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当前共找到 40374 篇文献，本页显示第 1021 - 1040 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1021 | 2026-06-06 |
Scalable differentiation of human cardiac organoids from iPSCs generates cardiac tissues for cardiac cell therapy
2026, Theranostics
IF:12.4Q1
DOI:10.7150/thno.127654
PMID:42245001
|
研究论文 | 本研究提出了一种可扩展的方法，从iPSC分化出心脏类器官，用于心脏细胞治疗，并在猪心肌梗死模型中验证了其移植效果 | 首次在20天内从iPSC分化出含有心肌细胞、心脏成纤维细胞和内皮细胞的成熟心脏类器官，并验证了生物反应器辅助放大策略和猪体内移植可行性 | 仅使用了少量类器官（3500个），且随访时间较短（8-30天），长期效果和安全性需进一步评估 | 开发可扩展的心脏类器官分化技术，用于改善心肌梗死细胞治疗的细胞植入效果 | 人诱导多能干细胞（iPSC）衍生的心脏类器官 | 数字病理学 | 心血管疾病 | NA | NA | 图像 | 3500个心脏类器官，移植到猪心肌梗死模型 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1022 | 2026-06-06 |
Toll-Like Receptors in Diabetes: Immunometabolic Mechanisms and Emerging Precision Therapeutic Strategies
2026, Journal of inflammation research
IF:4.2Q2
DOI:10.2147/JIR.S606875
PMID:42245151
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综述 | 综述Toll样受体在糖尿病中的免疫代谢机制及新兴精准治疗策略 | 提出“特洛伊木马”途径——肠道来源外泌体将炎症配体隐蔽运输至β细胞内体，绕过传统表面受体监控，并利用单细胞转录组学和孟德尔随机化揭示β细胞免疫反应细胞异质性和因果遗传联系 | 未提及具体限制 | 综合梳理Toll样受体在糖尿病中的免疫代谢整合角色，并为精准医学提出框架 | Toll样受体及其在糖尿病中的作用机制 | 机器学习 | 糖尿病 | NA | NA | 文本 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1023 | 2026-06-06 |
Integrated clinical and multi-omics analysis links composite inflammatory indices to macrophage-associated molecular programs in aortic dissection
2026, Frontiers in genetics
IF:2.8Q2
DOI:10.3389/fgene.2026.1840880
PMID:42245402
|
研究论文 | 通过临床数据与多组学分析，探索复合炎症指数与主动脉夹层中巨噬细胞相关分子程序之间的联系 | 首次将常规血液检测衍生的复合炎症指数与单细胞RNA测序、批量转录组数据整合分析，揭示炎症指数与巨噬细胞转录重编程的关联 | 样本量相对有限，炎症指数与分子机制的因果关系尚未完全验证 | 评估复合炎症指数在主动脉夹层疾病评估中的作用，并揭示其与分子机制的整合关系 | 主动脉夹层患者和对照组参与者 | 数字病理学 | 心血管疾病 | RNA-seq, 单细胞RNA测序 | 逻辑回归, LASSO, 随机森林, SVM-RFE, 加权基因共表达网络分析 | 基因表达数据, 临床数据 | 288名参与者（144名主动脉夹层患者和144名对照组） | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 1024 | 2026-06-06 |
Graph Topology Reframes the Coherence of Cell-State Manifold Inference under Heterogeneous Single-Cell Observations
2026, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.34133/csbj.0087
PMID:42245398
|
研究论文 | 该论文讨论了在异质性单细胞观测数据下，图拓扑结构如何重构细胞状态流形推断的一致性 | 提出拓扑稳定性描述符用于评估低维流形骨架的可靠性，识别异质性观测带来的系统性扭曲 | 主要基于模拟数据验证，未在多种真实数据集上充分验证拓扑描述符的普适性 | 研究单细胞观测异质性对基于流形的推断（如图抽象）的影响，并提出解决系统性扭曲的方法 | 异质性单细胞RNA测序数据中的浅层观测细胞与深层观测细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 一个经验性单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1025 | 2026-06-06 |
NAMPT orchestrates fibroblast cuproptosis and immune crosstalk during IPF progression
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1726692
PMID:42245670
|
研究论文 | 通过转录组分析揭示NAMPT在特发性肺纤维化（IPF）中调控成纤维细胞铜死亡和免疫互作的关键作用 | 首次将铜死亡机制与IPF病程进展关联，并发现NAMPT作为枢纽基因在调控成纤维细胞铜死亡和免疫微环境重塑中的双重功能 | 研究主要基于转录组数据分析，缺乏体内实验或功能验证机制的直接证据 | 探索NAMPT在IPF中调控成纤维细胞铜死亡及免疫互作的分子机制和潜在治疗靶点 | IPF患者和健康对照的肺组织样本 | 生物信息学 | 特发性肺纤维化 | RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | 机器学习算法 | 基因表达数据 | IPF患者和健康对照样本 | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1026 | 2026-06-06 |
The translational paradox of AI in hepatocellular carcinoma: from algorithmic over-engineering to real-world clinical utility
2026, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2026.1848190
PMID:42245726
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综述 | 批判性评述人工智能在肝细胞癌中从算法过度工程化到临床实际应用的转化悖论 | 揭示自监督视觉基础模型、无监督域适应与AI协同空间转录组学等先进算法在真实世界多扫描仪队列中未经验证的转化困境，并挑战多模态叙事范式，证明算法复杂度不等同于临床效用 | 该综述基于近期文献批判性分析，但未提供原始实验数据或具体队列验证结果 | 评估肝细胞癌中人工智能方法从静态模式识别到机制驱动诊断的演变及其临床转化障碍 | 肝细胞癌的人工智能诊断方法（包括视觉基础模型、虚拟分子分析、空间转录组学、大语言模型与概念瓶颈模型） | 机器学习 | 肝细胞癌 | NA | 自监督视觉基础模型、大语言模型、概念瓶颈模型 | 图像、文本 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 1027 | 2026-06-06 |
Comprehensive analysis of m6A RNA methylation regulators and the immune microenvironment in spinal cord injury
2026, Frontiers in neurology
IF:2.7Q3
DOI:10.3389/fneur.2026.1759661
PMID:42246043
|
研究论文 | 综合分析脊髓损伤中m6A RNA甲基化调控因子与免疫微环境的关系 | 首次系统性地结合多种机器学习算法、单细胞RNA测序和体内实验，识别并验证了FTO和YTHDC1作为脊髓损伤关键调控因子的作用，并探讨其与免疫微环境的关系 | 研究依赖于公共数据集，样本量有限，且未进行功能验证实验以确认FTO和YTHDC1在脊髓损伤中的直接作用机制 | 探索m6A RNA甲基化调控因子在脊髓损伤发病机制中的作用，并识别潜在生物标志物和治疗靶点 | 脊髓损伤组织和细胞（包括人源转录组数据和大鼠模型） | 数字病理学 | 脊髓损伤 | RNA-seq, scRNA-seq, qRT-PCR, 免疫荧光染色 | 机器学习算法, ssGSEA, NetworkAnalyst | 基因表达数据, 单细胞RNA测序数据 | 来自GEO数据库的多个脊髓损伤转录组数据集，以及大鼠脊髓损伤模型组织样本 | NA | scRNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1028 | 2026-06-06 |
Revealing the Best Strategies for Rare Cell Type Detection in Multi-Sample Single-Cell Datasets
2025-Dec-29, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010031
PMID:41595450
|
研究论文 | 系统评估多样本单细胞数据中稀有细胞类型检测的最佳分析策略 | 首次在多样本场景下系统比较不同检测策略（单样本、合并样本、批次校正合并样本）和多种工具的性能，并基于批次校正的合并检测策略取得最优效果 | 研究仅提供策略层面的比较，未深入探讨各方法在不同技术平台或更大规模数据集上的适用性 | 评估多样本单细胞RNA测序数据中稀有细胞检测方法的性能，确定最有效的分析策略 | 五款稀有细胞检测工具（CellSIUS、GapClust、GiniClust、scCAD、SCISSORS）以及基于scGPT和Isolation Forest的稀有细胞检测方法 | 自然语言处理、机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | Isolation Forest, scGPT | 基因表达数据 | 多个公开可用的单细胞RNA测序数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1029 | 2026-06-06 |
scSelector: A Flexible Single-Cell Data Analysis Assistant for Biomedical Researchers
2025-Dec-19, Genes
IF:2.8Q2
DOI:10.3390/genes17010002
PMID:41595423
|
research paper | 开发了一个交互式软件工具包scSelector，允许生物医学研究者基于专业知识灵活选择和分析单细胞数据中的细胞群 | 整合了套索选择工具与大型语言模型（DeepSeek/Gemini）辅助的细胞类型预测，突破了传统聚类依赖方法的刚性限制 | 可能依赖API稳定性，且不同数据集的生物学知识指导可能需要人工调整 | 为生物医学研究者提供灵活的单细胞数据分析工具，提高细胞亚群识别和功能异质性解析的精度 | 单细胞RNA测序数据中的细胞群，包括稀有细胞亚群和标准质控中丢弃的细胞 | 数字病理学 | NA | 单细胞RNA测序, 大型语言模型 | 大型语言模型 | 单细胞表达数据 | 多个公共数据集，具体数量未明确 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 1030 | 2026-06-06 |
Emerging technologies and current challenges in intratumoral microbiota research
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1685862
PMID:41552720
|
综述 | 系统总结瘤内微生物研究中的新兴技术与当前挑战，涵盖检测方法、功能解析及临床转化 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学、类器官共培养及人工智能等多技术手段，提出从描述性分析向机制研究和临床转化跨越的路径 | 瘤内微生物低生物量导致检测易受环境污染，分析流程标准化不足，跨研究比较困难 | 阐述瘤内微生物研究的技术进展和挑战，推动精准肿瘤学中微生物导向策略的发展 | 肿瘤微环境中的瘤内微生物 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 优化厌氧培养, 基因组解析分析, 酶水平分析, 类器官共培养 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 1031 | 2026-06-06 |
Integration of single cell and bulk transcriptomic analyses identifies FAM189A2 as a key prognostic gene in lung cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1701806
PMID:41567189
|
研究论文 | 通过整合单细胞和批量转录组分析，识别出FAM189A2作为肺癌关键预后基因 | 首次将单细胞RNA测序与TCGA批量转录组数据整合，构建八基因LASSO-Cox风险模型，并发现FAM189A2作为推定肿瘤抑制因子和潜在生物标志物 | 研究基于回顾性公共数据集，FAM189A2的功能仅在体外细胞系中验证，缺乏体内模型和前瞻性临床验证 | 阐明恶性细胞状态与患者预后和治疗脆弱性的关联，开发可行的预后风险分层模型 | 13例原发性肺肿瘤及配对正常肺组织的单细胞RNA测序数据，以及TCGA-LUAD和两个外部验证队列 | 机器学习 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | CNN, LSTM, GAN | 图像, 文本, 视频 | 13例肺肿瘤和配对正常组织（48149个细胞）以及三个批量转录组队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 1032 | 2026-06-06 |
A review of omics studies in sarcopenia: from molecular mechanisms to hepatic-gut-muscle interactions in chronic liver disease comorbidity
2025, Frontiers in cellular and infection microbiology
IF:4.6Q1
DOI:10.3389/fcimb.2025.1710582
PMID:41568005
|
综述 | 综述了肌少症的多组学研究，从分子机制到慢性肝病共病中的肝-肠-肌肉相互作用 | 提出“共性-特异性”双层框架，在共性层面识别出蛋白质稳态失衡、线粒体功能障碍、慢性炎症和肠-肌轴失调四大核心病理支柱，在特异性层面提出“弱信号协同积累”假说解释慢性肝病中的肌少症机制 | 目前组学研究大多停留在相关性层面，向临床转化面临挑战 | 系统解析肌少症及其与慢性肝病共病的分子机制，为精准诊疗提供理论基础和发展路线图 | 肌少症及慢性肝病相关肌少症的多组学研究 | 机器学习 | 肌少症，慢性肝病 | 单细胞多组学，空间转录组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | NA | NA |
| 1033 | 2026-06-06 |
Elucidating the role of SHROOM4 in non-small cell lung cancer: expression patterns, clinical correlations, and potential functions
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1723844
PMID:41573567
|
研究论文 | 通过生物信息学分析探索SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达模式、临床相关性及潜在功能 | 首次系统研究SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达特征及其与肿瘤微环境的关系，发现其与Wnt/Beta-Catenin通路和ANGPTL7/SFTPC的关联 | 基于公共数据库分析，需进一步实验验证SHROOM4在肺癌进展中的具体机制及临床实用性 | 阐明SHROOM4在非小细胞肺癌中的表达模式、临床意义及潜在功能 | SHROOM4基因在非小细胞肺癌（尤其是肺鳞癌）中的表达及其相关机制 | 生物信息学 | 肺癌 | 生物信息学分析、RNA-seq、单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据、单细胞RNA测序数据 | 肺鳞癌组织及对应正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1034 | 2026-06-06 |
Cuproptosis-driven reprogramming of fibroblast communication by GK is associated with the immune microenvironment in diabetic foot ulcers
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1687806
PMID:41583446
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析，揭示铜死亡相关基因GK在糖尿病足溃疡中通过成纤维细胞重编程免疫微环境的作用 | 首次将铜死亡机制与糖尿病足溃疡的成纤维细胞-免疫细胞通讯联系起来，并鉴定GK为诊断生物标志物 | 功能验证仅基于动物实验和计算预测，缺乏直接的细胞功能实验和人类样本验证 | 探究铜死亡在糖尿病足溃疡成纤维细胞与免疫细胞相互作用中的角色及潜在生物标志物 | 糖尿病足溃疡患者和健康皮肤组织的单细胞RNA测序数据，以及大鼠模型 | 数字病理学 | 糖尿病足溃疡 | scRNA-seq | 机器学习（LASSO, SVM-RFE, 随机森林） | 基因表达数据 | 33,095个细胞（质控后25,198个），9只SD大鼠（每组3只） | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1035 | 2026-06-06 |
PANoptosis in urological diseases: molecular mechanisms, pathological roles, and emerging therapeutic opportunities
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1729348
PMID:41583472
|
综述 | 本文综述了PANoptosis在泌尿系统疾病中的分子机制、病理作用及新兴治疗策略 | 首次系统阐述了PANoptosis在泌尿系统疾病中的双重作用，既促进组织损伤又驱动抗肿瘤免疫，并提出了多组学生物标志物筛选、纳米材料递送系统和联合疗法等创新治疗方向 | 未提及具体局限性 | 梳理PANoptosis在泌尿系统疾病中的分子机制和调控网络，探讨其作为诊断标志物和治疗靶点的潜力 | 泌尿系统疾病，包括急性/慢性肾损伤、前列腺癌、肾癌和睾丸病变 | 机器学习 | 前列腺癌 | 单细胞测序、空间转录组学 | NA | NA | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'测序，10x Visium FFPE空间转录组学 |
| 1036 | 2026-06-06 |
Single-cell transcriptomics reveals a novel mechanism of RDH16 regulating immune infiltration in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1689987
PMID:41601632
|
研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示RDH16在肝细胞癌中调控免疫浸润的新机制 | 整合单细胞RNA测序与批量转录组数据集，全面表征HCC的肿瘤细胞异质性和免疫微环境特征，并首次揭示了RDH16作为免疫调节生物标志物，通过调控CD163⁺ M2巨噬细胞浸润影响肿瘤免疫微环境 | NA | 探索肝细胞癌中免疫调节的可操作生物标志物及机制，以改善患者预后 | 肝细胞癌肿瘤细胞和免疫浸润细胞 | 机器学习 | 肝癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 1037 | 2026-06-06 |
Integrated multi-omic profiling reveals macrophage-driven prognostic signatures in clear cell renal cell carcinoma through machine learning optimization
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1612262
PMID:41601657
|
研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序与机器学习方法，揭示了肾透明细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性及其驱动的预后特征 | 首次通过机器学习优化整合多组学数据，鉴定出五种转录上不同的巨噬细胞亚群，并构建了基于巨噬细胞的预后签名，特别是识别出PRDX1+LA-Mac作为主要病理亚型 | 未提及具体限制，但基于摘要可推测可能包括样本量有限（仅10个肿瘤）及验证队列数量不足 | 描绘肾透明细胞癌中肿瘤相关巨噬细胞的异质性，识别预后巨噬细胞特征，并表征驱动疾病进展的免疫-代谢程序 | 肾透明细胞癌肿瘤组织中的巨噬细胞亚群及其相关免疫和代谢特征 | 机器学习 | 肾癌 | 单细胞RNA测序 | 随机生存森林 | 基因表达数据 | 10个肾透明细胞癌肿瘤样本（scRNA-seq）及TCGA和CPTAC独立队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 1038 | 2026-06-06 |
TIMP1 as a context-dependent biomarker linking cancer progression and cardiovascular disorders: a multi-level and bioinformatics study
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1699962
PMID:41613136
|
研究论文 | 通过多层次生物信息学分析，揭示TIMP1作为连接癌症进展与心血管疾病的上下文依赖性生物标志物 | 首次系统揭示TIMP1在多种癌症和心血管疾病中的上下文依赖性功能，提出其作为跨疾病调节因子的潜在作用，并整合了表观遗传调控、免疫浸润和药物敏感性分析 | 主要依赖公开数据库进行大规模分析，细胞系实验仅用于靶向验证，缺乏体内实验和前瞻性临床验证 | 阐明TIMP1在癌症和心血管疾病中的系统性表达模式及其作为跨疾病生物标志物的潜力 | 结直肠癌和胃癌组织、荷瘤小鼠心脏、动脉粥样硬化和心力衰竭队列 | 计算生物学, 数字病理学 | 结直肠癌, 胃癌, 动脉粥样硬化, 心力衰竭 | 微阵列分析, 全癌基因组分析, 单细胞RNA测序, 免疫组化, 蛋白质印迹法, Transwell实验 | NA | 基因表达数据, 基因组变异数据, 单细胞转录组数据, 组织样本 | 公开数据集包括GSE63032、TCGA/GTEx、GSE100927、GSE5406；细胞系实验涉及结直肠癌和胃癌模型 | NA | 单细胞RNA测序, 微阵列 | NA | NA |
| 1039 | 2026-06-06 |
Interleukin-36 upregulates type-I interferon responses in systemic lupus erythematosus by promoting the accumulation of self-nucleic acids
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1727524
PMID:41607774
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研究论文 | 研究揭示白介素-36通过促进自我核酸积累上调系统性红斑狼疮中的I型干扰素反应 | 首次阐明IL-36通过下调RNA酶基因和诱导单核细胞凋亡，促进自我核酸积累，从而激活I型IFN通路的新机制 | 样本量较小（scRNA-seq 5个供体，qPCR 9个供体，流式6个供体），可能限制统计效力 | 探索IL-36在系统性红斑狼疮中过度激活I型IFN反应的分子机制 | 健康人和SLE患者的外周血单核细胞 | 机器学习和单细胞转录组学 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、实时定量PCR、流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据、基因表达数据、流式数据 | scRNA-seq: 5个健康供体；qPCR: 9个供体；流式: 6个供体；SLE scRNA-seq数据集: 33例患者和11例对照 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 1040 | 2026-06-05 |
ANXA2, DBN1, ZNF385D, and IL6ST: Endothelial cell biomarkers linking atherosclerosis progression to immune microenvironment dysregulation
2026-Dec-31, Clinical and experimental hypertension (New York, N.Y. : 1993)
DOI:10.1080/10641963.2026.2627352
PMID:41655191
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研究论文 | 通过多组学整合和机器学习方法，鉴定与动脉粥样硬化进展和免疫微环境失调相关的内皮细胞生物标志物ANXA2、DBN1、ZNF385D和IL6ST | 首次利用单细胞转录组数据构建动脉粥样硬化图谱，结合高维WGCNA和机器学习筛选出四个内皮细胞特异性诊断基因，并通过分子对接预测其与沙利度胺和白藜芦醇的结合能力 | NA | 识别与动脉粥样硬化进展和免疫微环境失调相关的内皮细胞生物标志物 | 内皮细胞生物标志物ANXA2、DBN1、ZNF385D和IL6ST | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序、高维WGCNA、LASSO回归、SVM-RFE、ssGSEA、CIBERSORT、分子对接 | NA | 基因表达数据 | 来自单细胞RNA测序数据集的动脉粥样硬化单细胞图谱 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |