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| 序号 | 推送日期 | 文章 | 类型 | 简述 | 创新点 | 不足 | 研究目的 | 研究对象 | 领域 | 病种 | 技术 | 模型 | 数据类型 | 样本量 | 平台公司 | 平台技术 | 具体产品 | 平台详情 | 
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 3221 | 2025-10-06 | 
         Eriodictyol from Scutellariae Barbata alleviates inflammation and necrosis via ZBP1-dependent signaling in acute pancreatitis 
        
          2025-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
          
          IF:6.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.phymed.2025.156926
          PMID:40544733
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究首次揭示黄芩中圣草酚通过ZBP1依赖性信号通路缓解急性胰腺炎的炎症和坏死 | 首次发现黄芩中的活性成分圣草酚通过靶向ZBP1依赖性信号通路缓解急性胰腺炎的胰腺坏死和炎症 | NA | 探究黄芩及其活性成分圣草酚对急性胰腺炎的治疗机制 | 急性胰腺炎动物模型和266-6细胞 | 生物医学研究 | 急性胰腺炎 | 转录组分析, 单细胞RNA测序, 分子对接, 分子动力学模拟, 细胞热位移分析, 药物亲和响应靶点稳定性分析, mtDNA分析 | NA | RNA测序数据, 蛋白质相互作用数据 | NA | NA | 单细胞RNA-seq, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 3222 | 2025-10-06 | 
         Enhancing Sirt1-mediated deacetylation of p62 with a self-assembling nanopeptide and resveratrol hydrogel to mitigate sepsis-induced inflammation 
        
          2025-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
          
          IF:6.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.phymed.2025.157047
          PMID:40627928
         
       | 
      
      研究论文 | 开发自组装纳米肽和白藜芦醇复合水凝胶,通过增强Sirt1介导的p62去乙酰化来减轻脓毒症诱导的炎症 | 首次将自组装纳米肽与白藜芦醇结合形成复合水凝胶,通过调控Sirt1-p62轴促进线粒体自噬和免疫代谢重编程 | 研究主要基于小鼠模型,临床转化潜力需进一步验证 | 探究Sirt1在调节巨噬细胞线粒体自噬和免疫代谢重编程中的作用,以缓解脓毒症相关炎症 | 小鼠脓毒症模型及腹腔巨噬细胞 | 生物医学工程 | 脓毒症 | 单细胞RNA测序, 免疫染色, 透射电子显微镜, 代谢组学 | NA | 基因表达数据, 代谢物数据, 图像数据 | 小鼠脓毒症模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3223 | 2025-10-06 | 
         The role and mechanisms of macrophages in chronic pain: A peripheral-to-central perspective 
        
          2025-Sep, Brain research bulletin
          
          IF:3.5Q2
          
         
        
       | 
      
      综述 | 从外周至中枢视角分析巨噬细胞在慢性疼痛中的作用机制 | 首次系统性地从外周至中枢神经系统角度整合巨噬细胞在慢性疼痛中的功能差异 | 不同解剖部位巨噬细胞的具体功能角色研究不足且缺乏系统比较 | 阐明巨噬细胞在慢性疼痛发生和维持中的机制 | 外周伤害感受器、背根神经节和中枢神经系统中的巨噬细胞 | NA | 慢性疼痛 | 单细胞转录组学 | NA | NA | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 3224 | 2025-10-06 | 
         Selective PPARγ modulator alpinetin restores insulin sensitivity and protects from bone loss in type 2 diabetes 
        
          2025-Sep, Phytomedicine : international journal of phytotherapy and phytopharmacology
          
          IF:6.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.phymed.2025.157003
          PMID:40570558
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究探讨天然黄酮类化合物alpinetic作为选择性PPARγ调节剂,在恢复2型糖尿病胰岛素敏感性和保护骨骼健康方面的作用 | 首次发现alpinetic作为选择性PPARγ调节剂,既能改善胰岛素敏感性又能防止骨质流失,克服了传统PPARγ激动剂的骨骼副作用 | 研究主要基于STZ诱导的糖尿病小鼠模型,在人类临床效果方面仍需进一步验证 | 探究alpinetic是否可作为选择性PPARγ调节剂治疗2型糖尿病及其骨骼并发症 | 2型糖尿病小鼠模型和胰岛素抵抗脂肪细胞 | 生物医学研究 | 2型糖尿病 | 分子对接、分子动力学模拟、CETSA、双荧光素酶报告基因检测、单细胞RNA测序、网络药理学、RNA测序 | NA | 分子相互作用数据、基因表达数据、细胞功能数据、动物实验数据 | STZ诱导的2型糖尿病小鼠模型和体外细胞培养系统 | NA | 单细胞RNA测序, RNA测序 | NA | NA | 
| 3225 | 2025-10-06 | 
         The Key to Spinal Cord Recovery: Harnessing p21 Inhibition to Boost Neural Stem/Progenitor Cell Proliferation 
        
          2025-Aug-05, ACS nano
          
          IF:15.8Q1
          
         
        
          DOI:10.1021/acsnano.5c05512
          PMID:40712080
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究开发了一种基于阳离子脂质体的p21 siRNA递送系统,通过抑制p21表达增强脊髓损伤后内源性神经干/祖细胞的增殖能力 | 首次利用阳离子脂质体递送p21 siRNA来特异性增强脊髓损伤后神经干/祖细胞的增殖能力,并发现其通过调控细胞周期通路发挥作用 | 研究仅在T9脊髓损伤大鼠模型中进行验证,尚未在更大型动物或临床环境中测试 | 探索通过调控细胞周期来促进脊髓损伤后神经再生和功能恢复的新治疗策略 | 神经干/祖细胞和T9脊髓损伤大鼠模型 | 神经科学 | 脊髓损伤 | 单细胞测序,RNA干扰,转录组分析 | NA | 基因表达数据,功能行为数据 | T9脊髓损伤大鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3226 | 2025-10-06 | 
         Prg4+ fibroadipogenic progenitors in muscle are crucial for bone fracture repair 
        
          2025-Aug-05, Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
          
          IF:9.4Q1
          
         
        
          DOI:10.1073/pnas.2417806122
          PMID:40729389
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了肌肉中Prg4+纤维脂肪生成祖细胞在骨折修复中的关键作用 | 首次发现Prg4+ FAPs能从肌肉迁移至骨折部位并分化为软骨细胞、成骨细胞和骨细胞 | 研究主要基于小鼠模型,人类临床相关性需要进一步验证 | 探究肌肉细胞在骨骨折修复中的具体作用机制 | 小鼠骨骼肌中的Prg4+纤维脂肪生成祖细胞 | 骨骼生物学 | 骨折 | 单细胞RNA测序 | 小鼠骨折模型 | 基因表达数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3227 | 2025-10-06 | 
         Single-Cell Multi-Omics Identifies Specialized Cytotoxic and Migratory CD8+ Effector T Cells in Acute Myocarditis 
        
          2025-Aug-05, Circulation
          
          IF:35.5Q1
          
         
        
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞多组学技术识别了急性心肌炎中具有高细胞毒性和迁移潜能的CD57+CD8+效应T细胞亚群 | 首次在急性心肌炎中鉴定出具有特殊细胞毒性和迁移能力的CD57+CD8+效应T细胞亚群,并揭示了其上游IL-18信号通路 | 样本量相对有限(40例患者),且动物模型为小鼠模型,与人类疾病存在物种差异 | 探究急性心肌炎的免疫发病机制并寻找潜在治疗靶点 | 急性心肌炎患者(40例,其中轻度24例,暴发性16例)和柯萨奇病毒B3诱导的暴发性心肌炎小鼠模型 | 免疫学 | 心血管疾病 | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 飞行时间质谱流式细胞术, Olink蛋白质组学 | NA | 单细胞转录组数据, 蛋白质组数据, 流式细胞数据 | 40例急性心肌炎患者(24例轻度,16例暴发性)和柯萨奇病毒B3诱导的小鼠模型 | NA | 单细胞RNA测序, 单细胞T细胞受体测序, 飞行时间质谱流式细胞术, 蛋白质组学 | NA | NA | 
| 3228 | 2025-10-06 | 
         KAFSTExp: Kernel Adaptive Filtering with Nystrom Approximation for Predicting Spatial Gene Expression from Histology Image 
        
          2025-Aug-04, IEEE journal of biomedical and health informatics
          
          IF:6.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1109/JBHI.2025.3595101
          PMID:40758493
         
       | 
      
      研究论文 | 提出一种基于核自适应滤波和Nystrom近似的框架KAFSTExp,用于从组织学图像预测空间基因表达 | 首次将核自适应滤波与Nystrom近似结合用于空间转录组学预测,利用UNI病理基础模型编码图像特征,显著提升预测精度并降低计算成本 | 在有限的空间转录组数据集上验证,模型泛化能力仍需更多外部验证 | 开发从组织病理学图像预测空间基因表达的高效计算方法 | 空间转录组数据和对应的组织病理学图像 | 数字病理学 | 肿瘤 | 空间转录组学,核方法,Nystrom近似 | 核自适应滤波,核最小均方算法,UNI基础模型 | 图像,基因表达数据 | 多个空间转录组数据集 | NA | 空间转录组学 | NA | NA | 
| 3229 | 2025-10-06 | 
         Deciphering neutrophil dynamics in the focal lesion tumor microenvironment to overcome immunosuppression in multiple myeloma 
        
          2025-Aug-04, Blood
          
          IF:21.0Q1
          
         
        
          DOI:10.1182/blood.2025028963
          PMID:40758944
         
       | 
      
      研究论文 | 通过单细胞RNA测序分析多发性骨髓瘤病灶微环境中的中性粒细胞动态,揭示其免疫抑制机制 | 首次在多发性骨髓瘤中鉴定出三个不同的CXCR2+成熟中性粒细胞亚群,并发现TREM1+CD10+亚群具有强免疫抑制功能 | 临床前模型研究,需要进一步验证其临床转化潜力 | 解析多发性骨髓瘤肿瘤微环境中中性粒细胞的功能作用,寻找新的治疗靶点 | 多发性骨髓瘤患者的病灶组织和骨髓样本中的髓系细胞 | 单细胞生物学 | 多发性骨髓瘤 | 单细胞RNA测序,免疫荧光成像,功能分析实验 | NA | 单细胞转录组数据,图像数据 | 配对的病灶和骨髓样本,大型多发性骨髓瘤患者数据集 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3230 | 2025-10-06 | 
         Allele-specific expression analysis: pipelines, applications, challenges, and unmet needs 
        
          2025-Aug-03, Computers in biology and medicine
          
          IF:7.0Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.compbiomed.2025.110890
          PMID:40759060
         
       | 
      
      综述 | 本文系统评估了26种等位基因特异性表达分析流程的现状、应用与挑战 | 首次对26种前沿等位基因特异性表达分析流程进行系统性分类评估,提出未来发展方向 | 现有分析流程缺乏端到端解决方案、多组学整合能力不足、单细胞测序技术支持有限 | 评估等位基因特异性表达分析流程的能力与应用前景 | 26种等位基因特异性表达分析流程 | 生物信息学 | NA | 等位基因特异性表达分析 | NA | 基因组测序数据 | NA | NA | 单细胞测序,多组学整合 | NA | NA | 
| 3231 | 2025-10-06 | 
         Spatial mutual nearest neighbors for spatial transcriptomics data 
        
          2025-Aug-02, Bioinformatics (Oxford, England)
          
         
        
          DOI:10.1093/bioinformatics/btaf403
          PMID:40713795
         
       | 
      
      研究论文 | 提出了一种名为spatialMNN的新算法,用于整合多个空间转录组样本并识别空间域 | 将传统的互近邻算法扩展到空间转录组学领域,通过整合2D空间信息改进了批次校正方法 | NA | 开发能够整合空间信息的转录组数据批次校正和空间域识别算法 | 空间转录组数据 | 空间转录组学 | NA | 空间转录组学 | kNN, MNN, Louvain算法 | 空间转录组数据 | 包含31个10x Genomics Visium样本的大规模数据集 | 10x Genomics | 空间转录组学 | 10x Visium | 10x Genomics Visium平台 | 
| 3232 | 2025-10-06 | 
         Upregulation of YY1/EZH2 and MLH1 as Therapeutic Targets for Adult T-Cell Leukemia/Lymphoma 
        
          2025-Aug, Cancer science
          
          IF:4.5Q1
          
         
        
          DOI:10.1111/cas.70095
          PMID:40355804
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过单细胞RNA测序发现YY1/EZH2表观遗传调控轴在成人T细胞白血病/淋巴瘤中的关键作用,并揭示MLH1作为潜在治疗靶点 | 首次在单细胞水平识别ATLL中YY1/EZH2表观遗传调控轴,并发现其通过调控MLH1影响疾病侵袭性 | ATLL的遗传背景多样性使得作用机制难以完全阐明,样本量有限 | 探索成人T细胞白血病/淋巴瘤的共同治疗靶点 | 成人T细胞白血病/淋巴瘤(ATLL)原代细胞和细胞系 | 单细胞测序分析 | 白血病/淋巴瘤 | 单细胞RNA测序(scRNA-seq), 流式细胞术, 计算机启动子分析, 慢病毒敲低 | NA | 单细胞RNA测序数据, 流式细胞数据 | 原代ATLL细胞和细胞系 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3233 | 2025-10-06 | 
         Integrated single-cell RNA and ATAC sequencing of B-cell lymphoma-3(Bcl3) and endothelin-2(Edn2) proteins as targets to prevent glaucoma progression 
        
          2025-Aug, International journal of biological macromolecules
          
          IF:7.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1016/j.ijbiomac.2025.145455
          PMID:40562139
         
       | 
      
      研究论文 | 通过整合单细胞多组学分析发现Bcl3和Edn2是青光眼进展的关键蛋白,并验证其作为治疗靶点的潜力 | 首次通过整合单细胞RNA测序和ATAC测序识别Bcl3和Edn2在青光眼中的关键作用,并验证其通过NF-κB和Hippo信号通路影响疾病进展 | 研究样本量有限,需要更大规模的临床验证 | 探索原发性开角型青光眼的分子机制并识别潜在治疗靶点 | 青光眼患者样本、动物模型(视网膜缺血再灌注和NMDA诱导的青光眼大鼠模型)、R28细胞系 | 数字病理学 | 青光眼 | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, ATAC-seq, ELISA, RT-qPCR | NA | 基因表达数据, 染色质可及性数据, 蛋白质表达数据 | 多个公共数据集(GSE203499, GSE212186, GSE241782, GSE212188)和实验验证样本 | NA | 单细胞RNA测序, bulk RNA测序, ATAC-seq | NA | NA | 
| 3234 | 2025-10-06 | 
         Microglial landscape and signaling in spinal cord injury 
        
          2025-Aug, Spinal cord
          
          IF:2.1Q1
          
         
        
          DOI:10.1038/s41393-025-01103-y
          PMID:40624302
         
       | 
      
      研究论文 | 通过整合生物信息学分析揭示脊髓损伤后小胶质细胞景观变化及其信号通路机制 | 首次整合单细胞RNA测序、空间转录组和bulk RNA-seq数据,系统描绘脊髓损伤后小胶质细胞动态变化,并发现Trem2介导的神经炎症与TGFβ驱动修复机制的双重调控轴 | 基于公共数据库的二次分析研究,缺乏实验验证数据 | 探究脊髓损伤后小胶质细胞景观变化及其促进功能恢复的分子机制 | 脊髓损伤后的小胶质细胞 | 生物信息学 | 脊髓损伤 | 单细胞RNA测序,空间转录组, bulk RNA-seq, 生物信息学分析 | NA | 基因表达数据 | 来自GEO数据库的多个数据集 | NA | 单细胞RNA测序,空间转录组, bulk RNA-seq | NA | NA | 
| 3235 | 2025-10-06 | 
         Epiblast-derived CX3CR1+ progenitors generate cardiovascular cells during cardiogenesis 
        
          2025-Aug, The EMBO journal
          
         
        
          DOI:10.1038/s44318-025-00488-z
          PMID:40551012
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了胚胎CX3CR1+细胞作为多能性上胚层来源祖细胞群,在心脏发育过程中贡献于心肌细胞、内皮细胞和巨噬细胞的生成 | 首次通过遗传谱系追踪证明CX3CR1+细胞起源于上胚层,并在心脏发生过程中通过新生分化和细胞融合两种机制生成心血管细胞 | 研究主要基于小鼠模型,人类中的类似机制仍需验证 | 探究CX3CR1+细胞在心脏发育过程中的起源和命运 | 小鼠胚胎和成年心脏中的CX3CR1+细胞及其后代细胞 | 发育生物学 | 心血管疾病 | 遗传谱系追踪,单细胞RNA测序 | NA | 基因表达数据,细胞谱系数据 | 小鼠胚胎发育不同阶段(E6.5-E9.5)及成年心脏组织 | NA | 单细胞RNA测序 | NA | NA | 
| 3236 | 2025-10-06 | 
         A spatial transcriptomic atlas of acute neonatal lung injury across development and disease severity 
        
          2025-Aug-01, American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology
          
         
        
          DOI:10.1152/ajplung.00191.2025
          PMID:40748676
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究通过空间转录组学技术构建了新生儿急性肺损伤的发育和疾病严重程度图谱 | 创建了基于常规收集的客观指标(胎龄和生存时间)的简化分类方案,识别了传统二元比较可能忽略的细胞类型模式 | 样本量相对有限(17个婴儿肺组织),空间转录组学技术本身的分辨率限制 | 阐明肺器官发生过程中的细胞转变时序和调控机制,理解正常和停滞的人类肺发育 | 17个不同发育阶段和损伤程度的人类婴儿肺组织 | 空间转录组学 | 新生儿肺损伤 | 空间转录组学,单细胞转录组学 | 计算聚类方法 | 空间基因表达数据 | 17个人类婴儿肺组织,约120万个细胞 | NA | 空间转录组学,单细胞RNA-seq | NA | 成像基础的空间转录组学技术 | 
| 3237 | 2025-10-06 | 
         BACH2 drives the development and function of group 2 innate lymphoid cells 
        
          2025-Aug, Science advances
          
          IF:11.7Q1
          
         
        
          DOI:10.1126/sciadv.ads4323
          PMID:40749046
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究揭示了转录因子BACH2在2型先天淋巴细胞发育和功能中的关键作用 | 首次发现BACH2在ILC2s中高表达并表观遗传激活,通过整合多组学技术揭示其调控机制 | NA | 探究BACH2转录因子在2型先天淋巴细胞发育和功能调控中的作用机制 | 2型先天淋巴细胞及其祖细胞 | 免疫学 | 哮喘 | scRNA-seq, ATAC-seq, CUT&Tag-seq | NA | 单细胞转录组数据,表观遗传数据 | NA | NA | 单细胞RNA测序,ATAC测序,CUT&Tag测序 | NA | NA | 
| 3238 | 2025-10-06 | 
         Dihydroartemisinin enhances remyelination by switching microglia to the reparative phenotype 
        
          2025-Aug-01, Journal of neuroinflammation
          
          IF:9.3Q1
          
         
        
          DOI:10.1186/s12974-025-03510-7
          PMID:40750890
         
       | 
      
      研究论文 | 本研究首次证明双氢青蒿素通过促进小胶质细胞向修复表型转化增强髓鞘再生能力 | 首次揭示双氢青蒿素通过调控小胶质细胞表型转换促进髓鞘再生的新机制,特别是通过LXR介导的胆固醇循环代谢途径 | 研究主要基于动物模型,临床转化效果需进一步验证 | 探究双氢青蒿素促进髓鞘再生的作用机制及其在脱髓鞘疾病治疗中的应用潜力 | 实验性自身免疫性脑脊髓炎模型和铜宗诱导的脱髓鞘模型中的小胶质细胞和少突胶质前体细胞 | 神经科学 | 多发性硬化症 | 单细胞测序, 细胞耗竭技术 | 动物疾病模型 | 基因表达数据, 组织学数据 | NA | NA | NA | NA | NA | 
| 3239 | 2025-10-06 | 
         Co-Expression of MHC-II and ANXA1: Mediators of PD-1/PD-L1 Therapy Resistance in Breast Cancer 
        
          2025-Aug, Cancer reports (Hoboken, N.J.)
          
         
        
          DOI:10.1002/cnr2.70291
          PMID:40744683
         
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      研究论文 | 本研究探讨MHC-II和ANXA1在乳腺癌中对PD-1/PD-L1治疗耐药性的潜在作用 | 发现ANXA1在PD-1/PD-L1治疗无应答者中表达增加,揭示了其作为免疫治疗耐药性介导因子的新机制 | ANXA1表达与总生存率缺乏直接相关性,需要进一步验证 | 研究MHC-II表达在乳腺癌免疫逃逸、肿瘤转移和免疫治疗疗效中的作用 | 三阴性乳腺癌患者和乳腺癌组织 | 生物信息学 | 乳腺癌 | 单细胞测序, 差异表达分析, GO和KEGG通路富集分析, 孟德尔随机化分析 | Limma, clusterProfiler, Scanpy, CellTypist, UMAP, PCA, Leiden算法 | 基因表达数据, 单细胞测序数据 | UK Biobank和GEO数据集 | NA | 单细胞RNA-seq | NA | NA | 
| 3240 | 2025-10-06 | 
         Effects of Cholesterol Metabolism on Corneal Endothelial Dysfunction in Patients With Type 1 Diabetes 
        
          2025-Aug-01, Investigative ophthalmology & visual science
          
          IF:5.0Q1
          
         
        
          DOI:10.1167/iovs.66.11.9
          PMID:40762538
         
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      研究论文 | 本研究从胆固醇代谢角度揭示糖尿病诱导角膜内皮功能障碍的机制 | 首次发现糖尿病通过抑制SREBF2/SQLE依赖的胆固醇生物合成途径导致角膜内皮功能障碍 | 研究主要基于动物模型和细胞实验,在人体中的直接证据有限 | 探究胆固醇代谢在糖尿病角膜内皮功能障碍中的作用机制 | 1型糖尿病小鼠模型、高糖培养的B4G12细胞、人和小鼠角膜内皮样本 | 眼科疾病研究 | 糖尿病 | 单细胞RNA测序,RNA测序,RT-qPCR,Western blotting,免疫荧光染色 | NA | 基因表达数据,图像数据 | 糖尿病小鼠模型和高糖培养细胞模型 | NA | single-cell RNA-seq,RNA-seq | NA | NA |