单细胞与空转测序相关文章
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当前共找到 27773 篇文献，本页显示第 321 - 340 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 321 | 2025-05-12 |
Immunogenic cuproptosis in cancer immunotherapy via an in situ cuproptosis-inducing system
2025-Aug, Biomaterials
IF:12.8Q1
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research paper | 该研究探讨了铜死亡在结直肠癌免疫治疗中的免疫原性及其与免疫治疗的联合应用 | 首次评估了铜死亡在结直肠癌中的免疫原性，并开发了一种原位铜死亡诱导系统以增强免疫治疗效果 | 研究主要集中于结直肠癌，其他癌症类型的适用性尚待验证 | 探索铜死亡在癌症免疫治疗中的潜在应用 | 结直肠癌(CRC)细胞及肿瘤微环境(TME) | 癌症免疫治疗 | 结直肠癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 体外和体内实验 | NA | 基因表达数据, 实验数据 | 内部队列和其他独立队列的样本 |
| 322 | 2025-05-12 |
Identification of KANK1 as a tumor suppressor gene in pancreatic ductal adenocarcinoma
2025-06-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151885
PMID:40288262
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研究论文 | 本研究通过整合mRNA-蛋白质丰度相关性分析，鉴定出KANK1作为胰腺导管腺癌（PDAC）中的新型肿瘤抑制基因 | 首次将KANK1鉴定为PDAC中的肿瘤抑制基因，并揭示其通过拷贝数缺失和肿瘤缺氧下调的机制 | 未涉及KANK1在PDAC中的具体分子机制及其作为治疗靶点的临床验证 | 鉴定PDAC中的关键肿瘤抑制基因并探索其功能机制 | 胰腺导管腺癌（PDAC） | 肿瘤生物学 | 胰腺癌 | mRNA-蛋白质丰度相关性分析、单细胞RNA测序、免疫印迹分析 | NA | mRNA表达数据、蛋白质表达数据、单细胞RNA测序数据 | 多个数据集（包括TCGA和CCLE数据库）的样本 |
| 323 | 2025-05-12 |
The integration of scRNA-seq with microarray and in-vivo experiments facilitates a comprehensive elucidation of the molecular mechanisms underlying endothelial cell involvement in myocardial infarction
2025-06-20, Biochemical and biophysical research communications
IF:2.5Q3
DOI:10.1016/j.bbrc.2025.151820
PMID:40288264
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研究论文 | 本研究通过整合scRNA-seq、微阵列数据和体内实验，揭示了内皮细胞在心肌梗死中的关键基因及其分子机制 | 结合scRNA-seq、微阵列数据和体内实验，首次鉴定并验证了DBP、NR1D1和TEF在心肌梗死发展中的关键作用 | 研究依赖于公开数据库数据，样本量可能有限，且体内实验仅在特定模型中进行验证 | 阐明内皮细胞在心肌梗死发展中的分子机制 | 内皮细胞及其在心肌梗死中的功能 | 数字病理学 | 心血管疾病 | scRNA-seq, 微阵列, WB, qPCR, 免疫荧光 | hdWGCNA, scCODE, FindMarkers, PPI分析 | 基因表达数据, 图像数据 | 16个不同的细胞簇，涵盖7种独特的细胞类型，内皮细胞分为8个亚群 |
| 324 | 2025-05-12 |
Single-cell sequencing reveals alterations in the ovarian immune microenvironment regulated by 17β-estradiol in neonatal mice
2025-May-18, Zoological research
IF:4.0Q1
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研究论文 | 通过单细胞测序技术研究17β-雌二醇对新生小鼠卵巢免疫微环境的调控作用 | 首次全面描述了新生小鼠卵巢免疫微环境在17β-雌二醇调控下的动态变化，揭示了雌激素对巨噬细胞表型转换的影响 | 研究仅针对新生小鼠模型，结果可能无法完全反映成年个体的情况 | 探究雌激素在卵巢免疫微环境中的调控机制 | C57BL/6J新生小鼠的卵巢组织 | 单细胞生物学 | 生殖系统疾病 | 单细胞转录组测序 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 新生小鼠卵巢组织样本 |
| 325 | 2025-05-12 |
RETRACTION: Single-Cell Transcriptome Analysis Reveals Intratumoral Heterogeneity in Lung Adenocarcinoma
2025-May-10, Environmental toxicology
IF:4.4Q1
DOI:10.1002/tox.24531
PMID:40346999
|
撤稿声明 | 该文章因同行评审过程存在问题而被撤稿 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA |
| 326 | 2025-05-12 |
Spatial transcriptomic applications in orthopedics
2025-May-10, Connective tissue research
IF:2.8Q1
DOI:10.1080/03008207.2025.2501703
PMID:40347072
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综述 | 本文综述了空间转录组学在骨科研究中的应用，特别是在解析肌肉骨骼组织中复杂基因表达模式方面的变革性影响 | 强调了空间转录组学在识别新的细胞群体和细胞信号通路方面的创新应用 | 未提及具体的技术限制或研究中的不足 | 探讨空间转录组学在骨科研究中的应用及其潜力 | 肌肉骨骼组织（软骨、关节、骨、肌腱、韧带和滑膜） | 数字病理学 | 骨科疾病 | 10X Visium, 10X Xenium, seqFISH+, MERFISH, NanoString GeoMx DSP | NA | 空间转录组数据 | 29篇已发表的手稿，涉及软骨、骨、肌腱、滑膜和椎间盘 |
| 327 | 2025-05-12 |
Inhibition of SIRT1/HSF1 pathway contributes to doxorubicin-induced nephrotoxicity in ovarian tumor-bearing mice
2025-May-10, Apoptosis : an international journal on programmed cell death
IF:6.1Q1
DOI:10.1007/s10495-025-02122-z
PMID:40347321
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research paper | 本研究探讨了SIRT1/HSF1通路在多柔比星（DOX）诱导的卵巢肿瘤小鼠肾毒性中的作用 | 揭示了SIRT1/HSF1通路在DOX诱导的肾毒性中的新机制，并发现HSF1A和SIRT1激动剂RSV可减轻这种损伤 | 研究仅在小鼠模型中进行，尚未在人类临床试验中验证 | 探究DOX诱导的肾毒性机制及SIRT1/HSF1通路的作用 | 卵巢肿瘤小鼠模型及小鼠足细胞 | 生物医学 | 卵巢癌 | scRNA-seq, 基因集富集分析 | 小鼠模型 | RNA-seq数据, 组织样本数据 | 小鼠肾脏组织及足细胞样本 |
| 328 | 2025-05-12 |
The MYC/TXNIP axis mediates NCL-Suppressed CD8+T cell immune response in lung adenocarcinoma
2025-May-09, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01224-3
PMID:40346484
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研究论文 | 本研究探讨了核仁蛋白NCL通过MYC/TXNIP轴调节CD8+T细胞的葡萄糖代谢和免疫功能，从而影响肺腺癌的免疫逃逸 | 揭示了NCL通过MYC/TXNIP轴调控CD8+T细胞葡萄糖代谢的新机制 | 研究主要基于体外和小鼠模型，尚未在人体临床试验中验证 | 探究NCL在T细胞葡萄糖代谢和肺腺癌免疫逃逸中的作用 | CD8+T细胞和肺腺癌细胞 | 肿瘤免疫学 | 肺腺癌 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq)、原位移植小鼠模型 | NA | 基因表达数据、实验数据 | 来自GEO和TCGA的数据库数据，以及体外和小鼠实验样本 |
| 329 | 2025-05-12 |
Single-cell and bulk transcriptome sequencing identifies circadian rhythm disruption and cluster-specific clinical insights in colorectal tumorigenesis
2025-May-08, Discover oncology
IF:2.8Q2
DOI:10.1007/s12672-025-02521-3
PMID:40338428
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research paper | 该研究通过单细胞和批量转录组测序，探讨了结直肠癌（CRC）中昼夜节律（CR）的失调，并构建了CR亚型分类器，分析了不同CR簇的预后意义、肿瘤微环境状态及对免疫检查点阻断（ICB）治疗的反应 | 首次在CRC中构建了CR亚型分类器和CR评分系统（CRS），揭示了CR基因与CRC预后之间的潜在联系，并识别了影响CRC预后的潜在靶基因 | 研究样本量有限，且未进行实验验证CR基因与CRC预后的直接因果关系 | 探讨昼夜节律失调在结直肠癌发生发展中的作用，并开发基于CR相关基因的预后模型 | 结直肠癌患者及其肿瘤组织 | digital pathology | colorectal cancer | bulk and single-cell RNA sequencing | machine learning | RNA-seq data | 未明确提及具体样本数量，但涉及CRC患者和正常组织的转录组数据 |
| 330 | 2025-05-12 |
Isoform-resolution single-cell RNA sequencing reveals the transcriptional panorama of adult Baoshan pig testis cells
2025-May-08, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11636-4
PMID:40340725
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研究论文 | 本研究通过整合长读长（Nanopore）和短读长（Illumina）单细胞RNA测序技术，对保山猪睾丸细胞进行了转录组分析，揭示了睾丸细胞的异质性和精子发生的分子调控机制 | 首次在保山猪睾丸中应用长读长和短读长单细胞RNA测序技术，全面解析了睾丸细胞的转录组特征和精子发生的动态过程 | 研究仅针对保山猪睾丸细胞，结果可能不适用于其他物种或猪的其他品种 | 解析猪睾丸细胞的异质性和精子发生的分子调控机制 | 保山猪睾丸细胞 | 生殖生物学 | NA | Nanopore长读长测序, Illumina短读长测序, 单细胞RNA测序(scRNA-seq) | NA | 单细胞RNA测序数据 | 11,520个单细胞和23,402个基因 |
| 331 | 2025-05-12 |
Single-cell multi-omics delineates the dynamics of distinct epigenetic codes coordinating mouse gastrulation
2025-May-08, BMC genomics
IF:3.5Q2
DOI:10.1186/s12864-025-11619-5
PMID:40340740
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研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术描绘了小鼠原肠胚形成过程中不同表观遗传代码的动态变化 | 整合scRNA-seq和单细胞ChIP-seq分析揭示了增强子激活与基因表达之间的'时间滞后'过渡模式，并构建了以关键转录因子为中心的基因调控网络 | 研究仅关注H3K27ac和H3K4me1两种组蛋白修饰，可能忽略了其他重要的表观遗传调控机制 | 阐明表观遗传重编程在小鼠原肠胚形成过程中的分子协调机制 | 小鼠胚胎 | 表观遗传学 | 先天性疾病 | 单细胞ChIP-seq, scRNA-seq | NA | 表观遗传组数据, 转录组数据 | 六个连续时间点收集的小鼠胚胎样本 |
| 332 | 2025-05-12 |
Transcriptome-wide analysis reveals potential roles of CFD and ANGPTL4 in fibroblasts regulating B cell lineage for extracellular matrix-driven clustering and novel avenues for immunotherapy in breast cancer
2025-May-08, Molecular medicine (Cambridge, Mass.)
DOI:10.1186/s10020-025-01237-y
PMID:40340806
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研究论文 | 通过转录组和基因组数据分析乳腺癌中细胞外基质（ECM）的组成模式及其生物学功能，并探索其对免疫治疗的影响 | 首次识别了乳腺癌中三种不同的ECM簇，并发现ANGPTL4+和CFD+成纤维细胞通过不同信号通路调控B细胞谱系，为免疫治疗提供了新的生物标志物 | 研究主要依赖公共数据库数据，缺乏实验验证 | 探索乳腺癌中ECM的组成模式及其在肿瘤微环境中的作用，以及其对免疫治疗的影响 | 乳腺癌患者 | 数字病理 | 乳腺癌 | 转录组分析、单细胞RNA测序、机器学习 | 非负矩阵分解（NMF）、加权基因共表达网络分析（WGCNA） | 转录组数据、基因组数据 | TCGA数据库中的乳腺癌患者数据，以及10个独立公共队列（共6,736例样本） |
| 333 | 2025-05-12 |
Identification of the "Collagen-Macrophage" sub-category of patients with colorectal cancer as an extension of the CMS4 subtype with THBS2 as a therapeutic target
2025-May-08, BMC gastroenterology
IF:2.5Q2
DOI:10.1186/s12876-025-03918-8
PMID:40340827
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research paper | 该研究通过整合结肠癌转录组和单细胞转录组数据集，识别出一类富含'胶原蛋白-TAMs'的结直肠癌患者亚群，称为CM类，并发现CAF衍生的THBS2可作为潜在生物标志物 | 提出了一种新的结直肠癌患者分类系统CM类，作为传统CMS分类系统的扩展，并发现THBS2作为新的潜在免疫治疗联合靶点 | 未提及研究样本的具体数量或研究人群的详细信息 | 提高结直肠癌的分类准确性和治疗效果 | 结直肠癌患者及其肿瘤微环境 | digital pathology | colorectal cancer | 转录组测序, 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据, 单细胞数据 | NA |
| 334 | 2025-05-12 |
High-throughput strategies for monoclonal antibody screening: advances and challenges
2025-May-08, Journal of biological engineering
IF:5.7Q1
DOI:10.1186/s13036-025-00513-z
PMID:40340930
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综述 | 本文综述了高通量单克隆抗体筛选策略的最新进展与挑战 | 介绍了抗体库展示、单B细胞抗体技术和单细胞测序等新技术，显著降低了成本并提高了抗体开发效率 | 未具体讨论这些新技术在实际应用中可能遇到的具体技术障碍或限制条件 | 探讨高通量抗体开发的最新进展及其相对于传统方法的潜在优势 | 单克隆抗体的高通量筛选技术 | 生物医学工程 | NA | 抗体库展示、单B细胞抗体技术、单细胞测序 | NA | NA | NA |
| 335 | 2025-05-12 |
The cancer stem cells characteristics analysis of LGR5 + cells that influence lung cancer risk by using single cell RNA-seq analysis
2025-May-08, Scientific reports
IF:3.8Q1
DOI:10.1038/s41598-025-00585-3
PMID:40341189
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research paper | 通过单细胞RNA测序分析LGR5+细胞的癌症干细胞特性，研究其对肺癌风险的影响 | 首次通过单细胞RNA测序技术识别LGR5+干细胞在肺腺癌进展中的关键作用，并发现其hub基因如HLA-DPB1、CD74、CTSH和HLA-DRB5介导独特的转录状态 | 研究仅基于公开数据库GSE149655的数据，实验验证部分仅使用了BEAS-2B和A549细胞系，可能无法完全代表临床样本的复杂性 | 探索肺腺癌中癌症干细胞的特性及其在癌症进展中的作用 | 肺腺癌(LUAD)中的LGR5+干细胞 | digital pathology | lung cancer | single cell RNA-seq, qRT-PCR, western blotting, wound healing, trans-well assays, EdU tests, flow cytometry | NA | RNA-seq数据 | GSE149655数据集中的单细胞RNA-seq数据，以及BEAS-2B和A549细胞系 |
| 336 | 2025-05-12 |
Integrated analysis of MIOX gene in prognosis of clear-cell renal cell carcinoma
2025-May-08, Cell death & disease
IF:8.1Q1
DOI:10.1038/s41419-025-07698-7
PMID:40341358
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研究论文 | 本研究通过整合分析MIOX基因在透明细胞肾细胞癌(ccRCC)预后中的作用，揭示了其作为独立预后标志物的潜力 | 首次通过单细胞RNA测序和空间转录组分析确定了MIOX在ccRCC中的特异性，并验证了其作为独立预后标志物的价值 | 研究主要基于TCGA数据库，缺乏外部验证队列 | 探索铁死亡相关基因对ccRCC患者预后的影响 | 透明细胞肾细胞癌(ccRCC)患者 | 癌症基因组学 | 肾癌 | scRNA-seq, 空间转录组分析, Lasso回归分析, Kaplan-Meier分析 | NA | 基因表达数据 | TCGA数据库中的ccRCC样本与正常组织样本 |
| 337 | 2025-05-12 |
Single-Cell Transcriptome Reveals the Cellular Response to PEG-Induced Stress in Wheat Leaves
2025-May-07, Journal of agricultural and food chemistry
IF:5.7Q1
DOI:10.1021/acs.jafc.4c12749
PMID:40287963
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析研究小麦叶片在PEG诱导胁迫下的细胞响应机制 | 首次构建小麦叶片细胞图谱，并揭示不同类型细胞在干旱胁迫下的异质性响应机制 | 研究仅基于PEG模拟的干旱胁迫，未涉及真实田间干旱条件 | 探究小麦在干旱胁迫下的细胞水平响应机制 | 抗旱和易旱小麦幼苗的叶片细胞 | 植物分子生物学 | NA | 单细胞转录组测序 | NA | 转录组数据 | 抗旱和易旱小麦幼苗叶片细胞 |
| 338 | 2025-05-12 |
Angiotensin-Converting Enzyme-Dependent Intrarenal Angiotensin II Contributes to CTP: Phosphoethanolamine Cytidylyltransferase Downregulation, Mitochondrial Membranous Disruption, and Reactive Oxygen Species Overgeneration in Diabetic Tubulopathy
2025-May, Antioxidants & redox signaling
IF:5.9Q1
DOI:10.1089/ars.2024.0637
PMID:39495586
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research paper | 本研究探讨了血管紧张素转换酶（ACE）依赖的肾内血管紧张素II（AngII）在糖尿病肾小管病变（DT）中对线粒体膜破坏和活性氧（ROS）过度生成的贡献 | 揭示了ACE依赖的肾内AngII通过下调CTP:磷酸乙醇胺胞苷酰转移酶（PCYT2）导致线粒体膜破坏和ROS过度生成的新机制 | 研究主要基于小鼠模型，结果在人类中的适用性需要进一步验证 | 探究ACE依赖的肾内AngII在糖尿病肾小管损伤中的作用机制 | 糖尿病小鼠模型和肾小管细胞 | 糖尿病肾病研究 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序 | 小鼠糖尿病模型 | 实验数据 | 未明确说明样本数量，使用高脂饮食/链脲佐菌素诱导的2型糖尿病小鼠 |
| 339 | 2025-05-12 |
Single-Cell Transcriptomic Analysis Reveals an Aggressive Basal-Like Tumor Cell Subpopulation Associated With Poor Prognosis in Intrahepatic Cholangiocarcinoma
2025-May, Journal of gastroenterology and hepatology
IF:3.7Q2
DOI:10.1111/jgh.16915
PMID:39993788
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研究论文 | 通过单细胞转录组分析揭示了肝内胆管癌中与不良预后相关的侵袭性基底样肿瘤细胞亚群 | 首次在肝内胆管癌中鉴定出一个表达基底上皮相关基因的基底样肿瘤细胞亚群，并揭示了其通过HGF-MET轴与炎症性癌症相关成纤维细胞的相互作用机制 | 样本量相对较小（26个肿瘤样本），且需要进一步的功能实验验证 | 解析肝内胆管癌的肿瘤异质性并寻找新的治疗靶点 | 肝内胆管癌患者的肿瘤组织和肿瘤微环境 | 癌症基因组学 | 肝内胆管癌 | 单细胞RNA测序（scRNA-seq）、空间转录组测序、免疫组化染色、多重免疫荧光染色 | NA | 单细胞转录组数据、空间转录组数据、bulk RNA-seq数据 | 23名患者的26个肿瘤样本（scRNA-seq），6名患者的6个肿瘤切片（空间转录组） |
| 340 | 2025-05-12 |
Single-Cell RNA Sequencing in Incontinentia Pigmenti With Neonatal Encephalopathy Reveals Broad Immune Activation Moderated by Steroids
2025-May, Neurology(R) neuroimmunology & neuroinflammation
DOI:10.1212/NXI.0000000000200358
PMID:40020213
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research paper | 该研究通过单细胞RNA测序技术，探讨了色素失禁症（IP）伴新生儿脑病患者的细胞特异性基因表达，以及类固醇治疗对免疫激活的影响 | 首次在IP伴新生儿脑病患者中应用单细胞RNA测序技术，揭示了类固醇治疗对广泛免疫激活的调节作用 | 样本量小（n=1），结果可能不具有广泛代表性 | 探究IP伴新生儿脑病的发病机制及类固醇治疗的作用机制 | 一名IP伴新生儿脑病患者和一名性别匹配的健康幼儿对照 | digital pathology | geriatric disease | scRNAseq, HIVE single-cell system | NA | RNA sequencing data | 20,411个细胞（来自1名IP患者治疗前后和1名健康对照） |