单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 11161 - 11180 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 11161 | 2025-10-07 |
Transcriptomic profiles of single-cell autophagy-related genes (ATGs) in lung diseases
2025-Feb-07, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-09990-w
PMID:39920481
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术研究自噬相关基因在肺部疾病中的转录组图谱 | 首次在单细胞水平系统揭示自噬相关基因在多种肺部疾病中的表达异质性和细胞类型特异性变化 | 研究主要关注转录组水平变化，未验证蛋白质功能；外部刺激实验仅限于细胞系模型 | 阐明自噬相关基因在肺部疾病发生发展中的作用机制 | 健康人群和肺部疾病患者的肺组织样本，包括COVID-19相关急性肺损伤、特发性肺纤维化、慢性阻塞性肺疾病、系统性硬化症和肺腺癌 | 单细胞转录组学 | 肺部疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康受试者和多种肺部疾病患者的肺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11162 | 2025-10-07 |
Integration of single-cell and bulk RNA-sequencing data to construct and validate a signature based on NK cell marker genes to predict immunotherapy response and prognosis in colorectal cancer
2025-Feb-07, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-01842-7
PMID:39920524
|
研究论文 | 基于NK细胞标记基因构建并验证了预测结直肠癌免疫治疗反应和预后的特征模型 | 首次整合单细胞和bulk RNA测序数据构建基于NK细胞标记基因的预后特征，用于预测结直肠癌免疫治疗反应 | 验证队列样本量有限（共325个样本），需要更多独立队列验证 | 构建预测结直肠癌免疫治疗反应和预后的生物标志物特征 | 结直肠癌患者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, WGCNA, LASSO回归分析 | 预后特征模型 | 基因表达数据 | 训练集587个TCGA样本，验证集两个GEO队列共325个样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 11163 | 2025-10-07 |
Mural cell dysfunction contributes to diastolic heart failure by promoting endothelial dysfunction and vessel remodelling
2025-Feb-07, Cardiovascular diabetology
IF:8.5Q1
DOI:10.1186/s12933-025-02623-w
PMID:39920783
|
研究论文 | 本研究探讨了壁细胞功能障碍通过促进内皮功能障碍和血管重塑在舒张性心力衰竭中的作用机制 | 首次探索了壁细胞在HFpEF中的作用，建立了新的糖尿病db/db小鼠高盐HFpEF模型，揭示了壁细胞通过TNFα依赖性旁分泌信号诱导内皮细胞生长停滞的新机制 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证 | 研究壁细胞功能障碍在心力衰竭伴保留射血分数发病机制中的作用 | 糖尿病db/db小鼠和PDGFRβtg/tg-CreERT2-EYFPtg/tg转基因小鼠 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, NichetNet分析, 组织学分析 | NA | 单细胞转录组数据, 组织学图像 | 转基因小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11164 | 2025-10-07 |
Decoding SFRP2 progenitors in sustaining tooth growth at single-cell resolution
2025-Feb-07, Stem cell research & therapy
IF:7.1Q1
DOI:10.1186/s13287-025-04190-z
PMID:39920788
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学揭示了SFRP2hi成纤维祖细胞在维持牙齿持续生长中的关键作用 | 首次识别出小鼠切牙和人类磨牙发育牙根中特有的Sfrp2hi成纤维祖细胞群，并阐明其通过Twist1调控Wnt信号通路维持干细胞特性的分子机制 | 将小鼠牙齿研究发现应用于人类疾病的研究仍不够充分 | 构建全面的牙髓细胞图谱，阐明人类与小鼠之间的组织相似性和物种特异性差异 | 人类和小鼠的牙髓组织 | 单细胞生物学 | 牙科疾病 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 多个单细胞数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11165 | 2025-10-07 |
Myeloma cell-derived CXCL7 facilitates proliferation of tumor cells and occurrence of osteolytic lesions through JAK/STAT3 pathway
2025-Feb-06, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07413-6
PMID:39915476
|
研究论文 | 本研究揭示了骨髓瘤细胞通过分泌CXCL7趋化因子激活JAK/STAT3通路，促进肿瘤增殖和溶骨性病变发生的分子机制 | 首次发现高表达CXCL7的骨髓瘤细胞亚群具有强增殖和破骨信号通路激活能力，并阐明CXCL7通过CXCR2-JAK/STAT3-MMP13/C-myc轴驱动溶骨性病变的新机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证仍需扩大；CXCL7作为治疗靶点的具体干预策略尚未完全明确 | 探究多发性骨髓瘤中溶骨性病变的分子机制及潜在治疗靶点 | 多发性骨髓瘤细胞、小鼠异种移植瘤模型 | 数字病理 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序、转录组分析、体内外功能验证 | 小鼠异种移植瘤模型 | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 本中心和GEO数据库的骨髓瘤样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11166 | 2025-10-07 |
Single-cell atlas of human pancreatic islet and acinar endothelial cells in health and diabetes
2025-Feb-06, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-55415-3
PMID:39915484
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序构建了人类胰腺胰岛和腺泡内皮细胞在健康与糖尿病状态下的血管图谱 | 首次开发了富集胰岛特异性内皮细胞和腺泡特异性内皮细胞的策略，并揭示了它们在健康和糖尿病状态下的独特分子特征 | 仅分析了三个人类胰腺样本，样本量有限 | 表征胰腺内血管异质性并揭示糖尿病中的血管变化 | 人类胰腺胰岛特异性内皮细胞和腺泡特异性内皮细胞 | 单细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 三个人类胰腺样本加上三个已发表的胰腺数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11167 | 2025-10-07 |
MiR-18a-LncRNA NONRATG-022419 pairs targeted PRG-1 regulates diabetic induced cognitive impairment by regulating NGF\BDNF-Trkb signaling pathway
2025-Feb-06, Proteome science
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s12953-025-00239-2
PMID:39915794
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录组分析揭示了PRG-1通过NGF/BDNF-Trkb信号通路调控糖尿病认知功能障碍的分子机制 | 首次发现miR-18a-LncRNA NONRATG-022419对靶向调控PRG-1在糖尿病认知障碍中的作用机制 | 研究主要基于体外HT22细胞模型，需要进一步在体实验验证 | 探究PRG-1在糖尿病诱导认知功能障碍中的分子机制和细胞异质性 | 海马体细胞、HT22细胞系、I型螺旋神经节神经元 | 单细胞测序分析 | 糖尿病认知功能障碍 | 单细胞RNA测序, RNA转录组分析 | NA | 单细胞RNA测序数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11168 | 2025-10-07 |
Phospho-seq: integrated, multi-modal profiling of intracellular protein dynamics in single cells
2025-Feb-04, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56590-7
PMID:39905064
|
研究论文 | 开发了一种名为Phospho-seq的集成方法，用于在单细胞水平同时分析细胞质和核蛋白及其翻译后修饰 | 提出简化的台式抗体偶联方法创建大型定制神经聚焦抗体面板，实现蛋白质与scATAC-seq的同时分析 | NA | 开发能够量化细胞内蛋白质动态并与顺式调控元件和转录靶标连接的多模态单细胞分析技术 | 细胞系、诱导多能干细胞、数月龄视网膜和脑类器官 | 单细胞多组学 | 神经发育疾病 | 单细胞ATAC-seq, 转录组测量, 抗体偶联 | NA | 蛋白质组, 表观基因组, 转录组 | NA | NA | 单细胞ATAC-seq, 多组学分析 | NA | NA |
| 11169 | 2025-10-07 |
Expression of Osteopontin in M2 and M4 Intrinsically Photosensitive Retinal Ganglion Cells in the Mouse Retina
2025-Feb-03, Investigative ophthalmology & visual science
IF:5.0Q1
DOI:10.1167/iovs.66.2.14
PMID:39908128
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和免疫组织化学方法揭示了骨桥蛋白在小鼠视网膜M2和M4型内在光敏视网膜神经节细胞中的表达模式 | 首次发现骨桥蛋白不仅表达于M4-ipRGCs，还在M2-ipRGCs中表达，挑战了骨桥蛋白仅作为αRGCs特异性标志物的传统认知 | 研究仅针对C57BL/6J小鼠视网膜，尚未在其他物种或病理条件下验证 | 表征骨桥蛋白在ipRGCs各亚型中的表达模式 | 小鼠视网膜中的内在光敏视网膜神经节细胞(ipRGCs) | 神经科学 | 视神经损伤 | 单细胞RNA测序, 免疫组织化学, 神经突追踪 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | C57BL/6J小鼠视网膜样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11170 | 2025-10-07 |
Integrative analysis of SEPN1 in glioma: Prognostic roles, functional implications, and potential therapeutic interventions
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0318501
PMID:39919065
|
研究论文 | 本研究通过整合分析揭示了SEPN1在胶质瘤中的预后价值、功能作用及潜在治疗干预 | 首次系统阐明SEPN1在胶质瘤中的致癌作用，开发了SEPN1相关风险评分(SRS)，并基于此识别潜在抗胶质瘤药物 | 研究主要基于生物信息学分析，需要进一步实验验证SEPN1的具体分子机制 | 探究SEPN1在泛癌中的表达特征和预后意义，特别聚焦于胶质瘤 | 胶质瘤患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 富集分析, 药物敏感性分析 | 风险评分模型 | 基因表达数据, 临床数据 | TCGA、CGGA、GEO和ZN-GC多个队列的胶质瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 11171 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomes of dissecting the intra-tumoral heterogeneity of breast cancer microenvironment
2024-Dec-26, Journal of cancer research and clinical oncology
IF:2.7Q3
DOI:10.1007/s00432-024-06015-7
PMID:39724260
|
研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示乳腺癌肿瘤微环境的瘤内异质性 | 首次构建包含54,055个细胞的乳腺癌单细胞转录组图谱，识别了恶性上皮细胞的六种共同表达程序和六种亚型特异性表达程序 | 样本量较小（仅4例恶性患者和4例非恶性患者），需要更大规模研究验证 | 研究乳腺癌异质性在单细胞转录组中的形成机制和作用 | 乳腺癌临床标本中的细胞 | 单细胞组学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 非负矩阵分解(NMF) | 单细胞转录组数据 | 54,055个高质量细胞，来自4例恶性和4例非恶性患者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11172 | 2025-10-07 |
Integrated analysis reveals prognostic correlation and immune characteristics of a tumor-associated macrophage-based risk signature in triple-negative breast cancer
2024-Oct-31, Translational cancer research
IF:1.5Q4
DOI:10.21037/tcr-24-1037
PMID:39525038
|
研究论文 | 本研究通过整合分析构建了基于肿瘤相关巨噬细胞的风险特征，用于三阴性乳腺癌的预后预测和免疫特征分析 | 首次基于单细胞RNA测序数据识别TAM簇并构建8基因风险特征，开发了整合分期和TAM风险特征的新型列线图 | NA | 探索三阴性乳腺癌中肿瘤相关巨噬细胞的特征，构建预后风险特征并验证其与免疫特征的关系 | 三阴性乳腺癌患者 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，逆转录聚合酶链反应，Western blot，免疫组织化学 | LASSO回归，单变量Cox回归 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11173 | 2025-10-07 |
The CD8+ T cell tolerance checkpoint triggers a distinct differentiation state defined by protein translation defects
2024-06-11, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.04.026
PMID:38776918
|
研究论文 | 本研究揭示了外周CD8+ T细胞耐受检查点触发了一种由蛋白质翻译缺陷定义的独特分化状态 | 首次证明外周耐受触发与耗竭、记忆和功能效应细胞完全不同的分化状态，并发现该状态由蛋白质翻译缺陷维持 | 研究主要关注早期分化阶段（60小时内），长期耐受状态的维持机制需要进一步探索 | 阐明外周CD8 T细胞耐受检查点的分子机制和细胞状态特征 | 外周CD8+ T细胞 | 免疫学 | 自身免疫疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序, 染色质可及性分析 | NA | 流式细胞数据, 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11174 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA-seq and single-cell bisulfite-sequencing reveal insights into yak preimplantation embryogenesis
2024-01, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2023.105562
PMID:38097189
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和单细胞亚硫酸氢盐测序揭示牦牛植入前胚胎发育的表观遗传调控机制 | 首次在牦牛胚胎发育中结合单细胞转录组和DNA甲基化分析，鉴定出43个候选甲基化驱动基因和关键表观遗传调控因子 | 研究聚焦特定物种（牦牛），结果在其他哺乳动物的普适性需要进一步验证 | 探究高原牦牛植入前胚胎发育过程中的DNA甲基化作用和表观遗传重编程机制 | 牦牛卵母细胞和不同发育阶段的植入前胚胎 | 发育生物学 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞亚硫酸氢盐测序 | NA | 单细胞转录组数据, DNA甲基化数据 | 卵母细胞和系列发育阶段胚胎的单细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞甲基化测序 | NA | NA |
| 11175 | 2025-10-07 |
Human placental cells are resistant to SARS-CoV-2 infection and replication
2024, Wellcome open research
DOI:10.12688/wellcomeopenres.20514.2
PMID:39640372
|
研究论文 | 本研究通过分析胎盘细胞对SARS-CoV-2的易感性和病毒释放能力，揭示了病毒很少从母体传播给胎儿的机制 | 首次系统量化了不同胎盘细胞类型对SARS-CoV-2的感染率和病毒释放能力，发现原代滋养层细胞病毒释放水平极低 | 研究主要基于体外实验，可能无法完全模拟体内复杂的胎盘环境 | 探究胎盘细胞对SARS-CoV-2感染的易感性和病毒释放能力 | 人类早期妊娠和足月胎盘细胞，包括滋养层细胞、成纤维细胞、巨噬细胞以及JEG-3、JAR和HUVEC细胞系 | NA | COVID-19 | 单细胞RNA测序，共聚焦显微镜，体外感染实验 | NA | 基因表达数据，蛋白质表达数据，病毒感染数据 | 多个胎盘细胞类型和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11176 | 2025-10-07 |
Here and there a trophoblast, a transcriptional evaluation of trophoblast cell models
2022-Nov-08, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04589-4
PMID:36346530
|
综述 | 本文通过整合评估人滋养层干细胞模型与体内样本的转录组数据，分析这些模型的适用性 | 首次系统整合人滋养层干细胞模型、人类囊胚样结构、干细胞和胚胎的单细胞RNA测序数据，评估模型对早期滋养层发育的再现能力 | 基于现有转录组数据的回顾性分析，缺乏实验验证 | 评估人滋养层干细胞模型的转录组特征及其在再现早期滋养层发育方面的适用性 | 人滋养层干细胞模型、人类囊胚样结构、干细胞和胚胎样本 | 发育生物学 | 生殖医学 | 单细胞RNA测序，转录组分析 | NA | 转录组数据，单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 11177 | 2025-10-07 |
CD34+ cell atlas of main organs implicates its impact on fibrosis
2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04606-6
PMID:36315271
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序和遗传谱系追踪揭示CD34+细胞在生理和病理条件下的异质性及其在血管生成和器官纤维化中的作用 | 首次系统描绘CD34+细胞在不同器官中的细胞图谱，并发现表达Pi16的CD34+细胞可转化为肌成纤维细胞参与器官纤维化 | 研究主要基于小鼠模型，在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明CD34+细胞在生理和病理条件下的身份和功能 | CD34+细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 遗传谱系追踪 | 遗传谱系追踪小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11178 | 2025-10-07 |
Integrative insights and clinical applications of single-cell sequencing in cancer immunotherapy
2022-Oct-31, Cellular and molecular life sciences : CMLS
IF:6.2Q1
DOI:10.1007/s00018-022-04608-4
PMID:36316529
|
综述 | 概述单细胞测序技术在癌症免疫治疗中的整合见解与临床应用进展 | 系统阐述单细胞测序如何揭示肿瘤微环境复杂性及推动个体化免疫治疗方案开发 | 单细胞技术的临床转化研究尚不深入，尤其在免疫治疗应用方面仍需突破 | 探讨单细胞测序技术对癌症免疫治疗的机制解析和临床指导价值 | 肿瘤微环境中的细胞异质性、细胞组成与相互作用、肿瘤耐药机制 | 数字病理学 | 癌症 | 单细胞测序 | NA | 基因组、转录组、表观基因组、蛋白质组、多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 11179 | 2025-10-07 |
Identifying novel therapeutic targets in cystic fibrosis through advanced single-cell transcriptomics analysis
2025-Feb-07, Computers in biology and medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.109748
PMID:39921941
|
研究论文 | 通过先进单细胞转录组学分析识别囊性纤维化新型治疗靶点 | 采用增强分析方法整合多源数据，发现与CF气道疾病相关的新基因和调控网络 | 未明确说明样本规模和技术平台的具体限制 | 深入理解囊性纤维化相关基因表达机制，识别新型治疗靶点 | 囊性纤维化患者和健康对照者的肺部细胞 | 单细胞转录组学 | 囊性纤维化 | 单细胞转录组测序 | 共表达网络分析 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 11180 | 2025-02-10 |
Single-cell Sequencing Traces Mitochondrial Transfers
2025-Jan-15, Genomics, proteomics & bioinformatics
DOI:10.1093/gpbjnl/qzae092
PMID:39724171
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |