单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27536 篇文献，本页显示第 20041 - 20060 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 20041 | 2024-08-08 |
Corrigendum: The role of NR4A1 in the pathophysiology of osteosarcoma: A comprehensive bioinformatics analysis of the single-cell RNA sequencing dataset
2022, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2022.1027056
PMID:36176386
|
correction | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 20042 | 2024-08-08 |
Single-cell sequencing of brain tissues reveal the central nervous system's susceptibility to SARS-CoV-2 and the drug
2022, Frontiers in pharmacology
IF:4.4Q1
DOI:10.3389/fphar.2022.971017
PMID:36176453
|
研究论文 | 本研究利用单细胞转录组分析大脑组织，探讨了SARS-CoV-2感染对人类中枢神经系统的脆弱性，并预测了药物(-)-儿茶素对神经系统的影响。 | 首次通过单细胞测序技术揭示了SARS-CoV-2入侵大脑的机制，并发现了(-)-儿茶素可能减轻COVID-19对神经系统的影响。 | NA | 探讨SARS-CoV-2对中枢神经系统的感染机制及可能的治疗药物。 | 人类大脑组织及SARS-CoV-2病毒。 | 数字病理学 | COVID-19 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 涉及不同年龄段的大鼠及人类大脑组织样本。 |
| 20043 | 2024-08-08 |
M2-like tumor-associated macrophage-related biomarkers to construct a novel prognostic signature, reveal the immune landscape, and screen drugs in hepatocellular carcinoma
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.994019
PMID:36177006
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研究论文 | 本研究通过综合分析单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序数据，鉴定与M2样肿瘤相关巨噬细胞（M2-like TAMs）相关的生物标志物，构建新的预后标志物，揭示肝细胞癌（HCC）的免疫景观，并筛选潜在的治疗药物。 | 本研究通过综合分析scRNA-seq和批量RNA-seq数据，首次构建了基于M2样TAM相关基因的预后标志物，并揭示了HCC的免疫景观。 | NA | 旨在通过综合分析scRNA-seq和批量RNA-seq数据，鉴定与M2样TAM相关的生物标志物，构建新的预后标志物，揭示HCC的免疫景观，并筛选潜在的治疗药物。 | M2样肿瘤相关巨噬细胞（M2-like TAMs）相关的生物标志物及其在肝细胞癌（HCC）中的作用。 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）和批量RNA测序 | 加权基因共表达网络分析（WGCNA） | RNA-seq数据 | 127个M2样TAM相关基因 |
| 20044 | 2024-08-08 |
Single-cell RNA-seq uncovered hemocyte functional subtypes and their differentiational characteristics and connectivity with morphological subpopulations in Litopenaeus vannamei
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.980021
PMID:36177045
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术，结合RNA-FISH和流式细胞分选技术，揭示了南美白对虾血细胞的功能亚型及其分化特征和与形态亚群的联系 | 首次通过单细胞RNA测序技术详细定义了南美白对虾血细胞的功能亚型，并揭示了其潜在的分化轨迹和与形态亚群的对应关系 | NA | 旨在揭示南美白对虾血细胞的多样性，并为血细胞分类提供新的理论依据 | 南美白对虾的血细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | NA |
| 20045 | 2024-08-08 |
Astrocyte development in the cerebral cortex: Complexity of their origin, genesis, and maturation
2022, Frontiers in neuroscience
IF:3.2Q2
DOI:10.3389/fnins.2022.916055
PMID:36177355
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研究论文 | 本文综述了大脑皮层中星形胶质细胞的起源、生成和成熟过程，以及这些过程中的关键调控因素 | 利用大量和单细胞转录组学技术，逐步解开星形胶质细胞多样性的秘密，并更好地理解其复杂性 | 尽管取得了进展，但星形胶质细胞多样性的起源仍未完全解决，且缺乏针对每个星形胶质细胞亚型的特定标记 | 深入理解大脑皮层中星形胶质细胞的多样性及其发展机制 | 星形胶质细胞的起源、生成和成熟过程及其在大脑皮层中的多样性 | NA | NA | 单细胞转录组学 | NA | 转录组数据 | 未具体说明样本数量 |
| 20046 | 2024-08-08 |
Preparation of Single Pineal Cells
2022, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2593-4_13
PMID:36180682
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研究论文 | 本文描述了一种从松果体中分离单个细胞的简单程序 | 介绍了单细胞RNA测序技术在松果体细胞生理学研究中的应用 | NA | 理解松果体中分化、代谢和细胞间通讯等复杂过程 | 松果体中的单个细胞 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 少量松果体组织 |
| 20047 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome profiling of the human endometrium of patients with recurrent implantation failure
2022, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.74053
PMID:36185612
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研究论文 | 本研究使用单细胞RNA测序技术，对反复植入失败（RIF）患者和健康对照组的人类子宫内膜细胞在植入窗口期（WOI）的转录组进行了详细分析 | 首次提供了健康和RIF子宫内膜在WOI时期的详细分子和细胞图谱，并发现了RIF患者子宫内膜细胞中与接受性相关的基因表达显著差异 | 样本量较小，可能影响研究结果的普遍性和可靠性 | 深入了解RIF患者子宫内膜微环境紊乱，以改善不明原因RIF的病因诊断和治疗 | 反复植入失败患者和健康对照组的子宫内膜细胞 | 数字病理学 | 生殖系统疾病 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 转录组数据 | RIF患者6例，健康对照组3例 |
| 20048 | 2024-08-08 |
Single-Cell Analyses of Heterotopic Ossification: Characteristics of Injury-Related Senescent Fibroblasts
2022, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S369376
PMID:36185637
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研究论文 | 研究利用单细胞RNA测序技术分析异位骨化样本中与损伤相关的衰老成纤维细胞的特征 | 首次研究损伤相关细胞衰老在异位骨化中的作用，并发现损伤相关衰老与年龄相关衰老在SASP表型上存在显著差异 | 研究仅限于特定时间点的样本分析，未涵盖更广泛的时间范围和样本类型 | 探讨损伤相关细胞衰老在异位骨化中的作用及其分子机制 | 异位骨化样本中的衰老成纤维细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | 特定时间点的异位骨化样本 |
| 20049 | 2024-08-08 |
Identification of differentially expressed genes at the single-cell level and prognosis prediction through bulk RNA sequencing data in breast cancer
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.979829
PMID:36186437
|
研究论文 | 本研究通过单细胞水平分析和批量RNA测序数据，识别乳腺癌中正常细胞与肿瘤细胞之间的差异表达基因，并构建预后标志物 | 利用单细胞技术识别细胞类型特异性差异表达基因，并结合批量RNA测序数据构建预后标志物，有效区分患者风险组 | NA | 探讨单细胞水平上正常细胞与肿瘤细胞的差异表达基因，并探索这些基因在乳腺癌中的临床应用 | 乳腺癌中的正常细胞与肿瘤细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 23,909个正常乳腺细胞和33,138个乳腺癌肿瘤细胞 |
| 20050 | 2024-08-08 |
Single-cell transcriptome sequencing reveals potential novel combination of biomarkers for antibody-based cancer therapeutics in hepatocellular carcinoma
2022, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2022.928256
PMID:36186483
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研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析了人肝细胞癌（HCC）的肿瘤异质性，并鉴定出一种新的三基因标志物组合，可能作为基于抗体的癌症治疗的新型生物标志物。 | 本研究通过单细胞RNA测序技术揭示了肝细胞癌中潜在的新型生物标志物组合，为基于抗体的癌症治疗提供了新的靶点。 | 研究主要集中在肝细胞癌的肿瘤细胞表面抗原的鉴定，未涉及其他类型的癌症或更广泛的治疗应用。 | 本研究旨在通过单细胞RNA测序技术揭示肝细胞癌中的肿瘤异质性，并寻找新的生物标志物以促进基于抗体的癌症治疗。 | 研究对象包括肝细胞癌的肿瘤组织、癌旁组织和远端正常肝组织中的单细胞。 | 数字病理学 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 研究涉及28个细胞集群，并在多个独立患者队列中进行了验证。 |
| 20051 | 2024-08-08 |
Identification of key monocytes/macrophages related gene set of the early-stage abdominal aortic aneurysm by integrated bioinformatics analysis and experimental validation
2022, Frontiers in cardiovascular medicine
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fcvm.2022.950961
PMID:36186997
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研究论文 | 本研究通过综合生物信息学分析和实验验证，识别了早期腹主动脉瘤中与单核细胞/巨噬细胞相关的关键基因集。 | 本研究首次通过scRNA-seq数据和WGCNA分析，识别了与早期腹主动脉瘤相关的单核细胞/巨噬细胞基因模块，并构建了基于这些基因集的逻辑回归诊断模型。 | 本研究主要基于生物信息学分析和有限的实验验证，未来需要更多的临床样本和实验来进一步验证这些发现。 | 探讨早期腹主动脉瘤中免疫细胞浸润的分子机制，并寻找有效的腹主动脉瘤标志物。 | 早期腹主动脉瘤中的单核细胞/巨噬细胞及其相关基因集。 | 数字病理学 | 腹主动脉瘤 | scRNA-seq, WGCNA, Limma-Voom, RT-qPCR, ELISA | 逻辑回归模型 | mRNA表达数据, scRNA-seq数据 | 多个早期腹主动脉瘤模型数据集，以及人类腹主动脉瘤和健康捐赠者的样本 |
| 20052 | 2024-08-08 |
Identification of Monocyte-Associated Genes Related to the Instability of Atherosclerosis Plaque
2022, Oxidative medicine and cellular longevity
DOI:10.1155/2022/3972272
PMID:36187340
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研究论文 | 本研究通过全基因组测序和单细胞测序数据分析，识别与动脉粥样硬化斑块不稳定性相关的单核细胞关联基因 | 本研究首次识别了239个与单核细胞相关的基因，并通过WGCNA分析确定了与不稳定斑块高度相关的模块基因 | NA | 识别与动脉粥样硬化斑块不稳定性相关的单核细胞关联基因，并探讨其潜在的生物学机制 | 动脉粥样硬化斑块不稳定性相关的单核细胞关联基因 | 心血管疾病 | 心血管疾病 | 全基因组测序，单细胞测序 | WGCNA | 基因表达数据 | 来自GSE159677, GSE41571, GSE120521, 和 GSE118481的数据 |
| 20053 | 2024-08-08 |
Association of glioma CD44 expression with glial dynamics in the tumour microenvironment and patient prognosis
2022, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2022.09.003
PMID:36187921
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研究论文 | 本文研究了胶质瘤CD44表达与肿瘤微环境中胶质细胞动态变化及患者预后的关联 | 首次揭示了星形胶质细胞通过上调CD44表达增强胶质瘤细胞活性和迁移能力，并通过骨桥蛋白-CD44信号促进M1巨噬细胞的招募，从而可能促进胶质瘤干细胞特性 | NA | 探索胶质瘤微环境中免疫和基质成分的动态调节及其与患者预后的关系 | 胶质瘤细胞、星形胶质细胞、M1巨噬细胞及肿瘤微环境 | 数字病理学 | 脑瘤 | RT-qPCR、细胞活力和伤口愈合实验、CIBERSORT分析、单细胞测序 | NA | 基因组数据 | 使用The Cancer Genome Atlas数据库和中国胶质瘤基因组图谱数据库的数据 |
| 20054 | 2024-08-08 |
A combined analysis of bulk and single-cell sequencing data reveals that depleted extracellular matrix and enhanced immune processes co-contribute to fluorouracil beneficial responses in gastric cancer
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.999551
PMID:36189263
|
研究论文 | 本研究通过结合TCGA数据库的批量测序数据和GEO数据库的单细胞RNA测序数据，探讨了肿瘤微环境特征与胃癌患者氟尿嘧啶反应之间的关系 | 首次揭示了胃癌肿瘤微环境与氟尿嘧啶耐药性的关系，并提供了潜在的治疗靶点和预测原理 | NA | 探讨肿瘤微环境特征与胃癌患者氟尿嘧啶反应之间的关系 | 胃癌患者的肿瘤微环境特征及氟尿嘧啶反应 | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 测序数据 | 涉及TCGA数据库和GEO数据库的数据，具体样本数量未详细说明 |
| 20055 | 2024-08-08 |
T cell receptor repertoire analysis in HTLV-1-associated diseases
2022, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2022.984274
PMID:36189294
|
综述 | 本文综述了在HTLV-1相关疾病中T细胞受体（TCR）谱的研究现状，并讨论了TCR克隆扩展对HTLV-1相关疾病进程和治疗的影响 | 利用单细胞RNA测序等突破性技术提高了T细胞克隆的特异性，并加深了对病毒感染、癌症及关联治疗中TCR特征的理解 | 从无症状携带者到疾病状态的转变因素仍不完全清楚 | 识别和追踪可用于监测从初次感染到免疫功能障碍和疾病进展的HTLV-1特异性T细胞生物标志物 | HTLV-1相关疾病中的T细胞受体（TCR）谱 | NA | 白血病/淋巴瘤、神经炎症性疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 序列数据 | 涉及HTLV-1感染的CD4 T细胞和HTLV-1特异性CD8 T细胞 |
| 20056 | 2024-08-08 |
Development and validation of a gene model predicting lymph node metastasis and prognosis of oral squamous cell carcinoma based on single-cell and bulk RNA-seq analysis
2023-May, Journal of oral pathology & medicine : official publication of the International Association of Oral Pathologists and the American Academy of Oral Pathology
IF:2.7Q2
DOI:10.1111/jop.13360
PMID:36153671
|
研究论文 | 本研究基于单细胞和批量RNA测序分析，开发并验证了一种预测口腔鳞状细胞癌淋巴结转移和预后的基因模型 | 本研究发现了60个与口腔鳞状细胞癌淋巴结转移相关的基因，并构建了一个五基因风险模型，以改善淋巴结转移的预测和临床结果 | NA | 研究口腔鳞状细胞癌中淋巴结转移的遗传和细胞差异，并开发预测模型 | 口腔鳞状细胞癌患者的淋巴结转移和预后 | 数字病理学 | 口腔鳞状细胞癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | 五基因风险模型 | RNA测序数据 | 来自癌症基因组图谱和基因表达综合数据库的单细胞RNA测序和批量基因表达数据 |
| 20057 | 2024-08-08 |
Early Wnt Signaling Activation Promotes Inner Ear Differentiation via Cell Caudalization in Mouse Stem Cell-Derived Organoids
2023-01-30, Stem cells (Dayton, Ohio)
DOI:10.1093/stmcls/sxac071
PMID:36153788
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研究论文 | 本研究利用干细胞衍生的类器官探讨Wnt信号在早期前感觉外胚层（PPE）分化中的作用 | 发现调节Wnt信号显著提高了内耳类器官诱导的效率和可重复性，并揭示了Wnt信号通路在PPE区域化中的作用 | NA | 探究Wnt信号在内耳发育中的分子动态机制 | 小鼠干细胞衍生的类器官 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | RNA序列 | NA |
| 20058 | 2024-08-08 |
Methods for Isolation of Tumor-Associated Endothelial Cells for Surface Protein Analysis and Sorting by Flowcytometry
2023, Methods in molecular biology (Clifton, N.J.)
DOI:10.1007/978-1-0716-2703-7_3
PMID:36161406
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研究论文 | 本文介绍了一种基于流式细胞术的方法，用于分析肿瘤微环境中内皮细胞表面多种蛋白质并同时进行活细胞分选 | 本文提出了一种新的流式细胞术方法，能够同时分析和分选肿瘤微环境中占比小于0.5%的内皮细胞 | NA | 开发一种新的方法来分析和分选肿瘤微环境中的内皮细胞 | 肿瘤微环境中的内皮细胞 | 数字病理学 | NA | 流式细胞术 | NA | 细胞 | NA |
| 20059 | 2024-08-08 |
Influenza vaccination features revealed by a single-cell transcriptome atlas
2023-01, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.28174
PMID:36163452
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研究论文 | 本文报道了接种灭活流感疫苗后个体外周血单个核细胞的单细胞转录组图谱 | 首次在单细胞分辨率下揭示了流感疫苗接种的免疫学特征 | 未观察到流感疫苗接种后个体中促炎反应基因和关键血栓相关基因的显著上调 | 研究流感疫苗接种后的免疫反应机制 | 接种灭活流感疫苗的个体及其外周血单个核细胞 | NA | NA | 单细胞转录组 | NA | 转录组数据 | 多个接种流感疫苗的个体 |
| 20060 | 2024-08-08 |
Colorectal cancer organoid models uncover oxaliplatin-resistant mechanisms at single cell resolution
2022-Dec, Cellular oncology (Dordrecht)
DOI:10.1007/s13402-022-00705-5
PMID:36136268
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研究论文 | 本文通过建立结直肠癌患者来源的类器官模型，研究了奥沙利铂耐药的机制 | 首次使用单细胞RNA测序技术解析了奥沙利铂耐药的细胞群体及相关信号通路 | NA | 研究结直肠癌中奥沙利铂耐药的机制 | 结直肠癌患者来源的类器官 | 数字病理学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA | 两株患者来源的类器官 |