单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新，已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价10元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 27585 篇文献，本页显示第 20841 - 20860 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20841 | 2024-08-08 |
Gasdermin-D activation by SARS-CoV-2 triggers NET and mediate COVID-19 immunopathology
2022-07-07, Critical care (London, England)
DOI:10.1186/s13054-022-04062-5
PMID:35799268
|
研究论文 | 本文研究了Gasdermin-D（GSDMD）途径在COVID-19中中性粒细胞外陷阱（NETs）释放和器官损伤发展中的作用 | 发现SARS-CoV-2病毒直接激活孔形成蛋白GSDMD，触发NET产生和COVID-19中的器官损伤 | NA | 探究GSDMD途径在COVID-19中NETs释放和器官损伤发展中的作用 | COVID-19患者的血液和肺组织样本，以及SARS-CoV-2感染的小鼠模型 | NA | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 63名中度和重度COVID-19住院患者，以及SARS-CoV-2感染的小鼠模型 |
| 20842 | 2024-08-08 |
Reshaping the systemic tumor immune environment (STIE) and tumor immune microenvironment (TIME) to enhance immunotherapy efficacy in solid tumors
2022-07-07, Journal of hematology & oncology
IF:29.5Q1
DOI:10.1186/s13045-022-01307-2
PMID:35799264
|
综述 | 本文综述了单细胞转录组学和空间转录组学在研究系统性肿瘤免疫环境（STIE）和肿瘤免疫微环境（TIME）及其相互作用中的最新进展，旨在提高免疫治疗在实体瘤中的疗效。 | 本文深入探讨了系统性肿瘤免疫环境（STIE）的重要性，这是以往研究中较少涉及的领域。 | NA | 旨在通过综述相关研究，揭示STIE和TIME的异质性及其对免疫治疗反应的影响，从而提高免疫治疗的疗效。 | 研究对象包括系统性肿瘤免疫环境（STIE）、肿瘤免疫微环境（TIME）及其相互作用，以及这些因素在肺癌、肝细胞癌和鼻咽癌中的作用。 | 免疫学 | 肺癌, 肝细胞癌, 鼻咽癌 | 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20843 | 2024-08-08 |
scSTEM: clustering pseudotime ordered single-cell data
2022-07-07, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-022-02716-9
PMID:35799304
|
研究论文 | 开发了scSTEM方法，用于对从单细胞RNA测序数据中推断出的轨迹进行基因动态表达模式的聚类分析 | scSTEM通过使用多种度量方法总结基因表达并分配p值给聚类，从而识别显著的表达模式并比较不同路径上的模式 | NA | 开发一种新的方法来聚类分析单细胞RNA测序数据中的基因动态表达模式 | 单细胞RNA测序数据中的基因动态表达模式 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 多个单细胞RNA测序数据集 |
| 20844 | 2024-08-08 |
Spatial transcriptomics atlas reveals the crosstalk between cancer-associated fibroblasts and tumor microenvironment components in colorectal cancer
2022-07-06, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03510-8
PMID:35794563
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和批量RNA测序数据，探讨了结直肠癌中癌症相关成纤维细胞与肿瘤微环境之间的相互作用 | 本研究首次鉴定了两种不同类型的癌症相关成纤维细胞，并揭示了它们在肿瘤微环境中的功能意义 | NA | 探索结直肠癌中癌症相关成纤维细胞与肿瘤微环境之间的相互作用，为精准治疗提供依据 | 结直肠癌中的癌症相关成纤维细胞及其与肿瘤微环境的相互作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 空间转录组学（ST） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 20845 | 2024-08-08 |
Multi-omics molecular biomarkers and database of osteoarthritis
2022-07-05, Database : the journal of biological databases and curation
DOI:10.1093/database/baac052
PMID:35788653
|
research paper | 本文构建了一个名为OAomics和分子生物标志物（OAOB）的在线数据库，整合了来自159篇出版物的多组学实验结果和2405个分类的OA相关基因标记，以及基于最近单细胞RNA测序数据的5459个关节细胞类型基因标记。 | 这是首个针对骨关节炎的分子生物标志物数据库。 | NA | 构建一个综合的在线数据库，用于存储和提供骨关节炎相关的分子生物标志物信息。 | 骨关节炎（OA）相关的基因标记和多组学特征。 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因数据 | 2405个分类的OA相关基因标记和5459个关节细胞类型基因标记 |
| 20846 | 2024-08-08 |
Integrated analysis reveals the dysfunction of signaling pathways in uveal melanoma
2022-Jul-05, BMC cancer
IF:3.4Q2
DOI:10.1186/s12885-022-09822-8
PMID:35790930
|
研究论文 | 本研究通过综合分析揭示了葡萄膜黑色素瘤中信号通路的失调 | 本研究通过单细胞测序数据和细胞间通信分析，揭示了葡萄膜黑色素瘤中主要和转移阶段之间信号通路的异常状态 | NA | 探索葡萄膜黑色素瘤中信号通路的失调，并为潜在的临床应用提供理论基础 | 葡萄膜黑色素瘤中的信号通路 | 数字病理学 | 葡萄膜黑色素瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 健康数据集和三个葡萄膜黑色素瘤数据集 |
| 20847 | 2024-08-08 |
Renal organoid modeling of tuberous sclerosis complex reveals lesion features arise from diverse developmental processes
2022-07-05, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2022.111048
PMID:35793620
|
研究论文 | 研究通过遗传工程构建的人类肾脏类器官模型，模拟了TSC肾脏疾病的多种特征，并通过单细胞RNA测序揭示了TSC1或TSC2缺失对肾脏上皮、基质和胶质细胞发育过程的影响 | 首次报道了TSC肾脏疾病的遗传工程人类肾脏类器官模型，并通过单细胞RNA测序详细分析了TSC1或TSC2缺失对肾脏不同细胞类型的发育影响 | NA | 探究TSC肾脏疾病的发病机制 | TSC1或TSC2缺失对肾脏上皮、基质和胶质细胞发育的影响 | 数字病理学 | TSC综合症 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA |
| 20848 | 2024-08-08 |
The effects of sequencing depth on the assembly of coding and noncoding transcripts in the human genome
2022-Jul-04, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-022-08717-z
PMID:35787153
|
研究论文 | 研究了测序深度对人类基因组中编码和非编码转录本组装准确性的影响 | 首次系统地探讨了测序深度对转录本组装的影响，并发现非编码转录本在不同测序深度下未出现饱和现象 | 研究结果受限于细胞或组织类型、读取类型以及转录本的性质和表达水平 | 探讨测序深度对转录本组装准确性的影响 | 人类基因组中的编码和非编码转录本 | 基因组学 | NA | RNA测序 | NA | 序列数据 | 671个人类短读数据集和4个长读数据集 |
| 20849 | 2024-08-08 |
Peyer's patch TH17 cells are dispensable for gut IgA responses to oral immunization
2022-07, Science immunology
IF:17.6Q1
DOI:10.1126/sciimmunol.abc5500
PMID:35776804
|
研究论文 | 本研究探讨了Peyer's patch中的TH17细胞在口服免疫后肠道IgA反应中的作用 | 使用IL-17A命运报告鼠和MHC-II四聚体分析抗原特异性CD4 T细胞亚群，并通过单细胞RNA测序分离这些细胞，发现PP中抗原特异性T17细胞比例极低，且T17细胞的克隆型与T细胞不共享，表明T17细胞的可塑性不是T细胞分化的主要贡献者 | NA | 验证TH17细胞在口服免疫后肠道IgA反应中的必要性 | Peyer's patch中的TH17细胞及肠道免疫系统 | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 使用两种T17缺陷小鼠模型进行研究 |
| 20850 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing data analysis suggests the cell-cell interaction patterns of the pituitary-kidney axis
2022-07-01, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-022-14680-2
PMID:35778423
|
研究论文 | 本文利用单细胞RNA测序数据分析了垂体-肾脏轴的细胞间相互作用模式 | 首次详细描述了垂体和肾脏细胞类型间的配体-受体对相互作用模式 | NA | 深入了解垂体-肾脏轴的连接机制 | 垂体和肾脏的细胞类型及其相互作用 | 数字病理学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 使用了来自GEO数据库的小鼠垂体和肾脏的单细胞转录组数据 |
| 20851 | 2024-08-08 |
[Heterogeneity and function of uterine NK cells: A review]
2022-Jul, Xi bao yu fen zi mian yi xue za zhi = Chinese journal of cellular and molecular immunology
PMID:35786459
|
综述 | 本文综述了子宫自然杀伤（NK）细胞的异质性和功能 | 通过单细胞测序技术，研究人员在人类子宫中发现了三种具有不同表型和功能的子宫NK细胞 | NA | 探讨子宫NK细胞在妊娠早期的异质性和功能 | 子宫NK细胞及其在妊娠中的作用 | 免疫学 | NA | 单细胞测序 | NA | 细胞 | NA |
| 20852 | 2024-08-08 |
In vivo transcriptional analysis of mice infected with Leishmania major unveils cellular heterogeneity and altered transcriptomic profiling at single-cell resolution
2022-07, PLoS neglected tropical diseases
IF:3.4Q1
DOI:10.1371/journal.pntd.0010518
PMID:35789215
|
研究论文 | 本文通过结合批量RNA测序（RNA-Seq）和单细胞RNA测序（scRNA-Seq），对感染利什曼原虫L. major的小鼠进行体内转录组分析，揭示了感染后的细胞异质性和转录组变化。 | 首次进行了L. major感染小鼠的体内全局转录组分析，结合了批量和单细胞RNA测序技术，揭示了感染后的细胞异质性和转录组变化。 | NA | 研究L. major感染小鼠后的体内转录组变化，特别是免疫反应和细胞异质性。 | 感染利什曼原虫L. major的小鼠及其免疫细胞。 | 数字病理学 | 皮肤利什曼病 | RNA测序（RNA-Seq），单细胞RNA测序（scRNA-Seq） | NA | 转录组数据 | 感染L. major的小鼠样本 |
| 20853 | 2024-08-08 |
Natural high-avidity T-cell receptor efficiently mediates regression of cancer/testis antigen 83 positive common solid cancers
2022-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2022-004713
PMID:35798537
|
研究论文 | 本文研究了从年轻健康捐赠者中分离出的高亲和力T细胞受体（TCR）对CT83阳性常见实体癌的疗效 | 本文首次从年轻健康捐赠者中分离出针对常见实体癌中频繁表达的CTA的高亲和力TCR，并展示了其在体外和体内的抗肿瘤活性 | NA | 研究高亲和力TCR对CT83阳性常见实体癌的疗效 | CT83蛋白和其特异性TCR | 免疫学 | 实体癌 | 单细胞测序 | NA | 蛋白质 | 来自年轻健康捐赠者的T细胞 |
| 20854 | 2024-08-08 |
Insight into 2,3,7,8-tetrachlorodibenzo-p-dioxin-induced disruption of zebrafish spermatogenesis via single cell RNA-seq
2022-Jul, PNAS nexus
IF:2.2Q1
DOI:10.1093/pnasnexus/pgac060
PMID:35799832
|
研究论文 | 本文通过单细胞RNA测序技术研究了2,3,7,8-四氯二苯并-对二恶英（TCDD）对斑马鱼精子发生的影响 | 利用单细胞RNA测序技术详细分析了TCDD暴露后斑马鱼睾丸中不同细胞类型的基因表达变化 | NA | 探讨TCDD暴露对斑马鱼精子发生的影响及其分子机制 | 斑马鱼精子发生过程中的细胞类型及其基因表达 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 成年斑马鱼睾丸中的多种细胞类型 |
| 20855 | 2024-08-08 |
Integration and Reanalysis of Four RNA-Seq Datasets Including BALF, Nasopharyngeal Swabs, Lung Biopsy, and Mouse Models Reveals Common Immune Features of COVID-19
2022-Jun, Immune network
IF:4.3Q2
DOI:10.4110/in.2022.22.e22
PMID:35799708
|
研究论文 | 本研究重新分析了四个COVID-19的RNA测序数据集，包括人支气管肺泡灌洗液、鼻咽拭子、肺活检和hACE2转基因小鼠，揭示了COVID-19的共同免疫特征。 | 使用统一的标准化方法重新分析多个RNA测序数据集，揭示了COVID-19的共同免疫特征，与单细胞RNA测序研究结果一致。 | NA | 理解COVID-19的发病机制，并开发更好的治疗策略。 | COVID-19患者的免疫反应。 | 数字病理学 | COVID-19 | RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 包括人支气管肺泡灌洗液、鼻咽拭子、肺活检和hACE2转基因小鼠的四个数据集 |
| 20856 | 2024-08-08 |
Human obstructive (postvasectomy) and nonobstructive azoospermia - Insights from scRNA-Seq and transcriptome analysis
2022-May, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2020.09.004
PMID:35782978
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析阻塞性和非阻塞性无精症患者的睾丸活检样本，探索其分子基础和转录调控机制 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了阻塞性和非阻塞性无精症患者的转录组变化，特别是在Sertoli细胞和生殖细胞的相互作用方面的发现 | 研究样本量较小，仅包括两名患者，可能影响结果的普遍性 | 揭示无精症的分子病因和转录调控机制 | 阻塞性和非阻塞性无精症患者的睾丸组织 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 两名患者 |
| 20857 | 2024-08-08 |
ASCL2 Affects the Efficacy of Immunotherapy in Colon Adenocarcinoma Based on Single-Cell RNA Sequencing Analysis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.829640
PMID:35774798
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，探讨了ASCL2在结肠腺癌中对免疫治疗效果的影响及其潜在机制 | 首次揭示了ASCL2与癌症干细胞的正相关性，并通过负调控DUSP4间接影响肿瘤免疫细胞浸润，进而影响免疫治疗效果 | 研究主要集中在ASCL2与DUSP4的关系及其对免疫治疗的影响，未涉及其他可能的调控机制 | 探讨ASCL2在结肠腺癌中的生物学功能及其对免疫治疗效果的影响 | 结肠腺癌中的ASCL2表达及其与癌症干细胞和肿瘤免疫细胞浸润的关系 | 数字病理学 | 结肠腺癌 | 单细胞RNA测序 | WGCNA | RNA | NA |
| 20858 | 2024-08-08 |
Direct FACS Isolation of Neural Stem/Progenitor Lineages from the Adult Brain
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2409-8_8
PMID:35776349
|
研究论文 | 本文提供了一种简化的协议，用于直接从鼠脑中收获和分离神经干细胞谱系，以便为单细胞RNA测序提供输入材料 | 该方法能够在神经干细胞谱系的 niche 环境中阐明真实的转录特征和激活的通路 | 主要挑战是成年神经干细胞数量有限，以及体外培养和扩增对其特性的显著改变 | 理解调节神经干细胞/祖细胞在脑内功能的机制，为维持或增强神经功能的发展再生策略提供关键步骤 | 成年脑中的神经干细胞和祖细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 鼠脑样本 |
| 20859 | 2024-08-08 |
Hydrogels for Single-Cell Microgel Production: Recent Advances and Applications
2022, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2022.891461
PMID:35782502
|
综述 | 本文综述了水凝胶在单细胞微凝胶生产中的最新进展和应用 | 介绍了水凝胶在微流控液滴生产中的应用，提供了新颖且更稳健的分析和筛选应用 | NA | 探讨水凝胶在单细胞微凝胶生产中的应用及其在细胞生物学研究中的潜力 | 单细胞技术及其在细胞生物学研究中的应用 | 生物技术 | NA | 微流控技术 | NA | 液滴 | NA |
| 20860 | 2024-08-08 |
MarkerCount: A stable, count-based cell type identifier for single-cell RNA-seq experiments
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.06.010
PMID:35782735
|
研究论文 | 本文介绍了一种名为MarkerCount的细胞类型识别工具，该工具基于单细胞RNA测序实验中表达标记的数量进行细胞类型识别 | MarkerCount不仅能够识别已知细胞群体，还能识别可能代表已知细胞类型未知亚群或未知表型肿瘤细胞的未知集群 | NA | 开发一种稳定的细胞类型识别工具，用于单细胞RNA测序实验的下游分析 | 单细胞RNA测序实验中的细胞类型识别 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 使用公开可用的数据集和标记数据库进行评估 |