单细胞与空转测序相关文章

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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量
20401 2024-08-08
ACUTE AND SUSTAINED ALTERATIONS TO THE BONE MARROW IMMUNE MICROENVIRONMENT FOLLOWING POLYMICROBIAL INFECTION
2022-07-01, Shock (Augusta, Ga.)
研究论文 本研究使用单细胞RNA测序技术分析了多微生物感染后骨髓免疫微环境的急性及持续性改变 首次全面分析了脓毒症引起的免疫细胞景观内的转录变化 研究仅限于Friend白血病病毒B小鼠模型,可能限制了结果的普遍性 探讨多微生物感染后骨髓免疫微环境的急性及持续性改变 骨髓中的免疫细胞 NA 脓毒症 单细胞RNA测序 NA RNA 3402个单细胞样本
20402 2024-08-08
Comprehensive analysis of the potential cuproptosis-related biomarker LIAS that regulates prognosis and immunotherapy of pan-cancers
2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过多种生物信息学平台分析了LIAS在泛癌中的表达水平及其与预后的关系,并探讨了其在免疫治疗中的潜在作用 首次全面分析了LIAS在多种癌症中的表达与预后关系,并探讨了其在免疫治疗中的预测价值 NA 探索LIAS在泛癌中的表达水平及其对预后和免疫治疗的影响 LIAS在不同癌症中的表达及其生物学功能 数字病理学 泛癌 单细胞测序 NA 基因表达数据 涉及多种癌症类型
20403 2024-08-08
Bioinformatics analysis and experimental verification of the prognostic and biological significance mediated by fatty acid metabolism related genes for hepatocellular carcinoma
2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过生物信息学分析和实验验证,探讨了脂肪酸代谢相关基因在肝细胞癌中的预后和生物学意义 本研究首次发现并验证了一个新的脂肪酸代谢相关预后模型,为肝细胞癌的治疗和预防提供了潜在策略 NA 旨在发现脂肪酸代谢相关风险特征,并为肝细胞癌患者的预后预测制定更好的模型 肝细胞癌患者的mRNA表达数据和临床参数 生物信息学 肝癌 共识聚类、单因素和多因素Cox回归分析、单样本GSEA算法、qRT-PCR、Western blotting和单细胞转录组学 NA mRNA表达数据 使用TCGA数据库收集的肝细胞癌患者数据,并在ICGC数据集中进行验证
20404 2024-08-08
Dynamically upregulated mast cell CPA3 patterns in chronic obstructive pulmonary disease and idiopathic pulmonary fibrosis
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过基于组织学的方法,定量分析了慢性阻塞性肺疾病(COPD)和特发性肺纤维化(IPF)患者肺部肥大细胞CPA3表达的动态变化及其空间分布 首次揭示了COPD和IPF患者肺部肥大细胞CPA3表达的动态变化及其与免疫病理改变和肺功能的关系 NA 探讨肥大细胞特异性金属蛋白酶CPA3在肺部疾病中的表达模式及其与疾病发展的关系 COPD和IPF患者的肺部肥大细胞CPA3表达 数字病理学 慢性阻塞性肺疾病,特发性肺纤维化 单细胞RNA测序 NA mRNA,蛋白质 控制组和COPD及IPF患者的肺部样本
20405 2024-08-08
Increased proportion of follicular helper T cells is associated with B cell activation and disease severity in IgA nephropathy
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文研究了IgA肾病中CD4T细胞亚群的变化及其在B细胞激活和疾病进展中的作用 首次通过单细胞RNA测序和多重免疫组化染色揭示了IgA肾病患者中Th2、Th17和Tfh细胞比例的增加,以及Tfh细胞与B细胞之间的细胞间相互作用 NA 探讨IgA肾病中CD4T细胞的特征及其在疾病进展中的作用 IgA肾病患者中的CD4T细胞和B细胞 免疫学 肾脏疾病 单细胞RNA测序,多重免疫组化染色 NA 细胞 IgA肾病患者和健康对照组
20406 2024-08-08
Heterozygosity and homozygosity regions affect reproductive success and the loss of reproduction: A case study with litter traits in pigs
2022, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
研究论文 本研究探讨了杂合子区域(ROHet)和纯合子区域(ROH)对中国本土猪种繁殖成功率和繁殖损失的影响 首次深入研究了ROHet和ROH对哺乳动物繁殖成功率和繁殖损失的影响,并发现了一系列与繁殖性能相关的新候选基因 研究仅限于特定的中国本土猪种和其他五个猪种,可能需要进一步扩大样本范围以验证结果的普遍性 揭示ROHet和ROH对哺乳动物繁殖性能的影响,并识别相关的候选基因 中国本土猪种(如金华猪、淳安猪、龙游黑猪和嵊县花猪)及其他五个猪种的基因组 遗传学 NA 关联分析、线性模型、转录组关联研究、单细胞RNA测序 线性模型 基因组数据、转录组数据 涉及四个中国本土猪种和五个其他猪种
20407 2024-08-08
Gut Epithelial Inositol Polyphosphate Multikinase Alleviates Experimental Colitis via Governing Tuft Cell Homeostasis
2022, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology IF:7.1Q1
研究论文 研究肠道上皮细胞中的肌醇多磷酸多激酶(IPMK)如何通过调控簇细胞稳态减轻实验性结肠炎 首次探讨了IPMK在肠道上皮细胞中的功能,特别是其对簇细胞稳态的影响及其在结肠炎中的作用 NA 探究IPMK在肠道上皮细胞中的功能意义 肠道上皮细胞和簇细胞 NA 炎症性肠病 RNA测序 NA RNA IPMKΔIEC小鼠
20408 2024-08-08
Fibroblasts: Immunomodulatory factors in refractory diabetic wound healing
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本文探讨了纤维母细胞在糖尿病难治性伤口愈合中的免疫调节作用 通过单细胞RNA测序技术,发现纤维母细胞不仅是伤口愈合中的关键细胞,还能作为免疫哨兵细胞,监测免疫反应的激活和调节以及与损伤相关的分子模式 NA 探讨纤维母细胞在糖尿病难治性伤口愈合中的潜在作用 糖尿病患者的伤口愈合过程及纤维母细胞的功能 NA 糖尿病 单细胞RNA测序 NA RNA NA
20409 2024-08-08
Single-cell RNA sequencing reveals distinct immunology profiles in human keloid
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术系统地捕获了瘢痕瘤的细胞组成,并发现了瘢痕瘤与邻近正常组织中大多数细胞类型的显著差异 首次通过单细胞RNA测序技术详细描绘了瘢痕瘤的免疫学特征,并揭示了瘢痕瘤中以巨噬细胞为中心的细胞通讯调控网络 NA 揭示瘢痕瘤的免疫学特征及其形成机制 瘢痕瘤及其邻近正常组织的细胞组成和免疫学特征 数字病理学 瘢痕瘤 单细胞RNA测序 NA RNA 12对瘢痕瘤和邻近正常组织样本
20410 2024-08-08
Optimization of cancer immunotherapy through pyroptosis: A pyroptosis-related signature predicts survival benefit and potential synergy for immunotherapy in glioma
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究旨在建立一个与细胞焦亡相关的综合特征,并探讨其在胶质瘤中的潜在临床应用 首次系统研究了细胞焦亡在胶质瘤进展和肿瘤微环境重塑中的作用,并建立了一个与细胞焦亡相关的风险特征 NA 探索细胞焦亡在胶质瘤中的作用及其在免疫治疗中的潜在应用 胶质瘤患者及其免疫治疗反应 数字病理学 脑瘤 实时定量PCR,免疫组化染色,单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 TCGA胶质瘤队列和CGGA胶质瘤队列
20411 2024-08-08
Characterizing the role of SLC3A2 in the molecular landscape and immune microenvironment across human tumors
2022, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究探讨了SLC3A2在人类肿瘤分子景观和免疫微环境中的作用 首次系统阐述了SLC3A2在癌症患者生存和潜在免疫治疗反应中的作用 目前研究中关于SLC3A2调节抗肿瘤免疫的分子机制尚未完全阐明 揭示SLC3A2在癌症患者生存和免疫治疗反应中的作用 SLC3A2在不同肿瘤类型中的表达及其对患者预后和免疫微环境的影响 数字病理学 NA 转录组测序、单细胞测序、免疫组化染色 NA 转录组数据、单细胞数据、组织图像 涉及多种癌症类型,包括低级别胶质瘤和急性髓系白血病,以及食管癌细胞系ESO51
20412 2024-08-08
Exploring strain diversity of dominant human skin bacterial species using single-cell genome sequencing
2022, Frontiers in microbiology IF:4.0Q2
研究论文 本文通过单细胞基因组测序技术,从皮肤拭子中获取未培养皮肤细菌的全面全基因组序列,以探索人类皮肤细菌的优势种群的菌株多样性 单细胞测序技术在从相同皮肤拭子中恢复基因组方面表现更优,显示出比鸟枪法宏基因组测序和分箱方法多10倍的非冗余菌株基因组 NA 理解皮肤共生细菌群落在皮肤健康和病原体传播中的作用 人类个体对应的皮肤细菌菌株的遗传差异 基因组学 NA 单细胞基因组测序 NA 基因组 从八名个体(包括同居群体)中恢复了281个高质量和244个中等质量的单扩增基因组
20413 2024-08-08
Single-cell transcriptomics uncover the key ferroptosis regulators contribute to cancer progression in head and neck squamous cell carcinoma
2022, Frontiers in molecular biosciences IF:3.9Q2
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了铁死亡调控因子在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)进展中的关键作用 首次通过单细胞RNA测序数据分析,揭示了铁死亡途径与HNSCC发展和预后的显著关联 NA 探讨头颈部鳞状细胞癌与铁死亡之间的关联机制 5902个单细胞的转录组数据 数字病理学 头颈部鳞状细胞癌 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 5902个单细胞
20414 2024-08-08
Pan-Cancer Analysis of the Immunological Role of PDIA5: A Potential Target for Immunotherapy
2022, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过大规模生物信息学分析和实验,全面分析了PDIA5在人类癌症中的免疫浸润作用 首次揭示了PDIA5与免疫细胞的相互作用及其在肿瘤免疫中的作用,并证明了PDIA5沉默对癌细胞增殖、克隆形成和侵袭能力的抑制作用 NA 探讨PDIA5在人类癌症中的免疫学作用及其作为免疫治疗潜在靶点的可能性 PDIA5在人类癌症中的表达及其对肿瘤免疫的影响 数字病理学 癌症 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 涉及多种人类癌症样本
20415 2024-08-08
Comprehensive analyses of PDHA1 that serves as a predictive biomarker for immunotherapy response in cancer
2022, Frontiers in pharmacology IF:4.4Q1
研究论文 本研究利用TCGA、GEPIA2和cBioPortal数据库,全面分析了PDHA1在多种癌症中的表达及其与免疫治疗反应的关系 首次系统探讨了PDHA1在多种癌症中的功能及其调控机制,并揭示了其作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 研究主要基于数据库分析,缺乏实验验证 探讨PDHA1在多种癌症中的表达及其作为免疫治疗预测生物标志物的潜力 PDHA1在33种肿瘤类型中的表达及其与预后的关系 数字病理学 NA 单细胞测序 NA 基因表达数据 33种肿瘤类型
20416 2024-08-08
Revealing the intratumoral heterogeneity of non-DS acute megakaryoblastic leukemia in single-cell resolution
2022, Frontiers in oncology IF:3.5Q2
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,分析了非DS急性巨核细胞白血病(AMKL)的肿瘤内异质性 首次建立了AMKL的单细胞转录组图谱,并揭示了其肿瘤内异质性 NA 探究非DS急性巨核细胞白血病的肿瘤内异质性 来自两名融合阳性及一名融合阳性非DS-AMKL儿童的骨髓样本 NA 急性巨核细胞白血病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA RNA 三名儿童的骨髓样本
20417 2024-08-08
PlaqView 2.0: A comprehensive web portal for cardiovascular single-cell genomics
2022, Frontiers in cardiovascular medicine IF:2.8Q2
研究论文 本文介绍了PlaqView 2.0,一个全面的网络门户,用于心血管领域的单细胞基因组学研究 PlaqView 2.0提供了扩展的功能和数据集,包括基因查询、元数据浏览器、细胞身份预测等新工具 NA 旨在为心血管领域的单细胞数据提供一个集中的存储和分析平台 心血管领域的单细胞数据集,包括人类主动脉瘤、基因特异性小鼠敲除和健康参考数据 数字病理学 心血管疾病 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞数据 包括多个数据集,具体样本数量未详细说明
20418 2024-08-08
Identification of Human Cell Cycle Phase Markers Based on Single-Cell RNA-Seq Data by Using Machine Learning Methods
2022, BioMed research international IF:2.6Q3
研究论文 本文利用机器学习方法,基于单细胞RNA测序数据,构建分类器并识别关键基因标记,用于确定人类细胞周期的阶段 本文提供了一种新的方法来确定细胞周期,并识别了新的潜在细胞周期相关基因 NA 确定细胞周期阶段,为癌症发展和靶向细胞周期药物的研究提供关键信息 人类细胞周期的阶段 机器学习 NA 单细胞RNA测序 分类算法 RNA测序数据 大规模单细胞
20419 2024-08-08
Contribution of the Opioid System to the Antidepressant Effects of Fluoxetine
2022-12-15, Biological psychiatry IF:9.6Q1
研究论文 本文探讨了阿片系统在氟西汀抗抑郁效果中的作用 发现阿片系统在氟西汀治疗反应中的作用,并通过基因表达分析和行为测试验证了这一发现 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类中验证 探究阿片系统在氟西汀抗抑郁效果中的作用机制 小鼠的焦虑和抑郁样行为 NA NA 单细胞RNA测序 NA 基因表达数据 使用了mu和delta阿片受体敲除小鼠进行行为测试
20420 2024-08-08
Onepot-Seq: capturing single-cell transcriptomes simultaneously in a continuous medium via transient localization of mRNA
2022-12-09, Nucleic acids research IF:16.6Q1
研究论文 本文介绍了一种名为Onepot-Seq的无设备方法,用于在连续流体介质中同时捕获单细胞转录组 Onepot-Seq利用裂解后mRNA的短暂定位,无需复杂设备即可捕获单细胞转录组 NA 开发一种无需复杂设备的新方法,以扩大单细胞RNA测序的应用范围 单细胞转录组 生物技术 NA 单细胞RNA测序 NA 转录组数据 混合物种实验中获得了高质量的单细胞数据
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