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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 921 - 940 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 921 | 2025-10-05 |
Partial Compensation of IL-17 Production by Vγ1 T Cells in the Absence of Vγ4 and Vγ6 T Cells
2025-Sep, European journal of immunology
IF:4.5Q2
DOI:10.1002/eji.70061
PMID:40974348
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研究论文 | 本研究探讨了在缺乏Vγ4和Vγ6 γδ T细胞的情况下，Vγ1 T细胞对IL-17产生的部分补偿作用 | 首次揭示Vγ1 T细胞在Vγ4/Vγ6缺失条件下对IL-17产生的有限补偿能力，并明确Vγ4⁺和Vγ6⁺亚群在IL-17介导免疫中的不可替代作用 | 研究仅限于小鼠模型，尚未在人类中验证；补偿机制的具体分子通路尚未完全阐明 | 探究IL-17产生型γδ T细胞中γδ TCR的生物学功能和重要性 | 缺乏Vγ4和Vγ6 γδ TCR的小鼠模型中的γδ T细胞 | 免疫学 | NA | 流式细胞术, TCR测序, 单细胞转录组学 | NA | 单细胞基因表达数据, TCR序列数据, 流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 922 | 2025-10-05 |
Efferocytosis and M2 Macrophage Polarization Gene Expression Correlates With Relapsed and Refractory Classical Hodgkin Lymphoma Patients: A Multi-Omic Analysis
2025-Sep, Hematological oncology
IF:3.3Q2
DOI:10.1002/hon.70135
PMID:40976706
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研究论文 | 通过多组学分析揭示霍奇金淋巴瘤中胞葬作用和M2巨噬细胞极化基因表达与治疗失败的相关性 | 开发了37基因HRS细胞特征用于单细胞数据识别，首次发现胞葬作用介导的M2巨噬细胞极化是cHL的关键免疫检查点 | 样本量相对有限（130例患者），需进一步验证模型的临床适用性 | 研究经典霍奇金淋巴瘤治疗失败的预测因子和免疫微环境机制 | 经典霍奇金淋巴瘤患者和HRS细胞 | 生物信息学 | 霍奇金淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 批量转录组分析, 细胞互作分析 | 岭回归模型, 层次聚类 | 基因表达数据, 单细胞数据 | 130例cHL患者 | NA | 单细胞RNA测序, 批量转录组测序 | NA | NA |
| 923 | 2025-10-05 |
A comprehensive comparison on clustering methods for multi-slice spatially resolved transcriptomics data analysis
2025-Aug-31, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf471
PMID:40966657
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研究论文 | 本文对多切片空间转录组学数据的聚类方法进行了全面比较评估 | 首次系统评估了多切片空间转录组数据的聚类方法，并研究了空间坐标对齐和批次效应去除等预处理技术对聚类性能的影响 | 研究仅评估了特定的聚类方法和预处理技术，可能未涵盖所有现有方法 | 评估和比较单切片和多切片空间转录组数据的聚类方法性能 | 空间转录组数据聚类方法 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 聚类算法 | 空间转录组数据 | 2个模拟数据集和4个真实数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 924 | 2025-10-05 |
Uncovering Functional Gene Regulatory Networks in Bulk and Single-Cell Data through Robust Transcription Factor Activity Estimation and Model-Guided Experimental Validation
2025-Jul-26, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.09.658650
PMID:40661601
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研究论文 | 提出MERLIN+P+TFA方法，通过先验知识引导的稀疏正则化稳健估计转录因子活性和基因调控网络 | 使用先验知识引导的稀疏正则化方法，在存在先验知识噪声的情况下仍能准确估计转录因子活性和下游基因调控网络 | 需要生成特定背景的金标准来提高网络推断的准确性 | 重建基因组规模的基因调控网络 | 酵母和哺乳动物系统的模拟和真实表达数据，包括小鼠胚胎干细胞 | 系统生物学 | NA | 基因调控网络推断，转录因子活性估计 | MERLIN+P+TFA | 基因表达数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 925 | 2025-10-05 |
Monocyte-Derived Macrophages-Synovial Fibroblasts Crosstalk Unravels Oncostatin Signaling Network as a Driver of Synovitis in Osteoarthritis
2025-Jul-07, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43299
PMID:40621694
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了骨关节炎中巨噬细胞亚群的异质性及其与滑膜成纤维细胞的相互作用机制 | 首次发现单核细胞来源的巨噬细胞通过OSM/OSMR信号网络驱动滑膜成纤维细胞活化，并鉴定出MERTKlow CD48high CCR2+巨噬细胞亚群作为OSM的关键来源 | 研究样本量有限（仅4例OA患者），且主要基于胶原酶诱导的OA小鼠模型 | 探究骨关节炎中巨噬细胞亚群的异质性、起源及其与基质细胞的通讯机制 | 胶原酶诱导OA小鼠的滑膜细胞和4例OA患者的CD14+巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 骨关节炎 | 单细胞RNA测序, 流式细胞术, 遗传命运图谱, 成像质谱流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据, 图像数据 | 4例OA患者样本和胶原酶诱导OA小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 926 | 2025-10-05 |
Statistical significance of clustering for count data
2025-Jul-03, Biometrics
IF:1.4Q2
DOI:10.1093/biomtc/ujaf120
PMID:40971569
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研究论文 | 提出了一种用于评估计数数据聚类显著性的新方法SigClust-DEV | 开发了专门针对计数数据的聚类显著性评估方法，解决了传统SigClust方法在离散数据上统计效能不足的问题 | 未明确说明方法在极端稀疏计数数据或超大规模数据集上的性能表现 | 开发适用于计数数据的聚类显著性评估方法 | 计数数据，包括单细胞RNA测序数据和电子健康记录 | 机器学习 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | SigClust-DEV | 计数数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 927 | 2025-10-05 |
Linking Skin and Joint Inflammation in Psoriatic Arthritis through Shared CD8+ T Cell Clones
2025-Jun-17, Arthritis & rheumatology (Hoboken, N.J.)
DOI:10.1002/art.43286
PMID:40528683
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和空间转录组学分析，揭示了银屑病关节炎患者皮肤和关节中CD8+ T细胞的克隆共享现象 | 首次在银屑病关节炎中证实皮肤和关节炎症通过共享的CD8+ T细胞克隆相连，并发现这些细胞具有组织驻留记忆表型 | 样本量较小（6例皮肤样本，5例配对滑膜组织/滑液样本），空间转录组学数据有限 | 验证银屑病关节炎中皮肤和关节炎症通过CD8+ T细胞表型和克隆性相连的假说 | 银屑病关节炎患者的皮肤、滑膜组织和滑液样本 | 单细胞生物学 | 银屑病关节炎 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, T细胞受体谱分析 | NA | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据, T细胞受体序列数据 | 6例皮肤样本，5例配对滑膜组织样本，5例配对滑液样本，1例配对皮肤和滑膜活检样本，4例非配对活检样本 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 928 | 2025-10-05 |
New insights into the effects of PFOS exposure on rat lung development: morphological, functional, and single-cell sequencing analysis
2025-06, Archives of toxicology
IF:4.8Q1
DOI:10.1007/s00204-025-04014-2
PMID:40128328
|
研究论文 | 本研究通过形态学、功能学和单细胞测序分析，探讨了产前PFOS暴露对大鼠后代肺发育的影响 | 首次结合单细胞RNA测序技术系统揭示PFOS暴露对肺发育的细胞和分子机制，发现Fam111a上调和Stk35下调等新基因靶点 | 研究仅使用大鼠模型，结果外推至人类需谨慎；未探讨PFOS与其他环境污染物的联合效应 | 探究PFOS暴露对肺发育的毒性机制和长期健康风险 | 孕鼠及其后代大鼠的肺组织 | 毒理学 | 肺发育异常 | 单细胞RNA测序，形态学分析，肺功能检测，代谢组学分析 | NA | 基因表达数据，形态学图像，生理功能数据，代谢物数据 | 孕鼠暴露于4个剂量组(0, 0.01, 0.1, 1 mg/kg/天)，在后代0、4、14、21和60天龄时取样分析 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 929 | 2025-10-05 |
INLAomics for Scalable and Interpretable Spatial Multiomic Data Integration
2025-May-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.02.651831
PMID:40654897
|
研究论文 | 开发INLAomics框架用于空间多组学数据的可扩展和可解释集成分析 | 提出基于多元分层贝叶斯框架的空间多组学集成方法，克服现有方法忽略空间背景和可解释性差的局限 | 未提及具体的数据规模限制或计算资源需求 | 开发可扩展且可解释的空间多组学数据集成方法 | 空间转录组数据和基于抗体的蛋白质组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学，抗体蛋白质组学 | 多元分层贝叶斯框架 | 空间多组学数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞多组学 | NA | NA |
| 930 | 2025-10-05 |
Spatially resolved transcriptomic profiling for glomerular and tubulointerstitial gene expression in C3 glomerulopathy
2025-May, Clinical kidney journal
IF:3.9Q1
DOI:10.1093/ckj/sfaf139
PMID:40416397
|
研究论文 | 本研究利用空间转录组技术分析C3肾小球病的肾小球和肾小管间质基因表达特征 | 首次应用空间转录组技术对C3肾小球病进行亚结构特异性基因表达谱分析 | 样本量较小（仅3例C3G病例），需要更大规模研究验证 | 探究C3肾小球病的转录组特征和病理机制 | 人类肾脏活检标本（C3G患者、供体肾脏和其他肾小球肾炎患者） | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | 3例C3G病例、7例供体对照、41例其他肾小球肾炎疾病对照 | NA | 空间转录组学 | GeoMx Digital Spatial Profiler | GeoMx Digital Spatial Profiler与福尔马林固定石蜡包埋肾脏活检标本 |
| 931 | 2025-10-05 |
CellSP: Module discovery and visualization for subcellular spatial transcriptomics data
2025-Apr-18, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.01.12.632553
PMID:39868198
|
研究论文 | 开发用于亚细胞空间转录组数据分析的计算框架CellSP，能够识别、可视化和表征mRNA的一致亚细胞空间模式 | 提出“基因-细胞模块”概念，首次提供识别和解释亚细胞转录分布功能相关空间模式的工具 | NA | 解决亚细胞空间转录组数据中功能相关空间模式识别和解释工具缺乏的问题 | 小鼠脑组织、肾脏癌和健康样本、阿尔茨海默病小鼠模型 | 空间转录组学 | 肾脏癌,阿尔茨海默病 | 空间转录组学 | 计算框架 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 932 | 2025-10-05 |
High-resolution reconstruction of cell-type specific transcriptional regulatory processes from bulk sequencing samples
2025-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.04.02.646189
PMID:40291712
|
研究论文 | 提出一种名为DeepDETAILS的新型深度学习框架，能够从批量测序样本中高分辨率重建细胞类型特异性转录调控过程 | 开发了基于深度学习的跨模态反卷积方法，可利用scATAC-seq参考库对其他批量组学数据集进行细胞类型特异性信号重建，达到碱基对精度 | 依赖于scATAC-seq参考数据的可用性和质量，未明确说明模型对数据稀缺情况的处理能力 | 实现从批量测序数据中高分辨率重建细胞类型特异性基因组信号 | 人类组织和细胞类型，包括39种不同人体组织和86种不同细胞类型 | 机器学习 | 原发性硬化性胆管炎 | 深度学习，单细胞ATAC测序，染色质免疫沉淀测序，新生转录测序 | 深度学习框架 | 基因组测序数据 | 39种人体组织和86种细胞类型 | NA | 单细胞ATAC-seq, ChIP-seq, PRO-cap, PRO-seq | NA | NA |
| 933 | 2025-10-05 |
Inhibition of bone morphogenetic protein 4 alleviates angiotensin II-induced abdominal aortic aneurysm by reducing inflammation and endothelial-mesenchymal transition
2025-04, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示BMP4在血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤中通过调节内皮-间质转化和炎症促进疾病进展的机制 | 首次发现BMP4在腹主动脉瘤进展中的关键作用，并阐明其通过BGN结合和PI3K/AKT/mTOR通路诱导内皮细胞表型转换的机制 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性需要进一步验证 | 探究腹主动脉瘤的发病机制及BMP4在其中的作用 | 血管紧张素II诱导的腹主动脉瘤小鼠模型和鼠主动脉内皮细胞 | 单细胞测序分析 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序, 伪时间轨迹分析, 蛋白质-蛋白质相互作用分析, 共免疫沉淀 | 小鼠疾病模型 | 单细胞转录组数据 | 未明确说明具体样本数量 | 10x Genomics | single-cell RNA-seq | 10x Chromium | 10x单细胞测序分析 |
| 934 | 2025-10-05 |
Integrative analysis of single-cell transcriptomics and genetic associations identify cell states associated with vascular disease
2025-04, Atherosclerosis
IF:4.9Q1
|
研究论文 | 通过整合单细胞转录组学和遗传关联分析，识别与血管疾病相关的细胞状态 | 开发新的计算方法整合GWAS数据与单核RNA测序数据，识别血管疾病相关的特定细胞亚群和中间状态 | 样本量相对较小（正常n=7，动脉瘤n=9，动脉粥样硬化n=2），仅使用人类升主动脉组织 | 识别导致早期血管功能障碍的特定血管亚群和中间细胞状态 | 人类升主动脉组织（正常、动脉瘤和动脉粥样硬化） | 单细胞生物学 | 血管疾病 | 单核RNA测序（snRNA-seq），GWAS整合分析 | RNA轨迹分析，细胞类型特异性富集分析 | 单细胞转录组数据，遗传关联数据 | 18个样本（7正常，9动脉瘤，2动脉粥样硬化） | NA | 单核RNA测序 | NA | NA |
| 935 | 2025-10-05 |
Fate (or state) of CA2 neurons in a mineralocorticoid receptor knockout
2024-Nov-30, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.11.29.626110
PMID:39651204
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学方法探究盐皮质激素受体敲除后海马CA2区神经元的命运变化 | 首次发现MR敲除导致CA2神经元获得CA1样分子表型，揭示了MR在控制CA2神经元发育状态中的关键作用 | 研究主要关注分子表型变化，对行为功能影响的直接证据不足 | 探究盐皮质激素受体敲除对海马CA2区神经元命运的影响 | 小鼠海马CA2区神经元 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | 条件性基因敲除模型 | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 936 | 2025-10-05 |
Deciphering the landscape of transcriptional heterogeneity across cancer
2023-09-11, Cancer cell
IF:48.8Q1
DOI:10.1016/j.ccell.2023.07.008
PMID:37595585
|
研究论文 | 通过整合77项研究和24种癌症类型的单细胞RNA测序数据，揭示癌症转录异质性的重复模式及其功能意义 | 首次大规模整合跨癌症类型的单细胞转录组数据，系统识别转录异质性的重复模式 | NA | 解析癌症转录异质性景观并探索其功能意义 | 24种癌症类型的单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 77项研究整合数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 937 | 2025-10-05 |
Deterministic evolution and stringent selection during preneoplasia
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06102-8
PMID:37258665
|
研究论文 | 通过人类胃类器官模型研究TP53双等位基因失活后的癌前病变演化过程 | 建立了人类胃类器官模型模拟早期肿瘤发生过程，揭示了TP53失活后染色体不稳定的演化规律和克隆选择机制 | 研究基于体外类器官模型，可能与体内真实肿瘤发生环境存在差异 | 探索人类肿瘤发生的最早期事件及其演化规律 | TP53双等位基因失活的人类胃类器官 | 癌症生物学 | 胃癌 | 单细胞测序, 高通量谱系追踪, 实验演化 | 类器官模型 | 基因组数据, 转录组数据 | 多个克隆来源的培养物，历时2年的纵向研究 | NA | 单细胞测序, 谱系追踪 | NA | NA |
| 938 | 2025-10-05 |
Hallmarks of transcriptional intratumour heterogeneity across a thousand tumours
2023-06, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-023-06130-4
PMID:37258682
|
研究论文 | 通过整合77项研究的单细胞RNA测序数据，系统分析了24种肿瘤类型中1,163个肿瘤样本的转录组瘤内异质性模式 | 首次大规模整合跨研究单细胞数据，识别出41个保守元程序并归纳为11个瘤内异质性标志 | 基于已有研究的整合分析，可能受原始数据质量和批次效应影响 | 系统表征肿瘤转录组瘤内异质性模式 | 1,163个肿瘤样本涵盖24种肿瘤类型 | 生物信息学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序 | 整合分析 | 单细胞转录组数据 | 1,163个肿瘤样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 939 | 2025-10-05 |
Systems vaccinology of the BNT162b2 mRNA vaccine in humans
2021-08, Nature
IF:50.5Q1
DOI:10.1038/s41586-021-03791-x
PMID:34252919
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研究论文 | 本研究采用系统疫苗学方法分析BNT162b2 mRNA疫苗在人体内引发的免疫反应 | 首次通过系统疫苗学方法全面描绘mRNA疫苗的免疫应答机制，揭示加强免疫显著增强先天免疫反应的特征 | 样本量相对有限（56名健康志愿者），未涵盖不同年龄组或免疫功能低下人群 | 阐明mRNA疫苗如何刺激免疫系统产生保护性免疫应答 | 56名接种辉瑞-BioNTech mRNA疫苗（BNT162b2）的健康志愿者 | 免疫学 | COVID-19 | 单细胞转录组学，系统疫苗学方法 | NA | 转录组数据，免疫细胞表型数据 | 56名健康志愿者 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 940 | 2025-10-05 |
Repopulation of microglia and its implications for CNS disorders: Insights from the single-cell era
2025-Oct-15, Neurobiology of disease
IF:5.1Q1
DOI:10.1016/j.nbd.2025.107066
PMID:40865648
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综述 | 本文综述了小胶质细胞的起源、发育、再殖和异质性研究进展，并强调单细胞时代下小胶质细胞再殖对中枢神经系统疾病的治疗意义 | 整合单细胞测序技术揭示小胶质细胞在发育、稳态和病理状态下的细胞命运决定和异质性，并探讨再殖小胶质细胞的新型治疗价值 | NA | 增强对小胶质细胞再殖的理解，为中枢神经系统疾病的新治疗策略提供见解 | 小胶质细胞 | 神经科学 | 中枢神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |