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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 521 | 2026-03-28 |
Circulating tumor cells in myeloma are a compound biomarker for bone marrow high-risk genomic alterations and tumor load
2026-Feb-26, Blood
IF:21.0Q1
DOI:10.1182/blood.2025030083
PMID:41411148
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研究论文 | 本研究通过单细胞转录组学和全基因组测序分析,揭示了多发性骨髓瘤中循环肿瘤细胞(CTC)水平与骨髓高风险基因组改变及肿瘤负荷的关联机制 | 首次在单克隆水平上证明CTC与配对骨髓细胞转录相似,无独特循环群体;发现高CTC水平患者骨髓细胞增殖增加和基因组事件不平衡;开发了预测遗传改变和肿瘤负荷对CTC水平影响的模型 | 研究主要基于新诊断多发性骨髓瘤患者,未涵盖复发或难治性病例;样本量可能有限;机制性因果关系需进一步实验验证 | 探究多发性骨髓瘤中CTC水平与预后不良相关的机制,并评估CTC作为基因组驱动高风险疾病的生物标志物价值 | 新诊断多发性骨髓瘤患者的配对骨髓和血液样本 | 数字病理学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞转录组学, 全基因组测序, 全外显子组测序, 批量RNA测序 | 预测模型 | 转录组数据, 基因组数据 | 来自新诊断多发性骨髓瘤患者的配对骨髓和血液样本,并利用Multiple Myeloma Research Foundation CoMMpass数据集及内部数据集进行验证 | NA | 单细胞RNA-seq, 全基因组测序, 全外显子组测序, 批量RNA-seq | NA | NA |
| 522 | 2026-03-28 |
A Single-Cell Perspective on Remapping Human Adult Neurogenesis and Its Clinical Implications
2026-02-22, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16020331
PMID:41750399
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综述 | 本文综述了单细胞RNA测序在成人海马神经发生研究中的应用,及其对神经系统疾病机制和治疗策略的启示 | 整合了单细胞RNA测序技术提供的细胞和分子层面见解,为神经系统疾病的靶向治疗开发提供了新视角 | NA | 探讨成人海马神经发生的细胞和分子景观,以及神经系统疾病的病理机制及其治疗意义 | 成人海马神经发生、神经系统疾病(如癌症、心血管疾病和神经系统疾病) | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 523 | 2026-03-28 |
STING-induced blood-brain barrier opening combined with radiotherapy potentiates antitumor response in a high-grade glioma model
2026-Feb-16, The Journal of clinical investigation
IF:13.3Q1
DOI:10.1172/JCI198843
PMID:41697735
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研究论文 | 本研究探讨了STING激动剂8803联合放疗在高等级胶质瘤模型中的抗肿瘤效应及其机制,发现该组合能重塑血脑屏障并诱导独特的抗肿瘤免疫反应 | 首次揭示了STING激动剂8803能通过改变内皮细胞Pecam和Cd147通路实现双侧血脑屏障开放,并利用[18F]-FLT PET成像纵向可视化STING激活过程 | 研究仅在两种小鼠胶质瘤模型(CT-2A和QPP8v)中进行,其中辐射抗性QPP8v模型未显示长期生存获益,且临床转化效果需进一步验证 | 评估STING激动剂8803联合放疗治疗高级别胶质瘤的疗效,并阐明其作用机制 | 携带颅内CT-2A或QPP8v胶质瘤的C57BL/6J小鼠 | 肿瘤免疫治疗 | 胶质母细胞瘤/高级别胶质瘤 | 单细胞RNA测序,PET成像,基因敲除模型 | 动物模型(小鼠) | 基因表达数据,影像数据 | 未明确样本数量的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 524 | 2026-03-28 |
Lactate-Driven Reprogramming of Monocyte Bridges Bone Loss in Inflammatory Comorbidities
2026-02-14, Biomolecules
IF:4.8Q1
DOI:10.3390/biom16020308
PMID:41750376
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研究论文 | 本研究揭示了乳酸驱动的单核细胞重编程在牙周炎和类风湿关节炎等炎症共病中连接免疫激活与骨吸收加剧的分子机制 | 首次将乳酸代谢与炎症共病(牙周炎和类风湿关节炎)的骨丢失联系起来,并鉴定出SAT1、TET2和HIF1A作为核心乳酸相关基因和潜在生物标志物 | 研究主要基于小鼠模型和单细胞测序数据,需要在更大规模的人类队列中进行验证 | 揭示炎症共病中骨破坏的分子驱动机制 | 牙周炎和类风湿关节炎作为炎症疾病共病的临床相关模型 | 生物信息学 | 牙周炎, 类风湿关节炎 | 单细胞RNA测序 | 多种机器学习方法 | 基因表达数据 | PD和RA队列的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 525 | 2026-03-28 |
Aging-induced decrease in progenitor B cells enhances the osteoclastogenesis of bone marrow macrophages via ROS-activated Fos/CCL3 signaling pathway
2026-Feb-10, Immunity & ageing : I & A
IF:5.2Q1
DOI:10.1186/s12979-026-00561-z
PMID:41668199
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研究论文 | 本研究揭示了衰老过程中骨髓微环境内ROS水平升高导致B淋巴细胞免疫衰老,进而通过激活Fos/CCL3信号通路促进破骨细胞生成,从而加剧老年性骨质疏松的机制 | 首次通过单细胞RNA测序等多组学整合策略,系统阐明了衰老骨髓微环境中B淋巴细胞减少,特别是祖B细胞耗竭,通过ROS激活的Fos/CCL3信号轴促进破骨细胞生成的新机制 | 研究主要基于SAMP6小鼠模型,其结论在人类老年性骨质疏松中的普适性有待进一步验证;体外细胞实验(BaF3和RAW 264.7细胞系)可能无法完全模拟体内复杂的骨髓微环境 | 探究免疫细胞(特别是B淋巴细胞)改变在老年性骨质疏松发病机制中的作用 | 衰老加速小鼠模型SAMP6及其对照SAMR1小鼠的骨髓细胞、BaF3细胞系(模拟祖B细胞)、RAW 264.7细胞系(巨噬细胞/破骨前体细胞) | NA | 老年性骨质疏松 | 单细胞RNA测序、转录组测序、流式细胞术、多色免疫荧光、多重细胞因子分析、micro-CT、分子生物学、组织学技术 | NA | 单细胞RNA测序数据、转录组数据、流式细胞数据、影像数据(micro-CT)、荧光图像、细胞因子数据 | SAMP6和SAMR1小鼠模型(具体数量未明确说明),以及BaF3和RAW 264.7细胞系 | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 526 | 2026-03-28 |
Neonatal Hyperoxia Induces Metabolic Reprogramming in Senescent Alveolar Macrophages, Leading to Persistent Lung Injury
2026-Feb-10, Frontiers in bioscience (Landmark edition)
DOI:10.31083/FBL48370
PMID:41761973
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研究论文 | 本研究通过分析单细胞RNA测序数据,揭示了新生小鼠高氧暴露诱导衰老肺泡巨噬细胞的代谢重编程,并证明靶向代谢或清除衰老细胞可减轻持续性肺损伤 | 首次在新生小鼠高氧模型中,利用单细胞RNA测序技术系统描绘了衰老肺泡巨噬细胞的异质性、代谢重编程特征及其在持续性肺损伤中的作用机制 | 研究主要基于小鼠模型,其结论在人类早产儿支气管肺发育不良中的直接适用性仍需进一步验证 | 探究新生儿高氧暴露诱导的衰老肺泡巨噬细胞的分子与功能特征,及其在持续性肺损伤发生发展中的作用 | 新生小鼠的肺组织,特别是高氧暴露后分离的衰老肺细胞(以巨噬细胞为主) | 数字病理学 | 肺损伤/支气管肺发育不良 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,通路富集分析 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据 | 数据集GSE207866中的样本,包括高氧暴露后第7天(SD7)、年龄匹配的空气暴露对照(AirD7)及未富集衰老细胞的高氧暴露组(O2D7)小鼠肺细胞 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 527 | 2026-03-28 |
Integration of imaging-based and sequencing-based spatial omics mapping on the same tissue section via DBiTplus
2026-Jan-15, Nature methods
IF:36.1Q1
DOI:10.1038/s41592-025-02948-0
PMID:41540123
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研究论文 | 本文介绍了一种名为DBiTplus的新型整合多模态空间组学方法,可在同一组织切片上结合测序型空间转录组学与多重蛋白成像技术 | 开发了DBiTplus整合工作流程,首次实现同一组织切片上测序型空间转录组与多重蛋白成像的同步分析,并采用RNase H介导的cDNA回收技术以保留组织架构 | 方法在极具挑战性的临床样本(如FFPE组织)中的全面性能仍需进一步验证 | 开发一种整合成像与测序的空间组学映射技术,以在单细胞分辨率下探索细胞异质性和功能 | 冷冻小鼠胚胎、福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)的人体淋巴结及淋巴瘤组织 | 空间组学 | 淋巴瘤 | 空间条形码技术、RNase H介导的cDNA回收、多重蛋白成像、空间转录组学 | NA | 空间转录组数据、蛋白成像数据 | 多种样本类型,包括小鼠胚胎和人类淋巴组织 | NA | 空间转录组学, 多重蛋白成像 | DBiTplus | DBiTplus整合工作流程,支持测序型空间转录组学与成像型蛋白分析在同一组织切片上进行 |
| 528 | 2026-03-28 |
Targeting the epithelium in pulmonary fibrosis
2026-Jan, European respiratory review : an official journal of the European Respiratory Society
IF:9.0Q1
DOI:10.1183/16000617.0225-2025
PMID:41881452
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综述 | 本文综述了特发性肺纤维化(IPF)研究中的最新进展,重点探讨了上皮细胞群在疾病中的作用及作为治疗靶点的潜力 | 整合了单细胞测序、空间转录组学等前沿技术,揭示了IPF中新型疾病相关上皮细胞群,并强调了细胞间通讯在疾病机制中的重要性 | 作为综述文章,未提供原始实验数据,且部分新技术(如空间分析)的应用仍处于早期阶段 | 探讨IPF的病理生物学机制,特别是上皮细胞的作用,以寻找新的治疗靶点 | 特发性肺纤维化(IPF)患者肺组织及相关的上皮细胞群 | 数字病理学 | 肺纤维化 | 单细胞测序, 空间转录组学, 功能共培养研究, 计算基因集富集分析 | NA | 基因组数据, 转录组数据, 空间数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 529 | 2026-03-28 |
Exploring hub genes related to adipocytokines in keloids: a combined analysis integrating single-cell, Mendelian randomization and bulk transcriptome data with experimental verification
2026, Frontiers in molecular biosciences
IF:3.9Q2
DOI:10.3389/fmolb.2026.1740876
PMID:41889636
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研究论文 | 本研究通过整合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和批量转录组数据分析,结合实验验证,探索了与脂肪细胞因子相关的枢纽基因在瘢痕疙瘩发病机制中的作用 | 首次结合单细胞RNA测序、孟德尔随机化和批量转录组数据进行综合分析,识别出PIK3R3和ANGPTL5作为与脂肪细胞因子相关的潜在枢纽基因,并验证了PIK3R3在瘢痕疙瘩中的因果作用 | ANGPTL5的表达验证结果不一致,可能受样本限制影响,且研究主要基于现有公开转录组数据的再分析 | 识别瘢痕疙瘩形成的潜在治疗靶点,并阐明与脂肪细胞因子相关的病理机制 | 瘢痕疙瘩组织及相关基因表达 | 生物信息学 | 皮肤纤维增生性疾病 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化, 批量转录组分析, RT-qPCR | 机器学习 | 转录组数据, 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 530 | 2026-03-28 |
CCS-mediated mechanistic link between gestational diabetes mellitus and carpal tunnel syndrome: a multi-omics MR framework
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1766134
PMID:41890708
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研究论文 | 本研究通过多组学孟德尔随机化框架,揭示了妊娠期糖尿病与腕管综合征之间的因果关联及CCS基因介导的分子机制 | 首次整合遗传相关分析、孟德尔随机化、多组学数据(eQTL、pQTL)、单细胞RNA测序及分子对接,系统阐明GDM通过CCS介导的氧化、免疫和纤维化通路导致CTS的因果机制 | 研究主要基于欧洲人群的遗传数据,可能限制其跨人群普适性;动物模型和分子对接结果需进一步实验验证 | 探究妊娠期糖尿病是否因果增加腕管综合征风险及其分子通路 | 妊娠期糖尿病与腕管综合征的遗传关联、CCS基因的介导作用及相关分子通路 | 生物信息学与遗传流行病学 | 妊娠期糖尿病与腕管综合征 | 连锁不平衡评分回归、双样本孟德尔随机化、全血cis-eQTL分析、血浆蛋白QTL分析、批量RNA测序、单细胞RNA测序、组织学、免疫荧光、分子对接 | 孟德尔随机化模型、贝叶斯共定位分析 | 遗传数据、转录组数据、蛋白质组数据、单细胞数据、组织图像数据 | 基于FinnGen和UK Biobank的大规模人群遗传数据,涉及GDM和CTS病例及对照 | NA | 单细胞RNA测序、批量RNA测序 | NA | NA |
| 531 | 2026-03-28 |
Comprehensive management of hematopoietic stem cell transplantation complications: from infection prevention to immune microenvironment reconstruction
2026, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2026.1740067
PMID:41890754
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综述 | 本文系统综述了造血干细胞移植(HSCT)关键并发症(包括感染、移植物抗宿主病和肝窦阻塞综合征)的管理策略,并探讨了新兴技术在构建全程风险管理模型中的应用 | 整合了从感染预防到免疫微环境重建的综合管理视角,并强调了单细胞测序、微生物组分析和人工智能等新兴技术在构建全程风险管理模型中的应用潜力 | 作为一篇综述文章,未报告原始研究数据或进行新的临床试验 | 系统回顾并探讨造血干细胞移植并发症的管理策略及未来研究方向 | 造血干细胞移植患者及其并发症(感染、GVHD、VOD/SOS) | NA | 造血干细胞移植相关并发症 | 单细胞测序,微生物组分析,人工智能 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 532 | 2026-03-28 |
Sparse dimensionality reduction for analyzing single-cell-resolved interactions
2026, Bioinformatics advances
IF:2.4Q2
DOI:10.1093/bioadv/vbag047
PMID:41890810
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研究论文 | 本文提出了一种针对单细胞细胞间相互作用数据的端到端降维工作流程,旨在简化细胞对间相互作用模式的分析 | 采用稀疏降维方法(特别是Boosting Autoencoder)来精确定位与细胞对簇相关的特定配体-受体相互作用,并提供了包含结果可视化的完整工作流程 | NA | 增强单细胞转录组学数据中细胞间相互作用的下游分析 | 单细胞细胞间相互作用数据,特别是基于已知配体-受体相互作用的细胞对 | 机器学习 | NA | 单细胞转录组学 | Boosting Autoencoder | 单细胞转录组学数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 533 | 2026-03-28 |
Protocol for decoding immune predictors of response to immunotherapy through pan-cancer multiomics analysis
2025-Dec-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104183
PMID:41187056
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研究论文 | 本文提出了一种通过单细胞RNA测序、单细胞免疫分析和质谱流式细胞术分析多种癌症中T细胞动态的方案 | 整合了单细胞多组学技术和基因调控网络分析,以识别与免疫检查点阻断反应相关的T细胞亚群和预测性生物标志物 | NA | 解码免疫治疗响应的免疫预测因子 | 多种癌症中的T细胞 | 数字病理学 | 多种癌症 | 单细胞RNA测序, 单细胞免疫分析, 质谱流式细胞术 | NA | 单细胞RNA测序数据, 免疫分析数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, 单细胞多组学 | NA | NA |
| 534 | 2026-03-28 |
Protocol for preparation of mouse synovium for flow cytometry and RNA-seq
2025-Dec-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104207
PMID:41236928
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研究论文 | 本文介绍了一种从小鼠滑膜制备单细胞悬浮液用于流式细胞术和RNA-seq分析的实验方案 | 该方案整合了关节炎诱导、细胞收获和单细胞悬浮液制备,支持稳态或炎症状态下的分析,并可选血管内标记 | NA | 开发一种标准化的小鼠滑膜单细胞悬浮液制备方法,以模拟类风湿关节炎和骨关节炎中的无菌炎症 | 小鼠滑膜组织 | 数字病理学 | 骨关节炎 | RNA-seq | NA | 单细胞悬浮液 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
| 535 | 2026-03-28 |
Protocol to analyze changes in hippocampal neural stem cell quiescence from single-cell RNA sequencing data
2025-Dec-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104226
PMID:41289073
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研究论文 | 本文介绍了一种通过计算分析单细胞RNA测序数据来分离小鼠海马神经干细胞并评估扰动对静息深度影响的协议 | 提出了一种计算协议,通过顺序重聚类、伪时间轨迹分析和统计检验来区分静息神经干细胞与星形胶质细胞,以及增殖神经干细胞与祖细胞,解决了现有挑战 | 协议依赖于单细胞RNA测序数据,可能受数据质量和测序深度限制,且仅针对小鼠海马神经干细胞,未验证于其他组织或物种 | 开发一种计算协议来分析小鼠海马神经干细胞静息状态的变化 | 小鼠海马神经干细胞 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 536 | 2026-03-28 |
Transformer and graph variational autoencoder to identify microenvironments: A deep learning protocol for spatial transcriptomics
2025-Dec-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104206
PMID:41313684
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研究论文 | 本文提出了一个结合Transformer和图变分自编码器的计算框架TG-ME,用于通过空间转录组学和形态学图像识别微环境 | 创新性地整合了Transformer和图变分自编码器,以深度学习方式解析空间生态位,适用于健康、肿瘤和感染组织 | NA | 开发一个计算框架来识别和分析组织中的微环境 | 空间转录组学和形态学图像数据 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | Transformer, 图变分自编码器 | 空间转录组数据, 形态学图像 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 537 | 2026-03-28 |
Protocol for quantifying hepatitis B virus transcript abundance and genomic segment distribution from single-cell RNA-seq
2025-Dec-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104230
PMID:41313688
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研究论文 | 本文介绍了一种从HBV感染的肝脏组织中测序单细胞的协议,用于量化每个细胞的HBV转录本丰度和基因组片段分布 | 开发了一种单细胞RNA测序协议,能够同时定量HBV转录本丰度并绘制全基因组读取分布图,为病毒表达模式和HBV-宿主相互作用提供单细胞分辨率分析 | NA | 建立一种协议以详细分析HBV感染的肝脏组织中病毒表达模式和HBV-宿主相互作用 | HBV感染的肝脏组织 | 数字病理学 | 肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 538 | 2026-03-28 |
Protocol to track single-cell-derived clones using DNA barcoding combined with single-cell RNA sequencing
2025-Dec-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104229
PMID:41317321
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研究论文 | 本文介绍了一种结合DNA条形码与单细胞RNA测序技术来追踪单细胞来源克隆的实验方案 | 通过构建和验证慢病毒DNA条形码文库,结合单细胞RNA测序,实现了对克隆生长活动与转录组谱的关联分析,为永久性细胞标记和克隆动态追踪提供了新方法 | NA | 开发一种追踪单细胞来源克隆的实验方案,以研究克隆适应性和可塑性在肿瘤异质性中的作用 | 单细胞来源的克隆 | 数字病理学 | 肿瘤 | DNA条形码技术,单细胞RNA测序 | NA | RNA序列数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 539 | 2026-03-28 |
Protocol to investigate fibroblastic reticular cell-immune cell interaction in human lung cancer
2025-Dec-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104256
PMID:41364557
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研究论文 | 本文介绍了一种用于研究人类肺癌中成纤维网状细胞与免疫细胞相互作用的详细实验方案 | 开发了从肿瘤组织中富集稀有成纤维网状细胞进行单细胞RNA测序的步骤,并提供了分析细胞间通讯的计算框架 | NA | 研究肺癌中成纤维网状细胞与免疫细胞的相互作用机制 | 人类肺癌组织中的成纤维网状细胞和免疫细胞 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序,免疫组织化学,高分辨率显微镜 | NA | 单细胞RNA测序数据,图像数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 540 | 2026-03-28 |
Protocol for reconstructing spatially aware receptor-TF-target signaling cascades using spatial transcriptomics
2025-Dec-19, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2025.104237
PMID:41385380
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研究论文 | 本文介绍了一种使用SpaGRN框架从空间转录组学数据重建空间感知的受体-转录因子-靶标调控级联的协议 | 该协议整合了细胞外信号和空间依赖性,克服了传统方法忽略空间约束的局限 | NA | 旨在系统性地绘制复杂组织(如发育胚胎和肿瘤)中的信号通路 | 空间转录组学数据 | 空间转录组学 | 肿瘤 | 空间转录组学 | 统计框架(SpaGRN) | 空间转录组学数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |