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序号 推送日期 文章 类型 简述 创新点 不足 研究目的 研究对象 领域 病种 技术 模型 数据类型 样本量 平台公司 平台技术 具体产品 平台详情
5881 2025-12-27
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,对唐氏综合征个体在阿尔茨海默病不同阶段的PBMCs进行深入免疫分析,并与AD核心生物标志物水平关联 首次在单细胞分辨率下研究唐氏综合征个体在AD连续谱中外周免疫系统的作用,并整合多模态生物标志物数据 样本量相对有限,且为横断面研究,无法确定因果关系 表征唐氏综合征个体在AD不同阶段的外周血单核细胞,并探索其与AD病理标志物的关联 唐氏综合征个体(包括临床前AD、前驱期AD和AD痴呆)以及认知未受损的健康对照 单细胞组学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序,T细胞受体测序 NA 单细胞转录组数据,生物标志物数据 15名健康对照和46名唐氏综合征个体 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5882 2025-12-27
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究探讨了P2RX7在阿尔茨海默病tau病理中通过调节小胶质细胞外泌体分泌的作用机制 首次揭示了P2RX7通过调控小胶质细胞外泌体分泌影响tau蛋白传播和神经炎症的新机制 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需进一步验证 探究P2RX7在阿尔茨海默病tau病理传播中的作用及其治疗潜力 PS19 tauopathy小鼠模型、条件性基因敲除小鼠、脑组织外泌体 神经科学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序、蛋白质组学分析、免疫荧光、ELISA、病毒载体注射 动物模型(小鼠) 基因表达数据、蛋白质数据、影像数据 9-10月龄PS19:P2rx7-/-小鼠及对照小鼠 NA 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 NA NA
5883 2025-12-27
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究通过将急性缺血性卒中患者的粪便微生物移植到3xTg-AD小鼠中,探讨了卒中后肠道菌群失调如何加剧阿尔茨海默病病理 首次结合粪便微生物移植、免疫组化和单细胞空间转录组学,系统揭示了卒中后肠道菌群失调通过肠-脑轴加剧AD神经炎症和病理的机制 研究样本量较小(人类n=16,小鼠n=71),且仅在3xTg-AD小鼠模型中进行,未在人类中直接验证 阐明卒中增加AD风险的潜在机制,特别是肠道菌群失调的作用 3xTg-AD转基因小鼠模型,以及卒中患者和健康对照的粪便样本 数字病理学 阿尔茨海默病 粪便微生物移植,免疫组化,单细胞空间转录组学 NA 图像,空间转录组数据 人类:16名(8名卒中患者,8名健康对照);小鼠:71只(5雄8雌对照组,12雄15雌健康FMT组,14雄17雌卒中FMT组) NA 单细胞空间转录组学 CosMx Spatial Molecular Imaging CosMx空间分子成像用于全脑细胞类型分析和靶向基因表达
5884 2025-12-27
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究通过构建单核和空间转录组图谱,分析了突触核蛋白病和阿尔茨海默病的分子机制 首次构建了突触核蛋白病和阿尔茨海默病的单核及空间转录组综合图谱,识别了44个疾病特异性元程序,并揭示了不同细胞类型间的共失调网络 研究基于死后人脑样本,可能无法完全反映疾病早期动态;样本量虽大但可能存在批次效应 全面表征突触核蛋白病和阿尔茨海默病的共享与独特分子特征 513例死后人脑样本中的3.4百万个细胞核 数字病理学 阿尔茨海默病 单核RNA测序, 空间转录组学, MERFISH NA 转录组数据, 空间基因表达数据 513例人脑样本, 3.4百万个细胞核 NA 单核RNA-seq, 空间转录组学 NA MERFISH空间转录组验证技术
5885 2025-12-27
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究通过单细胞转录组和表观基因组分析,探究了Bexarotene在阿尔茨海默病小鼠模型中如何改变染色质结构和基因活性 首次在单细胞分辨率下整合scRNA-seq和snATAC-seq数据,揭示了Bexarotene对大脑细胞类型特异性转录因子活性和染色质可及性的影响 研究基于小鼠模型,结果可能不完全适用于人类阿尔茨海默病 探究Bexarotene如何通过调节染色质结构和基因活性发挥神经保护作用 APP/PS1阿尔茨海默病模型小鼠的大脑细胞 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞RNA测序, 单细胞ATAC测序, ChIP-seq NA 单细胞转录组数据, 表观基因组数据 8个样本(4个Bexarotene处理组和4个对照组),共37,640个细胞(scRNA-seq)和61,353个细胞核(snATAC-seq) 10x Genomics 单细胞RNA-seq, 单细胞ATAC-seq 10X平台 NA
5886 2025-12-27
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文研究了抗Aβ抗体暴露对大脑免疫反应的影响,特别是与ARIA相关的神经炎症机制 结合单细胞测序和空间转录组学技术,探索急性和慢性抗Aβ抗体暴露下的免疫细胞变化,并研究MMP9抑制对脑血管破坏的影响 慢性研究分析仍在进行中,结论尚未完整 理解抗Aβ抗体暴露对大脑免疫系统的影响,并探索ARIA的潜在原因 携带人源化Aβ(hAβ)及家族性淀粉样突变(Swedish, Arctic, Austrian; hAβSAA)的17-20月龄小鼠 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞测序(SCseq),空间转录组学,免疫组织化学(IHC),磁共振成像(MRI) NA 单细胞RNA测序数据,空间转录组数据,影像数据 17-20月龄hAβ及hAβSAA小鼠模型 NA 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 NA NA
5887 2025-12-27
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究开发了一种新颖的计算流程,整合单细胞和批量RNA-seq数据,以识别阿尔茨海默病中稳健的细胞间通讯网络 首次将细胞优先级工具与细胞间相互作用整合,系统识别并优先处理AD病理相关的细胞间通讯网络 NA 揭示阿尔茨海默病中驱动病理过程的细胞间通讯网络 阿尔茨海默病患者脑组织样本 生物信息学 阿尔茨海默病 RNA-seq, 单细胞RNA-seq, 免疫荧光, 共免疫沉淀 DEGAS, CellChat RNA-seq数据 超过240万个细胞 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq NA NA
5888 2025-12-27
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究利用单细胞空间转录组学和蛋白质分析技术,在老年猕猴大脑中探究了Aβ斑块与细胞类型特异性分子变化之间的关联 首次在缺乏神经原纤维缠结的猕猴模型中,结合空间转录组学和蛋白质组学技术,系统研究了早期阿尔茨海默病的细胞特异性分子机制 样本量较小(仅10只猕猴),且研究局限于顶叶皮层区域,可能无法完全反映大脑其他区域的病理变化 探究早期阿尔茨海默病阶段中Aβ斑块与细胞类型特异性分子变化之间的关联 老年猕猴(Chlorocebus aethiops)的大脑组织 数字病理学 阿尔茨海默病 单细胞空间转录组学,免疫荧光共标记,蛋白质空间分析 NA 空间转录组数据,蛋白质表达数据,组织图像数据 10只老年猕猴(平均年龄24.3岁,约相当于人类95岁),其中5只用于蛋白质分析 NanoString 单细胞空间转录组学,空间蛋白质组学 CosMx Spatial Molecular Imager, GeoMx Digital Spatial Profiler NanoString CosMx空间分子成像仪配合人类RNA 6K发现面板,NanoString GeoMx数字空间分析仪
5889 2025-12-27
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究利用单细胞RNA测序技术,探究了衰老和年轻血液暴露下,小胶质细胞在不同脑区的异质性及转录组变化 首次在单细胞水平上,系统揭示了小胶质细胞在衰老和年轻血液暴露下的区域特异性转录组动态,并鉴定出一个与衰老和反应性状态相关的核心基因激活特征 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类中的适用性尚需进一步验证,且未深入探究所识别基因特征的功能机制 探究大脑衰老和年轻血液暴露对小胶质细胞转录组的影响,以理解脑衰老的分子机制和区域脆弱性 小鼠大脑中的小胶质细胞 单细胞组学 神经退行性疾病 scRNA-seq NA 单细胞转录组数据 涉及小脑、皮层、海马体和纹状体四个不同脑区 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5890 2025-12-27
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本文通过多模态方法表征APPSAA小鼠模型在阿尔茨海默病研究中的临床相关表型,包括淀粉样斑块积累、神经炎症反应和认知缺陷 首次全面评估无转基因过表达限制的APPSAA小鼠模型,结合体内成像、空间转录组学和认知测试,为临床前研究提供更相关的疾病阶段选择 研究主要基于小鼠模型,可能不完全反映人类阿尔茨海默病的复杂性,且样本年龄范围有限 建立APPSAA小鼠作为阿尔茨海默病临床前研究的实用模型,并确定适合的实验阶段和检测方法 APPSAA转基因小鼠 数字病理学 阿尔茨海默病 免疫标记、转录组学、代谢组学、脂质组学、空间转录组学、认知行为测试 小鼠疾病模型 图像、转录组数据、代谢数据、行为数据 未明确指定具体数量,但涉及多个年龄阶段的小鼠样本 10x Genomics 空间转录组学 10X Genomics Xenium 10X Genomics Xenium平台用于9月龄小鼠脑空间转录组学分析
5891 2025-12-27
Basic Science and Pathogenesis
2025-Dec, Alzheimer's & dementia : the journal of the Alzheimer's Association
研究论文 本研究利用CROP-seq技术,在单细胞转录组水平上探究阿尔茨海默病基因如何影响小胶质细胞的表型调控网络 首次结合CRISPR筛选与单细胞RNA测序技术,系统分析AD基因对小胶质细胞转录调控网络的影响,并识别出受扰动最显著的特定小胶质细胞亚群 研究主要基于体外实验,尚未在体内模型中验证;样本来源和数量未明确说明,可能限制结果的普适性 探究阿尔茨海默病基因如何影响小胶质细胞的表型调控网络,以寻找潜在的治疗靶点 人类小胶质细胞 单细胞组学 阿尔茨海默病 CROP-seq(CRISPR筛选与单细胞RNA测序结合技术) CRISPR筛选 单细胞转录组数据 NA 10x Genomics 单细胞RNA测序 10x Chromium 10x Genomics Chromium平台,采用改进的单细胞RNA测序流程
5892 2025-12-27
Tumor microenvironment-mediated immune evasion and resistance in prostate cancer: mechanisms, cross-talk, and therapeutic opportunities
2025-Nov-26, Clinical and experimental medicine IF:3.2Q2
综述 本文全面分析了前列腺癌中免疫抑制性肿瘤微环境(TME)的组成、功能及其在免疫逃逸和治疗抵抗中的作用,并探讨了基于TME重塑的精准治疗策略 利用单细胞RNA测序、空间多组学和高维成像技术等前沿方法,重新定义了对肿瘤-免疫-基质相互作用的理解,并提出了整合多组学技术与生物标志物驱动临床试验设计的个体化精准干预新方向 NA 探讨前列腺癌中免疫抑制性肿瘤微环境介导的免疫逃逸和耐药机制,并寻找相应的治疗机会 前列腺癌及其肿瘤微环境中的细胞、基质和分子成分 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、空间多组学、高维成像技术 NA NA NA NA 单细胞RNA-seq, 空间多组学 NA NA
5893 2025-12-27
Developmental and transcriptional programs that define the initiation of the forelimb
2025-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过高通量测序方法定义了小鼠胚胎前肢起始的时间点,并识别了体侧板中胚层中区分新生前肢的转录特征基因 首次系统性地定义了前肢起始的四个阶段,并识别出富含TBX5结合位点的早期转录靶基因,为TBX5驱动的肢体起始机制提供了新模型 研究主要基于小鼠模型,结果在人类或其他脊椎动物中的普适性有待验证,且功能验证实验可能不足 阐明脊椎动物前肢起始的分子机制,特别是TBX5依赖的转录程序 小鼠胚胎的体侧板中胚层及前肢起始区域 发育生物学 NA RNA-seq, scRNA-seq, ChIP-seq, Ribo-ITP NA 转录组数据、单细胞转录组数据、染色质免疫沉淀数据 未明确指定样本数量,但基于小鼠胚胎阶段 NA 单细胞RNA-seq, 批量RNA-seq, 染色质免疫沉淀测序 NA NA
5894 2025-12-27
Mapping embryonic mouse lung development using enhanced spatial transcriptomics
2025-Nov-25, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过优化DBiT-seq工作流程,对小鼠胚胎早期肺组织切片进行高灵敏度空间转录组学分析,揭示了肺发育过程中上皮细胞和间充质细胞的空间分布动态 优化了基于确定性条形码测序(DBiT-seq)的工作流程,实现了对早期胚胎肺组织的高灵敏度空间图谱绘制,并发现了一个先前未被识别的、表达高水平细胞外基质蛋白并促进肺神经支配的间充质细胞群 研究聚焦于小鼠胚胎早期肺发育,结果向其他物种或发育后期的外推性尚不明确 探究哺乳动物肺发育过程中细胞空间分布模式的建立机制 胚胎小鼠肺组织 空间转录组学 NA 空间转录组学,测序 NA 空间转录组数据,组织切片图像 胚胎小鼠肺组织切片 NA 空间转录组学 DBiT-seq 基于微流控和确定性条形码测序(DBiT-seq)优化的空间转录组学工作流程
5895 2025-12-27
A spatiotemporal atlas of orchiectomy-induced androgen deprivation-mediated modulation of cellular composition and gene expression in the mouse prostate
2025-Nov, Neoplasia (New York, N.Y.)
研究论文 本研究通过时空分析,揭示了小鼠前列腺在去势诱导的雄激素剥夺后细胞组成和基因表达的动态变化,重点关注非上皮成分 整合空间转录组学和单细胞RNA测序,首次发现并描述了一种新的成纤维细胞亚型——ORX诱导的成纤维细胞(OIF),并绘制了高分辨率的时空图谱 研究基于小鼠模型,可能无法完全模拟人类前列腺癌的ADT反应;未涉及长期耐药机制 解析雄激素剥夺疗法(ADT)在小鼠前列腺中引起的细胞和转录组动态变化,为前列腺癌临床前模型提供基础资源 小鼠前列腺(包括背侧、腹侧、外侧和前叶)在去势后的非上皮细胞成分 数字病理学 前列腺癌 单细胞RNA测序,空间转录组学 NA 基因表达数据,空间定位数据 小鼠前列腺多个叶的样本(具体数量未明确说明) NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
5896 2025-12-27
Resolving ScRNA-Seq Signatures of Antigen-Specific CD4+ T Cells in Tolerance across Semi-Allogeneic Transplantation and Pregnancy
2025-Oct-23, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究通过单细胞RNA测序解析了抗原特异性CD4+ T细胞在半同种异体移植和妊娠耐受中的转录特征 首次在移植和妊娠模型中比较抗原特异性CD4+ T细胞的单细胞转录组,揭示了耐受与排斥的独特细胞簇特征 研究主要基于小鼠模型,人类数据仅作为验证,样本量相对有限 探究抗原特异性CD4+ T细胞在移植耐受和妊娠免疫耐受中的转录状态差异 内源性抗原特异性CD4+ T细胞,包括调节性T细胞(Tregs)和常规T细胞(Tconvs) 单细胞转录组学 移植免疫与生殖免疫 单细胞RNA测序(scRNA-seq) NA 单细胞转录组数据 小鼠模型中的抗原特异性CD4+ T细胞,包括心脏移植和妊娠模型 NA 单细胞RNA-seq NA NA
5897 2025-12-27
Identification of a distinctive gene signature associated with disease activity in granulomatous myositis
2025-Oct-22, Rheumatology (Oxford, England)
研究论文 本研究通过转录组分析揭示了肉芽肿性肌炎的独特基因特征,并识别出与疾病活动相关的关键基因CHIT1 首次系统性地定义了肉芽肿性肌炎的转录组特征,识别出包含1293个上调基因和256个下调基因的独特基因签名,并发现CHIT1作为最显著上调基因与疾病严重程度相关 研究样本量相对有限(仅38例GM患者),且主要基于肌肉活检的转录组数据,可能无法完全反映疾病的全貌 阐明肉芽肿性肌炎的病理生理机制,通过定义其特异性转录组特征来理解疾病活动 肌肉活检样本,包括肉芽肿性肌炎患者、其他肌病患者和健康对照者 数字病理学 肉芽肿性肌炎 RNA测序,空间转录组学,免疫组织化学 支持向量机 RNA测序数据,空间转录组数据,免疫组织化学图像 722例肌肉活检样本(包括38例GM患者) NA bulk RNA-seq, spatial transcriptomics NA NA
5898 2025-12-27
Charting the single-cell and spatial landscape of IDH-wild-type glioblastoma with GBmap
2025-Oct-14, Neuro-oncology IF:16.4Q1
研究论文 本研究通过整合单细胞RNA测序数据和空间转录组学,构建了IDH野生型胶质母细胞瘤的综合图谱GBmap,揭示了肿瘤的细胞异质性和空间结构,并开发了肿瘤结构评分以量化肿瘤组织并与患者预后相关 构建了首个针对IDH野生型胶质母细胞瘤的全面单细胞和空间图谱GBmap,识别了罕见细胞群如肿瘤相关中性粒细胞和稳态小胶质细胞,并开发了肿瘤结构评分来量化肿瘤组织 研究基于现有数据集整合,可能受数据异质性和样本选择偏差影响,且空间分析仅限于特定技术平台 创建胶质母细胞瘤的综合单细胞和空间图谱,以解析其细胞异质性、空间结构和临床相关性 IDH野生型胶质母细胞瘤患者样本 数字病理学 胶质母细胞瘤 单细胞RNA测序,空间转录组学 转移学习 单细胞RNA测序数据,空间转录组学数据 超过110万个细胞,来自240名患者 NA 单细胞RNA-seq,空间转录组学 NA NA
5899 2025-12-27
Phospholipid Scramblase 1 (PLSCR1) Regulates Interferon-Lambda Receptor 1 (IFN-λR1) and IFN-λ Signaling in Influenza A Virus (IAV) Infection
2025-Sep-12, bioRxiv : the preprint server for biology
研究论文 本研究揭示了磷脂爬行酶1(PLSCR1)通过调控III型干扰素受体1(IFN-λR1)的表达和信号传导,在甲型流感病毒感染中发挥抗病毒作用的分子机制 首次阐明PLSCR1通过直接结合Ifn-λr1启动子调控其转录,并在细胞表面与IFN-λR1互作调节信号传导,同时发现其脂质爬行酶活性对流感抗性非必需 研究主要基于小鼠模型,在人体细胞和组织中的验证尚不充分;PLSCR1调控IFN-λ信号的具体下游通路仍需进一步解析 探究PLSCR1在甲型流感病毒感染中的抗病毒机制及其与III型干扰素信号通路的调控关系 甲型流感病毒(IAV)、小鼠模型、气道上皮细胞(特别是纤毛上皮细胞) 分子生物学与病毒学 流感病毒感染 单细胞RNA测序、转录组分析、动物模型构建、启动子结合实验、蛋白互作检测 NA 基因表达数据、转录组数据、单细胞测序数据 小鼠模型(具体数量未明确说明)及气道上皮细胞 NA 单细胞RNA测序 NA NA
5900 2025-12-27
Unraveling the role of gut microbiota on the formation of nephrolithiasis: insights from integrated analysis of GWAS, single-cell transcriptomics, bulk RNA sequencing and network Pharmacology
2025-Jul-15, Urolithiasis IF:2.0Q2
研究论文 本研究通过整合GWAS、单细胞转录组学、bulk RNA测序和网络药理学分析,探讨了肠道微生物群在肾结石形成中的分子机制 首次结合孟德尔随机化、单细胞分析和网络药理学,系统揭示了肠道微生物群与肾结石之间的因果关系及关键基因PALLD和R3HDM1的作用 研究依赖于公共数据库数据,未进行实验验证,且样本来源和人群特征可能有限 探索肠道微生物群相关关键基因在肾结石形成中的分子机制 肾结石患者相关基因组、肠道微生物群数据及基因表达数据 生物信息学 肾结石 GWAS, 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq, 网络药理学, 分子对接 孟德尔随机化模型, 差异表达分析, 富集分析 基因组数据, 转录组数据, 微生物组数据 NA NA 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq NA NA
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