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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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8641 | 2025-10-07 |
Spatiotemporal landscape of kidney in a mouse model of hyperuricemia at single-cell level
2025-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202401801RR
PMID:39817712
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研究论文 | 本研究通过单细胞和空间多组学技术探索高尿酸血症小鼠模型中肾脏的时空图谱 | 首次结合单细胞RNA测序、空间转录组学、空间蛋白质组学和空间代谢组学技术研究高尿酸血症肾病 | 研究仅限于尿酸氧化酶敲除小鼠模型,人类相关性需要进一步验证 | 探索高尿酸血症肾病中尿酸排泄相关的标志物和治疗靶点 | 尿酸氧化酶敲除小鼠的肾脏组织 | 数字病理学 | 肾脏疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间蛋白质组学,空间代谢组学 | NA | 单细胞基因表达数据,空间分子数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学,空间蛋白质组学,空间代谢组学 | NA | NA |
8642 | 2025-05-03 |
TRAF6 promotes abdominal aortic aneurysm development by activating macrophage pyroptosis via the NLRP3/Caspase1/GSDMD pathway
2025-Jan-31, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202402873R
PMID:39831511
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研究论文 | 本研究探讨了TRAF6在腹主动脉瘤(AAA)形成中的作用及其机制,发现TRAF6通过NLRP3/Caspase1/GSDMD信号通路调节巨噬细胞焦亡,从而促进AAA的发展 | 首次揭示了TRAF6通过NLRP3/Caspase1/GSDMD信号通路调节巨噬细胞焦亡在AAA发展中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,人类样本验证有限 | 探究TRAF6在腹主动脉瘤形成中的作用机制 | 腹主动脉瘤(AAA)患者组织和弹性蛋白酶诱导的C57BL/6小鼠 | 心血管疾病研究 | 腹主动脉瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠疾病模型 | 基因表达数据 | 人类AAA组织和弹性蛋白酶诱导的C57BL/6小鼠 | NA | NA | NA | NA |
8643 | 2025-10-07 |
The GhANT-GoPGF module regulates pigment gland development in cotton leaves
2025-01-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115112
PMID:39721026
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研究论文 | 本研究通过整合酵母单杂交测序和单细胞RNA测序数据,揭示了棉花GhANT转录因子通过结合GoPGF启动子调控叶片色素腺体发育的分子机制 | 首次发现棉花ANT同源基因GhANT作为GoPGF的上游调控因子,通过结合GoPGF启动子的CCG框来调控组织特异性腺体形态发生 | 研究主要聚焦于叶片色素腺体发育,对其他组织器官腺体发育的调控机制尚未深入探讨 | 解析棉花色素腺体发育的转录调控网络 | 棉花色素腺体细胞 | 植物分子生物学 | NA | 酵母单杂交测序, 单细胞RNA测序, CRISPR基因编辑 | NA | 基因组数据, 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8644 | 2025-10-07 |
Cross-species comparative single-cell transcriptomics highlights the molecular evolution and genetic basis of male infertility
2025-01-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115118
PMID:39739532
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研究论文 | 通过跨物种比较单细胞转录组学揭示雄性不育的分子进化与遗传基础 | 首次整合人类、小鼠和果蝇的单细胞转录组数据进行跨物种比较,结合深度学习分析基因表达进化机制 | 仅分析了三个物种的睾丸单细胞数据,可能无法完全代表所有物种的保守性 | 探索强选择压力下精子发生的遗传基础 | 人类、小鼠和果蝇的睾丸细胞 | 单细胞转录组学 | 雄性不育 | 单细胞RNA测序, 基因敲除实验, 深度学习分析 | 深度学习模型 | 单细胞转录组数据 | 三个物种(人类、小鼠、果蝇)的睾丸单细胞数据,20个候选基因敲除实验 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8645 | 2025-10-07 |
Transcriptional determinants of goal-directed learning and representational drift in the parahippocampal cortex
2025-01-28, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2024.115175
PMID:39792551
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研究论文 | 本研究通过双光子钙成像和空间转录组学技术,揭示了海马旁回皮层中目标导向学习和表征漂移的转录调控机制 | 首次结合活体钙成像和空间转录组学技术,在任务学习过程中识别了调控表征漂移的特定细胞类型和分子机制 | 研究主要聚焦于海马旁回皮层,其他脑区的参与机制尚不明确 | 探究目标导向学习和记忆表征漂移的细胞与分子机制 | 小鼠海马旁回皮层的神经元 | 神经科学 | NA | 双光子钙成像, 空间转录组学, 基因敲除 | NA | 钙成像数据, 基因表达数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
8646 | 2025-10-07 |
Tissue-resident immune cells: from defining characteristics to roles in diseases
2025-Jan-17, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-024-02050-5
PMID:39820040
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综述 | 本文系统描述了组织驻留免疫细胞的发育特征、功能特性及其在健康和疾病中的重要作用 | 首次对各类组织驻留免疫细胞进行系统性总结,并提出利用TRICs开发新治疗靶点的策略 | 未对各类TRICs的起源、发育轨迹和细胞间通讯进行完整总结,缺乏疾病进展中TRICs的系统性概述 | 阐明组织驻留免疫细胞的特性及其在疾病中的作用机制 | 组织驻留免疫细胞(包括T细胞、记忆B细胞、先天淋巴细胞、巨噬细胞、中性粒细胞和肥大细胞) | 免疫学 | 免疫相关疾病 | 单细胞测序、时空组学 | NA | 组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq、空间转录组学 | NA | NA |
8647 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome atlas of lamprey exploring Natterin- induced white adipose tissue browning
2025-Jan-17, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56153-w
PMID:39820434
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研究论文 | 本研究构建了七鳃鳗单细胞转录组图谱,揭示了Natterin蛋白诱导白色脂肪组织褐变的作用机制 | 首次构建了七鳃鳗全面细胞图谱,发现了胰腺功能相关细胞群,并揭示了Natterin在脂肪代谢中的新功能 | 仅基于七鳃鳗和转基因小鼠模型,需要更多物种验证细胞进化保守性 | 探究脊椎动物细胞进化及脂肪代谢调控机制 | 七鳃鳗组织样本和转基因小鼠模型 | 单细胞组学 | 代谢疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 604,460个细胞/细胞核,来自14个七鳃鳗组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8648 | 2025-10-07 |
Innovative treatment of age-related hearing loss using MSCs and EVs with Apelin
2025-Jan-17, Cell biology and toxicology
IF:5.3Q1
DOI:10.1007/s10565-025-09988-4
PMID:39820591
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研究论文 | 本研究探索间充质干细胞通过细胞外囊泡递送Apelin治疗年龄相关性听力损失的可行性 | 首次发现MSCs可分化为内耳细胞亚群并通过EVs递送Apelin促进M2巨噬细胞极化 | 仅在小鼠模型中进行验证,尚未进行临床试验 | 开发年龄相关性听力损失的干细胞治疗方法 | 间充质干细胞、细胞外囊泡、内耳毛细胞、巨噬细胞 | 单细胞转录组学 | 年龄相关性听力损失 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 老年小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8649 | 2025-10-07 |
An atlas of neuropathic pain-associated molecular pathological characteristics in the mouse spinal cord
2025-Jan-17, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07506-0
PMID:39820760
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研究论文 | 本研究整合空间转录组学、单核RNA测序和bulk RNA测序技术,解析了神经病理性疼痛小鼠脊髓中的空间分子病理特征 | 首次系统展示了DRG神经元与脊髓背角神经元及胶质细胞之间的'跨组学对话',揭示了神经病理性疼痛条件下细胞通讯模式的变化 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 解析神经病理性疼痛相关的空间分子病理特征 | 小鼠脊髓组织和背根神经节神经元 | 空间转录组学 | 神经病理性疼痛 | 空间转录组学, 单核RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 空间转录组数据, 单细胞RNA测序数据, bulk RNA测序数据 | 神经病理性疼痛小鼠和假手术对照组小鼠 | NA | 空间转录组学, 单核RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
8650 | 2025-10-07 |
Herpesviruses mimic zygotic genome activation to promote viral replication
2025-Jan-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-55928-5
PMID:39814710
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研究论文 | 研究发现DNA病毒通过激活胚胎发育关键因子DUX4来模拟合子基因组激活过程,促进病毒转录和复制 | 首次揭示疱疹病毒等DNA病毒通过诱导DUX4表达来模拟胚胎发育中的合子基因组激活机制 | NA | 探究DNA病毒如何利用宿主细胞发育机制促进自身复制 | 疱疹病毒、乳头瘤病毒、Merkel细胞多瘤病毒 | 分子生物学 | 病毒感染 | 单细胞测序, CRISPR/Cas9基因编辑, 纳米抗体技术 | NA | 单细胞测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8651 | 2025-10-07 |
Inhibition of Interleukin-40 prevents multi-organ damage during sepsis by blocking NETosis
2025-Jan-16, Critical care (London, England)
DOI:10.1186/s13054-025-05257-2
PMID:39819454
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研究论文 | 本研究揭示了白细胞介素40(IL-40)通过促进中性粒细胞胞外诱捕网(NETs)形成加剧脓毒症多器官损伤的新机制 | 首次发现IL-40在脓毒症中的关键作用,证实其通过调控NETosis过程影响疾病进展 | 研究主要基于动物模型,临床转化需要进一步验证 | 探索IL-40在脓毒症发病机制中的作用及治疗潜力 | 脓毒症患者队列和基因敲除小鼠模型 | 免疫学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | 基因表达数据, 临床指标 | 两个独立脓毒症患者队列和实验小鼠 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序 | NA | NA |
8652 | 2025-10-07 |
Enhancing single-cell transcriptomics using interposed anchor oligonucleotide sequences
2025-Jan-16, Communications biology
IF:5.2Q1
DOI:10.1038/s42003-025-07474-5
PMID:39819888
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研究论文 | 通过改进寡核苷酸捕获设计,在条形码和UMI之间插入锚定序列,显著提升单细胞转录组测序数据质量 | 在条形码和UMI之间插入锚定序列的创新设计,有效减少因寡核苷酸合成错误导致的数据丢弃 | NA | 解决单细胞转录组测序中寡核苷酸合成错误对数据质量的影响 | 单细胞转录组测序数据 | 单细胞测序技术 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | 液滴式单细胞测序 |
8653 | 2025-10-07 |
The Human Microglia Atlas (HuMicA) unravels changes in disease-associated microglia subsets across neurodegenerative conditions
2025-Jan-16, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-025-56124-1
PMID:39820004
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研究论文 | 构建了人类小胶质细胞图谱(HuMicA),揭示了神经退行性疾病中小胶质细胞亚群的变化 | 首次在人类组织中识别出四种疾病相关小胶质细胞亚型和疾病炎症巨噬细胞,这些细胞类型最近在小鼠中被描述 | 研究样本来源多样,可能存在批次效应;部分发现需要在更多疾病模型中验证 | 研究神经退行性疾病中小胶质细胞的变化及其在疾病发展中的作用 | 人类大脑免疫细胞,特别是小胶质细胞 | 单细胞基因组学 | 神经退行性疾病 | 单核RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 原位杂交 | NA | 单细胞转录组数据 | 241个样本,包含90,716个核/细胞,来自阿尔茨海默病、自闭症谱系障碍、癫痫、多发性硬化、路易体病、COVID-19患者和健康对照 | NA | 单细胞RNA-seq, 单核RNA-seq | NA | NA |
8654 | 2025-10-07 |
The High-Affinity IL-2 Receptor Affects White Matter Damage after Cerebral Ischemia by Regulating CD8 + T Lymphocyte Differentiation
2025-Jan-16, Journal of neuroimmune pharmacology : the official journal of the Society on NeuroImmune Pharmacology
IF:5.2Q1
DOI:10.1007/s11481-025-10169-7
PMID:39821696
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研究论文 | 本研究探讨高亲和力IL-2受体通过调节CD8+T淋巴细胞分化影响脑缺血后白质损伤的机制 | 首次揭示高亲和力IL-2R在CD8+T细胞中的特异性表达及其通过干扰素-α反应通路等机制促进脑缺血后白质损伤 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 阐明高亲和力IL-2受体在脑缺血后免疫调节和白质损伤中的作用机制 | CD8+T淋巴细胞、脑缺血小鼠模型、内皮细胞 | 免疫学、神经科学 | 脑缺血、缺血性卒中 | 单细胞RNA测序、RNA-seq、qPCR、免疫荧光、多重检测、扩散张量成像、电生理学 | NA | 基因表达数据、影像数据、行为数据 | IL-2Rα基因敲除小鼠和对照小鼠 | NA | 单细胞RNA测序、RNA测序 | NA | NA |
8655 | 2025-10-07 |
Inhibition of aortic CX3CR1+ macrophages mitigates thoracic aortic aneurysm progression in Marfan syndrome in mice
2025-Jan-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI178198
PMID:39817456
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研究论文 | 本研究通过靶向CX3CR1+巨噬细胞及其分泌因子,揭示了其在马凡综合征胸主动脉瘤形成中的关键作用 | 首次发现主动脉内膜CX3CR1+巨噬细胞通过旁分泌TNF-α和IGF1驱动血管平滑肌细胞炎症,是胸主动脉瘤形成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床转化需进一步验证 | 探究免疫细胞介导的炎症在马凡综合征胸主动脉瘤发病机制中的作用 | Fbn1C1041G/+基因修饰小鼠和马凡综合征患者样本 | 单细胞生物学 | 胸主动脉瘤 | 单细胞RNA测序,骨髓移植,联体共生,shRNA慢病毒转导 | NA | 单细胞转录组数据,病理学数据 | 基因修饰小鼠模型和人类患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8656 | 2025-10-07 |
Aligned membranes regulate wound healing via MMP12 secreted by macrophages
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0317194
PMID:39813228
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研究论文 | 本研究揭示了排列电纺膜通过调控巨噬细胞分泌MMP12促进伤口愈合的机制 | 首次发现排列电纺膜通过上调MMP12表达抑制成纤维细胞迁移,从而促进无疤痕伤口愈合 | 未明确排列电纺膜调控MMP12表达的具体分子通路 | 阐明排列电纺纤维膜加速伤口愈合的分子机制 | 皮肤伤口愈合过程及相关细胞类型 | 组织工程 | 皮肤创伤 | bulk RNA测序, 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | bulk RNA-seq, 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8657 | 2025-10-07 |
Single-Cell RNA Sequencing Analysis Reveals Exercise-Induced Transcriptional Dynamics in Half-Marathon Runners
2025-Jan, Scandinavian journal of medicine & science in sports
IF:3.5Q1
DOI:10.1111/sms.70018
PMID:39817606
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析半马拉松业余跑者耐力运动后外周血单个核细胞的转录动态变化 | 首次在单细胞水平揭示耐力运动诱导的免疫细胞转录组变化,并采用伪批量分析方法与传统单细胞分析形成互补 | 样本量较小(仅4名参与者),研究结果需要更大规模研究验证 | 探究耐力运动对免疫细胞转录动态的影响及其潜在机制 | 半马拉松业余跑者的外周血单个核细胞 | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 4名参与者在跑半马拉松前后的血液样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
8658 | 2025-10-07 |
Integration of unpaired single cell omics data by deep transfer graph convolutional network
2025-Jan, PLoS computational biology
IF:3.8Q1
DOI:10.1371/journal.pcbi.1012625
PMID:39821189
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研究论文 | 提出基于图卷积网络的深度迁移模型scTGCN,用于整合未配对的单细胞组学数据 | 开发了能够保持生物变异性的深度迁移图卷积网络,可在低内存消耗下快速整合数十万个细胞 | 未在摘要中明确说明 | 提高单细胞组学数据中从scRNA-seq到scATAC-seq的标签迁移性能 | 单细胞RNA测序数据和单细胞染色质可及性数据 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞染色质可及性测序 | 图卷积网络(GCN) | 单细胞组学数据 | 数十万个细胞 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq, 多模态组学 | NA | APSA-seq, CITE-seq |
8659 | 2025-10-07 |
Single-cell transcriptome analysis reveals cellular reprogramming and changes of immune cell subsets following tetramethylpyrazine treatment in LPS-induced acute lung injury
2025, PeerJ
IF:2.3Q2
DOI:10.7717/peerj.18772
PMID:39822976
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示川芎嗪在LPS诱导的急性肺损伤中对细胞重编程和免疫细胞亚群的影响 | 首次在单细胞分辨率下系统揭示川芎嗪通过调节免疫细胞亚群和转录因子FOSL1/JunB发挥肺保护作用的新机制 | 研究仅基于小鼠模型,未进行临床验证;细胞亚群功能验证不够充分 | 探究川芎嗪对急性肺损伤肺组织微环境的保护作用及分子机制 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | 单细胞组学 | 急性肺损伤 | 单细胞RNA测序,生物信息学分析,免疫组织化学,酶联免疫吸附试验 | NA | 单细胞转录组数据 | LPS诱导的急性肺损伤小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
8660 | 2025-10-07 |
Cellular Senescence Genes as Cutting-Edge Signatures for Abdominal Aortic Aneurysm Diagnosis: Potential for Innovative Therapeutic Interventions
2025-Jan, Journal of cellular and molecular medicine
IF:4.3Q2
DOI:10.1111/jcmm.70323
PMID:39823264
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研究论文 | 本研究通过识别细胞衰老相关基因并验证其在腹主动脉瘤诊断中的潜力,揭示了细胞衰老在AAA进展中的关键作用 | 首次系统识别并验证ETS1和ITPR3作为腹主动脉瘤诊断生物标志物,结合机器学习算法和单细胞RNA测序技术 | 样本量相对有限,需要更大规模临床验证 | 识别与腹主动脉瘤发展相关的细胞衰老基因并评估其作为治疗靶点的潜力 | 腹主动脉瘤患者样本和小鼠模型 | 生物信息学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, WB, IF, RT-qPCR, 机器学习算法 | LASSO, SVM-RFE, 随机森林 | 基因表达数据, 血清样本, 组织样本 | GSE57691训练集和两个独立验证数据集,人类血清样本和小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 批量RNA测序 | NA | NA |