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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 9241 - 9260 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 9241 | 2025-10-07 |
Identifying reproducible transcription regulator coexpression patterns with single cell transcriptomics
2025-Apr, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012962
PMID:40257984
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研究论文 | 利用大规模单细胞转录组数据识别跨细胞类型可重复的转录调控因子共表达模式 | 整合了120个人类和103个小鼠单细胞RNA-seq数据集，构建跨物种可重复的转录调控因子共表达网络 | 未深入探讨特定生物学背景下的信号保存 | 识别跨生物背景可重复的转录调控因子共表达模式 | 人类和小鼠的转录调控因子及其共表达基因伙伴 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | 共表达网络分析 | 单细胞转录组数据 | 超过2800万个细胞，来自223个数据集（120个人类，103个小鼠） | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9242 | 2025-10-07 |
Distinct deregulation trends of transcriptional protein complexes in aging naive T cells
2025-Mar-14, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae231
PMID:39437255
|
研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和蛋白质相互作用网络，揭示了衰老对幼稚T细胞中转录蛋白复合物的不同调控趋势 | 首次将单细胞RNA测序数据与蛋白质-蛋白质和结构域-结构域相互作用网络整合，预测并比较不同年龄组幼稚T细胞中的转录蛋白复合物 | 研究仅关注幼稚CD4+和CD8+T细胞，未涉及其他T细胞亚型或免疫细胞 | 探究衰老过程中幼稚T细胞转录蛋白复合物的动态变化机制 | 来自3个不同年龄组的人类幼稚CD4+和CD8+T细胞 | 生物信息学 | 衰老相关免疫功能障碍 | 单细胞RNA测序 | 蛋白质相互作用网络分析 | 单细胞转录组数据 | 3个不同年龄组的幼稚CD4+和CD8+T细胞样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9243 | 2025-10-07 |
Screening and validating genes associated with cuproptosis in systemic lupus erythematosus by expression profiling combined with machine learning
2025-Mar-07, Biomolecules & biomedicine
DOI:10.17305/bb.2024.10996
PMID:39388708
|
研究论文 | 通过机器学习结合单细胞RNA测序筛选和验证与系统性红斑狼疮铜死亡相关的基因 | 首次将铜死亡机制与系统性红斑狼疮关联，并采用机器学习方法筛选诊断基因标志物 | 研究依赖于公共数据库数据，样本来源有限，需要进一步实验验证 | 识别系统性红斑狼疮中与铜死亡相关的关键基因 | 系统性红斑狼疮患者外周血样本 | 机器学习 | 系统性红斑狼疮 | 单细胞RNA测序, qPCR, 微阵列基因表达分析 | LASSO, 支持向量机递归特征消除 | 基因表达数据 | 两个公共数据集(GSE65391和GSE61635)的外周血样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 微阵列 | NA | NA |
| 9244 | 2025-10-07 |
scCrab: A Reference-Guided Cancer Cell Identification Method based on Bayesian Neural Networks
2025-Mar, Interdisciplinary sciences, computational life sciences
DOI:10.1007/s12539-024-00655-6
PMID:39348073
|
研究论文 | 提出一种基于贝叶斯神经网络和参考数据引导的自动癌细胞识别方法scCrab | 首次将贝叶斯神经网络与多头自注意力机制结合，能够整合外部参考数据作为先验信息进行癌细胞识别 | NA | 开发高效的癌细胞识别计算方法 | 癌细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序 | 贝叶斯神经网络, 线性回归模型, 多头自注意力机制 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9245 | 2025-10-07 |
Identification of novel biomarkers for atherosclerosis using single-cell RNA sequencing and machine learning
2025-Mar, Mammalian genome : official journal of the International Mammalian Genome Society
IF:2.7Q2
DOI:10.1007/s00335-024-10077-w
PMID:39400603
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和机器学习方法识别动脉粥样硬化的新型生物标志物 | 首次结合单细胞RNA测序、WGCNA和多种机器学习算法（LASSO和SVM-RFE）系统筛选动脉粥样硬化生物标志物 | 研究样本量有限，需在更大规模队列中进一步验证 | 开发可靠的动脉粥样硬化诊断生物标志物 | 动脉粥样硬化患者样本和正常对照样本 | 机器学习 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序，差异表达分析，免疫细胞浸润分析，免疫荧光，免疫组化，ELISA | LASSO, SVM-RFE | 基因表达数据 | 256个差异表达基因，使用GSE21545数据集验证 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9246 | 2025-10-07 |
Sandwich Therapy with Radionuclide Combined with Intralesional Injections Based on Differences in the Spatial Structure Components of Keloids
2025-Mar, Aesthetic plastic surgery
IF:2.0Q2
DOI:10.1007/s00266-024-04442-y
PMID:39402198
|
研究论文 | 基于瘢痕疙瘩空间结构成分差异设计放射性核素联合病灶内注射的'三明治'疗法 | 首次通过单细胞测序分析发现瘢痕疙瘩血管壁中两个高表达基因及其富集通路在血管生成和胶原合成中的关键作用，并基于空间结构差异设计改良疗法 | 样本量较小（40例患者41个部位），缺乏长期随访数据 | 开发基于瘢痕疙瘩空间结构成分差异的改良治疗方法 | 瘢痕疙瘩患者 | 数字病理学 | 皮肤瘢痕疾病 | 单细胞测序, 超声检查, 组织病理学染色 | NA | 基因表达数据, 影像数据, 病理图像 | 40例患者41个瘢痕部位 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9247 | 2025-10-07 |
SCG2 Mediates HNSCC Progression With CCL2/TGFβ1high M2 Macrophage Infiltration
2025-Mar, Oral diseases
IF:2.9Q1
DOI:10.1111/odi.15154
PMID:39404611
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研究论文 | 本研究揭示了SCG2在头颈部鳞状细胞癌中通过调控CCL2/TGFβ1促进M2巨噬细胞极化的机制 | 首次发现SCG2是HNSCC中M2巨噬细胞极化的关键调控因子，并鉴定出与M2巨噬细胞浸润相关的五基因预后标志物 | NA | 阐明头颈部鳞状细胞癌中M2巨噬细胞极化的机制并识别潜在治疗靶点 | 头颈部鳞状细胞癌患者样本和细胞系 | 生物信息学 | 头颈部鳞状细胞癌 | 生物信息学分析、单细胞转录组测序、基因敲低、细胞共培养 | NA | 转录组数据、单细胞转录组数据 | TCGA和GEO数据库中的HNSCC批量转录组数据 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9248 | 2025-10-07 |
Integrating spatial transcriptomics and single-nucleus RNA-seq revealed the specific inhibitory effects of TGF-β on intramuscular fat deposition
2025-Mar, Science China. Life sciences
DOI:10.1007/s11427-024-2696-5
PMID:39422812
|
研究论文 | 本研究通过整合空间转录组学和单核RNA测序技术，揭示了TGF-β信号通路对肌肉内脂肪沉积的特异性抑制作用 | 首次结合空间转录组和单核RNA测序技术揭示TGF-β信号通路在肌肉内脂肪沉积中的空间异质性调控机制 | 研究主要基于猪和小鼠模型，在人类临床应用的转化价值需要进一步验证 | 探究影响肌肉内脂肪沉积的关键调控因子及其分子机制 | 猪的背最长肌组织、猪内皮细胞、肥胖小鼠模型 | 空间转录组学 | 肌肉萎缩 | 空间转录组学, 单核RNA测序, 体外实验 | NA | 空间转录组数据, 单核RNA测序数据 | 不同IMF含量的猪背最长肌样本 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序 | NA | NA |
| 9249 | 2025-10-07 |
Unraveling aging from transcriptomics
2025-Mar, Trends in genetics : TIG
IF:13.6Q1
DOI:10.1016/j.tig.2024.09.006
PMID:39424502
|
综述 | 本文综述了利用转录组学技术研究衰老机制的最新进展 | 系统整合了不同类型转录本（mRNA、lncRNA、tRNA、miRNA）在衰老研究中的最新发现 | NA | 阐明衰老的生物学机制和年龄相关疾病，促进健康长寿 | 衰老相关的转录组变化 | 生物信息学 | 老年疾病 | RNA测序 | NA | 转录组数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞转录组学, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9250 | 2025-10-07 |
Bioengineered Extracellular Vesicles Delivering siMDM2 Sensitize Oxaliplatin Therapy Efficacy in Colorectal Cancer
2025-Mar, Advanced healthcare materials
IF:10.0Q1
DOI:10.1002/adhm.202403531
PMID:39440640
|
研究论文 | 本研究通过单细胞转录组测序发现MDM2介导的NDUFB8降解是结直肠癌奥沙利铂耐药早期机制，并开发了递送siMDM2的工程化细胞外囊泡以增强化疗疗效 | 首次结合单细胞测序与动态网络生物标志物方法揭示铂类耐药早期事件，并开发工程化细胞外囊泡靶向MDM2/NDUFB8/ROS信号轴逆转耐药 | 研究主要基于临床前动物模型，尚未进行人体临床试验验证 | 探索结直肠癌奥沙利铂耐药机制并开发新型治疗策略 | 结直肠癌细胞、患者来源异种移植模型、肝肺转移小鼠模型 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | 单细胞转录组测序, 动态网络生物标志物分析, 电穿孔技术 | 动物疾病模型 | 基因表达数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9251 | 2025-10-07 |
Active immunologic participation and metabolic shutdown of kidney structural cells during kidney transplant rejection
2025-Mar, American journal of transplantation : official journal of the American Society of Transplantation and the American Society of Transplant Surgeons
IF:8.9Q1
DOI:10.1016/j.ajt.2024.10.015
PMID:39461479
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究肾脏移植排斥中结构细胞的免疫参与和代谢变化 | 首次在单细胞水平揭示肾脏结构细胞在移植排斥中主动参与免疫过程并发生代谢关闭 | 样本量相对有限（18个活检样本来自14名受者） | 研究肾脏移植排斥过程中结构细胞的免疫反应和代谢变化 | 肾脏移植患者的活检组织 | 单细胞组学 | 肾脏移植排斥 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 18个肾脏移植活检样本来自14名受者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9252 | 2025-10-07 |
Glial 'omics in ischemia: Acute stroke and chronic cerebral small vessel disease
2025-Mar, Glia
IF:5.4Q1
DOI:10.1002/glia.24634
PMID:39463002
|
综述 | 本文综述了胶质细胞在急慢性脑缺血疾病中的转录组学研究进展 | 整合单细胞RNA测序、空间转录组学和核糖体标记技术揭示胶质细胞亚群在缺血中的新型功能 | 主要基于现有研究综述，缺乏原始实验数据验证 | 阐明胶质细胞在急慢性脑缺血疾病中的分子响应机制 | 脑缺血和小血管疾病中的胶质细胞（小胶质细胞和星形胶质细胞） | 生物信息学 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 流式细胞分选, 多组学分析 | NA | 转录组数据, 空间基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 多组学 | NA | NA |
| 9253 | 2025-10-07 |
Seq-Scope: repurposing Illumina sequencing flow cells for high-resolution spatial transcriptomics
2025-Mar, Nature protocols
IF:13.1Q1
DOI:10.1038/s41596-024-01065-0
PMID:39482362
|
研究论文 | 本研究开发了一种名为Seq-Scope的高分辨率空间转录组技术，通过重新利用Illumina测序平台克服现有技术的局限性 | 将Illumina测序平台重新用于空间转录组分析，实现亚微米级分辨率、高捕获效率和低成本 | 需要研究人员具备分子生物学、组织学和基础Unix技能 | 开发高分辨率空间转录组技术 | 新鲜冷冻组织切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组测序 | NA | 图像, 转录组数据 | 多个组织切片，覆盖7mm×7mm或更大区域 | Illumina | 空间转录组学 | Illumina NovaSeq 6000 | Illumina NovaSeq 6000测序流动槽 |
| 9254 | 2025-10-07 |
A multiplex single-cell RNA-Seq pharmacotranscriptomics pipeline for drug discovery
2025-Mar, Nature chemical biology
IF:12.9Q1
DOI:10.1038/s41589-024-01761-8
PMID:39482470
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研究论文 | 开发了一种结合药物筛选与单细胞RNA测序的药理转录组学流程，用于探索卵巢癌细胞的药物反应机制 | 首次将活细胞条形码技术与96重单细胞RNA测序相结合，实现高通量药理转录组分析 | 研究主要聚焦于高级别浆液性卵巢癌，尚未验证其他癌症类型的适用性 | 解析癌症药物反应的基因调控动态机制 | 原发性高级别浆液性卵巢癌细胞 | 单细胞转录组学 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 45种药物处理的原代HGSOC细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 96重单细胞RNA测序 |
| 9255 | 2025-10-07 |
Recent advances in basic research on prostate cancer: Where we are heading?
2025-Mar, International journal of urology : official journal of the Japanese Urological Association
IF:1.8Q3
DOI:10.1111/iju.15628
PMID:39474871
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综述 | 概述前列腺癌基础研究的最新进展，重点关注癌细胞及其肿瘤微环境两大领域 | 整合雄激素受体信号机制、基因组分析、液体活检与肿瘤微环境研究，强调单细胞RNA测序和空间转录组学等先进技术带来的新见解 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据，主要基于现有文献进行总结和分析 | 探讨前列腺癌研究的现状和未来发展方向 | 前列腺癌细胞及其肿瘤微环境 | 基础医学研究 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 液体活检, 基因组分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 临床样本数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 9256 | 2025-10-07 |
Integrating bulk RNA-seq and scRNA-seq data to explore diverse cell death patterns and develop a programmed cell death-related relapse prediction model in pediatric B-ALL
2025-02-15, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-86148-y
PMID:39955305
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研究论文 | 本研究通过整合批量RNA测序和单细胞RNA测序数据，探索了儿童B细胞急性淋巴细胞白血病中多种程序性细胞死亡模式，并开发了与复发相关的预测模型 | 首次系统整合批量RNA-seq和单细胞RNA-seq数据分析儿童B-ALL中16种程序性细胞死亡模式，并构建了基于7个关键基因的复发预测模型 | NA | 识别程序性细胞死亡相关生物标志物并开发儿童B-ALL复发预测模型 | 儿童B细胞急性淋巴细胞白血病患者 | 生物信息学 | B细胞急性淋巴细胞白血病 | RNA-seq, scRNA-seq, Cox回归分析 | Cox回归模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
| 9257 | 2025-10-07 |
B-cell signatures characterize the immune landscape and predict LUAD prognosis via the integration of scRNA-seq and bulk RNA-seq
2025-02-14, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-89213-8
PMID:39953119
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，构建基于B细胞特征的肺腺癌预后风险模型 | 首次通过整合单细胞和批量RNA测序数据识别B细胞特征基因，构建肺腺癌预后风险模型 | 研究基于公共数据库的回顾性数据，需要进一步实验验证 | 阐明B细胞在肺腺癌中的作用并构建预后预测模型 | 肺腺癌患者 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | LASSO回归模型 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的4个数据集(GSE164983, GSE50081, GSE37745, GSE30219)和TCGA-LUAD数据集 | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 9258 | 2025-10-07 |
B-cell interleukin 1 receptor 1 modulates the female adipose tissue immune microenvironment during aging
2025-Feb-13, Journal of leukocyte biology
IF:3.6Q2
DOI:10.1093/jleuko/qiae219
PMID:39378334
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研究论文 | 本研究探讨B细胞中IL-1β信号通路在衰老过程中对雌性脂肪组织免疫微环境的调控作用 | 首次揭示B细胞特异性IL-1受体1在雌性衰老脂肪组织免疫调节中的性别特异性作用机制 | 研究主要聚焦于雌性模型，性别差异机制的全面解析尚不充分 | 阐明IL-1β-B细胞信号通路在衰老相关脂肪组织炎症中的作用 | 衰老小鼠内脏白色脂肪组织及其免疫细胞 | 免疫学 | 衰老相关代谢疾病 | 单细胞RNA测序，基因敲除技术 | B细胞特异性Il1r1敲除小鼠模型 | 基因表达数据，细胞比例数据 | 未明确样本数量，使用BKO小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 9259 | 2025-10-07 |
Glioblastoma Cortical Organoids Recapitulate Cell-State Heterogeneity and Intercellular Transfer
2025-Feb-07, Cancer discovery
IF:29.7Q1
DOI:10.1158/2159-8290.CD-23-1336
PMID:39373549
|
研究论文 | 本研究利用胶质母细胞瘤皮质类器官模型，揭示了肿瘤细胞与非恶性细胞间广泛的mRNA和GFP转移现象 | 相比匹配的胶质瘤球模型，GBM皮质类器官更准确地重现了患者肿瘤中恶性细胞状态的多样性和表达程序，并首次系统观察到细胞间广泛的转录本转移 | 模型系统仍为体外类器官，可能无法完全模拟体内肿瘤微环境的复杂性 | 建立更真实的胶质母细胞瘤微环境模型，研究肿瘤细胞与非恶性细胞间的相互作用 | 胶质母细胞瘤皮质类器官中的恶性细胞和神经胶质细胞 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 类器官模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 9260 | 2025-10-07 |
Multimodal Profiling of Peripheral Blood Identifies Proliferating Circulating Effector CD4+ T Cells as Predictors for Response to Integrin α4β7-Blocking Therapy in Inflammatory Bowel Disease
2025-Feb, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.09.021
PMID:39343250
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研究论文 | 通过多模态分析外周血免疫特征，识别增殖性循环效应CD4+T细胞作为炎症性肠病患者对整合素α4β7阻断治疗反应的预测标志物 | 首次整合多组学数据识别出对vedolizumab治疗无应答者的特异性T细胞特征，并建立机器学习预测模型 | 样本量相对有限，需要在更大队列中验证预测模型的普适性 | 寻找炎症性肠病生物治疗反应的可靠预测标志物 | 接受vedolizumab治疗的炎症性肠病患者外周血样本 | 生物医学 | 炎症性肠病 | 质谱流式细胞术,单细胞RNA测序,单细胞BCR/TCR测序,血清蛋白质组学,多参数流式细胞术 | 机器学习 | 单细胞多组学数据 | 2个前瞻性队列的炎症性肠病患者 | NA | 单细胞RNA测序,单细胞BCR/TCR测序,质谱流式细胞术,蛋白质组学 | NA | NA |