单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 20061 - 20080 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20061 | 2024-08-08 |
Investigate the stemness of adult adipose-derived stromal cells based on single-cell RNA-sequencing
2022-Dec, Cell biology international
IF:3.3Q3
DOI:10.1002/cbin.11898
PMID:36150081
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术探讨了脂肪来源间充质干细胞的干细胞特性及其基因组特征 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细分析了脂肪来源间充质干细胞的细胞异质性和干细胞基因特征 | 研究样本仅来自一名健康成年志愿者，可能影响结果的普遍性 | 探究脂肪来源间充质干细胞的干细胞特性和基因组特征 | 脂肪来源间充质干细胞的干细胞特性和基因组特征 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 5325个脂肪来源间充质干细胞样本 |
| 20062 | 2024-08-08 |
Decoding brain memory formation by single-cell RNA sequencing
2022-11-19, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbac412
PMID:36156112
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综述 | 本文综述了通过单细胞RNA测序技术解码大脑记忆形成的研究进展 | 介绍了单细胞RNA测序和单核RNA测序技术在揭示记忆特异性基因表达动态变化及其调控网络中的应用 | NA | 探讨单细胞RNA测序技术在理解记忆形成分子机制中的应用及面临的计算挑战 | 大脑中记忆形成的分子机制 | 计算生物学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 20063 | 2024-08-08 |
SARA suppresses myofibroblast precursor transdifferentiation in fibrogenesis in a mouse model of scleroderma
2022-11-08, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.160977
PMID:36136606
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研究论文 | 本文研究了SARA在硬皮病小鼠模型中抑制肌成纤维细胞前体转分化的作用 | 首次揭示了SARA在硬皮病发病机制中与肌成纤维细胞前体和免疫细胞之间的新型交叉对话中的关键作用 | NA | 探讨SARA在硬皮病小鼠模型中抑制肌成纤维细胞前体转分化的机制 | SARA在PDGFR-β+周细胞和泛白细胞中的过表达对硬皮病皮肤纤维化的影响 | 数字病理学 | 硬皮病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型 |
| 20064 | 2024-08-08 |
Human Plasma Proteome During Normal Pregnancy
2022-11-04, Journal of proteome research
IF:3.8Q1
DOI:10.1021/acs.jproteome.2c00391
PMID:36154181
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研究论文 | 本研究利用基于适配体的新平台，在91例正常妊娠的528份血浆样本中分析了7288种蛋白质 | 首次在正常妊娠期间对人类血浆蛋白质组进行了大规模分析，并展示了其对监测健康和疾病的潜在价值 | NA | 探索正常妊娠期间人类血浆蛋白质组的变化及其在监测健康和疾病中的应用 | 正常妊娠期间的人类血浆蛋白质组 | NA | NA | 适配体技术 | 机器学习 | 蛋白质组数据 | 528份血浆样本来自91例正常妊娠 |
| 20065 | 2024-08-08 |
Identification of the OA-related metabolism-related genes, corresponding transcription factors, relevant pathways, and specific bioactive small molecules
2022-Nov, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2022.109096
PMID:36152536
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研究论文 | 本研究旨在通过RNA测序数据分析，识别与骨关节炎（OA）相关的代谢相关基因、转录因子、相关通路及特定生物活性小分子 | 本研究通过综合分析RNA测序数据、基因本体论（GO）、京都基因与基因组百科全书（KEGG）富集分析和基因集变异分析（GSVA），构建了转录因子、代谢相关基因和标志物的综合网络，并利用ChIP-seq和单细胞测序技术进一步验证了转录因子的调控作用 | NA | 识别与骨关节炎相关的代谢相关基因、转录因子、相关通路及特定生物活性小分子 | 关节软骨的代谢变化 | NA | 骨关节炎 | RNA测序, ChIP-seq, 单细胞测序 | NA | RNA测序数据 | 74个差异表达的代谢相关基因和38个转录因子 |
| 20066 | 2024-08-08 |
Acute kidney injury biomarkers in the single-cell transcriptomic era
2022-11-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00079.2022
PMID:36154695
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研究论文 | 本文探讨了单细胞转录组学技术在急性肾损伤（AKI）生物标志物研究中的应用 | 利用单细胞转录组学技术，能够详细分析尿液、血液或肾活检中的细胞，揭示传统生物标志物的细胞来源，捕捉患者异质性，定义与不同AKI亚型相关的细胞状态，并可能有助于预测治疗反应 | NA | 探索单细胞技术如何改变AKI的诊断方法，从单一生物标志物转向细胞特异性分子特征 | 急性肾损伤（AKI）的生物标志物 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 20067 | 2024-08-08 |
Single-cell landscape analysis reveals distinct regression trajectories and novel prognostic biomarkers in primary neuroblastoma
2022-Nov, Genes & diseases
IF:6.9Q1
DOI:10.1016/j.gendis.2021.12.020
PMID:36157484
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了17个神经母细胞瘤临床样本和3个肾上腺周围组织，揭示了神经母细胞瘤的独特退化轨迹和新的预后生物标志物。 | 本研究首次通过单细胞RNA测序揭示了神经母细胞瘤的退化机制，并识别出新的预后标志物和潜在的治疗靶点。 | 研究样本数量有限，可能影响结果的普遍性和可靠性。 | 揭示神经母细胞瘤的退化机制，并寻找新的预后生物标志物和治疗靶点。 | 神经母细胞瘤的细胞组成、退化机制和预后标志物。 | 数字病理学 | 神经母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 17个神经母细胞瘤临床样本和3个肾上腺周围组织 |
| 20068 | 2024-08-08 |
DNA sensor-associated type I interferon signaling is increased in ulcerative colitis and induces JAK-dependent inflammatory cell death in colonic organoids
2022-11-01, American journal of physiology. Gastrointestinal and liver physiology
DOI:10.1152/ajpgi.00104.2022
PMID:36165492
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研究论文 | 本研究探讨了DNA传感器途径在溃疡性结肠炎（UC）发病机制中的作用，通过分析结肠黏膜活检组织中DNA传感器、炎症小体和I型干扰素（IFN）生物标志物基因的表达，并研究了I型IFN、IFN-γ和TNF-α对人类结肠类器官中基因表达、细胞因子产生和细胞死亡的影响。 | 本研究发现活动性UC患者结肠基因表达的细胞质DNA传感器、炎症小体、STING和I型IFN信号通路显著增加，I型IFN与TNF-α联合诱导了JAK依赖但NLRP3和炎症小体独立的结肠类器官炎症细胞死亡，这是一种与UC免疫病理相关的新型炎症细胞死亡表型。 | NA | 探讨DNA传感器途径在溃疡性结肠炎发病机制中的作用及其对结肠类器官的影响。 | 结肠黏膜活检组织、人类结肠类器官。 | 免疫学 | 溃疡性结肠炎 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 控制组31例，非活动性UC 31例，活动性UC 33例，以及一个UC单细胞RNA-Seq数据集。 |
| 20069 | 2024-08-08 |
Single-cell mapping of regenerative and fibrotic healing responses after musculoskeletal injury
2022-10-11, Stem cell reports
IF:5.9Q2
DOI:10.1016/j.stemcr.2022.08.011
PMID:36150381
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研究论文 | 本文通过单细胞测序技术比较了再生性和纤维化愈合反应在肌肉骨骼损伤后的差异 | 研究发现纤维化的P2 DTA模型与异位骨化（HO）的转录相似度高于再生性的P3 DTA模型，表明基因表达与愈合结果的相关性大于与损伤类型或细胞来源的相关性 | NA | 指导未来伤口再生策略 | 肌肉骨骼损伤后的再生性和纤维化愈合反应 | NA | NA | 单细胞测序 | NA | 基因表达数据 | 涉及第三指节元素（P3）和第二指节元素（P2）的指尖截肢（DTA）模型以及异位骨化（HO）模型 |
| 20070 | 2024-08-08 |
Highly sensitive single-cell chromatin accessibility assay and transcriptome coassay with METATAC
2022-10-04, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2206450119
PMID:36161934
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研究论文 | 本文介绍了一种高灵敏度的单细胞染色质可及性检测方法METATAC及其与转录组共检测技术 | METATAC方法能够检测大量单细胞中的可及位点，并与自动化兼容，同时与高灵敏度单细胞RNA测序方法MALBAC-DT结合，开发了联合ATAC-RNA检测技术M2C-seq | NA | 提高单细胞染色质可及性和转录组检测的灵敏度和效率 | 单细胞染色质可及性和基因表达的关系 | 单细胞组学 | NA | scATAC-seq, scRNA-seq | NA | 染色质可及性数据, 转录组数据 | 小鼠大脑皮层细胞, 早期小鼠胚胎细胞 |
| 20071 | 2024-08-08 |
Single cell RNA-seq analysis identifies ferroptotic chondrocyte cluster and reveals TRPV1 as an anti-ferroptotic target in osteoarthritis
2022-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104258
PMID:36137413
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析，识别出铁死亡性软骨细胞簇，并揭示TRPV1作为抗铁死亡靶点在骨关节炎中的作用 | 首次通过单细胞RNA测序分析识别出骨关节炎中铁死亡性软骨细胞簇，并发现TRPV1作为抗铁死亡的新靶点 | 研究主要集中在体外和动物模型中，需要进一步的人体临床试验验证 | 探讨软骨细胞铁死亡在骨关节炎发病机制中的作用及其分子特征和潜在治疗靶点 | 骨关节炎患者的软骨细胞和软骨组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 17,638个软骨细胞 |
| 20072 | 2024-08-08 |
Integrating microarray-based spatial transcriptomics and single-cell RNA-sequencing reveals tissue architecture in esophageal squamous cell carcinoma
2022-Oct, EBioMedicine
IF:9.7Q1
DOI:10.1016/j.ebiom.2022.104281
PMID:36162205
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研究论文 | 本研究通过整合基于微阵列的空间转录组学和单细胞RNA测序技术，揭示了食管鳞状细胞癌中的组织结构 | 首次通过多模态交叉分析整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据，精确注释了肿瘤和间质区域的细胞组成 | 研究样本仅来自三位食管鳞状细胞癌患者，可能限制了结果的普遍性 | 揭示食管鳞状细胞癌肿瘤微环境中不同细胞亚群的空间景观及其潜在的细胞间交流 | 食管鳞状细胞癌的肿瘤微环境 | 数字病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序, 微阵列空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 三位食管鳞状细胞癌患者的组织样本 |
| 20073 | 2024-08-08 |
Unique Cell Subpopulations and Disease Progression Markers in Canines with Atopic Dermatitis
2022-10-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2200304
PMID:36165204
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学技术，在犬类特应性皮炎模型中探索健康皮肤与特应性皮炎皮肤之间的分子和细胞差异 | 首次在犬类特应性皮炎模型中发现γδ T细胞的富集，以及特应性皮炎中显著的-阳性成纤维细胞亚群，这些可能与皮肤炎症有关 | NA | 揭示特应性皮炎在分子和细胞层面的差异，并寻找可能的疾病进展标志物 | 犬类特应性皮炎的皮肤细胞 | 数字病理学 | 特应性皮炎 | 单细胞转录组学 | NA | 转录组 | NA |
| 20074 | 2024-08-08 |
Loss of apelin blocks the emergence of sprouting angiogenesis in experimental tumors
2022-10, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202200616RR
PMID:36165236
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研究论文 | 研究探讨了apelin在肿瘤生长和血管生成中的作用，特别是在VEGF信号抑制后的影响 | 发现apelin的缺失可以延缓肿瘤生长并减少血管密度，为抗血管生成治疗提供了新的潜在靶点 | NA | 识别VEGF途径抑制后的替代促血管生成途径，以开发更有效的抗血管生成疗法 | apelin在肿瘤生长和血管生成中的作用 | 肿瘤学 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 小鼠模型中的Lewis肺腺癌1和B16F10黑色素瘤 |
| 20075 | 2024-08-08 |
Recent developments in application of single-cell RNA sequencing in the tumour immune microenvironment and cancer therapy
2022-09-26, Military Medical Research
IF:16.7Q1
DOI:10.1186/s40779-022-00414-y
PMID:36154923
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序（scRNA-seq）在肿瘤免疫微环境（TIME）及其在癌症治疗中应用的最新进展 | 介绍了scRNA-seq在TIME中发现的新的细胞类型和细胞簇，如癌症相关成纤维细胞（CAFs）、T细胞、肿瘤相关巨噬细胞（TAMs）和树突状细胞（DCs），并提出了基于TIME细胞相互作用的潜在治疗干预措施 | NA | 探讨scRNA-seq在肿瘤免疫微环境和癌症治疗中的应用 | 肿瘤免疫微环境（TIME）中的细胞类型和相互作用 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | NA |
| 20076 | 2024-08-08 |
TIGIT is the central player in T-cell suppression associated with CAR T-cell relapse in mantle cell lymphoma
2022-09-26, Molecular cancer
IF:27.7Q1
DOI:10.1186/s12943-022-01655-0
PMID:36163179
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和多重细胞因子分析，探讨了在套细胞淋巴瘤（MCL）中使用brexucabtagene autoleucel（BA）的CAR T细胞疗法后复发的机制，发现TIGIT在T细胞抑制和BA复发中起核心作用。 | 首次揭示了TIGIT在套细胞淋巴瘤中CAR T细胞疗法后复发中的关键作用，并指出肿瘤细胞获得TIGIT表达是MCL特有的现象，未在其他CAR T治疗的疾病中报道。 | 研究样本量相对较小，且仅限于特定类型的淋巴瘤，可能限制了结果的普遍性。 | 探究CAR T细胞疗法在套细胞淋巴瘤中复发的机制，并寻找可能的治疗靶点。 | 套细胞淋巴瘤患者在接受brexucabtagene autoleucel（BA）CAR T细胞疗法后的复发机制。 | 免疫学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序，多重细胞因子分析 | NA | RNA序列，细胞因子 | 39个纵向收集的样本来自15名患者，80个连续样本来自20名患者 |
| 20077 | 2024-08-08 |
A single-cell transcriptomic atlas of the human ciliary body
2022-Sep-26, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04559-w
PMID:36163311
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术构建了人类睫状体的细胞和分子组分综合图谱，并分析了其相互作用 | 首次揭示了人类睫状体的单细胞分子分类，并发现了可能参与青光眼和葡萄膜炎发病机制的细胞间相互作用 | 研究样本仅来自3名人类捐赠者，可能存在样本量不足的问题 | 研究人类睫状体的细胞和分子组成及其在生理和病理条件下的功能 | 人类睫状体的细胞类型和基因表达模式 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 转录组数据 | 14,563个睫状体细胞来自3名人类捐赠者 |
| 20078 | 2024-08-08 |
Microenvironment components and spatially resolved single-cell transcriptome atlas of breast cancer metastatic axillary lymph nodes
2022-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2022131
PMID:36148946
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序（scRNA-seq）和空间转录组学，探讨了乳腺癌转移性腋窝淋巴结的转录组特征及其空间组织 | 首次在腋窝淋巴结肿瘤微环境中整合scRNA-seq和空间转录组学，提供了深入研究乳腺癌淋巴结转移的系统方法 | NA | 探讨乳腺癌细胞对淋巴结微环境成分和空间转录组图谱的影响 | 乳腺癌转移性腋窝淋巴结的转录组特征及其空间组织 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组学 | NA | 转录组数据 | 六个手术切除的淋巴结样本及一个阳性淋巴结 |
| 20079 | 2024-08-08 |
Single-cell analysis reveals that cancer-associated fibroblasts stimulate oral squamous cell carcinoma invasion via the TGF-β/Smad pathway
2022-Sep-25, Acta biochimica et biophysica Sinica
IF:3.3Q1
DOI:10.3724/abbs.2022132
PMID:36148955
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研究论文 | 本文通过单细胞分析揭示了癌症相关成纤维细胞（CAFs）通过TGF-β/Smad途径促进口腔鳞状细胞癌（OSCC）侵袭的机制 | 首次发现CAFs是TGF-β1的主要来源，并通过TGF-β1/Smad途径促进OSCC侵袭 | 研究仅限于14个OSCC肿瘤样本，可能无法完全代表所有OSCC病例 | 探讨CAFs与口腔鳞状细胞癌侵袭之间的关系及其分子机制 | 口腔鳞状细胞癌（OSCC）及其微环境中的癌症相关成纤维细胞（CAFs） | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA | 14个OSCC肿瘤样本 |
| 20080 | 2024-08-08 |
Correction to: Integrating spatial transcriptomics with single-cell transcriptomics reveals a spatiotemporal gene landscape of the human developing kidney
2022-Sep-25, Cell & bioscience
DOI:10.1186/s13578-022-00878-4
PMID:36155632
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |