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当前共找到 39398 篇文献,本页显示第 2021 - 2040 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
2021 2026-04-23
A SUMOylation/immune-related gene signature predicts the prognosis and immunotherapy efficacy of patients with triple-negative breast cancer
2026, PeerJ IF:2.3Q2
研究论文 本研究构建了一个结合SUMOylation和免疫相关基因的预后模型,用于预测三阴性乳腺癌患者的生存和免疫治疗效果 首次将SUMOylation与免疫相关基因结合,利用机器学习方法构建预后模型,并验证了其预测免疫治疗疗效的能力 研究依赖于公共数据库数据,样本量有限,且模型需进一步外部验证 开发一个预测三阴性乳腺癌患者预后和免疫治疗疗效的生存预测模型 三阴性乳腺癌患者 机器学习 乳腺癌 RNA-seq, 单细胞测序, qRT-PCR, IHC LASSO, SVM-RFE, 随机森林 RNA-seq数据, 临床信息 来自TCGA和GEO数据库的三阴性乳腺癌患者样本 NA RNA-seq, 单细胞测序 NA NA
2022 2026-04-23
Single-Cell Transcriptomics Reveals the Potential Role of GZMK+ CD8+ T Cells in Cell Senescence of Triple-Negative Breast Cancer
2026, International journal of genomics IF:2.6Q2
研究论文 本研究通过孟德尔随机化和单细胞RNA测序揭示了GZMK+ CD8+ T细胞在三阴性乳腺癌细胞衰老中的潜在作用 结合孟德尔随机化和单细胞转录组学分析,首次发现GZMK基因与三阴性乳腺癌风险的因果关系及其在免疫细胞互作网络中的关键角色 研究主要基于公共数据库的测序数据,功能实验仅在细胞系中进行,缺乏体内验证 阐明关键基因在细胞衰老和三阴性乳腺癌进展中的作用机制 三阴性乳腺癌样本中的免疫细胞(特别是GZMK+ CD8+ T细胞)和肿瘤细胞 数字病理学 乳腺癌 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 批量测序 NA 单细胞转录组数据, 批量RNA测序数据 来自基因表达综合数据库的三阴性乳腺癌和衰老数据集 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
2023 2026-04-23
SPP1 as a Critical Regulator of Cardiac Cell Reprogramming Following Myocardial Infarction Through Single-Cell Transcriptomic Analysis
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过整合bulk和单细胞RNA测序数据,并利用多种机器学习算法,识别了心肌梗死后心脏细胞重编程的关键调控基因SPP1,并初步验证了其促进细胞存活和释放心脏保护因子的功能 首次结合bulk和单细胞转录组数据,并系统性地应用26种不同的机器学习算法来识别心肌修复的关键调控基因,成功将SPP1鉴定为具有高预测能力(AUC = 0.896)的新型生物标志物和潜在治疗靶点 功能验证实验仅在H9c2心肌母细胞模型中进行,需要在更具生理相关性的系统(如动物模型或人源细胞)中进行验证,且研究结果有待在独立的临床队列中得到证实 阐明心肌梗死后心脏细胞重编程的分子机制,以寻找新的预后生物标志物和治疗靶点,促进心脏修复干预策略的发展 急性心肌梗死(AMI)患者的转录组数据,以及H9c2心肌母细胞 机器学习 心血管疾病 RNA-seq, 单细胞RNA测序 多种机器学习算法(共26种) 转录组数据 未在摘要中明确说明具体样本数量,但涉及AMI患者数据集 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
2024 2026-04-23
Multiomics Biomarkers for Differential Diagnosis of Pleural Effusion: Integration of Proteomic Markers and Single-Cell Transcriptomics
2026, Human mutation IF:3.3Q2
研究论文 本研究通过整合蛋白质组学生物标志物、单细胞转录组学和基因组突变分析,开发了一种用于胸腔积液鉴别诊断的多组学方法 首次将蛋白质组学生物标志物、单细胞转录组学免疫图谱和基因组突变分析整合到一个诊断框架中,揭示了疾病特异性免疫机制和突变驱动的治疗机会 研究为前瞻性队列但未进行外部验证,单细胞分析可能无法完全捕获所有细胞亚群 提高胸腔积液的鉴别诊断准确性并揭示其病理机制 564名接受内科胸腔镜检查的胸腔积液患者 数字病理学 肺癌 单细胞RNA测序,靶向二代测序,蛋白质生物标志物检测 NA 单细胞转录组数据,基因组突变数据,蛋白质生物标志物数据 564例患者(炎症性95例,结核性299例,恶性170例) NA 单细胞RNA-seq,靶向NGS NA NA
2025 2026-04-23
Metabolic reprogramming-associated genomic instability drives colorectal cancer progression via the UBXN1-NF-κB axis
2026, American journal of translational research IF:1.7Q4
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据集,系统探讨了结直肠癌中代谢重编程与拷贝数变异之间的关联,并识别了UBXN1作为潜在治疗靶点 首次在单细胞水平上系统性地将代谢特征与基因组不稳定性联系起来,并利用机器学习算法验证了代谢特征对恶性状态的预测能力,识别出UBXN1作为关键调控节点 研究依赖于公开可用的单细胞数据集,可能受到数据批次效应和样本来源的限制,且功能验证主要在细胞层面进行,缺乏体内实验的深入验证 探究结直肠癌中代谢重编程与拷贝数变异之间的关联,并识别潜在的调控机制和治疗靶点 结直肠癌患者的单细胞RNA测序数据,重点关注上皮细胞 数字病理学 结直肠癌 单细胞RNA测序 共识非负矩阵分解,机器学习算法 单细胞RNA测序数据 整合了四个公开可用的单细胞RNA测序数据集,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2026 2026-04-23
Interrogation of glioma immune microenvironment identifies a non-canonical role for microglial Galectin-9 in tumor cell adhesion and phagocytosis
2026, Frontiers in immunology IF:5.7Q1
研究论文 本研究通过单细胞转录组学分析,揭示了胶质瘤相关小胶质细胞中Galectin-9在肿瘤细胞粘附和吞噬中的非经典作用 首次发现Galectin-9在小胶质细胞中调控胶质瘤细胞粘附和吞噬的功能,为胶质母细胞瘤免疫治疗提供了新靶点 研究样本量较小(18例患者),且主要基于体外共培养系统,体内验证不足 识别抗胶质瘤的髓系细胞效应因子,并探究其在肿瘤微环境中的作用机制 胶质瘤患者肿瘤组织中的CD45阳性白细胞,包括小胶质细胞、树突状细胞和淋巴细胞 数字病理学 胶质瘤 单细胞转录组学、光谱流式细胞术、免疫组织化学、Western blotting、共聚焦成像 NA 转录组数据、蛋白质数据、图像数据 18例异柠檬酸脱氢酶(IDH)分层的胶质瘤患者肿瘤组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2027 2026-04-23
cGAS inhibitor IMSB301 modifies interferon signalling in peripheral mononuclear cells of SAMHD1 genetic interferonopathy in vitro
2026, Clinical & translational immunology IF:4.6Q2
研究论文 本文通过单细胞RNA测序评估了cGAS抑制剂IMSB301对SAMHD1基因突变患者外周血单个核细胞中干扰素信号通路的调节作用 首次在体外模型中验证了新型临床阶段cGAS抑制剂IMSB301对遗传性干扰素病SAMHD1突变患者免疫细胞的特定干扰素信号通路抑制作用 研究仅基于单个患者样本,样本量有限,且为体外实验,未进行体内验证 评估cGAS抑制剂IMSB301对遗传性干扰素病(Aicardi-Goutières综合征)患者免疫细胞干扰素信号通路的调节潜力 SAMHD1双等位基因致病突变患者的PBMCs与年龄性别匹配的健康对照 单细胞组学 遗传性干扰素病(Aicardi-Goutières综合征) 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 1例SAMHD1突变患者和1例健康对照的PBMCs NA 单细胞RNA-seq NA NA
2028 2026-04-23
Integration of single-cell and bulk transcriptomics reveals the association of manganese metabolism-related genes with prognosis and immune infiltration in lung adenocarcinoma
2026, Clinical & translational immunology IF:4.6Q2
研究论文 本研究通过整合单细胞和批量转录组数据,揭示了锰代谢相关基因与肺腺癌预后及免疫浸润的关联,并构建了一个基于9个基因的预后特征模型 首次整合单细胞RNA测序和TCGA数据系统研究锰代谢相关基因在肺腺癌中的预后价值,并验证了JQ1与PTMA抑制的协同抗肿瘤效应 研究主要基于回顾性数据,需要前瞻性临床研究进一步验证模型的预测效能和治疗指导价值 探究锰代谢相关基因在肺腺癌预后评估和免疫治疗中的潜在价值 肺腺癌患者 生物信息学 肺癌 单细胞RNA测序,批量RNA测序 Cox回归模型,LASSO回归 转录组数据 TCGA数据库中的肺腺癌样本及单细胞RNA测序数据 NA 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
2029 2026-04-23
Multi-Omics Analysis Reveals m7G Methylation-Related Genes May Be Involved in TGF-β Signaling-Mediated Anti-PD-L1 Response in Bladder Cancer
2026, ImmunoTargets and therapy IF:6.2Q1
研究论文 本研究通过多组学分析,揭示了m7G甲基化相关基因可能通过调控TGF-β信号通路参与膀胱癌抗PD-L1免疫治疗的耐药过程 首次整合bulk、单细胞和空间转录组数据,结合机器学习,系统研究了m7G甲基化相关基因在膀胱癌免疫治疗耐药中的作用,并鉴定出关键基因NUDT10 研究主要基于公共数据库的回顾性数据,实验验证仅限于体外细胞模型,缺乏体内实验和更大规模的临床队列验证 探究m7G甲基化相关基因在膀胱癌免疫治疗耐药中的潜在作用机制 膀胱癌 生物信息学 膀胱癌 多组学分析(转录组学、甲基化分析)、机器学习、siRNA转染、qRT-PCR、Western blot、免疫组化、CCK-8、伤口愈合实验 机器学习模型 转录组数据(bulk、单细胞、空间)、甲基化数据 来自多个公共数据库(TCGA、GEO、IMvigor210)的膀胱癌队列数据,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
2030 2026-04-23
Long-Read Sequencing Reveals RNA Splicing Complexity in Human Diseases
2026, Computational and structural biotechnology journal IF:4.4Q2
综述 本文综述了长读长RNA测序技术在揭示人类疾病中RNA剪接复杂性方面的应用与优势 强调了长读长RNA测序在无需转录本组装的情况下,精确解析外显子-内含子结构、可变剪接模式及非经典RNA加工事件的能力,并探讨了其与单细胞和空间转录组学的整合趋势 作为一篇综述文章,未涉及具体实验数据或样本量的局限性分析 概述长读长RNA测序的工作原理、技术创新及其在疾病研究中的应用,以推动疾病诊断和精准医学 人类疾病相关的转录组,特别是RNA剪接复杂性 自然语言处理 NA 长读长RNA测序 NA RNA测序数据 NA NA 长读长RNA测序, 单细胞转录组学, 空间转录组学 NA NA
2031 2026-04-23
Matrix Stiffness Directs Early Injury and Ketogenesis Programs to Prime Kidney Repair
2025-Dec-03, Journal of the American Society of Nephrology : JASN IF:10.3Q1
研究论文 本研究通过整合多种技术方法,揭示了细胞外基质刚度在急性肾损伤修复中的关键作用,并识别出Mfap2作为通过非经典Hippo通路调控酮体生成的重要修复介质 首次系统描绘了AKI肾脏基质支架的蛋白质组图谱,发现成纤维细胞/周细胞来源的Mfap2通过LATS1介导的非经典Hippo通路调控代谢重编程,提出了Mfap2-Esr2-Hmgcs2轴作为潜在药物靶点 研究主要基于动物模型,尚未在人体中验证;机制研究集中在特定信号通路,可能存在其他未被发现的调控网络 阐明细胞外基质如何通过机械代谢信号通路调控急性肾损伤修复过程 急性肾损伤动物模型、肾脏细胞外基质、成纤维细胞、周细胞、肾小管细胞 数字病理学 急性肾损伤 数据非依赖性采集蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学、空间转录组学、组织工程学 NA 蛋白质组数据、磷酸化蛋白质组数据、空间转录组数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
2032 2026-04-23
Single-cell RNA sequencing reveals the heterogeneity and interactions of immune cells and Müller glia during zebrafish retina regeneration
2025-Dec-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序揭示了斑马鱼视网膜再生过程中免疫细胞与Müller胶质细胞的异质性及相互作用 首次在斑马鱼视网膜再生中系统解析了Müller胶质细胞的两种静止亚型及其向激活状态或杆状前体细胞的转化,并鉴定了小胶质细胞的三种亚型及其动态变化,同时揭示了炎症通过Jak1-Stat3信号通路调控胶质细胞重编程的机制 研究主要基于斑马鱼模型,结果向哺乳动物视网膜再生的直接转化仍需进一步验证 探究炎症在视网膜再生过程中如何调控Müller胶质细胞重编程 斑马鱼视网膜中的免疫细胞(特别是小胶质细胞)和Müller胶质细胞 单细胞组学 视网膜损伤与再生 单细胞RNA测序 NA 单细胞转录组数据 未明确样本数量,但涉及未损伤和损伤后的斑马鱼视网膜组织 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2033 2026-04-23
Dynamic development of microglia and macrophages after spinal cord injury
2025-Dec-01, Neural regeneration research IF:5.9Q1
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术,揭示了脊髓损伤后小胶质细胞和巨噬细胞在动态发育过程中的不同演化路径和功能差异 首次结合单细胞RNA测序与空间转录组学技术,系统解析了脊髓损伤后小胶质细胞与巨噬细胞的差异化演化轨迹,并识别了巨噬细胞中与促炎效应(整合素β2)和神经保护效应(制瘤素M通路)相关的关键分子机制 研究主要基于动物模型,尚未在人类临床样本中得到验证;空间转录组学的分辨率可能不足以完全解析细胞间相互作用的微观空间结构 阐明脊髓损伤后继发性损伤过程中小胶质细胞与巨噬细胞的动态变化及其在炎症反应中的不同作用 脊髓损伤后的小胶质细胞和巨噬细胞 数字病理学 脊髓损伤 单细胞RNA测序, 空间转录组学 NA 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
2034 2025-12-05
Single-cell RNA sequencing identifies a peripheral monocyte subpopulation and its interaction with atrial macrophages via the CCL3-CCR1 axis during atrial remodeling
2025-12, Science China. Life sciences
NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
2035 2026-04-23
Role of long-chain acyl-CoA synthetases in MASH-driven hepatocellular carcinoma and ferroptosis
2025-Nov-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
研究论文 本研究通过整合多种组学技术,揭示了长链酰基辅酶A合成酶(ACSLs)在MASH驱动的肝细胞癌(MASH-HCC)脂质代谢重编程和铁死亡敏感性中的关键作用 首次在MASH-HCC中系统描绘了脂质代谢全景图,并在单细胞水平上揭示了ACSL4在肿瘤组织和免疫微环境中的特异性表达模式及其与铁死亡敏感性的关联 研究主要基于观察性数据,ACSLs在MASH-HCC中的具体功能机制和作为治疗靶点的潜力仍需进一步实验验证 探究MASH-HCC中脂质代谢重编程的特征及其与铁死亡敏感性的关系,以寻找新的治疗靶点 人类MASH-HCC组织样本、人类HCC细胞系、饮食诱导的小鼠MASH-HCC模型 数字病理学 肝细胞癌 bulk RNA测序, 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫组织化学 NA 转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据 人类MASH和MASH-HCC肝脏样本(具体数量未明确说明),人类HCC细胞系,小鼠MASH-HCC模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学, bulk RNA-seq NA NA
2036 2026-04-23
Disrupted developmental signaling induces novel transcriptional states
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本文介绍了一种名为DAISEE的新算法,用于建模单细胞数据集中的扰动响应,并应用于斑马鱼胚胎中ERK信号通路的研究 开发了DAISEE算法,能更有效地在复杂实验设计中分离单细胞扰动响应与混杂变异,并揭示了过激活信号通路在发育胚胎中诱导新基因表达状态的能力 NA 研究发育信号通路扰动对单细胞转录状态的影响 斑马鱼胚胎中的细胞 单细胞分析 NA 单细胞RNA测序 非负矩阵分解框架 单细胞转录组数据 5小时龄斑马鱼胚胎 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2037 2026-04-23
Single-cell sequencing uncovers sensory neuron-mediated CGRP signaling as a driver of sarcoma progression
2025-Oct-28, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America IF:9.4Q1
研究论文 本研究通过单细胞测序揭示了感觉神经元介导的CGRP信号在肉瘤进展中的驱动作用 首次发现肿瘤相关感觉神经元在骨癌中除疼痛感知外的调控功能,并利用化学遗传学方法验证了TrkA抑制对肉瘤生长和转移的抑制作用 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证相对有限,且干预策略的长期效果和临床转化需进一步评估 探究感觉神经元在骨肉瘤进展中的调控机制及潜在治疗靶点 小鼠骨肉瘤模型和人类骨肉瘤骨样本 数字病理学 骨肉瘤 单细胞转录组学、多模态多组学分析 NA 转录组数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
2038 2026-04-23
The acute myeloid leukemia microenvironment impairs neutrophil maturation and function through NF-κB signaling
2025-Oct-02, Blood IF:21.0Q1
研究论文 本研究揭示了急性髓系白血病(AML)微环境通过NF-κB信号通路损害中性粒细胞成熟和功能,导致免疫抑制和感染易感性增加 首次在非照射的宿主中使用中性粒细胞报告小鼠模型,结合单细胞转录组学和体外细胞因子筛选,系统阐明了AML微环境如何通过NF-κB信号通路重塑中性粒细胞的表观遗传和功能 研究主要基于小鼠模型,虽然患者样本验证了类似生物学现象,但人类AML的异质性可能带来更复杂的调控机制 探究AML微环境对健康中性粒细胞成熟和功能的影响及其分子机制 AML暴露的中性粒细胞(来自小鼠模型和AML患者) 单细胞组学 急性髓系白血病 单细胞转录组学、染色质重塑分析、基序发现、体外细胞因子筛选 NA 单细胞RNA-seq数据、表观遗传数据 临床前AML小鼠模型及AML患者样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq NA NA
2039 2026-04-23
Regulation of Collecting Lymphatic Vessel Contractile Function by TRPV4 Channels
2025-Sep, Arteriosclerosis, thrombosis, and vascular biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序和功能实验,揭示了TRPV4通道在收集淋巴管收缩功能调控中的新机制 首次在收集淋巴管中表征了TRPV4的表达,并发现其通过表达TRPV4的髓系细胞与淋巴肌细胞或淋巴内皮细胞之间的相互作用介导收缩失调 研究主要基于小鼠模型,临床样本仅限于乳腺癌相关淋巴水肿患者,机制细节如其他血管舒张前列腺素的作用需进一步验证 探究TRPV4通道在淋巴系统疾病中的表达和功能作用 小鼠收集淋巴管及周围组织,以及乳腺癌相关淋巴水肿患者的活检样本 单细胞转录组学 淋巴水肿 单细胞RNA测序,共聚焦显微镜,细胞内钙活性测量 NA 单细胞转录组数据,图像数据,功能实验数据 小鼠收集淋巴管样本及患者活检样本,具体数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
2040 2026-04-23
Integrating single-cell and single-nucleus datasets improves bulk RNA-seq deconvolution
2025-Aug-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究系统性地评估了整合单细胞RNA测序(scRNA-seq)和单核RNA测序(snRNA-seq)数据以改善批量RNA测序(bulk RNA-seq)反卷积性能的策略 首次系统性地比较了多种整合scRNA-seq和snRNA-seq数据的方法,并提出了针对不同场景的明确指导原则,包括基因过滤和条件变分自编码器(scVI)的应用 研究仅在四种组织类型中进行了验证,对于更广泛或更特殊的组织类型,方法的普适性有待进一步验证 提高批量RNA测序反卷积的准确性,特别是在缺乏完整scRNA-seq参考数据的情况下 批量RNA测序数据的细胞类型组成反卷积 生物信息学 NA 单细胞RNA测序(scRNA-seq),单核RNA测序(snRNA-seq),批量RNA测序(bulk RNA-seq) 条件变分自编码器(scVI),非条件变分自编码器,主成分分析 RNA测序数据 四种不同的组织类型 NA 单细胞RNA-seq,单核RNA-seq,批量RNA-seq NA NA
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