单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 30729 篇文献，本页显示第 5361 - 5380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 5361 | 2025-05-16 |
Protocol to combine brain sections from multiple mice into a single block for spatial transcriptomic analyses
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102617
PMID:37742175
|
研究论文 | 提出一种将多个小鼠大脑切片合并到单个空间转录组学载玻片上的协议 | 通过将不同大脑的海马区冷冻切片合并成单个冷冻块，减少了所需试剂的数量 | NA | 提高空间转录组学分析的样本处理效率并降低成本 | 小鼠大脑海马区切片 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | NA | 基因表达数据和空间标记 | 多个小鼠大脑切片 |
| 5362 | 2025-05-16 |
Single-cell isolation from full-thickness human intestinal tissue resections for single-cell RNA sequencing
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102686
PMID:37925636
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研究论文 | 本文提出了一种从全层肠道组织切除中分离单细胞的方案，用于单细胞RNA测序 | 开发了一种从全层肠道组织中分离单细胞的详细方案，包括预处理标本、分离固有层和肌肉层、红细胞裂解等步骤 | 未提及该方案的适用性限制或潜在问题 | 开发一种从全层肠道组织中分离单细胞的标准化方案 | 全层肠道组织切除样本 | 单细胞测序 | NA | 单细胞RNA测序, 10× Chromium平台 | NA | RNA测序数据 | 未提及具体样本数量 |
| 5363 | 2025-05-16 |
Protocol for multispectral imaging on cryosections to map myeloid cell heterogeneity in its spatial context
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102601
PMID:37742177
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研究论文 | 提出了一种用于原位多光谱成像的协议，以绘制组织冷冻切片中髓系细胞异质性 | 结合多光谱成像技术，保留细胞和分子背景，同时识别细胞类型和亚群 | 需要参考Goossens等人的研究以获取完整执行细节 | 开发一种协议来映射髓系细胞在组织中的异质性 | 组织冷冻切片中的髓系细胞 | 数字病理学 | NA | 多光谱成像 | NA | 图像 | NA |
| 5364 | 2025-05-16 |
Protocol for PPP1R15A-inhibited mouse model establishment with subcutaneous B16F1 tumor and single-cell analysis
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102616
PMID:37756156
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研究论文 | 本文提出了一种建立PPP1R15A抑制小鼠模型的协议，用于探索Sephin1对B16F1皮下肿瘤抗肿瘤免疫的影响 | 使用单细胞转录组和TCR文库构建技术，整合表达和TCR数据，进行基因分化、调控网络和细胞间通讯分析 | 具体实验细节和操作步骤需参考Wang等人的完整研究 | 探索PPP1R15A抑制剂Sephin1对小鼠B16F1皮下肿瘤抗肿瘤免疫的影响 | B16F1皮下肿瘤小鼠模型 | 生物医学研究 | 肿瘤 | 单细胞转录组测序、TCR测序 | 小鼠模型 | 测序数据 | NA |
| 5365 | 2025-05-16 |
Protocol for isolating single cells from human pancreatic cancer tissues and analyzing major immune cell populations using flow cytometry
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102679
PMID:37910511
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研究论文 | 本文提出了一种从人类胰腺癌组织中分离单细胞并使用流式细胞术分析主要免疫细胞群的方案 | 提供了一种详细的胰腺癌组织免疫细胞分离和分析流程，适用于单细胞RNA测序等相关研究 | 未提及样本量的具体信息，且依赖于Zhang等人(2023)的详细执行步骤 | 开发一种标准化流程用于胰腺癌免疫细胞研究 | 人类胰腺癌组织中的免疫细胞 | 数字病理学 | 胰腺癌 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | 细胞数据 | NA |
| 5366 | 2025-05-16 |
TimiGP: An R package to depict the tumor microenvironment from bulk transcriptomics
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102742
PMID:38019649
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研究论文 | 介绍了一个名为TimiGP的R包，用于从批量转录组数据中描绘肿瘤微环境 | 开发了一个基于基因对的肿瘤免疫微环境分析工具，能够推断细胞间相互作用并揭示免疫细胞相对丰度与患者预后的关联 | NA | 探索肿瘤微环境中不同免疫细胞类型的临床相关性，以揭示癌症复杂性并开发治疗方法 | 肿瘤微环境中的免疫细胞 | 生物信息学 | 癌症 | 单细胞RNA测序，批量基因表达分析 | NA | 基因表达数据，生存数据 | NA |
| 5367 | 2025-05-16 |
Protocol for nuclear dissociation of the adult C. elegans for single-nucleus RNA sequencing and its application for mapping environmental responses
2023-12-15, STAR protocols
IF:1.3Q4
DOI:10.1016/j.xpro.2023.102756
PMID:38043054
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研究论文 | 介绍了一种用于成年秀丽隐杆线虫核分离的单核RNA测序（snRNA-seq）协议，并应用于酒精暴露环境下的转录组分析 | 提出了一种克服秀丽隐杆线虫单细胞RNA测序困难的单核RNA测序协议 | 未提及具体样本量或实验验证的局限性 | 开发适用于秀丽隐杆线虫的单核RNA测序方法，以研究外部刺激下的细胞反应 | 成年秀丽隐杆线虫 | 基因组学 | NA | 单核RNA测序（snRNA-seq） | NA | RNA测序数据 | NA |
| 5368 | 2025-05-16 |
Heterogeneous murine peribiliary glands orchestrate compartmentalized epithelial renewal
2023-12-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.10.004
PMID:37909044
|
研究论文 | 本研究通过小鼠模型揭示了胆管外分支中腺体的异质性及其在胆管上皮更新中的作用 | 首次明确了胆管外腺体中不同位置胆管细胞的更新机制及其在组织维持中的作用 | 研究仅限于小鼠模型，人类胆管系统的可比性尚需验证 | 阐明胆管外分支上皮更新的细胞机制 | 小鼠胆管外分支腺体及其上皮细胞 | 细胞生物学 | 胆管疾病 | 无标记克隆命运追踪、单细胞测序 | 小鼠模型 | 基因表达数据 | NA |
| 5369 | 2025-05-16 |
Neural plate progenitors give rise to both anterior and posterior pituitary cells
2023-12-04, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.08.018
PMID:37683631
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research paper | 该研究挑战了垂体腺细胞仅来源于非神经外胚层的传统观点，揭示了神经板前体细胞对垂体前后叶细胞的贡献以及垂体细胞间的相互作用 | 研究发现神经板前体细胞（斑马鱼her4.3+和小鼠Sox1+）不仅贡献于神经垂体细胞，还贡献于部分腺垂体细胞，揭示了垂体细胞分化的新机制 | 研究主要基于斑马鱼和小鼠模型，人类垂体发育是否遵循相同机制尚需验证 | 探究垂体细胞的起源和分化机制 | 斑马鱼和小鼠的垂体细胞 | 发育生物学 | NA | 单细胞转录组学、遗传追踪 | NA | 基因表达数据 | 斑马鱼和小鼠垂体细胞 |
| 5370 | 2025-05-16 |
Alpha-1 adrenergic signaling drives cardiac regeneration via extracellular matrix remodeling transcriptional program in zebrafish macrophages
2023-11-20, Developmental cell
IF:10.7Q1
DOI:10.1016/j.devcel.2023.09.011
PMID:37875117
|
research paper | 本文研究了α-1肾上腺素能信号通过调节斑马鱼巨噬细胞的细胞外基质重塑转录程序驱动心脏再生的机制 | 揭示了肾上腺素能信号通过巨噬细胞表型多样化和细胞外基质重塑转录程序调控心脏再生的新机制 | 研究仅基于斑马鱼模型，尚未在哺乳动物中进行验证 | 探究肾上腺素能信号在心脏修复中的作用机制 | 斑马鱼心脏巨噬细胞 | 心血管生物学 | 心血管疾病 | 单细胞转录组学 | 斑马鱼模型 | 转录组数据 | NA |
| 5371 | 2025-05-16 |
The Impact of SIV-Induced Immunodeficiency on Clinical Manifestation, Immune Response, and Viral Dynamics in SARS-CoV-2 Coinfection
2023-Nov-16, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2023.11.15.567132
PMID:38014096
|
研究论文 | 本研究探讨了SIV诱导的免疫缺陷对SARS-CoV-2共感染的临床表现、免疫反应和病毒动态的影响 | 首次在控制环境下直接评估慢性HIV感染相关的免疫缺陷对COVID-19疾病和病毒持续性的影响 | 样本量较小（仅两只猪尾猕猴），且未观察到临床疾病迹象 | 评估免疫缺陷对SARS-CoV-2感染的影响 | 两只长期感染SIVmac239的猪尾猕猴（PTM） | 免疫学 | HIV感染和COVID-19 | 单细胞RNA测序（scRNAseq） | NA | 临床数据、病毒动力学数据和免疫反应数据 | 两只猪尾猕猴 |
| 5372 | 2025-05-15 |
Integrated bioinformatics analysis identifies neutrophils and villous cytotrophoblasts infiltration characterized by BLC6 upregulation as associated with the co-occurrence of gestational diabetes mellitus and pre-eclampsia
2025-Dec, Hypertension in pregnancy
IF:1.5Q4
DOI:10.1080/10641955.2025.2475814
PMID:40122115
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研究论文 | 通过整合生物信息学分析，发现中性粒细胞和绒毛细胞滋养层细胞浸润以及BLC6上调与妊娠期糖尿病和先兆子痫的共现相关 | 首次鉴定出BCL6、DNAH9和SCG2作为妊娠期糖尿病和先兆子痫的共同枢纽基因，并发现BCL6在中性粒细胞和绒毛细胞滋养层细胞中的高表达 | 研究依赖于公开数据集，未进行实验验证 | 探究妊娠期糖尿病和先兆子痫共现的枢纽基因和通路 | 妊娠期糖尿病和先兆子痫患者 | 生物信息学 | 妊娠期糖尿病和先兆子痫 | 生物信息学分析、单细胞测序数据分析 | 回归模型、ROC分析 | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集 |
| 5373 | 2025-05-15 |
The role of lactate metabolism in retinoblastoma tumorigenesis and ferroptosis resistance
2025-Aug, Tissue & cell
IF:2.7Q3
DOI:10.1016/j.tice.2025.102893
PMID:40188688
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研究论文 | 本研究探讨了乳酸代谢在视网膜母细胞瘤肿瘤发生和抗铁死亡中的作用 | 首次揭示了乳酸代谢通过上调MCT1促进视网膜母细胞瘤细胞存活和抗铁死亡的新机制 | 研究主要基于细胞系和小鼠模型，临床样本验证不足 | 阐明乳酸代谢相关基因表达谱对视网膜母细胞瘤发生和抗铁死亡的影响 | 视网膜母细胞瘤细胞系和患者组织样本 | 肿瘤代谢 | 视网膜母细胞瘤 | 单细胞RNA测序 | 小鼠异种移植模型 | 转录组数据 | 患者视网膜组织和视网膜母细胞瘤组织的单细胞RNA测序数据 |
| 5374 | 2025-05-15 |
Combining Single-Cell RNA Sequencing and Mendelian Randomization to Explore Novel Drug Targets for Parkinson's Disease
2025-Jun, Molecular neurobiology
IF:4.6Q1
DOI:10.1007/s12035-025-04700-3
PMID:39890696
|
研究论文 | 结合单细胞RNA测序和孟德尔随机化探索帕金森病的新药物靶点 | 首次结合scRNA-Seq和MR方法探索T细胞相关基因对帕金森病风险的因果效应，并识别出五个潜在药物靶点 | 需要进一步的研究和临床试验来验证这些潜在药物靶点的有效性 | 探索帕金森病的致病机制和潜在治疗靶点 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞 | 生物信息学 | 帕金森病 | 单细胞RNA测序(scRNA-Seq), 孟德尔随机化(MR), GWAS | NA | 基因表达数据 | 帕金森病患者和健康对照者的外周血T细胞scRNA-Seq数据集 |
| 5375 | 2025-05-15 |
A Case-Driven Multi-Omics Analysis for Longitudinal Ibrutinib Response Evaluation of Patients With Chronic Lymphocytic Leukemia
2025-Jun, European journal of haematology
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/ejh.14397
PMID:39988467
|
研究论文 | 通过多组学方法评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼的长期治疗反应 | 利用单细胞转录组学等多组学方法，首次在分子水平上探索了伊布替尼治疗期间克隆惰性的机制 | 研究样本量较小，仅包含两名患者的数据 | 评估慢性淋巴细胞白血病患者对伊布替尼治疗的长期分子和临床反应 | 两名接受伊布替尼单药治疗的慢性淋巴细胞白血病患者 | 数字病理学 | 慢性淋巴细胞白血病 | 单细胞转录组学, 多组学分析 | NA | DNA和RNA数据 | 两名患者的血液样本 |
| 5376 | 2025-05-15 |
Integrated bioinformatic analysis identifies GADD45B as an immune-related prognostic biomarker in skin cutaneous melanoma
2025-May-11, Hereditas
IF:2.1Q3
DOI:10.1186/s41065-025-00437-0
PMID:40350499
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研究论文 | 该研究通过整合多个数据库和实验方法，全面探讨了GADD45B在皮肤黑色素瘤(SKCM)中的功能及其作为免疫相关预后生物标志物的潜力 | 首次系统研究GADD45B在SKCM中的作用机制，发现其可作为新型免疫检查点并促进M1型巨噬细胞极化 | 研究主要基于生物信息学分析和体外实验，临床样本验证有待进一步加强 | 探究GADD45B在皮肤黑色素瘤中的功能及其临床意义 | 皮肤黑色素瘤细胞系和患者样本 | 生物信息学 | 皮肤黑色素瘤 | 转录组测序、单细胞分析、免疫浸润分析 | NA | 基因表达数据 | 26个SKCM相关数据集、30个人类SKCM细胞系转录组数据、29个SKCM细胞系表型特征分析 |
| 5377 | 2025-05-15 |
Mapping the molecular signature of ABA-regulated gene expression in germinating barley embryos
2025-May-10, BMC plant biology
IF:4.3Q1
DOI:10.1186/s12870-025-06654-z
PMID:40348990
|
研究论文 | 本研究通过整合转录组学、代谢组学和空间转录组学技术，揭示了ABA在发芽大麦胚胎中调控基因表达的分子特征 | 首次在植物组织中成功应用空间转录组学技术，实现了对胚胎不同区域基因表达的精确定位 | 空间转录组学技术在植物组织中的应用仍存在技术挑战 | 探究ABA调控大麦种子发芽的分子机制 | ABA处理的大麦(Hordeum vulgare)胚胎 | 植物分子生物学 | NA | Visium Spatial Transcriptomics (10× Genomics), RNA-seq | NA | 转录组数据, 代谢组数据 | 六个胚胎区域 |
| 5378 | 2025-05-15 |
Thioredoxin: a key factor in cold tumor formation and a promising biomarker for immunotherapy resistance in NSCLC
2025-May-10, Respiratory research
IF:4.7Q1
DOI:10.1186/s12931-025-03259-w
PMID:40349025
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研究论文 | 该研究探讨了硫氧还蛋白（TXN）在非小细胞肺癌（NSCLC）中作为免疫治疗耐药性生物标志物的作用及其在冷肿瘤形成中的关键影响 | 发现TXN在NSCLC患者中高表达并与冷肿瘤特征相关，揭示了TXN通过调节CD40促进肿瘤免疫逃逸的新机制 | 研究主要基于体外细胞实验和单细胞RNA测序数据，缺乏体内动物模型的验证 | 探究TXN在NSCLC免疫治疗耐药性中的作用及其分子机制 | 非小细胞肺癌（NSCLC）患者组织样本及A549和SK-MES-1细胞系 | 肿瘤免疫学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq） | NA | 基因表达数据 | NSCLC患者组织样本及两种肺癌细胞系（A549和SK-MES-1） |
| 5379 | 2025-05-15 |
Blocking LIF and PD-L1 enhances the antitumor efficacy of SBRT in murine PDAC models
2025-May-07, Journal for immunotherapy of cancer
IF:10.3Q1
DOI:10.1136/jitc-2024-010820
PMID:40341024
|
研究论文 | 研究探讨了在鼠胰腺导管腺癌模型中，通过阻断LIF和PD-L1增强立体定向体部放疗（SBRT）的抗肿瘤效果 | 首次展示了LIF和PD-L1同时抑制与SBRT联合治疗的显著协同效应，并深入分析了其免疫调节机制 | 研究仅在鼠模型中进行，尚未进行人体临床试验 | 探索胰腺导管腺癌的新型联合治疗方案 | 鼠胰腺导管腺癌模型 | 肿瘤免疫治疗 | 胰腺癌 | 流式细胞术、Luminex检测、bulk RNA测序、单细胞RNA测序 | 鼠原位胰腺肿瘤模型 | 基因表达数据、免疫细胞表型数据 | 多个鼠胰腺肿瘤模型 |
| 5380 | 2025-05-15 |
NEUROD1 efficiently converts peripheral blood cells into neurons with partial reprogramming by pluripotency factors
2025-May-06, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
IF:9.4Q1
DOI:10.1073/pnas.2401387122
PMID:40299704
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研究论文 | 本研究介绍了一种优化的方法，通过外周血细胞将体细胞转化为神经元，避免了诱导多能干细胞（iPSC）中间步骤 | 使用NEUROD1和四种Yamanaka重编程因子的独特组合，在3周内生成谷氨酸能神经元，提供了一种非侵入性、高效、快速且便捷的方法 | 虽然外周血细胞提供了潜在的替代方案，但其在神经元重编程中的广泛应用仍需进一步验证 | 开发一种非侵入性、高效、快速且便捷的方法，将外周血细胞转化为神经元，用于神经系统疾病建模和药物发现 | 外周血细胞 | 细胞重编程 | 神经系统疾病 | 单细胞RNA测序、全基因组亚硫酸氢盐测序、Cre-LoxP系统谱系追踪 | NA | 基因表达数据、甲基化数据 | NA |