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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1301 | 2026-03-19 |
Deciphering transcriptional plasticity in pancreatic ductal adenocarcinoma reveals alterations in sensory neuron innervation
2026-Mar-18, Molecular oncology
IF:5.0Q1
DOI:10.1002/1878-0261.70233
PMID:41847880
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序分析了胰腺和胰腺导管腺癌(PDAC)中的感觉神经元转录组,揭示了肿瘤相关神经重塑的分子机制 | 首次在PDAC小鼠模型中鉴定出感觉神经元内存在肿瘤来源的RNA,提示了细胞外囊泡介导的RNA转移新机制 | 研究基于小鼠模型,结果在人类PDAC中的适用性需进一步验证 | 探究胰腺导管腺癌中感觉神经元转录组的变化及其在肿瘤进展中的作用 | 野生型和PDAC小鼠模型中的胰腺感觉神经元 | 单细胞转录组学 | 胰腺导管腺癌 | 单细胞RNA测序、免疫荧光、类器官培养、qPCR | NA | 单细胞转录组数据 | 野生型和PDAC小鼠的背根神经节感觉神经元 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1302 | 2026-03-19 |
Tumor Necrosis Factor Receptor-Associated Factor 1 Inhibits Macrophage Killing of Sporothrix schenckii by Enhancing Expression and Activity of Inducible Nitric Oxide Synthase
2026-Mar-17, The Journal of infectious diseases
IF:5.0Q1
DOI:10.1093/infdis/jiaf646
PMID:41428466
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和实验模型,揭示了TRAF1通过稳定NOS2表达抑制巨噬细胞杀伤申克孢子丝菌的机制,并探讨了局部热疗的治疗作用 | 首次发现TRAF1通过结合NOS2抑制其泛素化降解,从而延迟孢子丝菌病愈合,并阐明热疗通过下调TRAF1和NOS2表达发挥治疗作用 | 机制研究主要在体外和动物模型中进行,临床转化需进一步验证 | 探究TRAF1和NOS2在孢子丝菌病免疫逃逸中的作用及热疗的治疗机制 | 申克孢子丝菌感染的巨噬细胞及孢子丝菌病病变组织 | NA | 孢子丝菌病 | 单细胞RNA测序, 免疫共沉淀, 泛素化分析, 定点突变 | NA | 单细胞RNA测序数据, 实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1303 | 2026-03-19 |
Maternal opioid use and hepatitis C infection disrupt the placental immune landscape and structure
2026-Mar-17, JCI insight
IF:6.3Q1
DOI:10.1172/jci.insight.199606
PMID:41842943
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研究论文 | 本研究探讨了母体阿片类药物使用障碍(OUD)和丙型肝炎病毒(HCV)感染对胎盘免疫景观和结构的破坏作用 | 首次结合流式细胞术、组织学、空间转录组学和单细胞转录组学,系统揭示OUD对胎盘组织的多层面影响,并基于母体HCV状态进行分层分析 | 研究样本量未明确说明,且未详细讨论OUD与HCV感染的独立或交互效应 | 探究母体OUD和HCV感染如何影响胎盘结构和免疫功能 | 胎盘组织 | 数字病理学 | 丙型肝炎 | 流式细胞术、组织学、空间转录组学、单细胞转录组学 | CellChat分析 | 图像、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞转录组学 | NA | NA |
| 1304 | 2026-03-19 |
A Novel Low-Dimensional Sparse and Low-Rank Representation Method for Single-Cell RNA Sequencing Data Clustering
2026-Mar-17, IEEE transactions on computational biology and bioinformatics
DOI:10.1109/TCBBIO.2026.3674992
PMID:41843533
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研究论文 | 本文提出了一种名为LDSLRR的新型低维稀疏低秩表示方法,用于单细胞RNA测序数据的聚类分析 | 将降维、自表示矩阵构建和聚类过程集成到一个端到端模型中,通过同时优化这三个模块来提高聚类准确性 | NA | 解决单细胞RNA测序数据因高维度和稀疏性带来的聚类挑战,以实现更精确的细胞聚类 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | LDSLRR(低维稀疏低秩表示模型),结合图正则化非负矩阵分解 | 基因表达矩阵 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1305 | 2026-03-19 |
DUSP6 ablation restores CAR T-cell fitness impaired by tumor CD58 loss through invigoration of AP-1 signaling
2026-Mar-17, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-026-02597-5
PMID:41844571
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤CD58缺失通过减弱AP-1信号导致CAR-T细胞功能障碍,并发现阻断DUSP6可恢复CAR-T细胞的适应性 | 重新定位CD58不仅是免疫突触成分,更是CAR-T细胞生物学中的代谢检查点,并确定DUSP6阻断是增强CAR-T细胞效力的新工程靶点 | 未明确说明 | 探究肿瘤CD58缺失导致CAR-T细胞功能障碍的机制,并寻找恢复CAR-T细胞适应性的治疗策略 | CAR-T细胞 | 肿瘤免疫治疗 | 癌症 | CRISPR/Cas9筛选、单细胞RNA-seq、转录组分析 | NA | 转录组数据 | 未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1306 | 2026-03-19 |
Spatial transcriptomics uncovers vasculature-centered cellular interactions driving Japanese encephalitis progression in a mouse model
2026-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70047-5
PMID:41844605
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研究论文 | 本研究利用空间转录组学技术,在小鼠模型中揭示了以血管为中心的细胞互作驱动日本脑炎进展的机制 | 首次结合Stereo-seq技术同时原位捕获宿主和病毒转录组,构建了日本脑炎发病机制的时空图谱,并明确了Ly6c2单核细胞作为主要病毒载体和IFN-γ来源的关键作用 | 研究仅使用雌性BALB/c小鼠模型,未涉及其他物种或性别差异;结论主要基于小鼠模型,人类病理机制可能有所不同 | 阐明神经侵袭性病毒(特别是日本脑炎病毒)引起神经病理的细胞互作机制 | 日本脑炎病毒感染的雌性BALB/c小鼠脑组织 | 空间转录组学 | 日本脑炎 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 日本脑炎病毒感染的雌性BALB/c小鼠脑组织样本 | 华大智造 | 空间转录组学 | Stereo-seq | Stereo-seq空间转录组技术,可同时原位捕获宿主和病毒转录组 |
| 1307 | 2026-03-19 |
A blueprint for local and distal invasion programs in glioblastoma
2026-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70470-8
PMID:41844611
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研究论文 | 本研究结合单细胞RNA测序、空间转录组学和多路成像技术,探索胶质母细胞瘤的局部和远端侵袭程序 | 通过整合单细胞RNA测序、空间转录组学和多路成像,首次解耦了胶质母细胞瘤侵袭潜力与侵袭过程相关的转录特征,并揭示了不同细胞状态与侵袭路径的关联 | 研究基于异种移植模型,可能不完全反映人类胶质母细胞瘤的复杂性;样本量有限(20个患者来源模型) | 研究胶质母细胞瘤的侵袭机制,区分局部和远端侵袭的转录程序 | 胶质母细胞瘤患者来源的胶质瘤球模型和异种移植小鼠模型 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多路成像 | NA | 转录组数据, 空间成像数据 | 20个患者来源的胶质瘤球模型 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1308 | 2026-03-19 |
Multimodal imaging reveals a lysosomal drug reservoir that drives heterogeneous distribution of PARP inhibitors
2026-Mar-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-70558-1
PMID:41844641
|
研究论文 | 本研究通过多模态成像揭示,PARP抑制剂在卵巢癌肿瘤中分布不均,其异质性积累与溶酶体药物储存相关,影响药物疗效 | 首次利用患者来源外植体多模态成像管道,在单细胞水平上展示PARP抑制剂(如rucaparib)的异质性积累,并发现溶酶体作为药物储存库驱动这种分布差异 | 研究主要聚焦于高分级浆液性卵巢癌,未广泛验证其他肿瘤类型;且仅针对特定PARP抑制剂(如rucaparib和niraparib),对olaparib的影响机制未明确 | 探究肿瘤异质性如何影响PARP抑制剂的细胞内分布和疗效,以克服临床耐药问题 | 高分级浆液性卵巢癌患者来源的肿瘤外植体及PARP抑制剂药物 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 多模态成像、空间转录组学 | NA | 图像、转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1309 | 2026-03-19 |
A differential single-cell transcriptome atlas of left-sided and right-sided colorectal cancer
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04789-5
PMID:41844817
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1310 | 2026-03-19 |
Human umbilical cord mesenchymal stromal cells therapy for neuromyelitis optica spectrum disorder: a phase 1/2a trial
2026-Mar-17, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-026-01720-x
PMID:41844898
|
研究论文 | 本研究评估了人脐带间充质干细胞治疗视神经脊髓炎谱系疾病的安全性和有效性 | 首次在临床试验中系统评估hUC-MSCs对NMOSD的疗效,并探索了其通过硫氧还蛋白和氧化磷酸化途径增强Treg细胞功能的潜在机制 | 单臂、开放标签设计,样本量较小(31例),缺乏对照组,随访时间有限(15个月) | 评估hUC-MSCs减少NMOSD复发和改善神经功能障碍的安全性与疗效 | 31名NMOSD患者 | NA | 视神经脊髓炎谱系疾病 | 单细胞RNA测序,代谢组学检测 | NA | 临床数据,MRI影像,单细胞RNA测序数据,代谢组学数据 | 31例NMOSD患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1311 | 2026-03-19 |
CellVoyager: AI CompBio agent generates new insights by autonomously analyzing biological data
2026-Mar-17, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-026-03029-6
PMID:41845065
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研究论文 | 介绍了一种基于大语言模型的AI代理CellVoyager,用于自主生成和执行单细胞RNA测序分析 | CellVoyager在Jupyter笔记本环境中自主执行scRNA-seq分析,在预测已发表研究中的分析方法上优于GPT-4o和o3-mini,并能生成专家认可的新发现 | 仅评估于CellBench基准的76项研究,可能未涵盖所有scRNA-seq分析场景 | 开发自主AI代理以加速计算生物学并发现新见解 | 单细胞RNA测序数据 | 计算生物学 | COVID-19 | scRNA-seq | 大语言模型 | 单细胞RNA测序数据 | 76项已发表scRNA-seq研究 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1312 | 2026-03-19 |
Identification of TRPM4 related genes in LUAD by RNA seq and spatial transcriptomics
2026-Mar-17, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-04797-5
PMID:41845138
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1313 | 2026-03-19 |
Single-cell transcriptome analysis reveals DNMT1+ epithelial cells promote lymphatic metastasis via CXCL17-mediated TAM infiltration
2026-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08032-1
PMID:41845371
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1314 | 2026-03-19 |
Dissecting the immunosuppressive microenvironment of LAMA3 + malignant cells and SPP1 + macrophages in esophageal squamous cell carcinoma using single-cell and spatial transcriptomics
2026-Mar-17, Journal of translational medicine
IF:6.1Q1
DOI:10.1186/s12967-026-08004-5
PMID:41845425
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 1315 | 2026-03-19 |
Indirubin and Retinoic Acid Show Binding Affinity to Monocyte Biomarker CSF3R in Parkinson's Disease
2026-Mar-17, Journal of clinical laboratory analysis
IF:2.6Q2
DOI:10.1002/jcla.70197
PMID:41845882
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞测序和多组学数据分析,识别了帕金森病外周血中与单核细胞相关的生物标志物CSF3R和IFITM3,并预测了其潜在靶向药物 | 首次结合单细胞测序与hdWGCNA方法,在帕金森病外周血中鉴定出与单核细胞密切相关的生物标志物,并预测了靶向药物结合潜力 | 研究基于公共数据库的回顾性数据,缺乏实验验证,样本来源和规模可能有限 | 阐明帕金森病中单核细胞相关的关键分子改变,以识别新型生物标志物和潜在治疗靶点 | 帕金森病患者的外周血单细胞数据及芯片数据集 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA-seq, 芯片数据分析, 分子对接模拟 | Seurat, CellChat, hdWGCNA, Limma, AutoDocktools | 单细胞测序数据, 基因表达芯片数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1316 | 2026-03-19 |
The importance of long-lived IgE plasma cells for protracted allergies
2026-Mar-17, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2026.01.006
PMID:41846175
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评论 | 本文讨论了长寿命IgE浆细胞在持久性过敏中的作用,基于遗传命运图谱和单细胞测序技术的新发现 | 通过遗传命运图谱和单细胞测序揭示了两种细胞群体(长寿命IgE浆细胞和'2型'记忆B细胞)维持IgE的新机制 | NA | 探讨长寿命IgE浆细胞对持久性过敏的重要性 | IgE浆细胞和'2型'记忆B细胞 | NA | 过敏性疾病 | 遗传命运图谱, 单细胞测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1317 | 2026-03-19 |
Cathepsin B promotes asthma potentially via macrophage-associated autophagy and apoptosis
2026-Mar-17, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.1093/jimmun/vkag020
PMID:41847863
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研究论文 | 本研究整合遗传学、转录组学和实验方法,揭示了组织蛋白酶B(CTSB)通过巨噬细胞相关的自噬和凋亡途径促进哮喘发病的机制 | 首次通过孟德尔随机化分析证实循环CTSB水平升高与哮喘风险存在因果关系,并利用单细胞RNA测序技术将CTSB表达定位到巨噬细胞,阐明了其通过调控自噬和凋亡影响哮喘的分子机制 | 研究主要基于小鼠模型和体外数据,在人类中的直接验证尚不充分;CTSB抑制剂的选择性及其在临床治疗中的安全性和有效性仍需进一步评估 | 探究组织蛋白酶B(CTSB)是否以及如何参与哮喘的发病机制 | 哮喘患者(人类数据)和C57BL/6小鼠卵清蛋白诱导的哮喘模型 | NA | 哮喘 | 孟德尔随机化分析、全基因组关联研究(GWAS)、RNA测序(RNA-seq)、单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 遗传数据、转录组数据、实验数据 | 大规模GWAS数据、哮喘患者RNA-seq数据、scRNA-seq数据集、C57BL/6小鼠模型 | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 1318 | 2026-03-19 |
Representation learning of single-cell RNA-seq data
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080889.125
PMID:41506911
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序数据的表示学习方法,包括因子模型、自编码器、对比学习和基于Transformer的基础模型,并提供了分类和挑战分析 | 将多种scRNA-seq表示学习方法统一到表示学习范式下,提供概念分类和基准测试讨论 | 作为综述,未提出新方法,主要基于现有文献总结 | 综述单细胞RNA测序数据的表示学习方法及其应用 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 因子模型, 自编码器, 对比学习, Transformer | 基因表达数据 | 超过1亿个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1319 | 2026-03-19 |
miRNA regulation in brain tissue space: the 3'UTR perspective
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080850.125
PMID:41672779
|
综述 | 本文综述了miRNA及其靶向3'UTR在脑组织空间中的调控作用,重点关注神经发育和神经元功能,并总结了当前空间定量方法及未来研究方向 | 首次从3'UTR角度探讨miRNA在脑组织空间中的调控,强调同时量化miRNA和3'UTR的空间表达及异构体变异的重要性,并提出未来研究策略 | 当前尚无方法能同时量化miRNA和3'UTR在空间中的表达,且3'UTR异构体的空间变异研究不足 | 探讨miRNA介导的基因调控在脑组织空间中的作用,特别是在神经发育和神经元功能中的复杂功能 | 脑组织中的miRNA和3'UTR | 自然语言处理 | NA | 空间转录组学 | NA | RNA表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1320 | 2026-03-19 |
Patient-Derived Organoids from Multiple Sites of a Single Tumor Recapitulates Intratumoral Heterogeneity in Patients with Gastric Cancer
2026-Mar-15, Gut and liver
IF:3.4Q2
DOI:10.5009/gnl250108
PMID:40910272
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研究论文 | 本研究利用单细胞转录组学分析来自单个胃癌肿瘤不同部位的PDOs,以评估其反映肿瘤内异质性的能力 | 首次通过单细胞转录组学分析来自同一肿瘤多个部位的PDOs,揭示了PDOs在基因表达上的相似性和差异性,并验证了神经内分泌肿瘤标志物的上调 | PDOs在反映肿瘤内异质性方面存在挑战,需要更全面的评估 | 评估PDOs作为临床前模型在捕捉胃癌肿瘤内异质性方面的能力 | 来自单个胃癌肿瘤不同部位的PDOs | 数字病理学 | 胃癌 | 单细胞转录组学,免疫组织化学染色 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 来自单个胃癌肿瘤多个部位的PDOs | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |