单细胞与空转测序相关文章

本数据库通过收集和整理最新科研文献信息而得,供了解领域前沿进展之用。数据源自 PubMed Data ,每日自动更新(使用关键词“['single-cell sequencing', 'single-cell RNA sequencing', 'single-cell transcriptomics', 'single-cell RNA-seq', 'single-cell transcriptome', 'scRNA-seq', 'spatial transcriptomics']”过滤),已收录文献数量参见 统计表格。表格内容由 GPT 自动整理,可能存在错误或遗漏,请使用时务必注意核实!

如有建议或合作意向,欢迎联系 linlin.yan(AT)bioinfo.app 或 微信 yanlinlin82。本项目遵循 MIT 许可 发布,欢迎下载 源码 自行修改使用。如觉得不错,还请不吝 给我打赏,你的支持是我继续创新的重要动力!

Sample Image
添加微信请说明来意
Sample Image
微信赞赏

除通过在线浏览外,为方便用户离线查阅,本站也提供 付费下载(定价19.9元)。之所以考虑收费,是因为批量扫描这些文献并整理也是有一定成本的,还请理解并多多支持。本站数据会持续更新,而仅需一次付费,未来就可以随时重新下载到最新版本数据。

当前筛选条件: [分区不过滤] [IF不过滤] [发表日期不过滤] [清除筛选条件]
当前共找到 38102 篇文献,本页显示第 661 - 680 篇。
序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
661 2026-03-29
ChemR23 prevents phenotypic switching of vascular smooth muscle cells into macrophage-like foam cells in atherosclerosis
2026-Mar-16, Cardiovascular research IF:10.2Q1
研究论文 本研究揭示了ChemR23在调节血管平滑肌细胞表型转换、影响动脉粥样硬化中的关键作用,并提出了其作为治疗靶点的潜力 首次在非造血细胞(特别是血管平滑肌细胞)中明确了ChemR23的功能,揭示了其通过调节VSMC表型转换(从收缩型向合成型/泡沫细胞样转换)影响动脉粥样硬化的新机制,并验证了靶向ChemR23的小分子抑制剂(α-NETA)和激动剂(C9)的治疗潜力 研究主要基于小鼠模型和体外细胞实验,人类数据仅来自单细胞转录组分析,缺乏直接的人类体内功能验证;治疗干预的观察时间相对较短(4周) 探究ChemR23在血管平滑肌细胞中的特异性功能及其在动脉粥样硬化发生发展中的作用 Apoe-/-小鼠、ChemR23e/e Apoe-/-双缺陷小鼠、人主动脉平滑肌细胞、人类晚期动脉粥样硬化斑块样本 心血管疾病研究 动脉粥样硬化 骨髓移植、bulk RNA测序、单细胞转录组测序、体外细胞培养与处理、基因表达分析、胆固醇摄取与流出测定、细胞增殖检测 NA 基因表达数据、单细胞转录组数据、细胞功能数据 使用Apoe-/- ►ChemR23e/e Apoe-/-骨髓移植小鼠模型进行体内实验,并利用人主动脉平滑肌细胞进行体外机制研究 NA bulk RNA-seq, 单细胞RNA-seq NA NA
662 2026-03-29
Equine endometrial organoids preserve tissue structure and cycle-stage transcriptional identity†
2026-Mar-16, Biology of reproduction IF:3.1Q2
研究论文 本研究评估了马子宫内膜类器官在生殖周期阶段和长期培养中的结构和分子保真度 首次详细表征了马子宫内膜类器官在不同生殖周期阶段的结构和转录组特征,并揭示了类器官在长期培养中转录特征的动态变化 类器官在分化、血管生成和免疫反应相关基因表达方面与原生组织存在差异,且长期培养中周期特异性转录特征会逐渐减弱 评估马子宫内膜类器官作为研究子宫内膜生物学和生殖周期模型的适用性 马子宫内膜类器官和原生组织 数字病理学 NA 组织学、免疫组织化学、电子显微镜、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 NA 图像、文本(基因表达数据) 从发情期和黄体期采集的活检组织生成的类器官 NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
663 2026-03-29
Cancer-associated fibroblasts in bladder cancer: Immunosuppressive mechanisms and therapeutic targeting
2026-Mar-10, Seminars in oncology IF:3.0Q2
综述 本文综述了膀胱癌中癌症相关成纤维细胞(CAFs)的免疫抑制机制及其作为治疗靶点的潜力 整合了单细胞分析和空间转录组学的最新发现,揭示了CAFs的异质性、可塑性及其在肿瘤微环境中调控免疫细胞行为和影响治疗反应的空间组织模式 作为一篇综述文章,主要基于现有文献进行总结和分析,未提出新的原始实验数据或模型 探讨膀胱癌中CAFs介导的免疫抑制机制,并综述针对CAFs的治疗策略 膀胱癌及其肿瘤微环境中的癌症相关成纤维细胞(CAFs) 肿瘤生物学 膀胱癌 单细胞分析,空间转录组学 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
664 2026-03-29
Dynamic transcriptomic remodeling in grafted human neural progenitor cells uncovers mechanisms for vision preservation in a rat model of retinitis pigmentosa
2026-03-06, Nature communications IF:14.7Q1
研究论文 本研究利用单细胞转录组学分析移植的人类神经祖细胞在视网膜色素变性大鼠模型中的动态基因表达变化,揭示了其通过营养因子分泌等机制保护光感受器细胞 首次通过单细胞转录组学系统揭示移植hNPCs在退行性视网膜环境中的长期命运及其与宿主细胞的动态互作机制 研究基于啮齿动物模型,结果向人类临床转化的适用性有待验证;长期观察时间点有限 探究移植人类神经祖细胞在视网膜色素变性模型中保护视力的分子机制 移植的人类神经祖细胞和宿主视网膜细胞 数字病理学 视网膜色素变性 单细胞转录组学 NA 单细胞RNA测序数据 啮齿动物模型样本 NA 单细胞RNA-seq NA NA
665 2026-03-29
Exploring the human brain: spatial transcriptomics challenges and approaches in post-mortem analysis
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
综述 本文回顾了空间转录组学技术在人类大脑研究中的应用、挑战与机遇 系统比较了空间转录组学工具,并总结了其在人类大脑研究中的具体应用,为研究人员提供了应对复杂器官分析挑战的指南 NA 探讨空间转录组学在人类大脑研究中的挑战与机遇 人类大脑 数字病理学 神经系统疾病 空间转录组学 NA mRNA表达数据 NA NA 空间转录组学 NA NA
666 2026-03-29
Somatic gene mutations in the motor cortex of patients with sporadic amyotrophic lateral sclerosis
2026-Mar-05, Brain : a journal of neurology IF:10.6Q1
研究论文 本研究通过分析散发性肌萎缩侧索硬化症(sALS)患者尸检组织中的DNA和单细胞RNA测序数据,探索了体细胞嵌合变异在sALS中的作用 首次在sALS患者运动皮层中鉴定出低等位基因频率的体细胞突变,特别是在兴奋性神经元中,并发现体细胞FUS p.E516X变异导致核质错误定位和聚集,支持神经元自主性疾病起始假说 研究基于尸检组织,可能无法完全反映疾病早期过程;样本量相对有限;单细胞RNA测序数据可能受技术噪音影响 探究体细胞嵌合变异在散发性肌萎缩侧索硬化症(sALS)发病机制中的作用 散发性肌萎缩侧索硬化症(sALS)患者的尸检运动皮层组织 数字病理学 肌萎缩侧索硬化症 深度靶向panel测序, 单细胞RNA测序 NA DNA测序数据, 单细胞RNA测序数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
667 2026-03-29
Class A scavenger receptors promote tumor progression and induce a unique macrophage phenotype in a mouse model of spontaneous breast cancer
2026-Mar-03, Journal of leukocyte biology IF:3.6Q2
研究论文 本研究通过小鼠自发性乳腺癌模型,探讨了A类清道夫受体(SR-A)在肿瘤进展中的作用及其对肿瘤相关巨噬细胞表型的影响 首次在自发性乳腺癌模型中证实SR-A缺失可延缓肿瘤发生并减少肺转移,发现SR-A可与乳腺癌细胞表面聚糖结合,并通过单细胞RNA测序鉴定出具有高精氨酸酶1基因表达的独特SR-A依赖性TAM亚群 研究基于小鼠模型,其在人类乳腺癌中的直接相关性仍需进一步验证,SR-A的具体信号通路和下游效应分子尚未完全阐明 评估成纤维细胞激活蛋白酶(FAP)和SR-A在乳腺癌进展中的作用,特别是SR-A对肿瘤相关巨噬细胞表型及肿瘤微环境的影响 自发性乳腺癌小鼠模型中的肿瘤相关巨噬细胞和乳腺癌细胞 肿瘤免疫学 乳腺癌 单细胞RNA测序,流式细胞术,通路分析 NA 基因表达数据,流式细胞数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
668 2026-03-29
Spatiotemporal transcriptomic profiling reveals upregulation of glycolysis pathway genes before overt tauopathy in the PS19 mouse model
2026-Mar, Experimental & molecular medicine
研究论文 本研究利用PS19小鼠模型,通过空间转录组分析揭示了在tau蛋白病明显病变前,海马CA3区糖酵解通路基因的早期上调,强调了代谢应激和胶质细胞激活在tau蛋白病及区域易感性中的作用 首次在PS19小鼠模型中,通过空间转录组学技术,在可检测的tau缠结病理出现前(2月龄)发现了海马CA3区糖酵解通路基因(如Pgk1)的早期上调,并揭示了区域特异性、时间动态的转录模式 研究基于转基因小鼠模型,其结果向人类疾病的直接转化可能存在限制;空间转录组分析可能受限于分辨率,未能解析单细胞水平的异质性 探究tau蛋白病进展中区域易感性与tau蛋白驱动的转录组变化之间的关系,特别是代谢失调的早期作用 PS19转基因小鼠(tau P301S模型)的海马和皮质区域 空间转录组学 阿尔茨海默病 空间转录组分析 NA 空间转录组数据 PS19小鼠模型在选定疾病阶段的海马和皮质区域样本 NA 空间转录组学 NA NA
669 2026-03-29
Early-activated extracellular matrix proteins shape the metabolic and spatial dynamics of the kidney fibrotic microenvironment
2026-Mar, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 本研究揭示了ECM1作为肾脏纤维化早期调控因子,通过整合素α2β1-RhoC轴调控YAP活性,进而影响线粒体氧化磷酸化,从而塑造肾脏纤维化微环境的代谢与空间动态 首次发现ECM1是肾脏重塑的早期调控因子,并阐明其通过整合素α2β1-RhoC-YAP-TEAD4-Pgc1a信号轴调控线粒体代谢重编程,从而对抗纤维化进展的机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床验证尚需进一步开展;ECM1在不同细胞类型中的特异性作用机制有待深入解析 探究早期激活的细胞外基质蛋白在肾脏纤维化微环境形成中的作用机制 小鼠肾脏组织、成纤维细胞、肾小管细胞 空间组学 慢性肾脏病 空间转录组学、空间蛋白质组学、AAV9介导的基因敲低、条件性基因敲除 基因敲除小鼠模型 空间转录组数据、空间蛋白质组数据、组织学图像 全球性Ecm1敲除小鼠及成纤维细胞特异性敲除小鼠 NA 空间转录组学, 空间蛋白质组学 NA NA
670 2026-03-29
A brain-gut excitatory peptide/CCHamide homolog regulates satiation and motivational state transitions in the Aplysia feeding circuit
2026-Mar, The Journal of biological chemistry IF:4.0Q2
研究论文 本研究在软体动物海兔中鉴定了EP/CCHa同源肽及其受体,揭示了该脑-肠肽作为饱食信号调控摄食动机状态转换的机制 首次在海兔中鉴定出EP/CCHa同源肽及其两个受体,发现其中一个受体意外地与节肢动物受体聚类,揭示了该肽通过特定中枢模式发生器中间神经元调控摄食动机状态转换的新机制 研究主要在海兔模型中进行,其发现是否适用于其他物种仍需进一步验证 探究EP/CCHa信号通路在摄食回路中的调控机制 海兔(Aplysia)的摄食回路及相关神经元 神经科学 NA 质谱分析、原位杂交、免疫组化、单细胞RNA测序 NA 分子数据、细胞数据、行为数据 NA NA 单细胞RNA测序 NA NA
671 2026-03-29
Lipid-dependent accrual of a subset of monocyte-derived macrophages is essential for tissue regeneration
2026-Mar, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 本研究揭示了一种脂质依赖性的单核细胞来源巨噬细胞亚群在肝脏损伤后组织再生中的关键作用 首次发现并表征了具有高脂质含量和强炎症反应的“脂质炎症性单核来源巨噬细胞”亚群,阐明其通过CD36-神经酰胺-IRE1α-XBP1-IL-6信号轴调控肝脏再生的新机制 研究主要聚焦于肝脏再生模型,在其他组织或疾病模型中的普适性有待验证;机制研究尚未完全解析脂质代谢与炎症信号整合的具体分子细节 探究肝脏损伤后免疫反应与代谢重编程如何协同调控肝细胞增殖和组织再生 小鼠肝脏损伤模型中的单核细胞来源巨噬细胞亚群、肝细胞 免疫代谢学 肝脏疾病 单细胞转录组学、定量脂质组学、多组学分析 NA 单细胞RNA测序数据、脂质组学数据 NA NA 单细胞RNA-seq NA NA
672 2026-03-29
Defining the vascular niche of human adipose tissue across metabolic states
2026-Mar, Nature metabolism IF:18.9Q1
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序技术,揭示了人类皮下脂肪组织中血管系统的细胞异质性及其在肥胖和2型糖尿病中的变化 首次在人类脂肪组织中系统描绘了血管细胞的单细胞图谱,并发现了一个具有内皮、间充质、脂肪细胞和免疫转录特征的独特内皮细胞亚群 研究仅针对皮下脂肪组织,未涉及内脏脂肪等其他脂肪类型;样本量相对有限(65名个体) 阐明人类脂肪组织血管微环境的细胞组成及其在代谢状态变化中的作用 人类皮下脂肪组织中的血管细胞 单细胞组学 肥胖、2型糖尿病 单细胞RNA测序、全组织成像、计算分析 NA 单细胞转录组数据、成像数据 65名个体的近70,000个血管细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
673 2026-03-29
A benchmark of semi-supervised scRNA-seq integration methods in real-world scenarios
2026-Mar, PLoS computational biology IF:3.8Q1
研究论文 本文首次在真实场景下系统性地评估了半监督单细胞RNA测序整合方法,并与无监督方法进行了比较 首次在真实条件下系统比较半监督与无监督单细胞RNA测序整合方法,并考虑了多种不完美标签场景 研究显示当前半监督方法在标签质量不确定时实际优势有限,且没有方法能始终优于最强的无监督方法 评估半监督单细胞RNA测序整合方法在真实场景下的性能与鲁棒性 单细胞RNA测序数据整合方法 单细胞组学 NA 单细胞RNA测序 scANVI, ssSTACAS 单细胞RNA测序数据 六个不同数据集 NA 单细胞RNA-seq NA NA
674 2026-03-29
Computational framework for therapeutic target discovery via perturbation simulation: application to cystic fibrosis airway disease
2026-Mar-01, Briefings in bioinformatics IF:6.8Q1
研究论文 本文提出了一种整合单细胞转录组学、加权基因共表达网络分析和计算扰动模拟的计算框架,用于系统性发现治疗靶点,并以囊性纤维化气道疾病为例进行应用 开发了一个结合多尺度生物数据整合与系统级扰动模拟的计算框架,能高效发现新颖治疗靶点,具有可扩展性和通用性 未在实验或临床层面进行验证,仅通过计算模拟评估靶点 开发一种计算框架,用于系统性发现复杂疾病的治疗靶点 囊性纤维化气道疾病患者 计算生物学 囊性纤维化 单细胞RNA测序 知识图谱、加权基因共表达网络分析 单细胞转录组数据 38名患者,51,415个细胞 NA 单细胞RNA-seq NA NA
675 2026-03-29
CoMBCR: Co-Learning Multi-Modalities of BCRs and gene expressions
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文介绍了CoMBCR,一种共同学习B细胞受体(BCR)和基因表达谱的B细胞嵌入工具,用于下游分析 CoMBCR创新性地将BCR和基因表达这两种互补模态数据共同学习,并在统一潜在空间中表示,优于仅编码BCR的方法 NA 开发一种能够共同学习B细胞多模态数据的工具,以提升B细胞生物学特征捕获和下游分析能力 B细胞 机器学习 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 嵌入模型 基因表达数据,BCR序列数据 126,791个B细胞 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
676 2026-03-29
BrainConnect: processing brain connectivity and spatial transcriptomics data for integrative analysis
2026-Feb-28, Bioinformatics (Oxford, England)
研究论文 本文开发了一个软件BrainConnect,用于处理小鼠大脑连接数据和空间转录组学数据,以预测连接强度并识别相关基因 首次提出一种方法,将不同类型的大脑连接数据与空间转录组学数据在一致的大脑区域格式下整合处理,并利用LSTM网络预测连接强度 该方法目前仅应用于小鼠大脑数据,尚未扩展到其他物种或更复杂的大脑模型 通过整合大脑连接数据和空间转录组学数据,预测大脑连接强度并识别调控连接的重要基因 小鼠大脑的神经元连接组和空间转录组学数据 数字病理学 NA 空间转录组学 LSTM 图像, 文本 NA NA 空间转录组学 NA NA
677 2026-03-29
Spatial Transcriptomics Profiling of Small Intestine Adenocarcinoma and Adenoma in Humans and a Murine Model with KRASG12D and Loss of CDKN2a-p16
2026-Feb-26, The American journal of pathology
研究论文 本研究利用空间转录组学分析了人类和小鼠模型中小肠腺癌和腺瘤的分子特征,揭示了分化亚型、微环境及驱动通路 首次结合人类和小鼠模型的空间转录组学分析,识别了小肠腺癌的分化特征、微环境信号交互及MEK抑制剂敏感性,并开发了模拟人类病变的新型基因工程小鼠模型 研究样本数量有限,且小鼠模型未完全复制人类所有亚型(如肠型腺癌) 确定人类和小鼠模型中小肠腺癌/十二指肠腺癌的分化亚型及驱动分子通路 人类和小鼠的小肠腺癌、腺瘤及其微环境 数字病理学 小肠腺癌 空间转录组学,免疫组织化学 基因工程小鼠模型(p16KOKrasG12D) 空间转录组数据,组织图像 人类和小鼠样本,具体数量未明确说明 NA 空间转录组学 NA NA
678 2026-03-29
A systems immunology approach reveals divergent immune profiles of RSV and SARS-CoV-2 infections in infants
2026-Feb-25, Science translational medicine IF:15.8Q1
研究论文 本研究通过系统免疫学方法比较了婴儿感染RSV和SARS-CoV-2后的免疫特征差异 首次在婴儿中综合运用细胞因子分析、单细胞转录组学和表观基因组学,揭示了两种病毒感染诱导的疾病特异性免疫特征 样本量相对较小(RSV 19例,SARS-CoV-2 30例,健康对照17例),且为横断面研究 揭示婴儿感染RSV和SARS-CoV-2后免疫反应的差异机制 婴儿血液样本(中位年龄2.3个月) 系统免疫学 呼吸道感染 细胞因子分析、单细胞转录组学、表观基因组学 NA 血液样本、转录组数据、表观遗传数据 RSV感染婴儿19例,SARS-CoV-2感染婴儿30例,健康对照婴儿17例 NA 单细胞转录组学、表观基因组学 NA NA
679 2026-03-29
Human hippocampal neurogenesis in adulthood, ageing and Alzheimer's disease
2026-Feb-25, Nature IF:50.5Q1
研究论文 本研究通过多组学单细胞测序技术,探讨了人类海马体神经发生在成年、衰老及阿尔茨海默病中的变化及其与认知功能的关系 首次利用单细胞多组学测序技术,系统分析了不同认知状态人群海马体神经发生的分子特征,并识别出超级老年人特有的神经发生特征 研究基于死后海马体样本,无法直接观察神经发生的动态过程;样本量相对有限,可能影响统计效力 探究人类海马体神经发生在衰老和阿尔茨海默病中的分子机制及其与认知功能的关系 人类死后海马体样本,包括年轻成人、无认知障碍老年人、超级老年人、临床前阿尔茨海默病成人和阿尔茨海默病患者 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞多组学测序,包括单核RNA测序和单核ATAC测序 NA 单细胞测序数据 355,997个海马体样本核 NA 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq NA NA
680 2026-03-29
ETV2-ECSCR-mTOR pathways regulate reprogramming to the endothelial lineage
2026-Feb-23, Stem cells (Dayton, Ohio)
研究论文 本研究揭示了ETV2通过调控ECSCR和mTORC1通路在细胞重编程为内皮谱系中的关键作用 首次将ECSCR鉴定为ETV2的直接转录靶点,并发现其通过mTORC1通路负反馈调节ETV2介导的细胞重编程 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在人类细胞中进行验证 探索ETV2调控内皮谱系重编程的分子机制 小鼠胚胎体分化、胚胎成纤维细胞重编程以及发育中的小鼠胚胎 细胞生物学 NA 单细胞RNA测序, ATAC-seq, ChIP-seq, 凝胶迁移实验, 转录分析 NA RNA-seq数据, ATAC-seq数据, ChIP-seq数据 使用转基因小鼠和基因敲除小鼠模型,具体样本数量未明确说明 NA 单细胞RNA-seq NA NA
回到顶部