单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27818 篇文献，本页显示第 20721 - 20740 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20721 | 2024-08-08 |
Monocyte biology conserved across species: Functional insights from cattle
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.889175
PMID:35967310
|
研究论文 | 本文深入分析了牛单核细胞在稳态下的批量和单细胞转录组，揭示了它们的功能特化和转录相关性 | 本文通过单细胞RNA测序揭示了先前未被重视的cM内部异质性，并提出intM作为cM和ncM之间的瞬态分化中间体 | NA | 探讨不同类型单核细胞的功能特化和转录相关性 | 牛的单核细胞，包括经典型、中间型和非经典型单核细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20722 | 2024-08-08 |
Immunosuppressive landscape in hepatocellular carcinoma revealed by single-cell sequencing
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.950536
PMID:35967424
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序技术分析了肝细胞癌（HCC）的肿瘤免疫微环境（TIME），揭示了主要免疫细胞类型的分布及其潜在机制。 | 发现了调节性T细胞（Treg）在HCC的TIME中的特异性分布，以及多个免疫检查点的过度表达和糖酵解/糖异生途径的富集。 | NA | 研究肝细胞癌的肿瘤免疫微环境，探索免疫细胞的异质性及其在形成免疫抑制环境中的潜在机制。 | 肝细胞癌的肿瘤免疫微环境中的主要免疫细胞类型。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞测序 | NA | 单细胞和组织测序数据 | NA |
| 20723 | 2024-08-08 |
A robust experimental and computational analysis framework at multiple resolutions, modalities and coverages
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.911873
PMID:35967449
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研究论文 | 本文构建并评估了一个集成的实验框架和分析流程，用于在全肿瘤切片水平上发现和验证潜在的配体-受体相互作用，无需组织解离 | 开发了STRISH计算方法，能够自动扫描整个组织切片，重现细胞间相互作用的全景 | 空间转录组学仍存在低表达配体-受体相互作用的误检问题，但减少了误发现 | 研究癌症免疫细胞间的通信，以促进癌症免疫治疗的发展 | 基底细胞癌和鳞状细胞癌 | 数字病理学 | 皮肤癌 | 单细胞RNA测序、空间转录组学、RNA原位杂交、Opal Polaris多重蛋白染色 | NA | 基因表达数据、蛋白表达数据 | 涉及两种癌症类型，占所有癌症病例的70%以上 |
| 20724 | 2024-08-08 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals the Role of Epithelial Cell Marker Genes in Predicting the Prognosis of Colorectal Cancer Patients
2022, Disease markers
DOI:10.1155/2022/8347125
PMID:35968507
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序数据，探讨了上皮细胞相关生物标志物在结直肠癌（CRC）中的预后价值 | 本研究首次基于单细胞RNA测序数据，构建了一个基于上皮细胞标记基因的风险评估模型，用于预测结直肠癌患者的预后 | 研究样本量较小，仅使用了四个CRC样本的数据，可能影响结果的普遍性 | 探讨上皮细胞标记基因在结直肠癌预后预测中的作用 | 结直肠癌患者的预后 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | Cox比例风险模型 | 转录组数据 | 四个CRC样本 |
| 20725 | 2024-08-08 |
Identification of Human Retinal Organoid Cell Differentiation-Related Genes via Single-Cell Sequencing Data Analysis
2022, Computational and mathematical methods in medicine
DOI:10.1155/2022/9717599
PMID:35979045
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序数据分析，识别了与人类视网膜类器官细胞分化相关的基因 | 本研究首次通过单细胞测序技术识别了220个与视网膜类器官细胞分化相关的基因，并分析了这些基因在视网膜发育和视觉感知中的作用 | 本研究主要依赖于公共数据库中的单细胞RNA测序数据，可能存在样本量和数据质量的限制 | 研究人类视网膜的发育过程，识别与视网膜类器官细胞分化相关的基因 | 人类视网膜类器官的细胞分化过程及相关基因 | 基因组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类视网膜类器官的单细胞RNA测序数据 |
| 20726 | 2024-08-08 |
A Pan-Cancer Analysis Reveals CLEC5A as a Biomarker for Cancer Immunity and Prognosis
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.831542
PMID:35979347
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研究论文 | 本研究通过分析TCGA、GTEx等多个数据库的数据，探讨CLEC5A在多种癌症中的表达及其与免疫浸润和患者预后的关系 | 首次揭示CLEC5A在多种癌症中的表达与免疫浸润和患者预后的关联，并发现其作为潜在的癌症预后生物标志物和抗肿瘤治疗靶点 | NA | 探讨CLEC5A在癌症中的表达及其作为生物标志物和治疗靶点的潜力 | CLEC5A在多种癌症中的表达及其与免疫浸润、患者预后的关系 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 多个癌症类型的样本 |
| 20727 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing to decipher the immunogenicity of ChAdOx1 nCoV-19/AZD1222 and mRNA-1273 vaccines in patients with autoimmune rheumatic diseases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.920865
PMID:35979368
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研究论文 | 研究比较了ChAdOx1 nCoV-19/AZD1222和mRNA-1273疫苗在自身免疫性风湿病患者中的免疫原性，并使用单细胞RNA测序探索了风湿性关节炎患者中高和低抗SARS-CoV-2 IgG水平之间的细胞间相互作用 | 首次通过单细胞RNA测序揭示了CD16单核细胞在抗SARS-CoV-2 IgG水平较高的风湿性关节炎患者中的主导作用，并发现了与MHC II类分子介导的抗原呈递相关的富集通路 | 研究样本仅包括445名参与者，且仅限于自身免疫性风湿病患者和健康对照组 | 探讨ChAdOx1 nCoV-19/AZD1222和mRNA-1273疫苗在自身免疫性风湿病患者中的免疫原性差异 | 自身免疫性风湿病患者和健康对照组的免疫反应 | 数字病理学 | 自身免疫性疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | CellChat | 单细胞RNA测序数据 | 445名参与者，包括389名自身免疫性风湿病患者和56名健康对照 |
| 20728 | 2024-08-08 |
Analysis of Single-Cell Transcriptome Data in Drosophila
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2541-5_4
PMID:35980574
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研究论文 | 本文章节旨在指导分析基于液滴的果蝇单细胞转录组数据 | 本文介绍了针对果蝇单细胞RNA测序数据开发的计算方法 | NA | 提供分析果蝇单细胞转录组数据的指导 | 果蝇的单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 (scRNA-seq) | NA | 转录组数据 | NA |
| 20729 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing reveals spatial heterogeneity and immune evasion of circulating tumor cells
2021-11-24, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20730 | 2024-08-05 |
Single-cell transcriptomics of immune cells in lymph nodes reveals their composition and alterations in functional dynamics during the early stages of bubonic plague
2023-01, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-021-2119-5
PMID:35943690
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研究论文 | 该文章系统地描绘了在鼠疫早期阶段淋巴结中免疫细胞的转录组特点及功能动态变化 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了鼠疫早期感染中淋巴结免疫细胞的组成和功能抑制 | 本研究仅限于小鼠模型，可能无法完全反映人类免疫反应的复杂性 | 研究在鼠疫早期阶段淋巴结内免疫细胞的动态变化及其功能抑制 | 小鼠淋巴结中的免疫细胞 | 数字病理学 | 鼠疫 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA |
| 20731 | 2024-08-08 |
Unique expression of the atypical mitochondrial subunit NDUFA4L2 in cerebral pericytes fine tunes HIF activity in response to hypoxia
2023-01, Journal of cerebral blood flow and metabolism : official journal of the International Society of Cerebral Blood Flow and Metabolism
IF:4.9Q1
DOI:10.1177/0271678X221118236
PMID:35929074
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研究论文 | 本文研究了非典型线粒体亚基NDUFA4L2在大脑周细胞中的独特表达，及其在低氧条件下对HIF活性的精细调控作用 | 发现NDUFA4L2在非低氧条件下在大脑中的持续表达，并揭示了其在周细胞中作为关键的低氧诱导代谢标志物的角色 | NA | 探讨NDUFA4L2在低氧条件下对大脑代谢的调控作用 | NDUFA4L2在大脑周细胞中的表达及其对HIF活性的影响 | 生物学 | NA | 单细胞转录组测序（scRNA-seq），高分辨率多重荧光RNA原位杂交（RNA F.I.S.H.） | NA | RNA | 小鼠和人类大脑样本，以及体外培养的人类大脑周细胞 |
| 20732 | 2024-08-08 |
Intestinal Epithelial Responses to IL-17 in Adult Stem Cell-derived Human Intestinal Organoids
2022-Dec-05, Journal of Crohn's & colitis
DOI:10.1093/ecco-jcc/jjac101
PMID:35927216
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研究论文 | 研究IL-17在成人干细胞衍生的肠道类器官中的作用及其对肠道上皮细胞的影响 | 首次揭示IL-17通过诱导肠道干细胞和肠上皮细胞的焦亡以及杯状细胞的黏液分泌和上皮细胞的IgA转运，发挥保护和病理作用 | 研究主要集中在体外类器官模型，可能与体内环境存在差异 | 探讨IL-17在肠道上皮细胞中的保护和病理作用机制 | 成人干细胞衍生的肠道类器官 | NA | 炎症性肠病 | RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未具体说明样本数量 |
| 20733 | 2024-08-08 |
A multi-omic single cell sequencing approach to develop a CD8 T cell specific gene signature for anti-PD1 response in solid tumors
2022-Dec-01, International journal of cancer
IF:5.7Q1
DOI:10.1002/ijc.34218
PMID:35932450
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研究论文 | 本文通过多组学单细胞测序方法，开发了一种针对CD8 T细胞的基因特征，用于预测实体肿瘤中抗PD1治疗的反应 | 本文利用单细胞RNA测序和单细胞TCR测序技术，揭示了抗PD1反应者和非反应者小鼠肿瘤模型中扩展的TCR克隆型的保守和独特的转录组特征 | NA | 开发一种新的生物标志物，用于预测免疫检查点阻断治疗在实体肿瘤中的反应 | CD8 T细胞在抗PD1治疗中的基因特征 | 数字病理学 | 实体肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | 多个人类恶性肿瘤和小鼠同基因肿瘤模型 |
| 20734 | 2024-08-08 |
Single-cell Sequencing Reveals Clearance of Blastula Chromosomal Mosaicism in In Vitro Fertilization Babies
2022-12, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1016/j.gpb.2022.07.004
PMID:35944838
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学测序分析了七名在胚胎期检测到染色体嵌合体的婴儿，发现胚胎期的染色体嵌合现象可能在发育过程中自行纠正 | 首次通过单细胞多组学测序证实胚胎期染色体嵌合体在出生后可能自行纠正，为胚胎移植提供了新的评估依据 | 研究样本量较小，需要进一步扩大样本验证结果的普遍性 | 探讨胚胎期染色体嵌合体在出生后的染色体状态 | 七名在胚胎期检测到染色体嵌合体的婴儿及其外周血细胞 | NA | NA | 单细胞多组学测序 | NA | 基因组数据和转录组数据 | 1616个外周血细胞来自七名婴儿和三名对照婴儿 |
| 20735 | 2024-08-08 |
Mutations in OOEP and NLRP5 identified in infertile patients with early embryonic arrest
2022-12, Human mutation
IF:3.3Q2
DOI:10.1002/humu.24448
PMID:35946397
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研究论文 | 本研究通过全外显子测序分析了118名经历反复胚胎植入前停滞的中国不孕患者，发现了OOEP和NLRP5基因的新变异，这些变异与早期胚胎停滞有关 | 首次证明了OOEP基因的双等位变异也能导致人类早期胚胎停滞，扩展了与早期胚胎发生相关的SCMC基因的遗传变异谱 | NA | 探究与早期胚胎停滞相关的新基因变异 | OOEP和NLRP5基因在不孕患者中的变异及其对胚胎发育的影响 | NA | 不孕症 | 全外显子测序，单细胞RNA测序 | NA | 基因序列数据，RNA表达数据 | 118名不孕患者及其胚胎 |
| 20736 | 2024-08-08 |
A novel high-risk subpopulation identified by CTSL and ZBTB7B in gastric cancer
2022-11, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-022-01936-x
PMID:35941174
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研究论文 | 本研究通过分析胃癌中的CTSL和ZBTB7B基因表达，识别出一个新的高风险亚群，并探讨了其与肿瘤微环境的关系 | 开发了一种基于两个基因的新型肿瘤微环境分子亚型系统，简化了以往复杂的基因签名和检测方法 | NA | 旨在通过简化分子亚型系统，提高胃癌治疗的临床应用性 | 胃癌患者及其肿瘤微环境 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞测序，定量RT-PCR，免疫化学/免疫荧光染色 | NA | 组织或单细胞水平的数据 | 超过2000名患者的数据 |
| 20737 | 2024-08-08 |
Inverse weighting method with jackknife variance estimator for differential expression analysis of single-cell RNA sequencing data
2022-Oct, Computational biology and chemistry
IF:2.6Q2
|
研究论文 | 本文提出了一种逆非丢失概率加权方法，用于校正单细胞RNA测序数据中由于信息性丢失事件引起的差异表达分析偏差 | 本文提出的方法在所有场景下在AUC、敏感性、特异性和FDR方面表现最佳 | NA | 校正单细胞RNA测序数据中的差异表达分析偏差 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 线性回归、广义线性回归和混合回归 | RNA测序数据 | 使用小鼠胚胎干细胞和成纤维细胞进行实验，以及一个真实数据集的随机分割 |
| 20738 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA and protein profiling of immune cells from the mouse brain and its border tissues
2022-10, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-022-00716-4
PMID:35931780
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研究论文 | 本文提供了一种单细胞多组学分析大脑免疫组分的详细协议 | 结合了高维流式细胞术和基于液滴的单细胞RNA测序，以及CITE-seq技术，实现了高通量且无偏倚的蛋白质表达筛选与转录组分析 | 实验操作需要专业训练，计算分析需要生物信息学和R编程背景 | 深入理解大脑免疫景观，为神经系统疾病的新治疗策略提供依据 | 小鼠大脑及其边界组织的免疫细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序，CITE-seq | NA | RNA和蛋白质 | 小鼠大脑及其边界组织的免疫细胞 |
| 20739 | 2024-08-08 |
Characteristics of plaque lipid-associated macrophages and their possible roles in the pathogenesis of atherosclerosis
2022-10-01, Current opinion in lipidology
IF:3.8Q1
DOI:10.1097/MOL.0000000000000842
PMID:35942822
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综述 | 本文通过比较斑块泡沫巨噬细胞与其他疾病相关巨噬细胞的基因表达谱，探讨了它们在动脉粥样硬化发病机制中的作用 | 将斑块泡沫巨噬细胞命名为斑块脂质相关巨噬细胞（PLAMs），并发现其高表达与吞噬/内吞作用、溶酶体、脂质代谢和氧化磷酸化相关的基因 | NA | 重新审视斑块泡沫巨噬细胞在动脉粥样硬化发病机制中的作用 | 斑块泡沫巨噬细胞的基因表达谱及其在动脉粥样硬化中的功能 | NA | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20740 | 2024-08-08 |
Protocol for profiling cell-centric assembled single-cell human transcriptome data in hECA
2022-09-16, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2022.101589
PMID:35942342
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研究论文 | 本文介绍了人类整体细胞图谱（hECA）的应用，包括通过网站进行“定量画像”探索、创建可定制的参考用于自动细胞类型注释以及使用逻辑条件的细胞排序 | hECA提供了一个统一的信息学框架和细胞中心组装的单细胞转录组数据，涵盖了1,093,299个标记的人类细胞 | NA | 介绍和应用hECA框架 | 人类单细胞转录组数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 1,093,299个标记的人类细胞 |