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当前共找到 31780 篇文献，本页显示第 3361 - 3380 篇。
| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3361 | 2025-10-06 |
PROFET Predicts Continuous Gene Expression Dynamics from scRNA-seq Data to Elucidate Heterogeneity of Cancer Treatment Responses
2025-Jul-03, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.06.27.662030
PMID:40631077
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研究论文 | 开发PROFET计算框架从稀疏采样的单细胞RNA测序数据重建连续基因表达动态轨迹 | 提出基于Lipschitz正则化梯度流和神经力匹配的粒子流方法，首次实现从静态单细胞数据推断连续非线性基因表达动态 | 方法依赖于时间戳样本的可用性，在极稀疏采样情况下性能可能受限 | 研究癌症治疗响应异质性，特别是激素受体阳性乳腺癌对帕博西尼的治疗反应 | 小鼠和人类单细胞RNA测序数据，包括帕博西尼耐药乳腺癌细胞系和患者来源数据集 | 计算生物学 | 乳腺癌 | 单细胞RNA测序 | 神经网络，梯度流模型 | 单细胞基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3362 | 2025-10-06 |
HMBOX1 reverses autophagy mediated 5-fluorouracil resistance through promoting HACE1-induced ubiquitination and degradation of ATG5 in colorectal cancer
2025-07, Autophagy
IF:14.6Q1
DOI:10.1080/15548627.2025.2477443
PMID:40126194
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研究论文 | 本研究揭示了HMBOX1通过促进HACE1介导的ATG5泛素化降解逆转结直肠癌中自噬介导的5-氟尿嘧啶耐药机制 | 首次发现HMBOX1-HACE1-ATG5轴在调控结直肠癌化疗耐药中的关键作用，阐明了转录因子通过调控E3泛素连接酶影响自噬的新机制 | 研究主要基于细胞和临床组织验证，缺乏动物模型在体验证；临床样本量有限 | 探究HMBOX1在结直肠癌5-氟尿嘧啶耐药中的作用机制 | 结直肠癌细胞系和临床组织样本 | 癌症生物学 | 结直肠癌 | RNA测序, 单细胞RNA测序, 质谱蛋白质组学, 免疫染色, 染色质免疫沉淀 | NA | 基因表达数据, 蛋白质组数据, 临床病理数据 | 结直肠癌患者组织样本（具体数量未明确说明） | NA | 单细胞RNA测序, 质谱蛋白质组学 | NA | NA |
| 3363 | 2025-10-06 |
Single-cell and spatial transcriptome analysis revealed cellular heterogeneity of glycosyltransferases in cervical cancer, and identified GALNT3-negative epithelial cells as a protective factor: a retrospective cohort study based on public database
2025-07-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002520
PMID:40387729
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研究论文 | 通过单细胞和空间转录组分析揭示宫颈癌中糖基转移酶的细胞异质性，发现GALNT3阴性上皮细胞是保护性因素 | 首次结合单细胞RNA测序和空间转录组学分析宫颈癌中糖基转移酶的细胞异质性，鉴定出GALNT3阴性上皮细胞作为保护因子 | 基于公共数据库的回顾性队列研究，需要进一步实验验证 | 探索糖基转移酶在宫颈癌中的作用机制 | 宫颈癌患者样本和细胞系 | 数字病理学 | 宫颈癌 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据, 空间转录组数据 | 基于公共数据库的回顾性队列 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3364 | 2025-10-06 |
Evaluation of tumor pseudocapsule using computed tomography-based radiomics in pancreatic neuroendocrine tumors to predict prognosis and guide surgical strategy: a cohort study
2025-07-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002511
PMID:40395025
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研究论文 | 本研究通过CT影像组学评估胰腺神经内分泌肿瘤假包膜状态，以预测预后并指导手术策略 | 首次结合CT影像组学和机器学习术前识别假包膜状态，为小胰腺神经内分泌肿瘤的手术方式选择提供依据 | 单中心回顾性研究，样本量有限，需要外部验证 | 评估胰腺神经内分泌肿瘤假包膜状态对预后的影响并指导手术决策 | 胰腺神经内分泌肿瘤患者 | 医学影像分析 | 胰腺神经内分泌肿瘤 | 单细胞RNA测序，CT影像组学分析 | 机器学习模型 | 医学影像，临床病理数据，单细胞测序数据 | 475例胰腺神经内分泌肿瘤患者 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3365 | 2025-10-06 |
Potential of SPHK1 as a prognostic marker and therapeutic target in colorectal cancer: insights from bioinformatics and experimental analysis
2025-07-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002506
PMID:40434736
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研究论文 | 本研究通过生物信息学和实验分析探讨SPHK1在结直肠癌中的预后标志物和治疗靶点潜力 | 首次通过孟德尔随机化方法证实鞘磷脂水平与结直肠癌风险的因果关系，并结合单细胞RNA测序分析SPHK1与免疫浸润的关联 | 样本量相对有限，需要更大规模临床验证 | 研究SPHK1在结直肠癌进展中的作用机制及其作为预后标志物和治疗靶点的潜力 | 结直肠癌组织和细胞系 | 生物信息学 | 结直肠癌 | 多组学分析,单细胞RNA测序,孟德尔随机化,多重荧光免疫组化,细胞迁移/侵袭/凋亡实验 | NA | 基因表达数据,甲基化数据,蛋白质表达数据,细胞功能数据 | 90例结直肠癌组织和对应正常组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3366 | 2025-10-06 |
Microbiome Single Cell Atlases Generated with a Commercial Instrument
2025-Jul, Advanced science (Weinheim, Baden-Wurttemberg, Germany)
DOI:10.1002/advs.202409338
PMID:40462354
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研究论文 | 本文介绍了EASi-seq方法，通过改造商业单细胞测序平台实现对微生物的高通量单细胞基因组测序 | 首次将商业单细胞测序仪器成功应用于微生物单细胞基因组测序，开发了配套生物信息学流程 | 未明确说明方法在特定微生物类型或复杂环境样本中的适用性限制 | 开发适用于微生物的单细胞基因组测序方法 | 人类和环境微生物组中的单个微生物细胞 | 微生物组学 | NA | 单细胞基因组测序 | NA | 基因组序列数据 | 每次运行可测序数万个微生物 | Mission Bio | 单细胞基因组测序 | Tapestri | Mission Bio Tapestri单细胞分析平台 |
| 3367 | 2025-10-06 |
Identification of an immunomodulatory lncRNA signature associated with immune cell reprogramming in high-grade glioma
2025-Jul, Cancer gene therapy
IF:4.8Q1
DOI:10.1038/s41417-025-00919-3
PMID:40527978
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研究论文 | 本研究通过识别与高级别胶质瘤免疫细胞重编程相关的免疫调节性长链非编码RNA特征，揭示了其在肿瘤免疫微环境形成中的作用 | 首次在高级别胶质瘤中系统鉴定与免疫抑制和促炎性肿瘤微环境相关的lncRNA特征，并通过单细胞和空间转录组学揭示其细胞类型特异性和空间分布特征 | 研究主要基于小鼠模型，人类样本验证有限；机制研究尚不深入 | 探索lncRNAs在高级别胶质瘤免疫微环境形成中的作用机制 | 高级别胶质瘤肿瘤浸润免疫细胞 | 生物信息学 | 脑肿瘤/胶质瘤 | 单细胞RNA测序, 空间转录组学, 转录组分析 | NA | RNA测序数据, 空间转录组数据 | 两种小鼠模型(RCAS-PDGFb和RCAS-BRAF V600E)及GBM患者样本 | NA | 单细胞RNA-seq, 空间转录组学 | NA | NA |
| 3368 | 2025-10-06 |
Bidirectional mendelian randomization and single-cell sequencing reveal T cell-mediated causal links between COPD and lung adenocarcinoma
2025-Jul-01, International journal of surgery (London, England)
DOI:10.1097/JS9.0000000000002448
PMID:40676822
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研究论文 | 通过双向孟德尔随机化和单细胞测序技术揭示T细胞介导的慢性阻塞性肺疾病与肺腺癌之间的因果关系 | 首次结合双向孟德尔随机化分析和单细胞RNA测序技术探索COPD与肺腺癌之间的因果机制 | 研究样本量有限，仅关注了CD4+T细胞亚群，未涵盖其他免疫细胞类型 | 探索慢性阻塞性肺疾病与肺腺癌之间的潜在关系和作用机制 | COPD和肺腺癌患者的CD4+T细胞亚群 | 生物信息学 | 肺癌 | 单细胞RNA测序, 孟德尔随机化分析, 表达数量性状位点分析, 全基因组关联研究 | 孟德尔随机化模型 | 单细胞RNA测序数据, GWAS数据, eQTL数据 | 来自COPD和肺腺癌患者外周血样本的单细胞RNA测序数据 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3369 | 2025-10-06 |
Mapping Genetic Associations With Functional Brain Area Alterations in Schizophrenia and Implications for Cortical Development
2025-Jul, Brain and behavior
IF:2.6Q3
DOI:10.1002/brb3.70688
PMID:40685676
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研究论文 | 本研究通过脑功能区域灰质体积变化与遗传因素关联分析，探索精神分裂症患者大脑皮层发育异常的潜在机制 | 首次系统性地将精神分裂症患者灰质体积变化定位到特定Brodmann脑功能区域，并结合GWAS和单细胞RNA测序技术揭示相关基因在皮层发育中的动态表达模式 | 样本量相对有限（194名患者和330名对照），且主要基于台湾人群，结果在其他人群中的普适性需要进一步验证 | 识别精神分裂症患者特定脑功能区域的灰质体积变化及其遗传基础，探索相关基因在皮层发育中的作用 | 精神分裂症患者和健康对照者的大脑灰质体积变化及遗传变异 | 神经影像遗传学 | 精神分裂症 | T1加权MRI、全基因组关联分析（GWAS）、单细胞RNA测序、原位杂交 | GWAS分析、单细胞转录组分析 | 脑影像数据、遗传数据、基因表达数据 | 194名精神分裂症患者和330名健康对照 | NA | 单细胞RNA测序、空间转录组学 | NA | NA |
| 3370 | 2025-10-06 |
Dissecting Sex-Specific Pathology in K18-hACE2 Transgenic Mice Infected With Different SARS-CoV-2 Variants
2025-Jul, Journal of medical virology
IF:6.8Q1
DOI:10.1002/jmv.70506
PMID:40686017
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研究论文 | 本研究通过分析感染不同SARS-CoV-2变异株的K18-hACE2转基因小鼠，揭示性别特异性病理差异 | 首次系统比较不同SARS-CoV-2变异株（614G、Delta、Omicron）在转基因小鼠模型中引发的性别特异性病理差异 | 研究局限于K18-hACE2转基因小鼠模型，结果需在人类中进一步验证 | 解析COVID-19病理中性别差异与SARS-CoV-2变异株特异性关系 | K18-hACE2转基因小鼠的肺组织和鼻腔组织 | 空间转录组学 | COVID-19 | 空间转录组学，免疫组织化学，细胞因子检测 | NA | 基因表达数据，细胞浸润数据，细胞因子数据 | 年龄匹配的雌性和雄性K18-hACE2转基因小鼠 | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3371 | 2025-10-06 |
Transcriptomic analysis reveals novel targets in benign schwannoma using machine learning
2025-Jun-21, Neuroscience
IF:2.9Q2
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研究论文 | 本研究通过机器学习辅助的转录组和单细胞分析识别良性神经鞘瘤的关键免疫相关生物标志物，并构建疾病评估预测模型 | 首次识别出ANGPTL1、IL17RC、LTBR、OLR1和TGFBR1五个新型免疫相关生物标志物在良性神经鞘瘤中的功能作用 | 预测模型的曲线下面积仅为0.67，模型性能有待进一步提升 | 识别良性神经鞘瘤的关键免疫相关生物标志物并构建疾病评估预测模型 | 良性神经鞘瘤患者转录组数据和NF2基因敲除小鼠模型 | 机器学习 | 神经鞘瘤 | 转录组分析,单细胞RNA测序 | LASSO,SVM,Random Forest | 转录组数据 | GSE108524数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3372 | 2025-10-06 |
Immune reconstitution following allogeneic hematopoietic cell transplantation and CAR-T therapy: dynamics, determinants, and directions
2025-Jun, Best practice & research. Clinical haematology
DOI:10.1016/j.beha.2025.101634
PMID:40701740
|
综述 | 总结异基因造血细胞移植和CAR-T治疗后免疫重建的动态过程、影响因素及优化策略 | 系统比较allo-HCT与CAR-T治疗后的免疫重建特征，提出个性化监测和治疗策略 | NA | 探讨免疫重建的动态过程及其对临床结果的影响 | 接受异基因造血细胞移植和CAR-T治疗的患者 | NA | 血液系统疾病 | 流式细胞术, 单细胞RNA测序 | NA | NA | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3373 | 2025-10-06 |
High-resolution comparative single-cell transcriptomics of doublesex-expressing neurons reveals evolutionary conservation and diversity of sexual circuits in Drosophila
2025-May-10, bioRxiv : the preprint server for biology
DOI:10.1101/2025.05.06.652433
PMID:40654601
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研究论文 | 通过单细胞转录组学比较分析果蝇属中表达doublesex基因的神经元，揭示性行为神经回路在进化中的保守性和多样性 | 首次在多个果蝇物种中系统比较性决定基因表达神经元的单细胞转录组，揭示细胞类型作为独立进化单元的特性 | 研究主要关注doublesex表达神经元，可能未涵盖所有参与性行为的神经元类型 | 探究神经回路在进化过程中的细胞和分子组成变化机制 | 果蝇属多个物种中表达doublesex基因的神经元细胞 | 神经科学 | NA | 单细胞转录组学 | NA | 单细胞RNA测序数据 | 四个果蝇物种的雄性个体，包括一个物种的雌性数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA |
| 3374 | 2025-10-06 |
Identification of podocyte molecular markers in diabetic kidney disease via single-cell RNA sequencing and machine learning
2025, PloS one
IF:2.9Q1
DOI:10.1371/journal.pone.0328352
PMID:40690456
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和机器学习识别糖尿病肾病中足细胞的分子标志物 | 结合单细胞RNA测序与多种机器学习算法首次系统鉴定糖尿病肾病足细胞特异性分子标志物ARHGEF26 | 研究主要聚焦早期糖尿病肾病，样本量有限 | 识别与糖尿病肾病相关的足细胞分子标志物 | 早期糖尿病肾病患者的足细胞 | 机器学习 | 糖尿病肾病 | 单细胞RNA测序, RT-qPCR, Western blot | 多种机器学习算法 | 单细胞RNA测序数据 | 早期糖尿病肾病患者样本 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3375 | 2025-10-06 |
3D visualization of uterus and ovary: tissue clearing techniques and biomedical applications
2025, Frontiers in bioengineering and biotechnology
IF:4.3Q2
DOI:10.3389/fbioe.2025.1610539
PMID:40692613
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综述 | 本文综述了组织透明化与三维可视化技术在子宫和卵巢研究中的最新进展与应用 | 系统评估了三种主要组织透明化技术（有机溶剂基、水凝胶基和水凝胶包埋法）在子宫和卵巢研究中的优缺点，并探索了与空间转录组学和AI分析工具的整合 | 作为综述文章，未涉及原始实验数据验证 | 促进对组织透明化技术的理解，帮助研究人员选择适合子宫和卵巢研究的方法 | 子宫和卵巢组织 | 数字病理学 | 妇科疾病 | 组织透明化技术、光片显微镜、多光子显微镜 | NA | 三维图像数据 | NA | NA | 空间转录组学 | NA | NA |
| 3376 | 2025-10-06 |
Cross-talk of m6A methylation modification and the tumor microenvironment composition in esophageal cancer
2025, Frontiers in immunology
IF:5.7Q1
DOI:10.3389/fimmu.2025.1572810
PMID:40692788
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研究论文 | 本研究通过生物信息学分析探讨m6A甲基化修饰与食管癌肿瘤微环境组成的相互作用 | 首次在食管癌中系统分析m6A修饰模式与肿瘤微环境特征的关系，并开发了基于主成分分析的m6A评分系统 | 研究主要基于生物信息学分析，需要实验验证来确认机制 | 阐明m6A甲基化修饰在食管癌肿瘤微环境形成和免疫调节中的作用 | 食管癌患者样本和相关的基因表达数据 | 生物信息学 | 食管癌 | 单细胞RNA测序，共识聚类算法，主成分分析 | 共识聚类算法 | 基因表达数据，临床数据 | 来自TCGA和GEO数据库的食管癌数据集 | NA | single-cell RNA-seq | NA | NA |
| 3377 | 2025-10-06 |
Integrating GEO Database, Mendelian Randomization, and Molecular Docking to Identify HLA-C as a Potential Therapeutic Target for Periodontitis
2025, Mediators of inflammation
IF:4.4Q2
DOI:10.1155/mi/9163431
PMID:40692979
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研究论文 | 通过整合GEO数据库、孟德尔随机化和分子对接技术，识别HLA-C作为牙周炎的潜在治疗靶点 | 首次结合基因表达数据库、孟德尔随机化分析和分子动力学模拟验证HLA-C在牙周炎中的作用及甲硝唑的潜在治疗价值 | 研究主要基于生物信息学分析，缺乏实验验证 | 探索牙周炎的分子机制并识别关键治疗靶点 | 牙周炎患者基因表达数据 | 生物信息学 | 牙周炎 | 微阵列分析,单细胞RNA测序,分子对接,分子动力学模拟 | 加权基因共表达网络分析(WGCNA),CIBERSORT,Seurat,CellChat | 基因表达数据 | GSE10334数据集 | NA | 单细胞RNA测序,微阵列 | NA | NA |
| 3378 | 2025-10-06 |
Tumor-associated bacteria activate PRDX1-driven glycolysis to promote immune evasion and PD-1 antibody resistance in hepatocellular carcinoma
2025, Frontiers in microbiology
IF:4.0Q2
DOI:10.3389/fmicb.2025.1599691
PMID:40693141
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研究论文 | 本研究揭示了肿瘤相关细菌通过激活PRDX1驱动的糖酵解促进肝细胞癌免疫逃避和PD-1抗体耐药的新机制 | 首次发现肿瘤内细菌通过NF-κB通路诱导PRDX1表达，进而驱动代谢重编程导致PD-1治疗耐药 | 样本量相对有限（29例临床样本），需在更大队列中验证 | 探究细菌感染如何通过重塑肿瘤代谢影响抗PD-1疗法疗效 | 肝细胞癌患者样本和原位肝癌小鼠模型 | 肿瘤免疫学 | 肝细胞癌 | 16S rRNA基因测序，单细胞RNA测序，流式细胞术 | NA | 基因测序数据，流式细胞数据 | 29例HCC临床样本，12,487个单细胞，每组8只小鼠的动物模型 | NA | 16S rRNA测序，单细胞RNA测序 | NA | NA |
| 3379 | 2025-10-06 |
NOVEL ACTIVE PROTEINS FOR SEPSIS PROGNOSIS REVEALED THROUGH ScRNA-seq AND QUANTITATIVE PROTEOMICS
2024-12-01, Shock (Augusta, Ga.)
DOI:10.1097/SHK.0000000000002408
PMID:38888471
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研究论文 | 通过单细胞RNA测序和定量蛋白质组学揭示影响脓毒症预后的关键活性蛋白 | 首次在单细胞水平结合scRNA-seq和DIA蛋白质组学识别脓毒症预后相关活性蛋白，并利用Viper算法估计蛋白质活性 | 样本量相对有限（脓毒症患者53例，对照组16例），需要在更大队列中验证 | 通过多组学分析揭示影响脓毒症预后的关键活性蛋白 | 脓毒症患者和健康对照者的外周血样本 | 生物信息学 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序,定量蛋白质组学,DIA蛋白质组学 | Viper算法,基因集变异分析,细胞通讯分析 | 单细胞转录组数据,蛋白质组数据 | 脓毒症患者53例（NS组26例，SV组27例），健康对照16例，共分析34,228个细胞 | NA | 单细胞RNA测序,蛋白质组学 | NA | NA |
| 3380 | 2025-10-06 |
Single-cell sequencing reveals LRRc17-mediated modulation of cardiac fibroblast ferroptosis in regulating myocardial fibrosis after myocardial infarction
2024-09, Cellular signalling
IF:4.4Q2
DOI:10.1016/j.cellsig.2024.111293
PMID:38996956
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研究论文 | 本研究通过单细胞测序揭示了LRRc17通过调节心脏成纤维细胞铁死亡来调控心肌梗死后心肌纤维化的机制 | 首次发现LRRc17基因在心肌梗死后通过调节心脏成纤维细胞铁死亡影响心室重构 | 研究主要基于动物模型和细胞实验，尚未进行临床试验验证 | 阐明心肌梗死后纤维化的发病机制并寻找治疗靶点 | 心脏成纤维细胞 | 单细胞生物学 | 心血管疾病 | 单细胞测序, qRT-PCR, Western blotting, 荧光染色 | NA | 基因表达数据, 蛋白质表达数据, 细胞功能数据 | 基于GEO数据库中的GSE153485和GSE210159数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA |