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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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9261 | 2025-10-07 |
The role of fibroblast in chronic rhinosinusitis with nasal polyps: a key player in the inflammatory process
2025-Feb, Expert review of clinical immunology
IF:3.9Q2
DOI:10.1080/1744666X.2024.2414774
PMID:39378160
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综述 | 本文综述了鼻息肉来源成纤维细胞在慢性鼻-鼻窦炎伴鼻息肉发病机制中的关键作用 | 强调了成纤维细胞在触发和加剧炎症反应中的新作用,并利用单细胞RNA测序技术探索其异质性和功能机制 | 成纤维细胞靶向治疗的临床开发仍面临挑战 | 阐明成纤维细胞在CRSwNP发病机制中的具体作用机制 | 鼻息肉来源成纤维细胞(NPDFs) | 病理学 | 慢性鼻-鼻窦炎伴鼻息肉 | 单细胞RNA测序 | NA | 文献数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9262 | 2025-10-07 |
Extraembryonic mesoderm cells derived from human embryonic stem cells rely on Wnt pathway activation
2025-Feb, Cell proliferation
IF:5.9Q2
DOI:10.1111/cpr.13761
PMID:39385268
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研究论文 | 本研究开发了一种通过激活Wnt通路从人primed胚胎干细胞分化产生胚外中胚层细胞及其后续间充质干细胞的方案 | 首次证明人primed胚胎干细胞可分化为胚外中胚层细胞并产生具有特定分化潜能的间充质干细胞 | 未明确说明样本数量和研究规模 | 探索人primed胚胎干细胞向胚外中胚层细胞分化的可能性及其后续发育潜能 | 人primed胚胎干细胞、胚外中胚层细胞、间充质干细胞 | 干细胞生物学 | NA | 单细胞转录组分析、免疫染色分析、细胞分选、三维分化培养 | NA | 转录组数据、图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9263 | 2025-10-07 |
Evidence for a lipofibroblast-to-Cthrc1 + myofibroblast reversible switch during the development and resolution of lung fibrosis in young mice
2025-Feb, The European respiratory journal
DOI:10.1183/13993003.00482-2023
PMID:39401861
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研究论文 | 本研究通过遗传谱系追踪和单细胞转录组学揭示了年轻小鼠肺纤维化过程中脂成纤维细胞与Cthrc1+肌成纤维细胞之间的可逆转换机制 | 首次发现活化的肌成纤维细胞包含四个具有不同促肺泡生成和促纤维化特征的亚群,并证实脂成纤维细胞特征高的细胞群在纤维化发生和消退过程中分别作为起源和归宿 | 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅通过数据挖掘获得,需要进一步实验验证 | 解析肺纤维化过程中活化肌成纤维细胞的异质性及其在纤维化消退过程中的分化轨迹 | 年轻小鼠肺组织及人类特发性肺纤维化数据集 | 单细胞生物学 | 肺纤维化 | 遗传谱系追踪, 单细胞转录组学, 数据挖掘, 类器官培养 | NA | 单细胞RNA测序数据, 基因表达数据 | 小鼠模型和人类IPF数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
9264 | 2025-10-07 |
Myeloid Mir34a suppresses colitis-associated colon cancer: characterization of mediators by single-cell RNA sequencing
2025-Feb, Cell death and differentiation
IF:13.7Q1
DOI:10.1038/s41418-024-01380-9
PMID:39425000
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示了髓系细胞中Mir34a缺失通过调控巨噬细胞极化状态抑制结肠炎相关结肠癌的机制 | 首次在体内证明髓系特异性Mir34a通过维持巨噬细胞M1样状态发挥肿瘤抑制作用,并发现新的炎症性CAC细胞亚型 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明髓系细胞中Mir34a在结肠炎相关结肠癌中的肿瘤抑制机制 | 髓系特异性Mir34a敲除小鼠的结肠炎相关结肠癌模型 | 单细胞测序 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9265 | 2025-10-07 |
Aging alters the effect of adiponectin receptor signaling on bone marrow-derived mesenchymal stem cells
2025-Feb, Aging cell
IF:8.0Q1
DOI:10.1111/acel.14390
PMID:39462849
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研究论文 | 本研究探讨衰老如何改变脂联素受体信号对骨髓间充质干细胞的影响 | 首次揭示衰老通过改变脂联素受体表达和下游信号通路激活差异,逆转脂联素受体激动剂对骨再生的治疗效果 | 研究仅在小鼠模型中进行,尚未在人类样本中验证 | 阐明衰老对脂联素受体信号在骨稳态和骨折修复中作用的调节机制 | 年轻和老年小鼠的骨髓间充质干细胞 | 干细胞生物学 | 骨质疏松 | 单细胞测序, 体内染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白表达数据 | 年轻和老年小鼠骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9266 | 2025-10-07 |
Sensory neuroimmune signaling in the pathogenesis of Stevens-Johnson syndrome and toxic epidermal necrolysis
2025-Feb, The Journal of allergy and clinical immunology
IF:11.4Q1
DOI:10.1016/j.jaci.2024.10.015
PMID:39481654
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研究论文 | 本研究探讨了感觉神经免疫信号在史蒂文斯-约翰逊综合征和中毒性表皮坏死松解症发病机制中的作用 | 首次揭示CGRP-RAMP1轴通过HCN2离子通道增强CD8+T细胞IL-15/IL-18受体表达和细胞毒性,阐明神经元素在皮肤炎症中的调控机制 | 未明确不同触发药物对神经免疫信号通路的影响差异 | 探究SJS/TEN发病过程中的神经免疫调节机制 | 健康对照和SJS/TEN患者的循环CD8+T细胞及皮肤组织 | 免疫学 | 史蒂文斯-约翰逊综合征/中毒性表皮坏死松解症 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,ELISA,LEGENDplex,免疫荧光染色,钙成像,Smart-seq,3D皮肤模型 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,图像数据 | 健康对照和SJS/TEN患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9267 | 2025-10-07 |
From metabolomics to therapeutics: identifying causal metabolites and potential drugs for the treatment of osteoarthritis
2025-Feb, Inflammopharmacology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s10787-024-01594-w
PMID:39488818
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研究论文 | 通过代谢组学孟德尔随机化研究识别骨关节炎的因果代谢物和潜在治疗靶点 | 首次采用大规模代谢组学孟德尔随机化方法系统识别与骨关节炎因果相关的血液代谢物 | 研究基于欧洲人群数据,结果可能不适用于其他族裔群体 | 识别骨关节炎的因果代谢物和潜在治疗靶点 | 骨关节炎患者和健康对照人群 | 生物信息学 | 骨关节炎 | 孟德尔随机化, 全基因组关联研究, 单细胞测序, 蛋白质相互作用网络分析 | NA | 基因组数据, 代谢组数据, 基因表达数据 | 总计231,625例病例和1,218,499例对照 | NA | 全基因组关联分析, 单细胞测序 | NA | NA |
9268 | 2025-10-07 |
p53 mutation biases squamocolumnar junction progenitor cells towards dysplasia rather than metaplasia in Barrett's oesophagus
2025-Jan-17, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-332095
PMID:39353725
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研究论文 | 本研究探讨p53突变在Barrett食管向食管腺癌进展过程中对贲门祖细胞命运和功能的影响 | 首次揭示p53突变通过Notch信号通路激活抑制干细胞分化,直接导致发育异常而非通过化生阶段 | 研究基于小鼠模型,在人类中的适用性需要进一步验证 | 阐明p53突变在Barrett食管癌变过程中的作用机制 | 贲门祖细胞(Cck2r+ cardia progenitor cells) | 分子病理学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,谱系追踪,类器官培养,原位移植 | L2-IL1β小鼠模型 | 基因表达数据,病理图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9269 | 2025-10-07 |
Development of the TP53 mutation associated hypopharyngeal squamous cell carcinoma prognostic model through bulk multi-omics sequencing and single-cell sequencing
2025 Jan-Feb, Brazilian journal of otorhinolaryngology
IF:1.7Q2
DOI:10.1016/j.bjorl.2024.101499
PMID:39341197
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研究论文 | 本研究基于TP53突变构建了下咽鳞状细胞癌预后模型,并通过单细胞测序验证了模型相关基因的表达特征 | 首次结合bulk多组学测序和单细胞测序技术,构建基于TP53突变的下咽鳞状细胞癌预后风险评分模型 | 研究主要依赖公共数据库数据,缺乏独立的前瞻性验证队列 | 构建基于TP53突变的下咽鳞状细胞癌预后预测模型 | 下咽鳞状细胞癌患者样本 | 生物信息学 | 下咽鳞状细胞癌 | bulk多组学测序, 单细胞测序, GSEA, Cox分析, LASSO分析 | 预后风险评分模型 | 基因组突变数据, 转录组数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和6个GEO数据集的下咽鳞状细胞癌样本 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
9270 | 2025-10-07 |
Single-cell Profiling of Intrahepatic Immune Cells Reveals an Expansion of Tissue-resident Cytotoxic CD4+ T Lymphocyte Subset Associated With Pathogenesis of Alcoholic-associated Liver Diseases
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101411
PMID:39349248
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示酒精相关肝病中组织驻留细胞毒性CD4+ T淋巴细胞亚群的扩增及其在疾病发病机制中的作用 | 首次在酒精相关肝病中发现以GZMK表达为特征的细胞毒性CD4+ T淋巴细胞亚群显著扩增,并揭示其组织驻留特性和终末效应状态 | 研究样本量有限,需要更大规模队列验证发现 | 探索酒精相关肝病中肝脏免疫细胞的转录组特征和免疫病理机制 | 健康个体、代谢功能障碍相关脂肪性肝病患者和酒精相关肝病患者的肝脏样本 | 单细胞生物学 | 酒精相关肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 健康个体、MASLD和ALD患者的肝脏样本,包含独立验证队列 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9271 | 2025-10-07 |
Pathogenesis of Germinal Matrix Hemorrhage: Insights from Single-Cell Transcriptomics
2025-Jan, Annual review of pathology
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综述 | 通过单细胞转录组学探讨胚胎人脑生发基质出血的发病机制 | 首次系统整合单细胞转录组学数据揭示生发基质中免疫-血管相互作用的调控机制 | 主要基于已有研究数据的整合分析,缺乏原始实验验证 | 阐明早产儿生发基质出血的分子机制 | 胚胎人脑生发基质的神经发生和血管生成过程 | 数字病理学 | 新生儿脑出血 | 单细胞转录组测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
9272 | 2025-10-07 |
The Human Milk-derived Peptide Drives Rapid Regulation of Macrophage Inflammation Responses in the Neonatal Intestine
2025, Cellular and molecular gastroenterology and hepatology
IF:7.1Q1
DOI:10.1016/j.jcmgh.2024.101420
PMID:39414025
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研究论文 | 本研究鉴定了人乳细胞外囊泡中的一种新型肽CASB135-150,发现其通过靶向肠道巨噬细胞快速调节炎症反应并保护新生儿肠道健康 | 首次在人乳细胞外囊泡中鉴定出β-酪蛋白衍生肽CASB135-150,并阐明其通过破坏FHL2/TRAF6复合物抑制NF-κB信号通路的分子机制 | 研究主要基于大鼠坏死性小肠结肠炎模型,尚未在人类临床研究中验证 | 探索人乳肽在调节新生儿先天免疫稳态和肠道健康中的作用 | 人乳细胞外囊泡肽、大鼠坏死性小肠结肠炎模型、骨髓源性巨噬细胞、肠道巨噬细胞 | 免疫学 | 坏死性小肠结肠炎 | 单细胞RNA测序,免疫荧光分析,蛋白质相互作用分析,免疫共沉淀,RNA测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质相互作用数据,组织图像数据 | 大鼠坏死性小肠结肠炎模型 | NA | 单细胞RNA测序,RNA测序 | NA | NA |
9273 | 2025-10-07 |
Impact of potential biomarkers, SNRPE, COX7C, and RPS27, on idiopathic Parkinson's disease
2025-Jan, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01591-x
PMID:39467967
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研究论文 | 通过生物信息学方法鉴定特发性帕金森病的潜在生物标志物SNRPE、COX7C和RPS27 | 首次通过整合全血基因表达、DNA甲基化、microRNA和单细胞RNA测序数据系统筛选帕金森病生物标志物 | 研究主要基于生物信息学分析,需要实验验证 | 识别特发性帕金森病的关键基因和分子机制 | 特发性帕金森病患者 | 生物信息学 | 帕金森病 | 基因表达分析,DNA甲基化分析,microRNA分析,单细胞RNA测序 | 蛋白质-蛋白质相互作用网络分析 | 基因表达数据,甲基化数据,microRNA数据,单细胞RNA测序数据 | 特发性帕金森病患者全血样本 | NA | 单细胞RNA测序,全血基因表达分析 | NA | NA |
9274 | 2025-10-07 |
Machine learning identification of NK cell immune characteristics in hepatocellular carcinoma based on single-cell sequencing and bulk RNA sequencing
2025-Jan, Genes & genomics
IF:1.6Q3
DOI:10.1007/s13258-024-01581-z
PMID:39433650
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序和bulk RNA测序结合机器学习方法,鉴定肝细胞癌中NK细胞的免疫特征标志物CD7 | 首次结合单细胞测序和bulk RNA测序,利用机器学习方法系统鉴定肝细胞癌中NK细胞的免疫特征标志物CD7 | 样本量较小(8例正常肝组织和8例HCC肿瘤组织),需要更大样本验证 | 鉴定肝细胞癌中具有NK细胞免疫特征的分子标志物 | 肝细胞癌组织中的NK细胞 | 机器学习 | 肝细胞癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,RT-qPCR,MTS,流式细胞术 | 机器学习模型 | 单细胞RNA测序数据,bulk RNA测序数据 | 8例正常肝组织和8例HCC肿瘤组织 | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
9275 | 2025-10-07 |
Challenges and Opportunities in the Clinical Translation of High-Resolution Spatial Transcriptomics
2025-Jan, Annual review of pathology
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综述 | 探讨高分辨率空间转录组学技术在临床转化中的挑战与机遇 | 首次系统阐述分子显微镜技术在临床样本中的应用潜力及与深度学习整合的前景 | 未提供具体临床验证数据,主要基于技术原理和发展趋势分析 | 推动空间转录组学技术的临床转化和应用 | 常规采集和存档的临床组织样本 | 数字病理 | NA | 空间转录组学,下一代测序 | 深度学习 | 空间基因表达数据,组织切片图像 | NA | NA | 空间转录组学,单细胞分辨率基因表达分析 | NA | 亚细胞分辨率完整组织切片基因表达数字化技术 |
9276 | 2025-10-07 |
Therapeutic targets for hepatocellular carcinoma identified using proteomics and Mendelian randomization
2025-Jan, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.16785
PMID:39477889
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研究论文 | 本研究通过蛋白质组学和孟德尔随机化方法识别肝细胞癌的潜在治疗靶点 | 首次整合血浆蛋白质组数据与HCC数据,应用MR方法系统识别10个与HCC风险相关的蛋白质生物标志物 | 研究依赖于公开数据库数据,需要进一步实验验证 | 识别肝细胞癌的潜在治疗靶点和蛋白标志物 | 肝细胞癌患者和蛋白质生物标志物 | 生物信息学 | 肝细胞癌 | 蛋白质组学, 孟德尔随机化, 单细胞测序, KEGG通路分析, PPI分析 | 孟德尔随机化模型 | 蛋白质组数据, 基因组数据 | 多个GWAS研究队列(7个已发表GWAS), DeCODE队列, FinnGen队列, UK Biobank | NA | 蛋白质组学, 单细胞测序 | NA | NA |
9277 | 2025-10-07 |
RAC2 as a Tumor-Suppressive Biomarker Associated with T Cell Infiltration in Breast Cancer
2025-Jan, Cancer biotherapy & radiopharmaceuticals
DOI:10.1089/cbr.2024.0142
PMID:39479793
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研究论文 | 本研究探讨RAC2在乳腺癌中的表达及其与免疫细胞浸润的关系 | 首次系统揭示RAC2作为抑癌生物标志物与T细胞浸润的关联,并验证其诊断和预后价值 | 研究主要基于公共数据库分析,需要进一步实验验证 | 探索RAC2在乳腺癌中的作用机制及其临床价值 | 乳腺癌组织和正常组织 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序, 免疫组化分析, 基因集富集分析 | ROC曲线分析 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | 来自TCGA和GEO数据库的乳腺癌样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | NA |
9278 | 2025-10-07 |
S100A8/A9 high-expression macrophages mediate renal tubular epithelial cell damage in acute kidney injury following acute type A aortic dissection surgery
2025, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2025.1530741
PMID:40270593
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研究论文 | 本研究探讨S100A8/A9高表达巨噬细胞在A型主动脉夹层术后急性肾损伤中对肾小管上皮细胞的损伤机制 | 首次揭示S100A8/A9通过促进巨噬细胞向M1表型转化并激活TNF信号通路导致急性肾损伤的机制 | 研究主要基于小鼠模型和细胞实验,尚未在人体临床样本中验证 | 阐明S100A8/A9在A型主动脉夹层术后急性肾损伤中的分子机制 | 肾小管上皮细胞(TCMK-1)、巨噬细胞(RAW264.7)、AKI小鼠模型 | 分子生物学 | 急性肾损伤、心血管疾病 | 转录组测序、单细胞测序、分子生物学实验 | NA | 基因表达数据、单细胞数据 | 细胞系和小鼠模型,具体样本数量未明确说明 | NA | 单细胞RNA-seq、RNA-seq | NA | NA |
9279 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing in diffuse large B-cell lymphoma: tumor heterogeneity, microenvironment, resistance, and prognostic markers
2025, Frontiers in oncology
IF:3.5Q2
DOI:10.3389/fonc.2025.1583250
PMID:40270607
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综述 | 本文总结了单细胞RNA测序在弥漫大B细胞淋巴瘤研究中的关键发现,包括肿瘤异质性、微环境相互作用、耐药机制和预后生物标志物 | 整合单细胞RNA测序与空间转录组学和单细胞多组学技术,为DLBCL的精准治疗策略开发提供新见解 | NA | 总结单细胞RNA测序在弥漫大B细胞淋巴瘤研究中的应用和发现 | 弥漫大B细胞淋巴瘤 | 数字病理学 | 淋巴瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 单细胞多组学 | NA | NA |
9280 | 2025-10-07 |
Mapping Cell Identity from scRNA-seq: A primer on computational methods
2025, Computational and structural biotechnology journal
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.csbj.2025.03.051
PMID:40270709
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综述 | 本文提供了单细胞RNA测序中细胞身份注释计算方法的简明概述 | 将现有细胞注释工具系统分类为五大类别,并讨论其关键优势、局限性和应用范围 | 主要面向新用户和非计算科学家,可能未涵盖所有高级技术细节 | 为单细胞RNA测序数据中的细胞身份注释计算方法提供入门指南 | 单细胞RNA测序数据和相关的计算方法 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |