单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 20081 - 20100 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20081 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA transcriptome analysis of CNS immune cells reveals CXCL16/CXCR6 as maintenance factors for tissue-resident T cells that drive synapse elimination
2022-Sep-24, Genome medicine
IF:10.4Q1
DOI:10.1186/s13073-022-01111-0
PMID:36153630
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了小鼠WNV恢复后前脑中的免疫细胞，揭示了CXCL16/CXCR6作为维持组织驻留T细胞并驱动突触消除的关键因子。 | 首次识别并验证了CXCL16/CXCR6在维持WNV特异性CD8 TRM细胞中的作用，并揭示了其在微胶质激活和持续突触消除中的重要性。 | NA | 探讨RNA病毒感染后中枢神经系统中T细胞与微胶质细胞相互作用的信号机制。 | 小鼠WNV恢复后的前脑免疫细胞。 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组 | NA |
| 20082 | 2024-08-08 |
Comparative profiling of single-cell transcriptome reveals heterogeneity of tumor microenvironment between solid and acinar lung adenocarcinoma
2022-09-23, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-022-03620-3
PMID:36138435
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研究论文 | 通过单细胞转录组测序数据比较分析，揭示了实体型和腺泡型肺腺癌肿瘤微环境的异质性 | 发现了实体型肺腺癌肿瘤微环境中缺氧和酸性环境最为严重，并识别出可能的治疗靶点MTHFD2 | NA | 旨在通过单细胞水平的研究，揭示不同组织学亚型肺腺癌的肿瘤微环境特征，以发现潜在的治疗靶点和联合治疗策略 | 肺腺癌的不同组织学亚型 | 数字病理学 | 肺腺癌 | scRNA-seq | NA | 转录组数据 | 多个肺腺癌样本，包括独立免疫组化验证队列 |
| 20083 | 2024-08-08 |
Chromatin organizer SATB1 controls the cell identity of CD4+ CD8+ double-positive thymocytes by regulating the activity of super-enhancers
2022-09-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-022-33333-6
PMID:36138028
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研究论文 | 本文探讨了染色质组织因子SATB1通过调控超级增强子的活性，控制CD4+ CD8+双阳性胸腺细胞的细胞身份 | 首次揭示了SATB1在染色质结构层面全局调控双阳性胸腺细胞超级增强子的作用，从而促进双阳性细胞身份的建立 | NA | 探索SATB1在双阳性胸腺细胞中调控基因表达的机制 | CD4+ CD8+双阳性胸腺细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序, Hi-C | NA | 基因表达数据 | NA |
| 20084 | 2024-08-08 |
Integration of Bulk and Single-Cell RNA-Seq Data to Construct a Prognostic Model of Membrane Tension-Related Genes for Colon Cancer
2022-Sep-19, Vaccines
IF:5.2Q1
DOI:10.3390/vaccines10091562
PMID:36146640
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研究论文 | 本研究通过整合批量和单细胞RNA测序数据，构建了一个基于膜张力相关基因的结肠癌预后模型 | 开发了一个新的4-MTRG标志物，用于预测结肠癌患者的临床结果，并发现TIMP1可能是结肠癌进展的敏感调节因子 | NA | 旨在从膜张力相关基因中识别结肠癌的预后标志物，并探讨其在疾病中的意义 | 结肠癌患者的预后标志物 | 数字病理学 | 结肠癌 | RNA测序 | LASSO-Cox回归 | RNA测序数据 | 从TCGA数据库获取的批量RNA测序数据，以及单细胞RNA测序数据 |
| 20085 | 2024-08-08 |
Drepmel-A Multi-Omics Melanoma Drug Repurposing Resource for Prioritizing Drug Combinations and Understanding Tumor Microenvironment
2022-09-16, Cells
IF:5.1Q2
DOI:10.3390/cells11182894
PMID:36139469
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research paper | 本文开发了一个名为DRepMel的Shiny应用程序，用于基于多组学药物再利用计算方法，从两组独立患者队列的全外显子和RNA测序数据中，为黑色素瘤患者提供合理的联合治疗预测 | DRepMel不仅提供了强大的预测资源，还利用黑色素瘤患者的单细胞RNA测序数据，识别了潜在的治疗对肿瘤微环境的影响 | NA | 开发一个全面的计算资源，用于定义合理的联合治疗方案 | 黑色素瘤患者及其治疗方案 | digital pathology | 黑色素瘤 | 全外显子测序, RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | 两组独立患者队列 |
| 20086 | 2024-08-08 |
Understanding Mammalian Hair Follicle Ecosystems by Single-Cell RNA Sequencing
2022-Sep-14, Animals : an open access journal from MDPI
IF:2.7Q1
DOI:10.3390/ani12182409
PMID:36139270
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术在毛囊发育中主要细胞类型的研究进展，特别强调了单细胞技术发现的新毛囊亚群 | 利用单细胞RNA测序技术揭示了毛囊细胞的新亚群，提供了对毛囊功能的多样化见解 | 讨论了单细胞RNA测序观察中的问题及其当前解决方案 | 重新认识各种组织和器官，特别是毛囊的细胞异质性 | 毛囊及其细胞类型 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 未具体说明样本数量 |
| 20087 | 2024-08-08 |
Loss of Serpina1 in Mice Leads to Altered Gene Expression in Inflammatory and Metabolic Pathways
2022-Sep-09, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231810425
PMID:36142337
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研究论文 | 研究Serpina1基因在老鼠中的缺失对炎症和代谢途径基因表达的影响 | 首次探讨了Serpina1基因敲除对老鼠肝脏中炎症、脂质代谢和胆固醇代谢相关基因表达的影响 | 研究仅限于老鼠模型，尚未在人类中验证 | 探讨Serpina1基因敲除对肝脏基因表达的影响及其在人类治疗中的潜在应用 | Serpina1基因敲除的老鼠肝脏 | NA | 慢性肝病，慢性阻塞性肺病 | RNA测序 | NA | RNA | 年龄和性别匹配的C57BL/6野生型和Serpina1敲除老鼠，年龄8至14周 |
| 20088 | 2024-08-08 |
An Innovative Approach to Tissue Processing and Cell Sorting of Fixed Cells for Subsequent Single-Cell RNA Sequencing
2022-Sep-06, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms231810233
PMID:36142141
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研究论文 | 本文开发了一种新的组织处理和固定细胞分选方法，用于后续的单细胞RNA测序 | 提出了一种新的组织处理和细胞固定方法，该方法兼容FACS分选和后续的单细胞RNA测序，且不影响结果质量 | 目前处理、染色和保存新鲜细胞的方法非常有限，且需要昂贵的细胞分选设备 | 开发一种方法，允许细胞在固定和储存后进行FACS分选，用于单细胞RNA测序，而不影响结果质量 | 胰腺导管腺癌样本 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 细胞 | 使用小鼠胰腺癌模型Pan02进行评估 |
| 20089 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing: A cutting edge tool in molecular medical research
2022-Sep, Medical journal, Armed Forces India
DOI:10.1016/j.mjafi.2022.08.006
PMID:36147383
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综述 | 本文综述了单细胞测序技术在分子医学研究中的应用及其对疾病相关细胞的时空分析 | 单细胞测序技术通过分析单个细胞而非整个组织，提供了更深入的时空分析，增强了数据的精确性 | 该技术产生大量数据，需要特定的处理和定制的生物信息学分析 | 阐明健康和疾病中的细胞间遗传、表观遗传、转录组和蛋白质组异质性 | 单细胞测序技术及其在医学研究中的应用 | 分子医学 | NA | 单细胞测序 | NA | DNA序列、RNA序列、miRNA、表观遗传修饰DNA或染色质DNA | 大量单细胞 |
| 20090 | 2024-08-08 |
[Clonal Evolution in the Tumor Microenvironment]
2022-Sep, Gan to kagaku ryoho. Cancer & chemotherapy
PMID:36156003
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研究论文 | 本文探讨了肿瘤微环境中克隆进化的机制及其在癌症免疫治疗中的应用 | 利用单细胞测序技术分析肿瘤细胞和免疫细胞的克隆进化，以及新技术允许在保留组织位置信息的同时进行空间分析 | NA | 阐明肿瘤微环境中的克隆进化，以开发预测治疗效果的生物标志物和新型疗法 | 肿瘤细胞和免疫细胞的克隆进化 | 数字病理学 | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 使用来自同一患者的治疗前和治疗后样本 |
| 20091 | 2024-08-08 |
Clinical Characterization and Prognostic Value of TPM4 and Its Correlation with Epithelial-Mesenchymal Transition in Glioma
2022-Aug-24, Brain sciences
IF:2.7Q3
DOI:10.3390/brainsci12091120
PMID:36138856
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研究论文 | 本研究探讨了TPM4在胶质瘤中的临床特征及其与上皮-间质转化的关系，以及其对患者预后的影响 | 首次系统分析了TPM4在胶质瘤中的表达模式及其与上皮-间质转化的关联，并评估了其作为预后标志物的潜力 | 研究依赖于现有数据库的数据，可能存在样本选择偏倚；未涉及TPM4在胶质瘤中的分子机制的深入探讨 | 确定TPM4在胶质瘤中的临床特征和预后价值 | TPM4在胶质瘤中的表达及其与上皮-间质转化的关系 | NA | 脑肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | 998名胶质瘤患者 |
| 20092 | 2024-08-08 |
A Human Stem Cell-Derived Neurosensory-Epithelial Circuitry on a Chip to Model Herpes Simplex Virus Reactivation
2022-Aug-24, Biomedicines
IF:3.9Q1
DOI:10.3390/biomedicines10092068
PMID:36140168
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研究论文 | 本研究展示了在芯片上使用人干细胞衍生的背根神经节（DRG）器官样体建立稳定的神经感觉上皮连接 | 本研究通过在微流控芯片上重建人感觉神经元和角质形成细胞的有序连接，提供了一个强大的体外平台，用于模拟人类病毒病原体的潜伏和再激活 | NA | 开发一个可靠且可重复的体外系统，模拟不同人类感觉神经元与周围组织之间的连接，以深入理解病毒潜伏和再激活的细胞和分子机制 | 人干细胞衍生的背根神经节（DRG）器官样体，感觉神经元细胞类型，以及单纯疱疹病毒1（HSV-1）的关键受体 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 不同组合的关键受体表达于每种感觉神经元细胞类型 |
| 20093 | 2024-08-08 |
Inhibition of APOE potentiates immune checkpoint therapy for cancer
2022, International journal of biological sciences
IF:8.2Q1
DOI:10.7150/ijbs.70117
PMID:36147474
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研究论文 | 本研究探讨了抑制APOE对免疫检查点疗法在癌症治疗中的增强作用 | 首次报道了APOE抑制剂COG 133TFA与αPD-1联合使用可以抑制肿瘤生长并促进肿瘤消退 | NA | 研究APOE在肿瘤免疫治疗中的作用及其潜在的靶向治疗策略 | APOE在肿瘤浸润巨噬细胞中的表达及其对免疫检查点疗法的影响 | 肿瘤学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 包括Apoe小鼠和野生型小鼠，以及对αPD-1治疗有反应和无反应的癌症患者 |
| 20094 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA sequencing analysis to explore immune cell heterogeneity and novel biomarkers for the prognosis of lung adenocarcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.975542
PMID:36147484
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析肺腺癌（LUAD）的细胞异质性，并探索新的预后生物标志物 | 首次对GSE149655单细胞数据进行降维处理，并通过统计分析发现肿瘤组织中高度富集的亚群，构建了10基因预后风险模型，并通过qPCR和免疫组化验证了新分子标记HLA-DRB5和CCDC50 | NA | 探索肺腺癌的免疫细胞异质性和新的预后生物标志物 | 肺腺癌（LUAD）的细胞亚群及其在肿瘤发生发展中的作用 | 数字病理学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞数据 | GSE149655单细胞数据集中的23个亚群和11个细胞子群，以及TCGA-LUAD数据集中的462个基因 |
| 20095 | 2024-08-08 |
Computational solutions for spatial transcriptomics
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.08.043
PMID:36147664
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综述 | 本文综述了空间转录组学平台及其计算解决方案的优势与局限，并探讨了如何利用这些平台和方法进行空间转录组学研究 | 介绍了基于深度学习的联合分析表达、空间和图像数据的新解决方案，以提取空间解析转录组中的生物信息 | 当前平台在空间分辨率、转录组异质性捕获和大规模研究吞吐量方面仍存在不足 | 旨在帮助选择适合的空间转录组学研究平台和计算解决方案 | 空间转录组学平台及其计算方法 | 生物信息学 | NA | 空间转录组学平台 | 深度学习 | 转录组数据 | NA |
| 20096 | 2024-08-08 |
Mathematical model for the relationship between single-cell and bulk gene expression to clarify the interpretation of bulk gene expression data
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.08.062
PMID:36147671
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研究论文 | 本文开发了一个数学模型，用于阐明单细胞和批量基因表达之间的关系，并解释批量基因表达数据的均值和方差 | 提出了一个数学模型，将批量基因表达值与单细胞基因表达轮廓的均值成比例，并通过理论、模拟和真实单细胞RNA-seq数据分析验证了其有效性 | NA | 阐明批量基因表达数据的均值和方差的解释 | 单细胞和批量基因表达之间的关系 | 分子生物学 | NA | 单细胞RNA-seq | 数学模型 | 基因表达数据 | NA |
| 20097 | 2024-08-08 |
scWizard: A web-based automated tool for classifying and annotating single cells and downstream analysis of single-cell RNA-seq data in cancers
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.08.028
PMID:36147672
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研究论文 | 开发了一个名为scWizard的网络自动化工具，用于分类和注释单细胞以及下游分析单细胞RNA测序数据在癌症中的应用 | scWizard集成了基于深度神经网络学习的细胞注释方法和11种下游分析方法，提供了预训练集供用户灵活选择，并在注释肿瘤衍生淋巴细胞/自然杀伤细胞和骨髓细胞亚型方面具有更高的准确性 | NA | 开发一个集成多种分析方法的自动化工具，用于单细胞RNA测序数据的分类、注释和下游分析 | 单细胞RNA测序数据在肿瘤微环境中的应用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 单细胞数据 | 使用113,976个细胞跨越13种癌症类型作为内置参考数据集 |
| 20098 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling reveals several LncRNAs differentially expressed in idiopathic germ cell aplasia
2022, Frontiers in cell and developmental biology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcell.2022.952518
PMID:36147743
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序技术，分析了特发性生殖细胞发育不全患者睾丸中的长链非编码RNA（LncRNA）表达差异 | 首次在单细胞水平上揭示了特发性生殖细胞发育不全患者中差异表达的LncRNA，并发现这些LncRNA与转录因子TAF9B及环境污染物双酚A的激活有关 | NA | 深入理解特发性生殖细胞发育不全的分子机制及其临床进程 | 特发性生殖细胞发育不全患者的睾丸组织 | 数字病理学 | 男性不育症 | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 多个特发性生殖细胞发育不全患者的睾丸组织样本 |
| 20099 | 2024-08-08 |
Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Different Immune Signatures in HPV- and HPV + Driven Human Head and Neck Squamous Cell Carcinoma
2022, Journal of immunology research
IF:3.5Q2
DOI:10.1155/2022/2079389
PMID:36157879
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了HPV阳性和HPV阴性驱动的人类头颈鳞状细胞癌中不同的免疫特征 | 本研究首次通过单细胞转录组分析揭示了HPV阳性和HPV阴性头颈鳞状细胞癌微环境中的细胞组成和信号通路差异 | 研究样本量较小，且仅基于公开数据库的数据进行分析，可能影响结果的普遍性 | 评估病毒（特别是人乳头瘤病毒[HPV]）和致癌物驱动的头颈鳞状细胞癌（HNSCC）微环境 | HPV阳性和HPV阴性头颈鳞状细胞癌患者的单细胞转录组数据 | 数字病理学 | 头颈鳞状细胞癌 | 单细胞测序 | NA | 转录组数据 | 131224个细胞，来自18名HPV阴性HNSCC患者和8名HPV阳性HNSCC患者 |
| 20100 | 2024-08-08 |
Identification of macrophage correlated biomarkers to predict the prognosis in patients with intrahepatic cholangiocarcinoma
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.967982
PMID:36158683
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，识别与肝内胆管癌（ICC）预后相关的巨噬细胞相关生物标志物，并探讨其对免疫治疗反应的预测作用 | 首次在单细胞水平上研究ICC患者中的巨噬细胞，并发现MMP19和SIRPα可预测ICC的预后和免疫检查点阻断（ICB）反应 | 研究仅限于特定的生物标志物和特定的免疫治疗反应，未来研究需扩大样本量和探索更多潜在的生物标志物 | 探讨巨噬细胞在肝内胆管癌发展及治疗反应中的作用，并寻找相关的预后生物标志物 | 肝内胆管癌患者的巨噬细胞及相关生物标志物 | 数字病理学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序（ScRNA-seq） | NA | 转录组数据 | ICC和邻近组织的巨噬细胞被分为12个集群 |