单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 20161 - 20180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20161 | 2024-08-08 |
RAB20 deficiency promotes the development of silicosis via NLRP3 inflammasome
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.967299
PMID:36131930
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研究论文 | 研究通过单细胞测序分析硅肺病患者的支气管肺泡灌洗液，发现RAB20缺乏与硅肺病的发展密切相关，并通过小鼠模型验证了RAB20缺失加剧硅晶体诱导的肺间质纤维化和呼吸功能障碍，主要通过NLRP3炎症小体的激活和IL-1β的释放。 | 首次揭示了RAB20在硅肺病发病机制中的关键作用，为理解环境刺激介导的先天免疫提供了新的分子见解。 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据，需要在人体中进一步验证。 | 探究RAB20在硅肺病发病机制中的作用及其分子机制。 | 硅肺病患者和小鼠模型的单细胞测序数据。 | 数字病理学 | 职业病 | 单细胞测序 | NA | 单细胞数据 | 包括硅肺病患者和未发病矿工的支气管肺泡灌洗液样本 |
| 20162 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome landscape and antigen receptor dynamic during SARS-CoV-2 vaccination
2023-Jul, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2022.08.020
PMID:36097543
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研究论文 | 本研究系统地描绘了接种前后单细胞转录组、TCR和BCR表达谱，并分析了COVID-19患者的TCR序列 | 首次详细描述了接种SARS-CoV-2疫苗后的单细胞分子免疫反应，并发现了特定的克隆CD8 T细胞群 | NA | 揭示SARS-CoV-2疫苗接种和感染期间的详细免疫反应 | 接种疫苗的候选者的单细胞转录组、TCR和BCR表达谱，以及COVID-19患者的TCR序列 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 具体样本数量未在摘要中提及 |
| 20163 | 2024-08-08 |
SLE stratification based on BAFF and IFN-I bioactivity for biologics and implications of BAFF produced by glomeruli in lupus nephritis
2023-05-02, Rheumatology (Oxford, England)
DOI:10.1093/rheumatology/keac528
PMID:36094336
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研究论文 | 本研究通过分析系统性红斑狼疮（SLE）患者中B细胞激活因子（BAFF）和I型干扰素（IFN-I）的生物活性，探讨了BAFF信号阻断疗法的临床应用及其在狼疮性肾炎（LN）中的作用。 | 首次通过单细胞RNA测序和免疫组化分析，揭示了LN患者肾脏样本中BAFF的表达细胞类型，并提出了基于BAFF和IFN-I生物活性的SLE患者分层方法。 | 研究主要集中在BAFF和IFN-I的生物活性分析，未涉及其他可能影响SLE病程的因素。 | 旨在探索SLE患者中BAFF和IFN-I的生物活性，以及这些活性在临床治疗中的应用。 | SLE患者，特别是LN患者，以及健康对照组和非LN患者。 | 数字病理学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, 免疫组化分析 | NA | 生物样本 | 包括LN患者、非LN患者和健康对照组的肾脏样本 |
| 20164 | 2024-08-08 |
CD11b + CD43 hi Ly6C lo splenocyte-derived macrophages exacerbate liver fibrosis via spleen-liver axis
2023-05-01, Hepatology (Baltimore, Md.)
DOI:10.1002/hep.32782
PMID:36098707
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research paper | 本文研究了脾脏来源的CD11b+ CD43hi Ly6Clo脾细胞衍生的巨噬细胞通过脾-肝轴加剧肝纤维化的机制 | 首次揭示了脾脏中的CD11b+ CD43hi Ly6Clo脾细胞迁移至肝脏并转化为巨噬细胞，加剧肝纤维化的具体机制 | NA | 探讨脾脏在肝纤维化发病机制中的具体作用 | 脾脏来源的CD11b+ CD43hi Ly6Clo脾细胞及其在肝纤维化中的作用 | NA | 肝纤维化 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 20165 | 2024-08-08 |
Growth and differentiation of human induced pluripotent stem cell (hiPSC)-derived kidney organoids using fully synthetic peptide hydrogels
2023-Mar, Bioactive materials
IF:18.0Q1
DOI:10.1016/j.bioactmat.2022.08.003
PMID:36093324
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研究论文 | 研究使用全合成自组装肽水凝胶（SAPHs）调控人诱导多能干细胞（hiPSCs）衍生的肾脏类器官的生长和分化 | 首次使用具有可调节刚度的全合成自组装肽水凝胶作为微环境，促进肾脏类器官的分化和成熟，减少非目标细胞类型的产生 | 研究中未提及具体的局限性 | 改进肾脏类器官的形成参数，提高其可重复性和成熟度 | 人诱导多能干细胞衍生的肾脏类器官 | 生物技术 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 细胞 | 共分析了13,179个细胞 |
| 20166 | 2024-08-08 |
Single-cell landscape and clinical outcomes of infiltrating B cells in colorectal cancer
2023-01, Immunology
IF:4.9Q2
DOI:10.1111/imm.13568
PMID:36082430
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多色免疫荧光染色实验，揭示了结直肠癌中浸润B细胞的五种不同亚型及其在肿瘤微环境中的分布模式和功能特性 | 首次详细描述了结直肠癌中浸润B细胞的亚型及其在肿瘤微环境中的功能，并发现B细胞和三级淋巴结构在免疫治疗中的潜在临床意义 | NA | 探究结直肠癌中浸润B细胞的特征及其临床意义 | 结直肠癌中的浸润B细胞及其在肿瘤微环境中的作用 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20167 | 2024-08-08 |
The role of goblet cells and mucus in intestinal homeostasis
2022-12, Nature reviews. Gastroenterology & hepatology
DOI:10.1038/s41575-022-00675-x
PMID:36097076
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综述 | 本文综述了杯状细胞和黏液层在维持肠道稳态中的作用及其在炎症和感染性疾病中的变化 | 通过单细胞RNA测序识别出新的杯状细胞亚群，加深了对它们在肠道稳态中多种贡献的理解 | NA | 探讨杯状细胞和黏液层在维持肠道健康中的作用及其在疾病中的变化 | 杯状细胞和黏液层 | NA | 炎症和感染性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20168 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA analysis of chemokine expression in heterogeneous CD14+ monocytes with lipopolysaccharide-induced bone resorption
2022-11-15, Experimental cell research
IF:3.3Q2
DOI:10.1016/j.yexcr.2022.113343
PMID:36088998
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研究论文 | 研究探讨了脂多糖（LPS）诱导的骨吸收中，CD14+单核细胞的异质性及其在表达趋化因子中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序技术揭示了LPS处理后CD14+单核细胞的异质性及其在骨吸收过程中的趋化因子表达模式 | 研究主要基于体外实验和动物模型，可能与人体内实际情况存在差异 | 探究LPS诱导的骨吸收过程中CD14+单核细胞的响应机制 | CD14+单核细胞及其在LPS处理后的反应 | 数字病理学 | 炎症性骨疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 从人外周血单个核细胞（PBMCs）中分离的CD14+单核细胞 |
| 20169 | 2024-08-08 |
The druggable transcription factor Fli-1 regulates T cell immunity and tolerance in graft-versus-host disease
2022-11-01, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI143950
PMID:36074578
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研究论文 | 研究了转录因子Fli-1在移植物抗宿主病（GVHD）发病机制中的作用，并验证了Fli-1作为治疗靶点的潜力 | 首次揭示了Fli-1在调节T细胞免疫和耐受中的作用，并发现低剂量的喜树碱类药物可以作为有效的Fli-1抑制剂，减轻GVHD的严重程度 | NA | 探讨Fli-1在GVHD中的作用及作为治疗靶点的可能性 | Fli-1在GVHD中的作用及治疗潜力 | NA | 移植物抗宿主病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20170 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome study in forensic medicine: prospective applications
2022-Nov, International journal of legal medicine
IF:2.2Q1
DOI:10.1007/s00414-022-02889-9
PMID:36083564
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review | 本文综述了单细胞转录组学在法医学中的应用前景 | 探讨了单细胞转录组学在法医学领域的潜在应用，为法医学研究提供了新的视角 | 目前该技术在法医学相关研究中尚未得到充分关注 | 旨在通过审查和回顾单细胞转录组学的最新发展和应用，探讨其在法医学研究中的未来方向 | 单细胞转录组学技术及其在法医学中的应用 | NA | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | NA |
| 20171 | 2024-08-08 |
Decoding the associations between cell functional states in head and neck cancer based on single-cell transcriptome
2022-11, Oral oncology
IF:4.0Q2
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研究论文 | 本研究基于单细胞转录组测序技术，系统识别了头颈鳞状细胞癌中的六种癌症相关状态及其关联模式 | 首次定义了头颈鳞状细胞癌中功能状态之间的关联模式，并发现这些模式与状态活性相关 | NA | 旨在理解癌症发病机制中癌细胞功能状态及其关联 | 头颈鳞状细胞癌中的癌细胞功能状态及其关联 | 数字病理学 | 头颈癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 包括免疫细胞和四个独立头颈鳞状细胞癌队列的单细胞RNA测序数据 |
| 20172 | 2024-08-08 |
MSR1 characterized by chromatin accessibility mediates M2 macrophage polarization to promote gastric cancer progression
2022-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2022.109217
PMID:36095948
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研究论文 | 本文通过分析TCIA数据库和综合ATAC-seq、RNA-seq及单细胞RNA测序数据，研究了M2巨噬细胞在胃癌进展中的作用及机制 | 首次揭示了MSR1基因通过染色质可及性介导M2巨噬细胞极化，从而促进胃癌进展的机制 | NA | 探究M2巨噬细胞在胃癌进展中的作用及其潜在的肿瘤促进机制 | 胃癌样本中的M2巨噬细胞及其相关基因 | 数字病理学 | 胃癌 | ATAC-seq, RNA-seq, 单细胞RNA测序 | CIBERSORTx算法 | 基因表达数据 | 17,334个具有染色质可及性的基因，2,714个同时具有染色质可及性和差异表达的基因，171个与生存相关的差异表达基因 |
| 20173 | 2024-08-08 |
Developmental regulation of epithelial cell cuboidal-to-squamous transition in Drosophila follicle cells
2022-11, Developmental biology
IF:2.5Q2
DOI:10.1016/j.ydbio.2022.09.001
PMID:36100084
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研究论文 | 本研究探讨了果蝇卵泡细胞中上皮细胞从立方形到扁平形的转变过程及其调控机制 | 揭示了蜕皮激素和JAK/STAT信号通路在调控上皮细胞形态变化中的重要作用，并首次报道了蜕皮激素信号在上皮细胞重塑中的抑制作用 | NA | 研究上皮细胞形态转变的调控机制 | 果蝇卵泡细胞中的上皮细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20174 | 2024-08-08 |
A machine learning-based method for automatically identifying novel cells in annotating single-cell RNA-seq data
2022-10-31, Bioinformatics (Oxford, England)
DOI:10.1093/bioinformatics/btac617
PMID:36083008
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研究论文 | 本文开发了一种基于自动编码器和迭代特征选择的方法，用于自动识别单细胞RNA测序数据中的新型细胞 | 该方法通过迭代选择显示双峰模式的特征并使用所选特征重新聚类细胞，能够准确识别训练数据中不存在的新型细胞 | NA | 开发一种新的方法来自动识别单细胞RNA测序数据中的新型细胞 | 单细胞RNA测序数据中的新型细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 自动编码器 | 数据 | 五个真实的单细胞RNA测序数据集 |
| 20175 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptomics reveals skewed cellular communication and phenotypic shift in pulmonary artery remodeling
2022-10-24, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.153471
PMID:36099047
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，揭示了肺动脉重塑过程中细胞组成的改变及其对细胞间通信网络的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细描述了肺动脉重塑过程中的细胞和分子变化，特别是平滑肌细胞的异质性和表型转变 | NA | 探究肺动脉重塑过程中不同细胞群体的贡献及其分子机制 | 肺动脉重塑过程中的细胞组成和细胞间通信网络 | 数字病理学 | 肺动脉高压 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | 来自肺动脉高压和捐赠肺的肺动脉样本 |
| 20176 | 2024-08-08 |
Mouse embryo model derived exclusively from embryonic stem cells undergoes neurulation and heart development
2022-10-06, Cell stem cell
IF:19.8Q1
DOI:10.1016/j.stem.2022.08.013
PMID:36084657
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研究论文 | 本文开发了一种基于胚胎干细胞的体外模型，该模型通过转录因子介导的诱导，重构了多能胚胎干细胞谱系和两个胚外谱系，模拟了从胚胎发育第5.5天到第8.5天的发育事件。 | 该模型成功模拟了胚胎发育的关键阶段，包括原肠形成、前后轴形成、脑部和跳动心脏结构的形成，以及胚外组织的发育，如卵黄囊和绒毛膜。 | 模型与自然胚胎发育程序在某些时间和位置存在差异。 | 克服现有体外模型无法完全模拟胚胎与胚外组织间相互作用的局限，开发一种新的胚胎干细胞体外模型。 | 胚胎干细胞及其在体外模型中的发育过程。 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20177 | 2024-08-08 |
Probabilistic boolean networks predict transcription factor targets to induce transdifferentiation
2022-Sep-16, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2022.104951
PMID:36093045
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研究论文 | 本文开发了一种计算方法，用于找到实现转录因子介导的转分化的最佳干预措施 | 本文采用概率布尔网络（PBNs）从单细胞RNA测序数据中构建模型，以模拟造血转录因子的相互作用，并使用“采样网络”方法构建大型网络 | NA | 寻找实现转录因子介导的转分化的最佳干预措施 | 转录因子和细胞状态 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 概率布尔网络（PBNs） | RNA测序数据 | 两种不同细胞状态的数据 |
| 20178 | 2024-08-08 |
Transcription and splicing regulation by NLRC5 shape the interferon response in human pancreatic β cells
2022-09-16, Science advances
IF:11.7Q1
DOI:10.1126/sciadv.abn5732
PMID:36103539
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研究论文 | 本文研究了NLRC5在人胰腺β细胞中通过转录和剪接调控影响干扰素反应的作用 | 首次揭示了NLRC5在人胰腺β细胞中通过调节HLA I类表达和抗原呈递相关基因的表达，以及干扰素α对剪接的影响，从而在1型糖尿病中触发和放大自身免疫反应 | NA | 探讨NLRC5在人胰腺β细胞中对干扰素α反应的调控作用及其在1型糖尿病中的病理生理意义 | 人诱导多能干细胞衍生的胰岛样细胞、人胰岛素产生细胞EndoC-βH1和人胰岛细胞 | NA | 1型糖尿病 | RNA测序 | NA | RNA | 批量和单细胞RNA测序数据 |
| 20179 | 2024-08-08 |
Cell lineage specification and signalling pathway use during development of the lateral plate mesoderm and forelimb mesenchyme
2022-09-15, Development (Cambridge, England)
DOI:10.1242/dev.200702
PMID:36093878
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，定义了鸡胚胎中侧板中胚层（LPM）的细胞命运决定及其在发育过程中的信号通路 | 本研究揭示了TWIST1在早期肢芽上皮-间充质转化中的潜在驱动作用，并定义了BMP信号在早期肢发育中的新角色 | NA | 探讨侧板中胚层（LPM）早期分化和发育的分子机制 | 鸡胚胎中的侧板中胚层（LPM）及其在肢芽发育中的作用 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 鸡胚胎中的多种细胞类型 |
| 20180 | 2024-08-08 |
Single-cell profiling reveals molecular basis of malignant phenotypes and tumor microenvironments in small bowel adenocarcinomas
2022-Sep-14, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-022-00434-x
PMID:36104333
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了12例小肠腺癌（SBA）患者的肿瘤样本，揭示了恶性细胞的分子特征及其与肿瘤微环境的相互作用，并预测了针对SBA的潜在药物候选物 | 首次揭示了小肠腺癌中四种主要恶性细胞亚型的分子特征及其进展关系，并发现了EMT特征的癌细胞亚群与高度耗竭的CD8 T细胞之间的配体-受体相互作用 | NA | 揭示小肠腺癌的分子特征及其与肿瘤微环境的相互作用，并寻找潜在的治疗靶点和药物候选物 | 小肠腺癌患者的肿瘤样本及其分子特征 | 数字病理学 | 小肠腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 12例小肠腺癌患者 |