 数字病理学 | 肺疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2085 | 2025-12-31 |
Distinct Single-Cell Expression Pattern of the Soluble Epoxide Hydrolase and Cytochrome p450 Epoxygenases in Human and Mouse Small Intestinal Epithelia
2025-Dec-25, The journal of histochemistry and cytochemistry : official journal of the Histochemistry Society
DOI:10.1369/00221554251403631
PMID:41449646
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和原位杂交技术，首次绘制了人和小鼠小肠上皮细胞中参与多不饱和脂肪酸代谢的细胞色素P450环氧合酶和可溶性环氧化物水解酶的单细胞表达图谱 | 首次提供了小肠上皮细胞中CYP-sEH轴酶的高分辨率单细胞表达图谱，揭示了其在人和小鼠中的物种特异性表达模式，并观察到其在辐射损伤再生模型中的动态变化 | 研究主要基于转录组数据，酶蛋白的表达和活性需要进一步验证；功能研究尚不充分 | 阐明多不饱和脂肪酸代谢酶在小肠上皮中的细胞类型特异性表达模式及其在黏膜屏障稳态中的潜在功能 | 人和小鼠的小肠上皮细胞 | 单细胞组学 | 肠道疾病 | 单细胞RNA测序，RNAscope原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据，原位杂交图像数据 | 未明确指定具体样本数量，使用了公开可用的单细胞RNA测序数据集和实验模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2086 | 2025-12-31 |
Spatial and single-cell transcriptomics reveal the reorganization of cerebellar microglia with aging
2025-Dec-23, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116624
PMID:41307999
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研究论文 | 本研究通过空间和单细胞转录组学技术，揭示了小脑小胶质细胞在衰老过程中的重组现象 | 结合单核RNA测序、小胶质细胞批量RNA测序和基于MERFISH的空间转录组学，首次系统揭示了小脑小胶质细胞在衰老中的区域特异性适应和与颗粒细胞的邻近关系 | 研究主要基于小鼠模型，人类小脑衰老的类似变化尚需进一步验证 | 探究小脑在衰老过程中的转录组变化及小胶质细胞的重组机制 | 小鼠小脑组织，特别是小胶质细胞和颗粒细胞 | 数字病理学 | 老年疾病 | 单核RNA-seq, 批量RNA-seq, MERFISH | NA | 转录组数据, 空间转录组数据 | 十五个小鼠脑区域 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2087 | 2025-12-31 |
Decoding muscle-resident Schwann cell dynamics during neuromuscular junction remodeling
2025-Dec-23, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.195917
PMID:41433107
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，通过比较稳定神经支配模型与部分或完全去神经支配后再神经支配模型，揭示了肌肉驻留雪旺细胞在神经肌肉接头重塑中的作用 | 发现了多个不同的雪旺细胞亚型，包括一种在去神经-再神经支配循环中起关键作用的新型终末雪旺细胞亚型，并确定了SPP1信号通路是调节神经肌肉接头动态的关键调控因子 | NA | 阐明肌肉驻留雪旺细胞在神经肌肉接头重塑中的贡献 | 肌肉驻留雪旺细胞 | 数字病理学 | 神经肌肉疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2088 | 2025-12-31 |
Stc1-expressing myofibroblasts are a developmentally distinct lineage cleared through apoptosis in the neonatal lung
2025-Dec-21, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116750
PMID:41428484
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研究论文 | 本研究利用Stc1小鼠模型，揭示了肺肌成纤维细胞中一个独特的发育谱系——次级嵴肌成纤维细胞的生命周期及其在肺泡发育中的作用 | 首次通过Stc1谱系示踪技术，在体内明确区分了次级嵴肌成纤维细胞和肺泡管肌成纤维细胞，并揭示了前者通过克隆增殖和凋亡被清除的独特发育命运 | 研究主要基于小鼠模型，其在人类肺发育中的直接相关性尚需验证；遗传工具的特异性可能不完全排除其他细胞类型的标记 | 阐明肺肌成纤维细胞不同谱系在肺泡发育过程中的独特贡献和命运 | 小鼠肺组织中的肌成纤维细胞谱系，特别是Stc1表达的次级嵴肌成纤维细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序，胚胎谱系示踪，遗传激活实验 | NA | 基因表达数据，谱系追踪数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2089 | 2025-12-31 |
Single cell RNA-seq characterization of non-fibrotic stromal wound repopulation in the rabbit
2025-Dec-18, Experimental eye research
IF:3.0Q1
DOI:10.1016/j.exer.2025.110816
PMID:41421445
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，分析了兔子角膜冻伤模型中非纤维化伤口愈合过程中的转录变化，揭示了基质角质细胞向成纤维细胞的连续转化过程 | 首次在兔子角膜冻伤模型中，通过单细胞RNA测序揭示了非纤维化伤口愈合的转录动态，识别了保留角质细胞标记的成纤维细胞亚群，并发现了一种机械活跃但非纤维化的表型 | 研究仅基于兔子模型，可能无法完全反映人类角膜愈合过程；样本时间点有限（仅第7天和第28天），可能错过中间动态变化 | 探究角膜损伤后非纤维化伤口愈合的分子机制，以预防角膜手术或损伤后的瘢痕形成 | 兔子角膜基质细胞（包括角质细胞和成纤维细胞） | 单细胞转录组学 | 角膜疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确指定样本数量，但涉及对照和冻伤后第7天及第28天的兔子角膜样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2090 | 2025-12-31 |
Influenza A infection accelerates disease-associated microglia formation during physiological aging
2025-Dec-14, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.11.693336
PMID:41415465
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研究论文 | 本研究探讨了甲型流感病毒感染如何加速生理性衰老过程中疾病相关小胶质细胞的形成 | 首次揭示了非神经侵袭性流感肺炎可诱导大脑小胶质细胞的转录反应，驱动疾病相关小胶质细胞的过早扩增，并阐明了其代谢特征和空间分布模式 | 研究主要使用雄性小鼠模型，未考虑性别差异；人类样本分析仅限于中额回区域 | 探究流感感染对大脑免疫细胞（特别是小胶质细胞）在衰老过程中的影响机制 | 年轻、中年和老年雄性小鼠的大脑免疫细胞；正常老年人、超级老人和痴呆患者的中额回组织 | 神经免疫学 | 老年性疾病 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 代谢组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据, 代谢组数据, 空间转录组数据 | 不同年龄段的雄性小鼠；人类中额回组织样本（包括正常老年人、超级老人和痴呆患者） | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA测序 | NA | NA |
| 2091 | 2025-12-31 |
Multimodal analysis defines GNG4 as a distinguishing feature of germinal center-positioned CD4 T follicular helper cells in humans
2025-Dec-13, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.10.693235
PMID:41427421
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研究论文 | 本文通过多模态单细胞测序和空间转录组学，揭示了人类生发中心定位的CD4 T滤泡辅助细胞中GNG4作为区分特征的关键作用 | 首次结合trimodal单细胞测序和空间转录组学，将GNG4鉴定为人类生发中心内活化Tfh细胞的标志性特征，其特异性优于传统GC相关标记 | 研究主要基于扁桃体和外周血样本，可能未涵盖其他淋巴组织或疾病状态下的Tfh细胞异质性 | 阐明人类Tfh细胞的功能异质性及其在生发中心微环境中的分子特征 | 人类扁桃体和外周血中的CD4 T滤泡辅助细胞 | 单细胞组学 | 免疫相关疾病 | trimodal单细胞测序、光谱流式细胞术、空间转录组学 | NA | 单细胞多组学数据（表观基因组、转录组、蛋白质组）及空间转录组数据 | 未明确样本数量，但涉及人类扁桃体和外周血样本 | NA | 单细胞多组学测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 2092 | 2025-12-31 |
Building dynamical models of multi-step state transitions from single cell gene expression trajectories
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.693064
PMID:41415381
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研究论文 | 本文介绍了一种名为NetDes的计算方法，用于从单细胞基因表达轨迹中推断核心转录因子调控网络并构建基于ODE的动态模型 | NetDes整合了自上而下和自下而上的系统生物学方法，能够在一个动态模型中捕获顺序状态转换，相比现有方法具有优势 | 未在摘要中明确说明 | 研究多步细胞状态转换（如细胞分化和疾病进展）的调控机制 | 单细胞基因表达轨迹，包括人类iPSC分化过程中的时间序列scRNA-seq数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | ODE-based dynamical models | 基因表达数据 | 未在摘要中明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2093 | 2025-12-31 |
Heat-shock pathway activation by TRC051384 protects spiral ganglion neurons from noise-induced hearing loss
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.693048
PMID:41415422
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研究论文 | 本研究通过RNA测序和空间转录组学发现噪声暴露会诱导螺旋神经元及其支持细胞内质网伴侣和蛋白酶体亚基的短暂上调，并证实小分子化合物TRC051384可通过激活热休克转录因子Hsf1来保护螺旋神经元免受噪声性听力损失 | 首次在噪声性听力损失模型中揭示螺旋神经元的蛋白毒性应激是关键驱动因素，并发现激活HSF1是一种有前景的治疗策略 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人体验证；TRC051384的长期安全性和疗效需进一步评估 | 探究噪声性听力损失的分子机制并开发保护螺旋神经元的治疗策略 | 小鼠耳蜗螺旋神经元及其支持细胞 | 空间转录组学 | 噪声性听力损失 | RNA测序, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, RNA测序 | NA | NA |
| 2094 | 2025-12-31 |
Plasma cell identity escape drives resistance to anti-BCMA T-cell-redirecting therapy in multiple myeloma
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.692978
PMID:41415462
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研究论文 | 本文通过全基因组测序和单细胞RNA测序，揭示了多发性骨髓瘤患者对靶向BCMA的T细胞重定向疗法产生原发性耐药的细胞和分子机制，包括基因组复杂性和浆细胞身份逃逸现象 | 首次提出“浆细胞身份逃逸”概念，并发现其与高增殖特征、BCMA表达降低及CD8 T细胞免疫失调相关，通过临床队列和临床前模型验证了这些机制 | 研究样本量相对有限（102例复发患者），且主要关注原发性耐药，对继发性耐药机制探讨不足，临床前模型可能无法完全模拟人类疾病复杂性 | 探究多发性骨髓瘤患者对靶向BCMA的CAR-T和T细胞衔接子疗法产生原发性耐药的机制 | 接受抗BCMA CAR-T或T细胞衔接子治疗的复发多发性骨髓瘤患者的肿瘤细胞 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 102例复发多发性骨髓瘤患者 | NA | 全基因组测序, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2095 | 2025-12-31 |
OddSNP: a predictive framework for optimizing multiplexed single-cell RNA-seq experiments
2025-Dec-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.08.692882
PMID:41415468
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研究论文 | 开发了一个名为OddSNP的预测框架，用于优化多重单细胞RNA测序实验的设计 | 提出了SNP-信息含量（SNP-IC）这一可量化的新指标，能够基于简单的未混合先导数据准确预测基于基因型的分型成功率 | 未明确说明该框架在不同组织类型或疾病模型中的普适性验证情况 | 为单细胞RNA测序中的供体多重实验提供可靠的实验设计指导 | 干细胞和类器官模型 | 单细胞组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 预测模型 | 基因型数据、测序数据 | 多个大规模数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2096 | 2025-12-31 |
Early skin seeding regulatory T cells modulate PPARγ-dependent skin pigmentation
2025-Dec-09, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-66229-2
PMID:41365874
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研究论文 | 本文探讨了早期皮肤定居调节性T细胞（ETregs）在新生儿皮肤中通过调控PPARγ信号通路，促进毛囊黑素干细胞介导的皮肤色素沉着的作用 | 首次揭示了ETregs在出生后第一周内对皮肤色素沉着的关键调控作用，并明确了PPARγ信号通路在此过程中的核心地位 | 研究主要基于小鼠模型，人类数据仅来源于对白癜风患者的单细胞转录组分析，需要进一步验证ETregs在人类皮肤发育中的具体机制 | 探究早期皮肤定居调节性T细胞（ETregs）在新生儿皮肤发育中对色素沉着的调控机制 | 小鼠新生儿皮肤组织、人类白癜风患者皮肤组织 | 免疫学与皮肤生物学 | 白癜风 | 单细胞转录组分析、转录组学分析 | NA | 转录组数据、单细胞RNA-seq数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2097 | 2025-12-31 |
Copula modeling of gene coexpression in single-cell RNA sequencing data
2025-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.04.692380
PMID:41415412
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研究论文 | 本文评估了六种Copula模型在单细胞RNA测序数据中模拟基因共表达的能力，发现高斯Copula在准确性和速度之间提供了最佳平衡 | 首次系统评估Copula模型在scRNA-seq数据中模拟基因共表达的应用，比较了不同模型的准确性和效率 | Vine Copula虽具高准确性潜力，但当前实现无法扩展到典型scRNA-seq数据集的大规模 | 开发准确的统计模型来模拟单细胞RNA测序数据中的基因共表达模式 | 单细胞RNA测序数据中的基因共表达 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Copula模型（包括高斯Copula、Vine Copula等） | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2098 | 2025-12-31 |
Phenotypic and functional characterization of tumor-reactive T cells in malignant pleural effusions
2025-Dec-09, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.05.692662
PMID:41415427
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研究论文 | 本研究通过高维流式细胞术、单细胞RNA测序和T细胞受体测序，对恶性胸腔积液（MPE）中的肿瘤反应性T细胞进行了表型和功能表征，并与肺转移瘤和血液中的T细胞进行比较 | 首次系统比较了MPE、肿瘤和血液中T细胞的组成、转录组和功能特性，发现MPE富含肿瘤反应性T细胞且具有较低的终末耗竭特征和较高的细胞毒性潜力 | 研究仅基于一名黑色素瘤患者的样本，样本量小，结果可能需要更大规模研究验证 | 表征恶性胸腔积液中肿瘤反应性T细胞的表型和功能特性，评估其作为过继性细胞疗法来源的潜力 | 恶性胸腔积液、肺转移瘤和血液中的T细胞 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 高维流式细胞术、单细胞RNA测序、T细胞受体测序、体外激活和细胞毒性实验 | NA | 流式细胞数据、单细胞转录组数据、T细胞受体序列数据 | 一名转移性黑色素瘤患者的同步采集的MPE、肺转移瘤和血液样本 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序 | NA | NA |
| 2099 | 2025-12-31 |
From features to slice: parameter-cloud modeling of spatial transcriptomics for simulation and 3D interpolatory augmentation
2025-Dec-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.64898/2025.12.04.692251
PMID:41415403
|
研究论文 | 本文介绍了FEAST，一个用于空间转录组学数据计算模拟和三维插值增强的计算基础设施 | 提出了参数云建模方法，能够灵活控制空间和转录异质性，捕获高阶基因依赖性，并扩展到三维或对齐感知的上下文 | 未在摘要中明确提及 | 开发一个用于空间转录组学数据模拟、增强和三维重建的计算平台 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 参数云建模 | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 2100 | 2025-12-31 |
C3a-C3aR1-Mediated Interactions Between Fibroblast-Like Synoviocytes and Macrophages Promote the Progression of Rheumatoid Arthritis
2025-Dec, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43319
PMID:40654154
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研究论文 | 本研究揭示了类风湿关节炎滑膜中成纤维样滑膜细胞与巨噬细胞通过C3a-C3aR1信号介导的相互作用，促进疾病进展的机制 | 首次结合成像质谱流式细胞术和单细胞RNA测序解析RA滑膜细胞邻域，并发现FLS与巨噬细胞间通过C3a-C3aR1信号形成正反馈环路驱动炎症 | 研究主要基于胶原诱导关节炎小鼠模型，人体内的验证和临床转化仍需进一步探索 | 探究类风湿关节炎滑膜炎症微环境中细胞间相互作用机制及潜在治疗靶点 | 类风湿关节炎患者滑膜组织、胶原诱导关节炎小鼠模型 | 数字病理学 | 类风湿关节炎 | 成像质谱流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 图像, 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，涉及RA患者滑膜组织与CIA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |