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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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901 | 2025-10-05 |
Single-cell RNA sequencing reveals palmitoylation-driven cellular heterogeneity and prognostic biomarkers in lung adenocarcinoma
2025-Nov, Translational oncology
IF:4.5Q1
DOI:10.1016/j.tranon.2025.102501
PMID:40811979
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示棕榈酰化驱动的肺腺癌细胞异质性并建立预后生物标志物 | 首次在单细胞水平系统分析棕榈酰化对肺腺癌细胞异质性的影响,并开发了基于棕榈酰化特征的12基因风险模型 | 研究结果需要在更多独立队列中进一步验证,实验验证主要集中于ASPH基因 | 探索棕榈酰化修饰在肺腺癌细胞异质性和预后预测中的作用 | 肺腺癌患者肿瘤细胞 | 数字病理 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序,GSVA,ssGSEA,拷贝数变异分析,伪时间序列分析,细胞互作分析 | 风险预测模型 | 单细胞RNA测序数据,批量RNA测序数据 | TCGA数据集和多个GEO数据集 | NA | 单细胞RNA-seq,批量RNA-seq | NA | NA |
902 | 2025-10-05 |
Elucidating the therapeutic mechanisms of resveratrol in benign prostatic hyperplasia via an integrated strategy of network pharmacology, multi-omics and molecular biology
2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157165
PMID:40839986
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研究论文 | 通过整合网络药理学、多组学分析和分子生物学方法,阐明白藜芦醇治疗良性前列腺增生的作用机制 | 首次整合网络药理学、单细胞转录组、分子对接和分子动力学模拟等多种方法系统研究白藜芦醇对BPH的治疗机制 | 研究主要基于体外实验,需要进一步体内实验验证 | 阐明白藜芦醇治疗良性前列腺增生的药理机制和关键信号通路 | 良性前列腺增生疾病模型和前列腺细胞 | 生物信息学 | 前列腺癌相关疾病 | 网络药理学, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, 体外实验验证 | NA | 转录组数据, 蛋白质数据, 分子相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |
903 | 2025-10-05 |
Genistein ameliorates thoracic aortic dissection by inhibiting CB1 receptor hyperactivation and modulating its-mediated cAMP-PKA signaling
2025-Nov, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
IF:6.7Q1
DOI:10.1016/j.phymed.2025.157178
PMID:40845589
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研究论文 | 本研究探讨染料木黄酮通过抑制CB1受体过度激活并调节其介导的cAMP-PKA信号通路来改善胸主动脉夹层的作用机制 | 首次揭示CB1受体在胸主动脉夹层中的过度表达及其通过抑制cAMP-PKA信号通路促进疾病发展的机制,并发现染料木黄酮通过靶向该通路发挥治疗作用 | 研究主要聚焦于CB1受体-cAMP-PKA信号轴,可能还存在其他未被探索的分子机制参与胸主动脉夹层的发病过程 | 研究染料木黄酮通过抑制CB1受体和调节cAMP-PKA信号通路缓解胸主动脉夹层进展的潜力 | 血管平滑肌细胞(VSMCs)和胸主动脉夹层动物模型 | 心血管疾病研究 | 胸主动脉夹层 | 单细胞RNA测序,体外和体内实验 | NA | 基因表达数据,病理学数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
904 | 2025-10-05 |
Immune cell transcriptional profiles from pre-vaccination peripheral blood predict immune response to preventative MUC1 cancer vaccine
2025-Oct-01, European journal of cancer (Oxford, England : 1990)
DOI:10.1016/j.ejca.2025.115685
PMID:40815873
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析疫苗接种前外周血免疫细胞转录谱,预测MUC1癌症预防疫苗的免疫反应 | 首次使用单细胞RNA测序技术结合机器学习方法识别疫苗免疫反应的预测性生物标志物 | 样本量较小(16名应答者和16名无应答者),需要在更大队列中进一步验证 | 预测癌症预防疫苗的免疫反应并识别相关生物标志物 | 曾患晚期结肠腺瘤的个体 | 生物信息学 | 结肠癌 | 单细胞RNA测序,机器学习 | 贝叶斯图分析 | 单细胞转录组数据 | 32个疫苗接种前外周血单个核细胞样本(16名应答者和16名无应答者) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
905 | 2025-10-05 |
Selective EPAC1 activators enhance endothelial function in models of vascular inflammation
2025-Oct, Pharmacological research
IF:9.1Q1
DOI:10.1016/j.phrs.2025.107923
PMID:40848957
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研究论文 | 本研究通过体外和离体模型探讨选择性EPAC1激活剂在血管炎症中改善内皮功能的作用机制 | 首次系统验证选择性EPAC1激活剂在多种血管炎症模型中恢复内皮功能的作用,并揭示其通过上调SOCS3抑制JAK/STAT3信号通路的分子机制 | 研究主要基于体外和离体模型,缺乏在体动物模型的验证 | 探究EPAC1在调节血管炎症和损伤中的作用及其治疗潜力 | 小鼠主动脉、人冠状动脉、血管内皮细胞、平滑肌细胞和巨噬细胞 | 分子生物学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,三细胞共培养系统 | NA | 基因表达数据,功能实验数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
906 | 2025-10-05 |
Stage-specific regulation by autophagy-related transcription factors drives hematopoietic stem cell formation
2025-Oct, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2025.2551671
PMID:40878056
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和转录因子分析揭示了自噬相关转录因子在造血干细胞发育过程中的阶段性调控机制 | 首次结合单细胞RNA测序和metaTF方法系统解析了造血干细胞发育过程中自噬相关转录因子的阶段性调控网络 | 研究仅限于小鼠模型,人类造血干细胞发育的调控机制可能有所不同 | 探索自噬相关转录因子在造血干细胞发育过程中的调控机制 | 小鼠造血干细胞发育过程中的六个连续阶段 | 单细胞测序分析 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序, 转录因子分析 | metaTF | 单细胞转录组数据 | 小鼠胚胎期E10.5主动脉-性腺-中肾区、E12.5/E14.5胎肝和成年骨髓样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
907 | 2025-10-05 |
Triple checkpoint blockade of PD-1, Tim-3, and Lag-3 enhances adoptive T cell immunotherapy in a mouse model of ovarian cancer
2025-Sep-30, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2419888122
PMID:40982684
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研究论文 | 本研究通过联合阻断PD-1、Tim-3和Lag-3三种检查点,增强工程化T细胞在卵巢癌小鼠模型中的免疫治疗效果 | 首次在卵巢癌模型中证明三重检查点阻断(PD-1/Tim-3/Lag-3)与工程化T细胞联合治疗的协同效应 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体临床试验中验证 | 探索多重检查点阻断策略对增强过继性T细胞免疫疗法疗效的作用 | 卵巢癌小鼠模型和工程化靶向MSLN的T细胞 | 免疫治疗 | 卵巢癌 | 单细胞RNA测序,T细胞工程化 | 动物模型 | 基因表达数据,生存数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
908 | 2025-10-05 |
Single-Cell Transcriptomics Reveals ITGA2-Mediated Metabolic Reprogramming and Immune Crosstalk in Pediatric Thyroid Carcinogenesis
2025-Sep-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202504088
PMID:40985182
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研究论文 | 通过单细胞转录组学揭示ITGA2介导的代谢重编程和免疫串扰在儿童甲状腺癌发生中的作用机制 | 首次在单细胞水平识别出ITGA2-PTC细胞亚群,揭示其通过增强糖酵解通量和诱导M2巨噬细胞极化的双重致癌通路驱动儿童甲状腺癌发生 | 样本量相对有限(4例PPTC和9例APTC),需要更大规模验证 | 阐明儿童甲状腺乳头状癌特异性病理生物学的分子机制 | 儿童和成人甲状腺乳头状癌临床标本 | 单细胞组学 | 甲状腺癌 | 单细胞RNA测序,多重免疫组织化学,类器官模型 | NA | 单细胞转录组数据 | 90234个细胞转录组(来自4例PPTC和9例APTC标本) | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
909 | 2025-10-05 |
Multiomics Analyses Reveal an Essential Role of Tryptophan in Treatment of csDMARDs in Rheumatoid Arthritis
2025-Sep-23, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202413170
PMID:40985320
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研究论文 | 通过多组学分析揭示色氨酸在类风湿关节炎患者对csDMARDs治疗反应中的关键调节作用 | 首次通过整合代谢组学、微生物组学、转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学和磷酸化蛋白质组学等多组学方法,系统阐明色氨酸在类风湿关节炎治疗中的作用机制 | NA | 阐明类风湿关节炎患者对csDMARDs治疗反应差异的分子机制 | 类风湿关节炎患者(血浆、粪便、外周血单个核细胞)及小鼠模型 | 多组学分析 | 类风湿关节炎 | 代谢组学、微生物组学、转录组学、单细胞转录组学、蛋白质组学、磷酸化蛋白质组学 | NA | 多组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
910 | 2025-10-05 |
Distinct Roles of IL-4, IL-13, and IL-22 in Human Skin Barrier Dysfunction and Atopic Dermatitis
2025-Sep-23, Allergy
IF:12.6Q1
DOI:10.1111/all.70060
PMID:40985485
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研究论文 | 本研究通过空间转录组学和多组学分析揭示了IL-4、IL-13和IL-22在特应性皮炎皮肤屏障功能障碍中的独特作用机制 | 首次在具有完整屏障和免疫细胞的生物稳定化人皮肤模型中系统比较三种细胞因子的差异作用,并发现它们之间的免疫交叉调节机制 | 研究主要基于体外皮肤模型,可能无法完全模拟体内复杂环境 | 阐明IL-4、IL-13和IL-22在特应性皮炎皮肤屏障功能障碍中的特异性作用 | 特应性皮炎患者的皮肤组织和生物稳定化人皮肤模型 | 皮肤生物学 | 特应性皮炎 | 空间转录组学,RNA测序,非靶向蛋白质组学,电阻抗光谱法 | NA | 转录组数据,蛋白质组数据,电生理数据 | 特应性皮炎患者皮肤活检样本和体外皮肤模型 | NA | 空间转录组学,RNA-seq,蛋白质组学 | NA | NA |
911 | 2025-10-05 |
Alleviated T cell exhaustion and SLC1A3-mediated stroma-remodelling dictate chemoimmunotherapy efficacy in oesophageal squamous cell carcinoma
2025-Sep-22, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2025-335642
PMID:40983502
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组分析揭示了化疗联合抗PD-1治疗在食管鳞癌中的协同作用机制及耐药原因 | 发现化疗通过减轻TIGIT-NECTIN2/NECTIN1-CD96免疫检查点相互作用缓解T细胞耗竭,并首次鉴定SLC1A3高表达肿瘤细胞通过COL1A1+肌成纤维细胞诱导基质重塑导致耐药 | 样本量有限,需进一步验证SLC1A3抑制剂的临床转化潜力 | 探究化疗增强免疫检查点抑制剂疗效的机制及耐药因素 | 食管鳞癌患者组织样本及小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 食管鳞癌 | 单细胞转录组测序, T细胞受体谱分析, 多重免疫组化 | 小鼠模型 | 单细胞RNA测序数据, 免疫组化图像 | 接受化疗联合抗PD-1或抗PD-1单药治疗的ESCC患者纵向组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
912 | 2025-10-05 |
ENO1 promotes cancer metastasis via stimulating metabolism reprogramming in osteosarcoma
2025-Sep-22, British journal of cancer
IF:6.4Q1
DOI:10.1038/s41416-025-03182-3
PMID:40983627
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示ENO1基因通过刺激代谢重编程促进骨肉瘤转移的机制 | 首次在单细胞水平发现ENO1通过调控糖酵解过程促进骨肉瘤转移 | 样本量较小(仅10例儿科骨肉瘤样本),需要更大规模验证 | 揭示骨肉瘤转移的分子机制并寻找治疗靶点 | 儿科骨肉瘤患者组织样本 | 数字病理学 | 骨肉瘤 | 单细胞RNA测序, 生物信息学分析, 体外功能实验, 体内动物实验 | NA | 单细胞RNA测序数据, 组织样本 | 10例儿科骨肉瘤样本(分为原发无转移组、原发转移组和转移灶组) | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
913 | 2025-10-05 |
Toxic Switch and Key Effectors of Cu in Zebrafish Gills: Coupling Single-Cell RNA Sequencing and Redox Imaging
2025-Sep-22, Environmental science & technology
IF:10.8Q1
DOI:10.1021/acs.est.5c05966
PMID:40983989
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和氧化还原成像技术揭示了铜在斑马鱼鳃中的毒性开关机制 | 首次结合单细胞RNA测序与原位荧光探针技术,系统识别铜毒性开关和关键效应因子 | 研究仅针对斑马鱼鳃组织,结果在其他水生生物中的普适性需要进一步验证 | 探究铜污染对水生生物的毒性机制,特别是毒性开关和关键效应因子 | 斑马鱼鳃组织细胞 | 单细胞生物学 | 重金属中毒 | 单细胞RNA测序, 原位荧光成像 | NA | 单细胞转录组数据, 荧光成像数据 | 斑马鱼鳃组织细胞(6个显著变化的细胞群体) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
914 | 2025-10-05 |
Protocol for single-cell dissociation of head and neck cancer organoids
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103930
PMID:40616840
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研究论文 | 本文介绍了一种将头颈部鳞状细胞癌患者来源类器官解离为可用于下游应用的活单细胞悬液的实验方案 | 开发了通过0.05%胰蛋白酶孵育和温和机械解离最大化单细胞产量的优化方案,避免高浓度胰蛋白酶和长时间孵育导致的细胞聚集和活力下降 | NA | 建立头颈部癌症类器官单细胞解离的实验方案 | 头颈部鳞状细胞癌患者来源类器官 | NA | 头颈部癌症 | 单细胞RNA测序,药物筛选,流式细胞术,活细胞成像 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
915 | 2025-10-05 |
Protocol for predicting single- and multiple-dose-dependent gene expression using deep generative learning
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103932
PMID:40650899
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研究论文 | 提出使用深度生成学习预测单剂量和多剂量依赖性基因表达的协议 | 开发了scVIDR模型,一种专门用于模拟剂量依赖性化学扰动下单细胞基因表达的变分自编码器 | NA | 建立预测剂量依赖性基因表达的计算方法 | 单细胞基因表达数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | VAE(变分自编码器) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
916 | 2025-10-05 |
Protocol for conducting a single-cell sequencing assay for transposase-accessible chromatin analysis
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.103960
PMID:40700014
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研究论文 | 本文提供了一个使用公开数据集进行单细胞ATAC测序分析的详细操作流程 | 为scATAC-seq分析新手提供了标准化的分析流程指南,包括数据预处理、下游分析和计算多组学整合 | 仅使用公开数据集作为示例,未涉及实验设计或数据生成阶段 | 建立标准化的单细胞ATAC测序分析流程 | 单细胞染色质可及性数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞ATAC测序 | NA | 基因组测序数据 | 公开数据集(未指定具体样本数量) | NA | single-cell ATAC-seq | NA | NA |
917 | 2025-10-05 |
Protocol for automated graph-based clustering of single-cell RNA-seq data with application in mouse intestinal stem cells
2025-Sep-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104000
PMID:40748762
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研究论文 | 提出一种从小鼠肠道分离高度纯化的隐窝上皮细胞并进行单细胞RNA测序的自动化流程 | 开发了ACDC Python软件包,实现大规模单细胞RNA测据集的自动化图论聚类分析 | 主要针对小鼠空肠优化,但可适用于其他肠道区域 | 建立单细胞RNA测序数据的自动化聚类分析流程 | 小鼠肠道隐窝上皮细胞 | 单细胞测序分析 | NA | 单细胞RNA测序 | 图论聚类算法 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
918 | 2025-10-05 |
A spatiotemporal atlas of orchiectomy-induced androgen deprivation-mediated modulation of cellular composition and gene expression in the mouse prostate
2025-Sep-19, Neoplasia (New York, N.Y.)
DOI:10.1016/j.neo.2025.101230
PMID:40974890
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研究论文 | 构建了小鼠前列腺在睾丸切除诱导雄激素剥夺后的时空细胞组成和基因表达图谱 | 发现了新的ORX诱导成纤维细胞亚型,整合空间转录组学和单细胞分析揭示了前列腺各叶对雄激素剥夺的特异性响应 | 研究仅限于小鼠模型,缺乏人类前列腺组织的验证 | 解析雄激素剥夺疗法对前列腺细胞组成和基因表达的时空调控机制 | 小鼠前列腺组织 | 空间转录组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据 | 小鼠前列腺组织样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
919 | 2025-10-05 |
Differentiation latency and dormancy signatures define fetal liver hematopoietic stem cells at single-cell resolution
2025-Sep-18, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2025.116289
PMID:40971295
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研究论文 | 本研究通过单细胞技术揭示了胎儿肝脏造血干细胞的分化延迟和休眠特征 | 开发了模拟胎儿肝脏内皮生态位的培养平台,结合多组学技术首次在单细胞水平鉴定出具有连续移植能力的FL-HSCs特征 | 研究主要聚焦于胎儿肝脏阶段,成人HSCs的特征可能有所不同 | 探索胎儿肝脏造血干细胞自我更新的内在和外在调控机制 | 胎儿肝脏造血干细胞 | 单细胞生物学 | 血液系统疾病 | 单细胞RNA测序,流式细胞术,活细胞成像,移植实验 | NA | 单细胞转录组数据,流式细胞数据,成像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
920 | 2025-10-05 |
Predicting the structural impact of human alternative splicing
2025-Sep-17, Genome biology
IF:10.1Q1
DOI:10.1186/s13059-025-03744-x
PMID:40963109
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研究论文 | 使用AlphaFold2预测人类选择性剪接异构体的结构影响 | 首次大规模预测人类选择性剪接异构体的三维结构,并系统分析剪接对结构特性的影响 | 仅基于计算预测,缺乏实验验证 | 研究选择性剪接对蛋白质结构和功能的影响 | 11,000多个人类剪接异构体 | 计算生物学 | NA | 蛋白质结构预测,单细胞RNA测序 | AlphaFold2 | 蛋白质序列,单细胞RNA-seq数据 | 超过11,000个人类剪接异构体 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | Tabula Sapiens项目的单细胞RNA-seq数据 |