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序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
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4501 | 2025-10-06 |
Understanding disease-associated metabolic changes in human colon epithelial cells using i ColonEpithelium metabolic reconstruction
2024-Oct-25, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2024.10.22.619644
PMID:39484551
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研究论文 | 本研究构建了首个结肠上皮细胞特异性基因组尺度代谢模型iColonEpithelium,用于探索炎症性肠病相关的代谢变化 | 开发了首个人类结肠上皮细胞特异性基因组尺度代谢模型,包含独特的转运反应区室用于模拟与肠道微生物组的代谢相互作用 | 模型基于稳态假设,可能无法完全反映体内动态代谢过程 | 解析人类结肠上皮细胞的代谢活动,识别炎症性肠病相关的代谢特征 | 人类结肠上皮细胞 | 代谢组学 | 炎症性肠病 | 单细胞RNA测序,基因组尺度代谢模型 | 基因组尺度代谢模型 | 基因表达数据 | 克罗恩病和溃疡性结肠炎患者样本及健康对照样本 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4502 | 2025-10-06 |
Metabolic coordination between skin epithelium and type 17 immunity sustains chronic skin inflammation
2024-07-09, Immunity
IF:25.5Q1
DOI:10.1016/j.immuni.2024.04.022
PMID:38772365
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研究论文 | 本研究揭示了皮肤炎症中上皮细胞与免疫细胞通过代谢协调维持慢性炎症的机制 | 发现HIF1α驱动的糖酵解代谢通路在上皮细胞和γδ T17细胞间建立代谢层级协调,共同维持皮肤炎症 | 研究主要基于小鼠模型和离体人类病变组织,在体人类验证尚需进一步研究 | 探究皮肤炎症疾病中上皮细胞与免疫细胞代谢协调的分子机制 | 银屑病皮肤病变组织、小鼠皮肤炎症模型 | 空间转录组学 | 银屑病 | 单细胞转录组测序,空间转录组学,免疫荧光 | 小鼠遗传模型 | 基因表达数据,蛋白质定位数据 | 人类银屑病病变组织和小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | NA | NA |
4503 | 2025-10-06 |
Transcriptomic Approaches to Cardiomyocyte-Biomaterial Interactions: A Review
2024-Jul-08, ACS biomaterials science & engineering
IF:5.4Q2
DOI:10.1021/acsbiomaterials.4c00303
PMID:38934720
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综述 | 本文综述了转录组学方法在研究心肌细胞与生物材料相互作用中的应用 | 强调转录组学方法在理解心肌细胞-生物材料相互作用中的独特价值,并探讨新兴技术如单细胞RNA测序和空间转录组学的应用前景 | 存在成本高、细胞尺寸限制、样本差异和复杂分析流程等挑战 | 探讨转录组学方法在心肌细胞与生物材料相互作用研究中的应用,促进心脏生物工程和再生医学发展 | 心肌细胞与生物材料的相互作用 | 生物医学工程 | 心血管疾病 | bulk RNA-seq, single-cell RNA-seq, single-nucleus RNA-seq, spatial transcriptomics, 机器学习 | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序, 单核RNA测序, 空间转录组学, 批量RNA测序 | NA | NA |
4504 | 2025-10-06 |
Dynamic Transcriptional Programs During Single NK Cell Killing: Connecting Form to Function in Cellular Immunotherapy
2024-Jun, Cellular and molecular bioengineering
IF:2.3Q3
DOI:10.1007/s12195-024-00812-3
PMID:39050513
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研究论文 | 本研究通过结合单细胞RNA测序和活细胞成像技术,探索自然杀伤细胞在杀伤过程中的转录程序动态变化 | 首次将单细胞RNA测序与活细胞成像结合,实时关联NK细胞转录组数据与杀伤功能表型 | 研究基于NK-92细胞系和HeLa细胞的模型系统,可能不完全代表体内NK细胞功能 | 确定驱动NK细胞杀伤表型的细胞内信号传导机制 | 自然杀伤细胞和HeLa宫颈癌细胞 | 单细胞生物学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序,活细胞成像,荧光显微镜 | NA | 转录组数据,图像数据 | NK-92细胞系与HeLa细胞的共培养系统 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞RNA测序平台 |
4505 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals aberrant sphingolipid metabolism in non-small cell lung cancer impacts tumor-associated macrophages and stimulates angiogenesis via macrophage inhibitory factor signaling
2024-05, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15283
PMID:38587042
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析揭示了非小细胞肺癌中鞘脂代谢异常通过巨噬细胞抑制因子信号影响肿瘤相关巨噬细胞并刺激血管生成 | 首次系统揭示鞘脂代谢在肿瘤微环境中的作用机制,发现MIF-CD74配体-受体对在巨噬细胞与癌细胞通讯中的关键作用 | 基于公共数据库的回顾性分析,缺乏实验验证 | 探究鞘脂代谢在非小细胞肺癌肿瘤微环境中的作用机制 | 非小细胞肺癌组织和癌旁正常组织 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, bulk RNA-seq | NA | 转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA |
4506 | 2025-10-06 |
Immune cell-related prognostic risk model and tumor immune environment modulation in esophageal carcinoma based on single-cell and bulk RNA sequencing
2024-05, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15301
PMID:38587029
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研究论文 | 基于单细胞和bulk RNA测序构建食管癌免疫细胞相关预后风险模型并分析肿瘤免疫环境调控 | 首次在单细胞水平构建食管癌独立预后模型,系统阐明免疫细胞组成、功能、演化和细胞间通讯模式 | 未明确说明样本量大小和数据来源的具体限制 | 开发食管癌预后风险模型并探索肿瘤免疫环境调控机制 | 食管癌患者的免疫细胞和肿瘤微环境 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序,多组学分析 | 预后风险模型 | RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,bulk RNA测序 | NA | NA |
4507 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals the immune landscape of breast cancer patients with brain metastasis
2024-03, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15243
PMID:38316626
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析乳腺癌脑转移患者脑脊液中的免疫细胞,揭示肿瘤免疫微环境特征 | 首次利用脑脊液单细胞测序非侵入性地描绘乳腺癌脑转移的免疫微环境景观 | 样本量有限,脑脊液可能无法完全代表肿瘤组织内的免疫微环境 | 解析乳腺癌脑转移患者的肿瘤免疫微环境特征 | 乳腺癌脑转移患者的脑脊液免疫细胞 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4508 | 2024-08-07 |
Single-cell RNA-seq reveals the links between the metabolic heterogeneity and cell identity in NBM and AML
2024-03, British journal of haematology
IF:5.1Q1
DOI:10.1111/bjh.19233
PMID:38009537
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
4509 | 2025-10-06 |
Single-cell RNA sequencing reveals immune microenvironment of small cell lung cancer-associated malignant pleural effusion
2024-01, Thoracic cancer
IF:2.3Q2
DOI:10.1111/1759-7714.15145
PMID:38010064
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序技术揭示小细胞肺癌相关恶性胸腔积液的肿瘤免疫微环境特征 | 首次在SCLC-MPE中应用单细胞转录组测序分析肿瘤免疫微环境 | 仅基于单一样本分析,样本量有限 | 揭示小细胞肺癌恶性胸腔积液的免疫微环境特征 | 小细胞肺癌患者的恶性胸腔积液样本 | 数字病理学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 8008个高质量细胞 | 10x Genomics | 单细胞RNA-seq | 10x Chromium | 10x Genomics单细胞转录组测序技术 |
4510 | 2025-10-06 |
Inference after latent variable estimation for single-cell RNA sequencing data
2023-12-15, Biostatistics (Oxford, England)
DOI:10.1093/biostatistics/kxac047
PMID:36511385
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研究论文 | 提出了一种称为计数分割的灵活框架,用于在单细胞RNA测序数据分析中进行有效的统计推断 | 开发了计数分割方法,能够在潜在变量估计后实现有效的统计推断,解决了标准方法无法控制I型错误的问题 | 方法基于泊松假设,可能不适用于不符合此假设的数据类型 | 解决单细胞RNA测序数据分析中潜在变量估计后的统计推断问题 | 单细胞RNA测序数据 | 生物信息学 | NA | 单细胞RNA测序 | 统计推断框架 | 基因表达数据 | 多能干细胞向心肌细胞分化的数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4511 | 2025-10-06 |
T cell-Mediated Development of Stromal Fibroblasts with an Immune-Enhancing Chemokine Profile
2023-08-01, Cancer immunology research
IF:8.1Q1
DOI:10.1158/2326-6066.CIR-22-0593
PMID:37216570
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研究论文 | 本研究揭示了癌症相关成纤维细胞通过T细胞介导的细胞因子信号从免疫抑制表型向免疫激活表型转化的分子机制 | 首次发现CAFs具有表型可塑性,能够通过T细胞来源的IFNγ和TNFα协调调控趋化因子表达,实现从CXCL12+/CXCL9-免疫抑制表型向CXCL12-/CXCL9+免疫激活表型的转化 | 研究主要基于小鼠胰腺腺癌模型,在人类肿瘤中的适用性需要进一步验证 | 探究癌症相关成纤维细胞是否能够适应不同免疫微环境并形成免疫促进性趋化因子谱 | 小鼠胰腺腺癌中的癌症相关成纤维细胞和CD8+ T细胞 | 单细胞生物学 | 胰腺癌 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
4512 | 2025-10-06 |
Gut microbial Nordihydroguaiaretic acid suppresses macrophage pyroptosis to regulate epithelial homeostasis and inflammation
2025-Dec, Gut microbes
IF:12.2Q1
DOI:10.1080/19490976.2025.2518338
PMID:40596758
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研究论文 | 本研究揭示肠道微生物代谢产物NDGA通过抑制巨噬细胞焦亡调节肠道上皮稳态和炎症的机制 | 首次发现衰老相关肠道菌群失调导致NDGA减少,并通过GSDMD/NR4A1/NLRP3轴调控巨噬细胞焦亡影响结肠炎易感性 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证有限;机制研究尚未完全阐明NDGA的具体作用靶点 | 探究衰老相关肠道菌群失调在炎症性肠病恶化中的作用机制 | 野生型和IL-10缺陷小鼠、IBD患者和老年人粪便样本 | 免疫学 | 炎症性肠病 | 粪便微生物移植、16S rDNA测序、代谢组学、单细胞RNA测序 | NA | 基因测序数据、代谢物数据、单细胞转录组数据 | 小鼠模型和人类粪便样本(具体数量未明确说明) | NA | 单细胞RNA测序, 16S rDNA测序 | NA | NA |
4513 | 2025-10-06 |
RETRACTION: Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Intratumoral Heterogeneity in Lung Adenocarcinoma
2025-Aug, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24531
PMID:40346999
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撤稿声明 | 因同行评审过程存在问题而撤回已发表的单细胞转录组分析研究论文 | NA | NA | NA | NA | NA | 肺腺癌 | 单细胞转录组分析 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4514 | 2025-10-06 |
Tracing Early Migratory Neurons in the Developing Nose Using Contactin-2 (Cntn2) CreERT2
2025-Aug, Genesis (New York, N.Y. : 2000)
DOI:10.1002/dvg.70021
PMID:40580015
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研究论文 | 本研究通过构建Cntn2CreERT2诱导性小鼠品系,追踪发育过程中鼻子区域的早期迁移神经元 | 开发了新型的Cntn2CreERT2诱导性小鼠品系,首次实现对嗅觉系统早期迁移神经元的时间可控性追踪和操作 | 研究主要聚焦于啮齿类动物模型,结果向其他物种的推广性需要进一步验证 | 研究胚胎发育过程中嗅觉系统神经元的迁移机制 | 啮齿类动物发育过程中鼻子区域的早期迁移神经元,特别是终末神经神经元 | 发育神经生物学 | NA | 单细胞RNA测序,遗传谱系追踪,Cre-loxP系统 | NA | 基因表达数据,组织学图像 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4515 | 2025-10-06 |
Cellular heterogeneity and patterning strategies as revealed by upper respiratory epithelium single cell atlas
2025-Jul-18, iScience
IF:4.6Q1
DOI:10.1016/j.isci.2025.112845
PMID:40612507
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序结合空间验证构建了小鼠上呼吸道上皮细胞图谱 | 首次结合单细胞RNA测序与空间验证揭示上呼吸道上皮细胞的18种类型及其三维空间分布模式 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人类样本中验证 | 解析上呼吸道上皮细胞的异质性和空间分布模式 | 小鼠上呼吸道上皮细胞 | 单细胞生物学 | 呼吸系统疾病 | 单细胞RNA测序,空间转录组验证 | NA | 单细胞转录组数据,空间分布数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4516 | 2025-10-06 |
Single-Cell RNA Sequencing Highlights a Contribution of Human Amniotic Mesenchymal Stem Cells-Derived Exosomes to Androgenetic Alopecia
2025-Jul-15, FASEB journal : official publication of the Federation of American Societies for Experimental Biology
IF:4.4Q2
DOI:10.1096/fj.202500853R
PMID:40622121
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研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序揭示人羊膜间充质干细胞外泌体通过Wnt/β-catenin信号通路促进雄激素性脱发模型小鼠毛发生长的分子机制 | 首次在单细胞水平解析hAMSC-exo促进毛发生长的细胞图谱和分子机制,发现其通过增强毛囊细胞与真皮乳头细胞间的通讯并改善线粒体功能 | 研究仅限于小鼠模型,尚未在人体验证;机制研究主要聚焦Wnt/β-catenin通路,可能存在其他未探索的调控途径 | 探索人羊膜间充质干细胞外泌体对雄激素性脱发的治疗作用及分子机制 | 雄激素性脱发模型小鼠的背部皮肤组织 | 单细胞组学 | 雄激素性脱发 | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4517 | 2025-10-06 |
Impact of IKCa Channels on CD34+ Cells in Arteriole Remodeling in Angiotensin II-Induced Hypertension Model Mice
2025-Jul-09, Hypertension (Dallas, Tex. : 1979)
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研究论文 | 本研究探讨了IKCa通道在Ang II诱导的高血压模型中CD34+细胞介导的动脉内皮修复作用 | 首次揭示非骨髓来源的CD34+细胞通过IKCa通道调控ERK/P38信号通路参与高血压血管修复的新机制 | 研究仅基于小鼠模型,尚未在人体中验证 | 阐明高血压条件下内皮修复的细胞分子机制 | CD34+细胞在Ang II诱导的高血压小鼠动脉重塑中的作用 | 心血管疾病研究 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序,免疫荧光,transwell迁移实验,膜片钳技术,骨髓移植 | NA | 基因表达数据,图像数据,电生理数据 | Ang II处理的高血压模型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
4518 | 2025-10-06 |
Proneural-Mesenchymal hybrid glioblastoma cells are resistant to therapy and dependent on nuclear import
2025-Jul-08, Neuro-oncology
IF:16.4Q1
DOI:10.1093/neuonc/noaf160
PMID:40627673
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研究论文 | 本研究揭示了胶质母细胞瘤中同时表达前神经和间充质标记的混合细胞亚群对常规疗法具有耐药性 | 首次发现并表征了胶质母细胞瘤中前神经-间充质混合细胞亚群,揭示了其通过核质转运机制介导治疗抵抗的新机制 | 研究主要基于患者来源的细胞系和动物模型,临床转化价值仍需进一步验证 | 探索胶质母细胞瘤细胞可塑性及其治疗抵抗的分子机制 | 胶质母细胞瘤细胞,特别是前神经-间充质混合细胞亚群 | 癌症生物学 | 胶质母细胞瘤 | 单细胞RNA测序, 单细胞ChIP测序, 核蛋白质组学, 高分辨率成像, 正交小鼠模型 | 动物模型, 细胞模型 | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 影像数据 | 多个患者来源的细胞系 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞ChIP测序, 空间转录组学 | NA | NA |
4519 | 2025-10-06 |
Peripheral immune imbalance in pediatric fulminant myocarditis revealed by single-cell sequencing and plasma proteomics
2025-Jul-08, Genes and immunity
IF:5.0Q2
DOI:10.1038/s41435-025-00343-5
PMID:40629105
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研究论文 | 通过单细胞测序和血浆蛋白质组学揭示儿童暴发性心肌炎的外周免疫失衡特征 | 首次系统描绘儿童暴发性心肌炎急性期和恢复期的外周免疫细胞图谱,发现多种独特细胞类型及CXCR4、S100A家族基因的广泛高表达 | 样本量有限,未明确验证IL-10和TGFB1在治疗中的具体作用机制 | 解析暴发性心肌炎的外周免疫病理机制 | 儿童暴发性心肌炎患者外周血单个核细胞和血浆样本 | 单细胞组学 | 心肌炎 | 单细胞RNA测序, TCR/BCR分析, 血浆蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, TCR/BCR序列数据, 蛋白质组数据 | 儿童暴发性心肌炎患者急性期和恢复期样本 | NA | 单细胞RNA测序, 蛋白质组学 | NA | NA |
4520 | 2025-10-06 |
Opposite regulation of intestinal and intrahepatic CD8+ T cells controls alcohol-associated liver disease progression
2025-Jul-07, Gut
IF:23.0Q1
DOI:10.1136/gutjnl-2024-334412
PMID:40199574
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研究论文 | 本研究揭示了肠道和肝内CD8+ T细胞的相反调控在酒精性肝病进展中的关键作用 | 首次发现肠道和肝内CD8+ T细胞在酒精性肝病中呈现相反的变化趋势,并证明BCL2在调控这些细胞存活中的关键作用 | 研究主要基于小鼠模型,人类样本验证仍需扩大 | 探究肠道和肝内CD8+ T淋巴细胞在酒精性肝病中的调控机制及其贡献 | 酒精性肝病患者和野生型、CD8特异性Bcl2转基因及Cd8基因敲除小鼠 | 免疫学 | 酒精性肝病 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据、细胞功能数据 | 酒精性肝病患者和多种基因型小鼠 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |