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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 10641 - 10660 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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| 10641 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomics of X-ray irradiated Drosophila wing discs reveals heterogeneity related to cell-cycle status and cell location
2025-Feb-11, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.10.627868
PMID:39990483
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组技术分析X射线辐射对果蝇翅盘细胞的影响，揭示了与细胞周期状态和细胞位置相关的异质性 | 首次将用于研究市场集中度的赫芬达尔-赫希曼指数应用于基因表达异质性分析，并发现辐射诱导基因表达在区域间和区域内均存在显著异质性 | 研究仅限于果蝇翅盘这一相对简单的组织模型，结果可能不适用于更复杂的哺乳动物组织 | 探究X射线辐射对组织细胞异质性的影响机制 | 果蝇翅盘细胞 | 单细胞转录组学 | 辐射损伤 | 单细胞RNA测序 | 聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 未明确样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10642 | 2025-10-07 |
Molecularly-guided spatial proteomics captures single-cell identity and heterogeneity of the nervous system
2025-Feb-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.10.637505
PMID:39990460
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研究论文 | 本研究利用空间单细胞蛋白质组学技术探索神经系统细胞身份和异质性 | 首次将免疫染色引导的激光捕获显微切割与LC-MS结合，应用于异质性中枢神经系统的空间单细胞蛋白质组学研究 | 研究主要聚焦于特定脑区域和损伤模型，尚未扩展到更广泛的神经系统疾病 | 开发和应用空间单细胞蛋白质组学方法以理解神经系统生物学和神经疾病分子机制 | 大脑皮层和黑质神经元群体、刺伤损伤相关的神经免疫变化、肠肌层神经节细胞与神经束 | 空间蛋白质组学 | 神经系统疾病 | 免疫染色引导激光捕获显微切割、液相色谱-质谱联用 | NA | 蛋白质组数据 | 多个脑区域和神经组织样本 | NA | 空间单细胞蛋白质组学、激光捕获显微切割 | LCM、LC-MS | 免疫染色引导激光捕获显微切割与液相色谱-质谱联用技术 |
| 10643 | 2025-10-07 |
A Benchmarking Study of Random Projections and Principal Components for Dimensionality Reduction Strategies in Single Cell Analysis
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.04.636499
PMID:39974925
|
研究论文 | 系统评估主成分分析和随机投影在单细胞RNA测序数据降维中的性能比较 | 首次对PCA和RP方法在单细胞分析中进行全面基准测试，包括计算效率和下游分析效果的多维度评估 | 仅评估了线性降维方法，未包含非线性降维技术的比较 | 比较不同降维策略在单细胞数据分析中的性能 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | PCA, SVD, 随机SVD, 稀疏随机投影, 高斯随机投影 | 基因表达数据 | 多个公开可用的标记和未标记单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10644 | 2025-10-07 |
Seq-Scope-eXpanded: Spatial Omics Beyond Optical Resolution
2025-Feb-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.02.04.636355
PMID:39975076
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研究论文 | 提出Seq-Scope-X技术，通过组织膨胀实现亚微米级空间转录组和蛋白质组分析 | 结合组织膨胀技术与Seq-Scope方法，突破光学分辨率限制，实现亚微米级空间多组学分析 | NA | 开发超高分辨率空间多组学分析技术 | 肝脏组织、脑组织、结肠组织、小鼠脾脏、人类扁桃体 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学、组织膨胀技术 | NA | 空间转录组数据、空间蛋白质组数据 | NA | NA | 空间转录组学、空间蛋白质组学 | Seq-Scope-X | 结合组织膨胀的Seq-Scope改进技术，支持亚微米级分辨率的转录组和蛋白质组分析 |
| 10645 | 2025-10-07 |
The profiles of immunosuppressive microenvironment in the Lauren intestinal-type gastric adenocarcinoma
2025-Feb-01, Cancer immunology, immunotherapy : CII
DOI:10.1007/s00262-024-03938-5
PMID:39891785
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学技术揭示了Lauren肠型胃腺癌免疫抑制微环境的细胞组成和相互作用机制 | 首次系统鉴定IGAC中HAVCR2+VCAM1+耗竭T细胞和LAYN+TNFRSF4+调节性T细胞等关键免疫抑制细胞亚群，并证实其与疾病进展的相关性 | 样本量相对有限（15例患者），且仅针对中国人群进行研究 | 探究Lauren肠型胃腺癌免疫抑制机制，为改善免疫治疗效果寻找潜在靶点 | 15例中国Lauren肠型胃腺癌患者的肿瘤组织和癌旁正常黏膜 | 数字病理 | 胃癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 免疫荧光, 流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, 图像数据, 流式数据 | 15例IGAC患者 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10646 | 2025-10-07 |
CFTR High Expresser BEST4+ cells are pH-sensing neuropod cells: new implications for intestinal physiology and Cystic Fibrosis disease
2025-Jan-27, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.24.634747
PMID:39974899
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现肠道BEST4+细胞是pH感应神经足细胞，并揭示了其在囊性纤维化疾病中的新作用机制 | 首次将BEST4+细胞鉴定为CFTR高表达细胞，发现其具有pH感应功能并参与囊性纤维化疾病发病机制 | 研究主要基于大鼠模型，人类样本验证尚不充分 | 探究肠道BEST4+细胞的分子特征及其在囊性纤维化疾病中的作用 | 人类和大鼠肠道上皮细胞，特别是BEST4+细胞亚群 | 单细胞生物学 | 囊性纤维化 | 单细胞RNA测序，免疫定位 | NA | 单细胞转录组数据，蛋白质表达数据 | 野生型和ΔF508囊性纤维化大鼠空肠组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10647 | 2025-10-07 |
Screening, identification and targeted intervention of necroptotic biomarkers of asthma
2024-11-26, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150674
PMID:39270557
|
研究论文 | 本研究通过机器学习方法鉴定哮喘中坏死性凋亡相关生物标志物，并探索靶向干预策略 | 首次系统鉴定哮喘中坏死性凋亡相关差异表达基因，并发现白藜芦醇和雷公藤甲素可作为潜在治疗药物 | 研究样本量有限，需要进一步实验验证药物疗效 | 阐明坏死性凋亡在哮喘发病机制中的作用并寻找治疗靶点 | 哮喘患者与健康对照的基因表达数据 | 机器学习 | 哮喘 | 机器学习算法(LASSO,随机森林,SVM-RFE),Western blot,qPCR,单细胞RNA测序,分子对接 | LASSO,随机森林,SVM-RFE | 基因表达数据,临床指标,单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 10648 | 2025-10-07 |
Identification of the 4CL family in cassava (Manihot esculenta Crantz) and expression pattern analysis of the Me4CL32 gene
2024-11-26, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.150731
PMID:39423574
|
研究论文 | 通过生物信息学方法鉴定木薯4CL基因家族并分析Me4CL32基因的表达模式 | 首次在木薯基因组中系统鉴定50个4CL基因家族成员，并发现与橡胶树存在密切同源关系 | 研究主要基于生物信息学分析和基因表达模式，缺乏功能验证实验 | 研究木薯4CL基因家族的功能及其在植物生长和胁迫响应中的作用 | 木薯(Manihot esculenta Crantz)的4CL基因家族，特别是Me4CL32基因 | 生物信息学 | NA | 生物信息学分析、qRT-PCR、RNA-seq转录组、单细胞转录组、亚细胞定位 | NA | 基因组数据、表达数据 | NA | NA | 单细胞转录组、RNA-seq | NA | NA |
| 10649 | 2025-10-07 |
Transcriptional regulation of the postnatal cardiac conduction system heterogeneity
2024-Aug-02, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-024-50849-1
PMID:39095365
|
研究论文 | 本研究通过单细胞和空间转录组学揭示了小鼠出生后心脏传导系统的转录组景观和区域特异性基因调控网络 | 首次在单细胞分辨率下结合空间信息展示出生后心脏传导系统的转录组景观，并发现Tbx3和Irx3转录因子在区域特异性基因调控中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型，在人类心脏传导系统中的适用性需要进一步验证 | 阐明出生后心脏传导系统的分子组成和调控机制 | 出生后小鼠心脏传导系统细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,ATAC-seq,ChIP-seq | NA | 单细胞转录组数据,空间基因表达数据,表观基因组数据 | 小鼠心脏传导系统不同区域细胞 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学,ATAC-seq,ChIP-seq | NA | NA |
| 10650 | 2025-10-07 |
spatialGE: A user-friendly web application to democratize spatial transcriptomics analysis
2024-Jul-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.06.27.601050
PMID:39005315
|
研究论文 | 开发了一个用户友好的网络应用程序spatialGE，用于简化空间转录组学数据分析 | 提供了一个无需编程专业知识即可进行空间转录组学数据分析的友好界面，支持多种分析流程和ST技术 | 未在摘要中明确说明具体的技术限制 | 开发简化空间转录组学数据分析的工具，使其更易于被广泛科学界使用 | 黑色素瘤脑转移和默克尔细胞癌的肿瘤微环境 | 空间转录组学 | 黑色素瘤,默克尔细胞癌 | 空间转录组学分析 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 10651 | 2025-10-07 |
Refining the identity of mesenchymal cell types associated with murine periosteal and endosteal bone
2024-04, The Journal of biological chemistry
IF:4.0Q2
DOI:10.1016/j.jbc.2024.107158
PMID:38479598
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据构建小鼠骨相关细胞图谱，澄清了与骨相关的间充质细胞类型身份 | 揭示了11个主要的骨相关间充质细胞簇，包括新发现的骨-X细胞，并发现Wnt16在骨膜细胞中的特异性表达 | 研究仅限于小鼠模型，结果可能不完全适用于人类 | 增加骨细胞单细胞RNA测序数据，比较骨膜和骨内细胞，澄清小鼠骨相关主要细胞类型 | 小鼠骨相关间充质细胞，特别是成骨细胞和骨细胞 | 单细胞测序分析 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过100,000个间充质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10652 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal profiling defines persistence and resistance dynamics during targeted treatment of melanoma
2024-Feb-05, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.02.02.577085
PMID:38370717
|
研究论文 | 本研究通过空间转录组学分析黑色素瘤靶向治疗过程中的细胞持久性状态和耐药机制 | 首次在患者来源异种移植模型中结合空间转录组学和深度学习，揭示黑色素瘤治疗过程中克隆谱系演化的时空动态 | 研究基于患者来源异种移植模型，可能与实际患者肿瘤微环境存在差异 | 阐明BRAF突变黑色素瘤靶向治疗中持久性细胞状态和耐药机制 | BRAF突变黑色素瘤细胞和患者来源异种移植模型 | 数字病理学 | 黑色素瘤 | 空间转录组学, 深度学习 | 深度学习模型 | 空间转录组数据, 组织病理切片图像 | 患者来源异种移植模型 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 空间转录组学平台 |
| 10653 | 2025-10-07 |
Single-Cell Transcriptomes and Immune Repertoires Reveal the Cell State and Molecular Changes in Pemphigus Vulgaris
2024-02-01, Journal of immunology (Baltimore, Md. : 1950)
DOI:10.4049/jimmunol.2300312
PMID:38117802
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研究论文 | 通过单细胞转录组和免疫受体分析揭示天疱疮的细胞状态和分子变化 | 首次结合5'单细胞RNA测序与V(D)J富集技术分析天疱疮患者治疗前后样本，发现IL-1α信号通路、髓系APC细胞和功能失调的T细胞亚群在疾病中的作用 | 样本量有限，部分发现仅通过免疫组化和多重免疫荧光验证 | 阐明天疱疮的病因和发病机制，特别是免疫细胞与上皮细胞的相互作用 | 初治天疱疮患者的口腔黏膜病变和外周血样本，以及泼尼松治疗后的外周血样本 | 单细胞组学 | 天疱疮 | 5'单细胞RNA测序，V(D)J富集，免疫组化，多重免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据，免疫受体序列数据 | 天疱疮患者的口腔黏膜和外周血样本（具体数量未明确说明） | 10x Genomics | 单细胞RNA测序，单细胞免疫受体测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 5' |
| 10654 | 2025-10-07 |
A framework for defining mesenchymal cell types associated with murine periosteal and endosteal bone
2023-Nov-17, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.17.567528
PMID:38014179
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据建立了小鼠骨相关间充质细胞类型的分类框架 | 首次比较了骨膜和骨内膜/骨小梁的细胞差异，定义了11个主要细胞簇，包括新发现的osteo-X细胞类型 | 研究仅针对小鼠模型，人类骨细胞的适用性需要进一步验证 | 增加骨细胞单细胞RNA测序数据量，比较骨膜与骨内细胞差异，明确小鼠骨相关细胞类型主要类别 | 小鼠骨相关间充质细胞 | 单细胞转录组学 | 骨骼疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 超过100,000个间充质细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10655 | 2025-10-07 |
Single circulating tumor cell sequencing based on improved high-porosity membranes and nanoporous microchambers
2025-May-15, Biosensors & bioelectronics
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.bios.2025.117263
PMID:39978235
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研究论文 | 本研究开发了基于高孔隙率超薄滤膜和纳米孔微腔的新型纳米器件，用于分离单个循环肿瘤细胞并建立自动化单细胞测序工作流程 | 开发了高孔隙率超薄滤膜和纳米孔微腔芯片两种新型纳米器件，建立了基于滤膜系统的自动化单CTC测序工作流程 | NA | 开发高效的循环肿瘤细胞单细胞测序方法，探索肿瘤异质性和进展机制 | 循环肿瘤细胞(CTCs) | 单细胞测序技术 | 肿瘤 | 单细胞测序 | NA | 基因组测序数据 | NCI-H358细胞系和患者来源的CTCs | NA | 单细胞测序 | NA | 基于滤膜系统的单细胞测序工作流程 |
| 10656 | 2025-10-07 |
Identification and validation of immune-related biomarkers and polarization types of macrophages in keloid based on bulk RNA-seq and single-cell RNA-seq analysis
2025-Apr, Burns : journal of the International Society for Burn Injuries
IF:3.2Q1
DOI:10.1016/j.burns.2025.107413
PMID:39923303
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研究论文 | 基于bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析鉴定瘢痕疙瘩中免疫相关生物标志物和巨噬细胞极化类型 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq数据，通过多种机器学习方法鉴定瘢痕疙瘩的免疫相关生物标志物，并揭示巨噬细胞极化状态异常 | 研究依赖于公共数据库的回顾性数据，样本量有限，需要进一步实验验证 | 鉴定瘢痕疙瘩的免疫相关生物标志物和巨噬细胞极化类型，为治疗提供新靶点 | 瘢痕疙瘩组织和正常皮肤组织 | 生物信息学 | 瘢痕疙瘩 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 蛋白质印迹, 免疫荧光 | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 四个GEO数据集(GSE83286, GSE212954, GSE92566, GSE90051) | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 10657 | 2025-10-07 |
Upregulation of LSP1 in AML cells enhances AML resistance to sorafenib and promotes apoptosis in CD8+ T cells
2025-Mar-26, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2025.114255
PMID:39952006
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研究论文 | 本研究通过RNA-seq和单细胞RNA-seq分析发现LSP1是AML的重要免疫相关标志物，影响索拉非尼耐药性和CD8+T细胞功能 | 首次揭示LSP1在AML免疫抑制微环境中的关键作用，及其对索拉非尼耐药性和CD8+T细胞凋亡的影响 | 未明确说明样本数量和研究人群的具体特征 | 探索AML免疫抑制肿瘤微环境的机制并寻找免疫治疗新靶点 | 急性髓系白血病(AML)细胞和CD8+T细胞 | 生物信息学 | 急性髓系白血病 | RNA-seq, scRNA-seq | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 10658 | 2025-10-07 |
Applications of Single-Cell Omics Technologies for Induced Pluripotent Stem Cell-Based Cardiovascular Research
2025-Feb-28, International journal of stem cells
IF:2.5Q3
DOI:10.15283/ijsc23183
PMID:39129179
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综述 | 探讨单细胞组学技术与诱导多能干细胞在心血管研究中的整合应用 | 整合单细胞组学与iPSC技术，探索空间组学等新兴范式在揭示心脏组织空间结构方面的潜力 | NA | 阐明心脏健康与疾病的分子复杂性，推动心血管研究发展 | 心脏细胞、诱导多能干细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间组学 | NA | 基因组, 转录组, 蛋白质组 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 10659 | 2025-10-07 |
A novel telomere-associated genes signature for the prediction of prognosis and treatment responsiveness of hepatocellular carcinoma
2025-Feb-27, Biological procedures online
IF:3.7Q1
DOI:10.1186/s12575-025-00271-8
PMID:40016654
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研究论文 | 本研究开发了一个包含18个端粒相关基因的肝细胞癌预后预测模型 | 首次建立了基于端粒相关基因的肝细胞癌预后模型，并通过孟德尔随机化分析确认了ASF1A基因与酒精性肝细胞癌的因果关系 | 研究主要基于TCGA数据库，需要更多独立队列验证模型的普适性 | 开发肝细胞癌预后预测模型并探索端粒相关基因在肝细胞癌中的作用 | 肝细胞癌患者组织和细胞系 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序,空间转录组测序,Western blotting,Transwell迁移实验,伤口愈合实验,集落形成实验 | Cox回归模型,LASSO回归模型 | 基因表达数据,临床数据 | 374例肝细胞癌样本和50例正常肝组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq,空间转录组学 | NA | NA |
| 10660 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Reveals Extensive Heterogeneity and Unique Gene Trajectories in Non-Transformed and Transformed Human Lung Epithelial Cells: Insights into the Role of LncRNAs in Tumor Heterogeneity
2025-Feb-16, International journal of molecular sciences
IF:4.9Q2
DOI:10.3390/ijms26041690
PMID:40004153
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人肺上皮细胞在非转化和转化状态下的转录组异质性及lncRNA在肿瘤异质性中的作用 | 首次在单细胞水平系统比较非转化与转化肺上皮细胞的lncRNA表达轨迹，揭示lncRNA亚型对细胞异质性的贡献机制 | 研究仅使用两种细胞系（BEAS2B和H460），未涉及原代肿瘤样本或体内模型验证 | 探究肺上皮细胞在癌变过程中的转录组异质性特征及lncRNA的作用机制 | 永生化非转化肺上皮细胞系BEAS2B和转化肺上皮细胞系H460 | 单细胞转录组学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序，生物信息学分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 两种肺上皮细胞系（BEAS2B和H460） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |