单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 31986 篇文献，本页显示第 8561 - 8580 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 8561 | 2025-05-09 |
scDREAMER for atlas-level integration of single-cell datasets using deep generative model paired with adversarial classifier
2023-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43590-8
PMID:38012145
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研究论文 | 介绍了一种名为scDREAMER的数据集成框架，用于整合异质性单细胞测序数据集 | 结合深度生成模型和对抗训练，支持无监督和有监督的数据集成，能够处理批次效应、细胞类型分布不均等问题 | 未提及具体的技术限制或应用范围的局限性 | 开发一个高效的框架来整合跨组织、时间和条件的单细胞测序数据集 | 单细胞测序数据集 | 生物信息学 | NA | 单细胞测序 | 深度生成模型与对抗分类器 | 单细胞测序数据 | 六个真实基准数据集和一个包含100万细胞的数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 8562 | 2025-05-09 |
Detection of isoforms and genomic alterations by high-throughput full-length single-cell RNA sequencing in ovarian cancer
2023-11-27, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43387-9
PMID:38012143
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研究论文 | 通过高通量全长单细胞RNA测序在卵巢癌中检测异构体和基因组改变 | 使用长读长单细胞RNA测序技术，提高了PacBio测序深度至每个细胞12,000读长，捕获了152,000个异构体，其中52,000个是先前未报道的 | 研究样本仅来自三名卵巢癌患者，样本量较小 | 理解癌症的复杂背景，提供单细胞分辨率的基因型-表型信息 | 卵巢癌患者的临床样本 | 数字病理学 | 卵巢癌 | 长读长单细胞RNA测序（scRNA-seq），PacBio测序 | NA | RNA测序数据 | 三名卵巢癌患者的临床样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8563 | 2025-05-09 |
Robust mapping of spatiotemporal trajectories and cell-cell interactions in healthy and diseased tissues
2023-11-25, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43120-6
PMID:38007580
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研究论文 | 开发了三种计算统计算法，整合空间转录组学的多种数据类型，以增强对健康与疾病组织中细胞过程的理解 | 提出了基于空间图的方法PSTS、空间约束的两级置换测试SCTP以及基于神经网络的插补方法stSME，用于建模细胞间相互作用和纠正技术噪声 | NA | 增强对健康与疾病组织中细胞过程的理解 | 细胞过程、细胞间相互作用 | 空间转录组学 | 癌症、脑损伤 | 空间转录组学 | 神经网络、基于图的方法 | 基因表达数据、物理距离数据、组织形态数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8564 | 2025-05-09 |
The extrafollicular B cell response is a hallmark of childhood idiopathic nephrotic syndrome
2023-11-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43504-8
PMID:37996443
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序和流式细胞术，揭示了儿童特发性肾病综合征（INS）中B细胞的异常反应特征 | 首次在儿童INS中发现了以非滤泡性B细胞反应为主的免疫扰动，并识别了特定的B细胞亚群扩增 | 样本量较小（13名INS患儿和24名健康对照），且仅分析了血液样本 | 探究儿童特发性肾病综合征的免疫发病机制 | 儿童特发性肾病综合征患者和健康对照的B细胞 | 免疫学 | 肾病综合征 | 单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 单细胞转录组数据，流式细胞数据 | 13名INS患儿和24名健康对照的血液样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8565 | 2025-05-09 |
Mouse models of pediatric high-grade gliomas with MYCN amplification reveal intratumoral heterogeneity and lineage signatures
2023-11-24, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43564-w
PMID:38001143
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research paper | 该研究通过构建基因工程小鼠模型，模拟人类MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤，揭示了肿瘤的分子特征和潜在治疗选项 | 首次构建了模拟人类HGG-MYCN的小鼠模型，并通过单细胞RNA测序揭示了肿瘤内异质性和谱系特征 | 研究仅基于小鼠模型，尚未在人类患者中进行验证 | 探索MYCN扩增的儿童高级别胶质瘤的肿瘤发生机制和分子特征，寻找潜在治疗选项 | 基因工程小鼠模型和人类肿瘤细胞 | 肿瘤生物学 | 儿童高级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序，高通量药物筛选 | 基因工程小鼠模型 | 基因表达数据，药物反应数据 | 未明确说明小鼠数量，但使用了小鼠和人类肿瘤细胞进行实验 | NA | NA | NA | NA |
| 8566 | 2025-05-09 |
Vector-borne Trypanosoma brucei parasites develop in artificial human skin and persist as skin tissue forms
2023-11-23, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43437-2
PMID:37996412
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研究论文 | 该研究通过人工人类皮肤模型和采采蝇自然感染，详细描述了布氏锥虫在皮肤中的发育过程及其进入可逆静止状态的特性 | 首次使用先进的人工人类皮肤模型和单细胞RNA测序技术，揭示了布氏锥虫在皮肤中的发育时序及其可逆静止状态 | 研究依赖于人工皮肤模型，可能无法完全模拟自然感染环境 | 探究布氏锥虫在人类皮肤中的发育过程及其持久感染机制 | 布氏锥虫及其在人工人类皮肤中的发育 | 寄生虫学 | 锥虫病 | 单细胞RNA测序 | 人工人类皮肤模型 | RNA序列数据 | NA | NA | NA | NA | NA |
| 8567 | 2025-05-09 |
Single-cell epigenomics and spatiotemporal transcriptomics reveal human cerebellar development
2023-11-22, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43568-6
PMID:37993461
|
研究论文 | 通过单细胞表观基因组学和时空转录组学揭示人类小脑发育的分子调控网络 | 结合单细胞转录组学、空间转录组学和单细胞染色质可及性状态，系统描绘了人类胎儿小脑发育的时空景观 | 研究主要关注人类胎儿小脑发育，可能不适用于其他物种或成体小脑 | 揭示人类小脑发育的分子调控机制及其与神经精神疾病的关联 | 人类胎儿小脑 | 基因组学 | 神经精神疾病 | 单细胞转录组学、空间转录组学、单细胞染色质可及性分析 | NA | 单细胞RNA-seq数据、染色质可及性数据、空间转录组数据 | 人类胎儿小脑样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8568 | 2025-05-08 |
Identification of CXCL13 as a Promising Biomarker for Immune Checkpoint Blockade Therapy and PARP Inhibitor Therapy in Ovarian Cancer
2025-Jun, Molecular biotechnology
IF:2.4Q3
DOI:10.1007/s12033-024-01207-5
PMID:38856873
|
research paper | 该研究识别了CXCL13作为卵巢癌免疫检查点阻断疗法和PARP抑制剂疗法的潜在生物标志物 | 发现CXCL13在HRD肿瘤中显著上调，并作为反映HRD状态的生物标志物，为卵巢癌ICB治疗提供了新的预后生物标志物视角 | 研究依赖于公共数据库和独立队列的验证，可能需要更多实验数据进一步确认CXCL13的临床应用价值 | 探索卵巢癌中免疫检查点阻断疗法和PARP抑制剂疗法的生物标志物 | 卵巢癌患者 | digital pathology | ovarian cancer | 基因组测序、免疫组化、单细胞测序 | NA | 基因组数据、临床数据、单细胞测序数据 | 来自TCGA、ICGC、GEO等公共数据库的数据，以及独立验证队列 | NA | NA | NA | NA |
| 8569 | 2025-05-08 |
ABCC3 Is a Differential Marker of CYP11B2-Negative Zona Glomerulosa Cells in Human Adrenal Cortex
2025-May-07, Endocrine pathology
IF:11.3Q1
DOI:10.1007/s12022-025-09862-3
PMID:40332623
|
research paper | 该研究探讨了ABCC3在人肾上腺皮质中的表达和功能，特别是在原发性醛固酮增多症背景下，与CYP11B2的关系 | 发现ABCC3作为CYP11B2阴性ZG细胞的新标记物，为区分正常肾上腺分区和醛固酮生成病变提供了新的组织病理学工具 | 研究主要关注ABCC3在特定肾上腺病变中的表达模式，未涉及其在其他疾病或组织中的潜在作用 | 研究ABCC3在人肾上腺皮质中的表达和功能，特别是在原发性醛固酮增多症中的作用 | 人肾上腺皮质细胞、醛固酮生成腺瘤(APAs)、皮质醇生成腺瘤和非功能性腺瘤 | 分子生物学 | 原发性醛固酮增多症 | 空间转录组学、免疫荧光共定位 | NA | mRNA/蛋白质表达数据 | 多种肾上腺腺瘤样本（APAs、皮质醇生成腺瘤、非功能性腺瘤）及相邻肾上腺皮质组织 | NA | NA | NA | NA |
| 8570 | 2025-05-08 |
Single-cell analysis reveals the implication of vascular endothelial cell-intrinsic ANGPT2 in human intracranial aneurysm
2025-May-06, Cardiovascular research
IF:10.2Q1
DOI:10.1093/cvr/cvae186
PMID:39187926
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research paper | 通过单细胞RNA测序揭示血管内皮细胞内在的ANGPT2在人颅内动脉瘤中的意义 | 首次通过单细胞RNA测序全面分析颅内动脉瘤的细胞组成和血管内皮细胞的转录组变化，并发现ANGPT2在动脉瘤形成中的作用 | 研究主要基于单细胞RNA测序数据，需要进一步的实验验证 | 探索颅内动脉瘤的发病机制和潜在治疗靶点 | 人颅内动脉瘤和对照动脉组织 | digital pathology | cardiovascular disease | scRNA-seq | zebrafish model | RNA sequencing data | 43,462个细胞的转录组数据 | NA | NA | NA | NA |
| 8571 | 2025-05-08 |
A Spatial Multi-Omic Framework Identifies Gliomas Permissive to TIL Expansion
2025-Apr-25, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-6314842/v1
PMID:40313763
|
研究论文 | 该研究通过多模态分析方法识别了允许肿瘤浸润淋巴细胞（TIL）扩增的胶质瘤的空间和分子特征 | 整合了多种高通量技术（如单细胞RNA测序、空间蛋白质组学等）进行多模态分析，揭示了TIL扩增的基因组和空间决定因素 | 研究主要针对高级别胶质瘤，结果在其他免疫排斥性癌症中的普适性需要进一步验证 | 识别TIL扩增的基因组和空间决定因素，为基于T细胞的免疫治疗提供选择平台 | 高级别胶质瘤 | 数字病理学 | 胶质母细胞瘤 | 光谱流式细胞术、TCR测序、单细胞RNA-seq、Xenium转录组学、CODEX空间蛋白质组学 | NA | 多组学数据（基因组、转录组、蛋白质组） | 未明确提及具体样本数量，但涉及高级别胶质瘤的TIL生成与非生成肿瘤对比 | NA | NA | NA | NA |
| 8572 | 2025-05-08 |
Induced B-Cell Receptor Diversity Predicts PD-1 Blockade Immunotherapy Response
2024-Dec-04, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.12.03.626669
PMID:39677742
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research paper | 研究通过单细胞RNA测序和高清空间转录组学分析，揭示了B细胞受体多样性在预测PD-1阻断免疫治疗反应中的作用 | 发现PD-1抑制成功反应的特征是治疗后B细胞受体克隆多样性的诱导，并验证了其作为跨多种癌症治疗反应预测因子的普遍性 | 研究样本主要集中在特定类型的癌症患者，可能限制了结果的广泛适用性 | 探索PD-1阻断免疫治疗反应的机制，并寻找预测治疗反应的生物标志物 | 局部晚期或转移性基底细胞癌患者，以及胶质母细胞瘤、黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌患者 | digital pathology | basal cell carcinoma, glioblastoma, melanoma, head and neck squamous cell carcinoma | single-cell RNA sequencing, high-definition spatial transcriptomics, spatial immunoreceptor profiling | machine learning | RNA sequencing data | 一组局部晚期或转移性基底细胞癌患者，以及更大的胶质母细胞瘤、黑色素瘤和头颈部鳞状细胞癌患者队列 | NA | NA | NA | NA |
| 8573 | 2025-05-08 |
Senescence of human pancreatic beta cells enhances functional maturation through chromatin reorganization and promotes interferon responsiveness
2024-Jun-24, Nucleic acids research
IF:16.6Q1
DOI:10.1093/nar/gkae313
PMID:38682582
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研究论文 | 研究人类胰腺β细胞的衰老如何通过染色质重组增强功能成熟并促进干扰素反应性 | 揭示了p16阳性β细胞的衰老状态如何通过染色质重组激活功能成熟基因的增强子，从而增强胰岛素分泌能力，并首次发现这些细胞中干扰素刺激基因的升高 | 研究主要基于体外培养的β样细胞和单细胞转录组数据，未在体内模型中验证这些发现 | 探究人类胰腺β细胞衰老对其功能成熟和干扰素反应性的影响 | 人类胰腺β细胞 | 细胞生物学 | 糖尿病 | 单细胞转录组分析 | NA | 转录组数据 | 成人人类胰腺β细胞的单细胞转录组数据集 | NA | NA | NA | NA |
| 8574 | 2025-05-08 |
Cabergoline targets multiple pathways to inhibit PRL secretion and increases stromal fibrosis
2024-Jun-05, European journal of endocrinology
IF:5.3Q1
DOI:10.1093/ejendo/lvae055
PMID:38781434
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析卡麦角林治疗和未治疗的泌乳素瘤的细胞组成和转录景观，揭示卡麦角林抑制PRL分泌及增加间质纤维化的多途径机制 | 首次描述了卡麦角林治疗后CD8+ T细胞的未知激活，这可能在其抗肿瘤作用中发挥作用 | 样本量较小（仅5例手术切除的泌乳素瘤） | 揭示多巴胺激动剂治疗在人类泌乳素瘤肿瘤及邻近间质和免疫细胞中的潜在机制 | 3例卡麦角林治疗患者和2例未治疗患者的5例手术切除泌乳素瘤 | 单细胞转录组学 | 泌乳素瘤 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | RNA-seq数据 | 5例手术切除的泌乳素瘤（3例治疗，2例未治疗） | NA | NA | NA | NA |
| 8575 | 2025-05-08 |
Single-cell Transcriptome Analysis Identifies Senescent Osteocytes as Contributors to Bone Destruction in Breast Cancer Metastasis
2024-Mar-14, Research square
DOI:10.21203/rs.3.rs-4047486/v1
PMID:38558984
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research paper | 该研究通过单细胞转录组分析揭示了衰老骨细胞在乳腺癌骨转移中促进骨破坏的作用 | 首次发现乳腺癌骨转移中的骨细胞会提前衰老并表现出独特的衰老相关分泌表型(SASP)，促进骨破坏 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限 | 探究乳腺癌骨转移中骨微环境重编程对骨细胞的影响 | 乳腺癌骨转移中的骨细胞 | digital pathology | breast cancer | single-cell RNA sequencing, multiplex hybridization, AI-assisted analysis | NA | RNA-seq数据 | 小鼠模型和乳腺癌骨转移患者样本 | NA | NA | NA | NA |
| 8576 | 2025-05-08 |
A review of single-cell transcriptomics and epigenomics studies in maternal and child health
2024, Epigenomics
IF:3.0Q2
DOI:10.1080/17501911.2024.2343276
PMID:38709139
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review | 本文综述了单细胞转录组学和表观基因组学在母婴健康领域的研究 | 总结了16个人类和哺乳动物胎盘的单细胞图谱以及31项关于母体暴露和并发症的单细胞研究 | NA | 综述单细胞测序技术在母婴健康领域的应用 | 人类和哺乳动物胎盘以及母体暴露和并发症 | 单细胞测序 | 母婴健康相关疾病 | 单细胞转录组学和表观基因组学 | NA | 单细胞测序数据 | 16个单细胞图谱和31项单细胞研究 | NA | NA | NA | NA |
| 8577 | 2025-10-07 |
SMARCB1 loss activates patient-specific distal oncogenic enhancers in malignant rhabdoid tumors
2023-12-01, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43498-3
PMID:38040699
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研究论文 | 本研究揭示了SMARCB1基因缺失通过激活患者特异性远端致癌增强子驱动恶性横纹肌样瘤发生的机制 | 首次发现SMARCB1缺失导致患者特异性远端增强子与MYC癌基因启动子形成染色质环，揭示了MRT肿瘤发生中的表观遗传重编程机制 | 研究主要基于患者来源的类器官模型，需要在更广泛的临床样本中验证 | 探究SMARCB1缺失在恶性横纹肌样瘤中如何改变调控景观并驱动肿瘤发生 | 恶性横纹肌样瘤患者来源的类器官组织和患者MRT组织 | 表观遗传学 | 恶性横纹肌样瘤 | 多组学分析、染色体构象捕获、单细胞RNA-seq、单细胞ATAC-seq | NA | 基因组学数据、表观遗传学数据、转录组数据 | 患者来源的MRT类器官和患者组织样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq | NA | NA |
| 8578 | 2025-10-07 |
PD-1- CD45RA+ effector-memory CD8 T cells and CXCL10+ macrophages are associated with response to atezolizumab plus bevacizumab in advanced hepatocellular carcinoma
2023-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43381-1
PMID:38030622
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研究论文 | 通过单细胞转录组学分析阿特珠单抗联合贝伐珠单抗治疗晚期肝细胞癌的免疫反应机制 | 首次在单细胞水平揭示PD-1-CD45RA+效应记忆CD8 T细胞和CXCL10+巨噬细胞与治疗反应的相关性 | 样本量有限，需要更大规模研究验证发现 | 探索阿特珠单抗联合贝伐珠单抗治疗晚期肝细胞癌的免疫机制 | 晚期肝细胞癌患者 | 数字病理学 | 肝细胞癌 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 未明确说明具体样本数量 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8579 | 2025-10-07 |
Integrating spatial and single-cell transcriptomics data using deep generative models with SpatialScope
2023-11-29, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-023-43629-w
PMID:38030617
|
研究论文 | 提出一种整合空间转录组和单细胞转录组数据的深度生成模型方法SpatialScope | 通过创新的模型和算法设计，能够同时提升测序型ST数据的单细胞分辨率并准确推断成像型ST数据的全转录组表达水平 | NA | 解决当前空间转录组技术在细胞分辨率或全转录组分析方面的局限性 | 空间转录组数据和单细胞RNA测序参考数据 | 计算生物学 | NA | 空间转录组学，单细胞RNA测序 | 深度生成模型 | 空间转录组数据，单细胞转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学，单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 8580 | 2025-10-07 |
Cellular underpinnings of the selective vulnerability to tauopathic insults in Alzheimer's disease
2023-Nov-29, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.07.06.548027
PMID:38076913
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研究论文 | 本研究通过细胞类型定位技术探索阿尔茨海默病中tau病理选择性易感性的细胞基础 | 首次在全脑水平系统研究细胞类型分布与tau病理选择性易感性的关系，发现细胞类型组成比风险基因更能预测tau病理 | 研究基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 揭示阿尔茨海默病中tau病理区域性易感性的细胞机制 | 小鼠脑组织中的神经元和非神经元细胞 | 神经科学 | 阿尔茨海默病 | 单细胞RNA测序，细胞类型定位分析，基因本体分析 | MISS（矩阵逆和子集选择）细胞类型定位流程 | 单细胞RNA测序数据，转基因小鼠模型数据 | 12种不同的PS19小鼠模型，5项转基因小鼠研究 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |