单细胞与空转测序相关文章
本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得，供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ，每日自动更新（使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤），已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理，可能存在错误或遗漏，请使用时务必注意核实！
如有建议或合作意向，欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布，欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错，还请不吝 给我打赏，你的支持是我继续创新的重要动力！
添加微信请说明来意
微信赞赏
除通过在线浏览外，为方便用户离线查阅，本站也提供 付费下载（定价19.9元）。之所以考虑收费，是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的，还请理解并多多支持。本站数据会持续更新，而仅需一次付费，未来就可以随时重新下载到最新版本数据。
当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 8661 - 8680 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8661 | 2025-10-07 |
BuDDI: Bulk Deconvolution with Domain Invariance to predict cell-type-specific perturbations from bulk
2025-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012742
PMID:39823522
|
研究论文 | 提出一种名为BuDDI的批量数据反卷积方法，通过域适应技术整合批量数据和单细胞RNA测序数据，预测细胞类型特异性扰动效应 | 利用域适应技术学习独立的潜在空间，能够在不使用单细胞扰动数据的情况下预测细胞类型特异性扰动响应 | NA | 开发能够从批量数据预测细胞类型特异性扰动效应的方法 | 批量RNA测序数据和单细胞RNA测序参考数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序，批量RNA测序 | 变分自编码器(VAE) | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8662 | 2025-10-07 |
Macrophage Infiltration and ITGB2 Expression in ESCC: A Novel Correlation
2025-Jan, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.70604
PMID:39825491
|
研究论文 | 本研究通过整合多组学数据发现并验证了食管鳞癌中巨噬细胞浸润与ITGB2表达的正相关性 | 首次发现ITGB2在浸润巨噬细胞中的表达随其向促肿瘤表型极化而增加，并提出了ITGB2敲除M1巨噬细胞回输的新型免疫治疗策略 | NA | 探索食管鳞癌中与肿瘤免疫相关的关键分子和治疗策略 | 食管鳞癌组织样本和免疫细胞 | 生物信息学 | 食管鳞癌 | 高通量测序、基因芯片、单细胞测序、生物信息学分析 | NA | 基因组数据、转录组数据、单细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8663 | 2025-10-07 |
Unveiling the mechanism of micro-and-nano plastic phytotoxicity on terrestrial plants: A comprehensive review of omics approaches
2025-Jan, Environment international
IF:10.3Q1
DOI:10.1016/j.envint.2025.109257
PMID:39818003
|
综述 | 本文综述了组学方法在揭示微纳塑料对陆生植物毒性机制方面的应用 | 系统整合了多种前沿组学技术（包括4D组学、表型组学、空间转录组学和单细胞组学）在微纳塑料植物毒性研究中的应用 | NA | 阐明微纳塑料对陆生植物的毒性机制 | 陆生植物 | 环境毒理学 | NA | 蛋白质组学、代谢组学、转录组学、微生物组学、4D组学、表型组学、空间转录组学、单细胞组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 空间转录组学, 单细胞组学 | NA | NA |
| 8664 | 2025-10-07 |
Single-cell RNA sequencing reveals S100A8/A9hi neutrophils-induced endothelial cell death and lymphocyte infiltration after ischemic stroke
2024-12-31, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151023
PMID:39579533
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序揭示缺血性中风后S100A8/A9高中性粒细胞诱导的内皮细胞死亡和淋巴细胞浸润机制 | 首次发现S100A8/A9hi中性粒细胞亚群在缺血性中风中的关键作用，并证实S100A8/A9抑制剂paquinimod的神经保护作用 | 未明确说明样本来源和具体数量，机制研究仍需进一步验证 | 探究缺血性中风后免疫细胞与血脑屏障相互作用的分子机制 | 中性粒细胞、内皮细胞和T细胞 | 单细胞基因组学 | 缺血性中风 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8665 | 2025-10-07 |
Revealing the roles of IL-7R in abdominal aortic aneurysm through integrated analysis of single-cell RNA-seq and bulk RNA-seq
2024-12-31, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2024.151042
PMID:39586133
|
研究论文 | 通过整合分析单细胞RNA测序和批量RNA测序数据，揭示IL-7R在腹主动脉瘤发病机制中的关键作用 | 首次通过整合scRNA-seq和bulk RNA-seq数据系统分析IL-7R在AAA中的作用机制，发现IL-7R通过JAK/STAT通路促进IFN-γ分泌并诱导平滑肌细胞表型转换 | 数据来源于公共数据库GEO，缺乏独立验证队列；样本数量未明确说明 | 探索腹主动脉瘤的发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 腹主动脉瘤组织样本和CD4记忆T细胞 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序, 免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据, 图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 8666 | 2025-10-07 |
Explainable deep neural networks for predicting sample phenotypes from single-cell transcriptomics
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbae673
PMID:39814561
|
研究论文 | 开发了一个名为singleDeep的端到端流程，利用深度神经网络分析单细胞转录组数据以预测样本表型 | 提出了首个专门针对单细胞RNA测序数据的端到端深度神经网络分析流程，能够同时提供表型预测和基因重要性解释 | 未明确说明模型在更大规模数据集上的可扩展性以及计算资源需求 | 开发能够有效分析单细胞转录组数据并预测样本表型的深度学习方法 | 系统性红斑狼疮、阿尔茨海默病和COVID-19患者的单细胞转录组数据 | 机器学习 | 自身免疫疾病,神经退行性疾病,传染病 | 单细胞RNA测序 | 深度神经网络 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8667 | 2025-10-07 |
scGO: interpretable deep neural network for cell status annotation and disease diagnosis
2024-Nov-22, Briefings in bioinformatics
IF:6.8Q1
DOI:10.1093/bib/bbaf018
PMID:39820437
|
研究论文 | 提出一种基于基因本体的可解释深度学习框架scGO，用于单细胞RNA测序数据的细胞状态注释和疾病诊断 | 利用稀疏神经网络整合基因、转录因子和GO术语之间的内在生物学关系，显著增强模型可解释性并降低计算成本 | 未在论文摘要中明确说明 | 开发可解释的深度学习模型用于细胞状态注释和疾病诊断 | 单细胞RNA测序数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | 深度学习、稀疏神经网络 | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8668 | 2025-10-07 |
Small Molecule Hydrogels Loading Small Molecule Drugs from Chinese Medicine for the Enhanced Treatment of Traumatic Brain Injury
2024-10-22, ACS nano
IF:15.8Q1
DOI:10.1021/acsnano.4c09097
PMID:39383335
|
研究论文 | 开发了一种负载中药小分子药物的自组装水凝胶用于创伤性脑损伤的增强治疗 | 无需额外载药或添加非活性成分，仅利用源自中药的小分子药物在生理条件下自组装形成水凝胶 | 未提及临床转化面临的具体挑战和长期安全性数据 | 开发一种新型创伤性脑损伤治疗策略 | 创伤性脑损伤模型 | 生物医学工程 | 创伤性脑损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8669 | 2025-10-07 |
Role of macrophages in regression of myocardial fibrosis following alleviation of left ventricular pressure overload
2024-05-01, American journal of physiology. Heart and circulatory physiology
DOI:10.1152/ajpheart.00240.2023
PMID:38363214
|
研究论文 | 本研究探讨巨噬细胞在左心室压力超负荷缓解后心肌纤维化消退中的作用 | 首次揭示巨噬细胞在压力超负荷缓解后对胶原降解和间质纤维化部分消退的潜在益处 | 纤维化消退不完全，具体机制仍需进一步研究 | 确定巨噬细胞表型在压力超负荷和负荷缓解过程中的时间变化及其对胶原降解的影响 | 小鼠心肌组织 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 免疫组织化学,流式细胞术,RT-PCR,免疫印迹,单细胞测序 | NA | 基因表达数据,蛋白质数据,细胞表型数据 | 对照组,2周和4周TAC组,2周,4周和6周unTAC组小鼠 | NA | 单细胞测序 | NA | NA |
| 8670 | 2025-10-07 |
SOCS3 regulates pathological retinal angiogenesis through modulating SPP1 expression in microglia and macrophages
2024-May-01, Molecular therapy : the journal of the American Society of Gene Therapy
IF:12.1Q1
DOI:10.1016/j.ymthe.2024.03.025
PMID:38504518
|
研究论文 | 本研究揭示了SOCS3通过调控小胶质细胞和巨噬细胞中SPP1表达在病理性视网膜血管生成中的作用机制 | 首次发现SOCS3/STAT3/SPP1轴在病理性视网膜血管生成中的关键调控作用，并确定SPP1是STAT3的直接转录靶基因 | 研究主要基于小鼠模型，人类临床相关性仍需进一步验证 | 探究髓系细胞在病理性眼血管生成中的分子机制 | 小鼠视网膜血管生成模型中的小胶质细胞和巨噬细胞 | 分子生物学 | 视网膜血管疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8671 | 2025-10-07 |
Macrophages in necrotic liver lesion repair: opportunities for therapeutical applications
2024-05-01, American journal of physiology. Cell physiology
DOI:10.1152/ajpcell.00053.2024
PMID:38618702
|
综述 | 本文综述了肝脏巨噬细胞在坏死性肝损伤修复中的不同作用及其治疗应用前景 | 通过特异性巨噬细胞标记物、靶向细胞清除和单细胞RNA测序技术，揭示了单核来源巨噬细胞亚群在肝损伤和修复中的不同功能 | NA | 探讨肝脏巨噬细胞在坏死性肝损伤修复中的作用及其作为治疗靶点的潜力 | 肝脏巨噬细胞（包括库普弗细胞和单核来源巨噬细胞） | NA | 急性肝衰竭、慢加急性肝衰竭 | 单细胞RNA测序、靶向细胞清除 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8672 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Identifies Response of Renal Lymphatic Endothelial Cells to Acute Kidney Injury
2024-May-01, Journal of the American Society of Nephrology : JASN
IF:10.3Q1
DOI:10.1681/ASN.0000000000000325
PMID:38506705
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序首次描述了小鼠肾脏淋巴管内皮细胞在急性肾损伤中的异质性和分子响应机制 | 首次系统描述肾脏淋巴管内皮细胞异质性，揭示其在急性肾损伤中调控局部免疫反应的新分子通路 | 淋巴管内皮细胞在肾脏中相对稀少，可能影响测序数据的全面性 | 研究肾脏淋巴管内皮细胞在急性肾损伤中的分子响应机制 | 小鼠肾脏淋巴管内皮细胞 | 单细胞组学 | 急性肾损伤 | 单细胞RNA测序，定量PCR，免疫荧光 | NA | 单细胞转录组数据 | 小鼠肾脏组织样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8673 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal Evolution of Developing Palate in Mice
2024-05, Journal of dental research
IF:5.7Q1
DOI:10.1177/00220345241232317
PMID:38619065
|
研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序和空间增强分辨率组学测序技术，构建了小鼠腭部发育的时空转录图谱 | 首次整合scRNA-seq和stereo-seq技术解析腭部发育的时空动态变化，发现间充质和上皮细胞在空间上分为3个功能域 | 研究仅针对C57BL/6J小鼠特定胚胎时期，结果可能不适用于其他物种或发育阶段 | 探索腭部发育过程中的主要细胞群体及其功能作用 | C57BL/6J小鼠胚胎期12.5、14.5和16.5天的腭部组织 | 发育生物学 | 腭部发育异常 | 单细胞RNA测序, 空间增强分辨率组学测序 | CellTrek | 单细胞转录组数据, 空间转录组数据 | 3个发育时间点的小鼠腭部样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8674 | 2025-10-07 |
Interleukin 21 Drives a Hypermetabolic State and CD4+ T-Cell-Associated Pathogenicity in Chronic Intestinal Inflammation
2024-05, Gastroenterology
IF:25.7Q1
DOI:10.1053/j.gastro.2024.01.026
PMID:38266738
|
研究论文 | 本研究揭示了白细胞介素21通过调控调节性T细胞的代谢状态驱动慢性肠道炎症的机制 | 首次发现IL21通过破坏线粒体-内质网接触点，诱导调节性T细胞进入高代谢状态并增强其炎症反应 | 研究主要基于体外实验和动物模型，在人类疾病中的直接应用仍需进一步验证 | 探究细胞代谢在调节性T细胞维持肠道稳态中的作用机制 | 人类调节性T细胞和CD4+ T细胞诱导的小鼠结肠炎模型 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 电子显微镜、共聚焦成像、邻近连接分析、免疫印迹、质谱流式、代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 图像、蛋白质、代谢物、基因表达 | NA | Agilent | 代谢分析 | Seahorse XF分析仪 | Seahorse XF实时代谢分析系统 |
| 8675 | 2025-10-07 |
Group 1 ILCs: Heterogeneity, plasticity, and transcriptional regulation
2024-05, Immunological reviews
IF:7.5Q1
DOI:10.1111/imr.13327
PMID:38563448
|
综述 | 本文系统综述了小鼠第1组先天淋巴细胞的异质性、可塑性及转录调控机制 | 整合单细胞RNA测序和命运图谱研究的最新发现，揭示第1组ILC的异质性和组织特异性特征 | 主要基于小鼠模型研究，人类第1组ILC的直接证据有限 | 探讨第1组先天淋巴细胞的发育程序、表型异质性和转录调控机制 | 小鼠第1组先天淋巴细胞（包括ILC1和自然杀伤细胞） | 免疫学 | NA | 单细胞RNA测序, 命运图谱技术 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8676 | 2025-10-07 |
Unveiling cell subpopulations in T1D mouse islets using single-cell RNA sequencing
2024-May-01, American journal of physiology. Endocrinology and metabolism
DOI:10.1152/ajpendo.00323.2023
PMID:38506753
|
研究论文 | 本研究利用单细胞RNA测序技术分析1型糖尿病小鼠胰岛细胞亚群，揭示α和β细胞的异质性及其在疾病进展中的潜在作用 | 首次在STZ诱导的1型糖尿病小鼠模型中构建全面的胰岛单细胞图谱，发现11种主要细胞类型并揭示α和β细胞亚群的异质性 | 研究仅限于小鼠模型，未在人类样本中验证；样本数量未明确说明 | 探究1型糖尿病胰岛细胞的异质性及其在疾病发病机制中的作用 | STZ诱导的1型糖尿病小鼠模型的胰岛细胞 | 单细胞组学 | 1型糖尿病 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据，流式细胞数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8677 | 2025-10-07 |
Nfe2l3 promotes neuroprotection and long-distance axon regeneration after injury in vivo
2024-May, Experimental neurology
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.expneurol.2024.114741
PMID:38395216
|
研究论文 | 本研究揭示了Nfe2l3在神经保护和长距离轴突再生中的新功能 | 首次发现Nfe2l3具有促进神经保护和轴突再生的功能，并鉴定其相关基因网络 | NA | 探究Nfe2l3在CNS损伤后神经保护和轴突再生中的作用 | 皮层和视网膜神经节细胞（RGC）CNS投射神经元 | 神经科学 | 中枢神经系统损伤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq），生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 8678 | 2025-10-07 |
How Mycobacterium tuberculosis builds a home: Single-cell analysis reveals M. tuberculosis ESX-1-mediated accumulation of anti-inflammatory macrophages in infected mouse lungs
2024-Apr-22, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.04.20.590421
PMID:38712150
|
研究论文 | 通过单细胞RNA测序研究结核分枝杆菌ESX-1系统在感染小鼠肺部调控单核吞噬细胞异质性和抗炎反应的作用机制 | 首次揭示ESX-1系统通过招募和分化抗炎性单核吞噬细胞帮助结核分枝杆菌建立生存环境的机制 | 研究仅使用小鼠和鼠源骨髓衍生巨噬细胞模型，未在人体样本中验证 | 探究结核分枝杆菌ESX-1分泌系统对宿主单核吞噬细胞招募和分化的调控作用 | 感染结核分枝杆菌的小鼠肺部组织和鼠骨髓衍生巨噬细胞 | 单细胞生物学 | 结核病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 基因表达数据, 空间转录组数据 | 小鼠肺部组织和骨髓衍生巨噬细胞 | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | NA |
| 8679 | 2025-10-07 |
Multimodal hierarchical classification of CITE-seq data delineates immune cell states across lineages and tissues
2024-Apr-08, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.06.547944
PMID:37461466
|
研究论文 | 提出一种基于标记的多模态分类方法MMoCHi，用于整合CITE-seq数据中的基因和蛋白表达信息进行细胞类型注释 | 开发了不依赖参考图谱的多模态层次分类方法，能够识别传统方法难以解析的免疫细胞亚群并发现新的亚群标记 | NA | 开发能够整合多模态单细胞数据的细胞类型分类方法 | 免疫细胞，特别是T淋巴细胞亚群和跨组织人类免疫细胞 | 生物信息学 | NA | CITE-seq，单细胞RNA测序 | 基于标记的分类器 | 单细胞转录组数据，表面蛋白组数据 | NA | NA | 单细胞多组学 | NA | NA |
| 8680 | 2025-10-07 |
Meta-analyses of mouse and human prostate single-cell transcriptomes reveal widespread epithelial plasticity in tissue regression, regeneration, and cancer
2024-Feb-02, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.01.30.578066
PMID:38352515
|
研究论文 | 通过对小鼠和人类前列腺单细胞转录组进行荟萃分析，揭示组织退化、再生和癌症中广泛存在的上皮细胞可塑性 | 首次通过跨物种单细胞转录组荟萃分析系统揭示前列腺上皮细胞在正常状态、雄激素剥夺后退化及癌症中的广泛可塑性 | 基于已有数据集的分析，可能受原始实验设计和技术差异的影响 | 研究前列腺组织中细胞状态可塑性在组织维持和癌症中的作用 | 小鼠和人类前列腺组织样本 | 单细胞转录组学 | 前列腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 多个已发表和新的scRNA-seq数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |