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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 401 | 2026-06-09 |
Tumor Matrix Proteoglycan Accumulation and Processing Alter T-cell Effector Function and the Response to Immunotherapy in Patients with Oligometastatic Colorectal Cancer
2026-May-01, Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research
IF:10.0Q1
DOI:10.1158/1078-0432.CCR-25-2780
PMID:41671077
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research paper | 研究肿瘤基质蛋白聚糖Versican(VCAN)在寡转移结直肠癌患者中如何影响T细胞效应功能及免疫治疗反应 | 首次在临床试验中评估VCAN蛋白聚糖及其裂解产物versikine对免疫监视和免疫治疗反应的影响,发现VCAN积累与蛋白水解表型(VPP)与循环CD8+ T细胞效应功能和临床结局改善相关 | 样本量较小(15名患者)的I期临床试验,且未详述机制验证步骤 | 评估VCAN对结直肠癌免疫监视和免疫治疗反应的影响 | 寡转移结直肠癌患者的T细胞功能和临床结局 | 机器学习 | 结直肠癌 | RNA-seq | NA | 测序数据 | 243名结直肠癌患者(组织样本)及15名寡转移结直肠癌患者(临床试验) | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 单细胞RNA测序用于分析循环免疫表型 |
| 402 | 2026-06-09 |
Bibliometric analysis of single-cell RNA sequencing in tumor microenvironment
2026-Apr-24, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-026-05073-2
PMID:42032150
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NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 403 | 2026-06-09 |
Intraovarian injection of securinine stimulates the growth of small ovarian follicles by reducing stromal suppression
2026-Apr-13, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71691-7
PMID:41974717
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研究论文 | 研究发现神经药物securinine通过卵巢内注射可刺激小卵泡生长,改善小鼠和食蟹猴的卵巢功能及生育能力 | 首次发现神经药物securinine可被重新用于促进卵泡生长,通过单细胞RNA测序揭示其通过缓解基质细胞外基质对颗粒细胞的负调控来发挥作用,并在非人灵长类中验证效果 | 未提及 | 探索securinine作为卵巢内注射候选药物治疗早发性卵巢功能不全或卵巢储备功能减退女性的不孕症 | 老年小鼠和老年食蟹猴的卵巢及卵泡 | 机器学习 | 不孕症 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠卵巢样本和食蟹猴卵巢样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3' |
| 404 | 2026-06-09 |
Comprehensive guide for optimizing octopus immune cell preparation to enhance single cell RNA sequencing success
2026-Apr-10, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-026-47700-6
PMID:41963494
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研究论文 | 提出一种优化章鱼免疫细胞制备方案以增强单细胞RNA测序成功率的综合指南 | 首次建立适用于章鱼免疫细胞的单细胞RNA测序方法学框架,解决了血细胞聚集和高盐度化学限制的难题 | 未提供关于测序深度和细胞类型确认的详细信息 | 优化章鱼免疫细胞分离方案,实现单细胞RNA测序在非模型海洋物种中的应用 | 普通章鱼(Octopus vulgaris)的循环血细胞和白体驻留血细胞 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | 单细胞转录组数据 | 未指定具体数量 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 使用低EDTA的MAS培养基兼容10x Genomics化学试剂进行GEM生成、逆转录和cDNA文库构建 |
| 405 | 2026-06-09 |
Identification of stem cell marker-positive subpopulations in the vocal fold of the larynx through transcriptomic analyses
2026-Apr-07, Nature communications
IF:14.7Q1
DOI:10.1038/s41467-026-71514-9
PMID:41942464
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研究论文 | 通过转录组分析鉴定喉部声带中干细胞标志物阳性亚群 | 首次利用单细胞RNA测序和空间转录组学技术鉴定小鼠声带中的SOX9阳性基底细胞亚群和Lgr5阳性细胞亚群,并成功生成了喉部上皮类器官作为体外模型 | 研究仅限于小鼠模型,需要进一步验证人类喉部中的相应细胞亚群 | 探索喉部组织稳态维持机制,鉴定喉部组织干细胞 | 小鼠喉部黏膜 | 机器学习 | 其他疾病 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 类器官培养 | NA | 基因表达数据 | 小鼠喉部黏膜样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | 10x Chromium, 10x Visium | 10x Chromium单细胞3'试剂盒,10x Visium空间转录组学通过光隔离化学 |
| 406 | 2026-06-09 |
Multi-omics characterization of benzo[a]pyrene toxicity networks identifies SERPINE1 and STK3 as prognostic biomarkers and therapeutic targets in head and neck squamous cell carcinoma
2026-Apr, Naunyn-Schmiedeberg's archives of pharmacology
DOI:10.1007/s00210-026-05065-7
PMID:41670688
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研究论文 | 通过多组学分析揭示苯并[a]芘毒性网络在头颈鳞癌中的作用,并确定SERPINE1和STK3为预后生物标志物和治疗靶点 | 系统整合苯并[a]芘毒性靶点与细胞程序性死亡机制,利用空间转录组学和单细胞测序解析细胞特异性表达模式,并通过分子对接和动力学模拟验证毒物-蛋白相互作用 | 未提及 | 阐明苯并[a]芘诱导头颈鳞癌毒性的分子网络,并鉴定预后生物标志物和治疗靶点 | 苯并[a]芘毒性网络、头颈鳞癌中的细胞程序性死亡机制 | 机器学习 | 头颈鳞状细胞癌 | 空间转录组学、单细胞RNA测序、分子对接、分子动力学模拟 | 随机森林、支持向量机 | 转录组数据、空间转录组数据、单细胞RNA测序数据 | NA | NA | 空间转录组学、单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 407 | 2026-06-09 |
Targeting HSPB1 inhibits tumor growth and abrogates Treg-mediated tumor immunosuppression
2026-Apr-01, International immunopharmacology
IF:4.8Q1
DOI:10.1016/j.intimp.2026.116333
PMID:41671620
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研究论文 | 该论文通过整合单细胞RNA测序、TCGA WGCNA和空间转录组学,发现HSPB1是调控结直肠癌中Treg/CD8+ T细胞比例的关键分子,靶向HSPB1可抑制肿瘤生长并解除Treg介导的免疫抑制 | 首次揭示HSPB1作为结直肠癌内Treg/CD8+ T细胞比例的决定因子,并阐明其通过CCL20-CCR6轴招募Treg的机制,提出靶向HSPB1的双重抗肿瘤作用 | 研究主要基于小鼠模型和体外实验,尚未在临床样本中验证HSPB1抑制剂的疗效和安全性 | 探索结直肠癌中免疫检查点阻断疗法效果不佳的分子机制,寻找调控肿瘤免疫抑制平衡的关键靶点 | 结直肠癌肿瘤微环境中的Treg和CD8+ T细胞,以及HSPB1基因 | 机器学习 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序,空间转录组学,流式细胞术,CRISPR-Cas9,RNA-seq | NA | 基因表达数据,图像 | MC38和SW480细胞系,以及皮下肿瘤模型的小鼠样本 | 10x Genomics | 单细胞RNA测序,空间转录组学 | 10x Chromium | 10x Chromium Single Cell 3'用于单细胞RNA-seq,空间转录组学平台用于组织原位分析 |
| 408 | 2026-06-09 |
Fibroblast Activation Protein Promotes Thoracic Aortic Dissection via PLAUR/ITGB1-Mediated Pro-inflammatory Macrophage Polarization
2026-Apr, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202514786
PMID:41674342
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研究论文 | 本研究揭示了成纤维细胞激活蛋白通过非酶促机制与PLAUR/ITGB1相互作用,促进促炎性巨噬细胞极化,从而推动胸主动脉夹层的发展 | 首次发现FAP通过非酶促位点与巨噬细胞PLAUR直接结合,激活ITGB1/FAK信号通路,介导成纤维细胞-巨噬细胞互作促进TAD进展,为TAD治疗提供新靶点 | 未明确说明研究的局限性 | 探究成纤维细胞激活蛋白在胸主动脉夹层发病机制中的作用及其分子机制 | 人类TAD标本、β-氨基丙腈诱导的TAD小鼠模型、成纤维细胞特异性Fap敲除小鼠 | 机器学习 | 心血管疾病 | RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 人类TAD标本和小鼠模型样本(具体数量未提及) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 409 | 2026-06-09 |
The importance of long-lived IgE plasma cells for protracted allergies
2026-04, Trends in immunology
IF:13.1Q1
DOI:10.1016/j.it.2026.01.006
PMID:41846175
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评论 | 本文讨论了关于长寿命IgE浆细胞在持续性过敏中的重要性,基于遗传命运图谱和单细胞测序的最新发现 | 揭示了两类细胞群(长寿命IgE浆细胞和'2型'记忆B细胞)共同维持IgE水平,为过敏持久性提供新机制见解 | 由于是评论文章,未提供实验验证数据,且未讨论不同过敏模型的差异 | 探讨长寿命IgE浆细胞在持续性过敏中的细胞来源和维持机制 | IgE浆细胞和记忆B细胞两类细胞群 | 机器学习 | 过敏性疾病 | 遗传命运图谱、单细胞测序 | NA | 单细胞转录组数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 410 | 2026-06-09 |
Linking Targeted Pancreatic Cancer Genes With Metabolic Disorders: A Cross-Species Translational Pathway
2026-Apr, Cancer medicine
IF:2.9Q2
DOI:10.1002/cam4.71775
PMID:41937118
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研究论文 | 通过跨物种分析,探究胰腺导管腺癌相关基因与代谢紊乱分子间的相互作用 | 首次系统整合人类与小鼠脂肪组织及胰腺癌单细胞数据,揭示PDAC复发相关基因与肥胖、糖尿病等代谢通路共享的免疫代谢调控轴 | 样本量有限且仅采用公开数据集,功能验证仅通过qPCR而未进行基因敲除或动物模型验证 | 阐明胰腺癌相关基因与代谢紊乱(肥胖、糖尿病、炎症)之间的分子联系通路 | 胰腺导管腺癌相关基因(ITGAM、PECAM1、CCL5、STAT1、STAT2、CD44)及代谢紊乱通路 | 生物信息学 | 胰腺癌,代谢性疾病 | RNA-seq | NA | RNA测序数据 | 公开数据集(人类及小鼠脂肪组织bulk RNA-Seq、晚期PDAC单细胞RNA-Seq)和人类脂肪组织qPCR样本 | NA | 单细胞RNA-seq,bulk RNA-seq | NA | NA |
| 411 | 2026-06-09 |
PEBP1 inhibition as a therapeutic target for neurological recovery in ischemic stroke
2026-Apr, Neurotherapeutics : the journal of the American Society for Experimental NeuroTherapeutics
IF:5.6Q1
DOI:10.1016/j.neurot.2026.e00912
PMID:42066623
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研究论文 | 通过整合单细胞RNA测序和孟德尔随机化分析,确定PEBP1为缺血性卒中后神经恢复的治疗靶点 | 首次将单细胞RNA测序与孟德尔随机化结合,鉴定出PEBP1作为缺血性卒中的新风险基因和潜在治疗靶点 | 可能存在的脱靶效应需进一步验证;仅使用小鼠模型进行实验验证,临床转化性需在人类研究中确认 | 探索缺血性卒中的新基因治疗靶点以改善神经功能恢复 | 缺血性卒中患者及小鼠模型(大脑中动脉阻塞模型) | 医疗健康 | 脑血管疾病 | 单细胞RNA测序、孟德尔随机化、共定位分析、定量PCR、免疫荧光、药理学抑制、shRNA敲低 | NA | 基因组数据、单细胞转录组数据 | 欧洲生物信息学研究所数据集(34,593例病例和624,214例对照)、独立验证数据集(86,668例病例和1,503,898例对照)、英国生物银行(26,052例病例和487,214例对照) | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 412 | 2026-06-09 |
miRNA regulation in brain tissue space: the 3'UTR perspective
2026-Mar-16, RNA (New York, N.Y.)
DOI:10.1261/rna.080850.125
PMID:41672779
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综述 | 本文探讨了microRNA在脑组织空间中的调控作用,特别是从3'UTR的视角,总结了当前空间定量miRNA和3'UTR的实验与计算方法 | 首次从3'UTR视角系统探讨miRNA在脑组织空间中的调控,并指出当前没有方法能同时空间定量miRNA及其靶标3'UTR | 目前尚无方法可同时空间定量miRNA和3'UTR,且3'UTR亚型在空间中的变化尚未被充分探索 | 讨论miRNA在脑组织空间中的调控机制,重点关注神经发育和神经元功能 | 脑组织中的miRNA和3'UTR | 数字病理学 | 神经系统疾病 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 413 | 2026-06-09 |
Downregulated lysyl oxidase in plasma extracellular vesicles: a biomarker linked to brain metastasis risk in lung adenocarcinoma
2026-Mar-12, BMC medicine
IF:7.0Q1
DOI:10.1186/s12916-026-04785-0
PMID:41814259
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研究论文 | 通过多组学分析发现肺腺癌脑转移患者血浆细胞外囊泡中赖氨酰氧化酶(LOX)下调,可作为非侵入性生物标志物 | 首次系统证明血浆细胞外囊泡来源的LOX蛋白可作为肺腺癌脑转移的非侵入性生物标志物,并提出PI3K/AKT-LOX-细胞外基质调控轴假说 | 提出了一种基于多组学验证策略的标志物发现框架,但LOX下调机制及临床转化价值仍需进一步验证 | 鉴定与肺腺癌脑转移相关的血浆细胞外囊泡蛋白标志物 | 59例IV期肺腺癌患者(30例脑转移 vs 29例非脑转移)的血浆细胞外囊泡 | 机器学习 | 肺癌 | 蛋白质组学,单细胞转录组学,酶联免疫吸附测定 | LASSO/RF/SVM | 蛋白质组学数据,单细胞转录组数据 | 发现队列59例,独立验证队列158例 | NA | NA | NA | NA |
| 414 | 2026-06-09 |
FGFR4 and HER2 co-expression is associated with the proinflammatory tumor microenvironment in HR + breast cancer
2026-Mar, Breast cancer (Tokyo, Japan)
DOI:10.1007/s12282-026-01833-8
PMID:41670928
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研究论文 | FGFR4与HER2共表达与HR+乳腺癌中促炎肿瘤微环境相关 | 首次在HR+乳腺癌中揭示FGFR4和HER2共表达与促炎肿瘤微环境的关联,提出免疫治疗潜力 | 样本量较小(94例),且未进一步探索重塑肿瘤免疫微环境的治疗策略 | 研究FGFR4在不同乳腺癌亚型中的分子特征,为潜在治疗策略提供依据 | 激素受体阳性(HR+)和阴性(HR-)乳腺癌患者 | 数字病理学 | 乳腺癌 | 靶向基因表达谱分析(AmoyDx Master Panel),单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,单细胞转录组数据 | 94例乳腺癌患者(53例HR+,41例HR-) | AmoyDx | 靶向基因表达谱分析,单细胞RNA测序 | AmoyDx Master Panel | NA |
| 415 | 2026-06-09 |
Protective role of early Tnfsf15 upregulation in limiting glomerular injury and proteinuria in experimental Alport Syndrome
2026-Mar, Journal of pharmacological sciences
IF:3.0Q2
DOI:10.1016/j.jphs.2026.01.005
PMID:41672640
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析Col4a5 G5X Alport小鼠模型,发现早期Tnfsf15上调在限制肾小球损伤和蛋白尿中的保护作用 | 首次在Alport综合征早期阶段通过单细胞测序发现Tnfsf15的保护性上调,并利用基因敲除小鼠模型验证其限制蛋白尿和肾小球损伤的功能 | 未具体说明研究局限性,但可能包括小鼠模型与人类疾病的差异、早期时间点选择的局限性等 | 探究Alport综合征早期分子变化及其在疾病发生中的作用,特别是Tnfsf15的功能 | Col4a5 G5X Alport小鼠模型(5周和8周龄)的肾小球细胞 | 数字病理学 | Alport综合征 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 基因表达数据 | Col4a5 G5X Alport小鼠,涉及Tnfsf15基因敲除后比较分析,具体数量未说明 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 416 | 2026-06-09 |
Unveiling hidden variables in stressed bacteria
2026-Feb-24, Cell reports
IF:7.5Q1
DOI:10.1016/j.celrep.2026.116966
PMID:41671084
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评论 | 综述了细菌应激反应中表型异质性背后的隐藏变量,提出看似随机的现象实际由可测定的确定性因素驱动 | 将细菌应激反应中的表型变异从随机噪声重新定义为可预测的隐藏变量,整合了确定性因素和前沿技术视角 | 主要基于已有案例和观点论述,缺乏原创实验数据验证 | 揭示细菌应激反应中表型异质性的隐藏变量,推动预测微生物学发展 | 细菌细胞及其应激反应行为 | 机器学习 | NA | 单细胞RNA测序,微流控 | 机器学习 | 图像,文本 | NA | 10x Genomics | 单细胞RNA测序 | 10x Chromium | 10x Chromium单细胞3'基因表达分析系统 |
| 417 | 2026-06-09 |
Predictive modeling of molecular activity underlying physical cell-cell interactions
2026-Feb-23, Cell reports methods
IF:4.3Q2
DOI:10.1016/j.crmeth.2026.101301
PMID:41672069
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研究论文 | 提出Gloss预测建模框架,系统关联基因与通路活性至直接细胞间相互作用强度 | 首次将组套索回归应用于单细胞RNA测序数据,实现可解释的细胞间相互作用强度预测 | 未明确说明,但基于方法学论文特点,可能存在对复杂相互作用网络的简化假设 | 开发能系统性关联分子活性与物理细胞间相互作用的计算框架 | 小鼠肿瘤中髓系-T细胞相互作用及病毒感染中T细胞亚群间相互作用 | 机器学习 | 肿瘤 | 单细胞RNA测序 | 组套索回归 | 基因表达数据 | 多项数据集,包括抗Ctla4免疫治疗小鼠肿瘤样本及病毒感染样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 418 | 2026-06-09 |
Microbiota-host interaction in colorectal cancer: emerging computational technology, multi-omics integration, and mechanisms
2026-Feb-23, Cancer biology & medicine
IF:5.6Q1
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综述 | 本文综述了结直肠癌中微生物群与宿主相互作用的机制,包括基因组不稳定性、转录和表观遗传重塑以及代谢重编程,并探讨了新兴计算技术、多组学整合和精准微生物组医学的应用 | 系统整合了多组学策略和计算工具在解析微生物群-宿主相互作用中的最新进展,并展望了人工智能驱动计算整合和精准微生物组医学在结直肠癌预防、诊断和治疗中的转化潜力 | 数据组成性、稀疏性和高维度等分析挑战仍阻碍有意义的结果解读 | 总结结直肠癌中微生物群与宿主相互作用的机制,并评估新兴计算技术和多组学整合方法在相关研究中的作用 | 结直肠癌相关的微生物群与宿主相互作用 | machine learning | 结直肠癌 | 高通量测序, 长读长测序, 细菌单细胞空间转录组学 | NA | 多组学数据(基因组、转录组、表观基因组、代谢组) | NA | NA | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 细菌单细胞空间转录组学(具体平台未明确提及) |
| 419 | 2026-06-09 |
RMzyme: regulations of RNA-modifying enzymes in humans
2026-Feb-12, Signal transduction and targeted therapy
IF:40.8Q1
DOI:10.1038/s41392-025-02568-2
PMID:41672979
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研究论文 | 通过378个多组学数据集对人类RNA修饰酶进行大规模表征,并开发了RMzyme平台 | 首次通过整合基因组学、转录组学、单细胞转录组学、表观转录组学、蛋白质组学和翻译后修饰等多组学数据,对RNA修饰蛋白进行了大规模系统性表征,并建立了RMzyme综合平台 | 信息不足,无法提取 | 系统表征人类RNA修饰蛋白的调控和功能,并构建综合性资源平台 | 人类63种组织中的RNA修饰蛋白及其多组学数据 | 机器学习 | 急性髓系白血病 | 多组学整合分析,包括基因组学、转录组学、单细胞转录组学、表观转录组学、蛋白质组学和翻译后修饰分析 | 非负矩阵分解 | 多组学数据(基因组、转录组、蛋白质组、翻译后修饰) | 378个数据集,涵盖63种人体组织 | NA | NA | NA | NA |
| 420 | 2026-06-09 |
A dual-action nanoparticle approach for spinal cord injury treatment: ferroptosis inhibition, inflammation control, and Myelin preservation
2026-Feb-12, Journal of nanobiotechnology
IF:10.6Q1
DOI:10.1186/s12951-026-04114-w
PMID:41673859
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研究论文 | 提出一种双作用纳米颗粒策略,通过抑制铁死亡、控制炎症和保护髓鞘来治疗脊髓损伤 | 首次使用从黄精中提取的新型果聚糖包被硒纳米颗粒,通过绿色抗坏血酸盐介导的还原合成PRP@SeNPs,实现与单细胞RNA测序识别的硒补充时间窗口对齐的前载且持续释放特性 | 未提及具体局限性 | 开发一种无药物、生物相容性的纳米治疗策略,通过补充硒来缓解脊髓损伤后的继发性损伤机制并促进神经保护和髓鞘再生 | 脊髓损伤小鼠模型及细胞 | 机器学习 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据 | 小鼠模型样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |