单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9521 - 9540 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9521 | 2025-10-07 |
Exploring wound management in dental pulp: Utilizing single-cell RNA sequencing for global transcriptomic analysis in healthy and inflamed pulpal tissues
2024-Mar, International wound journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1111/iwj.14804
PMID:38385817
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研究论文 | 利用单细胞RNA测序技术分析健康和炎症牙髓组织的转录组景观，探索牙髓伤口愈合的细胞和分子机制 | 首次在牙髓研究中应用单细胞RNA测序技术揭示龋齿条件下细胞组成变化和细胞间相互作用网络 | 样本量相对有限，仅包含50例患者样本 | 研究牙髓伤口愈合过程中信号级联、细胞反应和细胞外基质动力学的复杂相互作用 | 人类牙髓组织（健康和炎症状态） | 单细胞组学 | 牙髓疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 50例患者牙髓组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9522 | 2025-10-07 |
Evaluating the role of wound-healing genes in conjunction with stool routine and serum tumor markers for colorectal cancer diagnosis and prognostic implications
2024-Mar, International wound journal
IF:2.6Q1
DOI:10.1111/iwj.14768
PMID:38446012
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研究论文 | 本研究评估粪便常规检查联合血清肿瘤标志物检测在结直肠癌诊断中的临床应用价值 | 首次将伤口愈合基因(VEGFA、TP53、TGFA)与粪便常规和血清肿瘤标志物结合用于结直肠癌诊断和预后评估 | 样本量较小(仅56例患者)，需要更大规模研究验证结果 | 探索结直肠癌的新型诊断和预后评估方法 | 结直肠癌患者和健康对照者 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析 | NA | 临床数据, 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 56例结直肠癌患者和56例健康对照者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9523 | 2025-10-07 |
Simultaneous CRISPR screening and spatial transcriptomics reveals intracellular, intercellular, and functional transcriptional circuits
2023-Dec-01, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.30.569494
PMID:38076932
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研究论文 | 开发了一种结合CRISPR筛选和空间转录组学的新方法Perturb-FISH，用于研究单细胞分辨率下的遗传和分子关联 | 首次将成像空间转录组学与并行光学检测扩增的引导RNA相结合，能够同时分析细胞内、细胞间和功能转录回路 | NA | 开发一种能够在单细胞分辨率下研究空间和功能生物学遗传和分子关联的通用方法 | 培养的单核细胞、诱导多能干细胞衍生的星形胶质细胞 | 空间转录组学 | 自闭症谱系障碍 | CRISPR筛选、空间转录组学、成像技术 | NA | 转录组数据、空间位置数据、功能表型数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞转录组学 | NA | Perturb-FISH平台 |
| 9524 | 2025-10-07 |
Heterogeneity of human prostate carcinoma-associated fibroblasts implicates a role for subpopulations in myeloid cell recruitment
2020-02, The Prostate
DOI:10.1002/pros.23929
PMID:31763714
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示人类前列腺癌相关成纤维细胞的异质性及其在髓系细胞招募中的作用 | 首次在前列腺癌中发现CAF存在六个功能异质性亚群，并证实特定亚群通过分泌CCL2趋化因子招募髓系细胞 | 研究样本量有限（3321个CAF），机制研究主要基于体外实验，需要更多体内验证 | 鉴定前列腺癌相关成纤维细胞的功能亚群及其在肿瘤微环境中的作用机制 | 人类前列腺癌相关成纤维细胞（CAF）和正常前列腺成纤维细胞（NPF） | 单细胞生物学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序，贝叶斯分析，体外迁移实验 | 无监督聚类分析 | 单细胞转录组数据 | 3321个CAF细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9525 | 2025-10-07 |
OmniClust: A versatile clustering toolkit for single-cell and spatial transcriptomics data
2025-Jun, Methods (San Diego, Calif.)
DOI:10.1016/j.ymeth.2025.03.007
PMID:40057293
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研究论文 | 开发了一个名为OmniClust的多功能聚类工具包，用于单细胞和空间转录组学数据分析 | 开发了首个同时整合单细胞RNA测序和空间转录组学数据的聚类工具包，采用深度学习算法处理空间转录组数据，机器学习算法处理单细胞RNA测序数据 | NA | 开发一个能够整合单细胞和空间转录组学数据的通用聚类工具包 | 单细胞RNA测序数据和空间转录组学数据 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序，空间转录组学 | 深度学习，机器学习 | 转录组数据 | 12个空间转录组基准数据集和4个单细胞RNA测序基准数据集 | NA | 单细胞RNA-seq，空间转录组学 | NA | NA |
| 9526 | 2025-10-07 |
Senescent Syncytiotrophoblast Secretion During Early Onset Preeclampsia
2025-May, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
|
研究论文 | 本研究通过单核RNA测序和空间转录组学分析，发现早发性子痫前期中胎盘合体滋养层细胞存在衰老相关分泌表型 | 首次在早发性子痫前期中鉴定出合体滋养层细胞的衰老相关分泌表型，并发现其分泌标志物在妊娠早期母血中已升高 | 需要进一步研究验证这些生物标志物在更大人群中的预测价值 | 识别早发性子痫前期的早期标志物和信号通路 | 人类母胎界面单位（胎儿绒毛和母体蜕膜） | 空间转录组学 | 子痫前期 | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 来自多中心队列的胎盘组织 | NA | 单核RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9527 | 2025-02-23 |
Decoding cell-cell communication using spatial transcriptomics
2025-May, Nature reviews. Genetics
DOI:10.1038/s41576-025-00824-3
PMID:39984677
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9528 | 2025-10-07 |
Identification of the crucial roles of BAXhigh NK cells in human derived mesenchymal stem cell therapy for chronic heart failure patients
2025-May, Pathology, research and practice
DOI:10.1016/j.prp.2025.155924
PMID:40174277
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析，揭示了BAX高表达NK细胞在间充质干细胞治疗慢性心力衰竭中的关键作用机制 | 首次发现BAX高表达NK细胞在心力衰竭发病机制中的作用，并阐明间充质干细胞通过抑制BAX表达改善NK细胞功能的治疗机制 | 样本量有限，机制研究仍需进一步实验验证 | 探究间充质干细胞治疗心力衰竭的分子机制 | 慢性心力衰竭患者的外周血单个核细胞 | 单细胞组学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析 | NA | 单细胞转录组数据 | 心力衰竭患者治疗前后外周血样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9529 | 2025-10-07 |
Identification of a cancer stem cell-like subpopulation that promotes HCC metastasis
2025-May, JHEP reports : innovation in hepatology
IF:9.5Q1
DOI:10.1016/j.jhepr.2024.101302
PMID:40242316
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，鉴定并表征了肝细胞癌中促进转移的癌症干细胞样亚群 | 首次在肝细胞癌中鉴定出促进转移的癌症干细胞样亚群，并揭示其通过ICAM1信号通路诱导免疫抑制微环境的新机制 | 样本量相对有限（19例单细胞RNA测序样本和12例空间转录组样本），需要更大规模研究验证 | 探索癌症干细胞在肝细胞癌转移中的作用机制 | 肝细胞癌患者肿瘤组织中的癌症干细胞样细胞 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 生物信息学分析, 免疫组织化学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据, 临床队列数据 | 19例肝细胞癌样本（单细胞RNA测序）, 12例肝细胞癌样本（空间转录组）, 9个临床队列 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9530 | 2025-04-19 |
Single-Cell Transcriptomics Revealed E-Cigarettes-Induced Vascular Remodeling by Enhancing Tcf21 Expression
2025-May, MedComm
IF:10.7Q1
DOI:10.1002/mco2.70183
PMID:40248042
|
NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 9531 | 2025-10-07 |
CRISPR/Cas9-mediated SHP-1-knockout T cells combined with simvastatin enhances anti-tumor activity in humanized-PDX HCC model
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112266
PMID:40241752
|
研究论文 | 本研究通过CRISPR/Cas9敲除SHP-1的CD8 T细胞联合辛伐他汀治疗，增强了对肝细胞癌的抗肿瘤活性 | 首次将CRISPR编辑的SHP-1敲除T细胞与HMGCR抑制剂辛伐他汀联合使用，通过双重策略克服肝癌免疫治疗耐药性 | 研究基于人源化PDX模型，尚未进行临床试验验证 | 开发增强肝细胞癌免疫治疗疗效的新策略 | 肝细胞癌患者T细胞、人源化PDX肝癌模型 | 癌症免疫治疗 | 肝细胞癌 | CRISPR/Cas9基因编辑、单细胞RNA测序、转录组学分析 | NA | 单细胞RNA测序数据、转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9532 | 2025-10-07 |
CXCR4+ PD-L1+ neutrophils are increased in non-survived septic mice
2025-Apr-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112083
PMID:40241761
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析脓毒症小鼠免疫细胞，揭示CXCR4+ PD-L1+中性粒细胞在非存活小鼠中增加的现象 | 首次发现非存活脓毒症小鼠血液中未成熟CXCR4+ PD-L1+中性粒细胞频率增加，并鉴定该细胞群作为治疗靶点的潜力 | 研究仅限于CLP脓毒症小鼠模型，未在人类患者中验证 | 探究中性粒细胞在脓毒症高炎症表型中的免疫学机制 | 存活和非存活的CLP脓毒症小鼠 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 脓毒症小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9533 | 2025-10-07 |
Circular RNA discovery with emerging sequencing and deep learning technologies
2025-Apr-17, Nature genetics
IF:31.7Q1
DOI:10.1038/s41588-025-02157-7
PMID:40247051
|
综述 | 本文总结了环状RNA发现、表征和功能分析算法的最新突破 | 整合长读长和单细胞RNA测序技术与深度学习算法，以前所未有的分辨率和规模研究环状RNA | 整合大规模环状RNA测序数据仍面临挑战 | 探索环状RNA在基因调控和疾病发病机制中的作用 | 环状RNA分子 | 自然语言处理 | NA | 长读长测序, 单细胞RNA测序 | 深度学习 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9534 | 2025-10-07 |
Bulk RNA-seq conjoined with ScRNA-seq analysis reveals the molecular characteristics of nucleus pulposus cell ferroptosis in rat aging intervertebral discs
2025-Apr-17, Arthritis research & therapy
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s13075-025-03550-7
PMID:40247370
|
研究论文 | 本研究通过整合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq分析，揭示了大鼠衰老椎间盘中髓核细胞铁死亡的分子特征 | 首次结合bulk RNA-seq和单细胞RNA-seq技术系统鉴定髓核细胞铁死亡的关键驱动因子和细胞亚群特征 | 研究仅在大鼠模型中进行，需要进一步在人类样本中验证 | 明确椎间盘退变过程中髓核细胞铁死亡的关键驱动因子和细胞亚群特征 | 大鼠尾椎间盘的髓核组织和细胞 | 单细胞组学 | 椎间盘退变 | bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 普鲁士蓝染色, 荧光探针检测 | NA | 基因表达数据, 组织染色图像 | 10月龄和20月龄大鼠椎间盘组织 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 9535 | 2025-10-07 |
Progranulin deficiency in the brain: the interplay between neuronal and non-neuronal cells
2025-Apr-16, Translational neurodegeneration
IF:10.8Q1
DOI:10.1186/s40035-025-00475-8
PMID:40234992
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综述 | 本文综述了颗粒蛋白前体缺乏在脑部疾病中的作用机制，重点关注神经元与非神经元细胞之间的相互作用 | 系统阐述了颗粒蛋白前体缺乏导致神经退行性病变的非细胞自主机制，特别关注脂滴积累小胶质细胞和髓鞘脂质含量改变等新发现 | NA | 探讨颗粒蛋白前体缺乏如何通过不同脑细胞群体及其异常相互作用导致额颞叶痴呆的神经退行性变和神经炎症 | 神经元、小胶质细胞、星形胶质细胞、少突胶质细胞、内皮细胞和周细胞等脑部细胞群体 | 神经科学 | 额颞叶痴呆 | 单细胞转录组学、诱导多能干细胞技术、基因工程器官样体 | NA | 患者脑组织、生物体液、体外模型数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9536 | 2025-10-07 |
Senescence-induced p21high macrophages contributed to CD8+ T cells-related immune hyporesponsiveness in kidney transplantation via Zfp36/IL-27 axis
2025-Apr-15, Cell discovery
IF:13.0Q1
DOI:10.1038/s41421-025-00784-2
PMID:40234384
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研究论文 | 本研究揭示了衰老诱导的p21高表达巨噬细胞通过Zfp36/IL-27轴抑制CD8+ T细胞功能，从而减轻肾移植排斥反应的机制 | 首次发现衰老相关巨噬细胞通过Zfp36调控IL-27表达影响CD8+ T细胞功能的免疫抑制机制 | 研究主要基于小鼠模型，临床验证仍需进一步开展 | 探究衰老免疫系统对肾移植排斥反应的影响机制 | 肾移植受者和小鼠移植模型 | 免疫学 | 肾移植排斥反应 | 单细胞转录组分析，基因敲除，siRNA沉默，中和抗体 | 小鼠肾移植模型，条件性基因敲除模型 | 临床数据，单细胞转录组数据，体外功能实验数据 | 来自中国和德国两个医疗中心的临床数据，小鼠移植模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9537 | 2025-10-07 |
Redefining the high variable genes by optimized LOESS regression with positive ratio
2025-Apr-15, BMC bioinformatics
IF:2.9Q1
DOI:10.1186/s12859-025-06112-5
PMID:40234751
|
研究论文 | 开发了一种基于优化LOESS回归的单细胞RNA测序特征选择算法 | 利用优化的局部加权散点平滑回归精确捕捉基因平均表达水平与阳性比率的关系，同时最小化过拟合 | NA | 提高单细胞RNA测序数据的特征选择效果 | 单细胞RNA测序数据中的高变基因 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | LOESS回归 | 基因表达数据 | NA | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 9538 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptomic dynamics of scallop heart reveals the heterogeneous response to heat stress
2025-Apr-15, BMC biology
IF:4.4Q1
DOI:10.1186/s12915-025-02210-1
PMID:40234911
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了扇贝心脏在热应激下的异质性响应机制 | 首次在开放循环系统动物中揭示心室肌细胞和心房肌细胞对热应激的差异化响应模式，并鉴定出关键热响应基因PLRP2-like | 研究仅针对单一物种，未涉及其他开放循环系统动物的比较分析 | 探究开放循环系统动物心脏对高温应激的细胞异质性响应机制 | 软体动物模型Argopecten irradians（扇贝）的心脏组织 | 单细胞生物学 | 热应激反应 | 单细胞RNA测序，RNA干扰 | NA | 单细胞转录组数据，形态学数据，代谢数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9539 | 2025-10-07 |
Patterns of hemolysis, erythropoiesis, and iron distribution define unique disease trajectories in three mouse models of genetic anemia
2025-Apr-15, Experimental hematology
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.exphem.2025.104787
PMID:40245977
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研究论文 | 本研究系统比较了三种遗传性贫血小鼠模型的溶血模式、红细胞生成和铁分布特征 | 首次通过综合比较三种常见遗传性贫血模型，揭示了它们在溶血模式、铁代谢和红细胞生成方面的独特疾病轨迹 | 研究仅限于小鼠模型，结果向人类疾病的转化需要进一步验证 | 阐明不同遗传性贫血模型的病理生理差异，为疾病研究和治疗开发提供模型选择依据 | 镰状细胞病、β-地中海贫血和遗传性球形红细胞增多症的小鼠模型 | 血液病研究 | 遗传性贫血 | 单细胞RNA测序, 铁同位素示踪 | NA | 基因表达数据, 代谢数据 | 三种遗传性贫血小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9540 | 2025-10-07 |
Unveiling hypoxia-related prognostic and immunotherapeutic biomarkers in lung adenocarcinoma through single-cell and bulk RNA sequencing: Including insights into PGF
2025-Apr-12, International journal of biological macromolecules
IF:7.7Q1
DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.143056
PMID:40228772
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研究论文 | 本研究通过单细胞和bulk RNA测序揭示肺腺癌中缺氧相关的预后和免疫治疗生物标志物 | 识别了与晚期肺腺癌相关的新细胞亚型，发现了高缺氧评分的细胞亚型模块，构建了基于缺氧相关分子簇的新型预后特征 | 样本量相对较小(15例患者)，机制研究仍需进一步验证 | 探索缺氧微环境与免疫抵抗相互作用的机制 | 肺腺癌患者肿瘤微环境中的细胞亚型 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, 空间转录组分析 | 预后特征模型 | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 15例肺腺癌患者 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, bulk RNA测序 | NA | NA |