单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 35765 篇文献，本页显示第 2061 - 2080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2061 | 2026-01-01 |
Macrophage polarization: molecular mechanisms, disease implications, and targeted therapeutic strategies
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1732718
PMID:41459510
|
综述 | 本文综述了巨噬细胞极化的分子机制、疾病意义及靶向治疗策略 | 超越经典的M1/M2二分法，强调极化状态的连续性和动态性，并整合代谢重编程、表观遗传机制及新兴治疗策略 | 临床转化面临脱靶效应、递送效率低、微环境依赖性等挑战 | 探讨巨噬细胞极化的分子基础及其在疾病中的作用，并综述靶向治疗策略 | 巨噬细胞 | NA | NA | 单细胞组学、空间转录组学、计算建模、合成生物学 | NA | NA | NA | NA | 单细胞组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2062 | 2026-01-01 |
Single-cell and bulk transcriptomics reveal a CD8+ T-cell gene signature predicting prognosis in diffuse large B-cell lymphoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1685541
PMID:41459519
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据，建立了一个CD8⁺ T细胞相关的预后特征，用于预测弥漫性大B细胞淋巴瘤患者的生存和CAR-T疗法疗效 | 首次结合单细胞RNA测序和批量转录组数据分析DLBCL中CD8⁺ T细胞的异质性，并构建了一个基于CD8⁺ T细胞基因的预后模型，该模型能有效分层患者风险并预测CAR-T治疗反应 | 研究样本量相对有限（单细胞数据来自29个样本），且为回顾性分析，需要进一步的前瞻性验证 | 揭示DLBCL中CD8⁺ T细胞的异质性，并开发一个预后基因特征以预测患者生存和治疗反应 | 弥漫性大B细胞淋巴瘤患者样本中的CD8⁺ T细胞 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO回归, 多变量Cox分析 | 转录组数据 | 单细胞数据来自29个样本（28名个体），包括DLBCL和反应性淋巴结/扁桃体样本；批量RNA-seq数据集未指定具体样本数 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2063 | 2026-01-01 |
Identification and validation of biomarkers related to centrosome replication in ulcerative colitis based on bulk transcriptome, single-cell RNA sequencing and experiments
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1627926
PMID:41459538
|
研究论文 | 本研究通过整合批量转录组、单细胞RNA测序和实验验证，识别并验证了与溃疡性结肠炎中中心体复制相关的六个生物标志物 | 首次结合批量转录组、单细胞RNA测序和多种机器学习算法，系统性地识别并验证了与中心体扩增相关的基因在溃疡性结肠炎中的生物标志物作用 | 研究主要依赖于公共数据库数据，样本来源可能有限；实验验证部分可能未涵盖所有已识别的生物标志物 | 探究中心体扩增相关基因在溃疡性结肠炎进展中的相关性并识别潜在生物标志物 | 溃疡性结肠炎患者样本与对照样本 | 生物信息学 | 溃疡性结肠炎 | 批量转录组测序, 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blot, 免疫组织化学 | 多种机器学习算法 | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 2064 | 2026-01-01 |
Macrophage activation of the TREM2-DAP12-SYK pathway shapes the adipose tissue microenvironment in obesity and unveils the therapeutic potential of natural compounds egcg and SMRR
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1694985
PMID:41459526
|
研究论文 | 本研究通过整合批量转录组学和单细胞RNA-seq数据，揭示了肥胖中脂肪组织微环境的巨噬细胞异质性，并发现TREM2-DAP12-SYK通路在肥胖相关巨噬细胞状态中的关键作用，同时评估了天然化合物EGCG和SMRR的治疗潜力 | 整合批量与单细胞转录组数据识别BMI相关基因模块和巨噬细胞调控程序，揭示TREM2-DAP12-SYK轴在肥胖相关巨噬细胞状态中的核心功能障碍，并首次评估天然化合物EGCG和SMRR通过重新激活该通路缓解肥胖的疗效 | 研究主要基于转录组数据，功能验证和机制细节需进一步实验确认，且动物模型结果向人类转化的有效性有待验证 | 阐明肥胖中脂肪组织免疫代谢失衡的关键驱动因素，并开发靶向干预策略 | 人类脂肪组织样本（批量转录组n=434，单细胞RNA-seq 24个样本）和高脂饮食诱导的肥胖小鼠模型 | 数字病理学 | 肥胖 | 批量转录组学，单细胞RNA-seq | 细胞特异性网络，亚型特异性基因调控网络，伪时间轨迹分析，细胞间通讯分析，分子对接 | 转录组数据 | 批量转录组434个样本，单细胞RNA-seq 24个脂肪组织样本共194,608个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2065 | 2026-01-01 |
Deep learning-aided inter-species-comparison reveals shared and distinct molecular patterns in cynomolgus monkey and humans following non-specific T cell activation
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1603716
PMID:41459534
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学数据和深度学习技术，比较了食蟹猴与人类在非特异性T细胞激活后的免疫反应分子模式 | 开发了一个整合变分自编码器、细胞间通讯、差异基因表达和通路富集分析的跨物种时间序列分析计算框架 | 仅使用了两个生物学重复，样本量较小；研究仅关注了PBMCs，未涉及组织特异性免疫反应 | 比较食蟹猴与人类在免疫激活后的共享和差异分子特征，以改进临床前动物模型向人类条件的转化 | 食蟹猴和健康人类的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | 免疫系统疾病 | 单细胞RNA测序 | 变分自编码器 | 单细胞转录组数据 | 两个物种各两个生物学重复，在基线、刺激后0小时、6小时和24小时四个时间点采样 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2066 | 2026-01-01 |
Construction of a prognostic model for colorectal cancer liver metastasis based on single-cell transcriptomics and regulation of the MIF pathway
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1588514
PMID:41127012
|
研究论文 | 本研究基于单细胞转录组学数据，构建了结直肠癌肝转移的预后模型，并探讨了MIF通路在转移过程中的调控作用 | 结合单细胞转录组学与批量RNA-seq数据，识别了结直肠癌肝转移过程中上皮细胞的关键基因表达变化，并构建了一个新的预后风险模型 | 研究数据主要来源于公共数据库（GEO和TCGA），需要进一步的独立队列和实验验证来确认模型的普适性 | 构建结直肠癌肝转移的预后模型并阐明MIF通路在转移中的作用机制 | 结直肠癌患者样本（含肝转移） | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | 预后风险模型 | 转录组数据 | 来自GEO和TCGA数据库的结直肠癌样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2067 | 2026-01-01 |
Correction: Construction of a prognostic model for colorectal cancer liver metastasis based on single-cell transcriptomics and regulation of the MIF pathway
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1731870
PMID:41473439
|
correction | 本文是对一篇关于基于单细胞转录组学构建结直肠癌肝转移预后模型及调控MIF通路研究的文章的更正 | NA | NA | NA | NA | NA | 结直肠癌肝转移 | 单细胞转录组学 | 预后模型 | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2068 | 2026-01-01 |
Longitudinal multi-functional analysis identified responses of T cells, B cells, and monocytes as hallmarks of immunotherapy tolerance in patients with merkel cell carcinoma
2023, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0293922
PMID:37983224
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了默克尔细胞癌患者外周血中免疫细胞的动态变化，揭示了免疫治疗耐受的机制 | 采用纵向多组学方法，结合单细胞RNA测序和批量RNA数据验证，识别了T细胞耗竭、B细胞失调和单细胞亚群变化作为免疫逃逸的关键标志 | 样本量较小（仅基于四名患者的时间点数据），且主要依赖外周血分析，可能未完全反映肿瘤微环境的变化 | 探究默克尔细胞癌患者免疫治疗耐受的细胞机制和免疫逃逸条件 | 默克尔细胞癌患者的外周血免疫细胞 | 数字病理学 | 皮肤癌（默克尔细胞癌） | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），批量RNA测序 | NA | RNA测序数据 | 四名患者的外周血样本，采集自四个时间点 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2069 | 2026-01-01 |
High-Throughput Monitoring of Bacterial Cell Density in Nanoliter Droplets: Label-Free Detection of Unmodified Gram-Positive and Gram-Negative Bacteria
2021-01-19, Analytical chemistry
IF:6.7Q1
DOI:10.1021/acs.analchem.0c03408
PMID:33301291
|
研究论文 | 本文介绍了一种基于纳米液滴散射光的高通量、无标记细菌检测方法，适用于革兰氏阳性和阴性细菌 | 开发了无需基因修饰或化学标记的高通量无标记细菌检测技术，利用纳米液滴散射光测量实现细菌增殖的可靠检测 | 未在摘要中明确说明具体局限性 | 开发适用于临床、研究和工业领域多种细菌菌株的高通量微液滴分析技术 | 未修饰的革兰氏阳性和革兰氏阴性细菌 | 微生物分析技术 | NA | 液滴微流控技术、散射光测量 | NA | 光学信号数据（散射光、荧光） | NA | NA | 液滴微流控 | NA | 纳米液滴封装系统 |
| 2070 | 2025-12-31 |
Breaking barriers: epithelial-mesenchymal transition role in melanoma invasion and resistance
2026-Feb-01, Melanoma research
IF:1.5Q4
DOI:10.1097/CMR.0000000000001068
PMID:41222312
|
综述 | 本综述探讨了上皮-间质转化（EMT）在黑色素瘤侵袭和耐药中的核心作用 | 详细阐述了EMT在黑色素瘤中的分子机制，包括转录因子、信号通路、表观遗传和非编码RNA调控，并强调了EMT与肿瘤微环境的相互作用及作为预后生物标志物的潜力 | 存在EMT异质性和临床前模型不足的局限性 | 阐明EMT在黑色素瘤进展、转移和耐药中的角色，以推动治疗策略发展 | 黑色素瘤细胞及其EMT过程 | NA | 黑色素瘤 | NA | NA | NA | NA | NA | 单细胞分析, 空间转录组学 | NA | NA |
| 2071 | 2025-12-31 |
Revealing Inhibition of Gastric Cancer Occurrence and Metastasis by GPX3 Through Single-Cell Transcriptomics and Organoid Multimodal Technologies
2026-Jan, Molecular carcinogenesis
IF:3.0Q2
DOI:10.1002/mc.70057
PMID:41118587
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学结合类器官多模态技术，揭示了GPX3在抑制胃癌发生和转移中的作用 | 首次结合单细胞转录组分析和类器官模型，系统性地揭示了GPX3作为胃癌转移的潜在抑制因子及其在体内外实验中的功能验证 | 样本量相对较小（3个原发肿瘤、1个癌旁组织、6个转移样本），且主要基于公共数据集GSE163558进行分析 | 阐明驱动胃癌转移的关键因子，并探索其作为治疗靶点的潜力 | 胃癌细胞、患者来源的胃癌类器官、裸鼠肝转移模型 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 10个样本（3个原发GC、1个癌旁、6个GC转移样本） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2072 | 2025-12-31 |
Prognostic Significance of LGALS3BP in Triple-Negative Breast Cancer: Implications for Immune Infiltration and Therapeutic Response
2026-Jan, Journal of biochemical and molecular toxicology
IF:3.2Q2
DOI:10.1002/jbt.70536
PMID:41467329
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析，鉴定出LGALS3BP作为三阴性乳腺癌中关键的脂质相关巨噬细胞标志物，并探讨其与免疫浸润、治疗反应及预后的关联 | 首次将LGALS3BP识别为三阴性乳腺癌中脂质相关巨噬细胞的关键预后标志物，并揭示了其与免疫浸润和免疫治疗反应的直接联系 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证；样本来源和数量可能有限，需进一步临床队列验证 | 识别三阴性乳腺癌肿瘤微环境中的新型预后标志物，并探索其免疫调节功能 | 三阴性乳腺癌患者样本，特别是肿瘤微环境中的脂质相关巨噬细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2073 | 2025-12-31 |
Nanoplastics in Duckweed: Single-Cell Responses and Recovery
2025-Dec-30, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.5c15989
PMID:41400345
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞转录组学、酶活性测定和铕掺杂纳米塑料示踪技术，全面探究了浮萍对聚苯乙烯纳米塑料在环境相关剂量和高剂量下的响应与恢复过程 | 首次在单细胞分辨率下揭示了浮萍对纳米塑料的细胞类型特异性响应机制，并整合纳米示踪技术量化了吸收与排泄过程 | 研究仅针对聚苯乙烯纳米塑料和浮萍模型，其他类型纳米塑料或水生植物的响应机制仍需进一步探究 | 阐明水生植物对纳米塑料污染的响应与恢复分子机制 | 浮萍（水生植物模型） | 单细胞组学 | NA | 单细胞转录组学，酶活性测定，纳米示踪技术 | NA | 单细胞转录组数据，酶活性数据，示踪定量数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） |
| 2074 | 2025-12-31 |
Bulk and single-cell transcriptome analysis reveal shared key genes and patterns of immune dysregulation in systemic lupus erythematosus and sepsis
2025-Dec-30, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01350-y
PMID:41462079
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 2075 | 2025-12-31 |
Deciphering immune features and cellular heterogeneity in PRRSV infection via single-cell RNA sequencing
2025-Dec-30, Journal of virology
IF:4.0Q2
DOI:10.1128/jvi.01828-25
PMID:41467841
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序技术，分析了PRRSV感染猪肺组织中的免疫特征和细胞异质性 | 首次在单细胞水平上全面描绘了PRRSV感染期间肺组织的细胞异质性和免疫细胞动态变化，并识别出SPP1巨噬细胞亚群为PRRSV的主要靶细胞 | 研究仅基于转录组数据，未结合蛋白质组或功能验证实验，且样本来源单一（猪肺组织），可能限制了结果的普适性 | 揭示PRRSV感染如何扰乱肺免疫细胞群，探究病毒诱导免疫功能障碍的机制 | PRRSV感染的猪肺组织细胞 | 数字病理学 | 猪繁殖与呼吸综合征 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 46,922个单细胞，涵盖15种主要细胞类型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2076 | 2025-12-31 |
VAMP5 promotes glioma progression through bioinformatics analysis clinical correlation and functional validation
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04375-1
PMID:41467924
|
研究论文 | 本研究通过生物信息学分析、临床相关性研究和功能验证，探讨了VAMP5在胶质瘤中的表达模式、临床意义及功能作用 | 首次系统评估VAMP5在胶质瘤中的表达、预后价值和功能机制，结合单细胞RNA测序揭示其在胶质瘤细胞内的分布异质性 | 研究主要基于公共数据集和体外/体内实验，临床样本验证可能有限，且具体分子机制需进一步深入探索 | 探究VAMP5作为胶质瘤新型分子驱动因子的表达、临床意义及功能角色 | 胶质瘤组织、正常脑组织、GBM细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 实时PCR、免疫组化、Western blot、单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、临床数据、实验数据 | 来自TCGA和GEO数据集的多个数据集及临床样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 2077 | 2025-12-31 |
Integrating multi-omics data and machine learning to identify endocrine disrupting chemicals targeting key ccRCC-related genes
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04138-y
PMID:41467947
|
研究论文 | 本研究整合多组学数据与机器学习，识别靶向关键ccRCC相关基因的内分泌干扰化学物 | 首次结合多组学数据集与机器学习算法，系统性识别与ccRCC相关的内分泌干扰化学物及其靶基因，并揭示其在肿瘤微环境中的作用机制 | 研究基于计算模型预测，需实验验证确认EDCs的具体作用机制；样本数据可能受限于现有数据库的覆盖范围 | 探索内分泌干扰化学物在透明细胞肾细胞癌发病机制中的作用，识别潜在致病化学物及相关基因靶点 | 透明细胞肾细胞癌（ccRCC）相关的多组学数据、内分泌干扰化学物（EDCs）及肿瘤微环境 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA测序、批量RNA测序、多组学数据整合 | 机器学习算法（共评估101种） | RNA测序数据（单细胞与批量）、多组学数据集 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 2078 | 2025-12-31 |
Integrated transcriptomic and single-cell analysis reveals cell cycle dysregulation and cellular heterogeneity in lung cancer
2025-Dec-30, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-04303-3
PMID:41467951
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学和单细胞分析，揭示了肺癌中细胞周期失调和细胞异质性 | 结合bulk RNA-seq和scRNA-seq，识别了与临床表型相关的基因模块及五个关键的细胞周期调控因子，并进行了实验验证 | 研究主要基于转录组数据，可能未涵盖表观遗传或蛋白质水平的变化，且样本来源和细胞系验证有限 | 阐明肺癌的转录景观和肿瘤微环境中的细胞异质性，以识别潜在的治疗靶点和预后生物标志物 | 肺癌组织、邻近正常样本、A549和H1299肺癌细胞系 | 数字病理学 | 肺癌 | bulk RNA-seq, scRNA-seq, WGCNA, RT-qPCR | NA | 转录组数据 | 肺癌组织和邻近正常样本（具体数量未明确），以及A549和H1299细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 2079 | 2025-12-31 |
Construction of a single-cell transcriptome atlas for Pogostemon cablin embryoids reveals PcNAC048 as a dual regulator coordinating lateral root morphogenesis and patchouli alcohol biosynthesis
2025-Dec-29, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-09434-5
PMID:41461945
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了广藿香体细胞胚的单细胞转录组图谱，揭示了PcNAC048作为协调侧根形态发生和广藿香醇生物合成的双重调控因子 | 首次在广藿香中应用单细胞RNA测序技术构建体细胞胚的单细胞图谱，并鉴定出PcNAC048作为同时调控发育和次生代谢的新转录因子 | 研究主要基于体外培养的体细胞胚，可能无法完全反映自然条件下的发育过程；转基因验证仅在拟南芥中进行，在广藿香中的功能需进一步确认 | 解析广藿香体细胞胚发育的细胞异质性及调控机制，探索药用成分合成的遗传基础 | 广藿香的体细胞胚（包括球形胚、心形胚、鱼雷形胚和子叶胚） | 植物生物学 | NA | 单细胞RNA测序，酵母单杂交，双荧光素酶报告基因检测，转基因技术，病毒诱导基因沉默 | NA | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量，但包括球形胚和子叶胚两种发育阶段的体细胞胚 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 2080 | 2025-12-31 |
CCL20 secreted by KRT15high tumor Cells promotes tertiary lymphoid structure formation and enhances anti-PD-1 therapy response in HPV+HNSCC
2025-Dec-29, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-08359-5
PMID:41462011
|
研究论文 | 本研究揭示了HPV阳性头颈鳞状细胞癌中KRT15高表达肿瘤细胞通过分泌CCL20促进三级淋巴结构形成，从而增强抗PD-1疗法疗效的机制 | 首次阐明HPV感染通过KRT15高表达肿瘤细胞分泌CCL20促进三级淋巴结构形成的具体机制，并证实其对免疫检查点疗法疗效的增强作用 | 样本量相对有限（59例患者），且机制研究主要在动物模型中进行验证 | 探究HPV阳性头颈鳞状细胞癌中三级淋巴结构形成的机制及其对免疫治疗疗效的影响 | 头颈鳞状细胞癌患者样本、肿瘤细胞、免疫细胞、小鼠模型 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、RNA-seq、免疫组织化学、多重免疫荧光 | NA | 基因表达数据、空间转录组数据、图像数据 | 59例头颈鳞状细胞癌患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq | NA | NA |